Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2015-10-20T03:12:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 334837.pdf: 2471453 bytes, checksum: c8d933918ddca14ab49bb32081552c85 (MD5) Previous issue date: 2015 / Os fungos possuem um papel ecológico fundamental na decomposição e ciclagem de nutrientes. Agaricales inclui um grande grupo de fungos macroscópicos encontrados na natureza e entre seus membros variam desde fungos de vida livre decompositores a simbiontes ectomicorrízicos. Dentre os simbiontes, Pterulaceae chamou atenção recentemente devido a descoberta de espécies cultivadas por formigas. Das 92 espécies de Pterulaceae pelo menos 49 possuem registros de ocorrência na Região Neotropical e 26 no Brasil. A presente dissertação trata do estudo das espécies de Pterulaceae que ocorrem no Brasil sob duas abordagens. O capítulo 1 traz uma abordagem taxonômica, com estudos morfológicos e descrições de espécies, com a apresentação de uma espécie nova, Pterula harrisonii, um novo registro para a Região Neotropical, Deflexula lilaceobrunnea, e um novo registro para o Brasil, Pterula velohorta. O capítulo 2 traz uma abordagem filogenética, com a apresentação de três hipóteses filogenéticas baseadas em dois marcadores moleculares (ITS e LSU), onde é proposta um novo arranjo para a família. Através da análise dos resultados sete clados são propostos para incluir espécies que originalmente pertenciam a Deflexula, Pterula e Pterulicium. Este é o primeiro trabalho de filogenia molecular proposto para resolver as relações filogenéticas de Pterulaceae, abrindo o caminho para futuros estudos sobre a família.<br> / Abstract : Fungi have a key ecological role in decomposition and nutrient cycling. Agaricales includes a large group of macroscopic fungi found in nature and its members ranges from free-living decomposers to ectomycorrhizal symbionts. Among the symbionts, Pterulaceae recently drew attention for the discovery of some species being cultivated by ants. From 92 species of Pterulaceae at least 49 are reported to occur in the Neotropical Region and 26 in Brazil. In this work we studied species of Pterulaceae occurring in Brazil using two approaches. The chapter 1 is a taxonomic approach including morphological studies and species descriptions where a new species to science is presented, Pterula harrisonii; one new record for the Neotropical Region, Deflexula lilaceobrunnea; and one new record for Brazil, Pterula velohorta. In chapter 2 a phylogenetic study is presented showing three phylogenetic hypotheses based on two molecular markers (ITS and LSU), where a new arrangement is proposed for the family. The analysis of these results revealed seven clades harboring species that originally belonged to Deflexula, Pterula and Pterulicium. This is the first study of molecular phylogeny proposed to resolve the phylogenetic relationships of Pterulaceae, paving the way for future studies on the family.

Made available in DSpace on 2015-07-08T12:28:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 26.pdf: 2505316 bytes, checksum: f5db7e53d3352f1b2e198a85915b80c3 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Lagoas urbanas costeiras são ambientes dinâmicos e poluídos, sendo altamente afetadas pela mistura de sedimentos, água do mar e de água doce continental. Apesar de uma série de estudos publicados sobre estuários de água doce e ambientes marinhos há pouco interesse nas lagoas urbanas impactadas nos trópicos. Neste estudo, realizamos uma abordagem polifásica, utilizando métodos microbiológicos como isolamento de bactérias e seus perfis de resistência aos antibióticos e moleculares como a DGGE-PCR e bibliotecas do gene rrs do 16S rRNA para comparar as comunidades microbianas do ecossistema lagunar de Jacarepaguá. Foram selecionados três ambientes distintos para o estudo: água límpida (maçico Pedra Branca), águas poluídas das lagoas e água marinha do Joá. O isolamento das culturas foi realizado em meios seletivos e as bibliotecas foram preparadas a partir do DNA genômico ambiental e do DNA proveniente do enriquecimento em BHI. Análises de DGGE mostraram perfis distintos tanto entre as bibliotecas ambientais e enriquecidas quanto entre os pontos de coleta de cada uma das abordagens. Um total de 497 sequências resultou em 245 unidades taxonômicas operacionais agrupadas a 97%. As análises comparativas demonstraram comunidades bacterianas significativamente diferentes entre as abordagens por meio do programa Unifrac. Este resultado também pode ser observado pelo diagrama de Venn, no entanto, vale ressaltar que uma OTU, correspondente ao Vibrio cholerae, foi compartilhada entre as três abordagens. Bactérias potencialmente patogênicas foram isoladas nos três ambientes estudados e 50% delas apresentaram resistência a pelo menos uma das classes de antibióticos analisadas. Nossos resultados permitem concluir que ambientes com diferentes parâmetros físico-químicos possuem comunidades microbianas distintas. / Urban coastal lagoons are polluted and dynamic environments that highly affected by the mixing of sediment, seawater and continental freshwater. In spite of a number of published studies of estuaries, freshwater and marine environments few concerned impacted urban lagoons in the tropics. We performed a polyphasic approach using microbiological methods as bacteria isolation and their antibiotic resistance profiles and molecular techniques such as PCR-DGGE and rrs gene of the 16S rRNA libraries to compare the bacterioplankton communities from the Jacarepaguá lagoon ecosystem. We selected three different environments for the study: freshwater (Pedra Branca), polluted waters of the lagoons and Joa’s seawater. The culture isolation was performed on selective medium and libraries were prepared from the genomic DNA environment and DNA from the enrichment in BHI. DGGE analysis showed distinct community profiles between each BHI culture and their environmental counterparts indicating that culturing leads to shifts in community composition. A total of 497 bacterial sequences were analyzed by MOTHUR, yielding 245 operational taxonomic units (OTUs) grouped at 97% stringency. UniFrac metrics and Venn diagrams showed that bacterial communities covered by each experimental approach were significantly different and that only one OTU was shared between them, corresponding to Vibrio cholera. Potentially pathogenic bacteria were isolates from most of the sampled environments and 50% of them showed antibiotic resistance. Our results suggest that environments with physical and chemical parameters have different microbial communities. The detection of resistant organisms in polluted waters clearly demonstrates the presence of intrinsic resistant mechanisms acquired by the microorganisms depending on the selective pressure. Metagenomic analyses, with or without enrichment, demonstrated the efficiency model for the evaluation of bacteria diversity in Jacarepaguá aquatic ecosystem. Our data may contribute to the improvement of environmental services and epidemiological surveillance of waters resources.

Made available in DSpace on 2016-05-31T12:40:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 viviane_fernandes_ioc_mest_2015.pdf: 5190293 bytes, checksum: 4ac1474636e152c4455544df6d3ddc95 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A região Neotropical conta com a maior biodiversidade de peixes no mundo. No Brasil ocorrem 1.236 espécies de peixes marinhos, entre eles Kyphosus incisor (Cuvier, 1831) e K. sectatrix (Linnaeus, 1758) (Kyphosidae). K. incisor (\201Cpirangica\201D) é uma espécie nectônica costeira que ocorre no Oceano Atlântico tropical e subtropical. No Brasil estudos com kifosídeos são escassos. Com o objetivo de avaliar a helmintofauna de K. incisor da costa do Rio de Janeiro, foram coletados e analisados 22 peixes obtidos com pescadores na praia de Copacabana (n=9) e no mercado de peixes da Central Estadual de Abastecimento do Rio de Janeiro (n=13). Um exemplar de K. sectatrix proveniente da Baia de Ilha Grande foi examinado em caráter comparativo. Os parasitos coletados foram fixados em álcool a 70%, AFA ou formalina a 4%. Os Nematoda foram clarificados e examinados em lâminas temporárias com glicerina, os Platyhelminthes foram corados em Paracarmim de Mayer ou Tricrômico de Gomori, os Acanthocephala foram corados em Paracarmim de Mayer e examinados em lâminas permanentes montadas em Bálsamo do Canadá. Alguns Monogenea foram montados alternativamente em meio de Hoyer, Gray e Wess, ácido pícrico com glicerina (GAP) ou Berlese A identificação taxonômica foi feita através de morfometria, desenhos em câmara clara, estudos por microscopia eletrônica de varredura e técnicas moleculares. Foram calculadas a prevalência, amplitude de intensidade, abundancia média e desvio padrão para cada espécie de parasito. Foram coletados 1.312 parasitos, pertencentes a 7 taxa: Monogenea (Pseudobivagina sp., Acleotrema sp. e Acleotrema lamothei), Trematoda (Opisthadena dimidia e Aponurus laguncula), Nematoda (Pseudascarophis brasiliensis), Acanthocephala (Filisoma sp.). Acleotrema spp. apresentaram a maior prevalência (72,7%), seguido por Pseudobivagina sp. (54,5%) e P. brasiliensis (45,4%). K. incisor é referido como novo hospedeiro para Pseudobivagina sp., O. dimidia, A. laguncula, P. brasiliensis e Filisoma sp. e esta é a primeira ocorrência de Pseudobivagina sp., O. dimidia e Filisoma sp. no oceano Atlântico. Este estudo indica a presença de 3 espécies novas (2 Monogenea e 1 Acanthocephala) / The Neotropical region has the greatest fish biodiversity in the world. In Brazil there are 1,236 species of marine fish, including Kyphosus incisor (Cuvier, 1831) and K. sectatrix (Linnaeus, 1758) (Kyphosidae). K. incisor ("yellow sea chub") is a coastal nektonic species that occurs in tropical and subtropical Atlantic Ocean. In Brazil studies on kyphosids are scarce. In order to assess the helminthes of K. incisor off the coast of Rio de Janeiro, 22 fish were obtained from fishermen off Copacabana beach (n = 9) and at the State Central Fish Market in Rio de Janeiro (n = 13) to be analyzed. A specimen of K. sectatrix from the Ilha Grande Bay was examined for comparative data. The collected parasites were fixed in 70% alcohol, AFA or 4% formalin. The Nematoda were clarified and studied in temporary slides with glycerol, Platyhelminthes were stained with Mayer´s Paracarmine or Gomori's Trichrome the Acanthocephala were stained with Mayer´s Paracarmine and mounted in permanent slides with Canada balsam. Some Monogenea were mounted alternately in Hoyer, Gray and Wess, picric acid with glycerol (GAP) or Berlese. The taxonomic identification was made through measurements, drawings with camera lucida, and studies by scanning electron microscopy and molecular techniques. The prevalence, intensity amplitude, average abundance and standard deviation for each parasite species were calculated. A total of 1,312 parasites, belonging to 7 taxa: Monogenea (Pseudobivagina sp., Acleotrema sp. and Acleotrema lamothei), Trematoda (Opisthadena dimidia and Aponurus laguncula), Nematoda (Pseudascarophis brasiliensis), Acanthocephala (Filisoma sp.). Acleotrema spp. had the highest prevalence (72.7%), followed by Pseudobivagina sp. (54.5%) and P. brasiliensis (45.4%). K. incisor is a new host record for Pseudobivagina sp., O. dimidia, A. laguncula, P. brasiliensis and Filisoma sp. and this is the first occurrence of Pseudobivagina sp., O. dimidia and Filisoma sp. in the Atlantic Ocean. These results indicate the presence of three new species (2 Monogenea and Acanthocephala). / 2016-Jul-09

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2017 / Made available in DSpace on 2017-09-19T04:11:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 347953.pdf: 6614028 bytes, checksum: dbe6fad108589175837f6a746eebca78 (MD5) Previous issue date: 2017 / Cyperaceae é uma grande família cosmopolita de monocotiledôneas. No Brasil é a terceira família mais representativa do domínio fitogeográfico Pampa, sendo também representativa no Pantanal, Caatinga e Floresta Amazônica. Cyperus é o segundo maior gênero da família, com cerca de 950 espécies amplamente distribuídas. Cyperus subg. Pycreus possui cerca de 120 espécies com distribuição Pantropical. As espécies deste subgênero são caracterizadas pela combinação de ovário bicarpelar, estilete bífido, aquênios lateralmente achatados e espiguetas plurifloras. O presente trabalho teve como objetivo realizar um estudo taxonômico de Cyperus subg. Pycreus como forma de contribuir ao conhecimento da diversidade do subgênero no Brasil. O trabalho foi desenvolvido com base em levantamento bibliográfico, coletas, revisão de herbários e análises morfológicas. Foi reconhecida a ocorrência de 14 espécies (C. barrosianus, C. capillifolius, C. flavescens, C. fugax, C. jaeggii, C. lanceolatus, C. lorentzianus, C. macrostachyos, C. megapotamicus, C. mundii, C. niederleinianus, C. polystachyos, C. pumilus e C. unioloides) e três novas espécies foram descritas (C. tuckerianus, Cyperus sp. 1 e Cyperus sp. 2). Para todas as espécies são fornecidas descrições, ilustrações, dados da distribuição, habitat, informações sobre floração e frutificação, além de características macro e micromorfológicas dos frutos. / Abstract: Cyperaceae is a large cosmopolitan family of monocotyledons. In Brazil, this is the third most representative family of the Pampa phytogeographic domain, being also representative in the Pantanal, Caatinga and Amazon Rainforest. Cyperus is the second largest genus of Cyperaceae, with about 950 species widely distributed. Cyperus subg. Pycreus has about 120 species with Pantropical distribution. The species of this subgenus are characterized by the combination of ovary bicarpelar, style bifid, achene laterally flattened, and by spikelets pluriflowered. The present work aimed to carry out a taxonomic study of Cyperus subg. Pycreus as a way to contribute to the knowledge of the subgenus diversity in Brazil. The work was developed based on bibliographical survey, collections in field, herbarium review and morphological analyzes. It was confirmed the occurrence of 14 species (C. barrosianus, C. capillifolius, C. flavescens, C. fugax, C. jaeggii, C. lanceolatus, C. lorentzianus, C. macrostachyos, C. megapotamicus, C. mundii, C. niederleinianus, C. polystachyos, C. pumilus and C. unioloides) and the description of three new species (C. tuckerianus, Cyperus sp. 1 and Cyperus sp. 2). For all species we provide descriptions, illustrations, distribution data, habitat, information on flowering and fruiting, and macro and micromorphological characteristics of the achenes.

O Brasil abriga a maior riqueza de anuros do mundo (946 espécies). Os anuros são os anfíbios mais conhecidos no mundo, com um total de 5.679 espécies identificadas. Estudos em relação a estrutura das comunidades de parasitos de anuros vem sendo aos poucos estudadas em nosso país. Nesse estudo foram investigadas a composição e a estrutura da comunidade parasitária de seis espécies de anuros (Ischnocnema henselii, Leptodactylus latrans, Rhinella icterica, Physalaemus cuvieri, Scinax fuscovarius e Melanophryniscus simplex). Os anuros (68 espécimes de P. cuvieri; 60 espécimes de L. latrans, R. icterica e S. fuscovarius; 32 espécimes de I. henselii e 30 espécimes de M. simplex) foram coletados manualmente ou com pitfalls na área da Florestal Gateados, no município de Campo Belo do Sul, SC, Brasil. Foram encontradas 31 espécies de helmintos: 10 espécies de digenéticos; uma espécie de monogenético, duas espécies de cestóides, duas espécies de acantocéfalos e 16 espécies de nematóides. Os anuros estudados apresentaram riquezas parasitárias distintas (17 espécies em L. latrans; 12 espécies em R. icterica; oito espécies em P. cuvieri; cinco espécies em M. simplex; quatro espécies em I. henselii e quatro espécies em S. fuscovarius). As espécies com maiores valores de similaridade qualitativa (0,409) e quantitativa (0,581) foram L. latrans e R. icterica. O tamanho dos anuros de I. henselii, L. latrans e R. icterica influenciaram na abundância de parasitos, nos anuros de L. latrans o tamanho também influenciou na prevalência e na riqueza parasitária. Diferente dos anuros de P. cuvieri, S. fuscovarius e M. simplex onde tamanho não influenciou na abundância, na prevalência e na riqueza parasitária. O sexo do hospedeiro influenciou na abundância de cosmocercídeos em I. henselii e na prevalência de cosmocecídeos em L. latrans. Em R. icterica, P. cuvieri e em S. fuscovarius o sexo não influenciou na abundância, na prevalência e na riqueza parasitária dos helmintos. Nesse, estudo apresentamos novas espécies de hospedeiros para determinadas espécies de helmintos, nova localidade (Santa Catarina) para algumas espécies de helmintos e o município de Campo Belo do Sul é registrado como um novo local para as 31 espécies de helmintos.

Submitted by Maykon Nascimento (maykon.albani@hotmail.com) on 2015-08-03T20:20:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Estudo da evolução da paisagem da área do município de Linhares (ES) nos anos de 1985 e de 2013 - 2014, por meio das métricas.pdf: 9201087 bytes, checksum: a74978fbac7e02658d99693a2d6a6e2e (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2015-08-19T14:23:41Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Estudo da evolução da paisagem da área do município de Linhares (ES) nos anos de 1985 e de 2013 - 2014, por meio das métricas.pdf: 9201087 bytes, checksum: a74978fbac7e02658d99693a2d6a6e2e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-19T14:23:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Estudo da evolução da paisagem da área do município de Linhares (ES) nos anos de 1985 e de 2013 - 2014, por meio das métricas.pdf: 9201087 bytes, checksum: a74978fbac7e02658d99693a2d6a6e2e (MD5) Previous issue date: 2014 / Trata a presente pesquisa sobre o estudo da evolução da área da paisagem que compõe o município de Linhares (ES), nos anos de 1985 e 2013/2014, que constitui o maior município do Estado do Espírito Santo. Foi realizada, por meio de processamento digital de imagens de satélites LANDSAT 5 e 8, a classificação de uso e ocupação da terra da área em estudo. Além disso usou-se as imagens do satélite RapdEye para acurácia da classificação digital das imagens. A partir dos resultados levantados de uso e ocupação foram definidas as matrizes da paisagem para 1985 e 2013/2014, bem como avaliadas as manchas que compõem a matriz. Foram aplicadas as métricas da paisagem utilizando a ferramenta de estatística Fragstats, possibilitando o cálculo dos Índices de Paisagem afim de avaliar a evolução qualitativa e quantitativa da paisagem do município de Linhares. / This research aim about the study of the evolution of the landscape area that makes up the city of Linhares (ES) in the years of 1985 and of 2013/2014, which is the largest municipality in the state of Espírito Santo. By means of digital image processing of LANDSAT 5 and 8, the classification of land use and land cover of the study area was performed. Also used the images on RapdEye satelite for accuracy of digital image classification. From the results collected for use and cover land of the landscape matrices were set for 1985 and 2013/2014, as well as evaluated the spots that make up the array. The landscape metrics using the statistical tool Fragstats were applied, enabling the calculation of landscape indices in order to assess the qualitative and quantitative evolution of the landscape of the municipality of Linhares.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-12-13T03:13:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 342642.pdf: 1590647 bytes, checksum: 7a97c7b384d783e7464943e465dd4404 (MD5) Previous issue date: 2016 / A diversidade e coexistência de espécies vêm sendo estudada por décadas, o que desencadeou no desenvolvimento de diversas teorias ecológicas a fim de compreender os processos envolvidos na estruturação de comunidades. A composição e a distribuição de espécies são regidas por processos regionais (e.g. dispersão, especiação) e interações bióticas (e.g. competição, predação). No entanto, pouco se sabe sobre a influência de processos regionais e filtros espaciais na distribuição de espécies em comunidades locais. Em ecossistemas marinhos, peixes recifais exibem um gradiente longitudinal de riqueza de espécies em larga escala que está fortemente associado a processos regionais. Por outro lado, interações interespecíficas, como competição, atuam sobre a dinâmica de populações de peixes recifais e podem desempenhar um papel fundamental sobre a composição de espécies desse grupo. No presente estudo, investigamos a relação entre a riqueza de espécies e a diversidade de interações agonísticas de peixes recifais em diferentes escalas espaciais ao longo de sete recifes tropicais distribuídos em cinco províncias biogeográficas (Atlântico Oeste, Caribe, Polinésia, Pacífico Central e Indo-Pacífico Central). Ainda, para cada recife foi construída uma rede de interações agonísticas entre espécies de peixes recifais, para comparar a estrutura dessas interações entre os sete recifes. Dados de riqueza de espécies e diversidade de interações agonísticas foram coletados através de um total de 350 amostras de vídeos em recifes biogênicos rasos e abrigados. Cada amostra possui duração de 10 minutos e abrange uma área de 2m². Foi observado maior acúmulo de espécies em comunidades locais regionalmente mais ricas e uma relação positiva entre riqueza regional e local. A riqueza local, composta apenas por espécies que interagiram agonisticamente, demonstrou essa mesma tendência de acúmulo de espécies, porém uma relação fraca entre a riqueza regional e local, ou seja, o número de espécies interagindo em escala local não aumenta de acordo com número de espécies. Este contraste entre acúmulo de espécies e relações espaciais de riqueza pode ser explicado através do aumento da diversidade beta turnover de espécies que interagem conforme o aumento da riqueza regional, e sugere uma segregação espacial destas espécies em comunidades locais regionalmente ricas. As redes agonísticas em escala regional diferiram quanto à complexidade topológica, porém exibiram semelhanças na composição filogenética efuncional das espécies. Pomacentrídeos, labrídeos e acanthurídeos predominaram na composição das redes e o grupo funcional de herbívoros territoriais desempenhou um papel central em todas as sete localidades. Portanto, a contextualização empírica de comportamento agonístico de peixes recifais frente a diferentes escalas espaciais sugere que a riqueza regional é fundamental na estruturação de comunidades em diversas escalas espaciais, porém espécies que potencialmente competem pelos mesmos recursos podem ter sua distribuição espacial determinada por fatores locais (e.g. disponibilidade de recursos e atributos funcionais das espécies).<br> / Abstract : Diversity and coexistence of species have been studied for decades and triggered several ecological theories to understand the process involved in community assemblages. The composition of species pools is influenced by regional processes (e.g. dispersion, speciation and extinction) and biotic interactions (e.g. competition, predation). However, how these processes operate over species distributions across different spatial scales is poorly know. In marine ecosystems, reef fishes exhibit a longitudinal large-scale gradient of species richness and regional processes are strongly associated with community assembly. Conversely, interspecific interactions, such as competition, influence population dynamics of reef fishes and may have an essential role in shaping the community composition of this group. In this study, we aimed to investigate the relationship between species richness and the structure of agonistic interactions of fishes across different spatial scales, from tropical reefs in seven localities across five biogeographic provinces (south-western Atlantic, Caribbean, Polynesian, Central Pacific and Central Indo Pacific). Moreover, agonistic networks of reef fishes were built to compare the structure of these interactions among the seven studied localities. Species richness and agonistic interactions data were collected through a total of 350 samples of remote videos in shallow sheltered reefs, each sample consisting of a 2m² area during 10 minutes. We observed a higher species accumulation in regionally richer localities and a positive relationship between local and regional richness. For the local pool composed only by interacting species, we observed the same pattern in species accumulation, but not the local and regional positive relationship. This pattern can be explained by the increasing species turnover towards regional richer areas suggesting higher spatial segregation of interacting species in richer local communities. Moreover, the topological complexity of agonistic networks, defined by modularity and centralization values, increased according to the regional richness gradient. Pomacentrids, labrids and acanthurids were predominant at network composition in all seven localities and territorial herbivores performed a central role in all local communities. Combined, our findings suggest that regional richness of reef fishes plays an essential role on the composition of local species pool, and that local processes (e.g. resource availability and species intrinsic attributes) probably drive the agonistic behavior the spatial distribution of species. Furthermore, the empiricalcontextualization of agonistic behavior in reef fish across different spatial scales highlights the importance of a better understanding of the balance among different mechanisms regulating the spatial distribution and resource use partition in reef fish communities.

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:30:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-10-28. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:34:12Z : No. of bitstreams: 1 000857502.pdf: 5223996 bytes, checksum: 7799f5af97086ccd0a7ba6b4444345b8 (MD5) / O processo de urbanização é uma das principais ações antrópicas que alteram os ambientes naturais, resultando em inúmeras consequências ambientais, como a redução e fragmentação dos habitats naturais, causando perda da biodiversidade, entre outros desequilíbrios aos ecossistemas. A urbanização pode favorecer a homogeneização da avifauna e a dominância de algumas espécies, entre elas, estão os sabiás. Os sabiás são aves que possuem importante papel na manutenção da biodiversidade de plantas em áreas urbanas, graças à sua alta abundância e grau de frugivoria, juntamente com o uso frequente de fragmentos florestais. A estrutura do habitat e a disponibilidade de recursos são fatores importantes que influenciam as comunidades de aves tanto em ambientes naturais quanto em ambientes modificados pelo homem, com consequências para o tamanho da área de vida e na maneira como as aves utilizam o habitat. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi analisar o tamanho da área de vida de sabiás da espécie Turdus leucomelas, além de investigar o quanto a estrutura do ambiente influencia na seleção de habitat por essas aves em um ambiente urbanizado. O estudo foi realizado no município de Rio Claro / SP, no campus da Universidade Estadual Paulista ―Júlio de Mesquita Filho (UNESP). As coletas de dados foram realizadas entre Maio/2014 e Julho/2015. Foram monitorados 14 sabiás equipados com radiotransmissores, e no total foram coletados 1057 pontos de localização das aves. O valor médio das áreas de vida foi de 3,82 hectares quando estimado pelo Kernel 95%, e 3,26 hectares quando estimado através do MPC. Quanto a seleção de habitat todos os indivíduos selecionaram positivamente o tipo de habitat bosque (árvores, arbustos e áreas que formam bosques contínuos) e negativamente os outros tipos, o que mostra a importância da conservação da vegetação dentro das cidades, pois a manutenção dos indivíduos e da... / The process of urbanization is one of the main human activities that alter natural environments, bringing numerous environmental impacts such as the reduction and fragmentation of natural habitats, causing loss of biodiversity, among other imbalances to the ecosystems. Urbanization can foster the homogenization of birds and the dominance of a few species, so in disturbed areas, plants have their reproductive investment dependent on a small group of bird species.Thrushes are one of such groups, possessing significant role in plant biodiversity maintenance in urban areas because of its high abundance and extent of frugivory, along with the frequent use of forest fragments in urban areas. Habitat structure and resource availability are important factors that influence bird communities both in natural environments and in environments modified by humans, influencing the size of the home ranges and the way that birds use the habitats. Thus, the aim of this study was to analyze the home range size of the thrush species Turdus leucomelas, and to investigate how environmental structure influences the habitat selection by these birds in an urban area. The study was conducted in the municipality of Rio Claro / SP, at the Universidade Estadual Paulista - Júlio de Mesquita Filho (UNESP) campus. Data collection took place from May/2014 to July/2015. Fourteen thrushes were monitored with radio transmitters, and a total of 1057 points of location were collected. The average values of the home ranges was 3.82 hectares as estimated by the Kernel 95%, and 3.26 hectares when estimated by the MCP. As for habitat selection all individuals positively selected forest habitat and negatively the other types. This shows the importance of conservation of vegetation in cities, because the maintenance of the individuals and biodiversity of birds in an urbanized environment is directly related to the local vegetation volume. So it is clear the need for policies that ...

Orientador : Profª. Drª. Márcia C. M. Marques / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação. Defesa: Curitiba, 21/02/2017 / Referências ao final de cada capitulo / Área de concentração : Ecologia e conservação / Resumo: O bioma Floresta Atlântica, um hotspot de biodiversidade, abriga a maior parte das terras cultivadas e da população do Brasil. Encontrar um caminho sustentável para o uso da terra nesse bioma é necessário, dado que as condições regionais e globais do clima, a provisão de comida e energia e a conservação da biodiversidade, estão todos em jogo. Aplicações da teoria ecológica podem auxiliar nesse objetivo de se atingir o desenvolvimento sustentável, conciliando produção e conservação da Floresta Atlântica. Essa tese teve como objetivo geral verificar o padrão de distribuição espacial da diversidade de espécies lenhosas em remanescentes da Floresta Atlântica e relacionar com indicadores de produção agrícola, a fim de subsidiar ações eficazes de conservação da biodiversidade neste bioma. A tese foi organizada em três capítulos tratando destes temas relacionados. O primeiro capítulo explorou os elementos da estrutura de metacomunidade e da diversidade da Floresta Atlântica e seus determinantes em diferentes escalas espaciais, com intuito de subsidiar políticas de conservação. A metacomunidade da Floresta Atlântica como um todo, bem como de seus tipos florestais (Florestas Ombrófila Densa, Ombrófila Mista e Estacional) apresentam estrutura de nested subsets, que representa subconjuntos aninhados com perda agrupada de espécies. Além disso, os componentes locais e geográficos da diversidade são responsáveis pela alta diversidade do bioma. Estes resultados demonstram que a diversidade da Floresta Atlântica é espacialmente estruturada e sugere que os esforços de conservação seriam mais efetivos focando na proteção de sítios ricos em diversidade. No segundo capítulo foi apresentado um breve histórico da agricultura na Floresta Atlântica a fim de se evidenciarem as grandes mudanças temporais das práticas agrícolas adotadas. As práticas de exploração econômica da Floresta Atlântica avançaram muito ao longo dos anos; iniciaram-se com um modelo extrativista, chegando à mecanização e diversificação de culturas. A quebra de paradigma do modelo agrícola foi um dos responsáveis por esses grandes avanços da agricultura no Brasil. Considerando as atuais ameaças à biodiversidade, sugere-se que o momento atual seja prenúncio de um novo paradigma na agricultura, onde o desenvolvimento agrícola seja baseado na sustentabilidade. O terceiro capítulo explorou trade-offs entre biodiversidade e produção agrícola na Floresta Atlântica, utilizando método inovador que permite a comparação entre serviços ecossistêmicos mensurados com diferentes métricas. A biodiversidade é diretamente dependente da área conservada, mas a produção agrícola pode aumentar sem a necessidade de aumento da área agrícola. Estes resultados mostram que um cenário de ganhos tanto no aumento da produção agrícola como na conservação da biodiversidade são possíveis e devem ser considerados em planejamentos futuros. Em conclusão, o trabalho sugere que esforços de conservação na Floresta Atlântica contemplem os três tipos florestais e priorizem sítios ricos em espécies. A ênfase no aumento da eficiência das práticas agrícolas em terras já convertidas para a agricultura pode promover tanto o incremento da produtividade quanto a conservação da biodiversidade nessa floresta tropical hiperdiversa. Palavras-chave: Árvore, tropical, comunidade, diversidade, serviços ecossistêmicos. / Abstract: The Atlantic Forest biome is a hotspot of biodiversity and hosts most of Brazil's cultivated land and population. Finding a sustainable path for the land-use in this biome is necessary as regional and global climate conditions, food and energy provision, and biodiversity conservation are all at stake. Applications of the ecological theory can help achieving a sustainable development, reconciling production and conservation in the Atlantic Forest biome. The general objective of this thesis was to verify the pattern of the spatial distribution of the woody species diversity in forest remnants and to relate it with indicators of agricultural production, to subsidize effective conservation actions in the Atlantic Forest. The thesis was organized in three chapters addressing these related topics. The first chapter explored the elements of the metacommunity structure and diversity of the Atlantic Forest and its determinants in different spatial scales. The metacommunity of the entire Atlantic Forest, as well as of its forest types (Ombrophilous Dense, Ombrophilous Mixed, and Seasonal Forests) present a nested subsets structure with grouped loss of species. In addition, the local and geographic components of diversity are responsible for the high diversity of the biome. These results demonstrate that the diversity of the Atlantic Forest is spatially structured and suggests that conservation efforts would be more effective focusing on the protection of diversity-rich sites. In the second chapter, a brief history of agriculture in the Atlantic Forest was presented to show the temporal changes in the agricultural management. The economic exploitation practices of the Atlantic Forest have advanced over the years; it began with an extractivist model, reaching the mechanization and diversification of cultures. The paradigm breach of the agricultural model adopted was one of the responsible for these advances in the Brazilian agriculture. Given the actual levels of threat for the biodiversity, it is suggested that the current moment is a harbinger of a new paradigm in agriculture, with the agricultural advance being based on sustainability. The third chapter explored trade-offs between biodiversity and agricultural production in the Atlantic Forest, using an innovative method that allows the comparison between ecosystem services measured with different metrics. Biodiversity is directly dependent on the conserved area, but agricultural production can increase without the need to increase the agricultural land. These results show that a win-win scenario is possible, conciliating increases in the agricultural production and conserving biodiversity, and should be considered in future land use management planning. In conclusion, the result suggests that conservation efforts in the Atlantic Forest may encompass the three forest types and prioritize sites rich in species. Emphasis on increasing the efficiency of farming practices on already converted lands can enhance both productivity and biodiversity conservation in this hyper-diverse tropical forest. Key-words: Tropical Forest, metacommunity, tree, diversity, ecosystem services, agriculture.

Orientador : Dr. Carlos Eduardo Conte / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa: Curitiba, 17/02/2016 / Inclui referências : f. 61-68;154-159;178-182 / Resumo: A principal ameaça aos anfíbios é a destruição e alteração do hábitat, realidade no Brasil, onde fitofisionomias como a Floresta Estacional Semidecidual (FES) e Floresta Ombrófila Mista (FOM) foram quase dizimadas. Como agravante, estas fitofisionomias apresentam uma carência de conhecimento de aspectos relacionados à estruturação das taxocenoses de anfíbios. Desta forma, estudos que buscam conhecer os fatores que regulam e distribuem as taxocenoses de anfíbios em áreas que abrigam remanescentes destas formações são urgentes e necessários. Neste sentido, o presente estudo teve como objetivos: i) realizar o levantamento da anurofauna do Parque Nacional do Iguaçu (PNI), apresentando dados sobre o uso do hábitat das espécies registradas (local onde foram registrados os machos em atividade de vocalização), apresentando a distribuição das espécies no estado e informando dados sobre a história natural das espécies, ii) avaliar a estruturação das taxocenoses de anuros nas distintas formações vegetacionais do PNI, a FES e a FOM e iii) determinar a riqueza de modos reprodutivos das espécies de anuros encontradas nestes remanescentes, analisando quais fatores climáticos (temperatura e umidade relativa ar) influenciam na atividade de vocalização das taxocenoses destes e apresentar a temporada de vocalização dos machos de anuros em corpos da água inseridos destas fitofisionomias. Dentro dos objetivos, foram analisadas as seguintes hipóteses: Modos reprodutivos generalizados são encontrados em maior abundancia em FES; A temporada de vocalização das espécies são relacionadas ao clima, em FES a relação se da com a umidade e FOM com temperatura mínima. O estudo foi desenvolvido em doze fases de campo mensais entre setembro de 2014 a agosto de 2015. Foram utilizados três métodos coleta: i) busca em sitio de reprodução, ii) busca aural em transecções e iii) armadilhas de interceptação e queda. Ao todo foram registradas 31 espécies de anfíbios anuros distribuídas em nove famílias. De acordo com a extrapolação da curva de acumulação de espécies, a assíntota seria encontrada na vigésima primeira amostra, com registro de aproximadamente 32 espécies. Em relação ao uso de hábitat aproximadamente 39% das espécies foram consideradas generalistas, 29% foram classificadas como exclusiva de mata, 23% foram classificadas como exclusiva de área aberta e 9% foram classificadas como área aberta e borda. Das espécies registradas 35% apresentam distribuição ampla no Paraná, 35% apresentam distribuição média, 16% distribuição baixa e outras 14% não foram categorizadas por não terem sido identificadas a nível especifico. Para a diversidade alfa, não foi observado diferenças nas taxocenoses. Já em relação à diversidade beta, foi possível observar que as fitofisionomias são distintas, com dissimilaridade de 90%. Dez modos reprodutivos foram registrados na área, sendo que a FES apresentou maior variedade de modos reprodutivos generalizados (n=4) e a FOM maior variedade de modos reprodutivos especializados (n=3). Foi observado que em FES há maior registro e abundância de espécies nos períodos mais quentes e úmidos do ano, ao passo que em FOM há menor registro e abundância de espécies nos períodos mais frios. Quatro padrões temporais foram encontrados: anuais; de inicio de estação chuvosa; de estação chuvosa; e esporádicas. Mediante aos resultados, foi possível observar que as diferenças estruturais e climáticas das fitofisionomias formam composições de espécies singulares devido à presença de espécies distintas, associadas a cada fitofisionomia. Ainda, foi possível constatar, que as características especificas das fitofisionomias, atuam na diversidade e especificidade de modos reprodutivos e na distribuição temporal das espécies, onde as espécies podem adequar suas temporadas de vocalizações conforme as variáveis climáticas destas. Frente ao grande declínio que os anfíbios vêm sofrendo, nossos resultados evidenciam a importância do PNI e de grandes remanescentes formados por diferentes fitofisionomias para a conservação das taxocenoses de anfíbios. Palavras-chave: Riqueza, Diversidade, Taxocenoses de Anfíbios, Fitofisionomias, Floresta Estacional Semidecidual, Floresta Ombrófila Mista, Modos Reprodutivos, Fatores Climáticos. / Abstract: The main threat to amphibians is destruction and alteration of their habitat, a reality in Brazil, where phytophysiognomies such as the Mesophytic Semideciduous Forest (FES) and the Mixed Ombrophylous Forest (FOM) were almost decimated. As an aggravating factor, these phytophysiognomies present a lack of knowledge of aspects related to the structure of amphibian taxocenoses. In this way, studies that seek to know the factors that regulate and distribute amphibian taxocenoses in areas formed by these formations are urgent and necessary. In this sense, the present study had as objectives: i) inventory the anurofauna the Iguaçu National Park (PNI), presenting data on the habitat use of the registered species (where males were recorded in calling activity), presenting the distribution of the species in the state and reporting data on the natural history of the species, ii) evaluate the structure of anuran taxocenoses in the different vegetation formations of the PNI, FES and FOM and iii) determine the richness of reproductive modes of anuran species found in these remnants, analyzing which climatic factors (temperature and relative air humidity) influence the activity of vocalization of the taxocenoses and present the vocalization season of the anurans males in water bodies inserted in these phytophysiognomies. In addition to these objectives, the following hypotheses were tested: generalists reproductive modes are found in greater abundance in FES; The season of vocalization of the species is related to the climate: in FES its related to the moisture, and FOM its related to the minimum temperature. The study was developed in twelve monthly field phases between September 2014 and August 2015. Three collection methods were used: i) search on site of reproduction, ii) aural search in transections, and iii) pitfall traps. It was recorded 31 species of amphibians distributed in nine families. According to the extrapolation of species curve, the asymptote would be found in the twenty-first sample with, approximately, 32 species recorded. In relation to habitat use, 39% of the recorded species were considered generalists, 29% were classified as exclusive woods, 23% were classified as exclusive open area, 9% were classified as open area and edge. Of the species registered, 35% have a wide distribution in Paraná state, 35% have a medium distribution, 16% have a low distribution and another 14% were not categorized because they were not identified at a specific level. For alpha diversity, was not observed differences in taxocenoses. Regarding the beta diversity, it observed that the vegetation types are different, with average dissimilarity of 90%. Ten reproductive modes were recorded in the area, with the FES presenting a greater variety of generalists reproductive modes (n = 4) and FOM a greater variety of specialists reproductive modes (n = 3). It was observed that in FES there is more record and abundance of species in the hotter and wetter periods of the year, whereas in FOM there is less record and abundance of species in colder periods. Four temporal patterns were found: annually; in the beginning of the rainy season; in the rainy season; and sporadic. Through the results, it was possible to observe that the structural and climatic differences of phytophysiognomies form compositions of singular species due to the presence of distinct species, associated to each phytophysiognomy. It was also possible to verify that the specific characteristics of the phytophysiognomies affect the diversity and specificity of the reproductive modes and the temporal distribution of the species, where the species can adapt their seasons of vocalizations according to their climatic variables. In the face of the great decline that amphibians are suffering, our results highlight the importance of PNI and large remnants formed by different phytophysiognomies for the conservation of amphibian taxocenoses. Palavras-chave: Wealth, Diversity, Amphibian Taxocenoses, Phytophysiognomies, Mesophytic Semideciduous Forest, Mixed Ombrophilous Forest, Reproductive Modes, Climatic Factors.