Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-11-06T10:34:32Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1197204 bytes, checksum: e67ac91fc4ef323a7584307be5ae8443 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-06T10:34:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1197204 bytes, checksum: e67ac91fc4ef323a7584307be5ae8443 (MD5) Previous issue date: 2018-07-31 / Objetivou-se com esse trabalho avaliar o perfil de fermentação e a utilização de silagens de leguminosas em dietas de bovinos de corte. Para isso, foram conduzidos três experimentos. O primeiro experimento (capítulo I) foi realizado para avaliar o perfil fermentativo, a composição química e as populações microbianas de silagens de alfafa tratadas com inoculantes microbianos (I) em dois cortes (C). Foi utilizado um esquema fatorial 4 × 2 (quatro inoculantes e dois cortes), em um delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições. Os inoculantes avaliados foram: 1. Sem inoculante (Controle); 2. Lactobacillus plantarum (AV 14.17); 3. Mistura de L. plantarum, L. brevis e P. acidilactici (Combo); e 4. Inoculante comercial (IC). Todos os inoculantes foram aplicados na taxa de 10 6 UFC/g MN de forragem. Os inoculantes usados nos tratamentos 2 e 3 foram selecionados de estudo prévio com silagens de alfafa. Os cortes foram realizados em janeiro (corte 1) e março (corte 2) de 2016. Foram usados os mesmos inoculantes e procedimentos para ensilagem em ambos os cortes. O menor pH foi encontrado para as silagens tratadas com a cepa AV 14.17, enquanto o teor de nitrogênio amoniacal foi maior para a silagem controle no corte 2. O pH e a concentração de nitrogênio amoniacal foram menores nas silagens do corte 2, com médias de 4,34 e 59,86 g/kg N total, respectivamente. No corte 2 a silagem tratada com a cepa AV 14.17 apresentou maior teor de carboidratos solúveis residual. Foi observada maior recuperação de matéria seca na silagem controle no corte 1 em relação ao corte 2 (974,4 vs. 950,4 g/kg MS). Na avaliação da composição química, o teor de matéria seca foi maior para as silagens tratadas com os inoculantes microbianos em relação à silagem controle e o teor de proteína bruta apenas diferiu entre os cortes, com maiores valores para o corte 2. Houve efeito de interação I × C sobre os teores de FDN e FDA. Silagens produzidas no corte 1 apresentaram menores valores de FDN e FDA quando tratadas com o inoculante comercial e o combo, respectivamente. O teor de NIDA não diferiu entre as silagens. Foi observado maior teor de ácido lático e menor teor de ácido acético nas silagens produzidas no corte 2. Houve efeito de interação I × C sobre a relação ácido lático: ácido acético, sendo registrado maior valor na silagem tratada com a cepa AV 14.17 no corte 2. Houve efeito de interação I × C na população de leveduras, com menor contagem para o inoculante comercial no corte 2. As contagens de bactérias láticas foram maiores e de fungos menores no corte 1. A cepa AV 14.17 reduz o pH e o teor de nitrogênio amoniacal e aumenta a relação ácido lático: ácido acético em silagens de alfafa produzidas em condições tropicais, apresentando potencial de uso como inoculante. Nos outros dois experimentos (capítulo II), foram avaliados a digestibilidade, fermentação ruminal, utilização do nitrogênio e o desempenho de bovinos de corte alimentados com dietas contendo silagem de Stylosanthes cv. Campo Grande (StS) ou de milho (SM) e dois concentrados, sem (C1) ou com farelo de soja (C2). Foi utilizada relação forragem: concentrado de 50:50, na base da matéria seca. No primeiro experimento, quatro bovinos com peso médio de 200 ± 15,7 kg, fistulados no rúmen e abomaso, foram distribuídos em delineamento em quadrado latino, em arranjo fatorial 2 × 2, sendo dois volumosos (StS ou SM) e dois concentrados (C1 ou C2). O experimento foi constituído de quatro períodos experimentais com duração de 16 dias cada. No segundo experimento, dietas semelhantes foram avaliadas em 48 bovinos da raça Nelore com peso médio de 358 ± 30 kg, distribuídos em arranjo fatorial 2 × 2, no delineamento inteiramente casualizado, com 12 repetições. O período experimental teve 99 dias de duração, dos quais 15 dias foram para a adaptação e 84 para a coleta de dados. No primeiro experimento, as digestibilidades ruminal, intestinal e total dos nutrientes não foram influenciadas pelas dietas (P > 0,05). Os consumos de CNF e NDT foram maiores (P < 0,05) para as dietas contendo SM. O consumo de FDNi foi maior para as dietas contendo StS (P < 0,05). Houve tendência (P < 0,10) de maior consumo de MS, PB, MO e FDN para as dietas contendo SM. O tipo de concentrado afetou o consumo de nitrogênio, sendo maior valor obtido para a dieta contendo C2 (P = 0,03). O balanço de nitrogênio foi maior para a dieta contendo SM (P = 0,047). Houve tendência (P < 0,10) de maior síntese de proteína microbiana para as dietas contendo SM e de interação para a eficiência microbiana, sendo maior para a SM com o C2. No segundo experimento, os consumos de MS, MO, PB e FDN foram afetados pelo concentrado, sendo maiores (P < 0,05) para o C2. Os consumos de FDNi e de EE foram maiores (P < 0,05) para as dietas com StS. As dietas contendo SM apresentaram maior consumo de CNF (P < 0,05) e tendência de maior consumo de FDN (P =0,06). A digestibilidade aparente total dos nutrientes não foi afetada (P > 0,05) pelas dietas. Os ganhos médios diários de peso e de carcaça foram maiores (P < 0,05) para as dietas contendo C2, com médias de 1,3 kg e 0,81 kg, respectivamente. No entanto, houve tendência (P = 0,07) de maior eficiência alimentar para as dietas contendo SM. O rendimento de carcaça não foi afetado (P > 0,05) pelas dietas. Desta forma, conclui-se que a StS não altera os GMD e GMDC em bovinos de corte na fase de terminação, podendo substituir a silagem de milho, sem alterar a amônia e o pH ruminal. No entanto, deve-se manejar a fonte de concentrado de forma a não prejudicar os parâmetros produtivos. / The objective of this work was to evaluate the fermentation profile and the use of legume silages in beef cattle diets. Three experiments were developed: The first experiment (chapter I) was carried out to evaluate the changes on the fermentation profile, chemical composition and microbial populations of alfalfa silages treated with microbial inoculants (I) in two cuts (C). The experiment was conducted according to the completely randomized design in a 4 × 2 factorial scheme (four microbial inoculants and two cuts), with four replicates. The inoculants evaluated were: 1. No inoculant (Control); 2. Lactobacillus plantarum (AV 14.17); 3. Mixture of L. plantarum, L. brevis and P. acidilactici (Combo); and 4. Commercial inoculant (CI). All inoculants were applied at the rate of 10 6 CFU/g fresh matter. The inoculants used in the treatments 2 and 3 were selected from a previous study with alfalfa silages. The cuts were performed in January (cut 1) and March (cut 2), 2016. The same inoculants and procedures were used for ensiling in both cuts. The silages treated with the strain AV 14.17 showed the lowest pH while ammonia nitrogen content was higher for the control silage in the cut 2. The pH and ammonia nitrogen concentration were lower in the silages produced in the cut 2, with averages of 4.34 and 59.86 g/kg total N, respectively. In the second cut, the strain AV 14.17 resulted in higher concentration of residual water-soluble carbohydrates in the silage. The dry matter recovery was higher in the control silage in the cut 1 compared to the cut 2 (974.4 vs. 950.4 g/kg DM). In the chemical composition evaluation, the dry matter content was higher for the silages treated with microbial inoculants compared to the control silage and the crude protein content was different only between cuts, where the cut 2 showed the highest value. The NDF and ADF contents were affected by the I × C interaction. The silages produced in the cut 1 showed lower values of NDF and ADF when treated with the commercial inoculant and the combo, respectively. The ADIN content did not differ between silages. It was observed higher lactic acid content and lower acetic acid content in the silages produced in the cut 2. There was an I × C interaction effect for the lactic acid to acetic acid ratio, with the highest value found for the silage treated with the strain AV 14.17 in the cut 2. There was an I × C interaction effect on the yeast population with the lower number for the commercial inoculant in the cut 2.The lactic acid bacteria number was higher and the mold number was lower for the silages in the cut 1. The strain AV 14.17 reduce the pH and ammonia nitrogen content and increase the lactic acid to acetic acid ratio in alfalfa silages produced in tropical regions, presenting potential of use as inoculant. In the other two experiments (chapter II) were evaluated the digestibility, ruminal fermentation, nitrogen utilization and performance of beef cattle fed diets containing Stylosanthes cv. Campo Grande silage (StS) or corn silage (CS) and two concentrates, without (C1) or with soybean meal (C2). A 50:50 forage: concentrate ratio was used, on a DM basis. In the first experiment, four bulls with an average initial body weight (BW) of 200 ± 15.7 kg, rumen and abomasum fistulated, were distributed to a latin square with a 2 × 2 factorial design, two silages (StS or CS) and two concentrates (C1 or C2). The experiment consisted of four experimental periods with a duration of 16 days each. In the second experiment, the same diets were evaluated and 48 Nellore bulls with an average initial BW of 358 ± 30 kg were distributed to a 2 × 2 factorial arrangement in a complete randomized design, with 12 replicates. The experimental period lasted 99 days: 15 days for adaptation and 84 days for data collection. In the first experiment, diets did not alter the ruminal, intestinal and total nutrient digestibility (P > 0.05). The NFC and TDN intake were higher (P < 0.05) for diets containing CS. The iNDF intake was higher for diets containing StS (P <0.05). There was a tendency (P <0.10) of higher intake of DM, CP, OM and NDF for diets containing CS. There was a concentrate effect on the nitrogen intake, and the diets containing C2 provided the highest value (P = 0.03). The nitrogen balance was higher for the CS-based diet (P = 0.047). There was a tendency (P < 0.10) of greater microbial protein synthesis for the CS-based diet and a S × C interaction for microbial efficiency, with higher value for the CS with the C2. In the second experiment, the C2 showed the highest values for DM, OM, CP and NDF intakes (P < 0.05). The iNDF and EE intakes were higher (P < 0.05) for the StS-based diet, while diets containing CS showed higher (P < 0.05) NFC intake and a tendency (P < 0.06) of higher NDF intake. The total apparent digestibility of the nutrients was not affected (P > 0.05) by diets. The ADG and CADG were higher (P < 0.05) for the diets containing the C2, with averages of 1.3 kg and 0.81 kg, respectively. The dressing was not affected (P > 0.05) by diets. The CS-based diet tended (P = 0.07) to improve feed efficiency. Thus, it is concluded that StS-based diet does not alter the ADG and CADG of beef cattle in the finishing phase, being able to replace corn silage diets without altering the ammonia and ruminal pH. However, the concentrate source must be handled in a way that does not affect production parameters.

O presente estudo teve por objetivo estudar os efeitos da interação genótipos x ambientes sobre as características peso à desmama, peso ao sobreano e ganho de peso da desmama ao sobreano em bovinos de corte da raça Nelore. Foram analisados 45.697 registros de peso à desmama ajustados para 205 dias (PD), 34.773 registros de peso ao sobreano ajustados para 550 dias (PS) e 34.753 registros de ganho de peso da desmama ao sobreano (GP), originários de três fazendas localizadas nas regiões sudeste e centro-oeste do Brasil. Os componentes de variância foram estimados utilizando-se o programa MTDFREML. Os dados foram submetidos a análises de duas formas distintas: primeiramente processaram-se análises de características únicas para os dados de cada fazenda e para conjuntos de dados formados por pares de fazendas. Em seguida, processaram-se análises de características múltiplas, em que a mesma característica foi considerada como variáveis distintas em cada par de fazendas. A partir da obtenção dos valores genéticos dos animais, foram calculadas as diferenças esperadas na progênie (DEPs) dos mesmos, bem como as correlações de Pearson entre os valores das DEPs dos touros para as três características estudadas. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade variaram de 0,17 a 0,33 para a característica PD, 0,31 a 0,48 para a característica PS e 0,11 a 0,32 para a característica GP. Os coeficientes de correlação genética encontrados variaram de 0,82 a 1,00, enquanto as correlações de Pearson entre as DEPs dos touros variaram de 0,89 a 0,99. Os resultados levam a sugerir pequeno ou nenhum efeito da interação genótipo x ambiente nos rebanhos incluídos neste estudo. / The objective of the present study was to evaluate the genotype x environment interaction effect on weaning weight, post-weaning weight and weight gain post-weaning in Nellore beef cattle herds. There were analyzed 45,697 data of weaning weight adjusted to 205 days (PD), 34,773 data of post-weaning weight adjusted to 550 days (PS) and 34,753 data of weight gain post-weaning (GP), which were collected from three farms localized in southwest and middle-east of Brazil. The variance components were estimated by MTDFREML. Those data were analyzed applying two different methods: the first proceeding was of considering single traits to the data of each farm and also to the data-set originated by pair of farms. The second method was performing the analysis of multiple traits once the same trait was considered as a distinct variable in each pair of farms. Since genetic values were obtained there were calculated the expected breeding values (EPD) of the sires as the Pearson correlations between the EPD values and the traits analyzed. The estimative of heritability coefficients ranged from 0.17 to 0.33, 0.31 to 0.48 and 11 to 0.32 to PD, PS and GP respectively. The genetic correlations varied from 0.82 to 1.00, while the Pearson correlation between the EPDs ranged from 0.96 to 0.99. The results suggest a modest or inexistent genotype x environment interaction effect in the herds evaluated.

O presente trabalho teve como objetivo avaliar os efeitos da introdução da linhagem materna, representando a herança mitocondrial, no modelo de avaliação genética para características de desenvolvimento (peso ao nascer, aos 120 dias, a desmama, ao ano e ao sobreano), perímetro escrotal e temperamento de um rebanho Nelore. O banco de dados era composto pelo registro de produção de 24.498 animais e o de genealogia, de 27.476. Com o intuito de estimar componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos, os dados foram analisados sob dois modelos, o primeiro igual ao atualmente utilizado nas avaliações genéticas desse rebanho, e o segundo incluiu o efeito de linhagem materna como efeito aleatório. A linhagem materna foi obtida traçando-se a partir de uma fêmea, uma linha até a última fêmea com registro no banco de dados, considerando-a uma fundadora. Dentre as características analisadas, o efeito de linhagem materna foi significativo (P < 0,05) somente para peso à desmama. Para essa característica, o efeito de linhagem materna foi responsável por grande alteração do "ranking" dos 1000 melhores animais, tanto para machos quanto para fêmeas. A variação entre as linhagens maternas pode promover diferenças de mais de 22 kg no peso a desmama, o que corresponde a 12,9% da média fenotípica / The present work had the objective to evaluate the effect of the introduction of the maternal lineage, representing the mitocondrial inheritance, in the model of genetic evaluation for growth characteristics (weights at birth, 120 days, weaning, year and 18 months), scrotal perimeter and temperament of one Nelore herd. The data base was composed of 24.498 animals and pedigree, of 27.476. With intention of estimating the (co)variance components and genetic parameters, data were analyzed under two models: first the equal one that currently used in the genetic evaluations of this herd and second that included the maternal lineage effect as random effect. The maternal lineage was gotten tracing itself from a female, a line until the last female with register in the data base, considering she as a founder. Amongst the analyzed characteristics, the maternal lineage effect was significant (P < 0,05) only for weight weaning. For this characteristic, the maternal lineage effect was responsible for great alteration in the ranking of the 1000 better animals, as much for males and females. The variation of the maternal lineages can promote difference of more than 22 kg in the weight at weaning, corresponding to 12,9% of the phenotypic mean

A tendência atual, imposta pela competitividade do mercado, exige bovinos mais eficientes e adequados ao sistema de produção, visando atender a demanda pela qualidade de carne. Em função disso, o melhoramento genético vem sendo utilizado, de forma a incrementar a eficiência dos rebanhos, proporcionando assim, maior rentabilidade ao sistema. Assim, o presente estudo foi conduzido com o propósito de estudar a variabilidade da progênie de touros submetidos à avaliação genética, através da análise das Diferenças Esperadas na Progênie (DEP) dos filhos de 359 reprodutores. As DEP das progênies foram estimadas por procedimentos REML e as avaliações de touros por metodologias alternativas, foram realizadas com o auxílio do software SAS. Foram utilizados 45.014 dados de peso à desmama (PD), 45.014 de peso ao sobreano (PS) e 45.014 de ganho de peso da desmama ao sobreano (GP) de bovinos de corte da raça Nelore, criados em uma fazenda em região tropical do Brasil. As DEPs dos touros foram estimadas de acordo com três métodos: uso da média aritmética, média harmônica acrescida da média da característica estudada e média harmônica simples. Os resultados sugerem que o uso da média harmônica na estimação de DEPs com o objetivo de ajustar o valor genético aditivo de um touro para a dispersão dos valores genéticos de suas progênies não trouxe diferenças importantes em relação à estimativa pela média aritmética, na população estudada. No entanto, dadas as implicações e importância de novas metodologias, são necessários maiores estudos em busca de se encontrar uma metodologia que permita maior uniformidade das progênies de touros. / The strong competition in beef market imposed an actual trend of searching for quality in beef production systems, trying to attend the consumers\' demand. Due to the necessity of increasing productivity, animal breeding programs have been utilized to increase cattle efficiency, offering more profitability to the production system. The present study was carried out to contribute to knowledge about sires\' progeny variability, using Expected Progeny Difference (EPD) from calves of 359 sires. EPD\'s were estimated by REML procedures. The prediction od bull\'s EPD\'s were performed by software SAS, using 45,014 data of weaning weight (PD), 45,014 of post-weaning weight (PS) and 45,014 of weight gain post-weaning (GP) from Nellore beef cattle, raised in a tropical area of Brazil. Those data were analyzed according with three methods: application of arithmetic mean, harmonic mean of EPD added by trait mean and only harmonic mean. Results suggested that estimation of EPDs using harmonic mean on condition that adjust sire\'s additive genetic value to dispersion form its calves\' genetic values did not make difference to the prediction trough arithmetic mean in the population studied. Due to the implications and importance of alternative methods to adjust bull\'s EPDs to variability of progeny, further studies are necessary to search for better progeny\'s uniformity.

O objetivo do trabalho foi avaliar o desempenho de novilhos Nelore mantidos em pastagem de Brachiaria decumbens, suplementados com três tipos de aditivos, usados como promotores de crescimento na época das águas, durante 112 dias. Foram utilizados 60 bezerros da raça Nelore, com 12 meses de idade e 259,2 &plusmn; 10,68 kg de peso corporal médio. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, com quatro tratamentos (15 animais cada): controle (mistura mineral), mistura mineral com monensina (1.000 mg kg-1), mistura mineral com salinomicina (1.111 mg kg-1) e mistura mineral com flavomicina (333 mg kg-1). Os animais foram divididos em quatro piquetes de Brachiaria decumbens (com 6,7 ha) e submetidos a rodízios semanais. Foram avaliados consumo de suplemento, composição do pasto, desempenho e análise econômica. Os dados foram analisados pelo PROC GLM do SAS (2009) e as médias comparadas pelo teste de Tukey a 5% de significância. O consumo de suplemento mineral dos tratamentos com salinomicina e monensina foram menores em 27,5 e 38,8 %, respectivamente, em relação ao tratamento controle (P &lt;0,01). Não houve diferença no ganho de peso dos animais que receberam aditivos e esses foram maiores que o tratamento controle (P &lt;0,01). A suplementação mineral com monensina, salinomicina e flavomicina apresentou menor custo por arroba produzida em referência ao controle de 53,5; 42,1 e 18,3%, respectivamente. A eficiência do suplemento com flavomicina, salinomicina e monensina foi 56,1%; 88,2% e 142,3% maior em relação ao controle respectivamente. Foi concluído que a adição de monensina, salinomicina e flavomicina no suplemento mineral de bovinos Nelore, em pastagem de Brachiaria decumbens na época das águas, melhora o desempenho dos animais e aumentou o retorno econômico. / The objective of this research was to evaluate the performance of Nellore steers grazing on Brachiaria decumbens, supplemented with three types of additives used as growth promoters in the rainy season for 112 days. The total of 60 Nellore calves with 12 months and 259.2 &plusmn; 10.68 kg of body weight were divided randomly in four treatments (15 animals each one): control (mineral supplement mixture), mineral supplement with monensin (1000 mg kg-1), mineral supplement with salinomycin (1111 mg kg-1) and mineral supplement with flavomycin (333 mg kg-1). The animals were divided into four paddocks of Brachiaria decumbens (with 6.7 ha) and subjected to weekly rotation. It was evaluated the supplement intake, pasture composition, performance and economic analysis. Experimental data were analyzed using PROC GLM of SAS (2009) and the means was compared by Tukey test at 5% significance. The consumption of mineral supplement of the treatments with monensin and salinomycin were 27,5 % and 38,8 %, respectively, lower than the control (p &lt;0,01). There was no difference in weight gain of the animals supplemented with additives but their gain was higher than the control treatment (P &lt;0.01). The mineral supplementation with monensin, salinomycin and flavomycin presented less cost of meat production in reference to the control of 53,5; 42,1 and 18,3 %, respectively. The feed efficiency of the supplement with flavomycin, salinomycin and monensin was 56.1%; 88.2% and 142.3% higher than the control respectively. It was concluded that the feed additives increased the animal performance and the profit.

A reatividade, considerada como uma característica comportamental apresentada pelos bovinos diante das práticas de manejo, mais evidente nos animais de raças zebuínas, em associação com medidas fisiológicas pode se mostrar como um indicativo de estresse, dor ou desconforto, além de estar intimamente relacionada a diversas respostas produtivas apresentadas pelos animais dessa espécie. Desse modo, há necessidade de agregar essa característica, facilmente observável, ao conjunto de fatores que determinam o desempenho do animal. Para tanto, o presente estudo teve como objetivo avaliar a reatividade de novilhos Nelore confinados em dois diferentes sistemas (Curral ou Baia como tratamentos), e sua relação com o cortisol plasmático, temperatura corporal e desempenho. Foram avaliados 36 novilhos quanto às reatividades apresentadas durante o manejo de pesagem, a cada 28 dias, utilizando uma escala de Escores de Reatividade (ER) variando de 1 a 5, sendo 1 o valor atribuído ao animal mais calmo e o 5, ao animal mais reativo. Também foram coletadas amostras de sangue para posterior dosagem do cortisol plasmático, além do acompanhamento dos ganhos de peso durante todo o período. Não foram encontradas diferenças significativas da reatividade quanto ao sistema de alojamento, porém houve uma relação desse mesmo parâmetro com o tempo de permanência no confinamento para os animais nos dois tratamentos. A reatividade, quando relacionada aos valores de cortisol, não foi diferente entre os tratamentos, entretanto, esse resultado foi significante dentro do grupo dos animais alojados em Baias. O tempo de confinamento influenciou os níveis de cortisol apenas nos animais alojados em Curral. Os níveis de cortisol foram diferentes entre os tratamentos, e quando relacionados ao tempo de confinamento, evoluíram de forma inversa, tendo diminuído nas baias e aumentado nos currais. Não houve interação entre reatividade e desempenho ou entre reatividade e temperatura corporal, que foi influenciada pelos níveis de cortisol. / Reactivity as a behavioural trait of bovines presented during the handling and more obviously in Zebu cattle, in association with physiological measures can reveal as an indicative of stress, pain or discomfort, beyond being strongly related with several productive answers presented by the animals of this specie. Therefore, it is necessary to add this trait to the group of responsible factors for animals\' performances. The present study was conducted to evaluate the reactivity of Nellore steers in different feedlot systems (Stockyard and Individual pen as treatments) and its relationship with plasmatic cortisol, body temperature and performance. Thirty six Nellore steers had their reactivity evaluated during routine weighing. Blood samples were collected for cortisol analyses and the weight gains were measured during all the period. The results showed that the reactivity score did not differ between feedlots systems but there was a relation of this trait with feedlot time. There was no difference between reactivity and cortisol levels for the treatments, but this result was significant inside of the stall animals group. Feedlot time influenced the cortisol levels only for the stockyard steers. Cortisol levels differed between treatments, having increased in stalls animals and decreasing in stockyard animals. No interactions were presented between reactivity and performance, or reactivity and corporal temperature, but this last trait presented relation with cortisol levels.

A questão central dessa tese é entender as razões e a natureza das falhas de coordenação em sistemas agroindustriais complexos. A temática de falhas de coordenação é um problema multifacetado e complexo, representando um desafio para pesquisadores. Uma observação crítica das organizações leva à conclusão de que as falhas organizacionais, faceta visível das falhas de coordenação, são a regularidade no mundo organizacional. Essa constatação instiga e justifica esta pesquisa, sendo seu objeto de estudo a transação entre o produtor rural e a indústria frigorífica no Sistema Agroindustrial (SAG) da carne bovina. Especificamente, buscou-se estudar a razão e a natureza das falhas organizacionais a partir de diferentes aportes teóricos, com foco nas falhas de natureza institucional e informacional. Analisou-se o papel das instituições formais e informais para a resolução dos conflitos no SAG da carne bovina e as falhas na transmissão de incentivos ao longo de subsistemas de qualidade. Com base no suporte teórico oferecido pela Nova Economia Institucional, especialmente a Economia dos Custos de Transação, a Teoria do Agente-Principal e a Teoria dos Custos de Mensuração, desenvolveu-se três ensaios: dois ensaios empíricos e um ensaio teórico. O ensaio teórico explorou os determinantes da cooperação e das falhas de coordenação sob diferentes lentes e discutiu-se a necessidade de uma Teoria das Falhas. Um constructo analítico foi proposto e as dimensões de ordem institucional e informacional foram posteriormente exploradas nos ensaios empíricos. No primeiro ensaio empírico, considerou-se a dimensão institucional das falhas e investigou-se a falta de garantias na transação produtor indústria frigorífica no mercado spot. Analisou-se a cadeia de garantias da transação e, por meio de um modelo de regressão logit ordenado, investigou-se a relação da percepção de risco dos produtores com o padrão da transação e das suas garantias. No segundo ensaio empírico, baseado na dimensão informacional das falhas, analisou-se o papel das instituições formais e informais como mecanismos de incentivos não pecuniários em subsistemas estritamente coordenados. Para tanto, desenvolveu-se um modelo analítico matemático e um modelo estratégico (jogo). Como consideração final, destacou-se a necessidade de uma Teoria das Falhas que contemple de modo integrativo todas as nuances desse fenômeno recorrente no mundo das organizações as falhas organizacionais. Concluiu-se, também, que as instituições formais e informais são variáveis relevantes para a minimização da ocorrência das falhas, seja por oferecer garantias à transação ou por representar mecanismos não pecuniários para a transferência de incentivos em subsistemas coordenados. / The core aspect of this thesis is the understanding of the reasons and the nature of coordination failures in complex agrisystems. The issue of coordination failure is a multifaceted and complex problem, posing a challenge to researchers. A critical observation of the real world leads to the conclusion that organizational failures, which are the observable face of coordination failures, are the regularity. This finding encourages and justifies this research. The object of analysis is the transaction between the farmer and the meatpacking industry in the beef agrisystem. The aim of this research is to study the reason and the nature of organizational failures from different theoretical frameworks, focusing on the institutional and the informational dimensions. The role of formal and informal institutions for conflict resolution in the beef system and the failures in the transmission of incentives along a quality subsystem were analyzed. Based on the theoretical support provided by New Institutional Economics, especially the Economics of Transaction Costs, the Principal-Agent Theory and the Theory of Measurement Cost, three papers were developed: two empirical and one theoretical. The theoretical one explored the determinants of cooperation and coordination failures from different lenses and discussed the need for a \"Theory of Failure.\" An analytical construct was proposed and the institutional and the informational dimensions were subsequently explored in empirical essays. In the first empirical essay, the institutional aspect was tackled and the lack of guarantees in the transaction under spot market coordination was investigated. The chain of guarantees of the transaction was analyzed and an ordered logit regression model was developed to investigate the producers risk perception related to the transaction and the guarantee pattern. In the second empirical essay, which was based on the informational dimension of failures, the role of formal and informal institutions as non-pecuniary incentive mechanisms in strictly coordinated subsystem was studied. For this purpose, an analytical mathematical model and a strategic model (game) were developed. As a final consideration, the need for a \"Theory of Failure\" was stressed. This theory might encompass in an integrated way all the aspects of this recurrent phenomenon of the world of organizations - the organizational failures. Also, it was concluded that formal and informal institutions are important variables to minimize the occurrence of failures, either by offering guarantees to the transaction or by representing mechanisms for non-pecuniary incentives along a coordinated subsystem.

The present study has as objective to evaluate the effect of the inclusion in the model of analysis, the covariance between the additive genetic direct and maternal effects, on the estimation of genetic parameters for average daily gain from birth to weaning (GMDND) and from weaning to 550 days of age (GMDDS), and on the prediction of genetic values and rank of the animals, for Angus and Brangus breeds. The data were furnished by Gensys Consultores Associados S/C Ltda. and Natura Genética Sul Americana, and contained records from animals created in many farms, in different regions of Brazil and they were collected from 1968 and 2002. They were estimated genetic parameters and predicted genetic values for average daily gain from birth to weaning (GMDND) and from weaning to 550 days of age (GMDDS), for the two populations. In paper 1, they were studied 11,202 and 4,665 records of Angus breed animals, respectively for GMDND and for GMDDS. The genetic direct and maternal heritability coefficients and genetic values were obtained using the (co)variance components obtained by Restricted Maximum Likelihod Method by Boldman et al. (1995). It was adopted an animal model, considering GMDND as a function of the random effects additive genetic direct, maternal and residual and of the fixed effects of contemporaneous group at weaning (GC205), and the covariables, age at weaning (ID) and age of the cow at parturition (IV), linear and quadratic effects; for GMDDS, the model was the same, only substituting the fixed effects GC205 by contemporaneous group at 550 days of age (GC550) and ID by age at 550 days of age (IS). Each model was used for two analyzes, one do not including the genetic-maternal covariance, equal to zero and the other one, including the covariance previously estimated. I the two analysis, it was included in the model the permanent environment effect of the cow. The animals were ranked according to their genetic values in the two analysis (with and without the inclusion of the covariance between the additive genetic direct and maternal effects) with the objective of to evaluate the correspondence among the ranks getting from the different models. The genetic direct heritabilities were .21 and .55, and the maternal ones were .00 and .22, respectively, including and do not the covariance in the model. The correlations between genetic direct and maternal effects were negatives for GMDND and for GMDDS. It is recommended the inclusion of the covariance in the model, for GMDND because it can change the value of the estimative. The correlation between the ranks of the genetic values (.88 P<0,0001) suggest to occur an alteration in the ranks of the animals for GMDND. In paper 2, for Brangus breed, it were studied 28,949 and 11,884 records, respectively for GMDND and GMDDS. The components of (co)variance used to estimate additive direct and maternal heritabilities and to predict the genetic values were obtained by Restricted Maximum Likelihood Method and the computational program MTDFREML by Boldman et al. (1995). The animal model adopted for GMDND, considered as random, the additive genetic direct and maternal and residual effects, and as fixed, the effects of contemporaneous group at weaning (GC205) and the interaction of the percent of Nellore blood of the bull and cow (INTV), and the covariables age of the cow at parturition (ID) and age at weaning (ID). It was used as random, the permanent environmental effect of the cow. Each model was used for two analysis, one considering the genetic direct and maternal covariance effects, previously estimated and the other considering it equal to zero. The animals were ranked according to their genetic values to evaluate the correspondence of the ranks generated by different models. The genetic direct heritabilities were .14 ± .03 and .21 ± .01 and the maternal ones were .00 ± .01 and .15 ± .02, respectively including and do not, the covariance. The correlations between additive genetic direct and maternal effects were negatives for GMDND (-.25 ± .12) and for GMDDS (-.77 ± .19). It is recommended the inclusion of the covariance in the model because that can change the values of the estimative. The correlation, for GMDND (0,89 P<0,0001), suggest that occur light changes in the ranks of the animals. / O presente estudo teve como objetivo estudar o efeito da inclusão da covariância entre os efeitos genéticos diretos e maternos, no modelo de análise, sobre a estimação de parâmetros genéticos para ganho de peso do nascimento a desmama (GMDND) e da desmama ao sobreano (GMDDS), sobre a predição de valores genéticos e no ordenamento dos animais, em duas populações, uma da raça Angus e outra da raça Brangus. O arquivo de dados foi fornecido pela Gensys Consultores Associados S/C Ltda. e Natura Genética Sul Americana, e continha informações de desempenho de animais criados em diversas fazendas, localizadas em diferentes regiões do Brasil, coletadas no período entre 1986 e 2002. Foram estimados parâmetros genéticos e preditos valores genéticos para Ganho Médio Diário do Nascimento a Desmama (GMDND) e Ganho Médio Diário da Desmama ao Sobreano (GMDDS), para as duas populações. No artigo 1, foram estudados 11.202 e 4.665 registros de desempenho de animais para da raça Angus para GMDND e GMDDS, respectivamente. As herdabilidades direta e materna e os valores genéticos, foram obtidos utilizando os componentes de (co)variância estimados pelo método da Máxima Verossimilhança Restrita Livre de Derivada, com o programa computacional MTDFREML, descrito por Boldman et al. (2001). Foi adotado um modelo animal que considerou GMDND como função dos efeitos aleatórios genéticos aditivos diretos e maternos e residual e dos efeitos fixos de Grupo de Contemporâneos a Desmama (GC205), além das covariáveis, Idade a Desmama (ID) e Idade da Vaca ao Parto (IV), efeitos linear e quadrático; para GMDDS, o modelo foi o mesmo, apenas substituindo os efeitos fixos de GC205 por Grupo de Contemporâneos ao Sobreano (GC550) e ID por Idade ao Sobreano (IS). Cada modelo foi utilizado em duas análises, uma incluindo a covariância entre os efeitos genéticos diretos e maternos, previamente estimada e a outra, considerando esta covariância igual a zero. Nas duas análises, foi incluído no modelo o efeito aleatório de ambiente permanente da vaca. Após a predição dos valores genéticos, em separado para cada modelo, foi obtida a correlação de ordenamento entre estes valores, com o objetivo de avaliar a correspondência entre as classificações dos reprodutores com os diferentes modelos de análise. As herdabilidades diretas estimadas para GMDND foram 0,25 ± 0,03 e 0,55 ± 0,08 sem e com a inclusão da covariância respectivamente, e as maternas foram 0,07 ± 0,02 e 0,22 ± 0,04, respectivamente não incluindo e incluindo a covariância no modelo de análise. Para GMDDS, as herdabilidades diretas estimadas para foram de 0,21 ± 0,07 a 0,22 ± 0,08 sem e com a inclusão da covariância, respectivamente, e as herdabilidades maternas foram de 0,00 ± 0,04 a 0,00 ± 0,06, respectivamente não incluindo e incluindo a covariância no modelo de análise. As correlações entre os efeitos direto e materno foram negativas, tanto para GMDND quanto para GMDDS. Recomenda-se a inclusão da covariância nos modelos de análise para GMDND, visto que, houve alteração do valor das estimativas com a inclusão desta. A correlação ente o ordenamento dos valores genéticos (0,88 P<0,0001) sugere haver leve alteração na ordem de classificação dos animais para GMDND. No artigo 2, para a raça Brangus, foram estudados 28.949 e 11.884 registros de desempenho, respectivamente para GMDND e GMDDS. Os componentes de (co)variância utilizados para estimar as herdabilidades direta e materna e predizer os Valores Genéticos foram obtidos pelo método da Máxima Verossimilhança Restrita Livre de Derivada, com o programa computacional MTDFREML descrito por Boldman et al. (1995). O modelo animal adotado para GMDND considerou como aleatórios, os efeitos genéticos aditivos diretos, maternos e residual, como fixos, os efeitos de Grupo de Contemporâneos ao Desmame (GC205) e Interação Fração Gênica Nelore Touro-Vaca (INTV), além das covariáveis Idade da Vaca ao Parto (IV) e Idade a Desmama (ID), para GMDDS o modelo foi o mesmo, apenas substituindo GC205 por Grupo de Contemporâneos ao Sobreano (GC550) e ID por Idade ao Sobreano (IS). Foi utilizada como efeito aleatório o Ambiente Permanente da Vaca nos dois modelos. Cada modelo foi utilizado para duas análises uma considerando a covariância entre os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos igual a zero e a outra considerando o valor da covariância previamente estimado, diferente de zero. Foi feito o ordenamento dos animais através de seus valores genéticos, para avaliar a correspondência entre as classificações dos reprodutores para os diferentes modelos de análise. As herdabilidades diretas foram 0,14 ± 0,03 e 0,21 ± 0,03 e as maternas foram 0,00 ± 0,01 e 0,15 ± 0,02, respectivamente, não incluindo e incluindo a covariância. As correlações entre os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos foram negativas tanto para GMDND (-0,25 ± 0,12) quanto para GMDDS (-0,73 ± 0,19). Recomenda-se a inclusão da covariância nos modelos de análise, visto que, a inclusão desta, altera os valores das estimativas. A correlação encontrada (0,89 P<0,0001) sugere ocorrer alteração na ordem de classificação dos valores genéticos dos animais, conforme o modelo utilizado, para GMDND.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The objective of this study was to evaluate the best model for the genetic evaluation for the trait average daily gain of weaning to post weaning (ADGWP), of a multiple-breed Nellore and Angus population, comprised of 49.634 animals sired by 34.006 dams and 793 sire, born between 1986 and 2015. The genetic evaluation for this population was performed through the methodology of Bayesian inference with the animal model and the criteria of choice were the Number of Parameters (Np), Deviance Information (DIC) and the conditional predictive ordinate (CPO). In the first chapter three models were tested: Traditional Animal Model (TAM), Multiple-Breed Animal Model With (MBAMW) and without segregation (MBAMWS). Based on the selection criteria, the MBAMW was chosen because it presents better adjustments, besides presenting the smallest number of parameters, thus reducing the computational demand. In the second chapter, heteroscedastic multiple-breed models (HMBM) were tested. A 2×2 factorial scheme of two residual variance models (homoscedastic (HO) or heteroscedastic (HE)) was used based on two distributive assumptions (Gaussian (G) and Student’s t (T)). The HMBM-T-HE presented the best fit for the population in question. The Spearman's ordering correlations of the breeding values predicted for the sires were high when all animals were considered (0.93 to 0.99). However, when these sires were separated in TOP (10%) these correlations were reduced drastically (from 0.05 to 0.96). These results support the implementation of robust multibreed models that account for sources of heteroscedasticity to increase the accuracy of genetic assessments of multiple-breed populations. / Este estudo teve como objetivo avaliar o melhor modelo para a avaliação genética para a característica de ganho médio diário da desmama ao sobreano (GMDD) de uma população multirracial Nelore e Angus formada por 49.634 animais filhos de 34.006 matrizes e 793 touros, nascidos entre 1986 e 2015. A avaliação genética para esta população foi realizada através da metodologia de inferência Bayesiana por meio de um modelo animal e os critérios de escolha foram o Número de Parâmetros (Np), de Informação da Deviance (DIC) e Ordenada Preditiva (CPO). No primeiro capítulo foram testados três modelos: Modelo Animal Tradicional (MAT), Modelo Animal Multirracial sem (MAMRSS) e com segregação (MAMRCS). Com base nos critérios de escolha, o MAMRSS foi escolhido por apresentar melhores ajustes, além de apresentar o menor número de parâmetros, reduzindo assim a demanda computacional. No segundo capítulo foram testados modelos multirraciais (MAMR) homo e heteroscedástico. Foi utilizado um esquema fatorial 2×2 de dois modelos de variância residual (homoscedástica (HO) ou heteroscedástica (HE)) baseado em dois pressupostos distributivos (Gaussiano (G) e t de Student (T)). O MAMR-T-HE foi o que apresentou melhor ajuste para a população em questão. As correlações de ordenamento de Spearman dos valores genéticos preditos, para os reprodutores, foram altas quando consideradas todos animais (0,93 a 0,99). No entanto, quando separados estes reprodutores em TOPs (10%) estas correlações foram reduzidas drasticamente (de 0,05 a 0,96). Estes resultados apoiam a implementação de modelos multirraciais robustos que contabilizam fontes de heteroscedasticidade para aumentar a precisão de avaliações genéticas de populações multirraciais.

Considerando a importância econômica da precocidade sexual no sistema de produção de bovinos de corte, o objetivo deste estudo foi identificar regiões genômicas associadas a características reprodutivas tais como a prenhez precoce e número de folículos antrais em novilhas da raça Nelore, identificando processos biológicos envolvidos para um melhor entendimento da variabilidade fenotípica destas características. O banco de dados foi composto por 2.283 novilhas, filhas de 78 touros, provenientes de três fazendas comerciais do Brasil. Destas, 1.267 foram genotipadas com aproximadamente 74 K SNPs. Após análises de controle de qualidade, permaneceram informações de 1.255 animais e 64.800 marcadores. A informação genotípica de 42 touros também estava disponível e touros não genotipados com mais de 5 progênies genotipadas foram imputados para a mesma densidade de marcador das novilhas. Análises de associação genômica ampla (GWAS) foram utilizadas considerando uma metodologia Bayesiana (BayesB) para identificar potenciais janelas genômicas (~ 1 Mb) responsáveis pela explicação de &ge; 1% da variância genética das características. Essas regiões foram utilizadas para a pesquisa de genes bem como nas análises de enriquecimento utilizando os termos MeSH. Ainda, blocos haplotípicos dessas regiões genômicas foram ajustados como efeitos classificatórios no modelo BayesB, com o objetivo de estimar a influência de cada alelo dos touros heterozigotos sobre os fenótipos. Os coeficientes de herdabilidade preditos foram 0,28 ± 0,07 e 0,49 ± 0,09 para PP e NF, respectivamente, com correlação genética de -0,21 ± 0,29. Os resultados do GWAS apontaram janelas genômicas significativas nos cromossomos 5, 14 e 18 para PP e 2, 8, 11, 14, 15, 16 e 22 para NF. As análises de enriquecimento revelaram termos significativos (p &LT; 0,05) associados com PP: Munc-18 Proteins, Fucose e Hemoglobins, e com NF: Cathepsin B, Receptors-Neuropeptide e Palmitic Acid. Um total de 15 alelos haplotípicos tiveram efeitos diferentes (p &LT; 0,10) de sua cópia alternativa para PP e 16 para NF. As análises genômicas contribuíram para uma melhor compreensão da estrutura genética das características reprodutivas PP e NF, podendo colaborar com estratégias de seleção para melhoria dos índices reprodutivos de bovinos da raça Nelore. / Considering the economic importance of sexual precocity in beef cattle production system, the objective of this study was to explore genomic regions associated with heifer pregnancy (HP) and total number of antral follicle (NF) in a population of Nellore (Bos indicus) heifers. The dataset was composed by 2,283 animals, which were daughters of 78 sires, coming from three different commercial farms in Brazil. From these, 1,267 were genotyped with around 74 K SNP markers. After quality control analyses, the remained dataset was formed by 1,255 animals and 64,800 markers. Genotypic information of 42 sires was also available, and non-genotyped sires with more than five genotyped progenies in the dataset were imputed for the same marker density of the heifers. A Genome-wide Association Study (GWAS) was performed under a BayesB method to identify potential genomic windows (~1 Mb) that explained at least 1% of the total additive genetic variance of the traits. The pointed genomic regions were used in MeSH enrichment analyses as well as for genes searching. Haplotype blocks that span these potential genomic regions were fitted as classificatory effects in the BayesB model, aiming to estimate the effect of each allele of the heterozygous sires for these regions. The estimated heritabilities coefficients were 0.28 ± 0.07 and 0.49 ± 0.09 for HP and NF, respectively, with genomic correlation of -0.21 ± 0.29. The GWAS results pointed to significant genomic windows on chromosomes 5, 14 and 18 for HP and 2, 8, 11, 14, 15, 16 and 22 for NF. The MeSH enrichment analyses revealed significant (p &LT; 0.05) terms associated with HP: Munc-18 Proteins, Fucose and Hemoglobins, and with NF: Cathepsin B, Receptors-Neuropeptide and Palmitic Acid. The pointed regions by GWAS harbored important genes that can help explain the genetic basis of the considered traits. A total of 15 haplotype alleles obtained better results (p &LT; 0,10) than their alternative copy for HP and 16 for NF. The genomic analyses contributed to a better understanding of the genetic control of the reproductive traits HP and NF and can be useful to selection strategies in improving reproductive indices in Nellore cattle.