Dissertação apresentada para obtenção do grau de Mestre em Inteligência Artificial e Computação, na Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto

Mestre -- Universidade de Sao Paulo. Faculdade de Saude Publica. Departamento de Nutricao, Sao Paulo, 1997.

Doutor -- Universidade de Sao Paulo. Faculdade de Saude Publica. Departamento Pratica de Saude Publica, Sao Paulo, 2003.

Orientador: Regina Paolucci El Dib / Resumo: Introduction: A high-quality electronic search is essential in ensuring accuracy and comprehensivness in identifying potentially relevant records in conducting a systematic review. To assist researchers in identifying terms when formulating a sensitive search strategy, librarians and educators instruct researchers to consult and include preferred and non-preferred terms of the controlled database. However, by using all available terms in the thesaurus (i.e. subject headings), strategies can be lengthy and very laborious. Objective: To identify the most efficient method for searching in both Medline through PubMed and EMBASE, covering search terms with different spellings, direct and indirect orders, and association (or lack thereof) with MeSH and EMTREE terms. Method: In our cross-sectional study of search strategies, we selected and analysed 37 search strategies specifically developed for the anesthesiology field. These search strategies were adapted in order to cover all potentially relevant search terms in terms of different spellings and direct and indirect orders, most efficiently. Results: When adapted to include different spellings and direct and indirect orders, adapted versions of the selected search strategies retrieved the same number of search results in the Medline (mean of 61,3%) and higher number in EMBASE (mean of 63,9%) of the analyzed sample. The number of results retrieved by the searches analysed was not identical using the association or not of MeSH and E... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Introdução: O transplante de células‐tronco hematopoéticas (TCTH) é um procedimento complexo, que envolve diferentes fatores e condições biopsicossociais. O acompanhamento dos dados desses pacientes é fundamental para a obtenção de informações que possam auxiliar a gestão, aperfeiçoar a assistência prestada e subsidiar novas pesquisas sobre o assunto. Objetivos: desenvolver um modelo de banco de dados (BD) de pacientes submetidos a TCTH, contemplando as principais variáveis de interesse na área. Métodos: Trata‐se de um estudo aplicado, onde utilizou‐se a metodologia de desenvolvimento de um BD relacional, seguindo três etapas principais (modelo conceitual, modelo relacional, modelo físico). O modelo físico proposto foi desenvolvido na plataforma Research Electronic Data Capture (REDCap). Um teste piloto foi realizado com dados de três pacientes submetidos a TCTH no Hospital Moinhos de Vento no ano de 2016/2017, a fim de avaliar a utilização das ferramentas e sua aplicabilidade. Resultados: Foram desenvolvidos nove formulários no REDCap: dados sociodemográficos; dados diagnósticos; histórico, dados clínicos prévios; avaliação prétransplante; procedimento; acompanhamento pós‐imediato; acompanhamento pós‐tardio; reinternações; óbito. Adicionalmente foram desenvolvidos três modelos de relatórios, com as variáveis contidas nos formulários para auxiliar na exportação de dados para as instituições envolvidas com o TCTH. Após o teste piloto foram realizados pequenos ajustes na nomenclatura de algumas variáveis e exclusão de outras devido à complexidade na sua obtenção. Conclusão: Espera‐se que com a sua utilização, o modelo de BD proposto possa servir como subsídio para qualificar a assistência prestada ao paciente, auxiliar a gestão e facilitar futuras pesquisas na área. / Introduction: hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) is a complex procedure involving different biopsychosocial factors and conditions. Monitoring the data of these patients is fundamental for obtaining information that can help the management, improve the assistance provided and subsidize new research on the subject. Objectives: to develop a database model (DB) of patients submitted to HSCT, considering the main variables of interest in the area. Methods: it is an applied study, where the methodology of development of a relational DB was used, following three main steps (conceptual model, relational model, physical model). The proposed physical model was developed in the research electronic data capture (Redcap) platform. A pilot test was performed with data from three patients submitted to HSCT at Moinhos de Vento Hospital in 2016, in order to evaluate the use of the tools and their applicability. Results: nine forms were developed in redcap: demographic data; diagnostic data; previous clinical data; pre‐transplant evaluation; procedure; post‐immediate follow‐up; post‐late follow‐up; readmissions; death. In addition, three reporting models were developed, with the variables contained in the forms to assist in the export of data to the institutions involved with the TCTH. After the pilot test small adjustments were made in the nomenclature of some variables and others were excluded due to the complexity in obtaining them. Conclusion: it is hoped that with its use, the proposed BD model can serve as a subsidy to qualify the care provided to the patient, assist the management and facilitate research in the area.

COELHO, Odete Máyra Mesquita; PINTO, Virgínia Bentes. Recuperação da Informação: estudo da usabilidade na base de dados Public Medical (PUBMED). 2014. 172 f. Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal da Paraíba, Mestrado em Ciência da Informação, Paraíba, 2014. / Submitted by Lidya Silva (nagylla.lidya@gmail.com) on 2016-07-01T14:54:21Z No. of bitstreams: 1 2014_diss_ommsales.pdf: 4229373 bytes, checksum: 0087285c704b68c550008eeb3ca7869a (MD5) / Rejected by Márcia Araújo (marcia_m_bezerra@yahoo.com.br), reason: Por gentileza, faça as devidas correções de acordo com as orientações recebidas. Qualquer dúvida ligar 33667659. Márcia Bezerra Revisora do Repositório Institucional Biblioteca das Casas de Cultura Estrangeira/UFC on 2016-07-06T13:18:46Z (GMT) / Submitted by Lidya Silva (nagylla.lidya@gmail.com) on 2016-07-08T13:27:55Z No. of bitstreams: 1 2014_diss_ommsales.pdf: 4229373 bytes, checksum: 0087285c704b68c550008eeb3ca7869a (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Josineide Góis (josineide@ufc.br) on 2016-07-15T13:21:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_diss_ommsales.pdf: 4229373 bytes, checksum: 0087285c704b68c550008eeb3ca7869a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-15T13:21:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_diss_ommsales.pdf: 4229373 bytes, checksum: 0087285c704b68c550008eeb3ca7869a (MD5) Previous issue date: 2014 / It investigates the understanding that resident doctors have about the process of information retrieval on the basis of Public Medical (PubMed) data, taking into consideration the aspects of usability in human-computer interaction, the resources available and the level of user satisfaction in searching process. The theoretical framework used for this research relates the concepts of information and information systems for the healthcare, and then addresses the Information Retrieval systems and databases, entering the field of information architecture for evaluating the usability of these sources information. The methodological approach includes exploratory research whose first phase consisted of the heuristic evaluation of the PubMed database interface, using the guidelines proposed by Nielsen and Tahir (2002). The results of this analysis show that although these guidelines have been designed to build homepage, thirty-eight of them are suited to the PubMed interface. Therefore, it is inferred that these guidelines can be used for heuristic evaluation of databases focused on the area of Health regarding the usability of this database, it was observed that the interface has a well-structured architecture, is friendly and objective, and present numerous possibilities for search and retrieval of information. The second phase of empirical study took place through the application of prospective usability testing to measure user satisfaction database. These tests were done using a semi-structured questionnaire administered to resident doctors specialty of Internal Medicine, University Hospital Walter Cantídio the Federal University of Ceará, totaling 36% of participants. The results of this step show a good performance and a good user satisfaction PubMed regarding the usability of the database, considering that enables them to achieve their research goals with real effectiveness and efficiency, yet they do not know all the resources available to search and retrieval of information offered by this database. / Investiga qual o entendimento que os médicos residentes têm sobre o processo de recuperação de informação na base de dados Public Medical (PubMed), levando em consideração os aspectos relativos à usabilidade na interação humano-computador, os recursos disponíveis e o nível de satisfação do usuário no processo de busca. O referencial teórico utilizado para esta pesquisa relaciona os conceitos de informação e de informação para a área da saúde, e em seguida aborda os Sistemas de Recuperação de Informação e as bases de dados, adentrando no campo da arquitetura da informação para avaliar a usabilidade dessas fontes de informação. O percurso metodológico contempla a pesquisa exploratória cuja primeira etapa constou da avaliação heurística da interface da base de dados PubMed, utilizando- se as diretrizes propostas por Nielsen e Tahir (2002). Os resultados dessa análise evidenciam que, embora tais diretrizes tenham sido pensadas para a construção de homepage, trinta e oito delas se adequaram à interface da PubMed. Portanto, infere- se que essas diretrizes podem ser utilizadas para a avaliação heurística de bases de dados voltadas para a área da Saúde. Com relação à usabilidade dessa base de dados, evidenciou-se que a interface tem uma arquitetura bem estruturada, é amigável e objetiva, além de apresentar inúmeras possibilidades de busca e recuperação da informação. A segunda etapa do estudo empírico deu-se por meio da aplicação dos testes prospectivos de usabilidade para mensurar a satisfação dos usuários da base de dados. Esses testes foram feitos por meio de um questionário semiestruturado aplicado aos médicos residentes da especialidade de Clínica Médica do Hospital Universitário Walter Cantídio da Universidade Federal do Ceará, perfazendo um total de 36% de participantes. Os resultados dessa etapa evidenciam um bom desempenho e uma boa satisfação dos usuários da PubMed quanto à usabilidade dessa base de dados, haja vista que permite a eles atingirem seus objetivos de pesquisa com real eficácia e eficiência, ainda que não conheçam todos os recursos disponíveis para a busca e a recuperação da informação oferecidos por essa base de dados.

Submitted by Frederico Azevedo (fazevedo@cdts.fiocruz.br) on 2010-11-10T17:01:50Z No. of bitstreams: 1 oliveiravsm.pdf: 1878124 bytes, checksum: 96c6fd44407809d315bca0121b1f16ff (MD5) / Made available in DSpace on 2010-11-10T17:01:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 oliveiravsm.pdf: 1878124 bytes, checksum: 96c6fd44407809d315bca0121b1f16ff (MD5) Previous issue date: 2005 / Este trabalho analisa as possibilidades de tornar interoperáveis bases de dados heterogêneas, de forma que possam ser pesquisadas através de uma única interface. A biblioteca do Instituto Fernandes Figueira, Unidade materno-infantil da FIOCRUZ é referência em tratamento de doenças de alta complexidade. Estes profissionais buscam a Biblioteca com necessidades de informações voltadas para a decisão clínica. As bases de dados mais pesquisadas por estes profissionais são as bases de dados LILACS, MEDLINE e ACERVOS ONLINE FIOCRUZ. Portanto estas bases norteiam este estudo e são analisadas em algumas facetas como: os procedimentos de descrição e as estruturas das bases, buscando semelhanças e divergências nos índices e nos campos de exibição das bases; a representação temática, caracterizada pela utilização dos Tesauros DeCS e MeSH; e tecnologias utilizadas e/ou compatíveis. Paralelamente busca-se apresentar algumas ferramentas tecnológicas atuais de interoperabilidade como os protocolos Z39.50 e o OAI-PMH, os metabuscadores, o conjunto de metadados Dublin Core e o MetaIAH. Através destas análises delineou-se três modelos conceituais para alcançar a interoperabilidade, são eles: Compartilhamento de Esforços, quando tanto a Interface de Consulta (IC) e os Recursos Informacionais (RI) trabalham para garantir a interoperabilidade; Esforço concentrado nos RIs, quando os Recursos Informacionais arcam com todo o esforço para possibilitar a interoperabilidade; e, Esforço concentrado na IC, quando a Interface de consulta se adapta para suprir as divergências de cada base proporcionando a interoperabilidade. Para finalizar comparam-se os modelos e as bases de dados estudadas destacando-se os modelos que se constituem como alternativas de interoperabilidade para a biblioteca do Instituto Fernandes e quais as vantagens e desvantagens de cada uma delas. / This work analyses the options to achieve interoperability among different library databases so they can be searched from a single Web interface. The databases object of this research are the ones used in The Fernandes Figueira Institute Library, which is a branch of FIOCRUZ specialized in Maternal and Child Health. Library users generally look for medical decision support information. The Library users preferred databases are LILACS, MEDLINE and ACERVOS ONLINE FIOCRUZ. All of them use the DeCS and MeSH Thesaurus to subject description. Each of these databases are analyzed in aspects as access points, bibliographic description and display formats, in order to identify common elements. Technologies and standards to achieve interoperability as Z39.50 and OAI-PMH protocols, meta-search engines, Dublin Core Metadata Set BIREME’s metaIaH meta-search engine are also analyzed. From this analysis emerged three conceptual models to achieve interoperability among the three databases, evolving two actors, the search interface – SI, and the information resources (the three databases) - IR: Effort Sharing, between SI and IRs; Concentrated Effort in the RIs; and Concentrated Effort in the SI to achieve interoperability. The three models are compared, outlining the advantages and disadvantages of each one to achieve interoperability, among the databases of interest to Fernandes Figueira Institute Library.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-05-14T13:46:13Z No. of bitstreams: 1 diogo_a_tschoeke_ioc_bcs_0001_2010.pdf: 39185036 bytes, checksum: e20b3df10a81fb78c2e226162dfdd94c (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-14T13:46:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 diogo_a_tschoeke_ioc_bcs_0001_2010.pdf: 39185036 bytes, checksum: e20b3df10a81fb78c2e226162dfdd94c (MD5) Previous issue date: 2010 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Este trabalho teve com objetivo o desenvolvimento e a validação/aplicação de um sistema integrado de genotipagem de protozoários, utilizando uma abordagem multidisciplinar envolvendo, PCR multiplex e análise bioinformática envolvendo evolução e filogenia molecular. Para isso, trinta e seis genes ortólogos universal (UOG) foram identificados e usados como marcadores para genotipagem de protozoários parasitas, a nível inter-específico. Temos extraído os dados genéticos de genes ortólogos universal selecionado. Para isso, estamos utilizando sequências de grupos ortólogos (COG e KOG). O COG é composto de genes ortólogos individuais ou grupos de ortólogos de parálogos de 3 ou mais linhagens filogenéticas. Os COG de interesse selecionados estão envolvidos processo de tradução protéica, categoria J do COG, e estes genes foram selecionados porque eles estão presentes em todos os organismos estudados até agora, o que facilita a montagem de um sistema integrado de protozoários patogênicos. As sequências desses genes foram obtidos a partir do banco de dados GenBank. Seqüências de espécies de Eimeria tenella, Leishmania major, L. braziliensis, L. infantum, Trypanosoma brucei, T. cruzi, T. vivax, Plasmodium falciparum e P. vivax foram obtidas e armazenadas localmente. Estas sequências nucleotídicas foram traduzidas em proteínas, e então validadas usando a ferramenta COGnitor/KOGnitor, que mostra a sequência selecionada pertence ao respectivo COG de interesse. Após essa validação, as sequências foram utilizadas nos alinhamentos e construção de iniciadores que foram usados para gerar fragmentos gênicos amplificados por PCR. Os programas para a construção dos iniciadores foram: Mafft para a construção de alinhamentos múltiplos de cada COG, JalView para visualizá-los e o programa Primer3 para o desenho dos iniciadores. Todo o processo foi realizado por um pipeline de integração destes programas escritos em linguagem de programação Perl. Após o processo automatizado de validação, alinhamento e construção dos iniciadores, realizamos uma análise final dos iniciadores, considerando suas características e da região de pareamento. Quando necessário, definiu-se manualmente a degeneração da posição dos nucleotídeos que contem a variação. Criamos 33 pares de iniciadores, que foram utilizados para a amplificação destes genes via PCR. As reações de amplificação da PCR fora bem-sucedida em 19 UOG nas espécies Leishmania major, L. braziliensis, L. infantum, L. mexicana, T. cruzi, T. vivax e Plasmodium vivax, utilizando-se iniciadores com posições degeneradas. Para genotipagem das seqüências geradas pela PCR, foi utilizado o programa Phred que realizou a leitura dos cromatogramas com qualidade por base, Phred ≥ 15, e o programa Blast foi utilizado para a caracterização das sequências geradas, estas duas etapas foram realizadas em pipeline de anotação que está disponível através de um website. As árvores filogenéticas foram geradas com o método de máxima verossimilhança utilizando o pipeline ARPA, e revelou que a metodologia apresenta potencial para ser utilizado na genotipagem destes organismos e os genes da metionil-tRNA sintetase e Seril-tRNA sintetase mostraram boa resolução para a genotipagem inter-específicas de tripanosomatídeos. / The aim of this work is to develop and validate an integrated genotyping system for protozoan parasites, using a multidisciplinary approach involving, multiplex PCR, and bioinformatics analysis involving molecular evolution and phylogeny. For this, thirty three universal orthologous genes (UOG) has been identified [1] and used as markers for genotyping parasitic protozoan at the intraspecific level. We have mined genomic data of universal orthologous genes selected. For this, we are using sequences of orthologous groups (COGs and KOGs). The COG's consists of individual orthologous genes or orthologous groups of paralogous of 3 or more phylogenetic lineages. The selected COGs of interest are involved protein translation process, category J of the COG and these genes are selected because they are present in all organisms studied so far, facilitating the assembly of an integrated system for the pathogenic protozoa. Note that all these genes are part of the process of protein translation. The sequences of these genes were obtained from GenBank database. Sequences of species, Eimeria tenella, Leishmania major, L. braziliensis, L. infantum, Trypanosoma brucei, T. cruzi, T. vivax, Plasmodium falciparum and P. vivax were obtained and locally stored. Nucleotide sequences were translated into proteins. So, they are validated using the Blast similarity tool and the database as the COG itself, which shows the sequence selected belongs to the respective COG. After this validation, the sequences were used in alignments and construction of primers that are used to generate amplicons by PCR. The programs for the primer construction were: Mafft for construction of multiple alignments of each COG, JalView to view them and the program Primer3Plus [6] for the design of primers. The whole process was performed by a pipeline integrating these programs written in Perl [7] programming language. After the automated process of validation, alignment and construction of the primers, we perform a final analysis of the primers manually, which gives its characteristics and the annealing region. When necessary, we manually define the degeneration of nucleotide position containing variations. We have designed 33 primer pairs, and these primers were designed and used for PCR amplification. The reactions of PCR amplification was successful for 19 UOG in species: Leishmania major, L. braziliensis, L. infantum, L. mexicana, T. cruzi, T. vivax and Plasmodium vivax, using primers with degenerate positions. For genotyping the sequences generates by PCR amplification was used the program Phred for reading chromatograms file with quality ≥ 15, and Blast to the characterization of sequences generated, this two steps was make with a pipeline and is available through a website. The phylogenetic trees was generated with methods of maximum likelihood using the pipeline ARPA, and revealed that the methodology has potential to be used in genotyping of these organisms, and genes of methionyl-tRNA synthetase, seryl- tRNA synthetase showed good resolution for the inter-specific genotyping of trypanosomatids.

Submitted by Erica Netto (nettoeri@icict.fiocruz.br) on 2012-11-22T14:05:00Z No. of bitstreams: 1 PPGICS NADINE FC CA.pdf: 432380 bytes, checksum: b49157d5139b97e1853cfdd0faf1b4a0 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-11-22T14:05:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PPGICS NADINE FC CA.pdf: 432380 bytes, checksum: b49157d5139b97e1853cfdd0faf1b4a0 (MD5) / Asociación Aida, Ayuda, Intercambio y Desarrollo. Bissau, Guiné-Bissau, África Ocidental / O objetivo da presente dissertação foi analisar a produção científica sobre avaliação do Programa Saúde da Família (PSF) Brasileiro a partir da revisão da literatura nacional. Para atingir este objetivo, foi realizado um levantamento de material bibliográfico publicado sobre o tema através de uma pesquisa bibliográfica de caráter exploratório descritivo para identificar as características e os modelos de avaliação empregados pelos estudos de avaliação do Programa Saúde da Família no Brasil, indexados em bases de dados bibliográficos nacionais. Foram consultadas as seguintes fontes de informação: o portal do Centro Latino-Americano e do Caribe de Informação em Ciências da Saúde (BIREME), que possibilita a busca, num único local, acesso à Biblioteca Virtual de Saúde (BVS), à base de dados Literatura Latino Americana em Ciências da Saúde (LILACS), à Scientific Electronic Library Online (SciELO), à base de dados Medline, à Literatura sobre Cidades/Municípios Saudáveis (CidSaúde) e à base Literatura em Engenharia Sanitária e Ciências do Ambiente (REPIDISCA); também foram consultadas Biblioteca Digital de Teses e Dissertações (BDTD), desenvolvida pelo Instituto Brasileiro de Informação Científica e Tecnológica (IBICT). Os resultados mostram que no período de 1994 a 2011 foram defendidas 248 dissertações e 79 teses e foram publicados 180 artigos científicos sobre o tema; observou-se que houve um aumento significativo de produção sobre o tema entre os anos de 2006 e 2008, que respondem por cerca de metade das 264 referências recuperadas. Os principais meios de divulgação dessa produção foram às revistas científicas da área de Saúde Coletiva, dentre as quais se destacam Cadernos de Saúde Pública e Ciência & Saúde Coletiva como os periódicos que mais publicaram artigos sobre o tema no período analisado. Os estados de São Paulo e Rio de Janeiro foram os principais sítios de estudo no período analisado. Os estudos valeram-se na sua maioria de método qualitativo, seguido de método quantitativo e a combinação de ambos os métodos. / The aim of this dissertation was to analyses the scientific production about evaluation of the Family Health Program of Brazil (PSF) from a review of the national bibliography. To reach this objective, we conducted a bibliographic research through a survey of bibliographic material published on this subject or relating to it and a descriptive exploratory study to identify ways and evaluation models used in assessment studies of the Family Health Program in Brazil indexed in national bibliographic databases. We searched the subject in the following sources: the portal of the Latin American and Caribbean Center on Health Sciences Information (BIREME), which allows the search in a single location in the Virtual Health Library (BVS), in the database Latin American Literature Health Sciences (LILACS), the Scientific Electronic Library Online (SciELO), the Medline database, Literature in Healthy Cities / Municipalities Database (CidSaúde) and Literature in Sanitary Engineering and Environmental Sciences (REPIDISCA) and Virtual Library of Theses and Dissertations of Fiocruz; the Digital Library of Theses and Dissertations (BDTD), developed by the Brazilian Institute of Scientific and Technological Information (IBICT) and also the Brazilian National Library's digital archives (BN). The results show that 79 dissertations and 248 thesis were defended and 180 scientific articles were published on the subject in the period 1994 to 2011. It was observed a significant increase in the production on the subject between the years 2006 and 2008, which account for about half of the 264 references retrieved. The main channels of dissemination of this production were scientific journals specialized on Public Health. From 1994 to 2011, the journals Cadernos de Saúde Pública and Ciência & Saúde Coletiva published most of the articles on the subject. In the period analyzed in this study, São Paulo and Rio de Janeiro states were the major sites of studies. Studies have relied mostly on qualitative methods, followed by the quantitative and the combination of both quantitative and qualitative methods.

Made available in DSpace on 2016-03-18T12:15:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 marcia_bezerra_ioc_dout_2012.pdf: 3641805 bytes, checksum: 551d726828aba255caeef4c323eae9ee (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Esta tese descreve o projeto conceitual do sistema de banco de dados ProteinWorldDB (PWDB). Um ponto importante da proposta do PWDB é permitir a construção de consultas e procedimentos no domínio da genômica comparativa sem a necessidade de comparação de sequências. Além disso, o PCG comparou milhões de sequências de proteína, incluindo o conjunto proteico total de centenas de genomas completos, utilizando programação dinâmica, e não um método heurístico, para os cálculos de similaridade. A estratégia do PCG, assim como a genômica, está fundamentada no conhecimento de que sequências biológicas por si só são pouco informativas; elas precisam ser analisadas a partir de um enfoque comparativo para a inferência de homologia. A comparação de sequências de diferentes organismos introduz uma perspectiva evolutiva ao processo, e o estudo comparativo de genomas completos pode ampliar a escala do conhecimento de um único processo biológico para o de sistemas biológicos complexos em células e organismos. Para responder eficientemente questões dessa natureza, o esquema conceitual apresentado associa bases de dados biológicos de referência aos índices de similaridade já pré-calculados e armazenados pelo PCG Utilizando um formato gráfico de fácil compreensão para representar conceitos e relacionamentos (diagrama ER), o esquema foi proposto para facilitar o planejamento de consultas e procedimentos por pesquisadores da área de genômica (sem conhecimento de linguagens de bancos de dados), assim como guiar o desenvolvimento e a implementação física do PWDB por profissionais da área de computação. Alguns exemplos são apresentados com o objetivo de demonstrar a utilização do esquema conceitual para a especificação de consultas e procedimentos, mesmo antes da existência de um esquema lógico. O esquema pode ser facilmente estendido. Módulos anexos podem ser inseridos/removidos para incluir outros projetos, baseados em comparação de sequências de proteína, que se beneficiem das informações fornecidas pelo módulo central do esquema e novas bases de dados, específicas de diferentes áreas (-ômicas, por exemplo), podem ser integradas ao esquema / This thesis describes the conceptua l design of the database system ProteinWorldDB (PWDB) . An important point of the PWDB p roposal is to allow the construction of queries and procedures in the field of comparative genomics without the need for sequence comparison . Moreover , the PCG compared millions of protein sequences, including the entire set of proteins from hundreds of complete genomes using dynamic programming , rather than a heuristic method , for calculating similarity PCG‘s strategy, like that of genomic studies in general, is grounded in the knowledge that biological sequences alone are uninformative. They need to be analyzed from a comparative approach to infer homology. The comparison of sequences from different organisms introduces an evolutionary perspective to the process and the comparative study of complete genomes can expand our knowledge from a single biological process all the way to complex biological systems in cells and organisms. To efficiently answer questions of this nature, the conceptual schema links selected internati onal reference biological databases to similarity indexes already precomputed and stored by the PCG . By using an easily understandable graphic format to represent concepts and relationships (ER diagram), the schema was proposed to help the design of querie s and procedures by genomic researchers (who may not have knowledge of database languages) as well as to guide the development and physical implementation of the system by developers. Some e xamples are presented to demonstrate the use of the conceptual sch ema for specifying queries and procedures, even before the existence of a logical schema. The schema can be easily extended. Additional modules can be inserted/removed to include other protein sequences comparisons projects that may benefit from the inform ation provided by the schema ́s central module. Likewise, new databases specific to different areas ( - omics, for example) can be cross - referenced to the schema / This thesis describes the conceptua l design of the database system ProteinWorldDB (PWDB) . An important point of the PWDB p roposal is to allow the construction of queries and procedures in the field of comparative genomics without the need for sequence comparison . Moreover , the PCG compared millions of protein sequences, including the entire set of proteins from hundreds of complete genomes using dynamic programming , rather than a heuristic method , for calculating similarity PCG‘s strategy, like that of genomic studies in general, is grounded in the knowledge that biological sequences alone are uninformative. They need to be analyzed from a comparative approach to infer homology. The comparison of sequences from different organisms introduces an evolutionary perspective to the process and the comparative study of complete genomes can expand our knowledge from a single biological process all the way to complex biological systems in cells and organisms. To efficiently answer questions of this nature, the conceptual schema links selected internati onal reference biological databases to similarity indexes already precomputed and stored by the PCG . By using an easily understandable graphic format to represent concepts and relationships (ER diagram), the schema was proposed to help the design of querie s and procedures by genomic researchers (who may not have knowledge of database languages) as well as to guide the development and physical implementation of the system by developers. Some e xamples are presented to demonstrate the use of the conceptual sch ema for specifying queries and procedures, even before the existence of a logical schema. The schema can be easily extended. Additional modules can be inserted/removed to include other protein sequences comparisons projects that may benefit from the inform ation provided by the schema ́s central module. Likewise, new databases specific to different areas ( - omics, for example) can be cross - referenced to the schema