Foram avaliados os efeitos do intervalo entre aspirações foliculares (IEA; OPU) e do tratamento com somatrotopina bovina recombinante (bST) na produção in vitro de embriões bubalinos. Dezesseis fêmeas foram distribuídas aleatoriamente em quatro grupos (fatorial 2x2): (1) G-Cont7: sessões de OPU uma vez por semana; (2) G-bST7: sessões de OPU uma vez por semana + 500mg de bST a cada 14 dias; (3) G-Cont14: sessões de OPU a cada 14 dias e (4) G-bST14: sessões de OPU + 500mg de bST a cada 14 dias. Os animais do G-Cont7 e G-bST7 foram submetidos a 16 sessões de OPU, e os animais do G-Cont14 e G-bST14 a oito sessões de OPU. Nas sessões realizadas uma vez por semana (G-s/bST) reduziu-se o número de folículos aspirados, de oócitos totais recuperados e de oócitos viáveis (P0,004). O tratamento com bST aumentou o número de folículos aspirados (P<0,0001), o total de oócitos recuperados e a taxa de recuperação (P=0,07). No entanto, nem o IEA e nem o tratamento com bST aumentaram a produção in vitro de embriões bubalinos. / It was evaluated the effect of OPU interval and bST treatment on embryo production in buffalo. Sixteen females were randomly assigned in 4 groups, in a 2x2 factorial experimental design: (1) G-Cont7: OPU session each seven days; (2) G-bST7: OPU session each seven days plus 500mg of bST each 14 days; (3) G-Cont14: OPU session each 14 days and (4) G-bST14: OPU session plus 500mg of bST each 14 days. Animals of G-Cont7 and G-bST7 were submitted to 16 OPU sessions, and those of G-Cont14 and G-bST14 to 8 OPU sessions. The OPU session performed every week (G-s/bST) decreased the number of aspirated follicles, and the number of total and viable recovery oocytes (P0.004). The treatment with bST increased the number of aspirated follicles (P<0.0001), the number of recovery oocytes and the oocyte recovery rate (P=0.07). However, neither OPU interval nor bST treatment increased the in vitro embryo production in buffalo.

O presente estudo teve por objetivo avaliar quantitativa e qualitativamente os fagócitos presentes no leite de búfalas (Bubalus bubalis) hígidas criadas nos Estado de São Paulo. Para tal, o experimento foi subdividido em três etapas, designadas capítulos, conforme os objetivos: (1) determinar e estudar a celularidade do leite de búfalas hígidas; (2) estabelecer metodologia adequada para a recuperação das células somáticas do leite de búfalas, possibilitando a avaliação in vitro; (3) descrever e avaliar as provas de atividade fagocítica das células presentes no leite de búfalas hígidas, através de testes de mensuração direta (espraiamento e fagocitose de partículas de Zymosan) e por testes indiretos, que mensuram os metabólitos de oxigênio gerados na “explosão respiratória". Foram colhidas 132 amostras de leite de 35 búfalas hígidas (sem alterações ao exame físico da glândula mamária, bem como resultado da prova de CMT e exame microbiológico negativos). Após as avaliações do CMT, da CCS, da contagem diferencial, da viabilidade celular, do exame bacteriológico, dos testes de fagocitose, de espraiamento e da liberação de peróxido de hidrogênio, concluiu-se que: (1) os resultados das contagens de células somáticas, microscópica e automática, foram semelhantes, mas a predominância celular diferiu conforme a técnica empregada, sendo identificadas percentualmente mais células mononucleares na lâmina de suspensão celular citocentrifugada, e mais polimorfonucleares no leite submetido à técnica de Prescott e Breed; o leite diluído e citocentrifugado permitiu melhor avaliação da morfologia celular sendo identificados: 61,1% de monócitos e macrófagos; 32,9% de neutrófilos; 5,3% de linfócitos e 0,7% de eosinófilos; os fagócitos mononucleares apresentaram uma acentuada plasticidade na estrutura, com variados padrões morfológicos; (2) a baixa celularidade do leite necessitou maiores volumes da amostra mas, o aumento do volume da amostra aumenta a concentração celular obtida, mas não de forma ilimitada pois pode passar a comprometer a viabilidade das mesmas pelo excesso de manipulação e tempo exigidos pelas amostras mais volumosas; não foi necessária a elicitação, sendo possível a recuperação de 2 x 106 células viáveis/mL de leite de búfalas hígidas com 500 mL de leite, no mínimo; (3) os macrófagos aderidos espraiaram significativamente, além de apresentarem correlação com outro marcador de ativação celular, no caso, a liberação de peróxido de hidrogênio; mais da metade dos macrófagos aderidos fagocitaram partículas de Zymosan; os fagócitos mantêm sua capacidade de liberar peróxido de hidrogênio, espontaneamente ou não, em grau máximo, com uma significativa variação entre amostras / The aim of this study was to make a quantitative and a qualitative evaluation of phagocytes from healthy buffaloes (Bubalus bubalis) milk bred in Sao Paulo state. For this purpose, the experiment was divided in three parts, called chapters, as specific objectives: (1) establish and study the cellularity of healthy buffaloes milk; (2) establish an adequate method for the recuperation of somatic cells from buffaloes milk, making possible an in vitro evaluation; (3) standardize and evaluate the phagocytic activity tests of cells from healthy buffaloes milk, through direct measurement methods (spreading and phagocytosis of Zymosan particles) and indirect methods, which measure the oxygen metabolites from the respiratory burst. Milk samples (n=132) of healthy 35 buffaloes (without alterations on the physical examination of the mammary gland, and also negative results on CMT and microbiologic exams) were obtained. After the evaluations of CMT, SCC, differential cells count, cellular viability, bacteriologic exam, phagocytic tests, spreading and hydrogen peroxide liberation, the conclusions were: (1) the results of somatic cells count, microscopic and automatic, were similar but the cellular predominance differed with the utilized method, being percentually identified more mononuclear cells on slide of cytocentrifugation cellular suspension and more polymorphonuclear on milk submitted to the Prescott and Breed methods; the diluted and cytology by cytocentrifugation of milk permitted a best evaluation of the cellular morphology, being identified: 61.1% of monocytes and macrophages; 32.9% of neutrophils; 5.3% of lymphocytes and 0.7% of eosinophils; mononuclear phagocytes showed a high plasticity on structure with many morphological patterns; (2) a lower cellularity on milk requires higher quantities of the samples but an increase on sample volume increases cellular concentrations obtained, not on an unlimited way because it can compromise the cells viability with the excess of manipulation and time required by the biggest samples; it was not necessary the elicitation, being possible the recuperation of 2 x 106 viable cells/mL on milk of healthy buffaloes with 500 mL of milk minimum (3) adherent macrophages spreaded and were correlated with hydrogen peroxide release; majority of adherent macrophages phagocyted Zymosan particles; milk phagocytes showered a high oxidative metabolism, undependably of PMA stimulation, but with a great individual variation.

O presente trabalho teve como objetivo identificar determinadas características produtivas e econômicas de algumas criações de búfalos no Brasil desenvolvendo um estudo sobre as dificuldades, facilidades e potencialidade da bubalinocultura envolvendo as ferramentas de marketing aplicadas ao agronegócio bubalino. Foi realizada uma pesquisa de campo utilizando formulário eletrônico para preenchimento on line por criadores de búfalos com questões estratégicas e disponibilizado na página da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos da Universidade de São Paulo. O mesmo questionário impresso foi encaminhado, via correio, à 184 criadores de búfalos com endereços cadastrados na página da Associação Brasileira de Criadores de Búfalos. Foram avaliadas 50 propriedades com atividade em bubalinocultura rurais distribuídas em 12 Estados brasileiros. O presente estudo identificou que a bubalinocultura representa uma atividade promissora junto ao agronegócio brasileiro com bom nicho de mercado para a produção de leite, porém com barreiras no posicionamento do mercado da carne de búfalo. Há um desafio a ser vencido a partir da articulação dos componentes de toda a estrutura no agronegócio bubalino envolvendo cadeia produtiva de leite e de carne para produção em escala visando atender adequadamente a demanda do mercado interno e do mercado externo. / This study aimed to identify certain characteristics of some productive and economical of buffalo production in Brazil developing a study on the difficulties, advantages and potential of buffalo production involving the tools of marketing applied to buffalo agribusiness. We performed a field research using electronic form to fill on line by buffalo raisers with strategic questions available on the website of Faculty of Food Engineering and Animal Science from University of Sao Paulo. The same form was sent via mail to the 184 buffalo raisers with addresses registered on the website of the Brazilian Buffalo Raisers Association. We evaluated 50 rural farms with activity in buffalo production distributed in 12 Brazilian states. This study identified that buffalo production represents a promising activity to the Brazilian agribusiness with a good special market for milk production, but with barriers in the market positioning of buffalo meat. There is a challenge to be achievement from the articulation of the components of the entire structure in the agribusiness production chain involving buffalo milk and meat production scale to adequately meet the demand of the internal and external markets.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-01-25Bitstream added on 2014-06-13T20:07:26Z : No. of bitstreams: 1 araujo_dn_dr_jabo.pdf: 567500 bytes, checksum: bbf5f199afa8e9062527ea8384197179 (MD5) / Este estudo teve por objetivo analisar quais os fatores ambientais, comportamentais e genéticos que afetam a produção de leite e o fluxo lácteo de búfalas (Bubalus bubalis). Os dados foram coletados durante dois anos em 3 fazendas leiteiras participantes do projeto de controle leiteiro realizado pelo Departamento de Zootecnia da Universidade Estadual Paulista em Jaboticabal, no Estado de São Paulo. No primeiro artigo descreveu-se as médias e as curvas de fluxo lácteo para búfalas e foram estimados parâmetros genéticos para a produção de leite, tempo de ordenha e fluxo lácteo em modelo multicaracterística com inferência bayesiana. No segundo artigo destacou-se a análise da relação de manejo aversivo com reatividade de búfalas na ordenha e os possíveis efeitos desta reatividade sobre as características de produção e rotina de ordenha em búfalas. No terceiro artigo verificou-se a existência de polimorfismos nos genes da ocitocina e do receptor adrenérgico α1A e suas possíveis associações com produção de leite, fluxo lácteo e tempo de ordenha. Os resultados sugeriram que a variação genética da produção de leite, fluxo lácteo e tempo de ordenha são suficientes para efeitos de seleção, sendo que a seleção de uma das características influenciará as outras no mesmo sentido. Observou-se que a reatividade das búfalas e as ações dos retireiros não influenciam as características de produção. E que os polimorfismos encontrados nos genes ocitocina e receptor adrenérgico α1A não se mostram associados às características de produção em búfalas / This study aims to analyze which environmental, behavioral and genetic aspects affect the milk production and milk flow of water buffaloes (Bubalus Bubalis). The data was collected in a period of two years in three dairy farms that were participating in the Dairy Bubaline Test Program developed by the Animal Science Department of São Paulo State University, FCAV, Jaboticabal, SP, Brazil. The first paper described the average and milk flow curves of water buffaloes and genetics parameters were estimated for the milk production, milking speed and milk flow in a multiple-trait analysis with bayesian inference. The second paper highlights an analysis of the relation between the aversive handling with the reactivity of water buffaloes in the milking process and the possible effects of this reactivity on the traits of production and the milking process routine in water buffaloes. The third paper verifies the existence of polymorphisms in the genes of oxytocin and of adrenergic receptor α1A and it's possible associations with milk production, milk flow and milking speed. The results suggest that the genetic variation of the milk production, milk flow and milking speed are sufficient for selection purposes, considering that the selection of one of the characteristics will influence the others in the same way. It was noticed that the reactivity of water buffaloes and the activities of the stockpersons has no influence on the other production characteristics. And also that the polymorphisms found in the genes of oxytocin and of the adrenergic receptor α1A do not show themselves associated to production characteristics in water buffaloes, except for the effect of the α1A over production of protein

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-29Bitstream added on 2014-08-13T18:01:11Z : No. of bitstreams: 1 000736017_20140829.pdf: 268216 bytes, checksum: d24c916cb4f2f5d62140603bab304a45 (MD5) Bitstreams deleted on 2014-10-03T16:24:43Z: 000736017_20140829.pdf,Bitstream added on 2014-10-03T16:27:41Z : No. of bitstreams: 2 000736017_20140829.pdf.txt: 31163 bytes, checksum: e21dedff28a6a8d49196eb12ad922ee5 (MD5) 000736017.pdf: 1092117 bytes, checksum: 23730ac0c228da8c6df28821beccf960 (MD5) Bitstreams deleted on 2014-10-03T16:33:17Z: 000736017.pdf,Bitstream added on 2014-10-03T16:43:31Z : No. of bitstreams: 2 000736017_20140829.pdf.txt: 31163 bytes, checksum: e21dedff28a6a8d49196eb12ad922ee5 (MD5) 000736017.pdf: 1092117 bytes, checksum: 23730ac0c228da8c6df28821beccf960 (MD5) Bitstreams deleted on 2014-10-03T16:48:57Z: 000736017.pdf,Bitstream added on 2014-10-03T16:49:48Z : No. of bitstreams: 1 000736017.pdf: 1092117 bytes, checksum: 23730ac0c228da8c6df28821beccf960 (MD5) Bitstreams deleted on 2014-10-27T11:47:13Z: 000736017.pdf,Bitstream added on 2014-10-27T11:48:06Z : No. of bitstreams: 1 000736017.pdf: 1092117 bytes, checksum: 23730ac0c228da8c6df28821beccf960 (MD5) / As β-defensinas são as proteínas mais amplamente estudadas dentre as três subfamílias das defensinas, uma vez que possuem extensa atividade antimicrobiana e são produzidas por vários tipos de células epiteliais, fornecendo assim proteção às membranas das células do hospedeiro. Em mamíferos, além de sua atividade antimicrobiana, essas proteínas atuam na maturação do espermatozoide, na capacitação espermática, na proteção do espermatozoide contra a resposta imune da fêmea e na expressão diferenciada e específica nos tecidos reprodutivos, sugerindo assim, uma importante função na reprodução e na fertilidade. O painel de linhagens celulares híbridas irradiadas (painel RH) construído para o genoma do búfalo (BBURH5000) vem sendo utilizado com sucesso nos estudos de mapeamento dos cromossomos bubalinos. A estratégia do mapeamento RH, ou seja, a utilização do painel RH associado a análises estatísticas, determina a ordem linear de marcadores nos cromossomos, sendo uma importante ferramenta para a construção de mapas físicos de alta resolução do genoma, e também na construção de mapas comparativos entre espécies. O presente trabalho teve por objetivo utilizar o painel BBURH5000 para mapear um conjunto de genes das β-defensinas no cromossomo 14 bubalino (BBU14) e a construção de um mapa comparativo in silico entre o BBU14 e seu homólogo em bovino. Para tal, foram testados com DNA bubalino, sequências de iniciadores para PCR provenientes de oito genes das β-defensinas, localizados no cromossomo 13 bovino (BTA13), o qual é homólogo ao BBU14. Do total de marcadores testados, seis amplificaram produtos de PCR adequados ao mapeamento utilizando o painel BBURH5000. No entanto, dois marcadores foram excluídos na etapa de genotipagem. A frequência de retenção dos marcadores no painel apresentou uma variação de 16,66% com o marcador BBD125 a 20,00% com ... / The β-defensins are proteins most widely studied of the three subfamilies of defensins, because have extensive antimicrobial activity and are produced by several types of epithelial cells, thereby providing protection to the membranes of host cells. In mammals, in addition to their antimicrobial activity, these proteins act in the maturation of spermatozoa, in sperm capacitation, in protecting the sperm against the female immune response and specific and differential expression in reproductive tissues, thus suggesting an important role in reproduction and fertility. The radiation hybrid panel (RH panel) constructed for buffalo genome (BBURH5000) has been successfully used in mapping studies of buffalo chromosomes. The RH mapping strategy, in other words, use of RH panel associated statistical analysis, determines the linear order of markers on chromosomes and is an important tool for the construction of physical maps of high resolution genome and also in the construction of comparative maps between species. The present study has the purpose to use the BBURH5000 panel to map a set of β-defensins genes on buffalo chromosome 14 and the construction of a comparative map in silico between BBU14 and homologous bovine. To this end, we tested buffalo DNA sequences of primers for PCR from eight genes of β-defensins, located on bovine chromosome 13 (BTA13), which is homologous to BBU14. Of the markers tested, six amplified suitable PCR product to the mapping using BBURH5000 panel. However, two markers were excluded in step genotyping. The retention frequency of markers on the panel presented a variation of 16.66% with a marker BBD125 to 20.00% with markers BBD119 and BBD122. The comparative analysis in silico between the BBU14 RH map and the sequence map of BTA13 allowed to indicate the location of these markers on buffalo chromosome 14

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-30Bitstream added on 2014-08-13T18:01:11Z : No. of bitstreams: 1 000736106.pdf: 1310930 bytes, checksum: 28ecc16bb9798a305ffacdd9b95396fe (MD5) / O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é uma região do genoma com um denso agrupamento de genes que apresentam alto grau de polimorfismo. Os genes do MHC estão divididos em regiões que apresentam similaridades funcionais, contendo genes da classe I, II e III, sendo que em bovídeos a classe II é subdividida em dois agrupamentos denominados IIa e IIb. Genes da classe II do MHC têm chamado muito a atenção, se tratando de animais de produção, diante da necessidade de melhorar métodos de controle de doenças, por meio do desenvolvimento de novas vacinas e seleção de animais resistentes. Desta forma, o presente trabalho visou à realização de um estudo da diversidade alélica do gene DRB3 em três raças de búfalo de rio criadas no Brasil (Mediterrâneo, Jafarabadi e Murrah) utilizando a técnica de PCR-RFLP. As amostras de DNA foram extraídas de bulbo folicular de 24 animais da raça Mediterrâneo, 23 animais da raça Jafarabadi e 18 animais da raça Murrah. As reações de PCR foram realizadas com volume total de 30 μl e o produto de PCR obtido foi digerido com três enzimas de restrição: RsaI, HaeIII e PstI. Os pares de iniciadores de PCR produziram produto de PCR de aproximadamente 300 bp de tamanho. A digestão com a enzima de restrição RsaI apresentou oito alelos, com tamanhos aproximados: O (300 bp), RsaI-A (230+70 bp), RsaI-B (180+120 bp), RsaI-C (130+90+70 bp), RsaI-D (140+90+70 bp), RsaI-E (120+70+60 bp), RsaI-F (120+110+70 bp) e RsaI-G (110+70+60+55 bp), sendo cinco alelos (O, RsaI-A, RsaI-B, RsaI-C, RsaI-E) na raça Mediterrâneo, quatro alelos (O, RsaI-A, RsaI-F e RsaI-G) na raça Jafarabadi e três alelos (O, RsaI-A e RsaI-D) na raça Murrah. Em todos os produtos de PCR, das três raças, o genótipo homozigoto para o alelo O foi o mais frequente (300bp/300bp). Com a enzima de restrição HaeIII foram observados quatro alelos, com tamanhos aproximados ... / The Major Histocompatibility Complex (MHC) is a genome region with have a dense clusters of genes that showing a high degree of polymorphism. The genes of the MHC are divided in regions that show similar functions, and contain genes of the classe I, II and III. The class II, in bovides is subdivided in two clusters called IIa and IIb. Much attention has been given to class II genes, especially to the livestock, because the production animal has a need of more efficient methods to control diseases through the development of vaccines and selection of resistant animals. Therefore, the present work aimed study the allelic diversity of the DRB3 gene in three breeds of river buffaloes raised in Brazil (Mediterranean, Jafarabadi and Murrah) by PCR-RFLP. DNA samples were extracted from follicle bulb of 24 Mediterranean, 23 Jafarabadi and 18 Murrah buffaloes breeds. The PCR reactions have 30 μl of volume and the PCR product was digested with three restriction enzymes: RsaI, HaeIII and PstI. The primers pairs produced a PCR product with 300 bp size proximally. Digestion with the restriction enzyme RsaI presented eight alleles, with proximally sizes: O (300 bp), RsaI-A (230+70 bp), RsaI-B (180+120 bp), RsaI-C (130+90+70 bp), RsaI-D (140+90+70 bp), RsaI-E (120+70+60 bp), RsaI-F (120+110+70 bp) and RsaI-G (110+70+60+55 bp), and were five alleles (O, RsaI-A, RsaI-B, RsaI-C and RsaI-E) in the Mediterranean breed, four alleles (O, RsaI-A, RsaI-F and RsaI-G) in the Jafarabadi breed and three alleles (O, RsaIA and RsaI-D) in the Murrah breed. In all of the PCR products, of the three breeds, the homozygote genotype for the allele O was the most frequent (300bp/300bp). Digestion with the HaeIII restriction enzyme produced four alleles, with proximally sizes: HaeIII-A (220+80 bp), HaeIII-B (170+80+50 bp), HaeIII-C (210+80 bp) and HaeIII-D (170+130 bp), where the Mediterranean breed presented the four alleles ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-13Bitstream added on 2014-06-13T20:33:37Z : No. of bitstreams: 1 bizari_dc_me_jabo.pdf: 336489 bytes, checksum: 0801c01531c7ce877e08321205d11d07 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / No presente estudo, cinco novos genes codificantes de proteínas foram selecionados para o mapeamento do cromossomo 6 bubalino (BBU6). Os novos genes (muc1, ppp1r7, psmd4, tshb e gtf2b) foram testados com a tecnologia de PCR resultando em produtos de PCR adequados ao mapeamento utilizando-se um painel de células somáticas híbridas irradiadas, denominado BBURH5000. Os resultados obtidos mostraram uma freqüência de retenção (FR) do produto de PCR de cada gene nas diferentes linhagens do painel com variação de 13,3% (gtf2b) a 26,6% (psmd4). A análise comparativa entre os mapas RH do BBU6 e a sequência do cromossomo 3 bovino permitiu indicar a localização dos novos genes no cromossomo 6 bubalino / In this study, five new protein coding genes were select for mapping buffalo chromosome 6. The new genes (muc1, ppp1r7, psmd4, tshb and gtf2b) were tested using PCR technology resulting in PCR products suitable for mapping using a radiation hybrid panel (BBURH5000). The retention frequency of the PCR products in each hybrid cell line of the panel showed the percentage from 13,3% (gtf2b) to 26,6% (psmd4). Comparative analysis between the buffalo chromosome 6 RH map and the sequence from bovine chromosome 3 allowed to assign the location of the new genes on buffalo chromosome 6

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-27Bitstream added on 2014-11-10T11:57:53Z : No. of bitstreams: 1 000791348_20150331.pdf: 259472 bytes, checksum: e03bc33d39ac6d201634f17b4ed02897 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-04-01T12:51:15Z: 000791348_20150331.pdf,Bitstream added on 2015-04-01T12:51:48Z : No. of bitstreams: 1 000791348.pdf: 1806331 bytes, checksum: c4b0df6ca2360e55b28b2a011cb7e6c0 (MD5) / Em mamíferos, os genes relacionados à resposta imune do hospedeiro à patógenos encontram-se organizados na região genômica denominada Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC). Os genes da região MHC também estão envolvidos na escolha do parceiro para acasalamento, na ocorrência de abortamentos espontâneos e na manutenção da gestação. A disponibilidade de uma biblioteca genômica construída com o genoma de búfalo torna possível a caracterização molecular dos genes dessa região. Tal caracterização permitirá o entendimento dos mecanismos envolvidos na resistência/suscetibilidade à doenças e na reprodução em búfalos, além de contribuir para a anotação desses genes no genoma bubalino. Visando determinar a estrutura molecular dos genes do sistema imune de búfalo, o presente trabalho teve como objetivo a identificação e a caracterização de clones da biblioteca genômica de búfalo contendo marcadores da classe IIb. A seleção dos clones foi realizada por meio da tecnologia de PCR, segundo o sistema de organização tridimensional (superpool, singlepool e sistema linha/coluna) no qual os clones da biblioteca se encontram organizados. As reações de PCR foram realizadas utilizando 21 marcadores da classe IIb mapeados no cromossomo 2 de búfalo. Dentre os 33.792 clones avaliados, foram identificados três clones positivos para quatro marcadores da classe IIb, sendo eles: 11.05, 12.05, 13.00 e DMA. Após a seleção, os clones foram purificados e sequenciados via pirosequenciamento, onde apresentaram tamanho de inserto variando de 26 a 117 Kb. As sequências obtidas para cada um dos clones foram alinhadas com as duas versões de anotação do genoma bovino (UMD_3.1 e Btau_4.6.1), onde os alinhamentos mais significativos foram identificados com as sequências correspondentes do cromossomo BTA23. Os resultados obtidos mostraram que as sequências de ambos os clones ... / In mammals, genes related to immune response to pathogens are organized in a genomic region named Major Histocompatibility Complex (MHC). MHC genes are also involved in mate-choice, occurrence of spontaneous abortions and maintenance of pregnancy. The existence of a genomic library, constructed with buffalo genome, allows the characterization of MHC genes, providing sources for understanding the mechanisms involved in resistance/susceptibility to diseases and in reproduction, contributing for annotation of these genes on buffalo genome. To determine the molecular structure of buffalo immune system genes, the present study aimed to identify and characterize clones containing class IIb markers from a buffalo genomic library. Selection of clones was performed by PCR technique, according to three-dimensional system (superpool, singlepool, row/column system) in which clones are arranged. To identify the clones were used 21 class IIb markers, previously mapped on buffalo chromosome 2. Among the 33.792 clones evaluated, three clones were identified for the MHC markers 11.05, 12.05, 13.00 and DMA. These clones were then purified and sequenced by pyrosequencing, presenting insert size ranging from 26 to 117 Kb. Each clone sequence were aligned with two bovine genome assemblies (UMD_3.1 and Btau_4.6.1), where the most significant alignments were identified with the corresponding sequences to BTA23. Sequences of both clones showed a greater coverage in UMD_3.1 assembly. Four genes were predicted for clone A/17 DNA sequence (H2B, DMB, DMA and BRD2), and one gene (VPS52) was predicted for clone I/09 sequence. Each gene had the number and size of exons and introns determined. The identification of repetitive sequences showed that 49,3% of clone A/17 sequence and 46,3% of clone I/09 sequence are represented by transposable elements. Furthermore, small RNA sequences were identified in both clones ...

Submitted by Aelson Maciera (aelsoncm@terra.com.br) on 2017-05-11T17:29:15Z No. of bitstreams: 1 TeseTAN.pdf: 1864712 bytes, checksum: 75782f61cc6526aa709949101798707e (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-05-18T20:22:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseTAN.pdf: 1864712 bytes, checksum: 75782f61cc6526aa709949101798707e (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-05-18T20:22:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseTAN.pdf: 1864712 bytes, checksum: 75782f61cc6526aa709949101798707e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-22T20:17:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseTAN.pdf: 1864712 bytes, checksum: 75782f61cc6526aa709949101798707e (MD5) Previous issue date: 2016-06-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Bovine babesiosis and anaplasmosis are distinct diseases, which constitute the syndrome called tick fever, characterized by infection of red blood cells. Its distribution in herds causes the reduction in productivity and high economic losses to livestock worldwide. Anaplasma marginale, Babesia bovis, and Babesia bigemina are the predominant species in Brazil. Rhipicephalus (Boophilus) microplus is the biological vector of babesiosis and anaplasmosis may be transmitted by ticks, hematophagous flies, and fomites. It is known that the water buffalo can become infected with Babesia and Anaplasma, but little is known the extent of the infection and how it affects the health of these animals. Thus, the present study aimed to determine the frequency and the level of infection by B. bovis, B. bigemina and A. marginale in 108 water buffalo (50 calves and 58 adult females), naturally infested with the tick R. (B). microplus raised in farms located in areas of endemic stability in São Paulo state. From each animal, a blood sample from the jugular vein was taken for DNA extraction and packed cell volume (PCV) determination. Samples from auricular vessels were taken for blood smears. The body temperature was measured with a mercury thermometer column. Electrochemical impedance spectroscopy technique was used to differentiate the serum of uninfected animals from the serum of animals infected with B. bovis. To this end, antigens derived from culture were immobilized on gold electrodes (150 nm thick) to give a biosensor device using the compound [Fe (CN) 6] 3- / 4-proof redox. The peripheral blood smears were stained with May-Grunwald-Giemsa for research of hemoparasites by optical microscopy. DNA extractions were performed using the Easy DNA TM Kit (Invitrogen). DNA amplification protocols were tested with primers specific to B. bigemina, B. bovis, and A. marginale using nested PCR (nPCR) and quantitative real-time PCR (qPCR). qPCR was used to estimate the number of copies of the gene cytochrome b (mt-cytB) of both babesias and Anaplasma msp 1b gene in all samples. Merozoites of B. bigemina were seen in blood smears of three calves from the Alambari herd (all less than 0.1 of parasitemia). Molecular techniques, nPCR, and qPCR, were more sensitive in the detection of parasites that direct examination of the blood smears and the frequencies of infection were 20:37% and 100% for B. bovis and 59.26% and 100% to B. bigemina, respectively. CN of the mt-cytB gene of B. bovis and B. bigemina showed significant effects (p <0.05) of herd age, species, and their interaction. The CN values were higher (p≤0.05) for B. bovis (2.81 ± 0:07) when compared to B. bigemina (2.61 ± 12:07) and A. marginale (0:57 ± 0:07). These data suggest a high frequency of infection by B. bovis and B. bigemina in the population of water buffalo studied. Preliminary testing of diagnosing infection with B. bovis device showed changes in the impedance in the system used and clearly demonstrated that the biosensor can detect infected animals, which can be exploited for rapid detection of B. bovis infections and also extended for the test to other parasites. / A babesiose e anaplasmose bovina são enfermidades distintas, que constituem o complexo chamado de Tristeza Parasitária Bovina (TPB), caracterizada por infecção das células vermelhas do sangue. Sua distribuição nos rebanhos ocasiona redução na produtividade e grandes perdas econômicas para a pecuária mundial. Anaplasma marginale, Babesia bovis e Babesia bigemina são as espécies prevalentes no Brasil. O carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus é o vetor biológico das babesioses, e a anaplasmose, além do carrapato pode ser transmitida por moscas hematófogas ou fômites. Sabe-se que, os búfalos podem se infectar com os agentes da TPB, porém pouco é conhecido a extensão dessa infecção e como ela afeta a saúde desses animais. Assim o presente estudo teve o objetivo de determinar a frequência e o nível de infecção por B. bovis, B. bigemina e A. marginale em 108 búfalos d’água (50 bezerros e 58 fêmeas adultas), naturalmente infestados com o carrapato R. (B). microplus, oriundos de fazendas localizadas em áreas endêmicas para as babesioses no estado de São Paulo. Foram colhidas amostras de sangue dos capilares auriculares para confeccção de esfregaços em lâminas de vidro e sangue da veia caudal para extração de DNA e determinação do volume globular (VG) pela técnica do microhematócrito. A técnica de espectroscopia de impedância eletroquímica foi realizada com o soro dos bovinos, com o objetivo de diferenciar animais saudáveis dos animais infectados com B. bovis. Para tanto, antígenos provenientes de cultura foram imobilizados em eletrodos de ouro (150 nm de espessura) dando origem a um dispositivo biossensor utilizando o composto [Fe (CN)6]3-/4-como prova redox. Os esfregaços de sangue periférico foram corados com May Grunwald-Giemsa para a pesquisa dos hemoparasitas por meio de microscopia óptica. As extrações de DNA foram feitas usando o Easy-DNATM Kit (Invitrogen). Foram testados protocolos de amplificação do DNA com primers específicos para B. bigemina, B. bovis e A. marginale por meio de Nested PCR (nPCR) e PCR em tempo real quantitativo (qPCR), usado para estimar o número de cópias (NC) do gene do citocromo b (mt-cytB) de ambas as babesias e do gene de superfície 1b (msp1b) de Anaplasma em todas as amostras. Foram visualizados merozoítas de B. bigemina nos esfregaços sanguíneos de três bezerros do rebanho de Alambari (todos com menos de 0,1 de parasitemia). As técnicas moleculares, nPCR e qPCR foram mais sensíveis para a detecção dos parasitas que o exame direto das lâminas, sendo que as frequências de infecção foram de 20.37% e 100% para B. bovis e 59.26% e 100% para B. bigemina, respectivamente. O NC do gene do mt-cytB de B. bovis e B. bigemina mostrou efeitos significativos (p<0.05) para rebanho-idade, espécies e sua interação. Os valores de NC foram superiores (p≤0.05) para B. bovis (2.81 ± 0.07) quando comparado a B. bigemina (2.61 ± 0.07) e A. marginale (0.57 ± 0.07). Estes dados sugerem uma elevada frequência de infecção por B. bovis e B. bigemina na população de búfalos estudada. Os testes preliminares do dispositivo de diagnóstico da infecção por B. bovis mostraram alterações na impedância do sistema usado e evidenciaram claramente que o biossensor é capaz de diferencia/detectar os animais infectados, podendo ser explorado para a detecção rápida da B. bovis e estendido também para a detecção de outros parasitas.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-22Bitstream added on 2014-06-13T20:30:44Z : No. of bitstreams: 1 pizauro_ljl_me_jabo.pdf: 778689 bytes, checksum: a96c01e32d69a414f6936810c8b64538 (MD5) / O presente estudo objetivou realizar o exame microbiológico, a contagem de células somáticas (CCS) e o perfil bioquímico do soro lácteo de amostras de leite de 30 búfalas da raça Murrah, primíparas (G1), com duas a três lactações (G2) e com mais de três lactações (G3) que foram acompanhadas mensalmente durante uma lactação completa (270 dias). Antes da colheita das amostras de leite foi realizado o exame físico da glândula mamária, teste da caneca de fundo escuro e California Mastitis Test (CMT). Após a assepsia dos tetos, foram colhidas, amostras de 20 mL de leite de cada quarto mamário, em frascos esterilizados e sem conservante, para o isolamento microbiológico, perfil bioquímico e o fracionamento proteico em SDS-PAGE, e amostras de 30 mL de leite de cada quarto mamário em frascos plásticos esterilizados contendo conservante bronopol para realização da contagem de células somáticas (CCS), em contador automático. Adicionalmente, foi avaliado o perfil da sensibilidade antimicrobiana dos microorganismos isolados e a influência da pluviosidade sobre a ocorrência de mastite nos animais avaliados. Durante a lactação foi observado aumento da CCS, aumento das atividades das enzimas gamaglutamiltransferase (GGT) e fosfatase alcalina (ALP), aumento das concentrações de proteína total, albumina, fósforo (P), magnésio (Mg), cloretos (Cl), sódio (Na), imunoglobulina A (IgA), lactoferrina, albumina sérica, imunoglobulina G (IgG), α-lactoalbumina e redução das concentrações de cálcio total (Ca), ferro (Fe), cálcio ionizado (Cai), potássio (K) e b- lactoglobulina. As fêmeas primíparas (G1) apresentaram maior atividade das enzimas GGT e ALP e maiores concentrações de P, K e α-lactoalbumina. As fêmeas com duas a três lactações (G2) apresentaram maiores concentrações de proteína total... / The aims of the study were to perform the microbiological examination, somatic cell count (SCC), the biochemical profile, and protein fractionation of milk samples from 30 primiparous Murrah buffaloes (G1), with two or three lactations (G2) and over three lactations (G3). The animals were accompanied monthly during a complete lactation (270 days). Physical examination of the mammary gland, stip cup test, and California Mastitis Test (CMT) were performed for the diagnosis of clinical and subclinical mastitis before sampling. After quarters asepsis, 50 mL of milk samples were collected, each month, from each quarter in sterilized bottles without preservative for the microbiological isolation, biochemical profile, and protein fractionation in sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE), and 30 mL of milk samples from each quarter in plastic bottles sterilized containing bronopol for performing the somatic cell count (SCC) in electronic counter. In addition, were evaluated the antimicrobial sensitivity profile of the microorganisms isolated from milk samples, and the influence of dry or rainy weather on the incidence of mastitis in the animals. During lactation were observed increase in SCC, gammaglutamyltranferase (GGT) and alkaline phosphatase (ALP) activities, increase in total protein, albumin, phosphorus (P), magnesium (Mg), chlorides (Cl), sodium (Na), immunoglobulin A (IgA), lactoferrin, serum albumin, immunoglobulin (G), α-lactalbumin concentrations and decrease in total calcium (Ca), iron (Fe), ionized calcium (Cai), potassium (K) and b-lactoglobulin concentrations. The females of G1 showed higher GGT and ALP activity and higher concentration of P, K and α-lactalbumin. The females of G2 showed higher total protein, albumin,Mg, Cl, Fe, Na and lactoferrin concentrations The females of G3 showed... (Complete abstract click electronic access below)