Submitted by Ubirajara Cruz (ubirajara.cruz@gmail.com) on 2017-03-29T15:43:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_Priscila_Dias.pdf: 621590 bytes, checksum: 4374c0a0e561b72bdead1ccfab73ac46 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-04-05T17:55:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese_Priscila_Dias.pdf: 621590 bytes, checksum: 4374c0a0e561b72bdead1ccfab73ac46 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-05T17:55:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Priscila_Dias.pdf: 621590 bytes, checksum: 4374c0a0e561b72bdead1ccfab73ac46 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul - FAPERGS / Campylobacter jejuni, Salmonella enterica e Yersinia enterocolitica estão entre os micro-organismos mais comumente associados a toxinfecções alimentares envolvendo o consumo de produtos de origem animal. As aves têm sido identificadas como reservatórios, atuando como possíveis propagadoras desses micro-organismos. Neste contexto, o trabalho teve como objetivo verificar a ocorrência de Campylobacter spp., Y. enterocolitica e S. enterica em frangos de corte e em aves silvestres, identificar as espécies de aves silvestres presentes na região sul do Brasil e quais podem ser portadoras de patógenos, pesquisar a presença dos genes cdtA, cdtB e cdtC nos isolados de Campylobacter e identificar os sorotipos de Salmonella encontrados. As aves silvestres foram capturadas próximas a lavouras de arroz e aviários com redes de neblina e soltas após a coleta. Amostras de fezes, 200 de frangos e 214 de aves silvestres de várias espécies, foram coletadas diretamente da cloaca com uso de zaragatoas e processadas para pesquisa de Campylobacter spp., S. enterica e Y. enterocolitica. Campylobacter spp. foi isolado de Chrysomus ruficapillus (Garibaldi) e Zonotrichia capensis (Tico-tico), e Salmonella isolada de Sicalis flaveola (Canário-da-terra). De frangos foram isolados Campylobacter spp., S. enterica e Y. enterololitica. Os mesmos micro-organismos foram isolados de fezes de frangos e aves silvestres capturadas no entorno dos mesmos aviários, sugerindo que ocorra uma contaminação mutua entre os dois grupos de animais. / Campylobacter jejuni, Salmonella enterica and Yersinia enterocolitica are among the most commonly microorganisms associated with food intoxication involving the consumption of animal products. The birds have been identified as reservoirs, acting like possible propagators of these microorganisms. In this context, the study aimed to verify the occurrence of Campylobacter spp., Y. enterocolitica and S. enterica in broilers and wild birds, identify the species of wild birds present in south Brazil and which may harbor pathogens, search the presence of genes cdtA, cdtB and cdtC in isolated Campylobacter and identify serotypes Salmonella found. Wild birds were captured near rice fields and aviaries with mist nets and released after collection. Faeces samples, 200 of broilers and 214 of wild birds, were collected directly from the cloaca using swabs and processed for Campylobacter spp., S. enterica and Y. enterocolitica research. Campylobacter spp. was isolated from Chrysomus ruficapillus (Garibaldi) and Zonotrichia capensis (Tico-tico), and Salmonella isolated from Sicalis flaveola (Canário-da-terra). Campylobacter spp., S. enterica and Y. enterololitica were isolated from broilers. The same microorganisms were isolated from broilers and wild birds faeces captured in the vicinity of the same aviaries, suggesting a mutual contamination between the two groups of animals.

A pesquisa agropecuária brasileira tem, ao longo dos anos, contribuído para resolver os problemas sociais e promover novos conhecimentos, incorporando novos avanços e buscando a independência tecnológica do País, por meio da transferência dos conhecimentos e tecnologias gerados. Todavia, o processo de transferência desses conhecimentos e tecnologias tem representado um grande desafio para as instituições públicas. A Embrapa é a maior e principal empresa de pesquisa agropecuária brasileira, com um quadro de 9.790 empregados, sendo 2.440 pesquisadores e um orçamento anual de R$ 2,52 bilhões. Atua por meio de 46 unidades de pesquisa descentralizadas, sendo ainda, coordenadora do Sistema Nacional de Pesquisa Agropecuária – SNPA. Considerando que a transferência de tecnologia é a consagração de esforço e recursos gastos para a geração do conhecimento e a validade da pesquisa, esse trabalho tem como objetivo realizar um diagnóstico sobre a atuação da Embrapa Suínos e Aves junto a cadeia produtiva de frangos de corte e propor um modelo de transferência de tecnologia para essa cadeia, que possa ser utilizado pelas as Instituições Públicas de Pesquisa - IPPs. O presente estudo justifica-se tanto pela importância da pesquisa agropecuária para o país, quanto pela instituição abordada. A metodologia utilizada foi o estudo de caso, com abordagem qualitativa, pesquisas documentais e bibliográficas e entrevistas com uso de questionários semiestruturados. A pesquisa foi realizada em três etapas. Na primeira etapa, foi realizado um diagnóstico sobre o processo de Transferência de Tecnologia (TT), a contribuição e o papel da Embrapa Suínos e Aves para cadeia produtiva de frangos de corte. Nessa etapa utilizou-se de pesquisa bibliográfica e documental e entrevistas semiestruturadas com agentes da agroindústria, pesquisadores da Embrapa Suínos e Aves, profissionais de TT da Embrapa e da Embrapa Suínos e Aves, gerentes de TT e pesquisadores da Agricultural Research Service – ARS. Na segunda etapa foi desenvolvido um modelo de TT avícola para a Embrapa. Nessa fase foram feitas pesquisas documentais e bibliográficas e análise das informações obtidas nas entrevistas realizadas. A terceira fase foi a validação do modelo proposto junto aos diversos elos da cadeia produtiva de frangos de corte. Os dados obtidos demonstram que, apesar de a Embrapa Suínos e Aves desenvolver tecnologias para a cadeia produtiva de frangos de corte, o índice de adoção destas tecnologias pela cadeia é muito baixo. Também foi diagnosticado que há um distanciamento entre a instituição e os diversos elos da cadeia. O modelo proposto busca uma maior interação entre a instituição e a cadeia, com o intuito de identificar as reais demandas de pesquisa da cadeia e a busca e desenvolvimento conjunto de soluções para essas demandas. O modelo de TT proposto foi aprovado pela grande maioria (96,77%) dos agentes entrevistados que atuam nos diversos elos da cadeia, bem como pelos representantes (92%) das entidades ligadas a essa cadeia. A aceitação do modelo proposto demonstra a disposição da cadeia em se aproximar da Embrapa Suínos e Aves, assim como em buscar soluções conjuntas para os problemas existentes. / The Brazilian agricultural research agency has, over the years, contributed to solve social problems and to promote new knowledge, incorporating new advances and seeking technological independence of the country, through the transfer of knowledge and technology generated. However, the process of transfering of knowledge and technology has represented a big challenge for public institutions. The Embrapa is the largest and main brazilian agricultural research company, with a staff of 9.790 employees, being 2.440 researchers and an annual budget of R$ 2.52 billion. Operates through 46 decentralized research units, and coordinate of the National Agricultural Research System - SNPA. Considering that technology transfer is the consecration of effort and resources spent for the generation of knowledge and the validity of the research, this work aims to conduct an assessment of the performance of Embrapa Swine and Poultry along the production chain of broilers and propose a technology transfer model for this chain, which can be used by the Public Institutions Research – IPPs. This study is justified by the importance of agricultural research for the country, and the importance of the institution addressed. The methodology used was the case study with a qualitative approach, documentary and bibliographic research and interviews with use of semi-structured questionnaires. The survey was conducted in three stages. In the first stage, there was a diagnosis of the Technology Transfer Process (TT), the contribution of the Embrapa Swine and poultry for the supply chain for broiler. At this stage it was used bibliographical and documentary research and semi- structured interviews with agroindustrial broiler agents, researchers at Embrapa Swine and Poultry, professionals of technology transfer, from the Embrapa and Embrapa Swine and Poultry, managers of technology transfer and researchers from the Agricultural Research Service - ARS. In the second step, a model was developed for the technology transferring poultry process of Embrapa. In this phase, there were made documentary and bibliographic research and analysis of information obtained in the interviews. The third phase was to validate the proposed model in the various sectors of the broilers productive chain. The data show that, although the Embrapa Swine and Poultry develops technologies for broiler production chain, the rate of adoption of these technologies by the chain is very low. It was also diagnosed that there is a gap between the institution and the various links of the chain. It was proposed an observatory mechanism to approximate Embrapa Swine and Poultry and the agents of the broiler chain for identifying and discussing research priorities. The proposed model seeks to improve the interaction between the institution and the chain, in order to identify the chain real research demands and the search and the joint development of solutions for these demands. The proposed TT model was approved by a large majority (96.77%) of the interviewed agents who work in the various links in the chain, as well as by representatives (92%) of the entities linked to this chain. The acceptance of the proposed model demonstrates the willingness of the chain to approach Embrapa Swine and Poultry, and to seek joint solutions to existing problems.

A pesquisa agropecuária brasileira tem, ao longo dos anos, contribuído para resolver os problemas sociais e promover novos conhecimentos, incorporando novos avanços e buscando a independência tecnológica do País, por meio da transferência dos conhecimentos e tecnologias gerados. Todavia, o processo de transferência desses conhecimentos e tecnologias tem representado um grande desafio para as instituições públicas. A Embrapa é a maior e principal empresa de pesquisa agropecuária brasileira, com um quadro de 9.790 empregados, sendo 2.440 pesquisadores e um orçamento anual de R$ 2,52 bilhões. Atua por meio de 46 unidades de pesquisa descentralizadas, sendo ainda, coordenadora do Sistema Nacional de Pesquisa Agropecuária – SNPA. Considerando que a transferência de tecnologia é a consagração de esforço e recursos gastos para a geração do conhecimento e a validade da pesquisa, esse trabalho tem como objetivo realizar um diagnóstico sobre a atuação da Embrapa Suínos e Aves junto a cadeia produtiva de frangos de corte e propor um modelo de transferência de tecnologia para essa cadeia, que possa ser utilizado pelas as Instituições Públicas de Pesquisa - IPPs. O presente estudo justifica-se tanto pela importância da pesquisa agropecuária para o país, quanto pela instituição abordada. A metodologia utilizada foi o estudo de caso, com abordagem qualitativa, pesquisas documentais e bibliográficas e entrevistas com uso de questionários semiestruturados. A pesquisa foi realizada em três etapas. Na primeira etapa, foi realizado um diagnóstico sobre o processo de Transferência de Tecnologia (TT), a contribuição e o papel da Embrapa Suínos e Aves para cadeia produtiva de frangos de corte. Nessa etapa utilizou-se de pesquisa bibliográfica e documental e entrevistas semiestruturadas com agentes da agroindústria, pesquisadores da Embrapa Suínos e Aves, profissionais de TT da Embrapa e da Embrapa Suínos e Aves, gerentes de TT e pesquisadores da Agricultural Research Service – ARS. Na segunda etapa foi desenvolvido um modelo de TT avícola para a Embrapa. Nessa fase foram feitas pesquisas documentais e bibliográficas e análise das informações obtidas nas entrevistas realizadas. A terceira fase foi a validação do modelo proposto junto aos diversos elos da cadeia produtiva de frangos de corte. Os dados obtidos demonstram que, apesar de a Embrapa Suínos e Aves desenvolver tecnologias para a cadeia produtiva de frangos de corte, o índice de adoção destas tecnologias pela cadeia é muito baixo. Também foi diagnosticado que há um distanciamento entre a instituição e os diversos elos da cadeia. O modelo proposto busca uma maior interação entre a instituição e a cadeia, com o intuito de identificar as reais demandas de pesquisa da cadeia e a busca e desenvolvimento conjunto de soluções para essas demandas. O modelo de TT proposto foi aprovado pela grande maioria (96,77%) dos agentes entrevistados que atuam nos diversos elos da cadeia, bem como pelos representantes (92%) das entidades ligadas a essa cadeia. A aceitação do modelo proposto demonstra a disposição da cadeia em se aproximar da Embrapa Suínos e Aves, assim como em buscar soluções conjuntas para os problemas existentes. / The Brazilian agricultural research agency has, over the years, contributed to solve social problems and to promote new knowledge, incorporating new advances and seeking technological independence of the country, through the transfer of knowledge and technology generated. However, the process of transfering of knowledge and technology has represented a big challenge for public institutions. The Embrapa is the largest and main brazilian agricultural research company, with a staff of 9.790 employees, being 2.440 researchers and an annual budget of R$ 2.52 billion. Operates through 46 decentralized research units, and coordinate of the National Agricultural Research System - SNPA. Considering that technology transfer is the consecration of effort and resources spent for the generation of knowledge and the validity of the research, this work aims to conduct an assessment of the performance of Embrapa Swine and Poultry along the production chain of broilers and propose a technology transfer model for this chain, which can be used by the Public Institutions Research – IPPs. This study is justified by the importance of agricultural research for the country, and the importance of the institution addressed. The methodology used was the case study with a qualitative approach, documentary and bibliographic research and interviews with use of semi-structured questionnaires. The survey was conducted in three stages. In the first stage, there was a diagnosis of the Technology Transfer Process (TT), the contribution of the Embrapa Swine and poultry for the supply chain for broiler. At this stage it was used bibliographical and documentary research and semi- structured interviews with agroindustrial broiler agents, researchers at Embrapa Swine and Poultry, professionals of technology transfer, from the Embrapa and Embrapa Swine and Poultry, managers of technology transfer and researchers from the Agricultural Research Service - ARS. In the second step, a model was developed for the technology transferring poultry process of Embrapa. In this phase, there were made documentary and bibliographic research and analysis of information obtained in the interviews. The third phase was to validate the proposed model in the various sectors of the broilers productive chain. The data show that, although the Embrapa Swine and Poultry develops technologies for broiler production chain, the rate of adoption of these technologies by the chain is very low. It was also diagnosed that there is a gap between the institution and the various links of the chain. It was proposed an observatory mechanism to approximate Embrapa Swine and Poultry and the agents of the broiler chain for identifying and discussing research priorities. The proposed model seeks to improve the interaction between the institution and the chain, in order to identify the chain real research demands and the search and the joint development of solutions for these demands. The proposed TT model was approved by a large majority (96.77%) of the interviewed agents who work in the various links in the chain, as well as by representatives (92%) of the entities linked to this chain. The acceptance of the proposed model demonstrates the willingness of the chain to approach Embrapa Swine and Poultry, and to seek joint solutions to existing problems.

Grande parte dos experimentos instalados atualmente é planejada para que sejam realizadas observações ao longo do tempo, ou em diferentes profundidades, enfim, tais experimentos geralmente contem um fator longitudinal. Uma maneira de se analisar esse tipo de conjunto de dados é utilizando modelos mistos, por meio da inclusão de fatores de efeito aleatório e, fazendo uso do método da máxima verossimilhança restrita (REML), podem ser estimados os componentes de variância associados a tais fatores com um menor viés. O pacote estatístico ASReml-R, muito eficiente no ajuste de modelos lineares mistos por possuir uma grande variedade de estruturas para as matrizes de variâncias e covariâncias já implementadas, apresenta o inconveniente de nao ter como objetos as matrizes de delineamento X e Z, nem as matrizes de variâncias e covariâncias D e , sendo estas de grande importância para a verificação das pressuposições do modelo. Este trabalho reuniu ferramentas que facilitam e fornecem passos para a construção de modelos baseados na aleatorização, tais como o diagrama de Hasse, o diagrama de aleatorização e a construção de modelos mistos incluindo fatores longitudinais. Sendo o vetor de resíduos condicionais e o vetor de parâmetros de efeitos aleatórios confundidos, ou seja, não independentes, foram obtidos resíduos, denominados na literatura, resíduos com confundimento mínimo e, como proposta deste trabalho foi calculado o EBLUP com confudimento mínimo. Para tanto, foram implementadas funções que, utilizando os objetos de um modelo ajustado com o uso do pacote estatístico ASReml-R, tornam disponíveis as matrizes de interesse e calculam os resíduos com confundimento mínimo e o EBLUP com confundimento m´nimo. Para elucidar as técnicas neste apresentadas e salientar a importância da verificação das pressuposições do modelo adotado, foram considerados dois exemplos contendo fatores longitudinais, sendo o primeiro um experimento simples, visando a comparação da eficiência de diferentes coberturas em instalações avícolas, e o segundo um experimento realizado em três fases, contendo fatores inteiramente confundidos, com o objetivos de avaliar características do papel produzido por diferentes espécies de eucaliptos em diferentes idades. / Currently, most part of the experiments installed is designed to be carried out observations over time or at different depths. These experiments usually have a longitudinal factor. One way of analyzing this data set is by using mixed models through means of inclusion of random effect factors, and it is possible to estimate the variance components associated to such factors with lower bias by using the Restricted maximum likelihood method (REML). The ASRemi-R statistic package, very efficient in fitting mixed linear models because it has a wide variety of structures for the variance - covariance matrices already implemented, presents the disadvantage of having neither the design matricesX and Z, nor the variance - covariance matrices D and , and they are very important to verify the assumption of the model. This paper gathered tools which facilitate and provide steps to build models based on randomization such as the Hasse diagram, randomization diagram and the mixed model formulations including longitudinal factors. Since the conditional residuals and random effect parameters are confounded, that is, not independent, it was calculated residues called in the literature as least confounded residuals and as a proposal of this work, it was calculated the least confound EBLUP. It was implemented functions which using the objects of fitted models with the use of the ASReml-R statistic package becoming available the matrices of interests and calculate the least confounded residuals and the least confounded EBLUP. To elucidate the techniques shown in this paper and highlight the importance of the verification of the adopted models assumptions, it was considered two examples with longitudinal factors. The former example was a simple experiment and the second one conducted in three phases, containing completely confounded factors, with the purpose of evaluating the characteristics of the paper produced by different species of eucalyptus from different ages.

O Vírus da influenza, apesar de todas as epidemias e pandemias referirem-se a infecções em seres humanos, não está restrita a espécie humana e é capaz de causar debilidade ou mortalidade em várias outras espécies, incluindo cavalos, suínos, mamíferos marinhos e aves, entre outros. Estudos ecológicos das viroses de influenza conduziram a hipótese que todas as que acometem mamíferos derivam de reservatórios destes vírus em aves. Mesmo com programas de monitoramento contínuo de aves silvestres em alguns países do mundo que possuem casos originados pelos vírus aviário H5N1, pouco foi feito na Antártica e por isso, o presente trabalho foi realizado nas estações de verão antártico de 2006, 2007 e 2008 em duas localidades no território Antártico, a Península Keller, localizada na Ilha Rei George e na ilha Elefante 61°08S, 55°07W, a primeira onde está situada a Estação Antártica Comandante Ferraz-EACF e a segunda onde está localizada uma base de apoio a estudos avançados. Para este estudo foi realizada a coleta de 283 amostras de quatro diferentes espécies de pinguins: Pygoscelis adeliae; P. papua; P. antarctica; Aptenodytes patagonicus. Para o diagnóstico das amostras colhidas, foi aplicada a detecção direta dos produtos amplificados pelo método de RT-PCR em gel de agarose confirmados pelo método de Real-Time PCR (Applied Biosystems) e pelo RT-PCR-GeneScan no laboratório de Virologia Clínica e Molecular, do Departamento de Microbiologia, da Universidade de São Paulo. Os resultados obtidos em nosso estudo foram 8 amostras positivas em pinguins para o vírus Influenza A. As amostras positivas por RT-PCR foram encaminhadas para o laboratório de Influenza do Department of Infectious Diseases, St. Jude Children\'s Research Hospital, Memphis, TN, USA, para isolamento em ovos embrionados, não havendo crescimento de vírus da influenza A. Quatro destas amostras positivas puderam ser sequenciadas e comparadas com sequências de Influenza A depositadas no Genbank apresentando uma identidade de 96,8 % a 100 % entre elas e o controle tendo este último uma identidade de 100% com as do banco de dados, confirmando a presença do vírus nestas aves. / Epidemics and pandemics of influenza usually refer to infections in human beings. The influenza virus is not, however, restricted to humans and can cause infirmity and death in other species including horses, swine, marine mammals, birds, and others. Ecological studies of viral infections have led to the hypothesis that the influenza viruses that attack mammals have their origin in the accumulation of these viruses in birds (avian flu). In some countries with influenza cases caused by the avian H5N1 virus, there was monitoring of wild birds but little had been done in Antarctica. The present work was therefore carried out during the Antarctic summer seasons of 2006, 2007, and 2008 in two Antarctic locations: The Commander Ferraz Antarctic Station, on the Keller Peninsula of King George Island, and at the Base of Advanced Studies located on Elephant Island (61°08S, 55°07W). Two hundred eighty-three (283) samples from four different penguin species Pygoscelis adeliae, Pygoscelis papua, Pygoscelis antarctica; and Aptenodytes patagonicus were collected for this study. Diagnoses of the samples were performed not only by application of direct detection and amplification according to the RT-PCR method in agar-gel, but also by Real-Time PCR (Applied Biosystems), and by RT-PCR gene scan at the Laboratory of Clinical and Molecular Virology of the Department of Microbiology of the University of Sao Paulo. Eight of the penguin samples tested positive for the Influenza-A virus. The positive samples, as determined by RT-PCR, were sent to the Influenza Laboratory of the Department of Infectious Diseases of the St. Jude Research Hospital in Memphis, Tennessee, USA, to be isolated in egg embryos where no further growth of the Influenza-A virus took place. Four of these positive samples could be sequenced and compared with those of Influenza-A on deposit at the Gene Bank and ranged from 96.85 to 100% when compared with the control samples (100% positive), thus confirming the presence of the virus in the tested birds.

Grande parte dos experimentos instalados atualmente é planejada para que sejam realizadas observações ao longo do tempo, ou em diferentes profundidades, enfim, tais experimentos geralmente contem um fator longitudinal. Uma maneira de se analisar esse tipo de conjunto de dados é utilizando modelos mistos, por meio da inclusão de fatores de efeito aleatório e, fazendo uso do método da máxima verossimilhança restrita (REML), podem ser estimados os componentes de variância associados a tais fatores com um menor viés. O pacote estatístico ASReml-R, muito eficiente no ajuste de modelos lineares mistos por possuir uma grande variedade de estruturas para as matrizes de variâncias e covariâncias já implementadas, apresenta o inconveniente de nao ter como objetos as matrizes de delineamento X e Z, nem as matrizes de variâncias e covariâncias D e , sendo estas de grande importância para a verificação das pressuposições do modelo. Este trabalho reuniu ferramentas que facilitam e fornecem passos para a construção de modelos baseados na aleatorização, tais como o diagrama de Hasse, o diagrama de aleatorização e a construção de modelos mistos incluindo fatores longitudinais. Sendo o vetor de resíduos condicionais e o vetor de parâmetros de efeitos aleatórios confundidos, ou seja, não independentes, foram obtidos resíduos, denominados na literatura, resíduos com confundimento mínimo e, como proposta deste trabalho foi calculado o EBLUP com confudimento mínimo. Para tanto, foram implementadas funções que, utilizando os objetos de um modelo ajustado com o uso do pacote estatístico ASReml-R, tornam disponíveis as matrizes de interesse e calculam os resíduos com confundimento mínimo e o EBLUP com confundimento m´nimo. Para elucidar as técnicas neste apresentadas e salientar a importância da verificação das pressuposições do modelo adotado, foram considerados dois exemplos contendo fatores longitudinais, sendo o primeiro um experimento simples, visando a comparação da eficiência de diferentes coberturas em instalações avícolas, e o segundo um experimento realizado em três fases, contendo fatores inteiramente confundidos, com o objetivos de avaliar características do papel produzido por diferentes espécies de eucaliptos em diferentes idades. / Currently, most part of the experiments installed is designed to be carried out observations over time or at different depths. These experiments usually have a longitudinal factor. One way of analyzing this data set is by using mixed models through means of inclusion of random effect factors, and it is possible to estimate the variance components associated to such factors with lower bias by using the Restricted maximum likelihood method (REML). The ASRemi-R statistic package, very efficient in fitting mixed linear models because it has a wide variety of structures for the variance - covariance matrices already implemented, presents the disadvantage of having neither the design matricesX and Z, nor the variance - covariance matrices D and , and they are very important to verify the assumption of the model. This paper gathered tools which facilitate and provide steps to build models based on randomization such as the Hasse diagram, randomization diagram and the mixed model formulations including longitudinal factors. Since the conditional residuals and random effect parameters are confounded, that is, not independent, it was calculated residues called in the literature as least confounded residuals and as a proposal of this work, it was calculated the least confound EBLUP. It was implemented functions which using the objects of fitted models with the use of the ASReml-R statistic package becoming available the matrices of interests and calculate the least confounded residuals and the least confounded EBLUP. To elucidate the techniques shown in this paper and highlight the importance of the verification of the adopted models assumptions, it was considered two examples with longitudinal factors. The former example was a simple experiment and the second one conducted in three phases, containing completely confounded factors, with the purpose of evaluating the characteristics of the paper produced by different species of eucalyptus from different ages.

O Vírus da influenza, apesar de todas as epidemias e pandemias referirem-se a infecções em seres humanos, não está restrita a espécie humana e é capaz de causar debilidade ou mortalidade em várias outras espécies, incluindo cavalos, suínos, mamíferos marinhos e aves, entre outros. Estudos ecológicos das viroses de influenza conduziram a hipótese que todas as que acometem mamíferos derivam de reservatórios destes vírus em aves. Mesmo com programas de monitoramento contínuo de aves silvestres em alguns países do mundo que possuem casos originados pelos vírus aviário H5N1, pouco foi feito na Antártica e por isso, o presente trabalho foi realizado nas estações de verão antártico de 2006, 2007 e 2008 em duas localidades no território Antártico, a Península Keller, localizada na Ilha Rei George e na ilha Elefante 61°08S, 55°07W, a primeira onde está situada a Estação Antártica Comandante Ferraz-EACF e a segunda onde está localizada uma base de apoio a estudos avançados. Para este estudo foi realizada a coleta de 283 amostras de quatro diferentes espécies de pinguins: Pygoscelis adeliae; P. papua; P. antarctica; Aptenodytes patagonicus. Para o diagnóstico das amostras colhidas, foi aplicada a detecção direta dos produtos amplificados pelo método de RT-PCR em gel de agarose confirmados pelo método de Real-Time PCR (Applied Biosystems) e pelo RT-PCR-GeneScan no laboratório de Virologia Clínica e Molecular, do Departamento de Microbiologia, da Universidade de São Paulo. Os resultados obtidos em nosso estudo foram 8 amostras positivas em pinguins para o vírus Influenza A. As amostras positivas por RT-PCR foram encaminhadas para o laboratório de Influenza do Department of Infectious Diseases, St. Jude Children\'s Research Hospital, Memphis, TN, USA, para isolamento em ovos embrionados, não havendo crescimento de vírus da influenza A. Quatro destas amostras positivas puderam ser sequenciadas e comparadas com sequências de Influenza A depositadas no Genbank apresentando uma identidade de 96,8 % a 100 % entre elas e o controle tendo este último uma identidade de 100% com as do banco de dados, confirmando a presença do vírus nestas aves. / Epidemics and pandemics of influenza usually refer to infections in human beings. The influenza virus is not, however, restricted to humans and can cause infirmity and death in other species including horses, swine, marine mammals, birds, and others. Ecological studies of viral infections have led to the hypothesis that the influenza viruses that attack mammals have their origin in the accumulation of these viruses in birds (avian flu). In some countries with influenza cases caused by the avian H5N1 virus, there was monitoring of wild birds but little had been done in Antarctica. The present work was therefore carried out during the Antarctic summer seasons of 2006, 2007, and 2008 in two Antarctic locations: The Commander Ferraz Antarctic Station, on the Keller Peninsula of King George Island, and at the Base of Advanced Studies located on Elephant Island (61°08S, 55°07W). Two hundred eighty-three (283) samples from four different penguin species Pygoscelis adeliae, Pygoscelis papua, Pygoscelis antarctica; and Aptenodytes patagonicus were collected for this study. Diagnoses of the samples were performed not only by application of direct detection and amplification according to the RT-PCR method in agar-gel, but also by Real-Time PCR (Applied Biosystems), and by RT-PCR gene scan at the Laboratory of Clinical and Molecular Virology of the Department of Microbiology of the University of Sao Paulo. Eight of the penguin samples tested positive for the Influenza-A virus. The positive samples, as determined by RT-PCR, were sent to the Influenza Laboratory of the Department of Infectious Diseases of the St. Jude Research Hospital in Memphis, Tennessee, USA, to be isolated in egg embryos where no further growth of the Influenza-A virus took place. Four of these positive samples could be sequenced and compared with those of Influenza-A on deposit at the Gene Bank and ranged from 96.85 to 100% when compared with the control samples (100% positive), thus confirming the presence of the virus in the tested birds.