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Étude des traits d'histoire de vie de "Melampsora larici-populina", agent de la rouille du peuplier : de leur déterminisme génétique à leurs conséquences évolutives / Study of life history traits of the poplar rust fungus Melampsora larici-populina : from their genetic determinism to their evolutionary consequencesPernaci, Michaël 25 June 2015 (has links)
L’adaptation d’un champignon pathogène à son milieu, ainsi que l’évolution et la structuration des populations qui en découlent, sont fortement influencés par ses traits d’histoire de vie qui conditionnent sa fitness. C’est ce que nous avons illustré chez Melampsora larici-populina, l’agent de la rouille du peuplier. Ainsi, nous avons mis en évidence que le volume des spores du champignon évolue de manière répétable au cours des épidémies annuelles dans la vallée de la Durance, et ce sous l’effet de la sélection naturelle, signe que ce trait intervient directement dans le processus adaptatif du champignon. Par conséquent, les contraintes génétiques conditionnant le potentiel adaptatif du champignon en lien avec les traits d’histoire de vie ont été étudiées en laboratoire, au sein d’une descendance S1 issue de l’autofécondation d’une souche de référence. Les résultats obtenus suggèrent que M. larici-populina présente un potentiel adaptatif élevé. Enfin, une carte génétique à haute résolution du champignon, comprenant 18 chromosomes, a été construite afin d’étudier le déterminisme génétique de ces traits d'histoire de vie. Un locus de virulence ainsi que des QTL intervenant dans l’expression de la taille des lésions ont pu être détectés et positionnés avec précision sur cette carte. Ce travail a mis en évidence le rôle des traits quantitatifs dans l’adaptation et la structuration des populations de M. larici-populina en réponse aux pressions de sélection du milieu, en lui conférant un potentiel adaptatif élevée, essence de l’adaptation des organismes. Il ouvre également de nombreuses perspectives de recherche visant à identifier les bases génétiques de l’adaptation de ce champignon pathogène à son hôte, éléments indispensables à l’élaboration de stratégies de lutte durables / Adaptation of a phytopathogenic fungus to its environment, as well as the resulting evolution and structuration of its populations, are strongly influenced by its life history traits which condition its fitness. This is illustrated here with the poplar rust fungus Melampsora larici-populina. Hence, we showed that spore volume repeatedly evolved through natural selection, during annual epidemics in the Durance River valley, showing the implication of this trait in the fungus adaptive processes. Consequently, genetic constraints conditioning the adaptive potential of the fungus, in connection with life history traits, were studied in laboratory, over a progeny resulting from a selfing of a reference strain. Results suggest that M. larici-populina has a high adaptive potential. Finally, a high resolution genetic map of the fungus, comprising 18 chromosomes, has been built in order to study genetic determinism of these traits. One locus of virulence and three QTL involved in the expression of the lesion size were detected and accurately mapped on this map. This work emphasizes the role of quantitative traits in adaptation and structuration of M. larici-populina populations in response to the environmental selective pressures, by conferring an adaptive potential, the basis of organisms’ adaptation. It also opens many opportunities to identify the genetic bases of adaptation of this fungus, these elements being essential for the development of sustainable strategies of disease control
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Gestion de mémoire pour la détection de fermeture de boucle pour la cartographie temps réel par un robot mobileLabbé, Mathieu January 2010 (has links)
Pour permettre à un robot autonome de faire des tâches complexes, il est important qu'il puisse cartographier son environnement pour s'y localiser. À long terme, pour corriger sa carte globale, il est nécessaire qu'il détecte les endroits déjà visités. C'est une des caractéristiques les plus importantes en localisation et cartographie simultanée (SLAM), mais aussi sa principale limitation. La charge de calcul augmente en fonction de la taille de l'environnement, et alors les algorithmes n'arrivent plus à s'exécuter en temps réel. Pour résoudre cette problématique, l'objectif est de développer un nouvel algorithme de détection en temps réel d'endroits déjà visités, et qui fonctionne peu importe la taille de l'environnement. La détection de fermetures de boucle, c'est-à-dire la reconnaissance des endroits déjà visités, est réalisée par un algorithme probabiliste robuste d'évaluation de la similitude entre les images acquises par une caméra à intervalles réguliers. Pour gérer efficacement la charge de calcul de cet algorithme, la mémoire du robot est divisée en mémoires à long terme (base de données), à court terme et de travail (mémoires vives). La mémoire de travail garde les images les plus caractéristiques de l'environnement afin de respecter la contrainte d'exécution temps réel. Lorsque la contrainte de temps réel est atteinte, les images des endroits vus les moins souvent depuis longtemps sont transférées de la mémoire de travail à la mémoire à long terme. Ces images transférées peuvent être récupérées de la mémoire à long terme à la mémoire de travail lorsqu'une image voisine dans la mémoire de travail reçoit une haute probabilité que le robot soit déjà passé par cet endroit, augmentant ainsi la capacité de détecter des endroits déjà visités avec les prochaines images acquises. Le système a été testé avec des données préalablement prises sur le campus de l'Université de Sherbrooke afin d'évaluer sa performance sur de longues distances, ainsi qu'avec quatre autres ensembles de données standards afin d'évaluer sa capacité d'adaptation avec différents environnements. Les résultats suggèrent que l'algorithme atteint les objectifs fixés et permet d'obtenir des performances supérieures que les approches existantes. Ce nouvel algorithme de détection de fermeture de boucle peut être utilisé directement comme une technique de SLAM topologique ou en parallèle avec une technique de SLAM existante afin de détecter les endroits déjà visités par un robot autonome. Lors d'une détection de boucle, la carte globale peut alors être corrigée en utilisant la nouvelle contrainte créée entre le nouveau et l'ancien endroit semblable.
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Approche standardisée pour la caractérisation et la cartographie du milieu fluvial cas appliqué au bassin versant de la rivière au SaumonRouleau, Madelaine January 2009 (has links)
Plusieurs disciplines traitent du milieu fluvial à travers différents types d'ouvrages, en utilisant différents concepts et définitions. Par conséquent, la caractérisation et la cartographie du milieu sont très variables. Ainsi, on remarque qu'il y a un réel besoin de convergence sur trois plans: dans les définitions des différents éléments du milieu étudié, dans les méthodes de caractérisation et dans les outils cartographiques. Le but de l'étude consiste donc à développer une approche standardisée et multidisciplinaire pour la caractérisation et la cartographie du milieu fluvial. Quatre objectifs spécifiques guident la méthodologie du travail. Tout d'abord, dans une optique multidisciplinaire, on doit définir le milieu fluvial et ses composantes, puis les niveaux de perception à travers lesquels on cartographiera le milieu. Ensuite, on propose un format synthétique de grilles d'analyse du milieu en fonction des échelles choisies pour l'observation et la cartographie. Par la suite, on crée un système de référence propre au milieu fluvial pour la caractérisation et la cartographie. Finalement, on présente une légende cartographique, appuyée par un essai cartographique appliquée à un bassin versant. On en arrive à proposer des définitions communes à la géomorphologie, à la potamologie, à l'écologie et à la législation québécoise, sans pour autant en perdre le sens précis. On présente également un système de référence à quatre niveaux de perception: le lit mineur, la zone inondable, la vallée et le bassin versant. A travers ces niveaux de perception, le milieu fluvial est étudié par cinq composantes: l'eau, le lit, les matériaux, la biologie et les agents dynamiques. Pour chacun de ces niveaux on suggère une échelle cartographique appropriée que l'on accompagne d'une légende. Ainsi, pour la cartographie du lit mineur, on propose et on applique l'échelle du 1 : 5 000, pour la zone inondable, celle du 1 : 20 000, pour la vallée, celle du 1 : 50 000, puis pour le bassin versant, celle du 1 : 250 000. L'application de l'approche à un bassin versant soulève quelques questions: (1) peut-être que d'autres échelles cartographiques et d'autres outils d'observation pourraient être valides; un examen d'alternatives est proposé; (2) lorsqu'on rencontre un cas de transition dans les milieux aquatiques, il faudrait aussi prévoir un cadre standard dans la définition, la caractérisation et la cartographie du milieu. Si l'étude présente permet la facilitation des travaux multidisciplinaire par la proposition d'un cadre structuré et la maximisation des outils d'observation et de cartographie des milieux, la dernière question soulevée par l'étude laisse la porte ouverte à une suite du travail pour les milieux aquatiques en transition.
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Localisation et cartographie simultanées de l'environnement à bord de véhicules autonomes : analyse de solutions fondées sur le filtrage de KalmanChanier, François 12 March 2010 (has links) (PDF)
Pour être autonome, un robot mobile doit être capable de décrire l'environnement dans lequel il évolue. Pour ce faire, le robot doit pouvoir se localiser et construire une carte de l'environnement si celle-ci n'existe pas. Grâce à ces informations, il pourra par exemple éviter les obstacles et donc naviguer en toute sécurité. Cette capacité correspond à une étape obligatoire sur la route de son autonomie totale. Le sujet traité dans ce manuscrit répond à cette problématique. Il concerne la localisation d'un véhicule et la cartographie d'un environnement en simultané, SLAM pour simultaneous localization and mapping. Après un etat de l'art des approches proposées durant la dernière décennie, deux points importants ont été constatés lors de l'emploi d'un filtre EKF-SLAM : les estimations obtenues avec ce filtre ne sont pas consistantes et cette approche, telle qu'elle a été introduite, ne répond pas aux critères d'observabilité d'un système. Pour chacun de ces problèmes, une solution est proposée et critiquée à l'aide de résultats de simulation et d'expérimentation
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Déséquilibre de liaison et cartographie de QTL en population sélectionnéeYtournel, Florence 28 January 2008 (has links) (PDF)
Par définition le déséquilibre de liaison (Linkage Disequilibrium, LD) décrit les associations préférentielles entre allèles de deux locus. Ce concept est devenu un outil indispensable pour la cartographie fine de locus quantitatifs (QTL), par l'identification de déséquilibres d'associations entre allèles à un locus marqueur (ou à un ensemble de locus marqueurs) et à un locus impliqué dans la variation d'un caractère quantitatif. La création et l'intensité du LD sont dépendantes des forces évolutives qui ont construit la population. Parmi ces forces, la dérive génétique et la sélection sont particulièrement actives dans les populations d'animaux de rente. Cette thèse a pour but d'étudier l'influence de la sélection sur la structure du déséquilibre de liaison autour d'un locus quantitatif, ainsi que son impact sur la précision de cartographie fine des QTL. Un logiciel de simulation de populations a été développé dans le cadre de la thèse. A partir d'une population en équilibre de liaison, il permet de générer du LD dans des générations dites historiques, grâce à différentes forces évolutives. La détection de QTL est appliquée aux générations suivantes, de généalogie connue. Pour ces dernières générations, les principaux dispositifs de détection de QTL de génétique animale sont décrits dans le simulateur. Les données exploitées dans cette thèse sont issues de ce logiciel. Le LD a été mesuré par le D' et le
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Images de synthèse pour l'Aménagement du territoire : la déformation de l'espace par les réseaux de transport rapideL'Hostis, Alain 07 January 1997 (has links) (PDF)
La thèse présente une nouvelle méthode cartographique pour représenter l'espace-temps tel qu'il est déformé par la présence simultanée sur un territoire de modes de transport caractérisés par des vitesses différents.
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L'évaluation des besoins de conservation d'un patrimoine naturel littoral marin. L'exemple des estrans meubles de l'archipel de Chausey.Godet, Laurent 13 March 2008 (has links) (PDF)
L'idée d'une nécessité de conservation de la nature littorale marine a émergé suite à la prise de conscience de sa vulnérabilité. Face au contexte actuel d'érosion de la biodiversité, ce sont les éléments riches, rares ou vulné-rables qui ont prioritairement bénéficié de mesures conservatoires. Mais ne s'agit-il pas d'une lutte contre la partie émergée de l'iceberg de la crise de la biodiversité ? Les habitats littoraux ordinaires, ne méritent t-ils pas, eux aussi, d'être conservés ? Pour répondre à cette question, les besoins de conservation des habitats intertidaux meubles de l'archipel de Chausey (Golfe Normand-Breton) ont été explorés. La mise en lumière de 180 années de témoignages naturalistes, formidable état de référence du patrimoine naturel du site et de sa perception, et le développement et l'application d'une nouvelle méthode permettant de cartographier, suivre et décrire précisé-ment chaque habitat, révèlent le caractère extraordinairement complexe et fragmenté de cet archipel qui rassem-ble presque tous les habitats intertidaux meubles de l'Europe du nord-ouest. Parmi ceux-ci, très peu bénéficient de mesures conservatoires. Pourtant, à travers l'exemple des banquettes à Lanice conchilega, nous soulignons l'importance des besoins de conservation d'un habitat ordinaire, a priori non vulnérable et presque impossible à conserver à large échelle tant il est répandu. A Chausey, cet habitat représente en effet un enjeu de conservation important, tant d'un point de vue socio-économique que biologique et il est en outre menacé par le développe-ment de la conchyliculture qui a des impacts négatifs sur son peuplement macrofaunique et son attractivité pour les limicoles. Les besoins conservatoires de chacun des habitats ont ensuite été évalués au travers d'enjeux (ce qui est susceptible d'être affecté si l'habitat disparaît), d'aléas (probabilité de disparition) et de possibilités de conservation, par une approche pluridisciplinaire alliant des méthodes issues de l'écologie, de la géographie mais aussi de l'histoire. La combinaison de ces critères fait apparaître une multiplicité de besoins de conservation généralisable à de nombreux habitats des littoraux tempérés.
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Apport des données radar polarimétriques pour la cartographie en milieu tropicalLardeux, Cédric 09 December 2008 (has links) (PDF)
Les capteurs RSO (Radar à Synthèse d'Ouverture) fournissent des observations des surfaces terrestres de manière continue depuis 1991 avec la mise en orbite du satellite ERS-1. Les données acquises jusqu'à peu, principalement basées sur l'exploitation de l'intensité du signal acquis selon une configuration de polarisation particulière, ont été l'objet de nombreuses études, notamment sur le suivi de la déforestation. Depuis 2007, de nouveaux capteurs RSO polarimétriques (PALSAR, RADARSAT-2, TerraSAR-X...) permettent la caractérisation polarimétrique des surfaces observées. Ces données nécessitent des traitements adpatés afin d'en extraire l'information la plus pertinente pour la thématique considérée. L'objet de ces travaux a été d'évaluer leur potentiel pour la cartographie de surfaces naturelles en milieu tropical. L'apport des multiples indices polarimétriques a été évalué à partir de l'algorithme de classification SVM (Machines à Vecteurs de Support). Cet algorithme est spécialement adapté pour prendre en compte un grand nombre d'indices non forcément homogènes. Les données utilisées ont été acquises par le capteur aéroporté AIRSAR sur une île en Polynésie Française. De nombreux relevés in situ ont permis la validation des résultats obtenus. Les résultats montrent que la sensibilité de ces données à la structure géométrique des surfaces observées permet une bonne discrimination entre les différents couvert végétaux étudiés, en particulier des types de forêts. De plus, la classification obtenue à partir de la méthode SVM est particulièrement plus performante que la classification usuelle basée sur la distribution de Wishart vérifiée a priori par les données radar. Ces résultats laissent présager de l'apport significatif des données radar polarimétriques futures pour le suivi des surfaces naturelles
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Le transport des sédiments, les structures sédimentaires et la stabilité dans les cours d'eau de morphologie en step-poolLamarre, Hélène January 2006 (has links)
Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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Diversité et confrontation intergénérationnelle dans la construction du sens : comprendre la Perception et le management de la reconnaissance au sein les laboratoires de recherche / Variety and confrontation intergenerationnelle in the construction of the sense : understand the Perception and the management of the gratitude within research laboratoriesDuboeuf, Patrick 08 February 2011 (has links)
À la lumière des évolutions actuelles du dispositif de traitement des pensions de retraite, afin de faire face au vieillissement des salariés, l’action des seniors au sein des organisations devient un enjeu de management majeur. Cette recherche vise la compréhension des spécificités de la relation âge-activité professionnelle dans le cadre de la nécessaire réintégration/conservation des quinquas avec une perspective d’efficacité organisationnelle, vidée de toute orientation d’instrumentalisation des cohortes seniors. La prise en compte du bien vivre professionnel des acteurs, avec des objectifs de résultats organisationnels, peut être un cadre de réflexion en sciences de gestion. Les représentations positives sont une clé d’une meilleure performance collective de groupes d’acteurs hétérogènes en âge. Cette hétérogénéité est le cadre de jeux de comparaison limitant l'engagement des seniors. La compréhension des mécanismes de reconnaissance des acteurs, en tant que valeur et action managériale, est posée comme un point focal, source de connaissances. Plusprécisément, cette démarche tente de répondre à la question : comment le management de la reconnaissance adaptée aux seniors leur permettra de « jouer un rôle » au sein des organisations par leur action contributive à la performance collective ? Afin d’apporter des éléments de réponse, nous analysons les schèmes constitutifs des représentations derépondant âgé de plus de 50 ans selon le modèle cognitiviste proposé par Cossette (2004). À partir de la mise à jour des schèmes individuels liant entités reconnaissantes, sièges de reconnaissance et engagement, nous avons élaboré et analysé quinze cartes cognitives de chercheurs et ingénieurs de recherche, en vue de tirer des éléments de compréhension et explication, au moyen du logiciel Decision Explorer. Les résultats mettent d’abord en évidence les types de reconnaissance perçus ou attendus en termes de moyens et objectifs. Deux unités de temps d’analyse sont ensuite proposées. Elles permettent de distinguer et rapprocher les reconnaissances d’utilité et appartenance dans le cadre d’interactions liées à la situation, de la reconnaissance de singularité liée aux dispositions personnelles en échos avec les spécificités liées à l’âge. Le croisement, entre cadre des unités de temps, entités et sièges de reconnaissance, constitueune boussole pour les actes de management de reconnaissance possibles orientés seniors. / In the light of the current evolutions of the device of treatment of retirement pensions, to face the ageing of the employees, the action of seniors within organizations becomes a stake in major management. This search aims at the understanding of the specificities of the relation age-activity professional within the framework of the necessary reinstatement / conservation of quinquas with a prospect of organizational efficiency, emptied of any orientation of instrumentalisation of the troops seniors. The consideration of the property to live professional actors, with objectives of organizational results, can be a frame of reflection in sciences of management.The positive representations are a key of a better collective performance of groups of heterogeneous actors in age. This heterogeneousness is the frame of sets of comparison limiting thecommitment of seniors. The understanding of the mechanisms of gratitude of the actors, as value and manager action, is put as a focal point, a source of knowledge. More exactly, this approach tries to answer the question: how the management of the gratitude adapted to seniors will allow them " to play a role " within organizations by their contributory action the collective performance? To bring elements of answer, we analyze the constituent schemas of the representations of referee of more than 50 years old according to the model cognitiviste proposed by Cossette (2004). From the update of the individual schemas linkin grateful entities, seats of gratitude and commitment, we elaborated and analyzed fifteen cognitive maps of researchers and engineers of search, to pull elements of understanding and explanation, by means of thesoftware Decision investigate.The results bring to light at first the types of gratitude received or waited in terms of means and objective. Two units of time of analysis are then proposed. They allow to distinguish and to move closer to the gratitudes of utility and membership within the framework of interactions connected to the situation, of the gratitude of connected to the personal capacities in echos with the age-related specificities. The crossing, between frame of the units of time, the entities and the seats of gratitude, constitutes)a compass for the possible acts of management of gratitude directed seniors.
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