O sobrepastejo é a principal causa de degradação das pastagens naturais, resultando na diminuição do potencial produtivo e consequente capacidade de suporte desses campos, além da substituição da vegetação natural por espécies de menor valor forrageiro. A exclusão temporária do pastejo é uma ferramenta que pode contribuir para a recuperação ambiental e da capacidade produtiva das pastagens degradadas. Esta ferramenta, além de proporcionar o crescimento da biomassa aérea das plantas, permitindo que espécies de alto valor forrageiro se reproduzam, pode influenciar características importantes na biomassa subterrânea que envolve sequestro de carbono e melhoria nas características do solo. Neste trabalho buscamos compreender as relações entre o sistema radicular das pastagens naturais e a biomassa aérea, com a hipótese de que o diferimento, além de promover a recuperação de áreas degradadas pelo sobrepastejo via acúmulo de pasto e aumento da cobertura do solo, aumenta também a biomassa de estruturas subterrâneas. Foram aplicados três tratamentos de diferimentos: diferimento de primavera (DP), diferimento de outono (DO) e não diferido (ND) em duas áreas com histórico de intensidade de pastejo contrastantes 4% (4 kg de MS para cada 100 kg PV) e 8-12% (8 kg de MS para cada 100 kg de PV na primavera e 12 kg de MS para cada 100 kg de PV no restante do ano) avaliados por dois anos consecutivos. A biomassa de raízes (Braíz) foi maior no primeiro ano de avaliações no 4% e no 8-12% nos períodos pós DP e no 4% nas avaliações pós DO. A biomassa de rizomas (Briz) foi maior nos diferimentos (DP e DO) quando comparados isoladamente com o não diferido (ND) no 4%, no segundo ano pós DP para o 8-12% e foi maior para o DP no efeito cumulativo dos dois anos. A (Bsubt) também foi maior no primeiro ano de avaliação somente no 4%. A relação da biomassa aérea/subterrânea (R:A/S) foi maior nos diferimento de primavera (DP) e outono (DO) no ambiente com OF 4% nas comparações com o não diferido (ND) nos dois anos de avaliações e o DP apresentou uma melhor resposta cumulativa. O diferimento aplicado em período favorável ao crescimento vegetal proporciona aumento da biomassa aérea e, em ambientes com longo histórico de sobrepastejo, pode aumentar a biomassa de rizomas contribuindo para a maior cobertura vegetal de espécies que apresentam esse tipo de estrutura subterrânea. / The overgrazing is the main cause of degradation of rangelands, resulting in decreased production potential and consequently carrying capacity of these fields in addition to the replacement of natural vegetation by species of lower feed value. The temporary grazing exclusion is a tool that can contribute to environmental recovery and the productive capacity of degraded pastures. This tool, in addition to providing the growth of the biomass plant, allowing species of high forage value to breed, can influence important features in the underground biomass involving carbon sequestration and improved soil characteristics. This study aims to understand the relationship between the root system of natural pastures and biomass, with the hypothesis that the deferral, and promote the recovery of degraded areas by overgrazing pasture via accumulation and increased soil cover, also increases biomass underground structures. Deferrals three treatments were applied: spring deferral (DP), autumn deferral (DO) and not deferred (ND) in two areas with contrasting grazing intensity of historical 4% (4 kg DM per 100 kg BW) and 8-12% (8 kg DM per 100 kg of body weight in the spring and 12 kg DM per 100 kg of body weight in the rest of the year) evaluated for two consecutive years. The root biomass (Braíz) was higher in the first year of evaluations at 4%, and 8-12% in post DP periods and 4% in after THE assessments. The biomass of rhizomes (Briz) was higher in deferrals (DP and DO) compared alone with no deferred (ND) at 4% and was higher in the DP in the cumulative effect of two years. The (Bsubt) was also higher in the first year of assessment only 4%. The ratio of aboveground / underground biomass (R: A/S) was higher in spring deferral (DP) and autumn (DO) in the environment with OF 4% in comparison with the non-deferred (ND) in the two years of reviews and the DP showed better cumulative response. The deferral applied in good times to plant growth provides increased biomass and, in environments with long history of overgrazing, can increase the biomass of rhizomes contributing to higher vegetation species that exhibit this type of underground structure.

O sobrepastejo é a principal causa de degradação das pastagens naturais, resultando na diminuição do potencial produtivo e consequente capacidade de suporte desses campos, além da substituição da vegetação natural por espécies de menor valor forrageiro. A exclusão temporária do pastejo é uma ferramenta que pode contribuir para a recuperação ambiental e da capacidade produtiva das pastagens degradadas. Esta ferramenta, além de proporcionar o crescimento da biomassa aérea das plantas, permitindo que espécies de alto valor forrageiro se reproduzam, pode influenciar características importantes na biomassa subterrânea que envolve sequestro de carbono e melhoria nas características do solo. Neste trabalho buscamos compreender as relações entre o sistema radicular das pastagens naturais e a biomassa aérea, com a hipótese de que o diferimento, além de promover a recuperação de áreas degradadas pelo sobrepastejo via acúmulo de pasto e aumento da cobertura do solo, aumenta também a biomassa de estruturas subterrâneas. Foram aplicados três tratamentos de diferimentos: diferimento de primavera (DP), diferimento de outono (DO) e não diferido (ND) em duas áreas com histórico de intensidade de pastejo contrastantes 4% (4 kg de MS para cada 100 kg PV) e 8-12% (8 kg de MS para cada 100 kg de PV na primavera e 12 kg de MS para cada 100 kg de PV no restante do ano) avaliados por dois anos consecutivos. A biomassa de raízes (Braíz) foi maior no primeiro ano de avaliações no 4% e no 8-12% nos períodos pós DP e no 4% nas avaliações pós DO. A biomassa de rizomas (Briz) foi maior nos diferimentos (DP e DO) quando comparados isoladamente com o não diferido (ND) no 4%, no segundo ano pós DP para o 8-12% e foi maior para o DP no efeito cumulativo dos dois anos. A (Bsubt) também foi maior no primeiro ano de avaliação somente no 4%. A relação da biomassa aérea/subterrânea (R:A/S) foi maior nos diferimento de primavera (DP) e outono (DO) no ambiente com OF 4% nas comparações com o não diferido (ND) nos dois anos de avaliações e o DP apresentou uma melhor resposta cumulativa. O diferimento aplicado em período favorável ao crescimento vegetal proporciona aumento da biomassa aérea e, em ambientes com longo histórico de sobrepastejo, pode aumentar a biomassa de rizomas contribuindo para a maior cobertura vegetal de espécies que apresentam esse tipo de estrutura subterrânea. / The overgrazing is the main cause of degradation of rangelands, resulting in decreased production potential and consequently carrying capacity of these fields in addition to the replacement of natural vegetation by species of lower feed value. The temporary grazing exclusion is a tool that can contribute to environmental recovery and the productive capacity of degraded pastures. This tool, in addition to providing the growth of the biomass plant, allowing species of high forage value to breed, can influence important features in the underground biomass involving carbon sequestration and improved soil characteristics. This study aims to understand the relationship between the root system of natural pastures and biomass, with the hypothesis that the deferral, and promote the recovery of degraded areas by overgrazing pasture via accumulation and increased soil cover, also increases biomass underground structures. Deferrals three treatments were applied: spring deferral (DP), autumn deferral (DO) and not deferred (ND) in two areas with contrasting grazing intensity of historical 4% (4 kg DM per 100 kg BW) and 8-12% (8 kg DM per 100 kg of body weight in the spring and 12 kg DM per 100 kg of body weight in the rest of the year) evaluated for two consecutive years. The root biomass (Braíz) was higher in the first year of evaluations at 4%, and 8-12% in post DP periods and 4% in after THE assessments. The biomass of rhizomes (Briz) was higher in deferrals (DP and DO) compared alone with no deferred (ND) at 4% and was higher in the DP in the cumulative effect of two years. The (Bsubt) was also higher in the first year of assessment only 4%. The ratio of aboveground / underground biomass (R: A/S) was higher in spring deferral (DP) and autumn (DO) in the environment with OF 4% in comparison with the non-deferred (ND) in the two years of reviews and the DP showed better cumulative response. The deferral applied in good times to plant growth provides increased biomass and, in environments with long history of overgrazing, can increase the biomass of rhizomes contributing to higher vegetation species that exhibit this type of underground structure.

O sobrepastejo é a principal causa de degradação das pastagens naturais, resultando na diminuição do potencial produtivo e consequente capacidade de suporte desses campos, além da substituição da vegetação natural por espécies de menor valor forrageiro. A exclusão temporária do pastejo é uma ferramenta que pode contribuir para a recuperação ambiental e da capacidade produtiva das pastagens degradadas. Esta ferramenta, além de proporcionar o crescimento da biomassa aérea das plantas, permitindo que espécies de alto valor forrageiro se reproduzam, pode influenciar características importantes na biomassa subterrânea que envolve sequestro de carbono e melhoria nas características do solo. Neste trabalho buscamos compreender as relações entre o sistema radicular das pastagens naturais e a biomassa aérea, com a hipótese de que o diferimento, além de promover a recuperação de áreas degradadas pelo sobrepastejo via acúmulo de pasto e aumento da cobertura do solo, aumenta também a biomassa de estruturas subterrâneas. Foram aplicados três tratamentos de diferimentos: diferimento de primavera (DP), diferimento de outono (DO) e não diferido (ND) em duas áreas com histórico de intensidade de pastejo contrastantes 4% (4 kg de MS para cada 100 kg PV) e 8-12% (8 kg de MS para cada 100 kg de PV na primavera e 12 kg de MS para cada 100 kg de PV no restante do ano) avaliados por dois anos consecutivos. A biomassa de raízes (Braíz) foi maior no primeiro ano de avaliações no 4% e no 8-12% nos períodos pós DP e no 4% nas avaliações pós DO. A biomassa de rizomas (Briz) foi maior nos diferimentos (DP e DO) quando comparados isoladamente com o não diferido (ND) no 4%, no segundo ano pós DP para o 8-12% e foi maior para o DP no efeito cumulativo dos dois anos. A (Bsubt) também foi maior no primeiro ano de avaliação somente no 4%. A relação da biomassa aérea/subterrânea (R:A/S) foi maior nos diferimento de primavera (DP) e outono (DO) no ambiente com OF 4% nas comparações com o não diferido (ND) nos dois anos de avaliações e o DP apresentou uma melhor resposta cumulativa. O diferimento aplicado em período favorável ao crescimento vegetal proporciona aumento da biomassa aérea e, em ambientes com longo histórico de sobrepastejo, pode aumentar a biomassa de rizomas contribuindo para a maior cobertura vegetal de espécies que apresentam esse tipo de estrutura subterrânea. / The overgrazing is the main cause of degradation of rangelands, resulting in decreased production potential and consequently carrying capacity of these fields in addition to the replacement of natural vegetation by species of lower feed value. The temporary grazing exclusion is a tool that can contribute to environmental recovery and the productive capacity of degraded pastures. This tool, in addition to providing the growth of the biomass plant, allowing species of high forage value to breed, can influence important features in the underground biomass involving carbon sequestration and improved soil characteristics. This study aims to understand the relationship between the root system of natural pastures and biomass, with the hypothesis that the deferral, and promote the recovery of degraded areas by overgrazing pasture via accumulation and increased soil cover, also increases biomass underground structures. Deferrals three treatments were applied: spring deferral (DP), autumn deferral (DO) and not deferred (ND) in two areas with contrasting grazing intensity of historical 4% (4 kg DM per 100 kg BW) and 8-12% (8 kg DM per 100 kg of body weight in the spring and 12 kg DM per 100 kg of body weight in the rest of the year) evaluated for two consecutive years. The root biomass (Braíz) was higher in the first year of evaluations at 4%, and 8-12% in post DP periods and 4% in after THE assessments. The biomass of rhizomes (Briz) was higher in deferrals (DP and DO) compared alone with no deferred (ND) at 4% and was higher in the DP in the cumulative effect of two years. The (Bsubt) was also higher in the first year of assessment only 4%. The ratio of aboveground / underground biomass (R: A/S) was higher in spring deferral (DP) and autumn (DO) in the environment with OF 4% in comparison with the non-deferred (ND) in the two years of reviews and the DP showed better cumulative response. The deferral applied in good times to plant growth provides increased biomass and, in environments with long history of overgrazing, can increase the biomass of rhizomes contributing to higher vegetation species that exhibit this type of underground structure.

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / A espÃcie botÃnica Annona squamosa, à uma planta comum na regiÃo Nordeste do Brasil onde à cultivada e bastante apreciada por seu fruto conhecido comumente como ata. Popularmente, à empregada no tratamento de diarrÃias, estomatites, em sinapismos nas nevralgias e cefalÃias, em furÃnculos, Ãlceras e na erradicaÃÃo de piolhos. Embora jà pesquisada anteriormente, o re-estudo dessa planta foi justificado, tendo em vista, estudar a parte do caule, pouco explorada, e tambÃm a possibilidade de isolamento de componentes possivelmente conhecidos ou menos comuns, visto que, possuem atividade biolÃgica expressiva. A investigaÃÃo fitoquÃmica a partir do extrato etanÃlico do lenho do caule e do extrato hexÃnico da casca do caule de A. squamosa atravÃs de cromatografia em coluna de gel de sÃlica, levou ao isolamento dos diterpenos (Fig. 1, PÃg. xiv) conhecidos como Ãcido caurenÃico e Ãcido 16b,17-diidroxi-ent-cauran-19-Ãico.Alguns derivados reacionais do Ãcido caurenÃico foram obtidos tendo em vista confirmaÃÃo de sua estrutura, treinamento nas tÃcnicas usuais de laboratÃrio e, principalmente, visando efetuar, em etapa posterior, testes de atividade biolÃgica. O estudo do extrato hexÃnico do lenho do caule de A. squamosa apÃs saponificaÃÃo com KOH/MeOH seguida de metilaÃÃo, forneceu uma mistura de Ãsteres metÃlicos que foram identificados por CG/EM. Os principais componentes (Fig. 2, PÃg. xiv) foram: Ãcido tetradecanÃico (Ãcido mirÃstico), Ãcido pentadecanÃico, Ãcido hexadecanÃico (Ãcido palmÃtico), Ãcido heptadecanÃico, Ãcido 9,12-octadecadienÃico, Ãcido 9,11-octadecadienÃico, Ãcido 9-octadecenÃico (Ãcido olÃico) e Ãcido octadecanÃico (Ãcido esteÃrico). Os compostos originais, como tambÃm, os derivados de reaÃÃo, foram caracterizados utilizando tÃcnicas espectroscÃpicas (RMN 1H e 13C, IV e EM). Assinalamentos de RMN 1H e 13C em colaboraÃÃo com dados da literatura, permitiram estabelecer a conformaÃÃo e configuraÃÃo dos produtos. / Annona squamosa is a common tree popularly know as âataâ. In the folk medicine is used for treatment of stomach diseases, headache, diarrhea and for removal of louse. Phytochemical investigation of EtOH and hexanic extraction using chromatographic techniques allowed identification of kaurenoic acid an 16b, 17-Dihidroxy-ent-kauran-19-oic acid. Derivative of kaurenoic acid were obtained in order to obtain biological activity and structure elucidation. The hexanic extract of trunk was submmited to hydrolise with KOH/MeOH, followes by methylation to yield ester misture identified by CG-MS as: tetradecanoic acid, penthadecanoic acid, hexadecanoic acid, heptadecanoic acid, octadecadi-9,11-en-oic acid, octadecadi-9,12-en-oic acid, octadec-9-enoic acid, octadecanoic acid. All natural compounds and derivatives were characterized by spectroscopic analysis including NMR 1H and 13C, IV and MS. Compounds structures were confirmed by comparison with literature data.

Submitted by Maryse Santos (maryseeu4@gmail.com) on 2016-09-02T13:41:55Z No. of bitstreams: 1 Dissertação de mestrado- Glauber Palma de Oliveira: 263777 bytes, checksum: 5c6aff5230edc4d6a8f43d052783106b (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-09-16T13:21:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação de mestrado- Glauber Palma de Oliveira: 263777 bytes, checksum: 5c6aff5230edc4d6a8f43d052783106b (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-09-16T13:23:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação de mestrado- Glauber Palma de Oliveira: 263777 bytes, checksum: 5c6aff5230edc4d6a8f43d052783106b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-16T13:23:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação de mestrado- Glauber Palma de Oliveira: 263777 bytes, checksum: 5c6aff5230edc4d6a8f43d052783106b (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The aim of this study was to evaluate the antimicrobial activity of aqueous extracts of the fruits and stem bark and a formulation orabase of Libidibia ferrea against biofilm microorganisms by agar diffusion method and broth microdilution, and to evaluate toxicity through hemolysis assay and fibroblast cell culture. For this purpose, aqueous extracts were prepared and from these was designed one orabase. The microorganisms used for determination of MICs were Streptococcus salivarius (ATCC 7073), Streptococcus mutans (ATCC 25175), Streptococcus oralis (ATCC 10557), Lactobacillus casei (ATCC 7469) and Candida albicans (40040 INCQS). As a positive control Chlorhexidine 0.12% and as a negative control the vehicle. In cytotoxicity tests the extract of the stem bark, the formulation vehicle, adjuvants and Orabase formulation were tested. In hemolytic activity, as a positive control Triton X-100, and in the activity of cultured cells doxorubicin, drug pattern of cell viability. As negative controls, the carrier and the diluent of the formulation. The results were presented using descriptive statistics. The results showed that both extracts of the fruits as the stem bark showed antimicrobial activity. MICs for the stem bark extract of jucá were 2.62 mg/mL (Streptococcus mutans), 2.25 mg/mL (Streptococcus oralis), 4.12 mg/mL (Lactobacillus casei), 2.62 mg/mL (Candida albicans) and 3.0 mg/mL (Streptococcus salivarius). As for the extract of the fruit MIC’s values were 3.75 mg/mL (Streptococcus mutans), and 3.37 mg/mL (Streptococcus oralis , Candida albicans and Lactobacillus casei). There was no activity for Streptococcus salivarius. Regarding the Orabase formulation MICs were 0.45 mg/mL (Streptococcus mutans), 0.48 mg/mL (Streptococcus oralis), 0.41 mg/ mL (Lactobacillus casei), 0.48 mg/mL (Candida albicans) and 0.48 mg/mL (Streptococcus salivarius ). As for the hemolysis test, both the extract of the stem bark as the formulation and its components did not cause hemolysis in mg / mL. There was an absence of hemoglobin in the supernatant and sedimented erythrocytes. The solutions tested showed no toxicity when tested against fibroblast cells. Based on the results it was concluded that the extract of the stem bark and the orabase formulation of Libidibia ferrea L. showed antimicrobial activity against microorganisms of the biofilm and were not toxic when tested in erythrocytes and cell culture. / O objetivo do presente estudo foi avaliar a atividade antimicrobiana dos extratos aquosos da vagem e da casca do caule e de uma formulação em orabase de Libidibia ferrea frente a microrganismos do biofilme dental através do método de difusão em ágar e microdiluição em caldo; e a toxicidade através do teste de hemólise e cultura de células de fibroblastos. Para tanto, extratos aquosos foram preparados e a partir destes foi formulada uma orabase. Os microrganismos utilizados para a determinação da CIM (Concentração Inibitória Mínima) foram: Streptococcus salivarius (ATCC 7073); Streptococcus mutans (ATCC 25175); Streptococcus oralis (ATCC 10557); Lactobacillus casei (ATCC 7469) e a Candida albicans (INCQS 40040). Como controle positivo a Clorexidina 0,12% e como controle negativo o veículo. Nos testes de citotoxicidade foram testados o extrato da casca do caule, veículo da formulação, seus adjuvantes e a formulação orabase. Na atividade hemolítica, foi utilizado como controle positivo o Triton X-100, e no teste de viabilidade celular a doxorrubicina e como controle negativo, foram utilizados o veículo e o diluente da formulação em ambos os testes. Os resultados obtidos foram apresentados através da estatística descritiva. Os resultados mostraram que tanto os extratos da vagem quanto da casca do caule apresentaram atividade antimicrobiana. As CIMs para o extrato casca do caule de jucá em relação ao microrganismo foram 2,62 mg/mL (Streptococcus mutans), 2,25 mg/mL (Streptococcus oralis), 4,12 mg/mL (Lactobacillus casei), 2,62 mg/mL (Candida albicans) e 3,0 mg/mL (Streptococcus salivarius). Já para o extrato da vagem os valores de CIM foram 3,75 mg/mL (Streptococcus mutans), e 3,37 mg/mL (Streptococcus oralis, Candida albicans e Lactobacillus casei). Não houve atividade para Streptococcus salivarius. Em relação à formulação em orabase as CIMs foram de 0,45 mg/mL (Streptococcus mutans), 0,48 mg/mL (Streptococcus oralis), 0,41 mg/mL (Lactobacillus casei), 0,48 mg/mL (Candida albicans) e 0,48 mg/mL (Streptococcus salivarius). Quanto ao teste de hemólise, tanto o extrato da casca do caule quanto a formulação e seus componentes não causaram hemólise. Verificou-se um sobrenadante com ausência de hemoglobina e eritróticos sedimentados. As soluções testadas não apresentaram toxicidade quando testadas em fibroblastos humanos. Baseado nos resultados foi possível concluir que o extrato da casca do caule e a formulação em orabase de Libidibia ferrea L. apresentaram ação antimicrobiana frente aos microrganismos do biofilme da cavidade bucal e não foram tóxicos quando testados em hemácias e cultura de células.

A variação genética natural é uma fonte rica em novos genes e alelos presentes nas espécies selvagens relacionadas às espécies cultivadas. O gênero Solanum seção Lycopersicum possui espécies que evoluíram em variados ecossistemas compreendidos na região que vai do sul do Equador até o norte do Chile. Tais espécies podem ser cruzadas com o tomateiro cultivado (Solanum lycopersicum) e vêm sendo exploradas como fonte de resistência a patógenos, a artrópodes e a estresses bióticos; além de possuírem características ligadas à qualidade do fruto, como alto teor de sólidos solúveis e presença de fitonutrientes. No entanto, tais espécies foram pouco exploradas até o momento quanto a variações alélicas afetando a estrutura da planta, como arquitetura de órgãos dos sistemas caulinares e radiculares. S. galapagense, uma espécie endêmica das Ilhas Galápagos, possui características únicas do gênero, como a presença de folhas bastante recortadas e entrenós curtos. As folhas recortadas de S. galapagense já haviam sido previamente ligadas a Petroselinum (Pts), um alelo com expressão aumentada de um gene da família KNOTTED1-LIKE HOMEOBOX (KNOX). O maior recorte foliar causado por Pts deve-se a interferência na via de desenvolvimento do primórdio foliar, através de sua interação com BIPINNATA (BIP), um gene da família BEL1-LIKE HOMEODOMAIN (BELL), para o qual o tomateiro apresenta um alelo perda de função, bip. No presente trabalho é caracterizado o lócus Galapagos dwarf (Gdw), uma variação genética natural oriunda de S. galapagense. Foram utilizadas em estudos comparativos a cultivar Micro-Tom (MT), uma variedade de tomateiro com pequeno porte e ciclo rápido, e isolinhas contendo o lócus Gdw e os alelos Pts, bip. Nestes estudos, verificou-se que embora todos esses alelos afetem a arquitetura foliar em tomateiro, formando folhas mais recortadas, somente Gdw apresentou fenótipo de entrenó curto, característico do parental S. galapagense. Tal característica, além de ter valor no melhoramento para obtenção de plantas compactas, pode ter implicações adaptativas e ecológicas no contexto em que evoluiu S. galapagense. O lócus Gdw foi mapeado no cromossomo 2 de tomateiro, e no futuro, pretendemos clonar o gene GDW. / Natural genetic variation is a rich source of new genes or alleles, harbored in wild relatives of cultivated plants. The genus Solanum section Lycopersicum has members who had evolved in several ecosystems, extending from southern Ecuador through northern Chile. These species can be hybridized with the cultivated tomato (Solanum lycopersicum) and have been exploited to great extent in tomato breeding, as source of resistance or tolerance to pest, diseases and abiotic stresses. Moreover, wild species bear quality fruit traits that can improve solids soluble content and add phytonutrients into cultivated tomato. However, allelic variations affecting plant architecture coming from wild species have been underexplored. S. galapagense, an endemic species from Galápagos Islands, owns unique features, such as highly subdivided leaves and short internodes. The increased-leaf-dissection phenotype of S. galapagense was previously associated with the higher expression of the causative allele Petroselinum (Pts), a member of the KNOTTED1-LIKE HOMEOBOX (KNOX) gene family. Pts affects the development pattern of leaf primordium, increasing leaf dissection through its interaction with BIPINNATA (BIP), a BEL1-LIKE HOMEODOMAIN (BELL) gene. Also, tomato has a BIP knockout allele, which is present in the bip mutant. The present work characterizes the Galapagos dwarf (Gdw) locus, a natural genetic variation from S. galapagense. Comparative analysis were made among Micro-Tom (MT), a S. lycopersicum cultivar with small size and short life cycle, and its near-isogenic lines (NILs) harboring Gdw, Pts and bip alleles. Although we verified that all these alleles affect leaf architecture, leading to more dissected leaves, only Gdw showed short internodes, which is typical from its parental S. galapagense. Besides its worth for the development of compact plants through breeding, such trait could be adaptive and ecologically meaningful in the evolutionary history of S. galapagense. The Gdw locus was mapped on the chromosome 2, and in the future we intent to clone the causative gene GDW.

Apesar da importância econômica e ambiental que a madeira representa como fonte natural e renovável de energia e fibras, pouco é conhecido sobre os processos celulares, moleculares e bioquímicos envolvidos com a sua formação. Usando metodologias proteômicas como 2D-PAGE e espectrometria de massas foi iniciada a análise do proteoma do caule de Eucalyptus grandis em diferentes estádios de desenvolvimento (5 meses, 3 anos e 6 anos). O presente trabalho baseou-se especificamente na idade de cinco meses. As plantas tiveram suas folhas, raízes e cascas removidas e seus caules foram macerados em almofariz com nitrogênio líquido e as proteínas extraídas pelo método de extração fenólica. As proteínas foram separadas por eletroforese bidimensional em fitas IPG com gradiente de pH imobilizado linear de 4-7 na primeira dimensão e gel de poliacrilamida (12,5%) na segunda dimensão. A coloração dos géis foi realizada com coomassie G250. Foram detectados 438 spots e um total de 168 spots foram retirados do gel, digeridos com tripsina e submetidos ao sequenciamento por espectrometria de massas através do sistema LCMS/ MS. O sequenciamento por MS apresentou uma eficiência de 72,02% possibilitando a identificação de 121 spots, enquanto que 35 (20,83%) não apresentaram homologia com nenhuma base de dados. Entre as proteínas identificadas 22 foram representadas por mais de um spot, podendo indicar a ocorrência e eventos provenientes do splicing alternativo, modificações pós-traducional, variações alélicas de uma mesma proteína ou degradação da amostra. Entre os spots analisados, 22,02% estão relacionados com a produção de energia, (17,86%) metabolismo, (13,69%) processes celulares, (0,60%) transporte, (8,33%) componentes estruturais, (5,36%) metabolismo macromolecular, (4,17%) proteínas putativas, (20,83%) não apresentaram homologia com nenhuma base de dados e (7,14%) não demonstraram resultado. A comparação realizada entre o volume de 59 proteínas e os seus respectivos transcritos demonstrou que não existe correlação entre mRNA e as proteínas do caule. O método possibilitou uma rápida e precisa separação e identificação das proteínas do caule de Eucalyptus grandis que são diferencialmente expressas durante a fase de crescimento de cinco meses. / The process of wood formation is an important economical factor for the forestry industry and it is also of ecological importance, although little is known about the proteins involved in wood formation. The sequencing, identification and analysis of proteins provides such information of wood formation. Using proteomics techniques such as two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry we have started a proteomic analysis of wood formation in Eucalyptus grandis at different stages of development (5 months, 3 and 6 years old). This work presents data related to the stage of 5 months. Using high resolution 2DE with linear pH gradient ranging from 4 to 7, a total of 438 spots were detected. However, only 168 spots were analyzed by LC ESIMS/ MS and 121 were identified (72.02%) while 35 (20.83%) presented no homology in the database used. Overall, 22 proteins appeared as multiple spots and accounted for most of the proteins found in the group. This observation may reflect post-translation modification, alternative splicing events, isozyme variation, allelic variation of the same protein, but also protein degradation. Over the 168 spots analysed, (22.02%) play a role in energy, (17.86%) metabolism, (13.69%) cellular processes, (0.60%) transport, (8.33%) structural components, (5.36%) macromolecular metabolism, (4.17%) putative protein, (20.83%) no homology and (7.14%) no result. For 59 proteins, the spot volume was compared with their respective transcript with mRNAs extracted from wood forming tissue. The method provided a faster and accurate tool for separation and identify of protein which are differentially expressed under different stages of development in Eucalyptus grandis.

De todas as adaptações que as plantas sofreram durante a evolução, a aquisição do sistema vascular à 400 milhões de anos atrás, foi sem dúvida um evento decisivo para sua bem sucedida existência na terra. A madeira é considerada o mais importante recurso natural de energia renovável e o setor econômico baseado na produção florestal cresce a cada ano. Inúmeros fatores como rápida taxa de crescimento, grande produção de biomassa, adaptabilidade a diversos ambientes e solos, boa qualidade de madeira para produção de uma ampla gama de produtos e presença de celulose de fibra curta, ideal para a produção de papel e celulose, contribuíram para o grande sucesso das espécies de Eucalyptus e tornaram o Brasil o maior produtor mundial de celulose de fibra curta utilizando o eucalipto como matéria prima. Devido à reconhecida importância econômica e também ambiental das árvores, o desenvolvimento do sistema vascular se tornou um importante e fascinante processo biológico para se estudar. No entanto, existe ainda pouco conhecimento sobre os processos celulares, moleculares e bioquímicos envolvidos na formação da madeira. Dessa forma, no presente trabalho foi utilizada a técnica de SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) para caracterizar o perfil transcricional do caule de plantas de E. grandis com 6 meses de idade. A partir do sequenciamento de 826 clones, foi possível analisar 2.274 tags/genes, sendo que 989 (43,5%) genes puderam ser identificados e ter uma possível função atribuída. Genes que codificam enzimas e proteínas muito importantes durante o processo de formação da madeira, como aqueles relacionados à biossíntese e deposição da parede celular e organização do citoesqueleto, apresentaram elevada expressão, sendo possível ainda sugerir a ocorrência de possíveis mecanismos comuns de controle transcricional para grupos de genes funcionalmente relacionados. A posterior comparação com as proteínas identificadas por espectrometria de massas através do sistema LC-MS/MS a partir do mesmo material biológico mostrou que muitos desses genes representam também as proteínas mais abundantes. Juntamente com outros projetos que vêm sendo desenvolvidos no laboratório, o presente trabalho contribuiu para a construção de um banco de dados local com informações do transcritoma e do proteoma de diferentes idades e tecidos, fornecendo uma visão global sobre os genes envolvidos no processo de formação da madeira e possivelmente responsáveis pelo rápido crescimento nas espécies de Eucalyptus, indicando importantes alvos para futuros programas de melhoramento. / From the numerous adaptations that plants have developed during evolution, the acquisition of the vascular system some 400 million years ago was been a decisive event for their successful existence on earth. Wood is considered the most important natural resource of renewable energy and the Forest-based economical sector grows every year. Several factors like the fast growth rate, large biomass production, adaptability to a wide range of environments and soils, good wood quality for the production of a wide range of products and the presence of short cellulose fiber, suitable for pulp and paper production, have contributed to the great success of Eucalyptus species making Brazil the main producer of short cellulose fiber using eucalypt as raw material. Due to the recognized economical and also environmental importance of trees, the development of the vascular system became an important and fascinating biological process to study. However, little is known about the cellular, molecular and biochemical processes involved in wood formation. In this way, in the current work SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) technique was used to characterize the transcriptional profile in stems of 6 months old Eucalyptus grandis. From the sequencing of 826 clones, it was possible to analyse 2,274 tags/genes, and 989 (43,5%) genes could be identified and to have a possible function attributed. Genes that code for enzymes and proteins important for wood formation process, like those related to cell wall biosynthesis and deposition, and cytoskeleton organization had high expression, making it possible to suggest the occurrence of a common transcriptional control for a few functionally related genes. The posterior comparison with the set of proteins identified by LC ESI-MS/MS from the same biological material showed that some of these genes also represent the most abundant proteins. Taken together with other projects that are being developed in the laboratory, the present work contributed for the construction of a local data-base with transcriptome and proteome information from different ages and tissues, giving a global vision of the genes involved in the wood formation process and potentially responsible for the fast growth in the Eucalyptus species, indicating important targets for future breedings programs.

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:48:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Manuela Gonoring Soares - texto.pdf: 1466930 bytes, checksum: 1d3ed3b45ce030e2a560ba080600448e (MD5) Previous issue date: 2012-02-28 / A capacidade das plantas em apresentar respostas adaptativas funcionais em relação às condições ambientais é conhecida como plasticidade, podendo ser expressa pelo processo de aclimatação. No ambiente florestal, a luz é um dos fatores principais no estabelecimento e distribuição de espécies vegetais. Neste contexto, espécies mais plásticas apresentam maiores taxas de sobrevivência em relação à variação da disponibilidade luminosa. Os ajustes podem ser fisiológicos, morfológicos e anatômicos e variam de acordo com o nível de exposição à radiação e as características de plasticidade do indivíduo. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo avaliar a plasticidade de plantas jovens de Handranthus chrysotrichus em resposta a diferentes intensidades luminosas. Para tanto, as plantas foram submetidas a três tratamentos: pleno sol (100% de radiação), sombreamento moderado (50% de radiação solar) e sombreamento severo (5% de radiação solar). A plasticidade foi avaliada por meio da análise de modificações de características aos níveis fisiológicos, morfológicos e anatômicos. Foram realizadas análises de crescimento, teor de pigmentos fotossintetizantes, teor de carboidratos solúveis foliares, atividade de enzimas antioxidantes (catalase e peroxidase do ascorbato), anatomia foliar (espessura da cutícula, da epiderme, parênquima paliçádico, mesofilo paravenal, parênquima esponjoso e densidade estomática) e caulinar (espessura da periderme, floema secundário, faixa cambial, xilema secundário e diâmetro, comprimento e densidade dos vasos), testes histoquímicos e índice de plasticidade (IP), após 90 e 200 dias de tratamento. Para as folhas, foram realizadas avaliações em folhas pré-existentes à submissão aos tratamentos e em folhas novas emitidas. As plantas apresentaram respostas comumente encontradas em espécies adaptadas ao sol e à sombra. O crescimento foi estimulado em resposta à alta irradiância, pelo maior acúmulo de massa seca e carboidratos solúveis foliares. O teor de pigmentos fotossintetizantes foi superior nas plantas sob sombreamento severo. A atividade da enzima catalase foi inferior nas plantas submetidas ao pleno sol e a enzima peroxidase do ascorbato não apresentou variação entre os tratamentos ao final do experimento. Em relação à anatomia foliar, houve variações na espessura da cutícula, dos tecidos foliares e na densidade estomática. O caule apresentou variações quanto à espessura dos tecidos avaliados, diâmetro e densidade dos vasos. As variáveis anatômicas analisadas mostraram valores superiores nas plantas em pleno sol e sombreamento moderado. Em relação aos testes histoquímicos, foram encontradas diferenças na deposição de grãos de amido em tecidos caulinares, maior em pleno sol. A análise do IP demonstrou que os ajustes após 90 dias de tratamento foram predominantemente fisiológicos, sendo o teor de pigmentos fotossintetizantes e a massa seca total, as características mais plásticas. Entretanto, ao final de 200 dias de tratamento, os ajustes foram predominantemente morfológicos (massa foliar específica, área foliar específica, razão de área foliar, bem como a produção de massa seca total), anatômicos foliares (espessura do parênquima esponjoso, densidade estomática) e anatômicos caulinares (espessura da faixa cambial). Os resultados obtidos indicam que plantas jovens de H. chrysotrichus apresentam grande plasticidade frente à variação da disponibilidade de luz, o que torna essa espécie recomendada para projetos de reflorestamento e recuperação de áreas degradadas / The ability of plants to show functional adaptive responses in relation to environmental conditions is known as plasticity and can be expressed by the acclimation process. In the forest environment, light is a major factor in the establishment and distribution of plant species. In this context, more plastic species have higher survival rates in relation to the variation of light availability. Adjustments can be physiological, morphological and anatomical and vary with the level of radiation exposure and the characteristics of plasticity of the individual. Thus, this study aimed to evaluate the plasticity of young plants of Handranthus chrysotrichus in response to different light intensities. For this purpose, plants were subjected to three treatments: full sun (100% of solar radiation), moderate shade (50% of solar radiation) and severe shading (5% of solar radiation). The plasticity was evaluated by analyzing changes in physiological characteristics levels, morphological and anatomical. Analyses of growth, photosynthetic pigments content, leaf soluble carbohydrates, antioxidant enzymes (catalase and ascorbate peroxidase), leaf anatomy (thick cuticle, epidermis, palisade parenchyma, paravenal mesophyll, spongy mesophyll and stomatal density) and stem anatomy (thickness of the periderm, secondary phloem, vascular cambium, secondary xylem, diameter, length and density of vessels), histochemical tests and plasticity index (PI) after 90 and 200 days of treatment. For leaves, were evaluated leaves pre-existing to the treatments and new leaves that emerged. Plants show responses commonly found in species adapted to sun and shade. Growth was stimulated in response to high irradiance by the greater accumulation of dry weight and leaf soluble carbohydrates. The content of photosynthetic pigments was higher in plants under severe shading. The catalase activity was lower in plants grown under full sun and the enzyme ascorbate peroxidase did not vary between treatments at the end of the experiment. In relation to leaf anatomy, there were variations in the thickness of the cuticle, of measured leaves tissues and stomatal density. The stem showed variation in the measured tissue thickness, diameter and density of vessels. The anatomic variables analyzed showed higher values in plants in full sun and moderate shade. Regarding the histochemical tests, differences were found in the deposition of starch grains in stem tissues, most in full sun. The analysis of IP demonstrated that the adjustments after 90 days of treatment were predominantly physiological. The content of photosynthetic pigments and the total dry mass were the most plastic characteristics. However, after 200 days of treatment, the settings were predominantly morphological (specific leaf mass, specific leaf area, leaf area ratio, as well as the production of total dry mass), leaf anatomical (thickness of the spongy parenchyma, stomatal density) and anatomical stem (thickness range of vascular cambia). The results indicate that young plants of H. chrysotrichus exhibit great plasticity to the variation of light availability, which makes this recommended species for reforestation and reclamation

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-08-31Bitstream added on 2014-06-13T19:23:50Z : No. of bitstreams: 1 calzavara_sa_dr_jabo.pdf: 571802 bytes, checksum: a2598276a148c9facfc38bedc5ba67f1 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Pratylenchus jaehni é o nematóide mais agressivo na citricultura paulista. A espécie foi descrita em 2001 com base em uma subpopulação coletada em um pomar de Itápolis-SP. Na presente pesquisa foram descritos e documentados os sintomas de plantas de laranjeiras adultas infectadas pelo nematóide, foi mensurada a resistência de seis porta-enxertos, assim como se estudou a faixa de hospedeiros do nematóide em algumas culturas e espécies de plantas daninhas. Em microparcelas, a campo, estudou-se a influência do nematóide, em níveis crescentes de inóculo, sobre o desenvolvimento de plantas jovens de laranjeiras. As plantas infectadas pelo nematóide exibem baixa densidade foliar, folhas e frutos menores, crescimento retardado e, em casos de acentuado déficit hídrico, podem morrer. Nas raízes são observadas manchas necróticas características da infecção e acentuada morte de radicelas. Entre seis portaenxertos estudados o limoeiro ‘Cravo’ foi o único suscetível ao nematóide, sendo que a tangerina ‘Cleópatra’, o citrumelo ‘Swingle’, a tangerina ‘Sunki’, o Poncirus trifoliata e o citrange ‘Carrizo‘ são resistentes ao nematóide. Entre as culturas estudadas apenas o milheto, a soja, o milho e a Crotalaria juncea são suscetíveis ao nematóide. Aos 12 meses após a inoculação de P. jaehni em plantas jovens de laranjeira ‘Valência’, enxertadas sobre limoeiro ‘Cravo’, observaram-se reduções significativas de 22% na altura das plantas, 22,5% no diâmetro do caule, 20,4% no diâmetro da segunda pernada e 43,7% e 52,5% no volume da copa, aos 11 e aos 12 meses, após a inoculação, respectivamente. / Pratylenchus jaehni is the most aggressive nematode for the citrus crop in São Paulo State. The species was described in 2001 on the basis of a subpopulation collected in an orchard of Itápolis-SP. In the present research the symptoms of orange plants infected by the nematode were described and documented. Also, the resistance of six rootstocks was evaluated, as well as the host range of the nematode crops and weeds. In microplots, at field conditions, it was studied the influence of the nematode in increasing levels of inoculum on the development of young plants of orange trees. The plants infected by the nematode show low foliar density, small leaves and fruits, smaller rate of growth and, under severe water stress they may die. Necrotic lesions on the roots, characteristic of the infection and death of feeder roots are observed. Among six rootstocks studied Rangpur lime was the only susceptible one to the nematode. Cleopatra tangerine, citrumelo Swingle, Sunki tangerine, Poncirus trifoliata and citrange Carrizo are resistant to the nematode. Among the plants species studied only the millet, soybean, maize and Crotalaria juncea are susceptible to the nematode. After 12 months from the inoculation of P. jaehni in young plants of orange trees `Valência', grafted on Rangpur lime, it were observed reductions of 22% in the height of the plants, 22.5% in the diameter of the stem, 20.4% in the diameter of the second branch and 43.7% and 52.5% of the canopy volume at 11 and 12 months, respectively, after the inoculation.