Dentre os répteis que ocorrem na Amazônia, os quelônios se destacam pela sua diversidade e importância econômica. Podocnemis expansa, conhecida popularmente como tartaruga-da-amazônia, é considerada o maior quelônio de água doce da América do Sul e tem sido explorada intensamente, por séculos, por inúmeras comunidades indígenas e ribeirinhas. O presente estudo teve como objetivo ampliar os conhecimentos acerca da ecologia populacional e da biologia reprodutiva de P. expansa no rio Javaés, Estado do Tocantins, no entorno do Parque Nacional do Araguaia (Ilha do Bananal). No primeiro capítulo desta dissertação foram investigados alguns aspectos da ecologia populacional. Os trabalhos em campo foram realizados entre os anos de 2004 e 2009 e os animais foram capturados pelos métodos de mergulho e arrasto de rede. Com os resultados obtidos, foi observado que a estrutura etária (baseada no comprimento da carapaça) dos indivíduos apresentou um padrão unimodal para os machos e um padrão não definido para as fêmeas. A população estudada era constituída basicamente por fêmeas jovens e machos adultos, apresentando uma razão sexual desviada para as fêmeas de 1:1,4 (:). A abundância relativa variou entre 0,4 e 8,6 animais/hora, dependendo do método de captura empregado, e a maioria dos animais (73,7%) encontrava-se concentrada em apenas um ponto específico do rio. No segundo capítulo, foram estudadas as relações alométricas entre o tamanho corpóreo da fêmea, seus rastros, as variáveis da ninhada e a forma dos ninhos em ambiente natural. O trabalho de campo foi realizado em uma praia de desova da área estudada, entre os meses de setembro e dezembro de 2008. Os resultados mostraram que o tamanho corpóreo da fêmea de P. expansa pode ser estimado em função do seu rastro, que fêmeas maiores deixam rastros maiores na areia, além de produzirem mais ovos (tamanho da ninhada) e com maior massa (massa da ninhada) do que fêmeas menores e que as variáveis largura da carapaça e massa da fêmea podem ser consideradas como confiáveis para estabelecer relações nos estudos de alometria com P. expansa. / Among the reptiles found in the Amazon, the turtles stand out because of its diversity and economic importance. Podocnemis expansa, popularly known as Amazon river turtle, is considered the largest freshwater turtle in South America and has been heavily exploited for centuries by many indigenous and riverine communities. This study aimed to expand the knowledge about the population ecology and the reproductive biology of P. expansa in the Javaés River, Tocantins State, around the Parque Nacional do Araguaia (Iha do Bananal). In the first chapter of this dissertation some aspects of population ecology were investigated. Fieldwork was carried out between 2004 and 2009, and the animals were captured by diving and trawling net. The age structure (based on carapace length) of the animals showed a unimodal pattern for males and not a standard defined for females. The population consisted mainly of young females and adult males, with a sex ratio of 1:1.4 (:), biased to females. The relative abundance varied between 0.4 and 8.6 animals per hour depending on the method of capture employed, and most animals (73.7%) was concentrated in a single specific point of the river. In the second chapter, the allometric relationships between female body size, their tracks, the clutch variables and nest form in natural environment were investigated. Fieldwork was carried out on a nest beach of the study area, between September and December 2008. Results indicated that P. expansa female body size can be estimated based on her track. Larger females leave larger foot tracks in the sand and produce more eggs (clutch size) with greater mass (clutch mass) than smaller females. Female carapace width and female body mass can be regarded as reliable to establish relationships in studies of allometry with P. expansa.

Orientador: Rozely Ferreira dos Santos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Civil, Arquitetura e Urbanismo / Made available in DSpace on 2018-08-16T10:34:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vieira_ElisaHardtAlves_D.pdf: 8333224 bytes, checksum: b6d47d6eee01814ae49bfd51c1fedb06 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: A proposição de estratégias e critérios de valoração da conservação biológica a partir de elementos estruturais da paisagem pode auxiliar no planejamento ambiental e subsidiar a tomada de decisão. Nessa direção, esse estudo teve como objetivo qualificar o estado de conservação de paisagens passadas e presente e cenários de expectativa dos grupos sociais por meio da interpretação da heterogeneidade estrutural e da valoração da paisagem. Essa proposta foi aplicada na Serra do Japi, uma área de florestas conservadas e legalmente protegidas do Estado de São Paulo, tendo como estudo de caso o loteamento Ermida, um empreendimento regularmente aprovado antes das medidas de proteção dessa área e que hoje enfrenta restrições para sua implantação. Foram utilizados Sistemas de Informação Geográfica e programas estatísticos para mapear o uso da terra, construir cenários, identificar fronteiras, criar mosaicos e valorar a paisagem por métricas de disponibilidade de recursos, permeabilidade e fragmentação. Os resultados mostraram que medidas de quantidade de floresta podem trazer decisões distintas daquelas que consideram a avaliação da heterogeneidade estrutural da paisagem por mosaicos, que se revelou mais eficaz na evidência de mudanças históricas e de interações e domínios de fronteiras. As métricas de valoração indicaram que o aumento da quantidade de habitat nem sempre representou um acréscimo na qualidade da paisagem. A via de acesso foi a ação antrópica de maior influência sobre as florestas. Seu efeito de borda foi de extensão variável de acordo com a vizinhança e com o indicador desse efeito na estrutura ou na composição da floresta. Esse estudo mostrou que as mudanças dos últimos 40 anos da Serra do Japi evoluíram em direção às expectativas de conservação em termos de quantidade, disponibilidade de recursos e permeabilidade da paisagem. Diferentemente do esperado, o cenário legal apresentou uma tendência de fragmentação da paisagem maior do que a situação atual. No caso do loteamento Ermida, os critérios adotados não mostraram uma perda substancial de florestas em área e a sua existência não impediu a continuidade do processo sucessional, bem como a conectividade da paisagem. Por outro lado, houve grande diminuição da disponibilidade de recurso ótimo, causada pela disposição das vias de acesso e pelo efeito de borda resultante. Por essa razão, entre as expectativas dos grupos sociais, a melhor alternativa para a conservação foi aquela que previu a otimização dos acessos. / Abstract: The proposal of strategies and valuation criteria for biological conservation based on structural elements of the landscape may help the process of environmental planning and decisionmaking. This study was aimed at assessing the quality of the conservation status of past and present landscapes and expectations of social groups scenarios based on the interpretation of the structural heterogeneity and the valuation of the landscape. This study was conducted in Serra do Japi, a preserved and legally protected area in São Paulo State. The case study was the Ermida residence property development, which was legally approved before the protective measures for the preservation of Serra do Japi, and that currently faces restrictions for its implementation. Geographic Information Systems and statistic software were used to: map land use, construct scenarios, identify borders, create mosaics and appraise the landscape based on resource availability, permeability, and fragmentation. The results revealed that measurements of the amount of forest may lead to decisions different from those based on the evaluation of the heterogeneity of landscape mosaics, which was more effective to show evidences of historical changes and interactions, and establishment of limits. The metrics of valuation indicated that the increase in the amount of habitat not always represented an increase in landscape quality. An access road was the anthropogenic component with the highest impact on forests. The extent of the edge effect varied depending on the neighborhood and on the indicator of this effect in the structure or composition of the forest. This study revealed that the changes in the last 40 years in Serra do Japi evolved toward conservation, regarding quantity, availability of resources and permeability of the landscape. Unlike the expected, the legal scenario presented a stronger tendency of fragmentation of the landscape than the current situation. In the case of the Ermida development area, the criteria used did not indicate a substantial loss of forests in the area and its existence did not prevent the continuity of the successional process, as well as the connectivity of the landscape. On the other hand, the availability of optimum resources greatly decreased, caused by the availability of access roads and by the resulting edge effect. Because of that, among the expectations of social groups, the best alternative for conservation was the one that predicted the optimization of road access. / Doutorado / Recursos Hidricos, Energeticos e Ambientais / Doutor em Engenharia Civil

A alteração dos ecossistemas naturais e a criação de novos ambientes podem alterar significativamente o padrão de distribuição das espécies silvestres e a disponibilidade dos recursos naturais. A expansão agrícola pode ser considerada como uma das principais perturbações antrópicas responsáveis pela conversão das florestas nativas. Mamíferos de médio e grande porte são responsáveis por processos ecológicos determinantes na estrutura das comunidades. Estes possuem importantes funções na manutenção e regeneração das florestas e sua contínua provisão de bens e serviços ecossistêmicos. Dieta e uso do espaço estão intimamente relacionados ao potencial adaptativo das espécies. Seu estudo é útil na tentativa de avaliar a conservação das mesmas nos ambientes alterados. Neste contexto dois estudos envolvendo mamíferos de médio e grande porte foram conduzidos em paisagens agrícolas da Região do Alto Paranapanema, Estado de São Paulo. No primeiro estudo, entre setembro de 2008 e setembro de 2010, foi avaliada a freqüência de ocorrência das espécies deste grupo, em corpos dágua naturais e artificiais da Fazenda Três Lagoas, no município de Angatuba. Ambos os ambientes (açudes e riachos) estavam associados à plantação recente de Eucalipto. Foram detectadas 20 espécies no total (18 em açudes e 17 em riachos), sugerindo razoável riqueza de espécies para o ambiente em questão, no entanto os ambientes ripários (i.e., que abrigam os corpos dágua naturais) apontaram maior riqueza e abundância. Tais resultados reforçam a importância da presença de remanescentes florestais sob proteção legal na paisagem agrícola, para a conservação dos mamíferos de médio e grande porte. Além disto, os resultados sugerem aumento da capacidade de suporte do ambiente em função da manutenção dos açudes. O segundo estudo trata do uso de abrigos e dieta de Lontra longicaudis (Mammalia, Carnivora), mamífero carnívoro semi-aquático já considerado como espécie vulnerável. Entre agosto de 2008 e julho 2009, foi realizada a coleta mensal das fezes de lontra encontradas em trecho sob influência antrópica do rio Paranapanema. Os abrigos foram descritos e representados graficamente e a dieta foi quantificada por meio da análise de 60 amostras de fezes. Foram identificados 15 itens alimentares, sendo peixes das famílias Cichlidae e Loricariidae os itens mais comuns. A amplitude de nicho apontou a espécie como especialista (utilizando o índice padronizado de Levins), reforçando a importância do ambiente e fauna aquáticos para sua conservação. No entanto, os resultados sugerem, de forma geral, certa plasticidade de L. longicaudis em relação aos ambientes alterados. Ambos os estudos, sugerem a relevância de paisagens alteradas na conservação da biodiversidade, e a necessidade de inserção de tais áreas em planos de manejo e conservação. / The expansion of agricultural land is recognized as one of the most significant anthropic alterations within the natural ecosystems. The conversion of forest into agricultural landscapes can change biotic interactions and natural resources availability. Alterations as such can have consequences in respect to the ecosystems services which are provided by natural forested areas. Mammals are responsible for ecological processes which are determinant for the forest maintenance and regeneration. Diet and habitat use are essential tools to determine species conservation status and how it deals with human-driven ecological changes. Hence within this context, two studies took place in disturbed areas in Southern São Paulo State, Brazil. Both studies involve middle-to large sized mammals in agricultural landscapes at the Alto Paranapanema watershed. In the first study, during the period of August 2008 to July 2010, every two months, the frequency of occurrence of middle-to large sized mammals was surveyed and recorded around streams of remaining gallery forests and artificial reservoirs originally built for cattle water supply. Both habitats are associated with new Eucalyptus plantations. As a result a total of 20 species were detected, 18 around artificial reservoirs and 17 in streams of gallery forests. However streams of gallery forests showed significantly higher species richness and abundance than artificial reservoirs. These results outline the importance of maintaining protected native vegetation areas by law in such landscapes. Results also suggest that the artificial reservoirs may increase habitat carrying capacity for middle- to large-sized mammals in such circumstances. The second study reports the diet and use of shelters by the neotropical otter (Lontra longicaudis) in a disturbed area. Otters are semi-aquatic carnivores with a potentially functional role in freshwater ecosystems. During the period from August 2008 to July 2009, otter scats were collected monthly at Paranapanema River. The shelters were described and graphically represented and the diet was quantified by analyzing 60 scats. The niche breadth analysis classifies L. longicaudis as a specialist species according to the trophic niche amplitude index (Levins index). The most common items identified were fishes from the Cichlidae and Loricariidae families, probably because of the habits of such species which makes them an easier prey. Such results stress the importance of freshwater ecosystems for the neotropical otter conservation. Results also suggest the adaptative potential of L. longicaudis and that some disturbed areas may be significant for this species conservation. Both studies emphasize the relevance of such altered ecosystems and it insertion requirement on protection and conservation initiatives towards biodiversity conservation.

Visando contribuir para estratégias efetivas de conservação e manejo de espécies arbóreas do cerrado, cuja paisagem encontra-se altamente fragmentada, este trabalho objetivou estudar, por meio de oito locos microssatélites nucleares, a diversidade genética, a estrutura genética espacial intrapopulacional, o sistema de reprodução e o fluxo gênico em uma população de Copaifera langsdorffii Desf localizada na Estação Ecológica de Assis (EEA), oeste do Estado São Paulo. Copaifera langsdorffii é hermafrodita, polinizada por insetos e dispersa por barocoria e ornitocoria, com potencial econômico e de utilização na restauração florestal, além de apresentar ampla distribuição no cerrado. Neste estudo, o seguinte desenho amostral foi adotado: em uma parcela de 10,24 ha, estabelecida no interior da EEA foram mapeadas, amostradas e genotipadas todas as 57 árvores adultas. Para estudar a dispersão realizada de sementes, no centro da parcela foi estabelecida uma subparcela de 1,44 ha, onde todos os 147 jovens existentes também foram mapeados, amostrados e genotipados. Para comparar a diversidade genética, a endogamia e o sistema de reprodução entre árvores da parcela com árvores da borda do fragmento foram coletadas sementes de polinização aberta de 17 matrizes na parcela (340 sementes) e de 11 matrizes na borda (220 sementes). Os resultados mostraram que os adultos da parcela tinham maior heterozigosidade e menor endogamia do que a observada nos jovens e nas sementes, sugerindo mecanismos seletivos que favorecem indivíduos heterozigóticos. A população de jovens apresentou fraca estrutura genética espacial, porém significativa até 102 m de distância, indicando uma dispersão moderada de sementes, gerada provavelmente por ornitocoria. Em concordância, a análise de maternidade nos jovens mostrou alta freqüência de dispersão acima de 100 m e um padrão tendendo à normalidade, sugerindo o fenômeno de escape previsto na hipótese Janzen-Connell. Também foi detectada uma alta taxa de imigração de sementes (15%) e pólen (64%) na parcela, sugerindo intenso movimento de genes na população. Por outro lado, o pólen foi disperso em alta freqüência em distâncias relativamente curtas (65% até 150 m), embora tenha também atingido longas distâncias dentro da parcela (300 m). De acordo com a estimativa da taxa de cruzamento, a população apresentou um sistema misto de reprodução, com predominância de cruzamentos. Comparando-se matrizes da parcela com as da borda foi observada maior taxa de autofecundação e heterogeneidade no conjunto de pólen naquelas localizadas na borda, evidenciando um nítido efeito de borda no cerradão. A estimativa do tamanho efetivo dos adultos na parcela sugere que EEA tem área mínima viável para a conservação in situ da respectiva população. Contudo, é fundamental que a conectividade genética (fluxo gênico) entre esse fragmento e outros no entorno, seja mantida para a manutenção do potencial evolutivo da espécie no longo prazo. Visando a coleta de sementes na EEA para estratégias de conservação ex situ e restauração florestal, os resultados indicam que a coleta deve ser realizada preferencialmente no interior do fragmento, em matrizes distantes pelo menos 300 m entre si e em, no mínimo, 19 matrizes para reter um tamanho efetivo de aproximadamente 50. / Aiming to contribute to effective strategies for conservation and management of Savanna cerrado tree species, whose landscape is highly fragmented, this study investigated, through eight microsatellite nuclear loci, the genetic diversity, the intrapopulation spatial genetic structure, the mating system and gene flow in a population of Copaifera langsdorffii Desf located in the Ecological Station of Assis (ESA), west of São Paulo State. Copaifera langsdorffii is hermaphroditic, pollinated by insects and its seed dispersal is carried out by gravity and birds; it has economic potential and forest restoration use, while it has a wide distribution in the cerrado. In this study, the following sampling design was adopted: in a plot of 10.24 ha, established within the ESA all 57 adult trees were mapped, sampled and genotyped. To study seed dispersal in the center of the plot a subplot of 1.44 ha was established, where all 147 young trees also were mapped, sampled and genotyped. To compare the genetic diversity, inbreeding and the mating system of trees from the plot and the edge of the remnant, open-pollinated seed arrays were collected from 17 seed-trees in the plot (340 seeds) and 11 seed-trees at the edge (220 seeds). The results showed that adults had a higher proportion of heterozygosity and lower inbreeding levels than that observed in young trees and seeds, suggesting that selective mechanisms are favoring heterozygous individuals. The population of young trees reveled a weak, but significant spatial genetic structure up to 102 m of distance, indicating a moderate seed dispersal, probably due to bird dispersal. In agreement, the analysis of maternity in the young trees showed a high frequency dispersion over 100 m with a pattern tending to normality, suggesting the escape phenomenon according to Janzen-Connell hypothesis. A high rate of immigration of seeds (15%) and pollen (64%) in the plot was also detected, suggesting intense movement of genes in the population. Furthermore, the pollen was dispersed with high frequency at relatively short distances ( 65% up to 150 m), but it also achieved long distances within the plot (300 m). According to the estimate of the outcrossing rate, the population had a mixed mating system, with predominance of outcrosses. In the comparison of seed-trees from the plot with the ones on the edge, higher rate of selfing and pollen heterogeneity were detected on the edge, showing a clear edge effect on the dry forest cerradão. Estimates of the effective size of adults in the plot suggests that ESA has a minimum viable area for in situ conservation. However, the maintenance of genetic connectivity (gene flow) between this fragment and others in the neighborhood, is essential to assure the evolutionary potential of this species in the long-term. Aiming seed collection in the EEA for ex situ conservation and forest restoration strategies, the results indicate that the collection should be done preferably within the fragment, in seed-trees at least 300 m distant from each other and from at least 19 seed-trees to retain an effective size of about 50.

Utilizaram-se duas onças-pintadas (Panthera onca) e um puma (Puma concolor) provenientes de natureza e 44 sincrânios das mesmas espécies. Estes animais de vida livre foram capturados respectivamente na Amazônia (Sul do Pará), na Mata Atlântica (Zona da Mata de Minas Gerais) e no Pantanal sul mato-grossense (Mato Grosso do Sul). Os animais foram avaliados mediante anestesia geral injetável, exame físico geral, exame físico da cavidade oral, documentação dos achados clínicos em fichas-odontogramas e fotografia. As duas onças-pintadas apresentaram algum tipo de enfermidade na cavidade oral variando de graus de pouco grave quanto à função do sistema estomatognático a grau severo (desgaste dental, traumatismo dental e doença periodontal), que podem levar o indivíduo a sofrer distúrbios da homeostase e possível alteração de comportamento predatório. O puma capturado no Pantanal não apresentou lesões macroscópicas que pudessem comprometer a função e higidez do sistema estomatognático. Após as observações serem feitas, todos os animais foram soltos no mesmo local da captura. Foram avaliados ainda 17 sincrânios (crânio + mandíbula) de Panthera onca e 27 de Puma concolor, todos de animais coletados na natureza ao longo de décadas, em diferentes biomas brasileiros e depositados na coleção de Mastozoologia do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo (MZUSP). Verificaram-se algumas evidências de lesões no sistema estomatognático envolvendo dentes, ossos alveolares, arco zigomático, ossos nasais, ossos frontais e palatinos, todas acontecidas em vida, fazendo com que os indivíduos tivessem que se adaptar a esta condição até a formação de processos reparativos. / Two jaguars (Panthera onca) and one puma (Puma concolor) proceeding from nature and 44 sincraniuns of the same species. These animals of free wildlife had been captured respectively in the Amazonia (South of Pará), in Atlantic Forest (Zona da Mata de Minas Gerais) and in the south Pantanal (Mato Grosso do Sul). The animals had been evaluated after injectable general anesthesia, general physical examination, physical examination of the oral cavity, documentation of the clinical findings in dental-charts and photograph. The two jaguars presented some type of disease in the oral cavity varying from mild degree according to the function of the stomatognathic system severe degree (dental wearing, dental trauma and periodontal disease), which can lead the individual to have its homeostasis and possibly the of predatory behavior altered. The puma captured in the Pantanal did not present macrocospic injuries that could compromise the function and healthiness of the stomatognathic system. After the examinatis, all the animals were released in the same local of the capture. 17 sincraniuns (skull + jaw) of Panthera onca had were evaluated and 27 of Puma concolor, all animals were collected in the nature through decades, from different Brazilian biomas and kept in the collection of Mastozoology of the Museum of Zoology of the University of São Paulo (MZUSP). Some evidences of injuries in the stomatognathic system were verified involving alveolar teeth, bones, zigomatic arch, nasal bones, frontals and palatine bones. All these variables occurred while the animal, forcing the individuals to adapt themselves to these conditions until the formation of reparative processes. Such findings possible were not the cause of death of the animals.

Apesar de ocupar cerca de 25% do território nacional e abrigar, potencialmente, um terço da fauna e flora brasileira, o bioma cerrado é classificado como um “hotspot" por apresentar expressiva redução de biodiversidade. Perante este quadro, este trabalho teve por objetivo comparar os métodos de amostragem de parcelas de área fixa e de ponto quadrante em uma área com predominância da fisionomia cerradão (savana florestada) na Estação Ecológica de Assis (SP), estando inserido no projeto temático “Métodos de Inventário da Biodiversidade de Espécies Arbóreas\", do Programa BIOTA/FAPESP. A área estudada é representada por uma grade amostral sistemática que contém 64 parcelas de 90 x 10 m (900 m2), inseridas em 8 linhas distantes 100 m entre si, com 8 parcelas em cada linha. Estas foram subdivididas em 9 subparcelas de 10 x 10 m, com um intervalo de 10 m não amostrado entre as parcelas nas linhas. Os pontos quadrantes foram instalados em cada limite entre as subparcelas. Os indivíduos arbóreos com DAP maior ou igual a 4,77 cm foram inseridos nesta amostragem, sendo posteriormente identificados. Partindo-se deste delineamento amostral e, diante da ocorrência de fragmentos de cerrado strictu sensu juntamente com áreas de cerradão, simulou-se a existência de nove tamanhos de parcela, variando de 100 a 900 m2, a fim de avaliar como esses diferentes tamanhos, bem como o método do ponto quadrante, interferem no esforço amostral, na estimativa da densidade e nos índices fitossociológicos e de diversidade. Ao final do levantamento, o método de parcelas de 900 m2 incluiu 102 espécies, distribuídas em 45 famílias, enquanto que o método do ponto quadrante amostrou 71 espécies, distribuídas em 37 famílias. Os resultados encontrados em ambos os métodos quanto ao Índice de Valor de Importância apontaram as espécies Copaifera langsdorffii, Vochysia tucanorum e Ocotea corymbosa como as mais importantes; já a família Myrtaceae se destacou nestes dois métodos quanto à riqueza de espécies. A curva de esforço amostral do método do ponto quadrante incluiu um número de espécies semelhante à curva das parcelas de 200 m2, com a vantagem de apresentar maior praticidade de instalação no campo. Os valores do Índice de Diversidade de Shannon foram inferiores a outros biomas, enquanto que o Índice de Diversidade de Simpson não pôde ser o mais indicado para o cerradão estudado, por não ser sensível à ocorrência de espécies com apenas um indivíduo na parcela. Para a determinação da diversidade arbórea do cerradão da E. E. Assis, recomendou-se o uso da parcela de 400 m2. Já na estimativa da densidade, as parcelas de 700 m2 foram as mais adequadas; entretanto, devido à grande variabilidade deste parâmetro na área, sugeriu-se uma estratificação da área de amostragem. / Cerrado biome is classified as a hotspot, because it presents an expressive reduction on the biodiversity, despite of occupying around 25% of the national territory and potentially sheltering one third of the Brazilian fauna and flora. In this scenario, this work had as objective to compare the fixed area plots and the point-centered quarter sampling methods in an area with a cerradão (savanna woodland) physiognomy at the Ecological Study Station in the city of Assis (SP), which is part of the “Tree Species Biodiversity Inventory Methods", a thematic project of BIOTA/FAPESP Program. The studied area is represented by a systematic sampling frame containing 64 plots, measuring 90 x 10 m (900 m2), inserted in 8 lines, which is 100 m away from each other, with 8 plots in each line. They were divided into 9 sub-plots measuring 10 x 10 m, with a 10-m non-sampled gap between the plots in the lines. The point-centered points were installed in each limit between the sub-plots. The arboreal individuals with DBH equal or larger than 4.77 cm were set in this sampling and identified later. From this sampling design and due to the presence of fragments of cerrado strictu sensu together with areas of cerradão, it was simulated the existence of nine size samples varying from 100 to 900 m2 aiming evaluating how these different sizes and the point-centered quarter method interfere in the sampling effort, in the density estimates, and in the phytossociological and diversity indexes. At the end of the surveying, the 900-m2-plot method included 102 species, distributed in 45 families, whereas in the center-pointed quarter method 71 species were sampled, distributed in 37 families. The results found in both methods in relation to the Importance Value Index showed Copaifera langsdorffii, Vochysia tucanorum, and Ocotea corymbosa as the most important ones; Myrtaceae family stood out on both methods in relation to species richness. The sampling effort curve of the point-center quarter method included a number of species similar to the 200-m2 plots’ curve, with an advantage of being easier to be installed in the field. The Shannon Index values were lower than in the other biomes, whereas the Simpson Index could not be the best indicated for the cerradão under study, because it was not sensitive to the presence of species with only one individual in the plot. It was recommended the use of 400-m2 plots in order to determine the tree diversity in the cerradão at the Ecological Study Station in the city of Assis. The most adequate plots to estimate the density were the 700-m2 ones. However, stratification on the sampling area was suggested due to the great variability of this parameter in the area.

O avanço agrícola é uma das maiores causas da fragmentação de habitats, levando à diminuição e ao isolamento de áreas naturais. Assim, torna-se importante compreender qual papel da estrutura e dinâmica da paisagem na manutenção da biodiversidade local. Este estudo teve como objetivo descrever a estrutura de uma comunidade de mamíferos de médio e grande porte em paisagem fragmentada agrícola, considerando a estrutura e dinâmica da paisagem. O estudo foi realizado em unidades de paisagem (16 Km2) com matriz predominante de pasto (n = 2) e cana-de-açúcar (n = 3) (bacia do rio Corumbataí, São Paulo) de maio a outubro de 2010. O levantamento da comunidade de mamíferos foi realizado através de busca ativa por pegadas, em 15 transectos alocados nas margens de riachos, com distância percorrida padronizada em 200 m. No entorno de cada transecto foram gerados buffers (250, 500, 1000 e 2000 m de raio), para o cálculo de índices de estrutura (porcentagens dos usos do solo, densidade de drenagem, densidade de estradas e proximidade entre fragmentos) e de dinâmica (taxa anual de mudança e perfil da curva de mudança florestal) para cinco anos (1962, 1978, 1995, 2000 e 2008). A relação entre os índices de paisagem e a riqueza de espécies foi analisada através de um teste PCA (Análise de Componentes Principais), gerando um gráfico Biplot. Posteriormente, foi realizada regressão linear múltipla, para análise da influência da estrutura e dinâmica da paisagem sobre a riqueza de espécies e frequência de registros. Foram registradas 19 espécies, sendo 17 em unidades de cana-de-açúcar e 13 em unidades de pasto. A comunidade de mamíferos de médio e grande porte, presente nestas matrizes da bacia do rio Corumbataí, é representada, em grande parte, por espécies tolerantes a alterações ambientais da região. A espécie com maior frequência de registros foi Procyon cancrivorus, de hábito generalista, como a maior parte dos animais registrados. Pelo gráfico Biplot, o buffer de 1000 m foi o que melhor distinguiu os sítios amostrais em relação às matrizes de cana-de-açúcar e pasto. A riqueza apresentou relação positiva com a porcentagem de áreas florestais e densidade de drenagem. Em contrapartida, a riqueza mostrou relação negativa com a porcentagem de pasto. A riqueza e a frequência de registros não apresentaram diferença estatística significativa entre as matrizes e também não houve relação significativa entre os índices de paisagem e as variáveis dependentes. A similaridade entre a composição de espécies das comunidades amostradas nas matrizes foi de 57%. As relações entre a estrutura desta comunidade e a paisagem necessitam de mais esforços para serem melhor compreendidas, já que o método de levantamento utilizado neste estudo, assim como a escala espaço-temporal, não permitiram descrever tais relações. / Agricultural expansion is a major cause of habitat fragmentation, leading to a reduction and isolation of natural areas. It is therefore important to understand the role of agricultural landscape structure and dynamics in maintaining local biodiversity. We aimed to describe how the structure and dynamics of an agricultural landscape influenced the community of mid and large bodied mammals in the south of Brazil. From May to October 2010 we studied the mammal community in five 16 km2 landscape units located within the Corumbatai river basin, São Paulo. Landscape units contained a matrix of predominantly pasture (n = 2) and cane sugar (n = 3). We used track surveys along 15 transects (200m each) to sample the mammal community along river banks. To calculate indices of habitat structure and dynamics we generated buffers (250, 500, 1000 and 2000 m radius) around each of the transects. Within each of these distance buffers we calculated habitat structure indices (percentage of land use, drainage density, road density and proximity of fragments) and indices of habitat dynamics (annual rate of change and profile of the forest change curve) for five years (1962, 1978, 1995, 2000 and 2008). The relationship between landscape indices and species richness was analyzed through a PCA (Principal Component Analysis) and associated Biplot. Subsequently, multiple linear regression was performed to analyze the influence of landscape structure and dynamics on species richness and frequency of records. We recorded 19 species, 17 in cane sugar units and 13 in pasture units. The community of mid and large bodied mammals present in the habitat matrices of the Corumbataí river basin was represented mostly by generalist species tolerant of environmental changes. The most frequently recorded species was Procyon cancrivorus, a habit generalist. The PCA Biplot showed that the 1000m buffer was the one that best distinguished the sampling sites in relation to the sugar cane and pasture matrices. Species richness was positively related with the percentage of forested areas and drainage density. In contrast, richness was negatively related with the percentage of pasture. The richness and frequency of records showed no statistically significant difference between the two matrix types and there was no significant relationship between landscape indices and the dependent variables. The similarity between the species composition of the sampled communities in the matrices was 57%. Understanding the relationships between the composition of this community and the landscape structure and dynamics requires more efforts, as the survey method used in this study, and the spatiotemporal scale, do not permit the description of these relationships.

Apesar do estado de São Paulo ter uma área de vegetação nativa pequena e, em sua maioria, altamente fragmentada, isolada e imersa em matrizes agrícolas em propriedades privadas, seu território ainda alberga um número considerável de espécies silvestres, inclusive nessas áreas comerciais. Para a elaboração de planos de manejo ecologicamente corretos, é necessário selecionar (1) espécies-chave, como os mamíferos carnívoros; (2) fatores ecológicos primários das espécies, como a dieta e o uso do espaço; e (3) locais com histórico de uso do solo representativos da exploração espaço-temporal, como, por exemplo, Angatuba (SP) em São Paulo. Essa dissertação foi desenvolvida na Fazenda Três Lagoas e seus arredores, entre maio de 2008 e junho de 2010 e abrange três temas distintos, mas interligados. No primeiro capítulo fez-se uma introdução geral sobre os temas. No segundo avaliou-se, em quatro fazendas adjacentes, a exposição de carnívoros domésticos aos agentes infecciosos da parvovirose, raiva, cinomose e leptospirose através de exames sorológicos. Verificou-se que as prevalências de contato dos 13 cães amostrados com esses agentes patológicos, foram, respectivamente, 100%, 80%, 23% e 15,4%. As reações positivas a alguns desses agentes e sorovares, mostram que os cães domésticos tiveram contato com os agentes através de outros hospedeiros, pois esses agentes não estão presentes em vacinas. Isso demostra a importância de sua detecção na vida silvestre e no ambiente visando elaborar um manejo sanitário efetivo para a economia e saúde humana e para a vida silvestre. No terceiro capítulo estudou-se a dieta de 12 espécies de mamíferos carnívoros através da análise de 524 amostras de fezes coletadas nas Fazendas Três Lagoas e Arca. Pode-se verificar que os carnívoros presentes na área possuem hábitos onívoros, com algumas alterações da dieta em comparação com áreas mais preservadas, consumindo em grande quantidade pequenos roedores, frutos e insetos. A competição, apesar de pequena, foi constadada entre as espécies domésticas e silvestres. Verificou-se, de forma complementar, que as espécies usam mais as áreas próximas da vegetação nativa que dentro da matriz, sendo que algumas espécies estiveram restritas ao ambiente nativo. Esse estudo sugere que essas paisagens albergam somente espécies com hábitos mais plásticos e que a matriz silvicultural é permeável a alguns predadores. No quarto capítulo, estudou-se a prevalência de ectoparasitas naquelas amostras de fezes, que mostrou-se de 42,17% para ácaros, dentre eles carrapatos, e 4% de pulgas. As prevalências desses artrópodes variaram entre as espécies de carnívoros. Os ácaros foram encontrados nas fezes de todas as espécies amostradas, e as pulgas estiveram presentes em fezes de todos os canídeos, de todos os felídeos, com exceção do gato-mourisco, e do quati. Foram detectados carrapatos em fezes de espécies de hospedeiros ainda não relatadas na literatura, mostrando serem hospedeiros não-usuais, o que poderia demonstrar um aumento de sua prevalência no ambiente como consequência provável da mudança da paisagem. Essa maior carga de parasitas, juntamente com o contato frequente da fauna silvestre com os humanos e seus animais domésticos, atesta a necessidade de estudos epidemiológicos de maior amplitude nessas paisagens agrícolas. / Although the state of Sao Paulo has a small area of native vegetation, mainly fragmented, isolated and highly immersed in agricultural matrices on private properties, it still lodges a considerable number of wild species, also on these commercial areas. For elaboration of ecologically correct manegement plans, it´s necessary to select (1) key-species, as carnivore mammals; (2) species primary ecological factors, as diet and space use; and (3) representative areas of space-temporal exploration of the land, as Angatuba does on Sao Paulo. This study was carried out at Fazenda Três Lagoas and its surrounding between May 2008 and June 2010, and encloses three distinct but linked subjects. The first chapter is a general introduction of those subjects. The second one evaluates, in those four adjacent farms, domestic carnivores exposition to infectious agents of parvovirosis, rabies, canine distemper and leptospirosis through serologic examinations. The prevalence of contact of those pathological agents, in the 13 dogs, were 100%, 80%, 23% and 15.4%, respectively. The positive reactions to some of these agents and serovares show that those domestic dogs had contact to other hosts, as some of them do not compose vaccines. It shows the importance of its detention in wildlife and in the environment aiming to elaborate an effective sanitary management for economy and human health and for wildlife conservation. In the third chapter the diet of 12 species of carnivorous mammals were investigated through analysis of 524 scats collected on Fazenda Três Lagoas and Fazenda Arca. Carnivore mammals on these area have omnivores\' food habits, with some modifications on diet in comparison with those in preserved areas, consuming in a great amount small rodents, fruits and insects. The competition, although weak, occurs among the domestic and wild species. In a complementary way, it was verified that the animals use more areas closer to native vegetation than inside matrix and that some species use areas restricted to native environment. This study suggests that these landscapes only lodge species with more plastic habits and that silvicultural matrix is permeable to some predators. In the forthy chapter, it was investigated the ectoparasites prevalence in those excrement samples and revealed a prevalence of 42,17% for mites, amongst them ticks, and 4% of fleas. The prevalence of those arthropods varied between carnivore species. Mites were found in excrements of all sampled species, and fleas were found in all wild dogs and wild cats faeces, but jaguarundi, and coati. Some carnivore scats contenied different ticks showing that those mammals are non-usual hosts of them and that, possibly, there is an increase of its prevalence in the environment as probable effect of the landscape modifications. A higher parasitic load with direct contact of wildlife to humans and livestock request to carry out a more in-depth epidemiologic investigation into these agricultural landscapes.

As Unidades de Conservação (UCs) foram criadas para proteger e manter os remanescentes de ecossistemas naturais a fim de reduzir a perda da biodiversidade e garantir sua manutenção em longo prazo. Atualmente, muitas UCs se encontram na forma de pequenos fragmentos isolados e sob forte pressão antrópica, exigindo um manejo na forma de uma rede de fragmentos, visando reduzir as pressões das atividades do entorno. O presente trabalho teve como objetivo gerar subsídios para a criação de uma zona de amortecimento (ZA) comum para o Parque Estadual de Vassununga e para a Estação Ecológica de Jataí, visando reduzir as pressões antrópicas sobre as UCs e facilitar o fluxo biológico entre os fragmentos. Foi realizado o mapeamento da paisagem para identificar as principais formas de uso, as fontes de impactos ambientais e verificar o cumprimento da legislação de áreas de preservação permanente. Foram utilizadas métricas de paisagens para analisar a configuração espacial dos remanescentes de vegetação arbórea e selecionar fragmentos importantes para a facilitação do fluxo biológico. Foram utilizados modelos de previsão de riqueza e probabilidade de ocorrência de espécies-alvo de aves para selecionar áreas potencialmente importantes para a manutenção da biodiversidade. A paisagem da área de estudo apresenta menos de 30% de remanescentes de vegetação natural, distribuídos em pequenos fragmentos, imersos em uma matriz de cana-de-açúcar e eucalipto. O desrespeito à legislação e numerosas fontes de impacto ambiental contribuem para aumentar a pressão sobre os recursos naturais. O incremento da conectividade dos fragmentos, principalmente com a restauração das florestas ribeirinhas mostrou ser uma estratégia importante para restabelecer a conectividade funcional entre as UCs e entre os remanescentes da paisagem. Na região existem fragmentos com potencial para facilitar os fluxos biológicos, atuando como uma rede de fragmentos, e auxiliar na manutenção da biodiversidade. Porém, grande parte deles está localizada no interior de propriedades particulares, exigindo esforços para conscientização dos proprietários para proteção e incremento da conectividade destes fragmentos. / Natural reserves have been created to protect and maintain natural ecosystems remnants in order to reduce biodiversity loss and to ensure their maintenance in the long run. Nowadays, most of these reserves are small and isolated fragments under anthropogenic pressure. Such small remnants must be managed and protected as a fragment network to reduce the human pressure and to promote biological fluxes among fragments. This study aimed at producing information to help on the process of designing a common buffer zone for three public natural reserves: Vassununga State Park, Jataí Ecological Station and Luís Antônio Experimental Station. An up to date land cover/land use map was generated to identify the main activities and sources of anthropogenic impacts in the study area, their possible consequences to the environment, and also if and how much the environmental legislation is being followed. To select the most important natural fragments which could facilitate biological fluxes and maintain the regional biodiversity, two approaches were used: analysis of the spatial arrangement of the fragments in the landscape applying landscape metrics, and the use of models to predict bird species richness and occurrence. The studied area presently has less than 30% of remnant natural vegetation, spread as small fragments in a sugar cane and eucalyptus matrix. Environmental legislation is not being obeyed and, together with several sources of impact, produce negative pressures on the natural resources. The restoration of riparian forests would be a good strategy to reestablish the landscape functional connectivity. Fragments able to facilitate biological fluxes and to maintain biological diversity still exist in the region, but a great deal of them are located in private properties. Therefore, efforts to warn and educate the owners are needed to increase the landscape connectivity and to conserve the regional biodiversity.

As palmeiras figuram entre as espécies vegetais mais importantes aos animais, já que seus frutos são bastante nutritivos e estão disponíveis geralmente em épocas de escassez de alimentos. Uma gama de animais alimentam-se de seus frutos, incluindo aves, morcegos, mamíferos não voadores, répteis, peixes e insetos. As palmeiras com frutos grandes apresentam, entretanto, limitação na dispersão de suas sementes, pois apenas poucas espécies animais podem atuar como dispersoras. As florestas tropicais vêm sofrendo da chamada “síndrome de florestas vazias", onde interações mutualísticas e agonísticas entre animais e plantas já foram perdidas, pela ausência de dispersores e predadores de sementes e herbívoros de grande porte. O primeiro capítulo teve como objetivo verificar os frugívoros que dispersam e predam as sementes da palmeira brejaúva, Astrocaryum aculeatissimum, bem como avaliar as proporções de predação das sementes por invertebrados e o recrutamento de plântulas próximos às plantas-mãe. No segundo capítulo foi avaliado o efeito da defaunação, relacionado a abundância de cutias, na remoção e na distância de dispersão das sementes. A predação por invertebrados e o recrutamento de plântulas e jovens ao redor da planta mãe também foram comparados em cinco áreas na Mata Atlântica com diferentes abundâncias de cutias. As hipóteses testadas foram que as áreas com baixas abundâncias de cutias apresentariam uma menor remoção das sementes, uma maior predação por invertebrados e um menor recrutamento de plântulas. Além das cutias (Dasyprocta spp.), ratos de espinho (Trynomis iheringi) e esquilos (Sciurus aestuans) também foram os responsáveis pela remoção de sementes e atuaram mais como dispersores do que predadores nos cinco dias de exposição das sementes. A massa das sementes não mostrou relação com a remoção pelas espécies animais. Sementes mais pesadas foram levadas a maiores distâncias da planta-mãe e as sementes predadas foram levadas a maiores distâncias do que as sementes dispersas. As áreas mais defaunadas mostraram uma menor porcentagem de remoção de sementes, bem como de predação e dispersão. A proporção de endocarpos predados por vertebrados foi maior na área com maior abundância de cutias (Ilha Anchieta) e as proporções de endocarpos intactos e predados por invertebrados foram maiores na área com menor abundância (Xixová Japuí). O recrutamento de plântulas embaixo das plantas-mãe amostradas não mostrou diferença significativa entre as áreas. O número de plântulas de Astrocaryum aculeatissimum nos 0,8 ha amostrados em cada área foi maior na Ilha do Cardoso, onde há também uma alta densidade de cutias e o menor recrutamento foi encontrado em Xixová Japuí, a área mais defaunada. Como a espécie estudada não é dispersa por uma grande diversidade de frugívoros, mudanças sutis na composição faunística do local podem ter efeitos cruciais na população da brejaúva a longo prazo. O estudo mostrou que o decréscimo populacional de cutias diminui a remoção, a predação e a dispersão de sementes, aumenta a proporção de sementes predadas por invertebrados embaixo das plantas-mãe, diminuindo o recrutamento das plântulas de Astrocaryum aculeatissimum. / The palms are among the most important plant species to the animals, because their fruits are nutritive and are available in periods of fruit scarcity. Lots of animals feed on palm fruits, including birds, bats, non-volant mammals, reptiles, fishes and insects. The palm species with big fruits show, however, limitation in seed dispersal because only a few animal`s species can act as dispersers. The tropical forest has suffered the “Empty Forest Syndrome", where mutualistic and agonistic interactions between animals and plants have just gone due to the absence of seed dispersers and predators and large size herbivores. The first chapter has as an objective study the frugivores responsible to disperse and predate the seeds of the palm brejaúva Astrocaryum aculeatissimum and evaluate the proportion of seed predation by invertebrates and the seedling recruitment close to the mother-plant. In the second chapter, the defaunation effect was evaluated, related to the agoutis’ abundance, on the removal and on the seed dispersal distance. The seed predation by invertebrates and the seedling and juvenile recruitment near the mother-plant were compared in five study sites with different agoutis`abundance. The principal hypothesis was that in areas with low agoutis’ abundance, the seed removal and the seedling recruitment were lower and the seed predation by invertebrates were higher. Besides agoutis (Dasyprocta spp.), spiny rats (Trynomis iheringi) and squirrels (Sciurus aestuans) were also responsible for the seed removal and acted more as seed dispersers than seed predators, during the five days of the experiment. The seed mass didn`t show relation with the seed removal by each of the animal species. Heavier seeds were carried to long distances, and the predated seeds were carried longer than the dispersed seeds. The most defaunated study site showed less seed removal, seed dispersal and seed predation. The proportion of seed predation by vertebrates was higher in study site with higher agoutis` abundance (Ilha Anchieta) and the proportion of intacts endocarps and predated by invertebrates were higher in the study site with less agoutis’ abundance (Xixová Japuí). The seedling recruitment near the mother plant didn`t show difference among the areas. The number of Astrocaryum aculeatissimum seedlings in the 0,8 hectares sampled in each area was higher at Ilha do Cardoso, where we have a high agoutis’ abundance and the smaller recruitment was found in Xixová Japuí, the more defaunated area. The study showed that the decrease in agoutis` population, decrease the Astrocaryum aculeatissimum seed removal, dispersal and predation and increase the seed predation by invertebrates, decreasing the seedling recruitment.