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Seleção de candidatos a agentes para o controle biológico de Pereskia aculeata (Miller) (Cactaceae) /

Cristo, Sandra Ciriaco de, 1982-, Vitorino, Marcelo Diniz, 1968-, Universidade Regional de Blumenau. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Florestal. January 2014 (has links) (PDF)
Orientador: Marcelo Diniz Vitorino. / Dissertação (mestrado) - Universidade Regional de Blumenau, Centro de Ciências Tecnológicas, Programa de Pós-Graduação de Engenharia Florestal.
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Como queimadas em diferentes épocas do ano afetam a relação entre gramíneas invasoras e a vegetação nativa de cerrado? /

Damasceno, Gabriella de Faria. January 2017 (has links)
Orientador: Alessandra Tomaselli Fidelis / Banca: Vania Regina Pivello / Banca: Giselda Durigan / Resumo: Gramíneas africanas são uma das principais ameaças à conservação da biodiversidade do Cerrado por estarem amplamente dispersas no interior de unidades de conservação. Melinis minutiflora e espécies do gênero Urochloa, como U. brizantha e U. decumbens, estão entre as invasoras mais comuns, alterando inclusive, regimes de distúrbio, como queimadas naturais. O fogo é um elemento recorrente em sistemas savânicos e, assim, a vegetação savânica é resiliente e apresenta adaptações ao regime de fogo. Este estudo avaliou 1) o impacto que as gramíneas invasoras Melinis minutiflora e Urochloa brizantha causam na vegetação nativa de Cerrado; 2) o efeito da época de queima no controle destas duas espécies; e 3) as alterações de diversidade das comunidades invadidas em resposta à queimadas em diferentes épocas do ano. A área de estudo está inserida na Estação Ecológica de Itirapina e, até o ano 1998, foi utilizada para silvicultura de Pinus caribaea, sendo que desde, então, fogo e pastejo foram excluídos. O delineamento experimental é composto por 32 parcelas (15x15m) dominadas por uma das duas espécies invasoras (cobertura mínima de 50%) e aleatoriamente submetidas a três tratamentos de queima: precoce (maio), modal (julho) e tardia (outubro), além de parcelas controle não queimadas (4 parcelas/tratamento/espécie invasora = 32 parcelas). Os experimentos de queima ocorreram em 2014 (maio, julho e outubro), sendo a amostragem da vegetação realizada anteriormente às queimas e ao longo de doi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Not available / Mestre
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O conhecimento dos comandantes de navios sobre Bioinvasão por água de lastro nos portos do Estado do Paraná e a importância da educação ambiental

Procopiak, Leticia Knetchel 01 June 2010 (has links)
Resumo: As bioinvasões por água de lastro de navios podem causar impactos sócioeconômicos e ambientais em vários ecossistemas, sendo a água de lastro considerada um dos principais vetores de ransferência de espécies exóticas, nocivas e patogênicas de um porto a outro. Apesar da legislação e campanhas educativas, as invasões ainda estão ocorrendo. O comandante do navio que, conforme a hierarquia da marinha mercante, é o responsável por tomar todas as decisões na embarcação, delegando normas de conduta e tarefas aos seus subordinados, incluindo o procedimento da execução da troca do lastro. Assim, houve necessidade de investigar o conhecimento, formal e não formal, destes oficiais em relação aos im pactos causados pelas invasões biológicas e a pertinente importância do emprego de étodos que previnam a introdução de espécies através do despejo da água de lastro, por meio de pesquisa quali quantitativa. Para tal, foram realizadas vinte entrevistas com estes oficiais, nos navios atracados nos Terminais Portuários da Ponta do Félix SA, em Antonina e nos do Terminal de Con êineres de Paranaguá. Além disso, foram analisados os formulários sobre água de lastro destes navios. A formação dos oficiais, em termos de conteúdos ambientais, aborda principalmente a MARPOL e leis e normas ambientais. Foi notável a confusão em relação aos conteúdos ambientais e os aspectos legais, estes sendo confundidos também com conteúdos de Educação Ambiental, ética e cidadania. A maioria dos oficiais tem noção dos impactos que são causados pela água de lastro, sabem da importância da troca oceânica como medida preventiva, mas nem todos sabem exatamente por que devem cumprir o que está disposto na lei. Os oficiais informaram que durante a navegação de cabotagem não há tempo para se trocar o lastro e a NORMAM 20, norma marítima brasileira que trata sobre as questões do lastro, estabelece que navios que navegam na costa brasileira não precisam trocar o lastro. Neste caso, a norma carece de medidas especificas que envolvam os estuários, pois recentemente ocorreram invasões no Complexo Estuarino de Paranaguá, provavelmente provenientes da navegação de cabotagem. Assim, para se suprir estas carências na formação dos oficiais, é necessário o investimento nos cursos de formação de oficiais, buscando uma ênfase â Educação Ambiental e aos impactos causados pelos navios, incluindo a bioinvasão por água de lastro no contexto social e econômico. Noções da biologia das espécies invasoras e dos ecossistemas deveriam ser mais detalhadas nos cursos. Não basta apenas conhecer as leis, mas sim entender o que as justificam, e não simplesmente cumpri-Ia devido às sanções punitivas, pois uma vez que há a compreensão o cumprimento vem naturalmente, pois há a verdadeira conscientização do problema. A fundamentação teórica eguiu principalmente autores como: Enrique Leff, Isabel Carvalho, Edgar Morin, Mauro Guimarães, Paulo Freire, Genebaldo Freire Dias, Ulrich Beck e Anthony Giddens.
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Análises isoenzimáticas, moleculares e ultraestruturais em camarões dulcícolas do gênero Macrobrachium

Lopes, Alessandro Garcia [UNESP] 21 February 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-21Bitstream added on 2015-04-09T12:47:34Z : No. of bitstreams: 1 000811200.pdf: 1923583 bytes, checksum: 84c931392978dc9e10b51b2550541665 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os camarões do gênero Macrobrachium (Crustacea, Decapoda, Palaemonidae), encontrados em ambientes de água doce, são amplamente distribuídos pelas regiões tropicais e subtropicais do mundo, inclusive em locais próximos ao litoral. Algumas espécies desse gênero, como por exemplo M. rosenbergii, apresentam valor econômico, sendo cultivadas e comercializadas como alimento. Na região Noroeste do Estado de São Paulo, são encontradas as espécies classificadas como M. amazonicum e M. jelskii, as quais são espécies exóticas de camarões dulcícolas recentemente introduzidas e amplamente disseminadas em reservatórios de usinas hidrelétricas desta região. Essas espécies possuem hábitos crípticos e noturnos, sendo predadores de larvas de peixes e também presas de peixes adultos e outros organismos. M. amazonicum e M. jelskii apresentam grande similaridade interespecífica em termos de caracteres morfológicos, o que pode dificultar a classificação taxonômica desses organismos. O objetivo deste estudo foi conduzir análises morfométricas, ultraestruturais, isoenzimáticas e moleculares em M. amazonicum e M. jelskii, na tentativa de obter-se novos dados para distinguí-los. Os camarões foram coletados das populações dos reservatórios de Sales/SP e Mendonça/SP. As análises morfométricas englobaram as medidas do télson, dos espinhos caudais internos e do rostro. As análises por microscopia eletrônica de varredura foram realizadas nas estruturas do télson, nos espinhos caudais internos e no apêndice masculino. As análises isoenzimáticas, realizadas por eletroforese em gel de poliacrilamida, abrangeram as enzimas álcool desidrogenase, octanol desidrogenase, glicose-6-fosfato desidrogenase, lactato desidrogenase, amilase e esterases do hepatopâncreas e tecido muscular. Análises moleculares envolveram a amplificação do espaçador intergênico interno ITS-1 (Internal Transcribed Spacer 1) do rDNA. Os fragmentos ... / Prawns of the genus Macrobrachium (Crustacea, Decapoda, Palaemonidae) can be found in freshwater environments, widely distributed throughout tropical and subtropical regions of the world, including regions near the coast. Some species of this genus, for example Macrobrachium rosenbergii, present economic value, which are reared and traded as food. In the northwest region of São Paulo State two exotic freshwater prawn species are found, classified as M. amazonicum and M. jelskii, which were recently introduced to the aquatic reservoirs of hydroelectric power plants and then, disseminated throughout reservoirs in this region of the State. These species have cryptic and overnight habits, being predators of fish larvae and also being prey to adult fishes and other organisms. M. amazonicum and M. jelskii present high rates of interspecific similarity in terms of morphological characters, which are generally used to distinguish them, what may induce mistakes in taxonomic identification. The objective of this study was to conduct morphometric, ultrastructural, isoenzymatic and molecular analyses of M. amazonicum and M. jelskii, in order to obtain more data about their differentiation. The prawns were collected in reservoirs of Sales/SP and Mendonça/SP. Morphometric analyses were performed involving the structures of telsons, internal caudal spines and rostrums. Scanning electron microscopy analyses were performed on structures of telsons, internal caudal spines and male appendices. Isoenzymatic analyses by polyacrylamide gel electrophoresis included the enzymes alcohol dehydrogenase, octanol dehydrogenase, glucose-6-phophate dehydrogenase, lactate dehydrogenase, amylase and esterases of hepatopancreas and muscle tissue. Molecular analyses were performed by amplification and sequencing of ITS-1(Internal Transcribed Spacer 1) intergenic spacer from rDNA. The amplificated fragments were used for analyzing length polymorphism restriction fragments ...
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Efeito da biomassa de espécie exótica (Brachiaria subquadripara (Trin.) Hitchc.) e nativa (Eichhornia azurea (SW. Kunth) sobre a estrutura da comunidade de macrófitas aquáticas

Amorim, Sara Regina de [UNESP] 29 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-29Bitstream added on 2014-06-13T20:29:40Z : No. of bitstreams: 1 amorim_sr_me_rcla.pdf: 536169 bytes, checksum: fff47fb3468cdfb820a4f0aaf0c557fe (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O estabelecimento, naturalização e expansão de espécies exóticas têm sido responsáveis por grandes mudanças na composição e estrutura dos ecossistemas naturais. Neste trabalho, testamos a hipótese de que a predominância e a biomassa de uma espécie exótica invasora alteram a estrutura da comunidade de macrófitas aquáticas de forma mais drástica que a predominância e biomassa de uma espécie nativa, reduzindo a riqueza funcional (RF), a riqueza de espécies (RE) e o índice de diversidade de Shannon (H’). O estudo foi realizado em rios da bacia hidrográfica do rio Itanhaém, litoral sul do Estado de São Paulo. A presença e a biomassa de macrófitas aquáticas foram obtidas por meio de quadrados coletados em bancos de macrófitas aquáticas com predominância de B. subquadripara, E. azurea ou ausência de predominância por essas espécies. Nossos resultados demonstram que áreas com predominância de B. subquadripara possuem número de espécies e grupos funcionais menores que os números encontrados nas áreas com predominância de E. azurea, ou sem predominância dessas espécies, e a predominância de E. azurea não interfere substancialmente na composição da comunidade de macrófitas aquáticas. O aumento de biomassa de B. subquadripara possui efeito negativo sobre a riqueza de espécies, riqueza funcional, índice de diversidade de Shannon e número de espécies emergentes, flutuantes livres, submersas enraizadas e epífitas, enquanto o aumento da biomassa E. azurea possui efeito positivo sobre o número de grupos funcionais na comunidade de macrófitas aquáticas e também sobre o número de espécies epífitas e submersas. Nossos resultados sugerem que o aumento da biomassa de B. subquadripara, espécie exótica invasora, assim como sua predominância, alteram a estrutura da comunidade de macrófitas aquáticas de forma mais drástica que o aumento da biomassa e predominância de E. azurea, espécie nativa, reduzindo / The establishment, naturalization and spread of exotic species have been responsible for major changes in the composition and structure of natural ecosystems. In this study, we tested the hypothesis that the prevalence and biomass of an invasive exotic species alter the structure of aquatic macrophyte communities in a more drastic than the dominance and biomass of native species, reducing the functional richness (FR), the wealth of species (RE) and Shannon diversity index (H '). The study was conducted in the river basin of the river Itanhaém, southern coast of São Paulo. The presence and biomass of aquatic macrophytes were obtained by means of squares collected in aquatic macrophytes with predominance of B. subquadripara, E. azurea or absence of both species. Our results show that areas with predominance of B. subquadripara number of species had a lower functional groups and than the numbers found in areas with a predominance of E. azurea, or without predominance of these species, and the prevalence of E. azurea does not interfere substantially in the community composition of aquatic macrophytes. The increase of biomass B. subquadripara had a negative effect on species richness, functional richness, Shannon diversity index and number of species emerging, free-floating, submerged rooted and epiphytes, while the increase in biomass E. azurea had positive effect on the number of functional groups in the community of aquatic macrophytes and also on the number of epiphytic species and submerged. Our results suggest that the increased biomass B. subquadripara, invasive alien species, as well as its predominance, alter the structure of aquatic macrophyte communities in a more drastic increase than the biomass and prevalence of E. azurea, native species, reducing the number of species and biological types of macrophytes in the littoral zones of rivers
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Caracterização dos padrões genéticos de populações invasoras e naturalizadas de schizolobium parahyba (Caesalpinioideae - Fabaceae) por restriction-site associated dna-sequencing /

Magalhães Filho, Gilberto, 1985. January 2013 (has links)
Orientador: Edson Seizo Mori / Coorientador: Danillo Pinhal / Banca: Guaracy Tadeu Rocha / Banca: Adriane Pinto Wasko / Resumo: Schizolobium parahyba é uma árvore nativa da Floresta Atlântica e é classificada como invasora da Floresta Estacional Semidecidual. A invasão biológica é considerada uma das maiores causas de perda de biodiversidade. As populações invasoras possuem diferentes padrões genéticos de estabelecimento, como as invasões repetitivas, crípticas, por introgressões e hibridizações. Neste contexto complexo, as misturas populacionais podem ser uma peça central no sucesso do estabelecimento de populações invasoras por favorecer a adaptabilidade local e diminuir a depressão endogâmica. Por meio do uso de uma nova técnica desenvolvida no presente trabalho de pesquisa baseada em Next-Generation Sequencing, a Restriction-Site Associated DNA-Sequencing com quatro restrições enzimáticas simultâneas, foram detectados parâmetros genéticos como relações de parentesco, subestrutura populacional e medidas variabilidade e diferenciação genética de populações invasoras e naturalizadas desta espécie. Com quase 5.000 locos polimórficos foi possível detectar processos de mistura populacional e das dinâmicas particulares de cada área estudada. Houveram casos de troca de material genético entre populações invasoras e naturalizadas e indícios de que a ação antrópica intensifica o processo de mistura populacional. As análises de subestrutura populacional sugeriram que a ação antrópica favoreceu a formação de subpopulações nas áreas estudadas. A utilização de marcadores moleculares com alta informatividade mostrou ser uma poderosa ferramenta para monitoramento de populações invasoras. / Abstract: Schizolobium parahyba is a native tree of Atlantic Rain Forest and is classified as Seasonally Semideciduous Forest invader. Biological invasion is considered major ones cause of biodiversity loss. Invasive populations have different genetic patterns of establishment, as repetitive invasions , cryptic invasoin, introgression and hybridization. In this complex context, population mixtures can be a centerpiece in the successful establishment of invasive populations by favoring local adaptability and reducing inbreeding depression. Through the use of a new technique developed in this research based on Next- Generation Sequencing, Restriction - site Associated DNA Sequencing with four simultaneous enzymatic restriction , genetic parameters were detected, as relatedness, population substructure and variability and genetic differentiation measures of invasive and naturalized populations of this species . With nearly 5,000 polymorphic loci was possible to detect processes of population mixture and the particular dynamics of each studied area. There have been cases of exchange of genetic material between invasive and naturalized populations and evidence that human action intensifies the process of population mixture. Analyses of population substructure suggested that human action favored the formation of subpopulations in the study areas. The use of molecular markers with high informativeness proved to be a powerful tool for monitoring of invasive populations / Mestre
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As interferências das pisciculturas em tanques-rede a assembléia de peixe em grandes reservatórios do rio paranapanema (Bacia doAlto Paraná) /

Zanatta, Augusto Seawright. January 2011 (has links)
Orientador: Edmir Daniel Carvalho / Banca: Mário Luis Orsi / Banca: Ângelo Antônio Agostino / Banca: José Eurico Possebon Cyrino / Banca: João Donato Scorvo Filho / Resumo: Atualmente, a filosofia da sustentabilidade ambiental que foca a preocupação com o uso racional dos recursos hídricos e pesqueiros, em particular a aqüicultura, está aumentando em nossa sociedade. Portanto, é preciso empregar esforços compatibilizando processos antagônicos da produção de alimento versus preservação ambiental. Neste contexto, o presente trabalho objetivou avaliar as possíveis interferências ambientais (limnológicas e ictiológicas) de um empreendimento de tilapicultura em tanques-rede no reservatório de Chavantes (Médio Rio Paranapanema, SP/PR). Para tanto, foram efetuadas 12 coletas mensais (fev/07-jan/08) de variáveis físico químicas da água e da assembléia de peixes em um trecho vicinal ao sistema de tilapicultura (TR) e outro trecho controle (CR). Em relação às variáveis físico químicas da água apenas a temperatura e o oxigênio dissolvido apresentaram diferenças significativas, sendo a primeira mais elevada no trecho TR e a segunda no trecho CR. Para a assembléia de peixes. Independente do trecho amostrado foram capturados 1274 indivíduos (19 espécies), sendo que cinco espécies foram exclusivas do trecho CR. Dentre os atributos ecológicos tanto a riqueza quanto a diversidade de espécies foram significativamente mais elevadas no trecho CR, assim como a dominância foi para o trecho TR. Os resultados diagnosticados para a dominância podem ser atribuídos devido à elevada representatividade de Pimelodus maculatus no trecho TR, espécie oportunista e onívora, o que favorece a sua adaptação à esse ambiente. Estes dados permitem inferir que o sistema de tilapicultura em tanques-rede está causando consecutivos distúrbios ambientais, os quais estão sendo responsáveis por interferir na integridade ambiental resultando em uma reestruturação significativa da assembléia de peixes na área sob influência da tilapicultura no reservatório de Chavantes / Abstract: Nowadays the environmental care is focusing on the sustainable use thru the rational occupation of the hydric and fishing sources, particularly aquaculture. For this to occur is necessary a deep correlation between the production system and preservation efforts. The present paper focus on the evaluation of the environmental interferences (limnologyc and ictiologyc) caused by Tilapia cage fish farm activities in the Chavantes reservoir (Middle Paranapanema River SP/PR). This work was based on 12 monthly samplings, occurred between February/2007 to January/2008 focusing on the water physicochemical variation and fish assemblage analysis in two areas: influenced (neighborhood) by cage fish farm (TR) and none influenced area (CR). The water physicochemical analyses shone significant alterations only in the temperature (higher in TR) and dissolved oxygen (higher in CR). A total of 1274 specimens were collected and grouped in 19 species with five species exclusive to stretch CR. The ecological analyses of richness and diversity were significantly higher in the CR zone as the dominance index was higher for TR. The dominance index was considered influenced by the Pimelodus maculatus high representativety in the TR area, this species is considered onivore and opportunist what explain its numerical abundance. These data concludes that the Tilapia cage fish farming is causing successive harm to the natural systems, provoking alterations in the fishing assemblages in the Chavantes reservoir / Doutor
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Efeito da biomassa de espécie exótica (Brachiaria subquadripara (Trin.) Hitchc.) e nativa (Eichhornia azurea (SW. Kunth) sobre a estrutura da comunidade de macrófitas aquáticas /

Amorim, Sara Regina de. January 2012 (has links)
Orientador: Antonio Fernando Monteiro Camargo / Banca: Sidnei Magela Thomaz / Banca: Marina Satika Suzuki / Resumo: O estabelecimento, naturalização e expansão de espécies exóticas têm sido responsáveis por grandes mudanças na composição e estrutura dos ecossistemas naturais. Neste trabalho, testamos a hipótese de que a predominância e a biomassa de uma espécie exótica invasora alteram a estrutura da comunidade de macrófitas aquáticas de forma mais drástica que a predominância e biomassa de uma espécie nativa, reduzindo a riqueza funcional (RF), a riqueza de espécies (RE) e o índice de diversidade de Shannon (H'). O estudo foi realizado em rios da bacia hidrográfica do rio Itanhaém, litoral sul do Estado de São Paulo. A presença e a biomassa de macrófitas aquáticas foram obtidas por meio de quadrados coletados em bancos de macrófitas aquáticas com predominância de B. subquadripara, E. azurea ou ausência de predominância por essas espécies. Nossos resultados demonstram que áreas com predominância de B. subquadripara possuem número de espécies e grupos funcionais menores que os números encontrados nas áreas com predominância de E. azurea, ou sem predominância dessas espécies, e a predominância de E. azurea não interfere substancialmente na composição da comunidade de macrófitas aquáticas. O aumento de biomassa de B. subquadripara possui efeito negativo sobre a riqueza de espécies, riqueza funcional, índice de diversidade de Shannon e número de espécies emergentes, flutuantes livres, submersas enraizadas e epífitas, enquanto o aumento da biomassa E. azurea possui efeito positivo sobre o número de grupos funcionais na comunidade de macrófitas aquáticas e também sobre o número de espécies epífitas e submersas. Nossos resultados sugerem que o aumento da biomassa de B. subquadripara, espécie exótica invasora, assim como sua predominância, alteram a estrutura da comunidade de macrófitas aquáticas de forma mais drástica que o aumento da biomassa e predominância de E. azurea, espécie nativa, reduzindo / Abstract: The establishment, naturalization and spread of exotic species have been responsible for major changes in the composition and structure of natural ecosystems. In this study, we tested the hypothesis that the prevalence and biomass of an invasive exotic species alter the structure of aquatic macrophyte communities in a more drastic than the dominance and biomass of native species, reducing the functional richness (FR), the wealth of species (RE) and Shannon diversity index (H '). The study was conducted in the river basin of the river Itanhaém, southern coast of São Paulo. The presence and biomass of aquatic macrophytes were obtained by means of squares collected in aquatic macrophytes with predominance of B. subquadripara, E. azurea or absence of both species. Our results show that areas with predominance of B. subquadripara number of species had a lower functional groups and than the numbers found in areas with a predominance of E. azurea, or without predominance of these species, and the prevalence of E. azurea does not interfere substantially in the community composition of aquatic macrophytes. The increase of biomass B. subquadripara had a negative effect on species richness, functional richness, Shannon diversity index and number of species emerging, free-floating, submerged rooted and epiphytes, while the increase in biomass E. azurea had positive effect on the number of functional groups in the community of aquatic macrophytes and also on the number of epiphytic species and submerged. Our results suggest that the increased biomass B. subquadripara, invasive alien species, as well as its predominance, alter the structure of aquatic macrophyte communities in a more drastic increase than the biomass and prevalence of E. azurea, native species, reducing the number of species and biological types of macrophytes in the littoral zones of rivers / Mestre
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Caracterização fenotípica, sequenciamento e anotação do genoma total de uma cepa de Escherichia coli isolada de uma paciente com Doença de Crohn

Santos, Ana Carolina da Silva. January 2015 (has links)
Orientador: Josias Rodrigues / Banca: Silvio Luís de Oliveira / Banca: Rogéria Keller / Resumo: A Doença de Crohn (DC) é uma variante das doenças inflamatórias intestinais que não tem uma causa definida, porém há o envolvimento de fatores ambientais e genéticos, entre eles a microbiota. Portadores da DC apresentam desequilíbrio na composição de espécies da microbiota intestinal, incluindo o aumento da Escherichia coli. A E. coli é uma bactéria versátil em sua relação com o hospedeiro, isto é, inclui cepas comensais e várias categorias patogênicas. Estas compreendem dois grupos: linhagens causadoras de infecções intestinais e linhagens causadoras de infecção extraintestinais. As E. coli isoladas de portadores da DC em geral pertencem ao segundo grupo, e uma das principais características apresentadas por estas bactérias é a interação com células epiteliais (aderência e invasão). Estudos feitos na década de 90 levaram a identificação de um novo patótipo de E. coli, capaz de aderir e invadir células epiteliais e ainda invadir e se replicar dentro de macrófagos, produzindo granulomas, característica histopatológica da DC. Este novo patótipo, chamado de Adherent and Invasive E. coli (AIEC), têm sido usada como referência na caracterização de E. coli isoladas a partir de portadores da DC. Neste trabalho, foi feito o estudo de caracterização fenotípica e genética de E. coli isoladas a partir de 9 portadores da DC e 5 pacientes controles, as quais foram submetidas a testes de adesão e invasão celular em células epiteliais, teste de formação de biofilme e identificação de filogrupos da coleção de referência de E. coli (EcoR). Dentre o conjunto de amostras bacterianas estudado, foi encontrada uma amostra isolada de uma paciente com DC que apresentou invasibilidade superior às demais, e foi intensivamente estudada, tendo-se verificado que ela apresenta um perfil de virulência distinto de AIEC. O genoma da amostra em questão foi sequenciado e anotado. Os resultados da caracterização... / Abstract: Not available / Mestre
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Caracterização dos padrões genéticos de populações invasoras e naturalizadas de schizolobium parahyba (Caesalpinioideae – Fabaceae) por restriction-site associated dna-sequencing

Magalhães Filho, Gilberto [UNESP] 02 December 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:21Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-12-02Bitstream added on 2014-06-13T18:40:23Z : No. of bitstreams: 1 000758823.pdf: 1966579 bytes, checksum: ad584d90fa1ba8a15edf2765b91f1744 (MD5) / Schizolobium parahyba é uma árvore nativa da Floresta Atlântica e é classificada como invasora da Floresta Estacional Semidecidual. A invasão biológica é considerada uma das maiores causas de perda de biodiversidade. As populações invasoras possuem diferentes padrões genéticos de estabelecimento, como as invasões repetitivas, crípticas, por introgressões e hibridizações. Neste contexto complexo, as misturas populacionais podem ser uma peça central no sucesso do estabelecimento de populações invasoras por favorecer a adaptabilidade local e diminuir a depressão endogâmica. Por meio do uso de uma nova técnica desenvolvida no presente trabalho de pesquisa baseada em Next-Generation Sequencing, a Restriction-Site Associated DNA-Sequencing com quatro restrições enzimáticas simultâneas, foram detectados parâmetros genéticos como relações de parentesco, subestrutura populacional e medidas variabilidade e diferenciação genética de populações invasoras e naturalizadas desta espécie. Com quase 5.000 locos polimórficos foi possível detectar processos de mistura populacional e das dinâmicas particulares de cada área estudada. Houveram casos de troca de material genético entre populações invasoras e naturalizadas e indícios de que a ação antrópica intensifica o processo de mistura populacional. As análises de subestrutura populacional sugeriram que a ação antrópica favoreceu a formação de subpopulações nas áreas estudadas. A utilização de marcadores moleculares com alta informatividade mostrou ser uma poderosa ferramenta para monitoramento de populações invasoras. / Schizolobium parahyba is a native tree of Atlantic Rain Forest and is classified as Seasonally Semideciduous Forest invader. Biological invasion is considered major ones cause of biodiversity loss. Invasive populations have different genetic patterns of establishment, as repetitive invasions , cryptic invasoin, introgression and hybridization. In this complex context, population mixtures can be a centerpiece in the successful establishment of invasive populations by favoring local adaptability and reducing inbreeding depression. Through the use of a new technique developed in this research based on Next- Generation Sequencing, Restriction - site Associated DNA Sequencing with four simultaneous enzymatic restriction , genetic parameters were detected, as relatedness, population substructure and variability and genetic differentiation measures of invasive and naturalized populations of this species . With nearly 5,000 polymorphic loci was possible to detect processes of population mixture and the particular dynamics of each studied area. There have been cases of exchange of genetic material between invasive and naturalized populations and evidence that human action intensifies the process of population mixture. Analyses of population substructure suggested that human action favored the formation of subpopulations in the study areas. The use of molecular markers with high informativeness proved to be a powerful tool for monitoring of invasive populations

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