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Diagnose molecular do cancro bacteriano da videira causado por Xanthomonas campestris pv. viticola

Trindade, Loiselene Carvalho da January 2007 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2007. / Submitted by Luanna Maia (luanna@bce.unb.br) on 2009-03-09T12:48:41Z No. of bitstreams: 1 Tese_Loiselene Carvalho da Trindade.pdf: 3690145 bytes, checksum: 0c6bb1644820c1ea99648a03adf90c94 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2009-03-09T16:04:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_Loiselene Carvalho da Trindade.pdf: 3690145 bytes, checksum: 0c6bb1644820c1ea99648a03adf90c94 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-03-09T16:04:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Loiselene Carvalho da Trindade.pdf: 3690145 bytes, checksum: 0c6bb1644820c1ea99648a03adf90c94 (MD5) / A bactéria Xanthomonas campestris pv. viticola (Nayudu) Dye, agente do cancro bacteriano da videira, foi relatada pela primeira vez nas áreas irrigadas do Submédio do Vale São Francisco em Petrolina, Pernambuco, em 1998. A doença também foi identificada em Juazeiro, Bahia, e posteriormente no Piauí, no Ceará, Roraima e Goiás. O uso de material propagativo livre do patógeno tornou-se uma preocupação, uma vez que a ocorrência da bacteriose ainda esta restrita a essas regiões no país e existe o risco de disseminação para outras regiões produtoras no sul e sudeste do Brasil. Com o objetivo de desenvolver um método molecular para detecção e identificação dessa bactéria, três oligonucleotídeos iniciadores foram desenhados com base no seqüenciamento parcial do gene hrpB. As combinações de iniciadores Xcv1F/Xcv3R e RST2/Xcv3R foram testados quanto à especificidade e sensibilidade para detecção do DNA de X. campestris pv. viticola. Com os dois pares de iniciadores, a amplificação foi positiva com o DNA das 44 estirpes de X. campestris pv. viticola testados, com quatro estirpes da patovar mangiferaeindicae, e cinco estirpes de X. axonopodis pv. passiflorae. Contudo, a digestão dos produtos de PCR com HaeIII permitiu diferenciar as estirpes das três patovares. Nenhum dos dois pares de iniciadores amplificou o DNA de videira, de 20 bactérias não patogênicas da flora da videira, e de nove estirpes de outros sete gêneros de bactérias fitopatogênicas. A sensibilidade dos iniciadores Xcv1F/Xcv3R e RST2/Xcv3R foi de 10 pg e 1 pg de DNA purificado de X. campestris pv. viticola, respectivamente. O limiar de detecção de RST2/Xcv3R foi de 104 UFC/ml, mas empregando-se um segundo ciclo de amplificação com o iniciador interno Xcv1F, esse limiar foi reduzido para 102 UFC/ml. Os iniciadores foram testados na detecção da bactéria em pecíolos inoculados com a estirpe UnB 1186 e embora não se tenha tido sucesso na PCR com o extrato do macerado do tecido sintomático, foi possível detectar o patógeno usando-se lavado de placas após o crescimento por 72 h ou a partir de uma única colônia diluída em 200 l de água. A identidade da bactéria foi confirmada pela análise de RFLP, que gerou o padrão típico de X. campestris pv. viticola. Com o uso de nested-BIO-PCR utilizando dois ciclos de amplificação com os iniciadores RST2/Xcv3R e Xcv1F/Xcv3R foi possível detectar X. campestris pv. viticola em plantas assintomáticas e sintomáticas, coletadas em março de 2007, em Petrolina, PE. xiii Este método mostrou-se mais eficiente que a detecção direta, ou seja, sem uma etapa de enriquecimento em meio de cultura. Além disso, foi possível reduzir para 72 horas o tempo para detecção e identificação de X. campestris pv. viticola, tempo reduzido se comparado aos métodos convencionais. A alta similaridade observada entre as duas patovares, viticola e mangiferaeindicae de X. campestris foi comprovada através da análise de seqüências de nucleotídeos de diferentes regiões genômicas, ITS, 16S rRNA, hrpB6 e o gene do citocromo “b561-like”. Os resultados também sugeriram que as duas patovares estariam mais próximas filogeneticamente a X. campestris e X. axonopodis. Testes de inoculação cruzada em videira e mangueira mostraram a capacidade de X. campestris pv. mangiferaeindicae de infectar plantas de videira e confirmaram a patogenicidade de X. campestris pv. viticola à mangueira, quando a inoculação é feita por infiltração foliar. O estudo dos perfis plasmideais mostrou variabilidade entre as estirpes em relação ao número e tamanho dos plasmídeos, sendo o primeiro relato da presença de plasmídeos em X. campestris pv. viticola. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The bacterium Xanthomonas campestris pv. viticola (Nayudu) Dye, causal agent of grapevine bacterial canker, was first detected in Brazil in the irrigated areas of the São Francisco river basin, in Petrolina, State of Pernambuco, in 1998. The disease was also reported in Juazeiro, Bahia and later in the states of Piauí, Ceará, Roraima and Goiás. The use of pathogen-free propagative material has become an important concern, considering the restricted occurrence of this pathogen in the country and the risk of dissemination to other grapevine production regions in the south and southeast of the country. In order to develop a molecular method for detection and identification of this pathogen, three primers were designed based on the partial sequences of the hrpB gene. The primers combinations Xcv1F/Xcv3R and RST2/Xcv3R were tested for specificity and sensitivity in detecting X. campestris pv. viticola DNA. With the two sets of primers, amplification was positive with all 44 X. campestris pv. viticola isolates tested, 4 isolates of pathovar mangiferaeindicae and 5 of X. axonopodis pv. passiflorae. Digestion of PCR products with HaeIII allowed differentiation of these 3 pathovars. None of the primer pairs were able to amplify grapevine DNA, DNA from 20 non pathogenic bacterium from the grapevine microflora, or DNA from 9 isolates from 7 genera of plant pathogenic bacteria. Sensitivity of the primers Xcv1F/Xcv3R and RST2/Xcv3R was 10 pg and 1 pg of purified X. campestris pv. viticola DNA, respectively. The detection limit for RST2/Xcv3R was 104 UFC/ml, but this limit could be lowered to 102 CFU/ml with a second round of amplification using the internal primer Xcv1F. The primers were tested for detecting of X. campestris pv. viticola in grapevine petioles previously inoculated with strain UnB 1186, and although amplification was not possible using extracts of macerated plant tissue, detection was possible using agar plate washes after 72 h of growth, or from a single colony diluted in 200 l of water. Using Nested-BIO-PCR with two amplification rounds with RST2/Xcv3R and Xcv1F/Xcv3R primers, it was possible to detect X. campestris pv. viticola in both symptomatic and asymptomatic plants. This method was more effective than a method that employed direct detection from boiled macerated extracts with no previous enrichment on culture medium. The use of BIO-PCR reduced the time needed for detecting and identifying X. campestris pv. viticola to 72 hours, when compared to more traditional diagnostic methods. xv The high similarity observed between the two pathovars of X. campestris, viticola and mangiferaeindicae was cnfirmed by the analysis of nucleotide sequences from different genomic regions, ITS, 16S rRNA, hrpB6 and the cytochrome b561-like gene. The results also suggested that these two pathovars are phylogenetically related to X. campestris and X. axonopodis. Cross inoculation tests on grapevine and mango plants inoculation, showed the ability of X. campestris pv. mangiferaeindicae to infect grapevine and confirmed the pathogenicity of X. campestris pv. viticola to mango plants, when using the infiltration technique. Plasmid DNA extractions showed variability among strains of the two pathovars in plasmid number and size. This is the first report of plasmid occurrence in X. campestris pv. viticola.
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O papel do sistema de secreção do tipo VI (TSS6) bacteriano na ativação dos inflamassomas durante a resposta imunológica inata

Ribeiro, Dalila Juliana Silva 03 March 2017 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2017. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2017-05-03T17:13:16Z No. of bitstreams: 1 2017_DalilaJulianaSilvaRibeiro.pdf: 2929027 bytes, checksum: 1b32a05c986132c8e68368e458010955 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-05-16T17:10:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_DalilaJulianaSilvaRibeiro.pdf: 2929027 bytes, checksum: 1b32a05c986132c8e68368e458010955 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-16T17:10:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_DalilaJulianaSilvaRibeiro.pdf: 2929027 bytes, checksum: 1b32a05c986132c8e68368e458010955 (MD5) Previous issue date: 2017-05-16 / Infecções por Escherichia coli (E. coli) ainda são um problema de saúde pública graças ao seu alto potencial zoonótico e ao fato de que em muitos países ainda existem altos índices de mortalidade. Sistemas de secreção são descritos como importantes aparatos celulares para que bactérias sejam capazes de translocarem proteínas efetoras para células hospedeiras. Dentre as proteínas efetoras que compõe o sistema de secreção do tipo VI (SST6), destacam-se ClpV e IcmF, por sua importância em manter o SST6 funcional. Desta forma, o objetivo do presente trabalho foi analisar o papel do SST6 bacteriano, via ClpV e IcmF, na ativação dos inflamassomas durante a resposta imune inata. Através dos resultados observamos que o SST6 é crucial para a replicação intracelular de E. coli em macrófagos, modulando a secreção de citocinas, o metabolismo redox da célula e a ativação dos inflamassomas através da clivagem de caspase 1. As proteínas NLRP3 e as caspases 1 e 11 são necessárias para o aumento da secreção de IL-1β induzida por E. coli. Demonstramos que a presença das caspases 1 e 11, bem como do receptor NLRP3 podem atuar em outros processos e mecanismos celulares ativados durante a infecção por E. coli, como a apresentação de antígenos lipídicos, geração de espécies reativas de oxigênios, produção de óxidos nítrico e outras citocinas pró-inflamatórias. A ausência de componentes do inflamassoma favoreceu a replicação intracelular bacteriana assim como a colonização de órgãos vitais em camundongos como o fígado e o baço. Investigamos também o papel do metabolismo lipídico durante a infecção através da análise da biogênese de corpúsculos lipídicos e ainda constatamos que a replicação intracelular bacteriana está relacionada com a presença da enzima ácido graxo-sintase. Portanto o presente trabalho caracterizou os diferentes mecanismos celulares envolvidos durante a ativação da resposta imune inata frente à infecção com uma linhagem patogênica de E. coli focando no papel do sistema de secreção do tipo VI, através do uso de cepas onde suas proteínas efetoras são ausentes, e ainda a relevância de componentes do inflamassoma nesse processo. / Escherichia coli (E. coli) infections remains a public health problem since its higher zoonotic power and the fact that in a lot of countries there are still cases with mortality risk. Secretion systems are described as important cellular apparatus to make bacteria capable of translocate effectors proteins to the host cell. Among all proteins constituent of type six secretion system (T6SS) effectors proteins, ClpV and IcmF are highlighted due to their importance to maintain T6SS functional. Therefore, the aim of the present work was to analyze the role of T6SS through ClpV and IcmF in inflammasome activation during innate immune response. Taken together, odemonstrated that T6SS is crucial to control intracellular bacterial replication in macrophages by modulating cytokines release, cell redox metabolism and inflammasome activation through caspase 1 cleavage. The NLRP3 receptor, as well as caspases 1 and 11, are necessary to increase IL-1β release induced by E. coli. We showed that the presence of caspases 1 and 11 and NLRP3 can influence in other process and cellular mechanisms active during E. coli infection, such as, lipid antigen presentation, generation of oxygen reactive species, nitric oxide and other pro-inflammatory cytokines production. The absence of inflammasome components improved bacterial intracellular replication and the colonization of the liver and spleen in mice. We also investigated the role of lipid metabolism during infection through analyses of lipid droplet biogenesis and verified that intracellular bacterial replication can be associated with fatty acid synthase. Therefore, this work characterized the different mechanisms involved during innate immune response activation upon infection with a pathogenic strain of E. coli focusing in the role of bacterial T6SS, using strains where its effector proteins are absent, and the relevance of inflammasome components in this process.
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Avaliação da densidade de linfócitos T CD8+ em gastrites e adenocarcinomas gástricos de pacientes portadores ou não de infecção pelo Helicobacter pylori

Tavares, Joana Teresa Diniz Carvalho 12 December 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências Médicas, Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas, 2016. / Submitted by Camila Duarte (camiladias@bce.unb.br) on 2017-01-25T14:50:20Z No. of bitstreams: 1 2016_JoanaTeresaDinizCarvalhoTavares.pdf: 1200318 bytes, checksum: 088c387d6efc5a0aff32859681e72166 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-03-22T21:05:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_JoanaTeresaDinizCarvalhoTavares.pdf: 1200318 bytes, checksum: 088c387d6efc5a0aff32859681e72166 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-22T21:05:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_JoanaTeresaDinizCarvalhoTavares.pdf: 1200318 bytes, checksum: 088c387d6efc5a0aff32859681e72166 (MD5) / A infecção pela bactéria Helicobacter pylori ocorre em todo o mundo. Sua prevalência varia de acordo com o desenvolvimento de diferentes países e está associada a inúmeras doenças gástricas. A presença da bactéria na mucosa gástrica induz resposta inflamatória ativa que determina danos em diferentes graus: de atrofia, metaplasia intestinal, displasia e carcinoma gástrico, na presença ou não de bacilos detectáveis na mucosa. Estas manifestações estão associadas ao estabelecimento do câncer da mucosa gástrica. Após a inflamação aguda, pode ocorrer aumento da permeabilidade do epitélio gástrico, exposição contínua ao antígeno do H. pylori, recrutamento de células T e ainda a produção de anticorpos pelas células B. Desta forma, o presente trabalho teve como objetivo geral avaliar a densidade de linfócitos T CD8+ em gastrites e adenocarcinoma gástrico de pacientes portadores ou não de infecção pelo H. pylori. Para esta análise, foram utilizados 25 casos de gastrite inativa, 26 casos de gastrite ativa leve, 25 casos de gastrite ativa moderada e 14 casos de adenocarcinoma gástrico, amostras coletadas do período de março de 2014 a abril de 2016 dos arquivos do Laboratório de Imunopatologia de Brasília. Para verificar a expressão dos linfócitos T CD8+ nos casos estudados, foi realizado o teste de imunohistoquímica e as células imunomarcadas foram obtidas, utilizando o programa ImageJ (1.32j). A maioria dos casos de gastrite foi de pacientes do sexo feminino (71,2%) e nos casos de adenocarcinoma gástrico foram pacientes do sexo masculino (71,4%). Verificou-se a progressão da resposta inflamatória à colonização da mucosa gástrica pelo H. pylori. Foram identificados mecanismos de migração celular, aparentemente associados à liberação de antígenos do bacilo no microambiente estabelecido no curso da infecção. Averiguou-se a participação das células inflamatórias na erradicação de bacilos e a presença de linfócitos T CD8+ que podem aparentemente exercer duas funções, tanto modular a inflamação como participar de mecanismos ontogênicos. Estes resultados demonstram que a colonização da mucosa gástrica pelo H. pylori estabelece uma resposta inflamatória, além de promover alterações em subpopulações de linfócitos. Esses importantes mecanismos que participam do controle da erradicação dos bacilos também estão presentes no estabelecimento do carcinoma gástrico. / Helicobacter pylori infection occurs worldwide. Its estimate of agreement with the development of different countries and is associated with numerous diseases. The presence of the bacterium in the gastric mucosa induces an active inflammatory response that determines gastric mucosa damage in different degrees: atrophy, intestinal metaplasia, dysplasia and gastric carcinoma, in the presence or not of detectable mucosa bacilli. These manifestations are associated with the establishment of cancer of the gastric mucosa. After an acute inflammation, there may be an increase in the permeability of the gastric epithelium, a continuous exposure to the H. pylori antigen, a recruitment of T cells, and an antibody production on B cells. In view of this, to evaluate a density of CD8+ T lymphocytes in gastritis and gastric adenocarcinoma of patients with or without H. pylori infection. We analyzed 25 cases of inactive gastritis, 25 cases of moderate active gastritis and 14 cases of gastric adenocarcinoma, samples collected from March 2014 to April 2016 from the archives of the Laboratory of Immunopathology De Brasilia. To verify the expression of CD8+ T lymphocytes in the cases studied, the immunohistochemical test was performed and the immunolabellated cells were obtained using the ImageJ program (1.32j). Most cases of gastritis were female (71.2%) and cases of gastric adenocarcinoma were male patients (71.4%). A progression of the inflammatory response to H. pylori colonization of the gastric mucosa has been reported. Cell migration mechanisms were identified, apparently associated with the release of bacillus antigens without microenvironment established in the course of infection. There was a participation of inflammatory cells in the eradication of bacilli and a presence of CD8+ T lymphocytes that may apparently exert two functions as modulating an inflammation as participating in oncogenic mechanisms. These results demonstrate that colonization of the gastric mucosa by H. pylori is an inflammatory response, besides promoting the development in subpopulations of lymphocytes. These important mechanisms that participate in the control of eradication of bacilli are also present in the establishment of gastric carcinoma.
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Hematologia e histopatologia de tilápias (Oreochromis niloticus) vacinadas e desafiadas com Aeromonas hydrophila e Streptoccocus agalactiae

Barbuio, Roberto [UNESP] 27 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-27Bitstream added on 2014-06-13T20:56:03Z : No. of bitstreams: 1 barbuio_r_me_jabo.pdf: 356013 bytes, checksum: 21a3483e6b33a8f8dbad2f27d9a65cbb (MD5) / A intensificação dos sistemas aquicolas tem contribuído para o aumento da ocorrência das doenças infecciosas. Assim, o objetivo deste estudo foi analisar as alterações hematológicas e histopatológicas de tilápias (Oreochromis niloticus) vacinadas e desafiadas com Aeromonas hydrophila e Streptococcus agalactiae. Para tanto, peixes com pelo menos 15 gramas foram vacinados com 0,05 mL por peixe, na cavidade celomática entre as nadadeiras ventrais e foram mantidos por 21 dias para o desenvolvimento da imunidade. A indução da infecção foi realizada em períodos diferentes para cada bactéria, sendo após a vacinação, com 60 dias para Aeromonas hydrophila e 90 dias para Streptococcus agalactiae, com as respectivas concentrações de DL50. Após sete dias da inoculação foram coletados, de forma asséptica, fígado, rim, baço e cérebro dos peixes, a realização das provas bioquímicas e confirmação da presença das bactérias Aeromonas sp. e Streptococcus sp. e coleta do sangue para a contagem total dos leucócitos e trombócitos e diferencial dos leucócitos, da série vermelha foram analisados hematócrito, eritrócitos, VCM (Volume Corpuscular Médio), HCM (Hemoglobina Corpuscular Média) e CHCM (Concentração Hemoglobina Corpuscular Média), além dos testes bioquímicos de proteína total (PPT), colesterol, albumina, uréia, triglicérides, lactato e glicose e também foi realizado o reisolamento das bactérias. Ao término do período experimental ocorreram aumento nas variáveis hematológicas e bioquímicos do CHCM, globulinas e colesterol e a diminuição no hematócrito, VCM, leucócitos e lactato de tilápias infectadas por S. agalactiae e aumento nos parâmetros de leucócitos, globulinas e a diminuição dos trombócitos e colesterol de tilápias infectadas por A. hydrophila além de alterações histopatológicas em... / The intensification of aquaculture systems has contributed to the increased occurrence of infectious diseases. The objective of this study was to analyze the hematological and histopathological tilapia (Oreochromis niloticus) vaccinated and challenged with Aeromonas hydrophila and Streptococcus agalactiae To that end, with at least 15 fish were vaccinated with 0.05 grams mL per fish in between the coelomic cavity and ventral fins were maintained for 21 days for development of immunity. Induction of Infection was performed at different times for each bacteria, which after vaccination, 60 days and 90 days A. hydrophila to S. agalactiae, with respective concentrations of LD50. After seven days of inoculation were collected aseptically, liver, kidney, spleen and brain of fish carrying out the biochemical and confirmation of the presence of the bacteria Aeromonas sp. and Streptococcus sp. and blood collection for the total count of leukocytes and thrombocytes and differential leukocytes, red series were analyzed hematocrit, erythrocytes, MCV (Mean Corpuscular Volume) , MCH (Mean Corpuscular Hemoglobin) and MCHC (Mean Corpuscular Hemoglobin Concentration), in addition to biochemical assays of total protein (PPT), cholesterol, albumin, urea, triglycerides, and glucose and lactate was also performed reisolation of bacteria. At the end of the experimental period there was an increase in haematological and biochemical variables of MCHC, globulin and cholesterol and decrease in hematocrit, MCV and lactate tilapia infected with S. agalactiae and an increase in leukocyte parameters, globulin and the decrease of platelets and cholesterol tilapia infected with A. hydrophila as well as histopathological changes in skin, liver and kidney of... (Complete abstract click electronic access below)
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Hematologia e histopatologia de tilápias (Oreochromis niloticus) vacinadas e desafiadas com Aeromonas hydrophila e Streptoccocus agalactiae /

Barbuio, Roberto. January 2013 (has links)
Orientador: Oswaldo Durival Rossi Junior / Coorientador: Claudinei da Cruz / Banca: Marco Antonio de Andrade Belo / Banca: Eduardo Makoto Onaka / Resumo: A intensificação dos sistemas aquicolas tem contribuído para o aumento da ocorrência das doenças infecciosas. Assim, o objetivo deste estudo foi analisar as alterações hematológicas e histopatológicas de tilápias (Oreochromis niloticus) vacinadas e desafiadas com Aeromonas hydrophila e Streptococcus agalactiae. Para tanto, peixes com pelo menos 15 gramas foram vacinados com 0,05 mL por peixe, na cavidade celomática entre as nadadeiras ventrais e foram mantidos por 21 dias para o desenvolvimento da imunidade. A indução da infecção foi realizada em períodos diferentes para cada bactéria, sendo após a vacinação, com 60 dias para Aeromonas hydrophila e 90 dias para Streptococcus agalactiae, com as respectivas concentrações de DL50. Após sete dias da inoculação foram coletados, de forma asséptica, fígado, rim, baço e cérebro dos peixes, a realização das provas bioquímicas e confirmação da presença das bactérias Aeromonas sp. e Streptococcus sp. e coleta do sangue para a contagem total dos leucócitos e trombócitos e diferencial dos leucócitos, da série vermelha foram analisados hematócrito, eritrócitos, VCM (Volume Corpuscular Médio), HCM (Hemoglobina Corpuscular Média) e CHCM (Concentração Hemoglobina Corpuscular Média), além dos testes bioquímicos de proteína total (PPT), colesterol, albumina, uréia, triglicérides, lactato e glicose e também foi realizado o reisolamento das bactérias. Ao término do período experimental ocorreram aumento nas variáveis hematológicas e bioquímicos do CHCM, globulinas e colesterol e a diminuição no hematócrito, VCM, leucócitos e lactato de tilápias infectadas por S. agalactiae e aumento nos parâmetros de leucócitos, globulinas e a diminuição dos trombócitos e colesterol de tilápias infectadas por A. hydrophila além de alterações histopatológicas em... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The intensification of aquaculture systems has contributed to the increased occurrence of infectious diseases. The objective of this study was to analyze the hematological and histopathological tilapia (Oreochromis niloticus) vaccinated and challenged with Aeromonas hydrophila and Streptococcus agalactiae To that end, with at least 15 fish were vaccinated with 0.05 grams mL per fish in between the coelomic cavity and ventral fins were maintained for 21 days for development of immunity. Induction of Infection was performed at different times for each bacteria, which after vaccination, 60 days and 90 days A. hydrophila to S. agalactiae, with respective concentrations of LD50. After seven days of inoculation were collected aseptically, liver, kidney, spleen and brain of fish carrying out the biochemical and confirmation of the presence of the bacteria Aeromonas sp. and Streptococcus sp. and blood collection for the total count of leukocytes and thrombocytes and differential leukocytes, red series were analyzed hematocrit, erythrocytes, MCV (Mean Corpuscular Volume) , MCH (Mean Corpuscular Hemoglobin) and MCHC (Mean Corpuscular Hemoglobin Concentration), in addition to biochemical assays of total protein (PPT), cholesterol, albumin, urea, triglycerides, and glucose and lactate was also performed reisolation of bacteria. At the end of the experimental period there was an increase in haematological and biochemical variables of MCHC, globulin and cholesterol and decrease in hematocrit, MCV and lactate tilapia infected with S. agalactiae and an increase in leukocyte parameters, globulin and the decrease of platelets and cholesterol tilapia infected with A. hydrophila as well as histopathological changes in skin, liver and kidney of... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Propagação rápida de Manihot esculenta (Crantz), e reação de acessos de mandioca a Xanthomonas axonopodis pv.manihotis

Aquiles, Kleiton Rodrigues 24 March 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2014-12-03T17:01:58Z No. of bitstreams: 1 2014_KleitonRodriguesAquiles.pdf: 2095267 bytes, checksum: a5a328874de2a8c08c6fb43b020b5bde (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2014-12-04T19:07:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_KleitonRodriguesAquiles.pdf: 2095267 bytes, checksum: a5a328874de2a8c08c6fb43b020b5bde (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-04T19:07:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_KleitonRodriguesAquiles.pdf: 2095267 bytes, checksum: a5a328874de2a8c08c6fb43b020b5bde (MD5) / As raízes da mandioca são componente cotidiano da refeição de milhões de pessoas no mundo em vários países, devido a grande capacidade de armazenamento de amido em suas raízes. Porém, alguns fatores são limitantes como o baixo índice de multiplicação da cultura e suscetibilidade a bacteriose Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) em condições climáticas favoráveis ao desenvolvimento da doença. Os objetivos deste trabalho foram testar a capacidade de produção de mudas de mandioca utilizando manivas com diferentes idades de estacas pelo método de propagação rápida e avaliar a agressividade de três isolados de Xam provenientes de três regiões geográficas distintas do Brasil em genótipos de mandioca de mesa em condições de casa de vegetação. Os experimentos foram realizados na Estação Experimental de Biologia da Universidade de Brasília em uma estufa do tipo glasshouse. No experimento de propagação rápida, foram escolhidas no campo plantas vigorosas e sadias da variedade Americana BGMC 1246, para a retirada de pequenos fragmentos da rama dos seguimentos basal, intermediário e apical. As ramas foram cortadas em minimanivas com aproximadamente 6 cm de comprimento com duas gemas cada uma. Três minimanivas foram plantadas em vasos plásticos de 2L, contendo uma mistura de latossolo vermelho cultivado de cerrado (LV), areia, esterco bovino curtido e vermiculita; nas seguintes proporções 2: 1: 1: 1, respectivamente. Após o plantio, sobre cada vaso foi colocado um recipiente plástico transparente, funcionando como campânula para a manutenção da alta temperatura e umidade no interior dos vasos. Durante o experimento foi avaliado o número de brotos herbáceos, porcentagem de brotação, número de brotos enraizados, porcentagem de brotos enraizados, número de mudas aclimatadas e porcentagem de mudas aclimatadas produzida por cada minimaniva de duas gemas correspondente a cada tratamento.As características que mostraram diferenças significativas entre os segmentos testados foram o número de brotos herbáceos, porcentagem de brotação, número de brotos enraizados e número de mudas aclimatadas, sendo o segmento basal o mais indicados para a produção dessas caracteríticas comparada aos outros segmentos. No experimento de reação de acessos de mandioca a Xam, foram utilizados 17 acessos de mandioca, provenientes principalmente do banco de germoplasma da Embrapa Cerrados. Os materiais de propagação dos acessos passaram por um processo de triagem a fim de identificação de possíveis focos de contaminação pela bactéria Xam. Pequenos fragmentos de cada rama foram retirados e depositados em meio 523, sendo incubados com temperatura de 28 °C por 48 horas. Após esse período, foi verificado o crescimento de colônias nos fragmentos das ramas, sendo selecionado quatorze acessos que apresentaram índice de contaminação inferior a 15 %. As ramas dos acessos selecionados foram cortadas com duas gemas cada uma; sanitizadas e tratadas com hipoclorito de sódio (5%) e Agrimicina, respectivamente. Após a sanitização, três minimanivas foram plantas em cada vaso de 2L, sendo os vasos preenchidos com a mistura de latossolo vermelho, areia, esterco bovino curtido e vermiculita autoclavados. Quando os brotos apresentaram dez centímetros de altura foram cortados com estilete desinfetado, e colocados para enraizar em água. Três a quatros semanas após o início do enraizamento, os brotos enraizados foram transplantados em sacos de mudas contendo a mesma mistura autoclavada utilizada no plantio das minimanivas, sendo colocadas em bancadas de concreto no interior da casa de vegetação. As mudas foram transplantadas novamente em vasos plásticos de 2 L de capacidade quando atingiram altura de 25 cm. As estirpes de Xam foram recuperadas em meio 523 por 48 horas a temperatura de 28 °C em uma estufa. Logo após a recuperação, para cada estirpe foi preparada suspensão bacteriana com concentração 1x108 UFC.ml-1 determinada no espectrofotômetro com absorbância de 0,350 e comprimento de onda 550 nm. As plantas foram inoculadas nas folhas e hastes. A inoculação das folhas foi realizada utilizando uma tesoura esterilizada, após a imersão prévia na suspensão bacteriana, sendo cortados três folíolos em folhas diferentes por planta. A inoculação da haste foi realizada utilizando palitos de madeira esterilizados, imersos na suspensão bacteriana por dez minutos, sendo introduzido um palito por planta na gema da folha mais velha. Foram atribuídas notas aos sintomas individuais de mancha, murcha e complexo de sintomas de natureza sistêmica durante o período de avaliação. A partir da associação das notas dos sintomas individuais, foi possível obter o índice de doença, que foi utilizado para diferenciar os acessos de mandioca quanto à reação àXam, avaliando também a relação genótipos de mandioca x estirpes de Xam. Os resultados mostraram diferenças significativas entre os genótipos de mandioca e entre as estirpes de Xam, porém a relação genótipos de mandioca x estirpes de Xam não foi significativa. Considerando as três estirpes utilizadas no estudo, sete genótipos foram classificados como moderadamente resistente a partir do valor médio de índice de doença, semelhante aos genótipos BGMC 753 e BGMC 982 que são amplamente utilizados por agricultores do Distrito Federal devido à tolerância a bacteriose. A estirpe UnB 1111 foi mais agressiva que as estirpes UnB 1386 e UnB 1152 com base no valor médio do índice de doença, considerando os quatorzes genótipos de mandioca utilizados no estudo. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The cassava roots are the daily meal of a hundred people all over the world in several countries, because of the great keep capacity of the starch in its roots. However, some factors are limiters as the low level of the multiplication and susceptibility of the culture to the bacteriose Xanthomonasaxonopodispv. manihotis (Xam) in wealthy favorable conditions for the development of the disease. The objectives of this paper were to test the production capacity of cassava seedlings using manivas with different stakes ages by the fast propagation method ant evaluate the aggressiveness of three isolated of Xam from the three distinguished geographic regions of Brazil in eatable cassava genotypes in conditions of vegetation house. The experiments were realized in the experimental biology station of the University of Brasilia in a glasshouse heater. In the fast propagation experiment were chosen, in the field, vigorous and healthy plants from the American variety BGMC 1246, for the taken of small fragments of the basal, intermediate and apical segments branches. The branches were cut in minimanivas with 6 cm in length around with two gems each one. Three minimanivas were planted in plastic vases of 2L, containing a mixture of red latosolo cultivated in the cerrado (LV), sand, cattle manure and vermiculite; in the following proportions 2: 1: 1: 1, respectively. After the plantation, over each vase was put a transparent plastic recipient, working as a bell for the manufacturing of the high temperature and moisture in the interior of the vases. During the experiment was valued the number of herbaceous shoots, born percent, number and percent of rooted shoots, number of acclimate seedlings, being the basal segment the most indicated for the production of these parameters compared to other segments. In the experiment the access reaction of cassavas to the Xam, were used 17 access of cassava, from, mainly, the bank of germplasm from Embrapa Cerrados. The access propagation materials went through a trial process looking for the identification of possible contamination focus by the Xam bacterium. Little fragments of each foliage were taken and put in middle 523, being incubated with a 28°C temperature for 48 hours. After this period, it was verified the colony growth in the foliage fragments, being selected fourteen access that showed contamination level lower than 15%. The selected access foliage were cut with two gems each one; sanitized and treated with sodium hypochlorite (5%) and agrimicina, respectively. After the sanitization, three manimanivas were planted in each vase of 2L, being the vases filled with the mixture of the red latosolo, sand, cattle manure and autoclaved vermiculite. When the seedlings showed 10cm high they were cut with a disinfected stylus and put to be rooted in the water. Three to four weeks after the beginning of the root, the rooted seedlings were transplanted in bags of seedlings containing the same autoclaved mixture used in the manivas plantation, being put in concrete banks in the house vegetation interior. The seedlings were transplanted again in plastic vases of 2L capacity when they got the 25cm high. The Xam strains were recovered in middle 523 for 48 hours in a 28°C temperature in a heater. Right after the recovering, for each strain was prepared a bacterial suspension with a 1x108 UFC. Ml-1 concentration determined in the spectrophotometer with absorbance of 0,350 and wave length 550 nm. The plants were inoculated in the leaves and rods. The leaf inoculation was realized using a sterilized scissors, after the previous immersion in the bacterial suspension, being cut three leaflets in different leaves for plant. The rod inoculation was realized using sterilized wooden toothpicks, drowned in the bacterial suspension for ten minutes, being introduced a toothpick for plant in the older leaf gem. It was attributed grades to the stink individual symptoms, wilt and complex of systemic nature symptoms during the evaluate period. From the grade association of the individual systems was possible to obtain the disease level, which was used to differentiate the cassava access as the Xam reaction, also evaluating the relation cassavas genotypes x Xam strains. The results showed meaningful differences among the cassava genotypes and among the Xam strains, however the relation cassava genotypes x Xam strains wasn’t meaningful. Considering the three strains used in the study, seven genotypes were classified as moderately resistant from the middle value of the disease level, similar to the BGMC 753 and BGMC 982 genotypes that are plenty used by agricultures from Distrito Federal because of the bacteriose tolerance. The UnB 1111 strain was more aggressive than the UnB 1386 and UnB 1152 strains with base in the middle value of the disease level, considering the fourteen cassava genotypes used in the study.
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Resistência de genótipos de maracujá-azedo à bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) e à virose do endurecimento do fruto (Cowpea aphid-borne mosaic virus) / Resistance of passionfruit genotypes to the bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) and the virose of the hardening of the fruit (Cowpea aphid-borne mosaic virus)

Viana, Carla Azevedo dos Santos January 2007 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2007. / Submitted by Diogo Trindade Fóis (diogo_fois@hotmail.com) on 2009-12-08T10:15:20Z No. of bitstreams: 1 2007_CarlaAzevedodosSantosViana.pdf: 2238479 bytes, checksum: 931d45ef6b404b6e81a45f7cd985e450 (MD5) / Approved for entry into archive by Joanita Pereira(joanita) on 2009-12-08T15:41:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_CarlaAzevedodosSantosViana.pdf: 2238479 bytes, checksum: 931d45ef6b404b6e81a45f7cd985e450 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-12-08T15:41:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_CarlaAzevedodosSantosViana.pdf: 2238479 bytes, checksum: 931d45ef6b404b6e81a45f7cd985e450 (MD5) Previous issue date: 2007 / A virose do endurecimento do fruto (Cowpea aphid-borne mosaic virus) e a bacteriose, causada por Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae são consideradas algumas das principais doenças que atingem a cultura do maracujá-azedo (Passiflora edulis f. flavicarpa Deg.). O objetivo desse trabalho foi avaliar e selecionar materiais genéticos com resistência a essas doenças. O trabalho consistiu de quatro experimentos conduzidos em casa-de-vegetação na Estação Biológica da Universidade de Brasília (UnB), sendo dois para avaliar a resistência à virose, com o emprego de apenas um método de inoculação e dois para avaliar a resistência à bacteriose, com o emprego de dois métodos de inoculação distintos. Nos quatro ensaios, foi utilizado o delineamento de blocos casualizados, com 4 repetições e 12 plantas por parcela, em esquema de parcela subdividida. No primeiro ensaio para resistência à virose, foram avaliados 36 genótipos em seis épocas. No segundo ensaio, foram avaliados 18 genótipos em dez épocas. No primeiro ensaio para resistência à bacteriose, foram avaliados 18 genótipos em quatro épocas, com o emprego do método de inoculação da agulha. No segundo ensaio, foram avaliados 42 genótipos em três épocas, com o emprego do método de inoculação da tesoura. Foi avaliada a severidade utilizando-se escalas de notas, com variação de 1 a 4, para a virose e de 0 a 4 para a bacteriose. Foram verificadas variabilidade genética intra e intervarietal para a resistência ao vírus e à bactéria. Diante disso, foram selecionadas plantas resistentes entre e dentro das variedades. No primeiro experimento para avaliar a resistência à bacteriose, quatro genótipos foram selecionados por apresentarem, ao final das três avaliações, mais de 30% de plantas medianamente resistentes, sendo eles: Maracujá Moranga, RC-0-3, Vermelhinho e PES-7. No segundo experimento, três genótipos foram selecionados por apresentarem, ao final das quatro avaliações, mais de 20% de plantas medianamente resistentes, sendo eles: MAR20#12, RC-0-3 e MAR20#39. No primeiro experimento para avaliar a resistência à virose, seis genótipos foram selecionados, visto que apresentaram, ao final das seis avaliações, mais de 80% de plantas medianamente resistentes, sendo eles: MAR20#25, MAR20#06, Amarelo Arredondado, MAR20#07, Maguary FB-100 e MAR20#34. No segundo experimento, cinco genótipos foram selecionados, visto que apresentaram, ao final das dez avaliações, mais de 50% de plantas medianamente resistentes, sendo eles: MAR20#12, MSCA, Vermelhinho, Yellow Master FB-200 e Maracujá Moranga. Entre os dois métodos de inoculação da bactéria empregados, observou-se que o método da agulha foi o mais adequado, por ser menos drástico. Visto que todo o programa de melhoramento genético visa obtenção de genótipos com resistência múltipla a fitopatógenos, observou-se na presente pesquisa que apenas o genótipo MSCA foi considerado resistente tanto à virose quanto à bacteriose. ________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The virose of the hardening of the fruit (Cowpea aphid-borne mosaic virus) and bacteriose, caused by Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae is considered some of the main illnesses that reach the culture of the passionfruit one (Passiflora edulis f. flavicarpa Deg.). The objective of this work was to evaluate and to select material genetic resistant to these illnesses. The work consisted of four experiments lead in a greenhouse at the Biological Station of the University of Brasilia, being two to evaluate the resistance to virose and two to evaluate the resistance to bacteriose. In the four assays, in a randomized block experiment was used, with 4 repetitions and 12 plants for parcel, in project of subdivided parcel. In the first assay to evaluate the resistance to virose, 36 genotypes had been evaluated, at six times of evaluation. In as the assay, 18 genotypes had been evaluated, at ten times of evaluation. In the first assay for the evaluation of bacteriose, 18 genotypes had been evaluated, at four times of evaluation. In as the assay, 42 genotypes had been evaluated, at three times of evaluation. For the evaluation of the severity analysis note scales had been used, with variation of 1 the 4, in the case of virose and of 0 the 4, in the case of bacteriose. In reason of the existence of genetic variability intra and intervarietal in terms of resistance to the virus and the bacterium, searched to select resistant plants in each genotype, that is, election enters inside and of the genotypes. The genotypes had presented variability with regard to the resistance, being that in the first experiment to evaluate the resistance to bacteriose, four genotypes had been selected by presenting, to the end of the three evaluations, more than 30% of medium resistant plants, being they: Maracujá Moranga, RC-0-3, Vermelhinho and PES-7. In as the experiment, three genotypes had been selected by presenting, to the end of the four evaluations, more than 20% of medium resistant plants, being they: MAR20#12, RC-0-3 and MAR20#39. In the first experiment to evaluate the resistance to virose, six genotypes had been selected by presenting, to the end of the six evaluations, more than 80% of medium resistant plants, being they: MAR20#25, MAR20#06, Amarelo Arredondado, MAR20#07, Maguary FB-100 and MAR20#34. In as the experiment, five genotypes had been selected by presenting, to the end of the ten evaluations, more than 50% of medium resistant plants, being they: MAR20#12, MSCA, Vermelhinho, Yellow Master FB-200 and Maracujá Moranga. It enters the two methods of used inoculation of the bacterium, was observed that the method of the needle was adjusted, for being less drastic. Since all the program of genetic improvement aims at attainment of genotypes with multiple resistance the phytopathogens, it was observed in the present research that only genotype MSCA was considered resistant in such a way to virose how much to bacteriose.
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Variabilidade e tolerância ao cobre em Xanthomonas campestris pv. viticola, agente causal do cancro bacteriano da videira (Vitis spp.)

Marques, Eder January 2007 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2007. / Submitted by wesley oliveira leite (leite.wesley@yahoo.com.br) on 2009-12-10T18:55:43Z No. of bitstreams: 1 2007_EderMarques.pdf: 3507588 bytes, checksum: 041b04ae51be60c2b687d29df8c79ff6 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-01-07T22:54:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_EderMarques.pdf: 3507588 bytes, checksum: 041b04ae51be60c2b687d29df8c79ff6 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-01-07T22:54:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_EderMarques.pdf: 3507588 bytes, checksum: 041b04ae51be60c2b687d29df8c79ff6 (MD5) Previous issue date: 2007 / O cultivo de uvas de mesa no Brasil tem se intensificado principalmente em áreas próximas ao Submédio do Vale do São Francisco. Essa região é responsável por 15 % da produção de uvas de mesa finas do país, correspondendo a cerca de 98 % das exportações brasileiras anuais de uva, tanto em volume quanto em valores de produção. Entretanto, muitos são os problemas fitossanitários que ocorrem nessa cultura. Dentre as doenças de etiologia bacteriana apenas o cancro bacteriano, causado por Xanthomonas campestris pv. viticola (Xcv), apresenta hoje incidência expressiva e importância econômica em videira. Embora tenha sido relatada em 1998, acredita-se que a bacteriose já estivesse presente na região desde 1996, sem ter sido detectada. Assim torna-se importante monitorar a variabilidade das populações bacterianas ao longo dos anos, o que pode ser conseguido de maneira eficiente utilizando marcadores moleculares. Outro fator a ser considerado é o uso contínuo e muitas vezes indiscriminado de compostos cúpricos na agricultura o que pode levar a ocorrência de bactérias fitopatogênicas ou saprofíticas resistentes ao cobre. Considerando a importância do cancro bacteriano para a viticultura no Brasil e buscando maior conhecimento sobre variabilidade do patógeno e seu comportamento quanto a tolerância aos cúpricos, foram objetivos deste trabalho: (1) Caracterizar a diversidade genética, através de rep-PCR, de isolados de Xcv coletados no Vale do São Francisco, entre os anos de 2003 e 2006, comparando-os aos isolados já caracterizados, coletados entre 1998 e 2001; (2) Determinar níveis de tolerância ao cobre em isolados de Xcv representativos de diferentes épocas (1998 a 2006) e áreas de coleta; (3) Detectar e caracterizar em Xcv a presença de regiões homólogas ao gene copA que confere resistência ao cobre em Xanthomonas spp. Os “fingerprints” gerados por rep-PCR, a partir do DNA purificado de Xcv coletados em diferentes anos, áreas e variedades de Vitis vinifera L. foram eficientes e reprodutíveis, constituindo-se em uma importante ferramenta no estudo da genética populacional deste patógeno. Os resultados indicaram ter ocorrido uma possível estabilização da população heterogênea observada por Trindade et al. (2005), além de permitir a observação de bandas comuns e perfis homogêneos entre os isolados que podem ser utilizados para o diagnóstico. Entretanto, não foi possível correlacionar, através dos estudos das seqüências repetitivas, a origem geográfica, a época de coleta ou a cultivar de origem dos isolados com os perfis genômicos. Nos testes de tolerância in vitro aos íons de cobre, de uma forma geral observou-se uma evolução no crescimento da tolerância ao cobre ao longo dos anos, em que isolados de Xcv foram coletados nas áreas de ocorrência do cancro bacteriano de 1998 a 2006. Os resultados do presente estudo confirmam aqueles já relatados anteriormente, de que as estirpes brasileiras apresentaram variabilidade na tolerância ao cobre e que esta tolerância ocorre naturalmente nas regiões produtoras. Araújo (2001) mostrou que essas estirpes mais tolerantes ocorrem na região de Petrolina, e no presente trabalho, demonstrou-se que também ocorrem em outras áreas como Bahia e Piauí. Amplificações com os “primers” desenhados a partir de seqüências do gene copA de X. axonopodis pv. citri e X. campestris. pv. campestris foram observadas para todos os isolados de Xcv testados. A alta homologia entre os produtos das amplificações com os “primers” copAR e copAL a partir do DNA dos isolados de Xcv com o gene cop A, confirmou a existência do gene em Xcv. A árvore filogenética gerada com alta reprodutibilidade mostrou maior distância de Xcv em relação a X. oryzae pv. oryzae e X. campestris pv. campestris e maior proximidade com X. axonopodis pv. citri. Este fato pode ser um indicativo de maior afinidade de X. campestris pv. viticola com a espécie X. axonopodis do que com X. campestris, confirmando as observações de Takita et al. (2004) em trabalho analisando a região rpf. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The production of table grapes (Vitis vinifera L.) in Brazil has increased mainly in the irrigated areas of the “Submédio” of the São Francisco valley, northeastern Brazil. This region is responsible for 15 % of the grape production of the country, corresponding to nearly 98 % of the annual exports. Among the many phytosanitary problems that affect grape production, bacterial canker is the most important bacterial disease affecting several V. vinifera cultivars in that region. The disease is caused by Xanthomonas campestris pv. viticola (Xcv). Although it was reported in 1998, it is believed that it has been present in the region since 1996, without being detected. It is important to monitor the population variability through time, which can be achieved by using molecular markers. Another relevant fact is the continuous, excessive and frequently inadequate use of copper-based fungicides that can lead to resistance in bacteria. Considering the importance of bacterial canker for grape production in Brazil and the lack of information on pathogen variability and its behavior regarding copper tolerance, the objectives of this work were: (1) to characterize the genetic diversity, using rep-PCR, among Xcv strains collected from 2003 to 2006, comparing them to a population already characterized, collected between 1998 and 2001; (2) to determine tolerance levels to copper in Xcv strains, selected to represent different collection years (1998 to 2006) and collection sites; and (3) to detect and characterize in Xcv the presence of homologous regions to the copA gene, which is involved in copper resistance in Xanthomonas spp. The fingerprints generated by rep-PCR using bacterial purified DNA from isolates collected in different years, areas and from different grape cultivars were reproducible and the results indicated lower levels of polymorphism among the isolates collected from 2003- 2006 than among the isolates previously characterized by Trindade et al. (2005). The profiles were generally very homogeneous and several common bands among isolates were detected. However, it was not possible to correlate geographic origin, collection year or cultivar with the rep-PCR genomic patterns. In vitro tests were conducted to assess tolerance to copper ions in Xcv. The results showed a general increase in copper tolerance from 1998 through 2006 and also showed variation in the minimum inhibitory concentration among the isolates. Previous studies demonstrated that this tolerance occurs naturally in the Petrolina region (Pernambuco state). Here we observed variation in tolerance also in isolates from Bahia and Piauí states. PCR- amplifications with primers (copAR and copAL) selected from the copA sequences of X. axonopodis pv. citri and X. campestris pv. campestris were observed for all Xcv isolates. After sequencing of the 925-bp PCR product, high sequence homology between Xcv sequences and those from X. axonopodis citri and X. campestris pv. campestris was observed, thus confirming the presence of the copA gene in Xcv. The phylogenetic analysis showed a closer relationship between Xcv and X. axonopodis pv. citri than with X. oryzae pv. oryzae or X. campestris pv. campestris. This suggests a closer proximity with the species X. axonopodis than with X. campestris, confirming the observations of Takita et al. (2004) when analyzing the rpf gene region.
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Reação em progênies de maracujá-azedo à antracnose, septoriose, cladosporiose e bacteriose em condições de campo e casa de vegetação

Bouza, Rafael Brugger da 04 1900 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2009. / Submitted by Allan Wanick Motta (allan_wanick@hotmail.com) on 2010-04-07T12:50:05Z No. of bitstreams: 1 2009_RafaelBruggerdaBouza.pdf: 1859470 bytes, checksum: f5b4c7a45e9ae092d93c5328f5aad6c2 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-05-05T19:36:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_RafaelBruggerdaBouza.pdf: 1859470 bytes, checksum: f5b4c7a45e9ae092d93c5328f5aad6c2 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-05-05T19:36:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_RafaelBruggerdaBouza.pdf: 1859470 bytes, checksum: f5b4c7a45e9ae092d93c5328f5aad6c2 (MD5) Previous issue date: 2009-04 / O objetivo deste trabalho foi avaliar e selecionar materiais genéticos de maracujá-azedo resistentes a antracnose (Colletotrichum gloeosporioides), septoriose (Septoria passiflorae), cladosporiose (Cladosporium herbarum) e bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae). Foram quatro experimentos, sendo dois conduzidos em condições de campo e dois em casa de vegetação. Em condições de campo, foi utilizado o delineamento em blocos casualizados com quatro repetições, em arranjo de parcela subdividida em 14 tratamentos e 8 plantas por parcela. Foram avaliadas, em quatro diferentes épocas (dezembro, janeiro, fevereiro e março), as progênies: MAR 20#36, MAR 20#09, MAR 20#03, MAR 20#23, MAR 20#46, GA2, AR 02, AR 01, FB 200, AP1, RC3, PCF-2, EC-RAM e FP 01. Foram escolhidos, ao acaso, 10 frutos por parcela durante a colheita das 14 progênies, levando em conta a incidência e a severidade das doenças. Todas as progênies foram consideradas moderadamente susceptíveis para as doenças analisadas. Não houve diferença significativa entre as progênies para severidade da antracnose. Para septoriose, RC3 apresentou a maior severidade, com 2,94% de lesões nos frutos. Para cladosporiose, as progênies MAR 20#03, RC 3, MAR 20#36 e AR02 diferiram significativamente das demais progênies, onde esses valores variaram de 1,73 a 1,89% na severidade. Na avaliação da severidade para bacteriose, as progênies AR02, A09 e MAR 20#36 diferiram das demais, onde os maiores valores variaram de 1,52 a 1,69%. Em casa de vegetação, utilizou-se o delineamento de blocos casualizados, com quatro repetições e 24 plantas por parcela, em esquema de parcela subdividida, com seis épocas de avaliação na parcela, totalizando 96 tratamentos. Para a inoculação de C. gloeosporioides e X. axonopodis pv. passiflorae foram utilizadas 24 progênies. Para a antracnose, a progênie Gigante Amarelo foi classificada como moderadamente resistente, enquanto as demais progênies foram classificadas com altamente susceptíveis. Todas as progênies foram consideradas moderadamente resistentes à bacteriose em casa de vegetação. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The purpose of this study was the analysis and selection of passionfruit progenies which are resistant to anthracnosis (Colletotrichum gloeosporioides), septoriosis (Septoria passiflorae), scab (Cladosporium herbarum) and bacteriosis (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae). Four experiments were done in the field, and two in the greenhouse. Randomized blocks with four repetitions, 14 treatments and eight plants per plot were managed in the field. The progenies MAR 20#36, MAR 20#09, MAR 20#03, MAR 20#23, MAR 20#46, GA2, AR 02, AR 01, FB 200, AP1, RC3, PCF-2, EC-RAM and FP 01 were evaluated in four different periods (December, January, February and March). Ten fruits per plot were randomly chosen during the harvest of the 14 genotypes, and the incidence and the severity of the diseases were considered. All progenies were partially susceptible to the diseases. There was no significant difference of anthracnosis severity among the progenies. RC3 showed the highest severity of septoriosis (2.94%). MAR 20#03, RC 3, MAR 20#36 and AR02 had different severities of scab compared to the other progenies (1.73% to 1.89%). In the bacteriosis analysis, AR02, A09 and MAR 20#36 showed the highest values (1.52% to 1.69%). In the greenhouse, four repetitions of randomized blocks were managed with 24 plants per plot, six periods of evaluation, totalizing 96 treatments. For the inoculum of C. gloeosporioides and X. axonopodis pv. passiflorae, 24 progenies were used. The progeny Gigante Amarelo was partially resistant to anthracnosis while the others were highly susceptible. All progenies were considered partially resistant to bacteriosis in the greenhouse.
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Reação de progênies de maracujazeiro azedo à antracnose (Colletotrichum gloeosporioides), à verrugose (Cladosporium herbarum) e à bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) / Agronomic reaction of passion fruits progenies to the antracnosis, verrugosis and bacteriosis, propagated by seeds and stakes, under greenhouse condictions

Colatto, Uéllen Lisoski Duarte 09 February 2010 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2010. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2011-04-14T14:58:50Z No. of bitstreams: 1 2010_UellenLisoskiDuarteColatto.pdf: 1172958 bytes, checksum: 36238a46fda59bf5b0bdb9e7da2f2e38 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2011-04-15T01:17:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_UellenLisoskiDuarteColatto.pdf: 1172958 bytes, checksum: 36238a46fda59bf5b0bdb9e7da2f2e38 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-04-15T01:17:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_UellenLisoskiDuarteColatto.pdf: 1172958 bytes, checksum: 36238a46fda59bf5b0bdb9e7da2f2e38 (MD5) / A cultura do maracujá é uma das mais importantes dentre as fruteiras cultivadas no Brasil, contudo apresenta sérios problemas fitossanitários. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a resistência de progênies de maracujazeiro azedo à verrugose (Cladosporium herbarum), à antracnose (Colletotrichum gloeosporioides) e à bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae). Os experimentos foram realizados na Estação Experimental da Biologia, para a avaliação das progênies, em casa de vegetação, quanto à incidência e severidade às doenças antracnose e bacteriose e severidade a doença verrugose. No primeiro experimento foram usadas sementes coletadas na Fazenda Água Limpa. O delineamento foi em blocos casualizados, com 12 tratamentos (progênies), 4 repetições e 6 plantas por parcela. Neste experimento, as progênies avaliadas foram famílias de meios irmãos dos seguintes materiais: MAR20#03, MAR20#10, MAR20#12, MAR20#29, MAR20#36, MAR20#40, MAR20#44, MAR20#2005, GA 2, FB 200, RC-3-0 e FP01. Neste experimento, as progênies MAR 20#03 e MAR 20#36 apresentaram as menores incidências da antracnose, com 87,30 % e 87,50 %. Contudo, na ultima avaliação, todas as progênies apresentaram a maior incidência para a doença, 100%. Todas as progênies apresentaram-se altamente suscetíveis (AS) a antracnose. No segundo experimento, as progênies avaliadas foram as seguintes: MAR, 20#03, 20#10, 20#12, 20#29, 20#36, 20#40, 20#44, 20#2005, GA2, RC 3-0, FP 01 e FB200. E as progênies usadas no terceiro experimento foram: MAR, 20#03, 20#09, 20#23, 20#36, 20#46, GA 2, FB 200, AR 01, AR 02, RC 3-0, FP 01 e ECRAM. O delineamento foi em blocos casualizados, com 12 tratamentos (progênies), 4 repetições e 6 plantas por parcela. No segundo experimento todas as progênies foram consideradas altamente suscetíveis (AS) a verrugose. No terceiro experimento, as progênies MAR 20#03 e MAR 20#46 se apresentaram como moderadamente resistentes a verrugose. As progênies MAR 20#23 e ECRAM se apresentaram como suscetíveis (S) a verrugose. As demais progênies foram consideradas altamente suscetíveis a verrugose. No quarto experimento foram usadas sementes coletadas na Fazenda Água Limpa. O delineamento foi em blocos casualizados, com 24 tratamentos (progenies), 4 repetições e 6 plantas por parcela. Neste experimento, as progênies utilizadas foram: MAR 20#01, MAR20#03, MAR20#06, MAR 20#10, MAR20#12, MAR20#15, MAR20#21, MAR20#23, MAR20#24, MAR20#29, MAR20#36, MAR20#39, MAR20#40, MAR20#44, MAR20#46, MAR20#49, MAR20#2005, GA 2, FB 200, AR 01, RC 3-0, FP 01, Roxo Australiano, MSCA. Uma planta da progênie 20#23 foi considerada moderadamente suscetível (MS). Uma planta das progênies MAR 20#46, MAR 20#2005, GA 2 e duas plantas da progênies RC 3-0 foram consideradas suscetíveis (S). Nos terceiro e quarto experimentos foram usadas estacas coletadas da Fazenda Água Limpa. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The passion fruit is one the most important cultivated fruits in Brazil. However it has serious fitossanitary problems. This work was carried out in order to evaluate reaction to the the antracnose (Colletotrichum gloeosporioides), verrugose (Cladosporium herbarum) e a bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) in the Federal District. The experiments were carried out in the Experimental Area of University of Brasilia to evaluate and select passion fruit progenies with resistance to the antracnosis, verrugosis and bacteriosis under greenhouse condictions. The first experiment used seeds (sexuality propagation) collected of the plants in the field of Água Limpa’s farm. It was used a experimental design in randomized block, with 12 treatments (progenies), 4 replications, in plots with 6 plants for replication The progenies used in this experiment were: selection MAR20#03, MAR20#10, MAR20#12, MAR20#29, MAR20#36, MAR20#40, MAR20#44, MAR20#2005, GA 2, FB 200, RC-3-0 and FP01. In this experiment, the progenies MAR 20#03 and MAR 20#36 showed the smallers incidences, 87,30 % and 87,50 % to the anatracnosis disease. However, in the last analysis, all the progenies showed the highest incidence to this disease, 100%. all the progenies were considerate highly susceptible to the antracnosis. The second and third experiments used stakes (assexuality propagation) collected in the field of Água Limpa’s farm. The progenies used in the second experiment were: MAR, 20#03, 20#10, 20#12, 20#29, 20#36, 20#40, 20#44, 20#2005, GA2, RC 3-0, FP 01 e FB200. And the progenies used in the third experiment were: MAR, 20#03, 20#09, 20#23, 20#36, 20#46, GA 2, FB 200, AR 01, AR 02, RC 3-0, FP 01 e ECRAM. It was used a experimental design in randomized block, with 12 treatments (progenies), 4 replications, in plots with 6 plants for replication. In the third experiment all the progenies were highly susceptible to verrugosis. In the fourth experiment, the progenies MAR 20#03 and MAR 20#46 were moderately susceptible (MS) to verrugosis. The progenies MAR 20#23 and ECRAM were susceptible (S) to verrugosis. The others progenies were highly susceptible to verrugosis. The fourth experiment used the seeds collected of the plants in the field of Agua Limpa’s farm. It was used an experimental design in randomized blocks with 24 treatments (progenies), 4 replication, in plots with 6 plants. The progenies used were: MAR 20#01, MAR20#03, MAR20#06, MAR 20#10, MAR20#12, MAR20#15, MAR20#21, MAR20#23, MAR20#24, MAR20#29, MAR20#36, MAR20#39, MAR20#40, MAR20#44, MAR20#46, MAR20#49, MAR20#2005, GA 2, FB 200, AR 01, RC 3-0, FP 01, Roxo Australiano e MSCA. One plant of the progeny 20#23 were moderately susceptible (MS). One plant of the progenies MAR 20#46, MAR 20#2005, GA 2 and two plants of the progeny RC 3-0 were susceptible (S). The others progenies were considerate highly susceptible to the bacteriosis.

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