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Análises discriminantes não paramétricas aplicadas ao estudo da diversidade genética baseado em dados fenotípicos quantitativos

Souza, Marcileia Santos, 92-99325-6955 04 December 2017 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-03-02T13:08:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Marcileia S. Souza.pdf: 1088069 bytes, checksum: 91eb662c19983ecff2646f7798e569ea (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-03-02T13:08:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Marcileia S. Souza.pdf: 1088069 bytes, checksum: 91eb662c19983ecff2646f7798e569ea (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-02T13:08:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Marcileia S. Souza.pdf: 1088069 bytes, checksum: 91eb662c19983ecff2646f7798e569ea (MD5) Previous issue date: 2017-12-04 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The multivariate discriminant analysis methods aim to identify the populations in which an individual should belong, admitting previously, that the individual composes one of the evaluated populations. Methods based on linear discriminant functions have been used in predictive studies of diversity in genetic improvement, when the data are quantitative phenotype. However, this type of analysis presupposes the multinormality of populations. The objective of this study was to evaluate the effectiveness of the non-parametric discriminant methodologies of the middle neighbor and k-Nearest Neighbour in the predictive study of diversity in genetic improvement, when applied to quantitative variables, in order to satisfactorily (re) classify the genotypes in their respective populations defined a priori. Two sets of data were used: i) 83 pupunha matrices, previously allocated in three primitive races, for seven variables of the fruit; ii) 122 clones of coffee trees, previously allocated among three botanical varieties, for ten agronomic characteristics. The non-parametric methods of the middle neighbor and the k-Nearest Neighbour were evaluated under various scenarios, according to possible combinations between non-parametric analysis technique x genetic distance measure x k x probability a priori of the genotypes belonging to the populations. The genotype allocation was compared in the different scenarios and the one obtained by Anderson's discriminant functions (considered standard) from the global apparent error rates (TEA) of classification of the individuals in the respective populations. The GENES software was used. The nonparametric methods were effective to classify the genotypes in their respective populations when compared with Anderson's discriminant analysis method. There were no significant differences between Euclidean distances measurements. The Gower distance provided apparent error rates different from the other studied distances. The method of discriminant analysis of the k-Nearest Neighbour proved to be adequate for populations whose genetic divergence within is smaller. The middle neighbor method, however, classifies the genotypes better in populations where there is greater inter- or intra-population diversity. / Os métodos multivariados de análises discriminantes visam identificar as populações nas quais um indivíduo deva pertencer, admitindo previamente, que o indivíduo compõe uma das populações avaliadas. Métodos baseados em funções discriminantes lineares têm sido usados nos estudos preditivos da diversidade no melhoramento genético, quando os dados são fenotípicos quantitativos. Entretanto, este tipo de análise pressupõe a multinormalidade das populações. Objetivou-se avaliar a efetividade das metodologias de análise discriminante não paramétricas do vizinho médio e dos k-vizinhos mais próximos no estudo preditivo da diversidade no melhoramento genético, quando aplicadas à variáveis quantitativas, de modo a classificar satisfatoriamente os genótipos em suas respectivas populações definidas a priori. Dois conjuntos de dados foram utilizados: i) 83 matrizes de pupunha, previamente alocadas em três raças primitivas, para sete variáveis do fruto; ii) 122 clones de cafeeiro, previamente alocados entre três variedades botânicas, para dez variáveis agronômicas. Avaliou-se os métodos não paramétricos do vizinho médio e dos k-vizinhos mais próximos sob vários cenários, conforme combinações possíveis entre técnica de análise não paramétrica x medida de distância genética x valor de k x probabilidade a priori dos genótipos pertencerem as populações. Comparou-se a alocação dos genótipos nos diferentes cenários e com aquela obtida pelas funções discriminantes de Anderson (considerada padrão) a partir das taxas de erro aparente globais (TEA) de classificação dos indivíduos nas respectivas populações. Utilizou-se o software GENES. Os métodos não paramétricos foram efetivos para classificar os genótipos em suas respectivas populações quando comparados com o método de análise discriminante de Anderson. Não houve diferenças significativas entre as medidas de distâncias Euclidianas. A distância de Gower proporcionou taxas de erro aparente diferente das demais distâncias estudadas. O método de análise discriminante dos k vizinhos mais próximos mostrou ser adequado para populações cuja divergência genética dentro é menor. Já o método do vizinho médio classifica melhor os genótipos em populações em que haja maior diversidade inter ou intrapopulacional.
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Produção de inflorescências de cultivares de brócolis em condições de clima quente e úmido da Amazônia Central

Santos, André Ricardo, 92-99231-4402 25 October 2017 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-03-02T15:12:51Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_André R. M. Santos.pdf: 2307236 bytes, checksum: 85ad86e1be6060a5e2dc274944250e0a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-03-02T15:13:03Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação_André R. M. Santos.pdf: 2307236 bytes, checksum: 85ad86e1be6060a5e2dc274944250e0a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-02T15:13:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_André R. M. Santos.pdf: 2307236 bytes, checksum: 85ad86e1be6060a5e2dc274944250e0a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-10-25 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Broccoli has economic, social and nutritional importance for generating income, employment and rich nutritional composition. Temperature is one of the main environmental factors capable of influencing the production of broccoli. Thus, with the objective of evaluating broccoli cultivars of the branch and single “head” groups with the best inflorescence production under hot and humid conditions in Central Amazonia, two experiments were carried out at Embrapa Amazônia Occidental, located at km 30 of Highway AM 010, in the period from August 2016 to January 2017. Experiment 1 evaluated the cultivars of the branch group Verão Ramoso Piracicaba, Ramoso Santana, Piracicaba, Piracicaba Precoce, Ramirez F1, Hanabi, Piracicaba Precoce Verão and Hanapon by the characteristics number of inflorescences per plant, fresh and dry mass of the flower buds, stems, leaves and total inflorescences. Experiment 2 evaluated the cultivars of the single “head” group Green Storm, Strong, TPX-00925, Salinas F1, Bibou, Domador, Burney and BRO 68 by the characteristics presence of leaves in the inflorescence, presence of anthocyanin in the inflorescence, granulometry of flower buds, premature opening of floral buds, arrangement of florets, occurrence of hollow stem in inflorescence, diameter of floral peduncle, largest diameter of inflorescence, diameter perpendicular to the largest diameter of inflorescence, fresh and dry mass of the inflorescence. The experimental design was a randomized block with eight treatments and four replicates for each experiment. The plot consisted of two lines with a total of fourteen plants spaced 1.0 m between rows and 0.5 m between plants. The useful area of the plot was formed by ten central plants and an area of 5.0 m2. As a border, two rows with evaluated broccoli cultivars were planted around the perimeter of the experimental area. The cultivars of broccoli that present the best production of inflorescences in hot and humid conditions of Central Amazonia are Verão Ramoso Piracicaba, Ramoso Santana, Piracicaba Precoce and Piracicaba Precoce Verão of the branch group and Burney of the single “head” group. / O brócolis possui importância econômica, social e nutricional por gerar renda, emprego e ter rica composição nutritiva. A temperatura é um dos principais fatores ambientais capaz de influenciar a produção de brócolis. Assim, com o objetivo de avaliar cultivares de brócolis dos grupos ramoso e “cabeça” única com melhor produção de inflorescências em condições de clima quente e úmido da Amazônia Central foram desenvolvidos dois experimentos na Embrapa Amazônia Ocidental, localizada no km 30 da Rodovia AM 010, Manaus, AM no período de agosto de 2016 a janeiro de 2017. O experimento 1 avaliou as cultivares do grupo ramoso Verão Ramoso Piracicaba, Ramoso Santana, Piracicaba, Piracicaba Precoce, Ramirez F1, Hanabi, Piracicaba Precoce Verão e Hanapon pelas características número de inflorescências por planta, massa fresca e seca dos botões florais, hastes, folhas e total das inflorescências. O experimento 2 avaliou as cultivares do grupo “cabeça” única Green Storm, Strong, TPX-00925, Salinas F1, Bibou, Domador, Burney e BRO 68 pelas características presença de folhas na inflorescência, presença de antocianina na inflorescência, granulometria dos botões florais, abertura prematura dos botões florais, arranjo dos floretes, ocorrência de talo oco na inflorescência, diâmetro do pedúnculo floral, maior diâmetro da inflorescência, diâmetro perpendicular ao maior diâmetro da inflorescência, massa fresca e seca da inflorescência. O delineamento experimental foi o de blocos casualizados com oito tratamentos e quatro repetições para cada experimento. A parcela foi composta por duas linhas com total de quatorze plantas em espaçamento de 1,0 m entre linhas e 0,5 m entre plantas. A área útil da parcela foi formada por dez plantas centrais e área de 5,0 m2. Como bordadura foram plantadas em todo o perímetro da área experimental duas fileiras com as cultivares de brócolis avaliadas. As cultivares de brócolis que apresentam melhor produção de inflorescências em condições de clima quente e úmido da Amazônia Central são Verão Ramoso Piracicaba, Ramoso Santana, Piracicaba Precoce e Piracicaba Precoce Verão do grupo ramoso e Burney do grupo “cabeça” única.
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Produção e silagem de sorgo forrageiro em função do espaçamento e do manejo de plantas daninhas

Castro, Francisco Martins de, 92-982145456 28 March 2018 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-05-11T14:29:58Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE-FRANCISCO MARTINS DE CASTRO.pdf: 2734907 bytes, checksum: 8cf39c9918a8ec2e86eabcdde7ad2b1a (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-05-11T14:30:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE-FRANCISCO MARTINS DE CASTRO.pdf: 2734907 bytes, checksum: 8cf39c9918a8ec2e86eabcdde7ad2b1a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-11T14:30:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE-FRANCISCO MARTINS DE CASTRO.pdf: 2734907 bytes, checksum: 8cf39c9918a8ec2e86eabcdde7ad2b1a (MD5) Previous issue date: 2018-03-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Forage sorghum is a crop with high forage yield per hectare, with large scale for silage production. It is cultivated in several regions of Brazil and easily adapts to different cropping systems. Thus, the objective of this research was to analyze the growth, production and chemical composition of forage sorghum silage as a function of different weed control and spacing between raw. The experimental design was randomized blocks, in subdivided plots with four replications, the treatments of the plot being the spacings (40, 50, 60, 70, 80 cm between rows) and in the subplot the weed control methods: herbicide; manual hoeing with hoe and without weeding. The silage was made in mini silos. The aerial part dry matter (DMAP), leaf area index (LAI), relative growth rate (RGR), crop growth rate (CGR) net assimilation rate (NAR). The dry matter of the weeds, dry matter of the sorghum, dry matter of the morphological components (leaf, stem and panicle) and sorghum leaf area in silage were evaluated for productivity analysis. Weed control, together with the larger spacings, provided greater accumulation of DMAP, but smaller spacings produced higher LAI, DLA, and GRC. The best productive indexes were found when weed control with herbicide allied to the spacing 50 cm between rows, providing higher dry matter yield of the sorghum in t haˉ¹ and, together with the spacing of 40 cm, the lowest yields of dry matter of weeds in t haˉ¹. Besides the better proportions of the morphological components compared to the treatment with weed that had a higher proportion of stem, less leaves and panicle. In the chemical composition, the weed control with herbicide, together with the smaller spacings (40, 50, 60 cm), were shown to be more efficient favoring silage quality, with higher levels of crude protein (CP), mineral matter (MM) and lower neutral detergent fiber (NDF). The reduction of the spacings and the chemical control of weeds provided better growth rates, higher productivity and better chemical composition of the silage for the forage sorghum, being indispensable the weed control in the environmental conditions of Central Amazonia. / O sorgo forrageiro é uma cultura com elevada capacidade de rendimentos de forragem por hectare, com larga escala para produção de silagem. É cultivado em diversas regiões do Brasil e se adapta facilmente aos diferentes sistemas de cultivo. Dessa forma, objetivou-se com essa pesquisa analisar o crescimento, produção e a composição química da silagem do sorgo forrageiro em função de diferentes métodos de controle de plantas daninhas e espaçamentos. O delineamento experimental foi em blocos casualizados, em parcelas subdivididas com quatro repetições, sendo os tratamentos da parcela os espaçamentos (40, 50, 60, 70, 80 cm entre linhas) e na subparcela os métodos de controle de plantas daninhas: herbicida; capina manual com enxada; e sem capina. A silagem foi confeccionada em mini silos. Foram estimados a matéria seca da parte aérea (MSPA), índice de área foliar (IAF), taxa de crescimento relativo (TCR), taxa de crescimento da cultura (TCC), taxa assimilatória líquida (TAL). Para análises da produtividade foram avaliadas a matéria seca das plantas daninhas, matéria seca do sorgo, matéria seca dos componentes morfológicos (folha, colmo e panícula) e a área foliar do sorgo na ensilagem. O controle das plantas daninhas, aliado aos maiores espaçamentos proporcionou maior acúmulo de MSPA, porém os menores espaçamentos produziram maiores IAF, DAF, TCC. Os melhores índices produtivos foram encontrados quando realizado o controle das plantas daninhas com herbicida aliado ao espaçamento 50 cm entre linhas, proporcionando maior produção de matéria seca do sorgo em t ha-1 e juntamente com o espaçamento de 40 cm as menores produções de matéria seca das plantas daninhas em t ha-1. Além das melhores proporções dos componentes morfológicos em comparação ao tratamento com capina que teve maior proporção de colmo, menos folhas e panícula. Na composição química o controle de plantas daninhas com herbicida aliado aos menores espaçamentos (40, 50, 60 cm) mostrou-se mais eficientes favorecendo a qualidade da silagem, com teores superiores de proteína bruta (PB), matéria mineral (MM) e inferiores da fibra em detergente neutro (FDN). A redução dos espaçamentos e o controle químico das plantas daninhas proporcionaram melhores índices de crescimento, maior produtividade e melhor composição química da silagem para o sorgo forrageiro, sendo indispensável o controle das plantas daninhas nas condições ambientais da Amazônia Central.
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Bioatividade de extratos de meliáceas e timbós no controle da mosca-branca, Bemisia tabaci (Genanadius, 1889) (Hemiptera: Aleyrodidae), em couve, Brassica oleracea L. var. acephala

Oliveira, Marcelo Victor de Souza, 92-99352-5270 30 April 2018 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-06-11T14:29:22Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Marcelo_Oliveira_Versao_Final_PPGATr_2018..pdf: 1585539 bytes, checksum: 8c2239fa89799abe20dabff4514c7413 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-06-11T14:29:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Marcelo_Oliveira_Versao_Final_PPGATr_2018..pdf: 1585539 bytes, checksum: 8c2239fa89799abe20dabff4514c7413 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-11T14:29:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Marcelo_Oliveira_Versao_Final_PPGATr_2018..pdf: 1585539 bytes, checksum: 8c2239fa89799abe20dabff4514c7413 (MD5) Previous issue date: 2018-04-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The “whitefly”, Bemisia tabaci is an insect difficult to control, with more than 500 plant species as hosts and that can cause enormous damage to various agricultural crops, in some cases, total loss of production. Among them is the leaf cabbage (Brassica oleraceae), a crop of economic importance to the State of Amazonas. As an alternative to the increasing use of chemical insecticides to control this pest, botanical insecticides appear to be promising and compatible with integrated pest management. The objective of this research was to evaluate the insecticidal potential of meliaceae (aqueous extracts, organic and andiroba oil) and fabaceae (aqueous and organic extracts of two timbó species) common in the Amazon region, “whitefly” controlling in cabbage, at semi-field conditions (laboratory: 24,02±0,20°C;55,13±0,98%UR; Greenhouse: 38,43±0,59°C; 55,08±1,62%UR). First of all, it sought to select insecticidal plants more promising (screening); the best extractor was used within each promising plant. Bioassays and chemical analysis of the promising extracts were performed. The cabbage seedlings in tubes were infested with whitefly nymphs, using a cage covered by voile tissue. After the majority of the nymphs reached the second stage, two leaves per plant were selected, with at least 50 nymphs for the extracts applications. The experimental design was completely randomized. The percentages of mortality were transformed into arcsine [{(x + 0.5) / 100}) 0.5], submitted to ANOVA and the average compared by the Tukey's test (p <0.05). The collected botanical material was dried in a forced air circulating oven (40 ° C) and ground in a lab knife mill to be mixed in water to prepare 5% (w / v) aqueous extracts. The extracts were applied during seven days to assessed mortality of them. The mortalities were chosen to select the most promising extracts. Leaf extracts of Azadiracta indica (21.82%) and Cedrela odorata (24.55%), and D. amazonica root extract (61.67%) were selected. These three species proceeded for the organic extractions in hexane, dichloromethane and methanol. Among the organic extracts, the best results of mortality were D. amazonica in hexane (72.23%), whereas A. indica results (31.42%) and C. odorata results (27.08%) in dichloromethane. Chromatographic fractionation was not able to find azadirachtin between meliaceae fractions or rotenone as main substance among organic extracts of timbó, possibly indicating the action of other metabolites in the effect of these extracts. In the tests with oil C. guiannesis, the concentration of 1.5% achieved a reduction to 88.55% in egg laying, reducing 68.34% of mortality. The aqueous and hexane extract of roots D. amazonica is considered promising in the development of a control for the “whitefly” in cabbages, while the aqueous and organic extracts of the meliaceae obtained inferiors performances. Andiroba oil is also a promising alternative to controlling that pest, making more detailed studies about the properties and scope of these bio-extracts. / A mosca-branca, B. tabaci, é um inseto de difícil controle com mais de 500 espécies de plantas como hospedeiras e que pode causar danos enormes à diversas culturas agrícolas, e em alguns casos com perda total da produção. Dentre elas se encontra a couve de folhas (Brassica oleraceae), cultura de importância econômica no Estado do Amazonas. Como alternativa ao uso crescente de inseticidas químicos para o controle desta praga, os inseticidas botânicos aparecem como promissores e compatíveis com o manejo integrado de pragas. Este trabalho teve como objetivo avaliar o potencial inseticida de meliáceas (extratos aquosos, orgânicos e óleo de andiroba) e fabáceas (extratos aquosos e orgânicos de duas espécies de timbó), encontrados na região amazônica, no controle da mosca-branca, em couve, em condições de semi-campo (Laboratório: 24,02±0,20°C;55,13±0,98%UR; Casa de vegetação: 38,43±0,59°C; 55,08±1,62%UR). Para isso, buscou-se selecionar as plantas inseticidas mais promissoras (screening); e utilizou-se o melhor extrator dentro de cada planta promissora. Foram realizados bioensaios de contato e a análise química dos extratos promissores. As mudas de couve em tubetes foram infestadas com ninfas da mosca-branca, a maioria no segundo estádio, sendo selecionadas duas folhas por planta, com pelo menos 50 ninfas para as aplicações dos extratos. O delineamento experimental adotado foi o inteiramente casualizado. Os percentuais de mortalidade foram transformados em arcsen[{(x+0,5)/100})0,5], submetidos à ANOVA e as médias comparadas pelo teste de Tukey (p<0,05). O material botânico coletado foi seco em estufa de circulação de ar forçada (40° C) e triturado em moinho de facas, para ser misturado em água para o preparo dos extratos aquosos a 5% (m/v). Após sete dias da aplicação dos extratos, foram avaliadas as mortalidades para escolha dos extratos mais promissores. Foram selecionados os extratos de folhas de Azadiracta indica (21,82%) e Cedrela odorata (24,55%), e o extrato de raízes de D. amazonica (61,67%). Essas três espécies prosseguiram para as extrações orgânicas em hexano, diclorometano e metanol. Entre os extratos orgânicos, o melhor resultado de mortalidade foi o de D. amazônica em hexano (72,23%), enquanto os de A. indica (31,42%) e C. odorata (27,08%) foram em diclorometano. O fracionamento cromatográfico não foi capaz de encontrar a azadiractina entre as frações das meliáceas e a rotenona como substância majoritária entre extratos orgânicos do timbó, indicando possivelmente a ação de outros metabólitos no efeito desses extratos. Nos testes com óleo de C. guiannesis, a concentração de 1,5% alcançou redução de 88,55% na postura de ovos, e 68,34% de mortalidade. O extrato aquoso e hexânico das raízes de D. amazônica é considerado promissor no desenvolvimento de um controle para a mosca-branca em couve, enquanto os extratos aquosos e orgânicos das meliáceas tiveram desempenhos inferiores. O óleo de andiroba também se apresenta como alternativa promissora ao controle desta praga, tornando-se necessário estudos mais detalhados sobre as propriedades e alcances desses bioextratos.
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Fungos endofíticos e extratos vegetais no controle alternativo da mancha-alvo do tomateiro

Costa, Socorro Cristina Tavares da, 92-99396-6020 30 April 2018 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-06-13T19:02:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) FUNGOS ENDOFÍTICOS E EXTRATOS VEGETAIS NO CONTROLE ALTERNATIVO DA MANCHA-ALVO.pdf: 1834924 bytes, checksum: 559ecffd91838e06bc0c870d7174f04f (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-06-13T19:03:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) FUNGOS ENDOFÍTICOS E EXTRATOS VEGETAIS NO CONTROLE ALTERNATIVO DA MANCHA-ALVO.pdf: 1834924 bytes, checksum: 559ecffd91838e06bc0c870d7174f04f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-13T19:03:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) FUNGOS ENDOFÍTICOS E EXTRATOS VEGETAIS NO CONTROLE ALTERNATIVO DA MANCHA-ALVO.pdf: 1834924 bytes, checksum: 559ecffd91838e06bc0c870d7174f04f (MD5) Previous issue date: 2018-04-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Secondary metabolites present in endophytic fungi and medicinal plants have several biological properties, including antifungal activity. In this context, 141 endophytic fungi isolated from guaraná leaves and seeds (Paullinia cupana Kunth), crude aqueous extracts of leaves of Picrolemma sprucei Hook.f (caferana), Croton cajucara Benth. (sacaca), Piper marginatum Jacq. (caapeba) and rhizome of Curcuma zedoaria (Christin.) Rosc (curcuma) prepared at the concentrations of 0 %, 10 %, 20 %, 30 %, 40 % and 50 %, and hexanic, ethyl acetate and methanolic fractions phytopathogen Corynespora cassiicola. Thirteen endophytic isolates showed inhibition between the antagonist and the pathogen, whereas the isolates 3012 R1 and 3031 R2 presented the highest inhibition value, showing their potential for future studies on the biocontrol of fungi of the genus Corynespora. In vitro bioassays (mycelial growth, sporulation, spore germination, direct bioautography and minimal inhibitory concentration) and in vivo (effect of the crude aqueous extract of P. marginatum on tomato seedlings) showed that the hexane and ethyl acetate fractions of P. marginatum reduced mycelial growth, sporulation and germination of the pathogen, and that the crude extract of P. sprucei presented the highest percentages of inhibition of these variables. In direct bioautography, zones of inhibition of mycelial growth were detected in the hexanic and acetate-ethylic fractions of P. marginatum, which presented a minimum inhibitory concentration (MIC) of 2.5 mg.mL-1. The in vivo test showed that control of the target spot in tomato was not feasible under the tested conditions of the crude extract of P. marginatum. / Metabólitos secundários presentes em fungos endofíticos e em plantas medicinais apresentam várias propriedades biológicas, incluindo a atividade antifúngica. Neste contexto, foram testados 141 fungos endofíticos isolados de folhas e sementes de guaranazeiro (Paullinia cupana Kunth), extratos brutos aquosos de folhas de Picrolemma sprucei Hook.f (caferana), Croton cajucara Benth. (sacaca), Piper marginatum Jacq. (caapeba) e rizoma de Curcuma zedoaria (Christin.) Rosc (curcuma) preparados nas concentrações de 0 %, 10 %, 20 %, 30 %, 40 % e de 50 %, e frações hexânicas, acetato-etílicas e metanólicas contra o fitopatógeno Corynespora cassiicola. Treze isolados endofíticos apresentaram inibição entre o antagonista e o patógeno, sendo que os isolados 3012 R1 e 3031 R2 apresentaram o maior valor de inibição, mostrando seus potenciais para futuros estudos no biocontrole de fungos do gênero Corynespora. Bioensaios in vitro (crescimento micelial, esporulação, germinação de esporos, bioautografia direta e concentração inibitória mínima) e in vivo (efeito do extrato bruto aquoso de P. marginatum em mudas de tomate) mostraram que as frações hexânica e acetato-etílica de P. marginatum reduziram o crescimento micelial, a esporulaççao e a germinação do patógeno, e que o extrato bruto de P. sprucei apresentou as maiores porcentagens de inibição dessas variáveis. Na bioautografia direta, foram detectadas zonas de inibição de crescimento micelial nas frações hexânica e acetato-etílica de P. marginatum, que apresentaram concentração inibitória mínima (CIM) de 2,5 mg.mL-1. O teste in vivo mostrou que o controle da mancha-alvo em tomateiro não foi viável nas condições testadas do extrato bruto de P. marginatum.
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Cobertura morta no cultivo do Feijão-caupi

Rocha, Vilson de Souza, 55-92991-1139 27 April 2018 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-06-13T19:35:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO_VILSON.pdf: 870025 bytes, checksum: 4c733bc1088948b69863827ff2253f3c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-06-13T19:35:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO_VILSON.pdf: 870025 bytes, checksum: 4c733bc1088948b69863827ff2253f3c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-13T19:35:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO_VILSON.pdf: 870025 bytes, checksum: 4c733bc1088948b69863827ff2253f3c (MD5) Previous issue date: 2018-04-27 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The mulch, constituted by vegetal residues, plays an important role in the success of several agricultural crops, serves as an insulating layer, protecting the soil from the daytime thermal amplitudes, keeping it moist and rich in organic matter. Cowpea is a source of protein, carbohydrates, vitamins and minerals. Its importance for the North, Northeast and Center-West regions is related to economic and social aspects, as it is an important food for low income populations, meeting their nutritional needs. This study was carried out in Manaus, Amazonas, under greenhouse conditions, with the objective of evaluating the effect of different dead coverages on the agronomic characteristics of cowpea cultivars. The design was completely randomized in a 4x4 factorial arrangement. The treatments applied were four cultivars of cowpea (BRS Caldeirão, BRS Tumucumaque, BRS Guariba and BRS Tracuateua) and three cover crop species (Brachiaria decumbens, Brachiaria ruziziensis and Mucuna pruriens) and another control treatment, without soil cover, totaling 16 treatments, with four replicates and two plants per experimental unit. The data were submitted to analysis of variance, and the means, compared by the Scott-Knott test, at 5% probability. The following characteristics were evaluated: number of pods per plant, pod length, number of grains per pod, weight of dry shoot mass, and yield. BRS Tumucumaque presented higher pod length. BRS Caldeirão stood out with the best results for number of pods per plant and also, together with BRS Guariba, the highest number of beans per pod. The cultivars with the highest dry weight of shoot were BRS Caldeirão, BRS Tumucumaque and BRS Guariba. The highest grain yields were recorded for BRS Caldeirão and BRS Guariba (977.32 kg ha-1, 952.73 kg ha-1), respectively. The dead cover on the soil provided better results in all traits evaluated for all cultivars when compared to the control. / A cobertura morta, constituída por resíduos vegetais, desempenha importante papel no sucesso de diversas culturas agrícolas, servindo como camada isolante, protegendo o solo das amplitudes térmicas diurnas, mantendo-o úmido e rico em matéria orgânica. O feijão-caupi é fonte de proteínas, carboidratos, vitaminas e minerais. Sua importância para as regiões Norte, Nordeste e Centro-Oeste está relacionada aos aspectos econômicos e sociais, por ser um alimento importante para as populações de baixa renda, atendendo suas necessidades nutricionais. Esse estudo foi realizado em condições de casa de vegetação, em Manaus, Estado do Amazonas, com o objetivo de avaliar o efeito de diferentes coberturas mortas nas características agronômicas de cultivares de feijão-caupi. O delineamento adotado foi inteiramente casualizado em arranjo fatorial 4x4. Os tratamentos aplicados foram quatro cultivares de feijão-caupi (BRS Caldeirão, BRS Tumucumaque, BRS Guariba e BRS Tracuateua) e três espécies de plantas de cobertura (Brachiaria decumbens, Brachiaria ruziziensis e Mucuna pruriens) e mais um tratamento controle, sem cobertura do solo, totalizando 16 tratamentos, com quatro repetições e duas plantas por unidade experimental. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância, e as médias, comparadas pelo teste de Scott-Knott, a 5% de probabilidade. Foram avaliadas as seguintes características: número de vagens por planta, comprimento de vagem, número de grãos por vagem, peso de massa seca da parte aérea, e a produtividade. BRS Tumucumaque apresentou maior comprimento de vagens. BRS Caldeirão se destacou com os melhores resultados para número de vagens por planta e, juntamente com BRS Guariba, apresentou o maior número de grãos por vagem. As cultivares com maior peso de massa seca da parte aérea foram BRS Caldeirão, BRS Tumucumaque e BRS Guariba. As maiores produtividades de grãos foram registradas para BRS Caldeirão e BRS Guariba (977,32 kg ha-1, 952,73 kg ha-1), respectivamente. As coberturas mortas sobre o solo proporcionaram melhores resultados em todas as características avaliadas para todas as cultivares, quando comparado ao controle.
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Produção de gramíneas forrageiras dos gêneros Urochloa e Megathyrsus nas condições edafoclimáticas de Manaus, Am

Souza, José Alexandre Siqueira de, 92-99209-4080 30 May 2018 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-08-02T19:49:14Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Jose_Alexandre_14_06_2018.pdf: 1789545 bytes, checksum: c4b284b35b57fa2d10339e1d9aee5454 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-08-02T19:49:33Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Jose_Alexandre_14_06_2018.pdf: 1789545 bytes, checksum: c4b284b35b57fa2d10339e1d9aee5454 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-02T19:49:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Jose_Alexandre_14_06_2018.pdf: 1789545 bytes, checksum: c4b284b35b57fa2d10339e1d9aee5454 (MD5) Previous issue date: 2018-05-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of this work was to identify perennial forage grasses, which are potentially capable of producing large amounts of dry matter at different times of the year under the edaphoclimatic conditions of Manaus, AM. The experiment was carried out in the experimental field of Embrapa Western Amazon. The treatments corresponded to the eleven cultivars, which were cut in two intervals (28 and 42 days), with three replicates, totaling 66 experimental units. The experimental units of 16 m2 (4m x 4m), with spacing between plots of 2 m, were established through sowing in April 2016, in factorial arrangement, following a completely randomized design. The samples were obtained by harvesting a plot of the plot measuring 3m x 1m with recommended cutting height according to each cultivar, using a mower-mower with 1 m wide cutting bar. The forage was heavy green in the field as well as a sub-sample of approximately 1 kg. This sub-sample was dried in a forced circulation air oven at 65 ° C until constant weight, weighing again to determine the dry mass contente. The contents were used to determine the forage mass (MF) for each sample, being considered equal to the accumulation of forage (AF). At the end of the experiment, the AFs referring to each regrowth were added to obtain the total forage accumulation (AFT) for each plot. The data were grouped in two periods: rainy season and dry season, generating the seasonal forage accumulations, rainy season (AFpc) and dry period (AFps). From these were also generated the values of seasonal distribution of dry period and the rainy season, as a proportion of the total annual distribution (AFpc / AFps), dividing AFpc and AFps by AFT. The cultivars Mombaça and Massai are the most recommended for the edaphoclimatic conditions of Manaus, AM because their yields are very high in comparison to the others. The cultivar Tupi is a good alternative for pasture formation in the climatic conditions of Manaus due to the fact that it does not present the seasonality effect and its high production. In the cut-off interval of 42 days the cultivars obtained higher forage production in the soil and climatic conditions of Manaus, AM. / The objective of this work was to identify perennial forage grasses, which are potentially capable of producing large amounts of dry matter at different times of the year under the edaphoclimatic conditions of Manaus, AM. The experiment was carried out in the experimental field of Embrapa Western Amazon. The treatments corresponded to the eleven cultivars, which were cut in two intervals (28 and 42 days), with three replicates, totaling 66 experimental units. The experimental units of 16 m2 (4m x 4m), with spacing between plots of 2 m, were established through sowing in April 2016, in factorial arrangement, following a completely randomized design. The samples were obtained by harvesting a plot of the plot measuring 3m x 1m with recommended cutting height according to each cultivar, using a mower-mower with 1 m wide cutting bar. The forage was heavy green in the field as well as a sub-sample of approximately 1 kg. This sub-sample was dried in a forced circulation air oven at 65 ° C until constant weight, weighing again to determine the dry mass contente. The contents were used to determine the forage mass (MF) for each sample, being considered equal to the accumulation of forage (AF). At the end of the experiment, the AFs referring to each regrowth were added to obtain the total forage accumulation (AFT) for each plot. The data were grouped in two periods: rainy season and dry season, generating the seasonal forage accumulations, rainy season (AFpc) and dry period (AFps). From these were also generated the values of seasonal distribution of dry period and the rainy season, as a proportion of the total annual distribution (AFpc / AFps), dividing AFpc and AFps by AFT. The cultivars Mombaça and Massai are the most recommended for the edaphoclimatic conditions of Manaus, AM because their yields are very high in comparison to the others. The cultivar Tupi is a good alternative for pasture formation in the climatic conditions of Manaus due to the fact that it does not present the seasonality effect and its high production. In the cut-off interval of 42 days the cultivars obtained higher forage production in the soil and climatic conditions of Manaus, AM. / O objetivo deste trabalho foi identificar cultivares de gramíneas forrageiras perenes, que sejam potencialmente capazes de produzir matéria seca em grande quantidade nas diferentes épocas do ano nas condições edafoclimáticas de Manaus, AM. O experimento foi realizado no campo experimental da Embrapa Amazônia Ocidental. Os tratamentos corresponderam às onze cultivares, as quais foram cortadas em dois intervalos (28 e 42 dias), com três repetições, totalizando 66 unidades experimentais. As unidades experimentais de 16 m2 (4m x 4m), com espaçamento entre as parcelas de 2 m, foram estabelecidas através de semeaduras em abril de 2016, em arranjo fatorial, seguindo um delineamento inteiramente casualizado. As amostras foram obtidas colhendo-se uma faixa da parcela medindo 3m x 1m com altura de corte recomendada de acordo com cada cultivar, empregando-se uma moto-segadora com barra de corte de 1 m de largura. A forragem foi pesada verde no campo assim como uma subamostra de aproximadamente 1 kg. Essa subamostra foi seca em estufa de circulação de ar forçado a 65 °C até peso constante, pesada novamente para determinação do teor de massa seca. Os teores foram usados na determinação da massa de forragem (MF) relativa a cada amostragem, sendo esta considerada igual ao acúmulo de forragem (AF). Ao final do experimento, os AFs referentes a cada rebrota foram somados para a obtenção do acúmulo total de forragem (AFT) referente a cada parcela. Os dados foram agrupados em dois períodos: período chuvoso e período seco, gerando os acúmulos de forragem estacionais, período chuvoso (AFpc) no período seco (AFps). A partir destes foram gerados ainda os valores de distribuição estacional de período seco e do período chuvoso, como proporção da distribuição anual total (AFpc/AFps), dividindo-se os AFpc e AFps pelo AFT. As cultivares Mombaça e Massai são as mais recomendadas para as condições edafoclimáticas de Manaus, AM pelas suas produções serem bem elevadas em comparação às demais. A cultivar Tupi é uma boa alternativa para formação de pastagem nas condições climáticas de Manaus pelo fato de quase não apresentar o efeito de estacionalidade e pela sua produção elevada. No intervalo de corte de 42 dias as cultivares obtiveram maior produção de forragem nas condições edafoclimáticas de Manaus, AM.
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Sequestro de carbono e supressão de plantas invasoras por cobertura vegetal

Monteiro, Giancarlo Francisco Pontes, 92-99240-9015 14 June 2018 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-09-12T15:21:32Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE GIANCARLO.pdf: 1594092 bytes, checksum: d2c87cf22db41bc5f6984a499402590b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-12T15:21:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE GIANCARLO.pdf: 1594092 bytes, checksum: d2c87cf22db41bc5f6984a499402590b (MD5) Previous issue date: 2018-06-14 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Soil is a dynamic compartment in its composition and it is important for the development of plants. The use of cover crops contributes to the maintenance and improvement of soil quality and nutrient cycling. The accumulated biomass of these plants promotes soil cover, suppresses the growth and development of invasive plants. Also the decomposition of these vegetal residues allows the accumulation of organic matter in the soil, in addition to the increment in the C stock of the soil. The aim of this study was to evaluate the effect of the use of different species of cover plants on the chemical properties of the soil and to evaluate the storage potential of organic carbon of these species, besides the suppression of invasive plants. The study was conducted at Fazenda Santa Rosa, located on AM 70 highway, Km 12, in Iranduba town, State of Amazonas-AM. The species of cover plants used in the treatments were: Brachiaria decumbens; Brachiaria ruziziensis; jack bean; Calopogonium and Millet. In addition to the cover crops, another treatment were the invasive plants as natural cover and non-vegetation treatment. The phytosociological survey of the invasive plants was in the area of the treatments, as well as the dry matter production of the cover plants and the invasive plants suppression. Fractions of organic matter were collected from soil samples at depths from 0-20 to 20-40 cm. In each plot, three replicates per depth were collected and the following variables were evaluated: total organic carbon (TOC), particulate organic carbon (COP), organic carbon associated with minerals (COAm), labile carbon (CL). The indexes of the neighborhood effect (RNE), carbon management index (BMI) and stratification index (SI). Ten invasive plant species distributed into 8 botanical families were identified. The plants of jack Bean of pig and Calopogônio were those that provided greater coverage of the soil and the main suppressors of the invasive plants. Also accumulated high amounts of dry matter were B. decumbens and B. ruziziensis with 12 t ha-1 and 11.5 t ha-1, respectively. There was no difference in soil carbon content among the different depths and species of cover plants. The cover plants sequestrated carbon and with superior quality of the organic matter, when compared without vegetal cover. These plants were efficient in maintaining and increasing the stocks of organic matter in the soil. / O solo é um compartimento dinâmico em sua composição e é importante para o desenvolvimento das plantas. A utilização das plantas de cobertura contribui para manutenção e melhoria na qualidade do solo e na ciclagem de nutrientes. A biomassa acumulada dessas plantas promove a cobertura do solo, suprime o crescimento e desenvolvimento de plantas invasoras Também a decomposição desses resíduos vegetais possibilita o acúmulo de matéria orgânica no solo, além do incremento no estoque de C do solo. O objetivo desse estudo foi avaliar o efeito do uso de diferentes espécies de plantas de cobertura sobre as propriedades químicas do solo e avaliar o potencial de armazenagem de carbono orgânico destas espécies, além da supressão das plantas invasoras. O estudo foi conduzido na propriedade Fazenda Santa Rosa localizada na rodovia AM 70, Km 12, no município de Iranduba no Estado do Amazonas-AM. As espécies de plantas de cobertura usadas nos tratamentos foram: Brachiaria decumbens; Brachiaria ruziziensis; Feijão-de-porco; Calopogônio e Milheto. Além das plantas de coberturas, outros tratamentos foram as plantas invasoras como cobertura natural e tratamento sem vegetação. O levantamento fitossociológico das plantas invasoras foi na área dos tratamentos, assim como também a produção de matéria seca das plantas de cobertura e a supressão das plantas invasoras. As frações da matéria orgânica foram coletadas de amostras de solo nas profundidades de 0-20 a 20-40 cm. Em cada parcela foram coletadas três repetições por profundidade e foram avaliadas as seguintes variáveis: carbono orgânico total (COT), carbono orgânico particulado (COP), carbono orgânico associado aos minerais (COAm), carbono lábil (CL). Os índices do efeito de vizinhança (RNE), Índice de manejo de carbono (IMC) e índice de estratificação (IE). Dez espécies de plantas invasoras distribuídas em 8 famílias botânicas foram identificadas. As plantas de Feijão-de-porco e Calopogônio foram as que proporcionaram maior cobertura do solo e as principais supressoras das plantas invasoras. Também acumularam altas quantidades de matéria seca foram B. decumbens e B. ruziziensis com 12 t ha-1 e 11,5 t ha-1, respectivamente. Não houve diferença nos teores de carbono no solo entre as diferentes profundidades e espécies de plantas de cobertura. As plantas de cobertura sequestraram carbono e com qualidade superior da matéria orgânica, quando comparadas sem a cobertura vegetal. Estas plantas foram eficientes em manter e elevar os estoques de matéria orgânica do solo.
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Variabilidade genética de Ralstonia solanacearum (smith) Yabucchi et al. utilizando marcadores AFLP e avaliação de respostas bioquímicas de defesa à murcha bacteriana em capsicum spp. nativo

Demosthenes, Liane Cristine Rebouças 17 December 2013 (has links)
Submitted by Izabel Monteiro (izabel_22@hotmail.com) on 2016-08-03T13:35:08Z No. of bitstreams: 1 Liane Cristine Rebouças Demosthenes - Tese.pdf: 1077147 bytes, checksum: b3915a604b50db5ab23367233a0eb874 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-15T18:05:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Liane Cristine Rebouças Demosthenes - Tese.pdf: 1077147 bytes, checksum: b3915a604b50db5ab23367233a0eb874 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-15T18:10:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Liane Cristine Rebouças Demosthenes - Tese.pdf: 1077147 bytes, checksum: b3915a604b50db5ab23367233a0eb874 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-15T18:10:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Liane Cristine Rebouças Demosthenes - Tese.pdf: 1077147 bytes, checksum: b3915a604b50db5ab23367233a0eb874 (MD5) Previous issue date: 2013-12-17 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum is one of the most important diseases of solanaceous. Present in all national territory, causes rapid wilting of plants and affects several crops of agronomic interest. In Amazonas, the high temperature and humidity combined with the genetic diversity of this pathogen diversity of hosts favor the development and aggressiveness of the pathogen and complicate the management of this disease. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity of R. solanacearum using AFLP markers and evaluate defense responses submitted by Capsicum spp. natives of the Amazon region, verifying the expression of pathogenesis-related proteins, resulting from infection by the pathogen. Samples were collected in four counties vegetable growers in the metropolitan area of Manaus to establish a collection of 30 isolates of the pathogen. We performed classical biochemical characterization of the isolates and characterization of genetic diversity using AFLP molecular markers. The 24 primer combinations were tested and selected the six best informative combinations . The six combinations of primers generated a 432 bands , ranging from 47 to 103 loci in the combination E + AT / M + C. The Jaccard similarity coefficient estimated between 30 isolates ranged from 0.01 to 0.98. From the similarity matrix a dendrogram was generated by UPGMA method being possible separate the isolates into six groups with cophenetic correlation coefficient of r = 0.98. The defense response submitted by Capsicum spp. were also evaluated by biochemical methods for the determination of total protein, phenylalanine ammonia lyase activity and peroxidase activity phenoloxidases. The enzymatic activity varied according to the level of resistance of the evaluated accessions, being higher in the first hours after inoculation and decreased after 72 hours. It was possible to identify two resistant accessions ( BC 05 and NT ) showed that grade point average of 1.17 xi and 0.94 . The BC had access resistance of accessions was associated with increased activity of PPO and FAL, indicating that these enzymes make up the defense mechanism in plants of Capsicum. The POX activity was lower when compared with the activity of PPO and FAL / A murcha bacteriana causada por Ralstonia solanacearum é uma das doenças mais importantes das solanáceas. Presente em todo o território nacional, causa murcha rápida das plantas e afeta várias culturas de interesse agronômico. No Amazonas, as condições de altas temperatura e umidade do ar aliados à ampla diversidade genética deste patógeno, diversidade de hospedeiros e agressividade favorecem o desenvolvimento do patógeno e dificultam o manejo desta doença. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de R. solanacearum utilizando marcadores AFLP e avaliar as respostas bioquímicas de defesa apresentadas por acessos de Capsicum spp. nativos da região Amazônica, verificando a expressão de proteínas relacionadas com a patogênese, decorrentes da infecção pelo patógeno. Foram realizadas coletas em quatro municípios produtores de hortaliças da área metropolitana de Manaus para estabelecer uma coleção com 30 isolados do patógeno. Foi realizada a caracterização bioquímica clássica dos isolados, testes de patogenicidade e caracterização da diversidade genética utilizando marcadores moleculares AFLP. Foram testadas 24 combinações de primers e seleciondas as seis combinações mais informativas. As seis combinações de primers utilizadas apresentaram um total de 432 bandas, variando de 47 loci à 103 na combinação E+AT/M+C. O coeficiente de similaridade de Jaccard estimado entre os 30 isolados avaliados variou de 0,01 à 0,98. A partir da matriz de similaridade foi gerado o dendrograma pelo método UPGMA sendo possível separar os isolados em seis grupos com coeficiente de correlação cofenética no valor de r = 0,98. Também foram avaliadas as resposta de defesa apresentadas por acessos de Capsicum spp. através de métodos bioquímicos de determinação de proteínas totais, atividade da fenilalanina amônia liase, atividade de fenoloxidases e peroxidases. A atividade enzimática variou conforme o nível de resistência ix dos acessos avaliados, sendo maior nas primeiras horas após a inoculação e decrescendo após 72 horas. Foi possível identificar dois acessos resistentes (BC 05 e NT) que apresentaram média de notas de 1,17 e 0,94. O acesso BC apresentou A resistência dos acessos foi associada com a maior atividade da PPO e FAL, indicando que estas enzimas compõem o mecanismo de defesa em plantas de Capsicum. A atividade da POX foi menor quando comparada com a atividade da PPO e FAL.
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Caracterização morfológica, atividade enzimática e processo inicial de colonização de Colletotrichum guaranicola patogênico e endofítico

Silva, Marcely Cristiny Andrade 10 March 2016 (has links)
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Silva.pdf: 2249758 bytes, checksum: 999de4ddf49880ac3079a439f26c357a (MD5) Previous issue date: 2016-03-10 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Paullinia cupana (guarana) is a tropical plant originated from the forest of the Brazilian Amazon. However, guarana production has been declining in the state of Amazonas, in comparison with the production of the State of Bahia. The main limiting factor of production and expansion in the state of Amazonas is anthracnose, caused by Colletotrichum guaranicola, which is considered the most serious disease of guarana culture. This study aimed to characterize the isolates of C. guaranicola pathogenic and endophytic, from guarana, considering cultural, morphological, molecular, enzymatic and histological aspects, in order to determine differences between pathogenic and endophytic. In the present work, 9 endophytic and 14 pathogenic isolated from C. guaranicola were obtained through indirect isolation of healthy leaves and guarana anthracnose symptoms. The isolates were characterized by morphological and cultural characteristics. The molecular identification involved PCR analysis using primers GACA4, GTG5 and M13. The enzyme activity, the following enzymes were tested: lipase, amylase, protease, polyphenoloxidase, cellulase and pectinase. The pathogenicity test was conducted in order to select one isolated pathogenic and one isolated endophytic for analysis of the pre-penetration process and colonization of the pathogen in the tissues of susceptible leaves (clone 300) of guarana. About the Morphocultura characterization, pathogenic and endophytic isolates presented great variability. The color of the colony and size of conidia differed between endophytes and pathogens. It was not possible to make a correlation with Morphocultural and molecular analysis with pathogenic and endophytic isolates. Genotyping confirmed that all isolates belong to the genus Colletotrichum, however, it was not possible to identify the isolated species level to the genre. There was no difference between the enzyme and endophytic pathogens, it is not possible to find correspondence with the infection process in guarana leaves. The period of 48 hours after inoculation allowed to verify 100% germination and appressorium formation in the isolated pathogenic, in addition to colonization in tissues of the plant, by contrast to the endophyte which showed lower percentages for germination and formation of appressoria, and it was not observed colonizing tissues 48 hours after inoculation. / Paullinia cupana (guaranazeiro), é uma planta tropical que se originou a partir da floresta da Amazônia brasileira. No entanto, a produção de guaraná tem vindo a diminuir no Estado do Amazonas, quando comparado com a produção do Estado da Bahia. O principal fator limitante da produção e expansão no Estado do Amazonas é a antracnose, causada por Colletotrichum guaranicola, que é considerada a doença mais grave da cultura do guaraná. Este trabalho teve como objetivo caracterizar os isolados de C. guaranicola patogênicos e endofíticos, provenientes de guaranazeiro, quanto aos aspectos culturais, morfológicos, molecular, enzimático e histológico, visando determinar diferenças entre o patogênico e o endofítico. Neste trabalho, nove isolados endofíticos e quartoze isolados patogênicos de C. guaranicola foram obtidos através do isolamento indireto de folhas de guaranazeiro sadias e com sintomas de antracnose. Os isolados foram caracterizados por meio das características morfológicas e culturais. A identificação molecular compreendeu a análise de PCR utilizando os primers GACA4, GTG5 e M13. Quanto a atividade enzimática, foram testadas as seguintes enzimas: lipase, amilase, protease, polifenol-oxidase, celulase e pectinase. Foi realizado o teste de patogenicidade com a finalidade de selecionar um isolado patogênico e um isolado endofítico para análise do processo de pré-penetração e colonização do patógeno nos tecidos das folhas suscetíveis (clone 300) de guaranazeiro. Quanto à caracterização morfocultural, os isolados patogênicos e endofíticos apresentaram alta variabilidade. A coloração da colônia e tamanho dos conídios diferenciou entre os endofíticos e os patógenos. Não foi possível fazer uma correlação com as análises morfocultural e molecular com os isolados patogênicos e endofíticos. A genotipagem permitiu confirmar que todos os isolados pertencem ao gênero Colletotrichum, entretanto, não permitiu identificar os isolados a nível de espécie para o gênero. Não houve diferença enzimática entre os endofíticos e patogênicos, não sendo possível encontrar correspondência com o processo de infecção nas folhas de guaranazeiro. O período de 48 horas após inoculação permitiu verificar 100% de germinação e formação de apressórios no isolado patogênico, além da colonização nos tecidos da planta, ao contrário do endofitico que apresentou porcentagens inferiores quanto a germinação e formação de apressórios, e não foi observado colonização dos tecidos 48 horas após inoculação.

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