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Human skin segmentation using correlation rules on dynamic color clustering / Segmentação de pele humana usando regras de correlação baseadas em agrupamento dinâmico de cores

Faria, Rodrigo Augusto Dias 31 August 2018 (has links)
Human skin is made of a stack of different layers, each of which reflects a portion of impinging light, after absorbing a certain amount of it by the pigments which lie in the layer. The main pigments responsible for skin color origins are melanin and hemoglobin. Skin segmentation plays an important role in a wide range of image processing and computer vision applications. In short, there are three major approaches for skin segmentation: rule-based, machine learning and hybrid. They differ in terms of accuracy and computational efficiency. Generally, machine learning and hybrid approaches outperform the rule-based methods but require a large and representative training dataset and, sometimes, costly classification time as well, which can be a deal breaker for real-time applications. In this work, we propose an improvement, in three distinct versions, of a novel method for rule-based skin segmentation that works in the YCbCr color space. Our motivation is based on the hypotheses that: (1) the original rule can be complemented and, (2) human skin pixels do not appear isolated, i.e. neighborhood operations are taken into consideration. The method is a combination of some correlation rules based on these hypotheses. Such rules evaluate the combinations of chrominance Cb, Cr values to identify the skin pixels depending on the shape and size of dynamically generated skin color clusters. The method is very efficient in terms of computational effort as well as robust in very complex images. / A pele humana é constituída de uma série de camadas distintas, cada uma das quais reflete uma porção de luz incidente, depois de absorver uma certa quantidade dela pelos pigmentos que se encontram na camada. Os principais pigmentos responsáveis pela origem da cor da pele são a melanina e a hemoglobina. A segmentação de pele desempenha um papel importante em uma ampla gama de aplicações em processamento de imagens e visão computacional. Em suma, existem três abordagens principais para segmentação de pele: baseadas em regras, aprendizado de máquina e híbridos. Elas diferem em termos de precisão e eficiência computacional. Geralmente, as abordagens com aprendizado de máquina e as híbridas superam os métodos baseados em regras, mas exigem um conjunto de dados de treinamento grande e representativo e, por vezes, também um tempo de classificação custoso, que pode ser um fator decisivo para aplicações em tempo real. Neste trabalho, propomos uma melhoria, em três versões distintas, de um novo método de segmentação de pele baseado em regras que funciona no espaço de cores YCbCr. Nossa motivação baseia-se nas hipóteses de que: (1) a regra original pode ser complementada e, (2) pixels de pele humana não aparecem isolados, ou seja, as operações de vizinhança são levadas em consideração. O método é uma combinação de algumas regras de correlação baseadas nessas hipóteses. Essas regras avaliam as combinações de valores de crominância Cb, Cr para identificar os pixels de pele, dependendo da forma e tamanho dos agrupamentos de cores de pele gerados dinamicamente. O método é muito eficiente em termos de esforço computacional, bem como robusto em imagens muito complexas.
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Estudo de coeficientes de correlação para medidas de proximidade em dados de expressão gênica / A study of correlation coefficients as proximity measures for gene expression data

Jaskowiak, Pablo Andretta 02 March 2011 (has links)
O desenvolvimento da tecnologia de microarray tornou possível a mediçao dos níveis de expressão de centenas ou até mesmo milhares de genes simultaneamente para diversas condições experimentais. A grande quantidade de dados disponível gerou a demanda por métodos computacionais que permitam sua análise de forma eficiente e automatizada. Em muitos dos métodos computacionais empregados durante a análise de dados de expressão gênica é necessária a escolha de uma medida de proximidade apropriada entre genes ou amostras. Dentre as medidas de proximidade disponíveis, coeficientes de correlação têm sido amplamente empregados, em virtude da sua capacidade em capturar similaridades entre tendências das sequências numéricas comparadas (genes ou amostras). O presente trabalho possui como objetivo comparar diferentes medidas de correlação para as três principais tarefas envolvidas na análise de dados de expressão gênica: agrupamento, seleção de atributos e classificação. Dessa forma, é apresentada nesta dissertação uma visão geral da análise de dados de expressão gênica e das diferentes medidas de correlação consideradas para tal comparação. São apresentados também resultados empíricos obtidos a partir da comparação dos coeficientes de correlação para agrupamento de genes, agrupamento de amostras, seleção de genes para o problema de classificação de amostras e classificação de amostras / The development of microarray technology made possible the expression level measurement of hundreds or even thousands of genes simultaneously for various experimental conditions. The huge amount of available data generated the need for computational methods that allow its analysis in an effcient and automated way. In many of the computational methods employed during gene expression data analysis the choice of a proximity measure is necessary. Among the proximity measures available, correlation coefficients have been widely employed because of their ability to capture similarity trends among the compared numeric sequences (genes or samples). The present work has as objective to compare different correlation measures for the three major tasks involved in the analysis of gene expression data: clustering, feature selection and classification. To this extent, in this dissertation an overview of gene expression data analysis and the different correlation measures considered for this comparison are presented. In the present work are also presented empirical results obtained from the comparison of correlation coefficients for gene clustering, sample clustering, gene selection for sample classification and sample classification
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Dialelo completo e associação entre caracteres de rendimento em trigo (Triticum aestivum L.) / Full diallel and association among yield traits in wheat (Triticum aestivum L.)

Pelegrin, Alan Junior de 03 August 2017 (has links)
Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-08-23T13:47:55Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação TopCD.pdf: 1350439 bytes, checksum: 0566d9ec824051dc45f1ae413a77db95 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-09-01T19:22:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação TopCD.pdf: 1350439 bytes, checksum: 0566d9ec824051dc45f1ae413a77db95 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-01T19:22:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação TopCD.pdf: 1350439 bytes, checksum: 0566d9ec824051dc45f1ae413a77db95 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-08-03 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / O objetivo deste trabalho foi avaliar a capacidade combinatória em um dialelo completo de trigo na geração F2, como critério para seleção de genitores promissores, bem como, revelar as associações de causa e efeito entre os componentes e o rendimento de grãos em função de diferentes manejos de nitrogênio. Foram realizados dois experimentos no campo experimental da Universidade Federal de Santa Maria Campus Frederico Westphalen. No primeiro experimento foram utilizados cinco genótipos de trigo (Tbio Mestre, Mirante, Quartzo, Pampeano e Fundacep Horizonte), submetidos a cruzamentos artificiais no ano de 2013, conforme modelo dialélico completo. Em 2015, as 20 populações F2’s e os cinco genitores foram conduzidos em blocos aumentados de Federer, e os genitores dispostos em quatro repetições. Os caracteres avaliados foram: massa de grãos por planta, altura de inserção da espiga, estatura de planta, número de afilhos férteis, espaçamento entre espigueta na espiga, número de espiguetas e comprimento da espiga. Foram realizadas as análises de capacidade geral e específica de combinação, efeito recíproco materno e não-materno. O segundo experimento foi conduzido em blocos ao acaso, sob esquema de parcelas subdivididas, com três genótipos (Fundacep 52, TBIO Mestre e TBIO Itaipu), duas fontes nitrogenadas (Ureia e Nitrato de amônia) e quatro manejos de nitrogênio (I: ausência de nitrogênio, II: 100% no afilhamento, III: 50% no afilhamento e 50% no emborrachamento e VI: 33,3% no afilhamento, 33,3% no emborrachamento e 33,3% no florescimento). Os caracteres avaliados foram: massa de mil grãos, número de grãos por espiga, massa de grãos na espiga principal, rendimento de grãos, estatura de planta, número de afilhos férteis e comprimento da espiga. Foram realizadas a análise de variância conjunta e posteriormente a correlação linear de Pearson e análise de trilha individual para cada manejo de nitrogênio. O genitor Cep Horizonte apresenta elevada capacidade de combinação para massa de grãos por planta. Quartzo e Mirante maximizaram o número de espiguetas por espiga e comprimento de espiga, respectivamente, e Tbio Mestre mostrou-se promissor para redução da altura de inserção da espiga, estatura de planta e espaçamento entre espiguetas na espiga. Para os cruzamentos realizados existem combinações híbridas favoráveis para pelo menos, uma das características avaliadas com base da capacidade específica de combinação. O efeito recíproco demostra-se presente nos caracteres avaliados. O manejo nitrogenado altera as relações de causa e efeito entre os componentes de rendimento de grãos nos genótipos estudados. A adoção do manejo sem nitrogênio aplicado em cobertura (manejo I), indica a relação de causa e efeito entre o número de afilhos férteis e o rendimento de grãos do trigo. A adoção de qualquer um dos outros manejos de nitrogênio, revela que a massa de grãos da espiga principal e o número de afilhos férteis possui relação de causa e efeito com o rendimento de grãos do trigo. / The aim of this work was to evaluate the combining ability of a wheat F2 generation through a full diallel, as a criterion for selecting promising genitors, as well as to reveal the associations of cause and effect between components and grain yield as function of different nitrogen management. Two experiments were carried out in the experimental field of the Federal University of Santa Maria, Campus Frederico Westphalen. Five wheat genotypes (Tbio Mestre, Mirante, Quartzo, Pampeano e Fundacep Horizonte) were used in the first experiment, which were subjected to artificial crosses in the year of 2013, according to the full diallel model. In 2015, the twenty F2 populations and the five genitors were conducted in Federer´s augmented blocks, with genitors arranged in four repetitions. The evaluated traits were: mass of grains per plant, spike insertion height, plant height, number of fertile tillers, spikelets spacing in the spike, number of spikelets and spike length. There were performed the analyses of general and specific combining ability, maternal and non-maternal reciprocal effects. The second experiment was conducted in randomized blocks, under subdivided plots, with three genotypes (Fundacep 52, TBIO Mestre and TBIO Itaipu), two nitrogen sources (urea and ammonium nitrate) and four nitrogen managements (I: absence of nitrogen, II: 100% at tilling stage, III: 50% at tilling stage, and 50% at booting stage, VI: 33.3% at tilling, 33.3% at booting and 33.3% at flowering. The evaluated traits were: mass of a thousand grains, number of grains per spike, mass of grains in the main spike, grain yield, plant height, number of fertile tillers and spike length. It was performed the analysis of joint variance followed by Pearson´s linear correlation and individual path analysis for each nitrogen management. The genitor Cep Horizonte presents high combining ability for mass of grains per plant. Quartzo and Mirante maximized the number of spikelets per spike and spike length, respectively, and Tbio Mestre presented itself promising for reduction of spike insertion height, plant height and spikelet spacing in the spike. Regarding the crosses performed, there are favorable hybrid combinations for at least one of the evaluated traits based on the specific combining ability. The reciprocal effect is present in the evaluated traits. Nitrogen management alters the relation of cause and effect among grain yield and its components. The adoption of no nitrogen on topdressing (management I) indicates the cause and effect relationship between number of fertile tillers and grain yield of wheat. The adoption of any other nitrogen managements reveals that mass of grains in the main spike and number of fertile tillers present cause and effect relationship with grain yield.
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Correlação experimental de ângulo sólido para correlação angular gama-gama / Solid angle experimental correction for gamma-gamma angular correlation

Vera Lucia Cervini Procida Veissid 26 June 1990 (has links)
Foi efetuado o mapeamento da eficiência intrínseca no fotopico de dois detetores Ge(Li) do tipo falso coaxial, com fótons colimados de uma fonte de 152Eu de 1 mCi, em f unção da direção de incidência. Este mapeamento permitiu efetuar experimentalmente a correção de ângulo sólido para experimentos de correlação angular gama-gama. Esta correção não possui hipóteses como: detetor perfeitamente cilíndrico, ou com seu eixo coincidente com aquele do invólucro. A aplicação da informação de eficiência para a correção de dados de correlação angular implicou em um novo método de análise, onde é ajustada a eles uma expressão do tipo: W(?)= ?.[1+ ?_(kpar>0)??Akk .?_(m= -k)^k?C_km .e^(-1m?)]? onde os Ckm são coeficientes complexos. A qualidade do método foi verificada com a análise de correlações angulares presentes nos decaimentos dos isótopos 60Co e 100Rh com misturas multipolares conhecidas. Os resultados obtidos foram satisfatórios, demonstrando a qualidade dos métodos de mapeamento e de análise da função de correlação angular. / The scanning of the intrinsic photopeak efficiency for two Ge(Li) detectors, of false coaxial type (wrap around) was performed with collimated photons from a 152Eu source with 1 mCi, as a function of the direction of incidence. This scanning allowed to obtain experimentally the solid angle correction, to be used in gamma-gamma angular correlation experiments. This correction have no hypotheses like: detector perfectly cylindrical, or with its axis coincident with the end cup axis. The efficiency information applied for the correction of angular correlation data involved a new analysis method, where it is fitted to the data an expression Iike this W(?)= ?.[1+ ?_(kpar>0)??Akk .?_(m= -k)^k?C_km .e^(-1m?)]? the Ckm are complex coefficients. The quality of the method was checked with data analysis of angular correlation functions present in the 60Co and 100Rh decays, with known multipole mixtures. The results were satisfactory, demonstrating the quality of both methods, detector mapping and analysis of correlation functions.
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Simulações de variáveis aleatórias dependentes: Aplicação ao risco subscrição / SIMULATION OF RANDOM VARIABLES DEPENDENT: APPLICATION UNDERWRITING RISK

Josivon Souza dos Santos 25 April 2008 (has links)
Com a crescente demanda de modelagem de riscos dependentes, enfatizamos neste trabalho a teoria de cópulas e algumas medidas de dependência tais como coeficiente de correlação linear, coeficiente de correlação de Spearman. Mostramos algumas interpretações errôneas sobre o coeficiente de correlação linear e como podemos realizar simulações de variáveis aleatórias com determinadas marginais e dependência. Realizamos uma aplicação na área de seguros para determinar o capital alocado da seguradora. / With the growing demand for modeling dependent risk, in this study we emphasize the theory of copulas and some measures of dependence such as linear correlation coefficient and Spearman correlation coefficient. We show some misleading interpretations on the linear correlation coefficient, and how we can perform simulations of random variables with some marginals and dependence. We conduct an application in the insurance area to determine the allocated capital of the insurer.
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Comparative evaluation of network reconstruction methods in high dimensional settings / Comparação de métodos de reconstrução de redes em alta dimensão

Henrique Bolfarine 17 April 2017 (has links)
In the past years, several network reconstruction methods modeled as Gaussian Graphical Model in high dimensional settings where proposed. In this work we will analyze three different methods, the Graphical Lasso (GLasso), Graphical Ridge (GGMridge) and a novel method called LPC, or Local Partial Correlation. The evaluation will be performed in high dimensional data generated from different simulated random graph structures (Erdos-Renyi, Barabasi-Albert, Watts-Strogatz ), using Receiver Operating Characteristic or ROC curve. We will also apply the methods in the reconstruction of genetic co-expression network for the differentially expressed genes in cervical cancer tumors. / Vários métodos tem sido propostos para a reconstrução de redes em alta dimensão, que e tratada como um Modelo Gráfico Gaussiano. Neste trabalho vamos analisar três métodos diferentes, o método Graphical Lasso (GLasso), Graphical Ridge (GGMridge) e um novo método chamado LPC, ou Correlação Parcial Local. A avaliação será realizada em dados de alta dimensão, gerados a partir de grafos aleatórios (Erdos-Renyi, Barabasi-Albert, Watts-Strogatz ), usando Receptor de Operação Característica, ou curva ROC. Aplicaremos também os metidos apresentados, na reconstrução da rede de co-expressão gênica para tumores de câncer cervical.
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Modelagem da evapotranspiração de referência e da evapotranspiração de limeira ácida com aplicação de técnicas de regressão e redes neurais artificiais / Modelling evapotranspiration for reference crop and acid lime orchard based on regression and artificial neural network tecniques

Andrea Inés Irigoyen 05 July 2010 (has links)
O objetivo principal deste trabalho foi testar redes neurais artificiais (RNAs) do tipo multilayer perceptron (MLP) na estimativa da evapotranspiração de referência e da evapotranspiração na linha de plantio de limeira ácida. As RNAs foram treinadas sob algoritmo de gradiente conjugado de erros, com funções de ativação sigmóide na camada intermediária e linear na camada de saída. Foram conduzidas análises comparativas com modelos de regressão. Valores diários de evapotranspiração de referência foram calculados usando o modelo Penman-Monteith (EToPM) a partir de dados meteorológicos (1997-2006) observados em Piracicaba, estado de São Paulo, Brasil (latitude: 22º 42 30 S; longitude: 47º 38 30 W; altitude: 546 m). Os modelos foram desenvolvidos a partir de dados de radiação solar global (Rg), saldo de radiação (Rn) ou radiação no topo da atmosfera (RTA) em combinação com temperatura do ar (Tar), déficit de pressão de vapor no ar (DPV) e velocidade do vento (u). Bom desempenho foi obtido quando os dados de Rg ou Rn estavam disponíveis, mesmo com a falta de uma ou mais das outras variáveis exigidas pelo modelo Penman- Monteith. As RNAs mostraram melhor desempenho do que os modelos de regressão, especialmente quando RTA foi considerada na entrada. O erro absoluto médio (MAE) das RNAs variou de 0,1 a 0,2 mm d-1, representando de 4 a 6 % dos valores médios de EToPM. A evapotranspiração na linha de plantio, condutância difusiva e transpiração foliar foram obtidas em pomar adulto de limeira ácida (Citrus latifolia Tan.), com espaçamento 7 m × 4 m , orientação Leste-Oeste das linhas de plantio e sem limitação hídrica, em Piracicaba, Brasil. A condutância à difusão de vapor (gs) e transpiração foliar (T) foram determinadas com porômetro de equilíbrio constante e balanço nulo, em folhas completamente expandidas, na parte média da copa nas faces expostas da linha de plantio, a intervalos horários ao longo de 42 dias. A densidade de fluxo de fótons fotossintéticos (DFFF) incidentes sobre a folha, temperatura e déficit de pressão de vapor no ar (Tar e DPV) no interior do pomar e o horário de observação (h) foram combinados nos modelos de estimativa de gs e T. Somente os modelos ajustados para o inverno apresentaram bom desempenho. Medidas lisimétricas foram utilizadas na determinação da evapotranspiração diurna na linha de plantio (ETli 9-17h). Saldo de radiação (Rn), temperatura do ar (Tar), déficit de pressão de vapor (DPV), evapotranspiração de referência estimada pelo modelo Penman-Monteith (EToPM) e dia do ano foram combinados na estimativa de ETli 9-17h. O desempenho das RNAs foi superior ao dos modelos com base em regressão. O erro médio absoluto (MAE) nos modelos RNAs variou entre 3,6 e 10,6 L planta-1, representando de 6 a 18% dos valores médios de ETli 9-17h. Os modelos incluindo o efeito temporal apresentaram melhor desempenho. A estimativa da evapotranspiração de referência na escala diária e da evapotranspiração diurna na linha de plantio pelos modelos propostos mostrou-se adequada. Ficou evidente a existência de outros efeitos temporais operando concomitantemente com o ambiente atmosférico na determinação de gs e ETli 9-17h. / The main objective of this study was to test artificial neural networks (ANNs) of multilayer perceptron type (MLP) for estimating reference evapotranspiration, diffusive leaf conductance and crop evapotranspiration of a mature and irrigated citrus orchard. The ANNs were trained under conjugate gradient algorithm. The sigmoid and linear activation functions were used for the hidden and output nodes, respectively. Comparative analyses with regression models were carried out. Daily values of reference evapotranspiration were computed using the Penman-Monteith method (EToPM) from climatic data (1997-2006) at Piracicaba, Brazil. All models were developed considering global radiation (Rg), net radiation (Rn) or extraterrestrial radiation (Ra) in combination with air temperature (Tar), air vapor pressure deficit (VPD) and wind velocity (u) as input data. Good performance was obtained for any model when net radiation or solar radiation were available, even missing one or more of other variables required by the Penman-Monteith equation. The performance of ANNs were improved when compared to those obtained with regression model basis, especially when Ra was considered as input data. Mean absolute error (MAE) from ANNs varied from 0.1 to 0.2 mm d-1, representing between 4 and 6 % of the mean EToPM values. Crop evapotranspiration, leaf diffusive conductance and leaf transpiration data were obtained from an acid lime (Citrus latifolia Tan.) mature orchard, located at the same region. The orchard, with East-West planting rows and 7 m × 4 m spacing, was drip irrigated to maintain non-limiting water conditions. Leaf diffusive conductance to water vapor (gs) and transpiration (T) were measured on fully expanded leaves, in the middle height of the canopy, at Northen and Southern exposed faces, in hourly intervals along 42 selected days, using a steady-state null-balance porometer. Variability of gs and T values were described as function of the exposition faces of the planting rows, time of day and season. Significant differences between exposition faces for gs and T values were only observed in the spring. The relationship between gs or T values and leaf environmental conditions varied according to the season. Photosynthetic photon flux density (PPFD) incident on the leaf, air temperature (Tar) and vapor pressure deficit (VPD) and time of day (h) were used as inputs. Adequate performance was only observed for winter models. Lysimetric data were used to determine diurnal evapotranspiration from orchard row (ETli 9-17h). Net radiation (Rn), air temperature and deficit pressure vapor (Tar, DPV) and Penman-Monteith reference evapotranspiration (EToPM) data were combined in the regression analyses and developing process of ANNs. Also any other temporal effect was taken into account by including day of the year (DOY). Mean absolute error (MAE) for ANNs models varied from 3.6 to 10.6 L plant-1, representing between 6 and 18% of mean ETli 9-17h values. Errors decreased when DOY was included. According to the results, it can be concluded that it is possible to estimate daily EToPM and diurnal citrus orchard evapotranspiration (ETli 9-17h) accurately by the proposed models. Relevance of other temporal effects operating on gs and ETli 9-17h determination, in addition to environmental variations, was evident.
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Medidas de correlação angular gama-gama no 100 ANTPOT. Ru / Measurements of gamma-gamma angular correlation in 100Ru

Garabed Kenchian 08 June 1990 (has links)
Um espectrômetro automático de correlação angular Ge(Li)-Ge(Li) foi desenvolvido. O espectrômetro é movido automaticamente, controlado um microcomputador. A correlação angular direcional gama-gama entre transições coincidentes dos níveis do ANTPOT100 RU, alimentados pelo decaimento ß+ e por captura de elétrons do ANTPOT 100 R foi medida. A fonte de ANTPOT 100 Ru foi produzida na reação ANTPOT 100 Ru (p, n) Rh POT. 100 utilizando o feixe de prótons do Acelerador cíclotron. Foram medidas 30 cascatas simples e 11 cascatas triplas produzindo como resultado a assinalação do spin e paridade dos estados de 1865 kev, 1881 kev, 2099 kev, 2167 kev, 2241 kev, 2517 kev, e 3070 kev e a determinação dos valores de mistura multipolar de 21 transições sendo que 12 delas pela primeira vez. Foi medido ainda o valor da razão de mistura multipolar Q POT. 2 (E0\\E2) da transição 2+ IND. 2 2+ IND. 2 / Knowledge of the spectral distribution of radiation emitted by radiodiagnostic units provides important information, which can be applied to the Quality Assurance and Radiological Protection programs. Detectors which utilize Silicon PIN Photodiodes have been increasingly used in recent years, due to their low cost and being worked with at room temperature, the liquid nitrogen containers used with Ge and Si(Li) detectors not being necessary. Although, initially, the PIN photodiodes have a poorer energy resolution, as compared with Ge detectors, it\'s good enough for most purposes. Moreover, the development of thermoelectrically cooled systems and low noise level pre-amplifiers have resulted in PIN photodiodes achieving comparable resolutions to Ge ones. This work seeks to establish the properties of detectors made with Silicon PIN photodiodes and to develop the correctional process of the raw specffa both for the efficiency of the detector and other relevant factors, with the aim of obtaining the true spectrum emitted by radiodiagnostic equipment. The radiation spectra of radiodiagnostic equipment experimentally obtained were compared with theoretical spectra calculated from a semi-empirical model. Furthermore, mammography x-ray spectra scattered by a breast simulator were obtained. As a direct application of these experimentally measured spectra, methodologies were developed to determine the peak kilovoltage (kvp) of X-Ray tubes, to be able to calibrate kVp meters, and the half-value layer (HW) of the beams of interest.
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Estudo da Influência de Aditivos (Decanol e Anestésico Local Tetracaína) em Sistemas Micelares / Study of the Influence of Additives (Decanol and Local Anesthetic Tetracaine) in micellar systems

Cilâine Verônica Teixeira 06 April 1999 (has links)
Neste trabalho estudamos a influência que os aditivos decanol e o anestésico local tetracaína (TTC) exercem sobre a estrutura de sistemas micelares. Foram estudadas particularmente a influência do decanol na estrutra das micelas do surfactante aniônico dodecil sulfato de sódio (SLS) e da TTC na estrutura micelar do SLS e do surfactante zwiteriônico N-hexadecil-N, N-dimetil-3-amônio-1-propanosulfonato (HPS). O estudo de soluções micelares concentradas (razão molar água:SLS, Mw= 45,2) do sistema binário SLS/água e do sistema ternário SLS/decanol/água por difração de raios X nas vizinhanças das transições de fase isotrópica (I) SETA hexagonal (Halfa) líqüido-cristalina indicam que existe um empacotamento das micelas em uma ordem hexagonal local na fase I do sistema binário, e a fase Halfa tem empacotamento típico de objetos finitos/rígidos. No sistema ternário, em contraste, o empacotamento é relaxado através de um crescimento micelar induzido pelo decanol e a fase Halfa, que ocorre a uma concentração molar decanol:SLS, Md = 0,20, tem um comportamento típico de objetos infinitos/flexíveis. Uma seqüência intrigante de fases HalfaSETA nemática cilíndrica (Nc) a Md= 0,25 foi também investigada e é atribuída a um efeito combinado de crescimento micelar e mudança na rigidez da micela, com aumento da quantidade de decanol. O subseqüente aumento em Md leva o sistema à transição de fase Nc SETA nemática discótica (Nd) (Md= 0,38), acompanhada de uma mudança de forma micelar cilindro SETA disco. A influência do decanol em soluções isotrópicas mais diluídas (Mw= 144,0) foi estudada por espalhamento de raios X a baixos ângulos (SAXS) e analisada através das funções distribuição de distâncias p(r) e da distribuição de densidades eletrônicas rô(r). Os resultados mostram que micelas esferoidais crescem por influência do decanol e mudam de forma esferoide SETA cilindro a Md= 0,20 e cilindro SETA disco a Md APROXIMADAMENTE IGUAL A 0,40. Portanto, tornou-se evidente que a evolução de forma micelar do SLS pela influência do decanol é governada pela energia de curvatura da interface polar/apolar, uma vez que o decanol prefere localizar-se em interfaces planas, e que as transições de fase líqüido-cristalinas dependem dessas mudanças, associadas a efeitos de ordem estrutural em soluções concentradas. A influência da TTC em micelas aquosas de SLS e HPS foi estudada pelas técnicas espectroscópicas de fluorescência e ressonância paramagnética eletrônica (RPE) e por SAXS. Os resultados de fluorescência indicam que a droga é incorporada nas micelas, sendo que a TTC protonada se localiza mais próxima à interface polar/a polar das micelas, enquanto que a desprotonada penetra mais o interior hidrofóbico. Os resultados de RPE concordam com estas observações e indicam um aumento na organização molecular das micelas de SLS com a incorporação do anestésico local. Este aumento é mais pronunciado para micelas compostas por SLS e TTC carregada. Por outro lado, não foi observada nenhuma alteração significativa na organização molecular de micelas de HPS por influência da TTC. Através dos resultados de SAXS não foi observada nenhuma alteração na dimensão e na forma micelar por adição gradual de TTC neutra em SLS ou carregada em HPS, até a razão molar TTC:SLS, \'M IND. TTC\'= 0,30. Já os resultados de SAXS para os sistemas compostos por SLS e TTC protonada evidenciam um crescimento de micelas elipsoidais prolatas com anisometria v APROXIMADAMENTE IGUAL A 1,5 a \'M IND. TTC\'= 0 para v APROXIMADAMENTE IGUAL A 1,8 a \'M IND. TTC\'= 0,20 e 0,30. Os resultados são discutidos em termos de alteração das forças envolvidas na formação micelar (eletrostáticas e hidrofóbicas) e da própria estrutura molecular da TTC. / The influence of the aditives decanol and the local anaesthetic tetracaine on the micellar structure of the anionic surfactant sodium dodecyl sulfate (SLS) and zwiterionic N-hexadecyl-N, N-dymethyl-3-ammonio-1-propane-sulfonate (HPS) has been studied. The study of concentrated micellar solutions (water:SLS molar ratio, Mw= 45.2) of the binary system SLS/water and ternary SLS/water/decanol through X-ray diffraction dose to the liquid-crystalline isotropic (I) \'SETA\' hexagonal (Halfa) phase transition indicates a local micellar hexagonal packing in the I phase in the binary system, whereas the Halfa phase exhibits a packing typic of finite/rigid objects. On the other hand, the ternary system presents a more relaxed packing through a micellar growth induced by decanol, and the Halfa phase, which occurs at the decanol:SLS molar ratio, Md= 0.20 has got a typical infinite/flexible objects behaviour. An intriguing Halfa \'SETA\' cilindric nematic (Nc) phase sequence was also investigated at Md= 0.25 and has been atributed to the combined effect of the micellar growth and change of rigidity with the increasing in decanol amount. A further increase in Md leads to the Nc \'SETA\' discotic nematic (Nd) transition (Md= 0.38), which is accompanied by the cylinder \'SETA\' disc change of form. The infiuence of decanol in more diluted solutions of SLS/water (Mw= 144.0) has been studied through small-angle X-ray scattering (SAXS) and analysed through the distance distribution function p(r) and electronic density distribution rô(r). The results show that the spheroidal micelles grow due to the influence of decanol, changing from spheroid to cylinder form at Md= 0.20 and from cylinder to disc at Md= 0.40. Therefore, it became evident that the evolution of the SLS micellar shape under the effect of decanol is dominated by the bending curvature energy from the polar/apolar interface, since the decanol prefers the flat interfaces, and the liquid-crystalline phase transitions depend on these changes of shape, associated to structural order effects in concentrated solutions. The influence of TTC on SLS and HPS micelles were studied through fluorescence and electronic paramagnetic resonance espectroscopic techniques as well as by SAXS. The fluorescence results indicate that the drug incorporates into the micelles in such a way that the protonated TTC is localized close to the polar/apolar interface, whereas the uncharged form penetrates deeper into the hydrophobic core, in SLS micelles. The EPR results agree with the above observation besides indicating an increase in the SLS micellar molecular organization as the local anaesthetic is incorporated. Such an increase is more pronounced for micelles composed of SLS and charged TTC. On the other hand, no meaningful alteration in the HPS micelles molecular organization was observed under the TTC influence. From the SAXS results, we have not detected any changes in the micellar dimension and shape by gradual addition of either neutral TTC in SLS or charged TTC in HPS up to the TTC:SLS molar ratio (\'M IND. TTC\') of 0.30. Conversely, the SAXS results for systems composed of SLS and charged TTC have shown a micellar growth of prolate ellipsoidal micelles from anisometry v APROXIMADAMENTE IGUAL A 1.5 at \'M IND. TTC\'= O to v APROXIMADAMENTE IGUAL A 1.8 at \'M IND. TTC\'= 0.20 and 0.30. The results are discussed in the view of alterations in the forces involved in the micellar auto-assembling (electrostatic and hydrophobic) and the TTC structure.
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Variabilidade genética e endogamia em um plantel comercial de codornas (Coturnix japonica) / Genetic variability and inbreeding on a quail (Coturnix japonica) commercial flock

Resende, Lucileide Vilela 15 March 2013 (has links)
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We used seven cages containing six females and two males each, which resulted in a progeny of 672 individuals. The genotypes of the individuals were obtained in an automated DNA sequencer. Genotypes were used for genetic diversity, inbreeding, and genetic link analyzes of two generations, and to perform analyzes of variance components, descriptive statistics, Pearson correlations, heritability, t-test, and Utest of Mann-Whitney. In the parental generation we found high probability of combined paternity exclusion (PE = 0.999956), low probability of combined identity (PI = 1.47 x 10-13), and that null alleles frequency was near zero. The values of expected (He) and observed (Ho) heterozygosity, and polymorphism information content (PIC) were equal to 0.768, 0.766 and 0.734, respectively, indicating a high genetic diversity. When we assessed only the progenies, the genetic diversity was maintained (He = 0.760, Ho = 0.757 and PIC = 0.725). The inbreeding coefficient (f) was low and not significant. The genetic link analysis was efficient to assign paternity and maternity for 97% of the progeny. The weight of the offspring at birth and the variables analyzed in eggs are highly correlated. There is also a significant correlation between most measures analyzed. Estimates of heritability values were considered moderate to high. The average number of offspring was 15.93 per female, and 44.6 for males. Females were, on average, heavier than males. The QF was only correlated with the CC in females. We found significant difference between the weight of heavier males when compared to lighter males, but the comparison between QF and weight category was not significant. These results indicated that the 12 microsatellite markers used in the study were robust for the genetic relationships and genetic variability analysis in this species. We also found that the egg’s variables and progeny’s weight were highly correlated, and heritability estimates ranged from moderate to high in the variables analyzed. Females were heavier than males, QF was correlated only with CC in females, and there was no significant difference between heavier males and lighter males. All these information may be useful in future breeding programs for Coturnix japonica. / O objetivo deste estudo foi utilizar marcadores microssatélites para estimar diversidade genética e endogamia, realizar análises de vínculo genético, estimar a herdabilidade para as variáveis morfométricas: peso (PO), comprimento (CO) e largura do ovo (LO), peso (P), comprimento do corpo (CC), comprimento do bico (CB), altura do bico (AB), largura do bico (LB), comprimento da asa (CA), comprimento do tarso (CT) e comprimento do dedo (CD) e verificar a associação genética para estas variáveis nas progênies e verificar quais características: P, CC, CB, AB, LB, CA, CT e CD estão relacionadas com quantidade de filhos (QF) nos adultos em famílias oriundas de um plantel comercial de codornas. Para o desenvolvimento do trabalho foi instalado um experimento com sete gaiolas contendo seis fêmeas e dois machos, resultando em uma progênie de 672 indivíduos. O genótipo dos indivíduos foi obtido em sequenciador automático de DNA. Os genótipos foram utilizados para realização das análises de diversidade genética, endogamia e vínculo genético nas duas gerações e para realizar análises de componentes de variância, estatísticas descritivas, correlações de Pearson, herdabilidade, teste t e teste U de Mann-Whitney. Considerando a geração parental foi encontrada alta probabilidade de exclusão de paternidade combinada (PE = 0,999956), baixa probabilidade de identidade combinada (PI = 1,47x10-13) e frequência de alelos nulos próximas a zero. Os valores de heterozigosidade esperada (He) e observada (Ho) e conteúdo de informação polimórfica (PIC) foram iguais a 0,768, 0,766 e 0,734 respectivamente, indicando uma elevada diversidade genética. A diversidade genética foi mantida quando se avaliou apenas as progênies (He = 0,760, Ho = 0,757 e PIC = 0,725). O coeficiente de endogamia (f) foi baixo e não significativo. A análise de vínculo genético foi eficiente para atribuir a paternidade e maternidade para 97% das progênies. O peso das progênies ao nascimento e as variáveis analisadas nos ovos estão altamente correlacionadas e também existe correlação significativa entre a maioria das medidas. As estimativas de herdabilidade encontradas são consideradas de moderada a alta. A média de filhotes por fêmea foi 15,93 e de machos 44,6, com fêmeas, em média, mais pesadas que os machos. A QF só foi correlacionada com o CC das fêmeas. Houve diferença significativa entre o peso dos machos mais pesados em relação aos mais leves, mas a comparação da QF por categoria de peso não foi significativa. Esses resultados permitem concluir que este painel de 12 marcadores microssatélites é robusto para a realização de análises de vínculo genético e para estudos de variabilidade genética nesta espécie, com as variáveis analisadas nos ovos e peso das progênies altamente correlacionadas, estimativas de herdabilidades moderadas a altas para as variáveis analisadas. As fêmeas são mais pesadas que os machos, QF só está correlacionada com o CC das fêmeas, não apresentando diferença significativa entre o peso dos machos mais pesados em relação aos mais leves. Essas informações podem ser úteis em futuros programas de melhoramento genético para Coturnix japonica.

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