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A interface entre pequenos mamíferos silvestres e animais domésticos em área fragmentada do alto Paranapanema, estado de São Paulo, Brasil / The interface between wild small mammals and domestic animals of the fragmented area from High Paranapanema, Sao Paulo state, BrazilOliveira, Alice Soares de 12 August 2011 (has links)
A Fazenda Três Lagoas, localizada no município de Angatuba, região do Alto Paranapanema (centro-sul do Estado de São Paulo), é uma área na qual houve introdução de espécies exóticas, como Eucalyptus sp e Brachiaria sp, que fragmentaram o habitat de cerrado original. Uma vez em que foi estabelecida atividade humana em um ambiente antes natural, houve expansão do contato entre humanos e animais domésticos com as populações de animais silvestres; sendo a influência destes fatores sobre o ecossistema local ainda pouco conhecido. O presente estudo teve como objetivo pesquisar a exposição de pequenos mamíferos silvestres e animais domésticos da região a agentes infecciosos e transmissores de zoonoses (Leptospira spp., Lyssavirus, Toxoplasma gondii, Neospora caninum e Rickettsia spp.). O levantamento dos patógenos nos animais silvestres revelou resultados sorológicos positivos para Leptospira spp. (5,5%, n= 73), Rickettsia spp. (7,9%, n=38) e Toxoplasma gondii (16,1%, n= 56). Em relação aos animais domésticos, foram encontrados 40% de cães (n=10) soropositivos para N. caninum, 20% de soropositivos para Leptospira spp. e T. gondii (n=10), e 23,27% dos cães (n=11) apresentaram títulos de anticorpos menores ou iguais a 0,5 UI/ml para Raiva. Os bovinos (n=42) apresentaram resultados sorológicos positivos para N. caninum (23,8%) e Leptospira spp. (40,5%). 47,6% do gado não havia sido vacinado ou a vacinação para o vírus rábico era desconhecida. Dos 22 bovinos conhecidamente vacinados para a Raiva, 36% foram pouco reagentes ao exame sorológico. Os resultados apresentados, além de contribuírem para a avaliação do status sanitário local, contribuem para o maior conhecimento da interface entre fauna doméstica e silvestre em agroecossistemas. / Três lagoas farm, which is located in Angatuba municipality, in High Paranapanema (southeast of São Paulo state) is an area where exotic species were introduced, such as Eucalyptus sp and Brachiaria sp, which fragmented the habitat in the original Cerradão (a tropical savanna ecoregion). Once the human activity has been established in a natural environment, the contact among human beings and domestic animals with wild animal populations has increased. Nevertheless, the influence of such factors on the ecosystem has not been clarified yet. The aim of the present study was to research the exposition between wild small mammals and domestic animals of this area against infecctious and transmitters of zoonoses agents (Leptospira spp., Toxoplasma gondii, Lyssavirus, Neospora caninum and Rickettsia spp.). The raising of pathogens in the wild animals revealed positive serological results for Leptospira spp. (5,5%, n= 73), Rickettsia spp. (7,9%, n=38) e Toxoplasma gondii (16,1%, n= 56). In relation to the domestic animals, were showed 40% of dogs (n=10) seropositives for N. caninum, 20% were seropositives for Leptospira spp. and T. gondii, and 23.7% of dogs presented antibody titers less than or equal to 0,5 UI/ml for Rabies. The cattle (n=42) had serologic results positives for N. caninum (23,8%) and for Leptospira spp. (40,5%). 47.6% of the cattle had not been vaccinated or vaccination for the rabies virus was unknown. Of the 22 cattle known to be vaccinated for rabies, 36% were less reactive to serologic test. These results presented, besides evaluating the local sanitary status, they can contribute to the greater understanding of the interface between domestic and wild fauna in agricultural ecosystems.
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Utilização de sistemas agrícolas (tangerinas, citrus reticulata) por aves na região de Pilar do Sul, São Paulo.Campolim, Marcelo Gonçalves 01 June 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-06-01 / Financiadora de Estudos e Projetos / This study aimed to compare environments of mandarin monocultures (Citrus reticulata) (P1, P2, P3, P4) with contiguous forest fragments (F1, F2, F3, F4) in its avifauna composition and dynamics. The point counts methodology was employed, and points were georeferenced 200m far from each other, and distributed along the plantations and fragments. Seven points were sampled each day of field work, remaining ten minutes in each one, recording all individuals seen and / or listen to an unlimited distance. From November 2009 to October 2010 after 6,730 minutes of observations (1970 and 4760 minutes in fragments and plantations respectivelly), we recorded 5978 contacts (1722 and 4256 in the fragments and in the plantations), which sampled 122 species from 43 families and 15 orders ( 73 passerine and 50 non-passerines). Of the 122 sampled species, 50 (41%) were common to both environments, 12 (10%) were found only in plantations and 60 (49%) only in the forest fragments. Generalist species assumed to be living in two studied environments appear to be well adapted in that region (Colaptes campestris, Furnarius rufus, Patagioenas picazuro, Pitangus sulphuratus, Turdus leucomelas, Vanellus chilensis and Zonotrichia capensis), a result of the disturbance of the environment and the intense anthropic interference . Even the species richness in the plantations not exceeding the fragments, one can propose that this is an attractive environment for part of the local avifauna. However, our data show that it is essential to maintaining patches of native vegetation for many species, which remain isolated even into agricultural systems of trees, as the case studied here, and are likely to disappear without the presence of these fragment. / Este trabalho tem como objetivo comparar ambientes de monocultura de tangerina (Citrus reticulata) (P1, P2, P3, P4) com fragmentos florestais contíguos ( F1, F2, F3, F4) em sua composição e dinâmica avifaunística. A metodologia utilizada foi a de observação por pontos fixos, marcados com GPS a uma distancia de 200m entre si e distribuídos ao longo das plantações e dos fragmentos. A cada dia de campo foram realizadas observações em sete pontos, permanecendo-se dez minutos em cada ponto, registrando-se todos os indivíduos vistos e/ou ouvidos a uma distancia ilimitada. Durante os meses de Novembro de 2009 a Outubro de 2010 após 6730 minutos de observações (1970 minutos nos fragmentos e 4760 nas plantações) foram registrados 5978 contatos (1722 nos fragmentos e 4256 nas plantações) que amostraram 122 espécies de 43 famílias e 15 ordens sendo 73 Passeriformes e 50 não-Passeriformes. Das 122 espécies registradas, 50 (41%) foram comuns aos dois tipos de ambientes estudados, 12 (10%) foram observadas somente nas plantações e 60 (49%) somente em ambiente florestal.Espécies generalistas e que foram classificadas como residentes nos dois ambientes estudados parecem estar bem adaptadas à região (Colaptes campestris, Furnarius rufus, Paragioenas picazuro, Pitangus sulphuratos, Turdus leucomelas, Vanellus chilensis e Zonotrichia capensis) resultado esse da perturbação do ambiente e pela intensa interferência antrópica. Mesmo a riqueza de aves nas plantações não superando a dos fragmentos florestais, pode-se propor que este é um ambiente atrativo para parte da avifauna local. Entretanto, os dados demonstram ser imprescindível a manutenção de manchas de vegetação nativa que, para muitas espécies, permanecem isolados mesmo entre sistemas agrícolas arbóreos, como o caso aqui estudado, e que provavelmente desaparecem na inexistência desta vegetação.
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A interface entre pequenos mamíferos silvestres e animais domésticos em área fragmentada do alto Paranapanema, estado de São Paulo, Brasil / The interface between wild small mammals and domestic animals of the fragmented area from High Paranapanema, Sao Paulo state, BrazilAlice Soares de Oliveira 12 August 2011 (has links)
A Fazenda Três Lagoas, localizada no município de Angatuba, região do Alto Paranapanema (centro-sul do Estado de São Paulo), é uma área na qual houve introdução de espécies exóticas, como Eucalyptus sp e Brachiaria sp, que fragmentaram o habitat de cerrado original. Uma vez em que foi estabelecida atividade humana em um ambiente antes natural, houve expansão do contato entre humanos e animais domésticos com as populações de animais silvestres; sendo a influência destes fatores sobre o ecossistema local ainda pouco conhecido. O presente estudo teve como objetivo pesquisar a exposição de pequenos mamíferos silvestres e animais domésticos da região a agentes infecciosos e transmissores de zoonoses (Leptospira spp., Lyssavirus, Toxoplasma gondii, Neospora caninum e Rickettsia spp.). O levantamento dos patógenos nos animais silvestres revelou resultados sorológicos positivos para Leptospira spp. (5,5%, n= 73), Rickettsia spp. (7,9%, n=38) e Toxoplasma gondii (16,1%, n= 56). Em relação aos animais domésticos, foram encontrados 40% de cães (n=10) soropositivos para N. caninum, 20% de soropositivos para Leptospira spp. e T. gondii (n=10), e 23,27% dos cães (n=11) apresentaram títulos de anticorpos menores ou iguais a 0,5 UI/ml para Raiva. Os bovinos (n=42) apresentaram resultados sorológicos positivos para N. caninum (23,8%) e Leptospira spp. (40,5%). 47,6% do gado não havia sido vacinado ou a vacinação para o vírus rábico era desconhecida. Dos 22 bovinos conhecidamente vacinados para a Raiva, 36% foram pouco reagentes ao exame sorológico. Os resultados apresentados, além de contribuírem para a avaliação do status sanitário local, contribuem para o maior conhecimento da interface entre fauna doméstica e silvestre em agroecossistemas. / Três lagoas farm, which is located in Angatuba municipality, in High Paranapanema (southeast of São Paulo state) is an area where exotic species were introduced, such as Eucalyptus sp and Brachiaria sp, which fragmented the habitat in the original Cerradão (a tropical savanna ecoregion). Once the human activity has been established in a natural environment, the contact among human beings and domestic animals with wild animal populations has increased. Nevertheless, the influence of such factors on the ecosystem has not been clarified yet. The aim of the present study was to research the exposition between wild small mammals and domestic animals of this area against infecctious and transmitters of zoonoses agents (Leptospira spp., Toxoplasma gondii, Lyssavirus, Neospora caninum and Rickettsia spp.). The raising of pathogens in the wild animals revealed positive serological results for Leptospira spp. (5,5%, n= 73), Rickettsia spp. (7,9%, n=38) e Toxoplasma gondii (16,1%, n= 56). In relation to the domestic animals, were showed 40% of dogs (n=10) seropositives for N. caninum, 20% were seropositives for Leptospira spp. and T. gondii, and 23.7% of dogs presented antibody titers less than or equal to 0,5 UI/ml for Rabies. The cattle (n=42) had serologic results positives for N. caninum (23,8%) and for Leptospira spp. (40,5%). 47.6% of the cattle had not been vaccinated or vaccination for the rabies virus was unknown. Of the 22 cattle known to be vaccinated for rabies, 36% were less reactive to serologic test. These results presented, besides evaluating the local sanitary status, they can contribute to the greater understanding of the interface between domestic and wild fauna in agricultural ecosystems.
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Caracterização da diversidade genética de inhame (Dioscorea alata) utilizando marcadores microssatélites / Genetic diversity characterization of water yam (Dioscorea alata L.) with microsatellites markersSiqueira, Marcos Vinicius Bohrer Monteiro 27 July 2011 (has links)
O gênero Dioscorea é o mais amplo da família Dioscoreaceae, apresentando cerca de 600 espécies distribuídas, sobretudo, nos trópicos, com grande importância na alimentação, principalmente na África Ocidental, na Sudeste Asiático, no Caríbe e em alguns países da América do Sul. No Brasil, algumas espécies de inhame (Dioscorea spp.), juntamente com a mandioca (Manihot esculenta Crantz), têm uma profunda importância na agricultura de subsistência, sendo utilizadas basicamente como fonte de carboidrato para alimentação humana. Pouco se conhece sobre a diversidade e estrutura genética dessas espécies, como evoluíram nos últimos anos, sobretudo pela escassez de avaliações moleculares. O presente estudo tem como objetivos: (i) apresentar dados sócio-econômicos e etnobotânicos relativos aos diferentes agricultores que cultivam a espécie; (ii) isolar primers de microssatélites usando uma biblioteca genômica enriquecida e testar sua amplificação entre outras espécies de Dioscorea; (iii) analisar a relação genética entre 73 variedades locais e 17 acessos comerciais de inhame coletados em cinco diferentes regiões do Brasil (Sul, Sudeste, Nordeste, Norte e Centro-oeste) usando um conjunto de 12 microssatélites. Túberas de inhame foram coletadas em 28 municípios proveniente de cinco regiões onde a espécie é comumente cultivada, bem como em mercados locais e feiras de vários estados do Brasil. Outros acessos foram obtidos dos bancos de germoplasma ex situ pertencentes a ESALQ/USP, IAC e FCA/UNESP. Uma análise descritiva de diferentes agricultores foi realizada, indicando distintos perfis entre as regiões analisadas. Um amplo espectro de nomes populares foi registrado com diferenças entre regiões. As entrevistas com os agricultores revelaram que a espécie tem perdido sua importância em algumas áreas tradicionais/locais. O isolamento de marcadores microssatélites polimórficos resultou na detecção de 14 locos de microssatélites (SSR). Destes, dez foram selecionados para caracterizar 80 acessos de D. alata. O conteúdo de informação polimórfica foi de 0,39 a 0,78 e o poder de descriminação foi de 0,15 a 0,91. Seis destes marcadores mostraram transferibilidade entre as espécies D. bulbifera, D. cayenensis-D. rotundata e D. trifida. Em um estudo de diversidade morfológica e molecular, 12 pares de microssatélites polimórficos (nove desenvolvidos neste estudo e três obtidos da literatura) foram usados para gerar perfis de DNA de cada acesso da espécie e quatro perfis morfológicos foram analisados. A caracterização morfológica mostrou considerável diversidade e nenhum agrupamento específico foi observado entre as regiões. As análises moleculares de D. alata mostraram alta diversidade intra-específica nos acessos locais de diferentes regiões do Brasil. Contudo, a estrutura populacional entre as regiões coletadas foi relativamente baixa. Somente acessos da região Centro-Oeste apresentaram um aparente agrupamento regional, resultado quase similar foi observado nos acessos do nordeste. Estes resultados mostram uma mistura de acessos em todas as regiões coletadas, na qual é consistente com a falta de correlação entre as distâncias geográficas e genéticas, sugerindo que as túberas de inhame têm se movido extensivamente pelo fluxo humano. A diversidade genética encontrada pode ser explicada pelo resultado de um contínuo intercâmbio de variedades através do território brasileiro. O desenvolvimento de marcadores moleculares SSR em D. alata e análises de genética populacional são essenciais para o avanço de pesquisas nesta espécie. A geração de informação é de grande importância para a identificação, exploração racional e conservação da variabilidade genética da espécie, tanto da forma in situ e/ou ex situ. / The genus Dioscorea is the largest in the Dioscoreaceae family, featuring approximately 600 species distributed mainly in the tropics, with high importance as food supply in West Africa, Asia southeast, the Caribbean and a few countries in South America. In Brazil, some species of yam (Dioscorea spp.) together with cassava (Manihot esculenta Crantz), have a profound importance in subsistence agriculture, being used primarily as a source of carbohydrate for human feeding. Little is known about the genetic diversity and structure of these species, and also how it evolved in recent centuries, particularly because of the scarcity of molecular evaluations. The present study is intended to: (i) present socio-economic and ethnobotanical data on the different agriculturists that cultivated the species; (ii) isolate microsatellite primers using an enriched genomic library technique and test for cross amplifications in other species of Dioscorea; (iii) analyse the genetic relationships among 73 local acessions and 17 commercial accessions of water yam collected in five different regions in Brazil (South, Southeast, Northeast, Central-West and North) using a set of 12 microsatellite. Tubers of D. alata were collected in 28 municipalities from this five regioesn where the species is commonly cultivated, as well as on local markets and fairs from several states across Brazil. Other accessions were obtained from the ex situ germplasm collections belonging to ESALQ/USP, IAC and FCA/UNESP. A descriptive analysis of different farmers was performed, indicating unequal profiles between the screened regions. A wide range of vernacular names were registered with differences between regions. The interviews eith the agriculturist revealed that the species are losing their importance in some traditional/local areas. The isolation of codominant polymorphic microsatellite markers resulted in the detection of 14 short tandem repeat (SSR) loci, and ten were selected to characterize 80 D. alata accessions. The polymorphism information content varied from 0.39 to 0.78 and the power discrimination ranged from 0.15 to 0.91. Six of the markers showed transferability between the species D. bulbifera, D. cayenensis-D. rotundata and D. trifida. In a morphological and molecular diversity study, 12 polymorphic microsatellite primers were used to generate DNA profiles for each accession of the species and four morphological traits were analyzed. The morphological characterization showed considerable diversity and no specific clustering was observed between regions. The molecular analyses of D. alata showed a high intraspecific diversity in local varieties from different regions in Brazil. However, population structuring between sampling regions was rather low. Only the accessions from the Central-Western region showed an apparent regional clustering, almoust similar were observed with northeast acessions. These results show an admixture of accessions in all sampling regions, which is further consistent with the lack of a correlation between geographic and genetic distances, suggesting that water yam tubers have moved extensively by human fluxes. The genetic diversity found can be explained by the result of a continuous exchange of varieties through the Brazilian distribution range. The development of molecular SSR markers for D. alata and genetic population analysis is essential for the ongoing research on this species. The generated information is of great importance for the identification, rational exploitation and conservation of the genetic variability of this species, in a in situ and/or ex situ way.
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Diversidade de ácaros em agroecossistemas e testes para controle alternativo do ácaro branco, Polyphagotarsonemus latus (Acari: Tarsonemidade), na região de Manaus, Amazonas / Diversity of mites in agroecosystems and testing to alternative control of the broad mite, Polyphagotarsonemus latus (Acari: Tarsonemidae), in the Manaus region, AmazonasVasconcelos, Geraldo José Nascimento de 17 May 2011 (has links)
A Amazônia é tida como a região de maior biodiversidade do Planeta. No entanto, pouco se sabe a respeito da diversidade de ácaros plantícolas nesta região. Dentre estes ácaros estão espécies fitófagas, generalistas e predadoras. Este último grupo é de grande interesse, pois pode haver espécies promissoras para uso em programas de controle biológico de pragas. Já os fitófagos são indesejados devido ao dano que algumas espécies podem causar como é o caso do ácaro-branco Polyphagotarsonemus latus (Banks), o principal ácaro praga na região de Manaus, sobretudo em pimentão. Assim, o objetivo deste trabalho foi determinar a diversidade de ácaros associados às frutíferas nativas da região Amazônica e testar formas alternativas e sustentáveis para o controle do ácaro-branco em pimentão nesta região. Foram realizadas coletas no campus da Universidade Federal do Amazonas (UFAM), na fazenda Experimental da UFAM e no município de Anamã, Iranduba e Manacapurú. Os ácaros retirados de cada amostra foram montados, identificados e quantificados. Para o controle do ácaro-branco foram feitos testes com ácaros predadores nativos da região e com extratos aquoso de folha e inflorescência de Piper aduncum L. Foram coletadas 81 espécies de ácaros das famílias Tetranychidae, Tenuipalpidae, Tarsonemidae, Phytoseiidae e Ascidae. Nenhum dos predadores estudados mostrou-se eficiente para o controle do ácaro-branco, apresentando baixa sobrevivência e taxa de oviposição, quando alimentados com esta praga. Extratos aquosos a base de P. aduncum em altas cocentrações mostraram-se promissores para o controle de P. latus, sendo seletivo ao ácaro predador Amblyseius largoensis (Muma). / The Amazon region is considered the most biodiverse on the planet. In however, little is known about the diversity of plants mites in this region. Among these mites are phytophagous species, generalist and predators. This latter group is of great interest because there may be promising species for use in biological control programs of pests. Since the phytophagous are unwanted because of the damage that some species can cause as is the case of broad mite Polyphagotarsonemus latus (Banks), the main mite pest in the Manaus region, especially in pepper. Thus, the objective was to determine the diversity mites associated with fruit native to the Amazon region and test alternative and sustainable ways to control the mite in peppers in this region. Collections were made on the campus of Universidade Federal do Amazonas-UFAM (Federal University of Amazon), in the experimental farm of UFAM and at the municipality of Anamã, Iranduba and Manacapuru. Mites removed from each sample were mounted, identified and quantified. To the broad mite control, were tested native predatory mite and aqueous extracts of leaf and inflorescence of Piper aduncum L. We collected 81 species of mites of the families Tetranychidae, Tenuipalpidae, Tarsonemidae, Phytoseiidae and Ascidae. None of the predators studied was efficient to control the mite, with low survival and oviposition rate when fed with this pest. Aqueous extracts the basis of P. aduncum in high cocentrações proved promising for the control of P. latus, being selective to predatory mite Amblyseius largoensis (Muma).
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Caracterização da diversidade genética de inhame (Dioscorea alata) utilizando marcadores microssatélites / Genetic diversity characterization of water yam (Dioscorea alata L.) with microsatellites markersMarcos Vinicius Bohrer Monteiro Siqueira 27 July 2011 (has links)
O gênero Dioscorea é o mais amplo da família Dioscoreaceae, apresentando cerca de 600 espécies distribuídas, sobretudo, nos trópicos, com grande importância na alimentação, principalmente na África Ocidental, na Sudeste Asiático, no Caríbe e em alguns países da América do Sul. No Brasil, algumas espécies de inhame (Dioscorea spp.), juntamente com a mandioca (Manihot esculenta Crantz), têm uma profunda importância na agricultura de subsistência, sendo utilizadas basicamente como fonte de carboidrato para alimentação humana. Pouco se conhece sobre a diversidade e estrutura genética dessas espécies, como evoluíram nos últimos anos, sobretudo pela escassez de avaliações moleculares. O presente estudo tem como objetivos: (i) apresentar dados sócio-econômicos e etnobotânicos relativos aos diferentes agricultores que cultivam a espécie; (ii) isolar primers de microssatélites usando uma biblioteca genômica enriquecida e testar sua amplificação entre outras espécies de Dioscorea; (iii) analisar a relação genética entre 73 variedades locais e 17 acessos comerciais de inhame coletados em cinco diferentes regiões do Brasil (Sul, Sudeste, Nordeste, Norte e Centro-oeste) usando um conjunto de 12 microssatélites. Túberas de inhame foram coletadas em 28 municípios proveniente de cinco regiões onde a espécie é comumente cultivada, bem como em mercados locais e feiras de vários estados do Brasil. Outros acessos foram obtidos dos bancos de germoplasma ex situ pertencentes a ESALQ/USP, IAC e FCA/UNESP. Uma análise descritiva de diferentes agricultores foi realizada, indicando distintos perfis entre as regiões analisadas. Um amplo espectro de nomes populares foi registrado com diferenças entre regiões. As entrevistas com os agricultores revelaram que a espécie tem perdido sua importância em algumas áreas tradicionais/locais. O isolamento de marcadores microssatélites polimórficos resultou na detecção de 14 locos de microssatélites (SSR). Destes, dez foram selecionados para caracterizar 80 acessos de D. alata. O conteúdo de informação polimórfica foi de 0,39 a 0,78 e o poder de descriminação foi de 0,15 a 0,91. Seis destes marcadores mostraram transferibilidade entre as espécies D. bulbifera, D. cayenensis-D. rotundata e D. trifida. Em um estudo de diversidade morfológica e molecular, 12 pares de microssatélites polimórficos (nove desenvolvidos neste estudo e três obtidos da literatura) foram usados para gerar perfis de DNA de cada acesso da espécie e quatro perfis morfológicos foram analisados. A caracterização morfológica mostrou considerável diversidade e nenhum agrupamento específico foi observado entre as regiões. As análises moleculares de D. alata mostraram alta diversidade intra-específica nos acessos locais de diferentes regiões do Brasil. Contudo, a estrutura populacional entre as regiões coletadas foi relativamente baixa. Somente acessos da região Centro-Oeste apresentaram um aparente agrupamento regional, resultado quase similar foi observado nos acessos do nordeste. Estes resultados mostram uma mistura de acessos em todas as regiões coletadas, na qual é consistente com a falta de correlação entre as distâncias geográficas e genéticas, sugerindo que as túberas de inhame têm se movido extensivamente pelo fluxo humano. A diversidade genética encontrada pode ser explicada pelo resultado de um contínuo intercâmbio de variedades através do território brasileiro. O desenvolvimento de marcadores moleculares SSR em D. alata e análises de genética populacional são essenciais para o avanço de pesquisas nesta espécie. A geração de informação é de grande importância para a identificação, exploração racional e conservação da variabilidade genética da espécie, tanto da forma in situ e/ou ex situ. / The genus Dioscorea is the largest in the Dioscoreaceae family, featuring approximately 600 species distributed mainly in the tropics, with high importance as food supply in West Africa, Asia southeast, the Caribbean and a few countries in South America. In Brazil, some species of yam (Dioscorea spp.) together with cassava (Manihot esculenta Crantz), have a profound importance in subsistence agriculture, being used primarily as a source of carbohydrate for human feeding. Little is known about the genetic diversity and structure of these species, and also how it evolved in recent centuries, particularly because of the scarcity of molecular evaluations. The present study is intended to: (i) present socio-economic and ethnobotanical data on the different agriculturists that cultivated the species; (ii) isolate microsatellite primers using an enriched genomic library technique and test for cross amplifications in other species of Dioscorea; (iii) analyse the genetic relationships among 73 local acessions and 17 commercial accessions of water yam collected in five different regions in Brazil (South, Southeast, Northeast, Central-West and North) using a set of 12 microsatellite. Tubers of D. alata were collected in 28 municipalities from this five regioesn where the species is commonly cultivated, as well as on local markets and fairs from several states across Brazil. Other accessions were obtained from the ex situ germplasm collections belonging to ESALQ/USP, IAC and FCA/UNESP. A descriptive analysis of different farmers was performed, indicating unequal profiles between the screened regions. A wide range of vernacular names were registered with differences between regions. The interviews eith the agriculturist revealed that the species are losing their importance in some traditional/local areas. The isolation of codominant polymorphic microsatellite markers resulted in the detection of 14 short tandem repeat (SSR) loci, and ten were selected to characterize 80 D. alata accessions. The polymorphism information content varied from 0.39 to 0.78 and the power discrimination ranged from 0.15 to 0.91. Six of the markers showed transferability between the species D. bulbifera, D. cayenensis-D. rotundata and D. trifida. In a morphological and molecular diversity study, 12 polymorphic microsatellite primers were used to generate DNA profiles for each accession of the species and four morphological traits were analyzed. The morphological characterization showed considerable diversity and no specific clustering was observed between regions. The molecular analyses of D. alata showed a high intraspecific diversity in local varieties from different regions in Brazil. However, population structuring between sampling regions was rather low. Only the accessions from the Central-Western region showed an apparent regional clustering, almoust similar were observed with northeast acessions. These results show an admixture of accessions in all sampling regions, which is further consistent with the lack of a correlation between geographic and genetic distances, suggesting that water yam tubers have moved extensively by human fluxes. The genetic diversity found can be explained by the result of a continuous exchange of varieties through the Brazilian distribution range. The development of molecular SSR markers for D. alata and genetic population analysis is essential for the ongoing research on this species. The generated information is of great importance for the identification, rational exploitation and conservation of the genetic variability of this species, in a in situ and/or ex situ way.
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Diversidade de ácaros em agroecossistemas e testes para controle alternativo do ácaro branco, Polyphagotarsonemus latus (Acari: Tarsonemidade), na região de Manaus, Amazonas / Diversity of mites in agroecosystems and testing to alternative control of the broad mite, Polyphagotarsonemus latus (Acari: Tarsonemidae), in the Manaus region, AmazonasGeraldo José Nascimento de Vasconcelos 17 May 2011 (has links)
A Amazônia é tida como a região de maior biodiversidade do Planeta. No entanto, pouco se sabe a respeito da diversidade de ácaros plantícolas nesta região. Dentre estes ácaros estão espécies fitófagas, generalistas e predadoras. Este último grupo é de grande interesse, pois pode haver espécies promissoras para uso em programas de controle biológico de pragas. Já os fitófagos são indesejados devido ao dano que algumas espécies podem causar como é o caso do ácaro-branco Polyphagotarsonemus latus (Banks), o principal ácaro praga na região de Manaus, sobretudo em pimentão. Assim, o objetivo deste trabalho foi determinar a diversidade de ácaros associados às frutíferas nativas da região Amazônica e testar formas alternativas e sustentáveis para o controle do ácaro-branco em pimentão nesta região. Foram realizadas coletas no campus da Universidade Federal do Amazonas (UFAM), na fazenda Experimental da UFAM e no município de Anamã, Iranduba e Manacapurú. Os ácaros retirados de cada amostra foram montados, identificados e quantificados. Para o controle do ácaro-branco foram feitos testes com ácaros predadores nativos da região e com extratos aquoso de folha e inflorescência de Piper aduncum L. Foram coletadas 81 espécies de ácaros das famílias Tetranychidae, Tenuipalpidae, Tarsonemidae, Phytoseiidae e Ascidae. Nenhum dos predadores estudados mostrou-se eficiente para o controle do ácaro-branco, apresentando baixa sobrevivência e taxa de oviposição, quando alimentados com esta praga. Extratos aquosos a base de P. aduncum em altas cocentrações mostraram-se promissores para o controle de P. latus, sendo seletivo ao ácaro predador Amblyseius largoensis (Muma). / The Amazon region is considered the most biodiverse on the planet. In however, little is known about the diversity of plants mites in this region. Among these mites are phytophagous species, generalist and predators. This latter group is of great interest because there may be promising species for use in biological control programs of pests. Since the phytophagous are unwanted because of the damage that some species can cause as is the case of broad mite Polyphagotarsonemus latus (Banks), the main mite pest in the Manaus region, especially in pepper. Thus, the objective was to determine the diversity mites associated with fruit native to the Amazon region and test alternative and sustainable ways to control the mite in peppers in this region. Collections were made on the campus of Universidade Federal do Amazonas-UFAM (Federal University of Amazon), in the experimental farm of UFAM and at the municipality of Anamã, Iranduba and Manacapuru. Mites removed from each sample were mounted, identified and quantified. To the broad mite control, were tested native predatory mite and aqueous extracts of leaf and inflorescence of Piper aduncum L. We collected 81 species of mites of the families Tetranychidae, Tenuipalpidae, Tarsonemidae, Phytoseiidae and Ascidae. None of the predators studied was efficient to control the mite, with low survival and oviposition rate when fed with this pest. Aqueous extracts the basis of P. aduncum in high cocentrações proved promising for the control of P. latus, being selective to predatory mite Amblyseius largoensis (Muma).
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Caracterização da comunidade de mamíferos de médio e grande porte em paisagem agrícola fragmentada / Characterization of the mid and large bodied mammal community in a fragmented agricultural landscapeAlves, Maísa Ziviani 22 June 2012 (has links)
O avanço agrícola é uma das maiores causas da fragmentação de habitats, levando à diminuição e ao isolamento de áreas naturais. Assim, torna-se importante compreender qual papel da estrutura e dinâmica da paisagem na manutenção da biodiversidade local. Este estudo teve como objetivo descrever a estrutura de uma comunidade de mamíferos de médio e grande porte em paisagem fragmentada agrícola, considerando a estrutura e dinâmica da paisagem. O estudo foi realizado em unidades de paisagem (16 Km2) com matriz predominante de pasto (n = 2) e cana-de-açúcar (n = 3) (bacia do rio Corumbataí, São Paulo) de maio a outubro de 2010. O levantamento da comunidade de mamíferos foi realizado através de busca ativa por pegadas, em 15 transectos alocados nas margens de riachos, com distância percorrida padronizada em 200 m. No entorno de cada transecto foram gerados buffers (250, 500, 1000 e 2000 m de raio), para o cálculo de índices de estrutura (porcentagens dos usos do solo, densidade de drenagem, densidade de estradas e proximidade entre fragmentos) e de dinâmica (taxa anual de mudança e perfil da curva de mudança florestal) para cinco anos (1962, 1978, 1995, 2000 e 2008). A relação entre os índices de paisagem e a riqueza de espécies foi analisada através de um teste PCA (Análise de Componentes Principais), gerando um gráfico Biplot. Posteriormente, foi realizada regressão linear múltipla, para análise da influência da estrutura e dinâmica da paisagem sobre a riqueza de espécies e frequência de registros. Foram registradas 19 espécies, sendo 17 em unidades de cana-de-açúcar e 13 em unidades de pasto. A comunidade de mamíferos de médio e grande porte, presente nestas matrizes da bacia do rio Corumbataí, é representada, em grande parte, por espécies tolerantes a alterações ambientais da região. A espécie com maior frequência de registros foi Procyon cancrivorus, de hábito generalista, como a maior parte dos animais registrados. Pelo gráfico Biplot, o buffer de 1000 m foi o que melhor distinguiu os sítios amostrais em relação às matrizes de cana-de-açúcar e pasto. A riqueza apresentou relação positiva com a porcentagem de áreas florestais e densidade de drenagem. Em contrapartida, a riqueza mostrou relação negativa com a porcentagem de pasto. A riqueza e a frequência de registros não apresentaram diferença estatística significativa entre as matrizes e também não houve relação significativa entre os índices de paisagem e as variáveis dependentes. A similaridade entre a composição de espécies das comunidades amostradas nas matrizes foi de 57%. As relações entre a estrutura desta comunidade e a paisagem necessitam de mais esforços para serem melhor compreendidas, já que o método de levantamento utilizado neste estudo, assim como a escala espaço-temporal, não permitiram descrever tais relações. / Agricultural expansion is a major cause of habitat fragmentation, leading to a reduction and isolation of natural areas. It is therefore important to understand the role of agricultural landscape structure and dynamics in maintaining local biodiversity. We aimed to describe how the structure and dynamics of an agricultural landscape influenced the community of mid and large bodied mammals in the south of Brazil. From May to October 2010 we studied the mammal community in five 16 km2 landscape units located within the Corumbatai river basin, São Paulo. Landscape units contained a matrix of predominantly pasture (n = 2) and cane sugar (n = 3). We used track surveys along 15 transects (200m each) to sample the mammal community along river banks. To calculate indices of habitat structure and dynamics we generated buffers (250, 500, 1000 and 2000 m radius) around each of the transects. Within each of these distance buffers we calculated habitat structure indices (percentage of land use, drainage density, road density and proximity of fragments) and indices of habitat dynamics (annual rate of change and profile of the forest change curve) for five years (1962, 1978, 1995, 2000 and 2008). The relationship between landscape indices and species richness was analyzed through a PCA (Principal Component Analysis) and associated Biplot. Subsequently, multiple linear regression was performed to analyze the influence of landscape structure and dynamics on species richness and frequency of records. We recorded 19 species, 17 in cane sugar units and 13 in pasture units. The community of mid and large bodied mammals present in the habitat matrices of the Corumbataí river basin was represented mostly by generalist species tolerant of environmental changes. The most frequently recorded species was Procyon cancrivorus, a habit generalist. The PCA Biplot showed that the 1000m buffer was the one that best distinguished the sampling sites in relation to the sugar cane and pasture matrices. Species richness was positively related with the percentage of forested areas and drainage density. In contrast, richness was negatively related with the percentage of pasture. The richness and frequency of records showed no statistically significant difference between the two matrix types and there was no significant relationship between landscape indices and the dependent variables. The similarity between the species composition of the sampled communities in the matrices was 57%. Understanding the relationships between the composition of this community and the landscape structure and dynamics requires more efforts, as the survey method used in this study, and the spatiotemporal scale, do not permit the description of these relationships.
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Aspectos etnoentomológicos, socioeconômicos e ecológicos relacionados à cultura da erva-mate (Ilex paraguariensis) no município de salto do lontra, Paraná, Brasil. / Ethnoentomological, socioeconomic and ecological aspects related to the yerba mate (ilex paraguariensis) culture in the municipal district of Salto da Lontra, Paraná, Brazil.Pasinato, Raquel 19 February 2004 (has links)
Esta pesquisa aconteceu com o objetivo de realizar um estudo etnoentomológico com os produtores de erva-mate do Município de Salto do Lontra, região Sudoeste do Paraná, visando diagnosticar parâmetros para um plano de manejo que viesse a contribuir para a solucionar problemas fitossanitários, socioeconômicos e ambientais enfrentados pelos agricultores do município. Assim, utilizando elementos da pesquisa qualitativa e da pesquisa quantitativa, como as entrevistas e as coletas de insetos, objetivou-se encontrar indicadores para as respostas ao problema da decadência da cultura da erva-mate em Salto do Lontra. O estudo buscou valorizar e compreender o etnoconhecimento do agricultor/a produtor/a de erva-mate, a respeito dos insetos que observam nas plantações desta cultura e as cognições que fazem sobre estes invertebrados. Observou-se que os agricultores identificam e conhecem mais os insetos classificando-os como benéficos ou maléficos à medida que estes causam danos às suas plantações. Ainda, foram diagnosticados aspectos como, a possibilidade da erva-mate representar um sistema agroecológico, sustentável e viável aos pequenos agricultores; pois ela adapta-se ao sistema de consorcio de culturas agrícolas e pode ser uma fonte de renda alternativa para a agricultura familiar. Além de evidenciar as dificuldades de comercialização do produto na região; a falta de apoio técnico, a desorganização dos agricultores e a necessidade de políticas públicas que fomentem a atividade local da erva-mate. Assim, foi demonstrado que um plano de manejo para a cultura da erva-mate só será eficaz quando forem considerados elementos como, possibilidades de comercialização do produto, retorno financeiro para o agricultor/a, política de incentivo governamental, organização dos agricultores, sustentabilidade do agroecosssitema e, principalmente, o respeito à diversidade e o intercâmbio de saberes e práticas. / This study was carried out with the objective of accomplishing an ethnoentomological study with the yerba mate producers of the Municipal district of Salto do Lontra, Southwest area of Paraná, aiming at diagnosing elements for a management project that leads to a contribution towards a solution to the plant health/crop protection, socioeconomic and environmental problems faced by the farmers of the municipal district. Qualitative and quantitative research parameters, such as interviews and collections of insects, have been used with the intention of finding indicators of the answers to the problem of the yerba mate culture decadence in Salto do Lontra. This study wanted to value and to understand the ethnoknowledge of the yerba mate producer, regarding the insects observed in this culture and the cognitions that they have about these insects. It has been observed that the farmers identify and know the insects, classifying them as beneficial or malicious, only when they cause damages to their plantations. Furthermore, it has been diagnosed aspects such as the possibility of the yerba mate to represent an agroecological system, sustainable and viable to the small farmers because it adapts well to the system of agricultural cultures association, and it can be a source of alternative income for the agricultural family. This study has also evidenced the difficulties of the product commercialization in the area, the lack of technical support, the farmers' disorganization, and the need of public politics that foment the local activity of the mate. It has demonstrated that a management project for the culture of the yerba mate will only be effective when it is considered elements such as possibilities of commercialization of the product, financial return for the producer, politics of government incentives, farmers' organization, sustainability of the agroecosystem and, mainly, the respect to the diversity and the exchange of knowledge and practices.
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Distribuição e abundância de pequenos mamíferos em relação à paisagem da bacia do Rio Passa-Cinco, São Paulo, Brasil / Distribution and abundance of small mammals in relation to the landscape of the Passa-Cinco River basin, São Paulo, BrazilGheler-Costa, Carla 15 August 2006 (has links)
A Bacia do Corumbataí é usada como principal fonte de abastecimento de água para os municípios de Piracicaba e Rio Claro, sendo o Rio Passa-Cinco seu principal tributário. A Bacia do Passa-Cinco pode ser considerada um modelo conveniente para o estudo de conservação de biodiversidade por conter os principais agroecossistemas existentes no estado de São Paulo. Para que sejam estabelecidas estratégias conservacionistas, são necessárias informações de como a biodiversidade é afetada e quais estratégias as populações de espécie silvestres lançam mão para se manter em remanescentes florestais alterados. Pequenos mamíferos tais como roedores e marsupiais, podem ser considerados um bom grupo para ajudar a responder essas questões, pois esse grupo desenvolve um importante papel ecológico em ambientes florestais, através da predação e dispersão de sementes. De agosto de 2003 a janeiro de 2005 foram realizados levantamentos de pequenos mamíferos utilizando 160 armadilhas do tipo Sherman distribuídas em linhas, em 16 sítios amostrais, sendo 4 em cada tipo de ambiente predominante na paisagem: floresta nativa, plantações de Eucalyptus, plantações de cana-de-açúcar e pastagens. Durante esse período, foram capturados 177 indivíduos de roedores e marsupiais distribuídos em oito espécies, com um sucesso de captura de 0.77%. Houve diferença significativa entre os ambientes estudados em termos de abundância, mas não em termos de riqueza de espécies, podendo-se observar uma clara separação entre habitats florestais e não-florestais. Os remanescentes florestais nativos da região, aparentemente, perderam as espécies mais exigentes com relação à qualidade do habitat, de forma que a comunidade atual é formada basicamente de espécies generalistas e características de áreas degradadas. A perda de espécies florestais não somente altera a comunidade de pequenos mamíferos, como favorece o aparecimento de espécies de áreas não-florestais que podem trazer, entre outras coisas, problemas de saúde pública. Ainda assim, a comunidade de pequenos mamíferos da bacia do Rio Passa-Cinco é meritória de esforços conservacionistas, que devem priorizar estudos relacionando o cumprimento das leis ambientais com as alterações que isto possa gerar na comunidade de pequenos mamíferos. / The Corumbataí Basin is used as the main source of water supply for the municipal districts of Piracicaba and Rio Claro, being the Passa-Cinco River its main tributary. The Passa-Cinco river basin can be considered as a convenient model for the study of the conservation of biodiversity for it contains the main existing agroecosystems in the state of São Paulo. So that conservationist strategies can be established, some information is required, such as how biodiversity is affected, and which strategies the population of wild species use to keep themselves in the altered forest remainings. Small mammals, such as rodends and marsupials can be considered a good group to help answer these questions, for this group develops an important ecological role in forest environments, through the predation and dispersion of seeds. From August 2003 to January 2005 surveys on small mammals were carried out using 160 Sherman type traps distributed in lines, in 16 sample country properties, being 4 in each type of environment that is predominant in the landscape: native forest, Eucalyptus plantation, sugar-cane plantation and pastures. In this period, 177 rodend and marsupial individuals were captured, which were distributed in 8 species, with a 0,77% rate of success in capture. There was significative difference among the studied environments in terms of abundance, but not in terms of the richness of the species. Also, we could observe a clear distinction between forest and non-forest habitats. Apparently, the native forest remainings in the region lost their species which are the most demanding in relation to the quality of habitat, in such a way that the current community is basically formed of generalists, which are a characteristic of degraded areas. The loss of forest species not only alters the community of small mammals, but also favors the occurrence of species from non-forest areas which can bring, among other things, problems related to public health. Eventhough, the small mammal community from the Passa-Cinco river basin is worth conservationist efforts which must give priority to studies relating the environmental law enforcement to the changes this might generate to the community of small mammals.
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