Orientador: Mateus José Rodrigues Paranhos da Costa / Coorientador: Monique Valéria de Lima Carvalhal / Banca: João Alberto Negrão / Banca: Luciandra Macedo de Toledo / Resumo: O objetivo com esta dissertação foi desenvolver uma ferramenta prática para caracterizar a vitalidade das bezerras e entender suas relações com a saúde e desempenho desses animais. Foram avaliadas 82 bezerras que nasceram de partos eutócicos (57,32%, N=47) e distócicos (42,68%, N=35), sendo distribuídas em dois grupos genéticos, 1/2HG (N=23, 28,05%) e 3/4HG (N=59, 71,95%). As seguintes características inerentes as bezerras foram quantificadas: latência para mamar, postura, sucção e velocidade de sucção. As notas de postura e sucção foram somadas para obter a nota de vigor, que variou de 2 a 6 (sendo 2 a nota correspondente ao pior vigor e 6 ao melhor estado de vigor), sendo que 42,68% das bezerras estavam no escore 6. Foram registradas características inerentes as vacas que somadas constituíram a nota de comportamento maternal, que nas análises estatísticas foi considerada juntamente com as variáveis latência para mamar, vigor, grupo genético das bezerras e tipo de parto, variáveis independentes. Ainda foram registradas variáveis consideradas dependentes nos modelos estatísticos: vigor, peso ao nascimento, transferência de imunidade passiva, tratamentos veterinários, ganho de peso diário e sobrevivência. Foi utilizada a regressão linear múltipla para identificar quais foram as variáveis inerentes as bezerras, utilizadas como efeito fixo do modelo na análise confirmatória. Para a análise confirmatória foi utilizado o procedimento PROC MIXED do SAS (versão 9.0). Para o vigor as... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objetive of this dissertation was to develop a practical tool to characterize the vitality of calves and to understand their relationships with the health and performance of these animals. Eighty-two calves born of eutocic (57.32%, N = 47) and dystocic (42.68%, N = 35) calves were distributed in two genetic groups, 1/2HG (N = 23, 28.05 %) and 3/4HG (N = 59, 71.95%). The following inherent characteristics were quantified: suckling latency, posture, suction and suction velocity. Posture and suction scores were added to obtain the vigor score, which ranged from 2 to 6 (2 being the worst strength score and 6 being the best state of vigor), and 42.68% of the calves were in the score 6. Inherited characteristics were registered cows, which together were the maternal behavior note, which, together with the variables latency to suckling, vigor, genetic group of calves and type of calving, were considered as independent variables. Variables considered to be dependent on statistical models were also recorded: vigor, birth weight, transfer of passive immunity, veterinary treatments, daily weight gain and survival. Multiple linear regression was used to identify which inherent variables were heifers, which were used as fixed effect of the model in the confirmatory analysis. For the confirmatory analysis, the SAS PROC MIXED procedure (version 9.0) was used. For vigor, the variables group and suction velocity had a significant effect (p = 0.0028 and <0.0001, respectively), with the hig... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-06-11Bitstream added on 2014-06-13T19:22:50Z : No. of bitstreams: 1 sirol_mlfg_dr_botfmvz.pdf: 1072564 bytes, checksum: 6ed08e0d4f835b1a9e0ed7d60ba42a2d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Foram utilizados dados de 116406 bovinos da raça Nelore, participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN), nascidos entre 1995 e 2005, com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para os pesos padronizados aos 120(P120), 210(P210), 365(P365), 450(P450) e 730(P730) dias de idade e para os ganhos em peso do nascimento aos 120(GP120), dos 120 aos 210 (GP210), dos 210 aos 365(GP365), dos 365 aos 450(GP450) e dos 450 aos 730(G730), além de avaliar a tendência genética das características citadas, tanto para efeito direto como materno. Os componentes de variância foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita utilizando o programa AIREMLF90, sob modelo animal, o qual incluiu como efeitos fixos, os grupos de contemporâneos e idade da vaca ao parto e como aleatórios, efeito genético aditivo direto para todas as características estudadas e efeito genético materno para P120, P210, P365, GP120, GP210 e GP365. As estimativas de herdabilidade direta foram 0,21, 0,22, 0,22, 0,34, 0,28, para cada peso, respectivamente, e 0,19, 0,20, 0,18, 0,18 e 0,20, para os respectivos ganhos em peso. As herdabilidades maternas foram 0,26, 0,25 e 0,12, para P120, P210 e P365 e 0,23, 0,17, 0,12 para GP120, GP210 e GP365. As correlações direto-maternas foram todas negativas, exceto para P365 (0,06). As tendências genéticas diretas foram todas positivas. As tendências maternas foram quase nulas para todas as características. As estimativas de herdabilidade para os pesos padronizados e para os ganhos em peso indicam que a seleção pode promover mudanças genéticas. As herdabilidades maternas para P120, P210, P365 e GP365 indicam que a seleção nestas características pode contribuir para melhorar a habilidade materna do rebanho. Os ganhos genéticos diretos observados, para todas as características estão aquém dos ganhos potenciais da raça Nelore... / Data of 116406 bovines of the Nellore beef cattle, participants of the Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN), been born between 1995 and 2005 were used with the objective to estimate genetic parameters for the 120-days weight (P120), 210-days weight (P210), 365-days weight (P365), 450-days weight (P450) and 730-days weight (P730) and for the weight gain from birth to 120(GP120), from 120 to 210(GP210), from 210 to 365(GP365), from 365 to 450(GP450) and from 450 to 730 days weight(GP730), besides evaluating the genetic trends of the traits, so much for the direct effect as for the maternal. The variance components were estimated by the restricted maximum likelihood method using the program AIREMLF90. The animal model included fixed effects for contemporary groups and age of the dam at calving, and also included random effects for genetic direct effects for all the studied traits and genetic maternal effect for P120, P210, P365, GP120, GP210 and GP365. The estimative of direct heritability were 0,21, 0,22, 0,22, 0,34, 0,28, for each weight, respectively and 0,19, 0,20, 0,18, 0,18 and 0,20, for the respective weight gains. The maternal heritability were 0,26, 0,25 and 0,12, for P120, P210 and P365 and 0,23, 0,17, 0,12 for GP120, GP210 and GP365. The direct-maternal correlations were all negatives except for P365 (0,06). The direct genetic trends were all positive ones. The maternal trends were almost null for all the traits. The estimative of heritability for the adjusted weights and for the weight gains indicated that the selection could promote genetic changes. The maternal heritability for P120, P210, P365 and GP365 indicated that the selection in these traits could contribute to improve the maternal ability of the herd. The direct genetic gain observed, for all the traits were on this side of the potential gain of the Nellore beef cattle... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Resumo: Este trabalho teve como objetivo comparar os métodos disponíveis para avaliação genética dos animais para a característica dias para se alcançar um peso (DIAS) e avaliar o impacto e as respostas esperadas à seleção para ganho médio diário (GMD) e DIAS, por meio das correlações entre classificações dos animais. Foram gerados 20 arquivos de dados, referentes a populações de 1.000 animais cada, distribuídos em quatro conjuntos de variâncias com cinco replicações cada. Todos os indivíduos possuíam registros para duas características; uma simulada com distribuição normal (GMD) e sua inversa (DIAS). Para GMD e DIAS analisados com modelo linear (DIAS_M) e para DIAS com modelo Weibull em análise de sobrevivência (DIAS_S), foram incluídos os efeitos de grupo de contemporâneos e o genético direto. As herdabilidades de GMD, DIAS_M e DIAS_S foram, respectivamente, de 0,50 a 0,52, de 0,52 a 0,59, de 0,35 a 0,58, para os quatro conjuntos analisados. As maiores correlações de Pearson e de Spearman entre os valores preditos e o real envolveram GMD, em todos os conjuntos. Entre o valor genético predito para DIAS_M e o real, as maiores correlações foram obtidas nos conjuntos com menor variação, e para DIAS_S nos de maior. Quando a variação foi reduzida, a relação de GMD e DIAS_M foi maior que com DIAS_S. A análise de sobrevivência é o método mais apropriado para descrever DIAS, e os resultados tendem a se aproximar daqueles obtidos para GMD. A comparação entre os critérios demonstrou que a predição do valor genético a partir de DIAS_M é menos acurada do que de DIAS_S e GMD. / Abstract: The objective of this study was to compare the available methods for genetic evaluation of animals for the trait days to gain (DIAS) and to evaluate the impact and the expected response to selection for weight daily gain (GMD) and DIAS, using the correlations among classifications of animals. For that, 20 data files were generated, regarding populations of 1000 animals each, distributed into four groups of variances with five replications each. All individuals had records for two traits; a simulated one with normal distribution (GMD) and its inverse one (DIAS). For GMD and DIAS analyzed by linear model (DIAS_M) and for DIAS by model Weibull in survival analysis (DIAS_S), the effects included were the contemporary group and the direct genetic ones. Heritabilities of GMD, DIAS_M and DIAS_S varied, respectively, from 0.50 to 0.52, 0.52 to 0.59 and 0.35 to 0.58, for the four analyzed groups. The highest Pearson's and Spearman's correlations between the predicted and the real values involved GMD, in all groups. Between the predicted genetic value for DIAS_M and the real one, the highest correlations were obtained in the groups with smaller variation, and for DIAS_S in the groups with larger variation. When the variation was reduced, the relationship between GMD and DIAS_M was higher than with DIAS_S. Survival analysis is the most appropriate method to describe DIAS, and the results approached those obtained for GMD. Comparison among the criteria showed that the predicted genetic value from DIAS_M is less accurate than from DIAS_S and GMD. / Doutor

Orientador: Mário De Beni Arrigoni / Resumo: Objetivando estudar o efeito da somatotropina bovina recombinante (rbST) sobre o desempenho, características de carcaça e concentrações plasmáticas de IGF-I e hormônios tireoideanos, trinta e seis bezerros mestiços ½ Angus-Nelore, com idade inicial de 63 ± 17 dias e pesando 76,8 ± 14,7 kg, criados em pastagens de Brachiaria decumbens e suplementados em creep feeding, foram submetidos a dois tratamentos até a desmama (217 dias) sendo que dezoito bezerros receberam 1,4 mg/kg de rbST (Boostin®) a cada 14 dias e dezoito bezerros controle receberam solução salina. As pesagens e colheitas de sangue foram realizadas a cada 28 dias e, à desmama, foram abatidos cinco animais de cada tratamento para avaliação das características de carcaça. Os animais suplementados apresentaram maior ganho de peso médio diário e peso vivo final, maiores concentrações plasmáticas de IGF-I e T4 em relação ao controle. Os parâmetros peso de carcaça quente, rendimento de carcaça, pesos de traseiro e dianteiro, gordura peri-renal, peso de fígado, área de olho de lombo, espessura de gordura subcutânea, pesos dos músculos do quarto do traseiro e concentração plasmática de T3 não diferiram significativamente entre os tratamentos. A utilização de rbST propiciou aumento de 7,9% no ganho de peso vivo e alterou o perfil hormonal de bezerros suplementados em creep feeding durante a fase de cria, não refletindo, entretanto, em maior peso ou rendimento de carcaça. / Abstract: The objective of this study was to evaluate the recombinant bovine somatotropin (rbST) effect on performance, carcass characteristics and plasma concentrations of IGF-I and thyroid hormones. Thirty-six ½ Angus-Nellore crossbred bull calves, 63 ± 17 days old and weighting 76.8 ± 14.7 kg, raised in Brachiaria decumbens pastures and creep fed, were assigned to one of two treatments until weaning (217 days): eighteen calves received 1.4 mg/kg of rbST (Boostin®) every 14 days and eighteen control calves received saline solution. Calves were weighed and blood samples were collected every 28 days and, at weaning, five animals from each treatment were slaughtered for carcass evaluation. The rbST-treated calves had greater average daily gain and final weight and higher IGF-I and T4 plasma concentrations than the control ones. The weights of hot carcass, forequarter and hindquarter, dressing percentage, kidney and pelvic fat, rib eye area, backfat thickness, weight of the hindquarter muscles and plasma concentrations of T3 were not affected by rbST. The rbST treatment implied in greater rates of gain, 7.9%, and altered the hormonal status in pre-weaning creep-fed bull calves, but did not reflect in greater carcass weight or dressing percentage. / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-18Bitstream added on 2014-06-13T20:33:48Z : No. of bitstreams: 1 000736264.pdf: 1121541 bytes, checksum: 010c2d99d683decfb45fc13975d70d2b (MD5) / O crescente mercado de carne bovina brasileiro tem sinalizado a busca de rebanhos mais produtivos e com maiores proporções de animais precoces ao abate, de grande importância a seleção para precocidade sexual. Existem evidências que o perímetro escrotal está correlacionado, negativa e favoravelmente, com a idade ao primeiro parto de fêmeas. Portanto, a seleção para aumentar o perímetro escrotal, em longo prazo, deve levar a um aumento na precocidade sexual das fêmeas. No Brasil a pressuposição comumente assumida é a ausência de interação genótipo-ambiente (IGA) nas características de interesse econômico para a raça Nelore. Ainda são escassos os estudos de IGA para características de precocidade sexual, como o perímetro escrotal. O objetivo do presente trabalho foi quantificar a magnitude da IGA sobre o perímetro escrotal ao sobreano em machos da raça Nelore utilizando normas de reação. Foram utilizadas 31.370 medidas de machos da raça Nelore de propriedades localizadas no Sul, Centro-Oeste e Sudeste do Brasil. Os diferentes grupos ou descritores ambientais foram definidos conforme a informação de ano e estação de nascimento, fazenda de origem dos dados e grupo de manejo alimentar (nascimento, desmama e sobreano). Para a estimação dos parâmetros genéticos foi aplicado um modelo animal utilizando análises de regressão aleatória, em análises uni-característica, utilizando polinômios de Legendre como funções base. Para perímetro escrotal foram considerados a idade do animal no momento da avaliação como consequência aleatória foi considerado o efeito genético aditivo do animal. Polinômios de Legendre (de primeiro grau) regredidos sobre os grupos ambientais foram utilizados para modelar o efeito genético aditivo do animal e as (co)variâncias entre a característica estudada nos diferentes ambientes. Foram consideradas classes heterogêneas e homogêneas... / The increasing search on growing market for Brazilian Beef are related to herds more productive and availability of animals for slaughter, as consequence more significant importance for sexual precocity selection. The use of indicator's characteristics to sexual precocity in indirect selection can result in improving of reproductive efficiency of females. There is significant evidence that scrotal circumference is correlated, negatively and positively, with age at first calving females. Therefore, the selection for increasing scrotal circumference in long-term should lead to an increase of sexual precocity in females. Nowadays, several Brazilian summaries for Nellore bulls are published with amount of characteristics with focus in economically important traits, including all large data sets of animals distributed in some regions of the country. These genetics evaluations have the assumption, commonly assumed, of absence the genotype-environment interaction (GxE). Although there are few studies of GxE related to indicator's characteristics to sexual precocity, such as scrotal circumference.The objectives of this study was to verify the occurrence of genotype-environment interaction on the scrotal circumference, as well as studying genetic association between this trait in different environments, in animals of Nellore breed using the approach of reaction norms. We used information from 31,370 male Nellore property located in the south-central and southeastern Brazil. The different groups or environmental descriptors were defined according to information year and season of birth, home farm and data feed management group (birth weaning and yearling). For the estimation of genetic parameters was applied an animal model using random regression analyzes in single-trait analyzes, using Legendre polynomials as basis functions. For scrotal circumference were considered the age of the animal at the ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-04-24Bitstream added on 2014-06-13T18:29:26Z : No. of bitstreams: 1 fonseca_pds_me_jabo.pdf: 310536 bytes, checksum: 07222b519d1969e1951a3e2fbf168660 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Na pecuária de corte, características de crescimento e de carcaça são de grande importância para programas de melhoramento genético. Para acelerar o processo de seleção, os marcadores moleculares auxiliam o estudo dessas características que são influenciadas por efeitos poligênicos. Os genes ACRP30, PPARGC1 e OLR1, foram associados à características ligadas a produção em Bos taurus taurus. Esses genes estão ligados aos processos de sínteses de lipídios, síntese metabólica e acúmulo de gordura no tecido adiposo. Em nosso estudo, foram genotipados 639 animais, através da técnica de PCR-RFLP, para os genes ACRP30/BsrI, PPARGC1/NheI e OLR/PstI, onde foram detectados polimorfismos correspondentes aos sítios de restrição. Para as linhas de seleção Controle (NeC), Seleção(NeS) e Tradição(NeT) em bovinos Nelore, do Instituto de Zootecnia de Sertãozinho-IZ, foram feitas associações com características de peso ao nascer, peso no desmame, peso ao sobreano das fêmeas, altura ao sobreano da garupa das fêmeas, peso ao sobreano dos machos, altura ao sobreano da garupa dos machos, área de olho de lombo, espessura de gordura da garupa, espessura de gordura subcutânea e polimorfismos nos genes estudados, utilizado o PROC MIXED, do programa SAS/STAT 9.1.3. para análises de associações e Teste de Fisher para diferenciação entre populações do programa Genepop. A correção dos testes de hipóteses para comparações múltiplas foi feita pelo método de Bonferroni Os genótipos apresentados foram associados com as características de crescimento e carcaça, não apresentando efeitos significativos na população estudada / In beef cattle production, growth and carcass traits are of great importance for animal breeding programs. To speed up the selection process, molecular markers help to study traits that are influenced by polygenic effects. The ACRP30, PPARGC1 and OLR1 genes were validated in some studies for traits related to production in Bos taurus. This genes are linked to processes of lipids and metabolic synthesis and accumulation of fat in the adipose tissue. In this study, 639 animals were genotyped by PCR-RFLP, for genes ACRP30/BsrI, PPARGC1/NheI and OLR/PstI, where polymorphisms were detected, corresponding to the restriction sites. For selection lines Control (NeC), Selection (NeS) and Tradition (NeT) in Nellore cattle, from the Institute of Zootecnia from Sertãozinho – IZ, associations were made with polymorphisms in the studied genes and the trais birth weight, weaning weight, yearling weight, yearling rump height, ribeye area, rump fat thickness and subcutaneous fat thickness, using the PROC MIXED from SAS/STAT 9.1.3. program for association analysis, and Fisher Test for population differentiation from Genepop program. The correctness of the hypothesis tests for multiple comparisons was made using the Bonferroni. The genotypes found were associated with the with growth and carcass traits but showed no significant effects on the studied population

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-07Bitstream added on 2014-06-13T20:04:47Z : No. of bitstreams: 1 scarpati_mtv_dr_botfmvz.pdf: 746146 bytes, checksum: 6c959bd3b44426bf5c3530ee8932b8fd (MD5) / Este trabalho teve como objetivo comparar os métodos disponíveis para avaliação genética dos animais para a característica dias para se alcançar um peso (DIAS) e avaliar o impacto e as respostas esperadas à seleção para ganho médio diário (GMD) e DIAS, por meio das correlações entre classificações dos animais. Foram gerados 20 arquivos de dados, referentes a populações de 1.000 animais cada, distribuídos em quatro conjuntos de variâncias com cinco replicações cada. Todos os indivíduos possuíam registros para duas características; uma simulada com distribuição normal (GMD) e sua inversa (DIAS). Para GMD e DIAS analisados com modelo linear (DIAS_M) e para DIAS com modelo Weibull em análise de sobrevivência (DIAS_S), foram incluídos os efeitos de grupo de contemporâneos e o genético direto. As herdabilidades de GMD, DIAS_M e DIAS_S foram, respectivamente, de 0,50 a 0,52, de 0,52 a 0,59, de 0,35 a 0,58, para os quatro conjuntos analisados. As maiores correlações de Pearson e de Spearman entre os valores preditos e o real envolveram GMD, em todos os conjuntos. Entre o valor genético predito para DIAS_M e o real, as maiores correlações foram obtidas nos conjuntos com menor variação, e para DIAS_S nos de maior. Quando a variação foi reduzida, a relação de GMD e DIAS_M foi maior que com DIAS_S. A análise de sobrevivência é o método mais apropriado para descrever DIAS, e os resultados tendem a se aproximar daqueles obtidos para GMD. A comparação entre os critérios demonstrou que a predição do valor genético a partir de DIAS_M é menos acurada do que de DIAS_S e GMD. / The objective of this study was to compare the available methods for genetic evaluation of animals for the trait days to gain (DIAS) and to evaluate the impact and the expected response to selection for weight daily gain (GMD) and DIAS, using the correlations among classifications of animals. For that, 20 data files were generated, regarding populations of 1000 animals each, distributed into four groups of variances with five replications each. All individuals had records for two traits; a simulated one with normal distribution (GMD) and its inverse one (DIAS). For GMD and DIAS analyzed by linear model (DIAS_M) and for DIAS by model Weibull in survival analysis (DIAS_S), the effects included were the contemporary group and the direct genetic ones. Heritabilities of GMD, DIAS_M and DIAS_S varied, respectively, from 0.50 to 0.52, 0.52 to 0.59 and 0.35 to 0.58, for the four analyzed groups. The highest Pearson’s and Spearman’s correlations between the predicted and the real values involved GMD, in all groups. Between the predicted genetic value for DIAS_M and the real one, the highest correlations were obtained in the groups with smaller variation, and for DIAS_S in the groups with larger variation. When the variation was reduced, the relationship between GMD and DIAS_M was higher than with DIAS_S. Survival analysis is the most appropriate method to describe DIAS, and the results approached those obtained for GMD. Comparison among the criteria showed that the predicted genetic value from DIAS_M is less accurate than from DIAS_S and GMD.

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:33:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-23. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:48:24Z : No. of bitstreams: 1 000834559.pdf: 388353 bytes, checksum: 77a6b5025d1c329db5a929f31567cdf0 (MD5) / As características de crescimento são fundamentais ao melhoramento genético de bovinos de corte, pois estão diretamente relacionadas à economia do sistema. Recentes avanços tecnológicos possibilitaram a utilização de dados genômicos na avaliação de animais de produção. Objetivou-se com este estudo avaliar modelos para predição de valores genéticos a partir de dados genômicos, bem como a detecção de polimorfismos de DNA associados à características de crescimento de animais da raça Nelore. Para tanto, foram genotipadas 5.064 animais, utilizando-se SNPs de alta densidade Illumina Bovine HD assay (Illumina, SanDiego, CA, USA) e, após o controle de qualidade, foram utilizados 412.993 SNPs. No Capítulo 2, foram utilizados três modelos para estimação dos efeitos dos marcadores para as características de peso ao nascer (PN), ganhos em peso do nascimento à desmama (GND) e da desmama ao sobreano (GDS), altura ao sobreano (ALTS) e peso da vaca (PV): melhor estimador linear não viesado (GBLUP), BAYESCπ e Improved Bayesian least absolut shrinkage and selection operator (IBLASSO). Foram utilizados os valores genéticos desregredidos como pseudo-fenótipos. Os métodos Bayesianos foram os mais adequados para estimação dos efeitos dos SNPs e dos valores genômicos para as características estudadas. No Capítulo 3, aplicou-se o modelo ssGBLUP para estimar os efeitos de marcadores e associá-los às características PN, GND, GDS, ALTS e PV. Observaram-se associações com PN no BTA (Bos taurus chromosomes) 14, com GND nos BTA 5 e 29, com GDS no BTA 11 e com ALTS no BTA 8, sendo destacados os genes TMEM68 (transmembrane protein 8B) associado ao PN e ALTS, XKR4(XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 4) associado ao PN e NPR2 (natriuretic peptide receptor B) associado a ALTS / Growth traits are fundamental to the genetic improvement of beef cattle, because they are directly related to the economy of the system. Recent technological advances have enabled the use of genomic data in the assessment of animals. The objective of this study was to evaluate models to predict breeding values from genomic data, and detection of DNA polymorphisms associated with growth traits in Nellore animals. Thus, it was genotyped 5,064 animals, using high-density SNPs Illumina Bovine HD assay (Illumina, San Diego, CA, USA), and after quality control 412,993 SNPs were used. In Chapter 2, three models were used to estimate the effects of markers for birth weight (BW), weight gains from birth to weaning (WGBW) and from weaning to yearling (WGWY), yearling height (YH) and cow weight (CW): better linear estimator not biased (GBLUP), BAYESCπ and Improved Bayesian least absolut shrinkage and selection operator (IBLASSO). Breeding values were desregressed and used as pseudo-phenotypes. Bayesian methods were the most suitable for estimating the effects of SNPs and genomic values for the studied traits. In Chapter 3, we applied the ssGBLUP model to estimate the effects of markers and associate them with BW, WGBW, WGWY, YH and CW. There were associations with BW in BTA (Bos taurus chromosomes) 14, with WGBW in BTA 5 and 29, with WGWY in BTA 11 and YH in BTA 8, distinguishing the genes TMEM68 (transmembrane protein 8B) associated with BW and YH, XKR4(XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 4) associated with BW and NPR2 (natriuretic peptide receptor B) associated with the YH

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-02Bitstream added on 2014-06-13T20:17:02Z : No. of bitstreams: 1 bianchini_w_me_botfmvz.pdf: 756139 bytes, checksum: 6306940bab459ba078e3f02ec1587ea4 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da raça Nelore na produção de bovinos Superprecoces, analisando desempenho, características de carcaça, comportamento de pH e temperatura e características dos principais cortes comerciais. Setenta e dois bovinos, machos inteiros jovens das raças: Nelore (18); u Simental x Nelore (18); Simental (18) e Simbrasil (18), desmamados aos oito meses de idade e peso vivo médio de 304,27 kg,provenientes de creep feeding durante a fase de cria, foram confinados por aproximadamente 137 dias. Durante o período experimental foram realizadas pesagens a cada 28 dias, para a monitoração do ganho de peso médio diário e acompanhamento do crescimento dos tecidos via ultrasonografia. Os animais foram abatidos, sendo o critério de abate o peso final mínimo de 450 kg e EGS mínima de 3,5 mm monitoradas por ultra-som. Durante o resfriamento da carcaça foram medidos nos tempos 2, 8, 16 e 24 horas após abate os valores de pH e temperatura em três pontos distintos da carcaça. Foram analisados os parâmetros: gordura peri-renal, pesos de dianteiro e traseiro, músculos do quarto traseiro e retiradas amostras do músculo Longissimus dorsi (LD) para análises de maciez na carne in natura e na carne maturada durante sete e quatorze dias. Não existiram diferenças entre os pesos finais dos animais em confinamento (PF), no entanto os animais Simental apresentaram os maiores ganho de peso média diário (1,67kg/dia)e os menores valores foram encontrados para a raça Nelore (1,09 kg/dia) (p<0,01), O Grupo Nelore apresentou maiores valores de gordura perirenal, espessura de gordura subcutânea, e maiores forças de cisalhamento (SF) do músculo LD (p<0,01), As curvas de pH e temperatura... / The aim of this study was to evaluate the effect of the Nellore breed in the Superprecoce production System, analyzing performance, characteristics of carcass, pH and temperature fall, and characteristics of the main commercial cuts. Seventy two young bulls of Nellore (18); u Simmental x Nellore (18); Simmental (18) and Simmbrasil (18) breeds, weaned at eight months and 304 kg of live weight, proceeding from creep feeding, had been confined per approximately 137 days. During the experimental period 28 days had been carried through to evaluate weigh gain and follow the growth through ultrasound. The animals were slaughtered, being the criterion of it slaughter the minimum final weight of 450 kg and EGS of 3,5 mm monitored by ultrasound. During the cooling of the carcass pH and temperature had been measured 2, 8, 16 and 24 hours after slaughter, in three distinct points of the carcass. The parameters had been analyzed: peri-renal fat, forequarter and hindquarter weights, hindquarter muscles, and were collected samples of the Longissimus dorsi muscle (LD) for analyses of tenderness and ageing in zero, seven and fourteen days. Differences between the final weights had not existed (PF), the Simental animals had however presented better weight gain (1,67kg/day) and Nelore group reached the lowest gain (1,09 kg/day) (p<0,01). Nelore group presented more perirenal fat, subcutaneous fat, and higher values of Shear force (SF) of the muscle LD (p<0,01). The pH and temperature curves of the three genetic groups and the three muscles were similar (p<0,01). The amimais with more Simental blood proportion presented larger ribeye area, carcass, cuts, and meat more tender. With seven days of ageing the Nelore animals were reached the same rates of SF of the others genetic groups (p<0,01).

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-07-29Bitstream added on 2014-06-13T20:17:03Z : No. of bitstreams: 1 pegolo_nt_me_botfmvz.pdf: 771332 bytes, checksum: 2f77fa63a8f8feeff3478f76368698f9 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Dados de bovinos da raça Red Angus oriundos de um único criatório localizado no centro-sul norte-americano foram utilizados com o objetivo de avaliar a significância da interação genótipo-ambiente (IGA) em animais nascidos na primavera e no outono por meio da estimação da sua correlação genética. Foi utilizada a inferência bayesiana (programa MTGSAM) em análises uni-caráter e bi-caráter dos pesos ao nascer (PN), aos 205 dias (PD), aos 365 dias (PA) e ganho de peso entre 205 e 365 dias (GA), sendo estimadas as funções de densidade de probabilidade associadas às herdabilidades e correlações genéticas, tendo as últimas médias de 0,56, -0,11, 0,43 e 0,40, e modas de 0,66, -0,07, 0,39 e 0,49, respectivamente para cada caráter, mostrando uma grande significância da IGA. A metodologia mostrou-se capaz de estimar satisfatoriamente os componentes de (co)variância, mesmo em um volume limitado de dados, mostrando correlações genéticas extremamente baixas em clima heterogêneo em um mesmo local, pondo em discussão os resultados da análise uni-caráter. / Data from Red Angus cattle from a single herd located in middle-southern from USA were analyzed with the objective of evaluating the significance of genotype by environment interaction (GxEI) in calves born in Spring and Fall by estimation of its genetic correlation. The Bayesian inference (MTGSAM program) were used in an uni-character and a bi-character analysis of birth weight, 205-days weight, 365-days weight and gain between 205 and 365 days. The functions of probabilistic density of heritabilities and genetic correlations were estimated, with this last ones having averages of 0,56, -0,11, 0,43 and 0,40, and modes of 0,66, -0,07, 0,39 and 0,49, respectively for each character, showing a large significance of GxEI. The methodology was satisfactory in estimating the (co)variance components, even with a small volume of dates, showing low values of genetic correlations in a place with heterogeneous climate, generating discussion about the uni-character analysis.