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Regulation of the base excision repair pathway

Fletcher, Sally C. January 2017 (has links)
Maintenance of genomic stability is paramount for survival of an organism; failure to repair DNA damage ultimately leads to the accumulation of genetically unstable cells and the onset of different human diseases including cancer. DNA single strand breaks and base oxidation/alkylation are among the most frequent types of DNA damage occurring spontaneously in cells. Base excision repair (BER), which copes with the majority of these lesions, is therefore a fundamental DNA repair system. Accordingly, it is important to understand how BER is regulated, and particularly, how and if BER is affected by the cellular load of DNA damage. Although functions of key BER proteins are well-defined, regulation of their expression is poorly understood. During BER, the protein XRCC1 is particularly important. It functions as a scaffold, stabilising repair complexes at sites of DNA damage thereby promoting efficient DNA repair. As a central coordinator in BER, it is therefore of great interest to understand how expression of XRCC1 is controlled. In this thesis I demonstrate that modulation of XRCC1 expression is mediated by transcription factor Sp1. Importantly, Sp1 is also affected during the DNA damage response, suggesting an indirect mechanism promoting BER modulation in response to the cellular DNA damage load. In fact, I show that, in response to persistent DNA strand breaks, the key DNA damage signalling factor ATM phosphorylates Sp1. This initiates Sp1 degradation, negatively affecting BER. Therefore, this thesis identifies a mechanism involving signalling from ATM that regulates BER in response to persistent DNA damage, which I link to susceptibility to apoptosis and cell elimination. I hypothesise that regulation of DNA repair in response to persistent DNA damage constitutes a mechanism to promote the elimination of potentially pre-cancerous cells that accumulate unrepairable levels of DNA lesions.
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Características persuasivas de Exemplars y Base Rate; La influencia del Vividness effect.

Bertoglia Fuentes, Tomás, Cortés Trejo, Sebastián January 2006 (has links)
Seminario para optar al título de Ingeniero Comercial, Mención Administración / En la primera etapa del presente estudio se indaga sobre la naturaleza y funcionamiento de Exemplars y Base Rate, dos de las principales herramientas comunicacionales que se emplean en la actualidad. Sin embargo el uso de dicho instrumental cuenta con su mayor grado de desarrollo en el área periodística, y de difusión de medios. De esta manera, la actual investigación busca extender al plano publicitario, algunas de las principales conclusiones que han sido obtenidas en el campo del periodismo, respecto de la utilización y procesamiento de Exemplars y Base Rate. Además, el estudio analiza con especial detalle las propiedades que estas herramientas tienen en materia de persuasión y de influencia en la opinión de las personas, así como también en el nivel de recordación e impacto emocional que son capaces de generar en éstas. Adentrándose un poco más en el tema de la persuasión, la investigación se orienta también a estudiar el rol que juega el Vividness Effect, como elemento clave de las facultades que un estímulo comunicacional posee para persuadir a una audiencia determinada. La sección experimental de este estudio fue desarrollada mediante encuestas, aplicadas a alumnos de Ingeniería Comercial de la Universidad de Chile, y cuyos principales resultados defienden las mayores propiedades persuasivas que los Exemplars poseen respecto de los Base Rate. De la misma forma se destacan los mejores resultados obtenidos por los Exemplars en materia de Recordación; y también en Impacto Emocional, al analizar las respuestas de Activación generadas en la muestra utilizada. Al mismo tiempo, no se obtuvieron resultados concluyentes acerca del efecto que el lineamiento cognitivo, tiene sobre el nivel de persuasión que la publicidad ejerce en las personas. Finalmente se entregan algunas sugerencias, explicando los aciertos y desaciertos de los resultados generados por esta investigación, y planteando temas de estudio complementarios al presente, para quienes deseen seguir indagando en áreas similares a la explorada.
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Evaluación de geoquímica-ambiental de sedimentos fluviales de hoja La Serena (1:250.000) por medio de análisis de datos composicionales

Fernández Saavedra, Gabriel Ignacio January 2018 (has links)
Geólogo / En este trabajo se analiza, por medio de una metodología multivariable de análisis de datos composicionales (CoDA), la composición química de 58 elementos y compuestos de la fracción fina (<0.18 mm) de 640 muestras de sedimentos fluviales de la Hoja La Serena (1:250.000) en el contexto del Plan Nacional de Cartografía Geoquímica llevada a cabo por el Servicio Nacional de Geología y Minería, Chile. Los datos composicionales (e.g. concentraciones químicas) se encuentran definidos en un espacio vectorial de características peculiares: el Simplex. Los datos alojados en este espacio presentan complicaciones a la hora de su procesamiento, tal como correlaciones espurias e incoherencias subcomposicionales, lo cual repercute en interpretaciones que pueden ser consideradas erróneas a partir de herramientas estadísticas tradicionales. Es por ello que resulta conveniente aplicar ciertas transformaciones con tal de trasladar los datos desde el Simplex hacia el espacio de los números Reales. La metodología CoDA empleada, en resumidas palabras, consiste en: (i) la transformación de los datos composicionales a coordenadas log-cocientes, (ii) el análisis estadístico tradicional de los datos transformados en el espacio de los Reales, y (iii) la interpretación de los resultados en las propias coordenadas transformadas y/o expresadas nuevamente en términos composicionales. En el presente estudio se ejecuta y evalúa la metodología de determinación de una línea base geoquímica por medio de una perspectiva CoDA propuesta por Buccianti y colaboradores (2015). En esta metodología se obtienen dos sub sets de datos, siendo uno correspondientes a composiciones (muestras) anómalas, y el otro a composiciones características de líneas base. De este último sub set de datos se obtiene un vector línea base que da cuenta de las composiciones representativas del área de estudio. Como resultado se obtiene que la línea base geoquímica muestra una marcada relación con procesos endógenos y exógenos conocidos para el área de estudio como lo son la litogénesis regional, mineralización económica, y alteración hipógena y supérgena; o bien dinámica geológica estructural y subsecuentes cambios hidrodinámicos de los cauces, meteorización y erosión; entre otros factores. Además las herramientas estadísticas empleadas, matrices de variación, correlación y biplots, permiten interpretar patrones geoquímicos no identificables por medio de metodologías tradicionales, como por ejemplo la relación existente entre Mg, Sc, Ga y fases silicatadas, diferencias de comportamiento entre el Co y Ni, enriquecimiento diferencial de MnO según litología, metales y metaloides como As, Pb, Zn, Cd ligados estrechamente a arcillas, comportamiento diferencial de elementos propios de fases minerales pesadas, entre otros patrones. Se identifican fuentes de variabilidad del sistema, como mineralización, principalmente del tipo Cu-Hg-Au, alteración hidrotermal, litología y acumulación de material orgánico. En suma, se estima que la metodología ejecutada es pertinente como herramienta en la determinación de una línea base geoquímica teniendo en consideración las particularidades de los datos composicionales.
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Uma base de dados para sondagens geotécnicas

Teles, Isabel Maria Alvim January 1992 (has links)
Dissertação apresentada para obtenção do grau de Mestre em Estruturas de Engenharia Civil, na Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto, sob a orientação do Prof. Doutor Matos Fernandes
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Sistema de gestão de dados de uma seroteca

Ferreira, Fernando Tavares January 1999 (has links)
Tese de mestrado. Engenharia Biomédica (Perfil de Tecnologias de Informação e Comunicação/Informática). Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 1999
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Sistemas aquosos transparentes em madeiras exóticas : caracterização, problemas e soluções

Marques, Marco Aurélio Gonçalves January 2009 (has links)
Estágio realizado na CIN e orientado pelo Eng.º Fernando Oliveira / Tese de mestrado integrado. Engenharia Química. Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2009
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Superposition of zeros of automorphic L-functions and functoriality

Gillespie, Timothy Lee 01 July 2011 (has links)
In this paper we deduce a prime number theorem for the L-function L(s; AIE=Q() AIF=Q(0)) where and 0 are automorphic cuspidal representations of GLn=E and GLm=F, respectively, with E and F solvable algebraic number elds with a Galois invariance assumption on the representations. Here AIF=Q denotes the automorphic induction functor. We then use the proof of the prime number theorem to compute the n-level correlation function of a product of L-functions dened over cyclic algebraic number elds of prime degree.
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Construction et utilisation de la sémantique dans le cadre de l'annotation automatique d'images

Millet, Christophe 02 April 2008 (has links) (PDF)
L'annotation automatique d'images est un domaine du traitement d'images permettant d'associer automatiquement des mots-clés ou du texte à des images à partir de leur contenu afin de pouvoir ensuite rechercher des images par requête textuelle. L'annotation automatique d'images cherche à combler les lacunes des deux autres approches actuelles permettant la recherche d'images à partir de requête textuelle. La première consiste à annoter manuellement les images, ce qui n'est plus envisageable avec le nombre croissant d'images numériques, d'autant que différentes personnes annotent les images différemment. La seconde approche, adoptée par les moteurs de recherche d'images sur le web, est d'utiliser les mots de la page web contenant l'image comme annotation de cette image, avec l'inconvénient de ne pas prendre du tout en compte le contenu de l'image. Quelques systèmes d'annotation automatique d'images commencent à émerger, avec certaines limites : le nombre d'objets reconnus reste de l'ordre de 10 à 100, alors que les humains sont capables de reconnaître de l'ordre de 10000 objets ; les mots-clés générés comme annotation pour une image sont parfois en contradiction entre eux, par exemple "éléphant" et "ours polaire" peuvent être détectés dans une même image ; la base de données pour l'apprentissage des objets est construite manuellement. Les travaux effectués au cours de cette thèse visent à proposer des solutions à ces problèmes, d'une part en introduisant de la connaissance dans l'annotation automatique d'images, d'autre part en proposant un système complètement automatique, où notamment la base d'images pour l'apprentissage est construite automatiquement à partir des images du Web. Cette thèse est constituée de trois parties : La première partie concerne la catégorisation d'une image en fonction de son type (photo, carte, peinture, clipart) puis pour les photographies, on s'intéresse à savoir quel est le contexte de la scène photographiée : est-ce une photographie d'intérieur ou d'extérieur, une photographie prise de nuit ou de jour, une photographie de nature ou de ville ? Y a-t-il des visages dans la photo ? Y a-t-il du ciel, de l'herbe, de l'eau, de la neige, une route,
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The mobile agent technology application in the distributed data

Lu, Weijia January 2005 (has links) (PDF)
Along with the development of the economy and technology, the network has become more important in people's work and life than before. More and more people take advantage of network to improve the quality of their work and life. The network applications are based on the database visiting, and the database visiting is almost based on the Distributed database. The Distributed data service can be widely used in the corporation and many important fields. More technology and solutions are proposed, including the Mobile Agent technology. Mobile Agent is a code segment that can migration in the network, carrying the task code, using network and computers' resource, cooperating with other MAs, finishing one or more designated tasks. Compared with other mobile code, the MA technology can use less network resource, carry less information, and operate with higher efficiency. Using the technology to solve distributed problems is a hot research topic currently. In this paper, we first review the current research status in the Mobile Agent and distributed data service fields. After that, based on the current issues in the Distributed data service fields, we propose a complete solution using the Mobile Agent technology. Last, with the proposed solution, we construct a complete distributed data service model. In our solution, the traditional Distributed data-retrieving procedure is investigated and enhanced with the Mobile Agent technology to achieve high efficiency. The Mobile Agent related technology, such as MA communication, MA security, and MA cooperation technology are also used to improve the model 's efficiency and reduce the network's cost. We have used a project management system as a sub-model. Compared with the traditional approaches, the model works more efficiently with larger number of stations and large amount of the data-request. Finally, detailed analyzing of one instance is presented to show the characteristic of the model.
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Les bases de Groebner et les ordres monomiaux

Marcotte, Laurence January 2008 (has links) (PDF)
Ce mémoire se veut une étude détaillée de ce que sont les bases de Groebner, de la manière dont on les calcule et dans quels cas elles sont utiles et utilisées. Un éventail de définitions, de théorèmes, de lemmes et de propositions sont énoncés et démontrés afin que les lecteurs, lectrices, intéressé(e)s, puissent avoir les ressources nécessaires leur permettant de comprendre vraiment ce que sont les bases de Groebner. Ce travail propose également une définition précise de ce que sont les ordres monomiaux et élabore une formulation claire de leur classification. Ce mémoire donne, en plus, une description des algorithmes sous forme de procédures, programmés en utilisant le logiciel Maple 10 qui sont mis en annexe. Tous les algorithmes, décrits en pseudo-code, ont été programmés de manière naïve, c'est-à-dire, sans astuce de programmation afin d'en réduire le temps d'exécution ou l'espace mémoire occupé. Cela afin de faire voir aux lecteurs, lectrices, intéressé(e)s, comment se font les calculs. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Anneau, Idéal, Base de Groebner, Module, Ordre monomial, Ordre monoïdal.

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