Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós Graduação em Ecologia, 2012. / Submitted by Sabrina Silva de Macedo (sabrinamacedo@bce.unb.br) on 2012-06-29T14:29:33Z No. of bitstreams: 1 2012_ElisaAraújoCunhaCarvalhoAlvim.pdf: 4187018 bytes, checksum: fce775b0d83a58f9c273ccfe0b275cef (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-05T18:23:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_ElisaAraújoCunhaCarvalhoAlvim.pdf: 4187018 bytes, checksum: fce775b0d83a58f9c273ccfe0b275cef (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-05T18:23:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_ElisaAraújoCunhaCarvalhoAlvim.pdf: 4187018 bytes, checksum: fce775b0d83a58f9c273ccfe0b275cef (MD5) / A decomposição é o principal processo de ciclagem de nutrientes e fluxo de energia, contribuindo para o funcionamento de ecossistemas aquáticos. O objetivo deste estudo foi avaliar a influência da composição química das folhas e da comunidade de invertebrados e de micro-organismos no processo de decomposição de diferentes detritos foliares em um córrego de altitude no Campo Rupestre em Minas Gerais. O estudo foi conduzido no córrego Geraldinho, localizado na Serra do Cipó e possui vegetação pripária pouco desenvolvida, composta apenas por arbustos e ervas. Foram utilizadas quatro espécies abundantes na região: Baccharis concinna, B. dracunculifolia, B.platypoda e Coccoloba cereifera. No total, 144 litter bags foram montados e incubadosentre maio e setembro de 2009, estação seca. As réplicas (n=4) foram retiradas após 3,7, 15, 21, 30, 60, 90 e 120 dias. No capítulo 1 foi realizada uma comparação entre a decomposição de B. concinna e B. dracunculi folia, que apresentaram valores de coeficiente de decomposição diferentes (k=0,0062 dia-1 e k=0,0023 dia-1,respectivamente). Os compostos secundários foram rapidamente lixiviados nos sete primeiros dias, porém os compostos estruturais persistiram por mais tempo. Os valores iniciais de ergosterol encontrados foram elevados para as duas espécies, sugerindo uma colonização fúngica antes da incubação dos detritos no córrego. Ao final do experimento observou-se um aumento abrupto da concentração de ergosterol (3808!g.g-1 AFDM para ambos os detritos), evidenciando a importância desse grupo na liberação da energia armazenada no detrito. O processo de colonização microbiana total foi marcado por oscilações constantes dos valores de ATP e os maiores valores foramencontrados nos estágios finais do processo para as duas espécies, assim como asmaiores concentrações de ergosterol, indicando que a biomassa microbiana total pode assimilar os compostos orgânicos liberados da degradação dos detritos pela ação enzimática dos fungos. No capítulo II ao analisar a decomposição de B. platypoda e C.cereifera encontrou-se taxas de decomposição lenta (k = 0,0019 dia-1 e k = 0,0008 dia-1,respectivamente). As concentrações iniciais de polifenóis totais e taninos condensados não diferiram significativamente entre as duas espécies e os compostos estruturais apresentaram maiores proporções nesses detritos, retardando a remobilização da energia e nutrientes para o ecossistema aquático. A biomassa de fungos filamentosos aquáticos apresentou maiores valores ao final do experimento, sugerindo que os detritos apresentaram condições favoráveis para a colonização, a partir deste período. As densidades dos invertebrados associados aos detritos aumentaram a partir do 60º dia de12!incubação em B. platypoda e em C. cereifera a partir do 90º dia, coincidindo com o picode concentração de ergosterol. Os grupos tróficos coletor-catador e raspador apresentaram maiores densidades em B. platypoda e C. cereifera. Os fragmentadores apresentaram as menores densidades tanto em B. platypoda quanto em C. cereifera(1,3% e 0,4%, respectivamente), sugerindo uma menor participação dos invertebrados na decomposição. Portanto, as espécies que possuem decomposição rápida são importantes fontes de carbono para os micro-organismos, enquanto espécies de decomposição lenta são importantes para os invertebrados como substrato e fonte de matéria orgânica particulada. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Decomposition is the main process of cycling nutrients and energy flow,contributing to the functioning of aquatic ecosystems. The objective of this study was to evaluate the influence of chemical composition of leaves and the presence of microorganisms and invertebrates in the decomposition of different leaf litter in an altitudinal stream in Cerrado Rupestre, in Minas Gerais. This work was conducted in Geraldinho stream, located in Serra do Cipó with a poorly vegetation riparian composedonly by shrubs. We used four abundant species in the region: Baccharis concinna, B.dracunculifolia, B. platypoda e Coccoloba cereifera. In total, 144 litter bags were doneand incubated en May to September 2009, the dry season. Replicates (n=4) wereremoved after 3,7, 15, 21 30, 60, 90 and 120 days. The chapter I we found a differentdecay rate between leaves of B. concinna and B. dracunculifolia (k = 0.0062 day-1 and k= 0.0023day-1, respectively). The secondary compounds were rapidly leached in the first seven day, but the structural compounds persisted longer. The initial values ofergosterol were high for both species, suggesting a fungal colonization before incubation of the detritus in the stream. At the end of the experiment, there was anabrupt increase of the concentration of ergosterol (3808 !g.g-1 AFDM for both detritus),indicating the importance of this group in the release of energy stored in the detritus.The total microbial colonization process was marked by constant oscillations of thevalues of ATP and the highest values were found in the final stages of the process for both species, as well as higher concentrations of ergosterol, indicating that total microbial biomass can assimilate organic compounds released by degradation ofdetritus by the enzymatic action of fungi. In the chapter II, the decay rates of leaves ofB. platypoda and C. cereifera were slow (k = 0.0019 day-1 and k = 0.0008 day-1,respectively). The initial concentrations of total polyphenols and condensed tannins didnot differ significantly between the two species and structural compounds had higher proportions in these detritus, delaying the remobilization of energy and nutrients to the aquatic ecosystem. The biomass of aquatic filamentous fungi presented higher values at the end of the experiment, suggesting that the detritus had favorable conditions for colonization, from this period. Densities of invertebrates associated with detritusin creased from the 60th day of incubation in B. platypoda and C. cereifera from 90thday, coinciding with the peak concentration of ergosterol. The trophic group ofcollector-gatherer and scraper had higher densities in both detritus. The shredders hadthe lowest densities such in B. platypoda as in C. cereifera (1.3% and 0.4%,14!respectively), suggesting a reduced participation of invertebrates in the leaf break down.There fore, the species with rapid decomposition are an important carbon sources formicroorganism whereas species of slow leak breakdown are important for invertebratesas substrate and source of particulate organic matter.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Pós-Graduação em Ecologia, 2011. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-20T12:24:38Z No. of bitstreams: 1 2011_ClarisseRezendeRocha.pdf: 4520251 bytes, checksum: 21f93ed1268b3f571a6bc8b8ee0b0ace (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-20T12:24:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_ClarisseRezendeRocha.pdf: 4520251 bytes, checksum: 21f93ed1268b3f571a6bc8b8ee0b0ace (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-20T12:24:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_ClarisseRezendeRocha.pdf: 4520251 bytes, checksum: 21f93ed1268b3f571a6bc8b8ee0b0ace (MD5) / A estrutura de uma população é determinada por fatores como densidade, distribuição de indivíduos no habitat, proporções de indivíduos em diferentes classes etárias, razão sexual, área de vida e comportamento. Esse estudo teve como objetivo caracterizar os parâmetros populacionais e os fatores que afetam as variações nas densidades de roedores no Cerrado (Myomorpha, Muroidea, Cricetidae). O estudo foi realizado em áreas de campo na Estação Ecológica de Águas Emendadas, Planaltina, DF, entre 2004 e 2009. Duas grades foram montadas em áreas de campo, onde foram colocadas mensalmente 50 armadilhas do tipo Sherman durante seis noites consecutivas. O tamanho da área de vida dos roedores foi diferente entre os sexos, mas não foi relacionada à reprodução, estações do ano e massa corporal. A abundância da espécie Thalpomys lasiotis influenciou no tamanho da área de vida dos indivíduos. Entretanto, a sobreposição dos indivíduos das três espécies foi influenciada pela abundância. A sobreposição foi maior entre indivíduos machos do que entre as fêmeas. As variáveis ambientais explicaram 21% da composição da comunidade. A variação no adensamento de gramíneas e no número de cupinzeiros e murundus foram as variáveis que mais influenciaram as populações destes roedores. Necromys lasiurus ocorreu em ambientes com maior adensamento de gramíneas, enquanto as espécies T. lasiotis e Calomys tener ocorreram nos ambientes com o menor adensamento de gramíneas. Para as espécies C. tener e T. lasiotis a estação seca foi o período de maior recrutamento de jovens. Os jovens de N. lasiurus foram encontrados durante todo ano. A menor massa corporal encontrada para os roedores na estação seca foi atribuída a fatores biológicos como idade dos indivíduos e fatores ambientais, como a menor oferta de recursos durante esta estação. Em geral, os roedores destas áreas de campo, apresentaram reprodução sazonal, com maiores picos na estação chuvosa. Calomys tener e T. lasiotis apresentaram padrões sazonais, com variação no tamanho da população entre as estações seca e chuvosa. A variação anual também foi importante na abundância para duas das três espécies estudadas. Necromys lasiurus apresentou flutuações, em média, bianuais e T. lasiotis apresentou declínio nas densidades populacionais ao longo dos seis anos de estudo. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The structure of a population is determined by factors such as density, distribution of individuals in the habitat, proportions of individuals in different age groups, sex ratio, home range and behavior. This study intended to characterize the factors and their determinants affecting the variation of three cricetid rodent population density in the Brazilian cerrado. This study was conducted in two grassland areas at the Estação Ecológica de Águas Emendadas in the Distrito Federal, Brazil, from 2004 to 2009. Fifty Sherman traps were monthly baited during six consecutive nights at each grid.The size of rodents’ home range differed between sexes, but it was not related to reproduction, seasons or body masses. The abundance of Thalpomys lasiotis influenced the home range size of that species. However, abundance influenced overlapping for the three species individual. Male overlapping was higher than females’. The environmental variables explained 21% of the community composition. The variation in grasses density and in the number of “termite mounds” and “murundus” were the variables that most influenced the rodents’ populations. Necromys lasiurus occurred in places with higher density of grasses, while T. lasiotis and Calomys tener occurred in environments with lower density of grasses. The dry season was the period of increased recruitment of juveniles of C. tener and T. lasiotis. Necromys lasiurus juveniles were found throughout the year. Their lower body mass in the dry season was attributed to biological factors such as age of individuals and environmental factors such as the lower supply of resources during the season. In general, the grassland rodents, showed seasonal reproduction, with higher peaks in the rainy season.Calomys tener and T. lasiotis showed distinct seasonal variation in population size between the dry and rain seasons. The abundance annual variation was also important for two of the three species. Necromys lasiurus showed population fluctuations, on average, every two years and T. lasiurus presented a decline in population densities over the six years of the study.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2012-09-21T14:40:33Z No. of bitstreams: 1 2012_ MarcelaVersianiVenancioPires.pdf: 832777 bytes, checksum: f5f19b9567603c3e584148e9ad0de9a5 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2012-09-24T13:26:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_ MarcelaVersianiVenancioPires.pdf: 832777 bytes, checksum: f5f19b9567603c3e584148e9ad0de9a5 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-09-24T13:26:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_ MarcelaVersianiVenancioPires.pdf: 832777 bytes, checksum: f5f19b9567603c3e584148e9ad0de9a5 (MD5) / Os frutos das espécies nativas do cerrado oferecem um elevado valor nutricional, além de atrativos sensoriais como, cor, sabor e aroma peculiares e intensos, ainda pouco explorados comercialmente. O baru (Dipteryx alata Vog.), árvore da família Leguminosae, é uma fruteira amplamente disseminada no Cerrado. O araticum (Annona crassiflora Mart.) é uma espécie frutífera da família Annonaceae, nativa da região do Cerrado, muito estudada atualmente em diversas áreas. Os objetivos deste estudo foram: a) estudar a variabilidade genética de acessos de baru com base em características morfológicas e com base em análise de DNA por marcadores moleculares RAPD e Microssatélites; b) estudar a variabilidade genética da coleção de trabalho de acessos de araticum, utilizando características morfológicas e marcadores moleculares RAPD e Microssatélites. Folhas de 10 acessos de baru e 18 acessos de araticum da coleção de trabalho da Embrapa Cerrados foram coletadas e o DNA genômico extraído utilizando o método do CTAB, com modificações. Amostras de DNA de cada material genético foram amplificadas via Reação em Cadeia da Polimerase para obtenção de marcadores moleculares RAPD e Microssatélites. Foram avaliadas 15 características morfológicas quantitativas do baru e 23 características morfológicas categóricas de baru e de araticum. As análises das amostras de DNA demonstraram grande diversidade genética entre os acessos. Os trabalhos de caracterização morfológica e molecular mostraram a importância dos diferentes grupos de características para avaliar a variabilidade genética dos acessos.Observou-se que o ambiente pode ter interferido muito nas características morfológicas dos acessos. Estudos de variabilidade genética utilizando apenas características morfológicas avaliadas in situ podem não ser adequados devido à grande influência ambiental sobre tais características. Os acessos de baru e araticum avaliados são importantes fontes de variabilidade para enriquecimento da atual coleção de trabalho da Embrapa Cerrados. Os resultados obtidos nesse trabalho sugerem que a análise das progênies ou de matrizes clonadas em diferentes ambientes assume importância estratégica para futuros estudos de caracterização morfo-agronômica de germoplasma. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The fruits of native species of the Brazilian Savanna offer a high nutritional value, as well as attractive color, flavor and intense aroma. Most of these species were not exploited commercially. The baru (Dipteryx alataVog.) is a fruit widely disseminated in the Brazilian Savanna. Araticum (Annona crassiflora Mart.) is an Annonaceae fruit, native in the Brazilian Savanna region, nowadays widely studied in several areas. The objectives of this work were: a) to analyze the genetic variability of baru accessions based on morphological characteristics and on DNA analysis using RAPD and microsatellite markers; b) studying the genetic variability of the araticum germplasm collections, using morphological and RAPD and microsatellites molecular markers. Young leaves of 10 baru and 18 araticum accessions from Embrapa Cerrados collections were collected and used to genomic DNA extractions using the CTAB method, with modifications. DNA samples from each genetic material were amplified by Polymerase Chain Reaction for obtaining. Fifteen quantitative and 23 categorical morphological characteristics were used to analyze baru and araticum genetic variability.DNA analyzes showed high genetic diversity among baru and araticum accessions. The characterization using morphological and molecular markers showed the importance of different types of characteristics to evaluate the genetic variability of accessions. It was observed that the environment may have high interference on morphological characteristics of the accessions. Genetic variability studies using only morphological characteristics assessed in situ may not be effective due to the large environmental influence on these phenotypic characteristics. The baru and araticum accessions evaluated in these work are important sources of variability to enlarge the current Embrapa Cerrados collections. The present results suggest that analysis of accessions (progeny or cloned plants)in different environment shave strategic importance for future studies of morpho-agronomic germplasm characterization.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, 2012. / Texto parcialmente liberado pelo autor. Conteúdo: Elementos pré-textuais. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2012-10-10T12:58:22Z No. of bitstreams: 1 2012_AlinneMartinsFerreiraMarin_Parcial.pdf: 3319996 bytes, checksum: 122d543a948efb54d56334076520001e (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-10-11T14:08:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_AlinneMartinsFerreiraMarin_Parcial.pdf: 3319996 bytes, checksum: 122d543a948efb54d56334076520001e (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-11T14:08:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_AlinneMartinsFerreiraMarin_Parcial.pdf: 3319996 bytes, checksum: 122d543a948efb54d56334076520001e (MD5) / O efeito protetor de alimentos de origem vegetal tem sido atribuído a presença de compostos bioativos encontrados em todas as partes da estrutura das plantas. Estudos anteriores retrataram uma alta concentração de sais minerais, taninos e ácido fítico na amêndoa de baru (Dipteryx alata Vog.), fruta típica do Cerrado brasileiro. O presente estudo investigou a atividade antioxidante (AA) dos extratos aquoso e acetato de etila da amêndoa do baru in vitro bem como os efeitos do consumo desta amêndoa sobre o estresse oxidativo, induzido pela suplementação oral com ferro em ratos. A AA nos dois extratos foi avaliada por meio de três métodos: utilizou-se a reação de captura do radical livre (DPPH), o sistema β-caroteno/ácido linoleico e a reação de redução de ferro com o reagente 2,4,6-tripiridil-s-triazina (FRAP). A concentração de polifenóis totais foi determinada por espectrofotometria utilizando o reagente Folin-Ciocalteu. O estudo in vivo foi realizado em ratos machos Wistar, alimentados com a dieta AIN-93G, adicionada ou não de 10% de amêndoa de baru ou 1% de ácido fítico; e suplementados diariamente com ferro ou solução salina, por gavagem, durante 17 dias. As concentrações de malondialdeído (MDA), proteínas carboniladas (carbonil) e de ferro foram determinadas no fígado, coração e baço dos animais. A atividade específica das enzimas antioxidantes (catalase, glutationa peroxidase, glutationa redutase e glutationa-S-transferase) também foi determinada nesses tecidos. O teste T foi utilizado para comparar os resultados entre os grupos de ratos e entre os doisextratos da amêndoa de baru, utilizando-se p <0,05 como grau de diferença. O extrato aquoso da amêndoa de baru apresentou o maior teor de compostos fenólicos e a mais alta atividade antioxidante nos ensaios com FRAP e no sistema β-caroteno/linoleico. A suplementação de ferro reduziu o ganho de peso corporal, aumentou os níveis de ferro e MDA no fígado e no baço e aumentou o nível de proteínas carboniladas em todos os três tecidos analisados. O consumo da amêndoa de baru reduziu o nível de proteínas carboniladas no fígado, coração e baço dos animais suplementados com ferrro (p = 0,002, 0,012 e 0,036, respectivamente) e reduziu marginalmente a oxidação lipídica induzida pelo ferro no fígado (p = 0,117) e no baço (p = 0,074) dos animais. O ácido fítico reduziu o nível de proteínas carboniladas no baço (p= 0,020) e marginalmente no fígado (p= 0,098) dos ratos suplementados com ferro. O tratamento com amêndoa do baru ou a suplementação com ferro não alteraram de forma significativa a atividade específica das enzimas antioxidantes. Os resultados indicam que a suplementação oral de ferro aumentou os níveis de dano oxidativo a lipídios e proteínas, além de retratar um efeito protetor do baru e do ácido fítico contra o dano oxidativo causado pela suplementação com ferro. O ácido fítico da amêndoa de baru pode ser responsável por este efeito protetor; no entanto, outros compostos, podem estar envolvidos. Assim, o consumo da amêndoa do baru parece proteger o coração e os demais tecidos contra o estresse oxidativo induzido por dietas ricas ou suplementadas com ferro. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The protective effect of plant-based foods in human health has been attributed to the presence of bioactive compounds in all parts of the plants. A previous study found a high level of minerals, tannins and phytic acid in the baru nut (Dipteryx alata Vog.), which is a native fruit of the Brazilian savanna. This study investigated the antioxidant activity (AA) of the aqueous and ethyl acetate extracts of the baru nut and the effect of the consumption of this nut on the oxidative status of rats supplemented orally with iron. The AA was evaluated in vitro using the ferric reducing antioxidant power (FRAP), β-carotene/linoleic acid system and freeradical scavenging (DPPH) assays. The total polyphenol concentration was determined spectrophotometrically using the Folin–Ciocalteu reagent. The in vivo study was conducted in male Wistar rats that were fed an AIN-93M diet with or without 10% baru nut or 1% phytic acid and supplemented daily with iron or saline by gavages for 17 days. The liver, heart and spleen were collected for the determination of the malondialdehyde (MDA), carbonyl protein and iron concentrations. The specific activities of catalase, glutathione reductase, glutathione peroxidase and glutathione S-transferase were also determined in these tissues. A T test was used to compare the results among the rats groups and between the different baru nut extracts (pb0.05). The aqueous extract of the baru nut contained a higher level of phenolic compounds and a higher antioxidant activity, as measured by FRAP and the β-carotene/linoleic system, relative to the EtOAc extract. The iron supplementation reduced the body weight gain, increased the levels of iron and MDA in the liver and the spleen and increased the carbonyl levels in all three tissues. Consumption of the baru nut reduced the carbonyl levels in the liver, heart and spleen of the iron-supplemented rats (p=0.002, 0.012 and 0.036, respectively) relative to the heart carbonyl level of rats that were fed the control diet (p=0.000); it also marginally reduced the ironinduced lipid oxidation in the liver (p=0.117) and the spleen (p=0.074). Phytic acid reduced the carbonyl level in the spleen (p=0.020) and marginally reduced the carbonyl level in the liver (p=0.098) of ironsupplemented rats. These results demonstrated that the consumption of the baru nut protects tissues against iron-induced oxidative stress, and the phytic acid from the baru nut may be partially responsible for this protective effect; however, other compounds such as phenols may also be involved.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2012. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2012-10-18T15:12:54Z No. of bitstreams: 1 2012_TaissaCameloVilasBoas.pdf: 15858416 bytes, checksum: 36fdde7289b0856dbdcb37fb23a73b2a (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2012-10-22T12:00:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_TaissaCameloVilasBoas.pdf: 15858416 bytes, checksum: 36fdde7289b0856dbdcb37fb23a73b2a (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-22T12:00:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_TaissaCameloVilasBoas.pdf: 15858416 bytes, checksum: 36fdde7289b0856dbdcb37fb23a73b2a (MD5) / Atualmente observa-se um fenômeno global de declínios populacionais e extinção de espécies de anuros. Os padrões de movimentação e uso do espaço (e.g. migração e área de vida) são influenciados por inúmeros fatores que geram consequências fundamentais na organização social das populações. A compreensão desses fatores pode ajudar a entender e a buscar soluções para esses problemas. Nós utilizamos técnicas de marcação-captura-recaptura e carretel de rastreamento para investigar os fatores que afetam a movimentação diária, a área de uso, a migração e o uso do espaço em R. rubescens e R. schneideri na Estação Ecológica de Águas Emendadas, Distrito Federal. Não houve diferença no tempo de permanência na área de estudo entre os sexos, sugerindo a importância de outros fatores para explicar a razão sexual desviada para machos nas populações. As espécies apresentaram fidelidade de sítio, padrão comum observado em anfíbios terrestres. Rhinella schneideri apresentou maior movimentação diária, área de uso e distância de migração do que R. rubescens. A área de uso, porém, esteve relacionada ao tamanho corporal, independentemente da espécie e do número de capturas. A movimentação diária esteve positivamente relacionada ao tamanho corporal e à precipitação do dia anterior além de estar associada à espécie. A segregação espacial esteve relacionada principalmente a condições climáticas distintas do período reprodutivo de cada espécie e a características ambientais, em que Rhinella rubescens reproduziu na estação seca e utilizou principalmente ambientes aquáticos com vegetação e maior profundidade, enquanto R. schneideri reproduziu no início das chuvas e utilizou mais ambientes terrestres e água rasa sem vegetação, próxima às margens. Os resultados indicaram que R. schneideri é mais terrestre e apresenta maior capacidade de dispersão que R. rubescens, o que pode explicar a maior distribuição geográfica da primeira. Apesar das espécies pertencerem ao grupo Rhinella marina, apresentaram padrões diferentes na movimentação e uso do espaço, o que favorece sua coexistência em áreas do Cerrado.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2012. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2013-01-16T15:44:38Z No. of bitstreams: 1 2012_MauraRejaneAraujoMendes.pdf: 1489859 bytes, checksum: 1a47828f12caa83a766ae71217a203ad (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2013-01-22T11:18:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_MauraRejaneAraujoMendes.pdf: 1489859 bytes, checksum: 1a47828f12caa83a766ae71217a203ad (MD5) / Made available in DSpace on 2013-01-22T11:18:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_MauraRejaneAraujoMendes.pdf: 1489859 bytes, checksum: 1a47828f12caa83a766ae71217a203ad (MD5) / O Parque Nacional de Sete Cidades está localizado na região setentrional do Cerrado e possui 14,3% de sua extensão total ocupada por campo limpo, na forma de manchas, na maioria pequenas, circundadas por matrizes que envolvem duas ou mais fisionomias do Cerrado. Este trabalho teve como objetivo investigar a heterogeneidade espacial e temporal em comunidades desta fisionomia no Parque, bem como estabelecer relações com variáveis ambientais e espaciais. Outro aspecto abordado foi a relação fitogeográfica das áreas amostradas no Piauí com outros 16 levantamentos de comunidades úmidas dominadas por vegetação campestre no Cerrado (campo limpo úmido e vereda). Desta forma, a presente tese apresenta quatro capítulos: o 1º mostrou a visão geral dos campos no Parque através da investigação das características da vegetação e sua relação com as propriedades do solo; o 2º tratou das modificações ocorridas nessas áreas ao longo de três amostragens no tempo; o 3º abordou dois fragmentos representativos da fisionomia no Parque e sua relação com o ambiente e espaço e; o 4º investigou os padrões fitogeográficos através da comparação de áreas com esforço amostral semelhante, do Cerrado. O trabalho de campo teve início em julho de 2007, com a instalação de 17 linhas de 10 m em seis fragmentos de campo limpo úmido no Parque. No mesmo período, em 2009 e 2011, as áreas foram reinventariadas para efeito de comparação com o primeiro levantamento. Em adição, no ano de 2009 dois desses fragmentos dominados por Trachypogon spicatus (L. f.) Kuntze tiveram suas amostragens ampliadas, totalizando 15 linhas de 10 m em cada (denominados neste trabalho de campos A e B). Assim, os capítulos utilizaram esforços amostrais diferentes. Amostras superficiais simples (0 – 20 cm) de solo foram coletadas em todas as linhas. A partir das amostragens de 2009, a umidade no solo foi medida em três pontos por linha. Utilizou-se para amostragem da cobertura das espécies o método de interseção na linha. Cada linha foi subdividida em segmentos de 1 m, com varetas de ferro, que representaram as subunidades amostrais (SuA) para a análise da estrutura da vegetação, onde foram registradas a cobertura e a frequência relativas de cada espécie. A avaliação da estrutura da vegetação e a dinâmica, além da relação com o ambiente e com outras áreas de Cerrado do Brasil, foi realizada por meio de índices de riqueza, diversidade, similaridade, técnicas de análises de agrupamento e ordenação dos dados e regressões múltiplas. Foram caracterizados dois subtipos de comunidades de campo úmido no Parque, com base no período de alagamento em 2007, com separação evidente na análise Escalonamento Multidimensional Não Métrico (NMDS). O primeiro reuniu as áreas mais secas e o segundo as mais úmidas. Com relação à estrutura da vegetação, poucas espécies responderam pelas maiores coberturas relativas, com destaque para representantes de Poaceae e Cyperaceae. Um fato interessante foi a ausência de gramíneas exóticas invasoras nas áreas de campo limpo estudadas no Parque. Os resultados das três amostragens (2007, 2009 e 2011) sugeriram aparente condição de estabilidade nas áreas estudadas. Maiores mudanças na riqueza e diversidade de espécies foram registradas em 2009, provavelmente devido às chuvas muito acima da média para região em função do evento climático La Niña. Foram verificados, ainda, modelos similares de especialização funcional das espécies entre os inventários. As análises dos efeitos das propriedades do solo sugeriram associação com a determinação da vegetação nos campos do Parque, embora a partição da variância resultasse em pequeno percentual explicado por essas variáveis, quando considerados campos com condição mais homogênea das propriedades do solo (campos A e B). Outros eventos podem estar contribuindo com os padrões encontrados no Parque, como os efeitos do espaço, além de eventos estocásticos e outros não mensurados neste trabalho. Neste caso, a fração da variância não explicada pelo ambiente pode estar relacionada a fatores bióticos, por exemplo, os efeitos da dispersão em escalas finas, como já tratados na literatura. Em escalas amplas, foi verificada elevada substituição de espécies entre as áreas (diversidade beta). A análise das 18 áreas úmidas dominadas por vegetação campestre no Cerrado relacionou 581 espécies, onde 55,25% foram registradas em apenas um levantamento. O primeiro eixo da NMDS reuniu maior variação dos dados e captou melhor as diferenças geográficas nas áreas. Destas, duas estão localizadas no Parque Nacional de Sete Cidades (campos A e B) e as demais em áreas nas regiões Centro Oeste e Sudeste do Brasil. No geral, áreas próximas geograficamente foram agrupadas e determinadas pelas variáveis climáticas, especialmente precipitação e temperatura, aliadas aos efeitos do espaço. Além disso, a partição de variância nesta escala de estudo, realizada a partir de modelos de regressão múltipla, sugeriu que as variáveis ambientais ditaram conjuntos florísticos particulares entre as áreas. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Sete Cidades National Park is located in the northern Cerrado region and has 14.3% of its total size covered by grassland, in the form of mostly small patches surrounded by matrices involving two or more Cerrado physiognomies. This study aimed to investigate spatial and temporal heterogeneity in communities in the park bearing such features, as well as establish relationships with environment and space variables. A further issue addressed was the phytogeographic relationship in the areas sampled in Piaui with other surveys of 16 communities where Cerrado wet grassland vegetation prevails (grasslands and swampy plains). Thus, the present thesis is divided into four chapters: chapter 1 is an overview of the grasslands in the park through the investigation of its vegetation characteristics and their relationship to soil properties; chapter 2 addresses changes in these areas that occurred over time in the three samples; chapter 3 focuses on two fragments representing the park’s physiognomy and its relationship with the environment and space; and chapter 4 investigates phytogeographic patterns by comparing areas with a similar sampling effort in the Cerrado. Fieldwork began in July 2007 with the setting up of 17 lines of 10 meters in length in six fragments of moist grassland in the Park. In the same month in 2009 and 2011, the areas were again surveyed for comparison with the first survey. In addition, the sampling of two of these fragments dominated by Trachypogon spicatus (L. f.) Kuntze was expanded in 2009, totaling 15 lines of 10 m each (referred to in this study as fields A and B). Thus, the chapters have used differente sampling efforts. Simple soil surface samples (0 - 20 cm) were collected on all lines. From the 2009 sampling, soil moisture was measured at three points per line. The line-intercept method was employed for species cover sampling. Each line was divided with iron rods into 1-m segments, which represented the sample subunits (SuA) for vegetation structure analysis in which were recorded the relative cover and relative frequency of each species. The assessment of vegetation structure and dynamics and the relationship with the environment and with other areas of the Brazilian Cerrado was conducted by means of richness, diversity and similarity indices, as well as cluster analysis, data sorting and multiple regression techniques. Two subtypes of wet grassland communities in the park were characterized based on the 2007 flooding, with evident separation in the Non-Metric ultidimensional Scaling (NMDS) analysis. The first comprised the drier areas and the second the wetter ones. With regard to vegetation structure, few species accounted for the higher relative coverage, especially representatives of the Poaceae and Cyperaceae families. A remarkable fact was the absence of invasive exotic grasses in the grassland areas studied in the park. The results of three samples (2007, 2009 and 2011) suggested the structure had been maintained over time, with an apparent stability condition in the studied areas. Major changes in species richness and diversity were recorded in 2009, probably due to a rainfall well above average for the region due to the La Nina weather event. Similar species function specialization models were also cross-checked between inventories. The analyses of soil property effects suggested an association with the determination of grassland vegetation in the park, although variance partition had yielded a low percentage attributable to these variables when fields of more homogeneous soil properties were considered (fields A and B). Other events may be contributing to the patterns found in the park, such as the effects of space and stochastic events, among others not assessed in this study. In this case, the fraction of variance not explained by the environment may be related to biotic factors, like the effects of fine scale dispersion, as the literature has already addressed. On large scales, there was high turnover of species between areas (beta diversity). The analysis of the 18 wetlands dominated by grassland vegetation in the Cerrado selected 581 species, where 55.25% were recorded in one survey alone. The first NMDS axis showed greater data variation and best captured the differences in geographical areas. Of these, two are located in the Sete Cidades National Park (fields A and B) and the remainder in areas in the Center-West and Southeast regions of Brazil. In general, areas geographically close to each other were grouped and categorized by climatic variables, especially rainfall and temperature, combined with spatial effects. Furthermore, the variance partition on this research scale, conducted from multiple regression models, suggested that environmental variables dictated particular floristic sets across those areas.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Departamento de Nutrição, 2012. / Texto parcialmente liberado pelo autor. Conteúdo restrito: Metodologia, Resultados e Discussão. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2013-04-29T11:33:19Z No. of bitstreams: 1 2012_LiviaPimenteldeSantAnaDourado_Parcial.pdf: 1181395 bytes, checksum: 33e9cc488aaa873a718b874f3559a2e9 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-04-29T12:19:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_LiviaPimenteldeSantAnaDourado_Parcial.pdf: 1181395 bytes, checksum: 33e9cc488aaa873a718b874f3559a2e9 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-04-29T12:19:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_LiviaPimenteldeSantAnaDourado_Parcial.pdf: 1181395 bytes, checksum: 33e9cc488aaa873a718b874f3559a2e9 (MD5) / Introdução e objetivo: O consumo de frutas e hortaliças tem sido inversamente associado à incidência de doença crônicas e ao processo de envelhecimento. Esse potencial protetor parece estar associado à presença, nesses alimentos, de compostos bioativos que exercem atividade antioxidante, reduzindo a geração de espécies reativas, causadores de danos oxidativos celulares. Na literatura, os poucos relatos acerca do potencial antioxidante de frutos do Cerrado apontam esses como uma boa fonte de agentes antioxidantes. O objetivo do presente trabalho foi avaliar in vitro o potencial antioxidante de doze frutos do cerrado e testar a hipótese que o tucum, fruto que apresentou alto teor de fenólicos totais e potencial antioxidante, quando consumido in natura é capaz de proteger os tecidos contra danos oxidativos gerados pelo excesso de ferro. Metodologia: Estudo in vitro. O conteúdo de fenólicos totais dos extratos aquoso e acetato etílico de 9 frutos (araticum - Annona crassiflora Mart.; cagaita - Eugenia dysenterica DC.;; ingá - Inga laurina Willd.; jatobá-do-cerrado - Hymenaea stigonocarpa Mart.; jenipapo - Genipa americana L.; jurubeba - Solanum paniculatum L.; lobeira - Solanum grandiflorum Ruiz & Pav.; mangaba - Hancornia speciosa Gomes; e tucum do cerrado - Bactris setosa Mart); 1 pseudofruto (cajuzinho-do-cerrado - Anacardium humile) e 1 caule (guariroba - Syagrus oleracea Mart. Becc.) típicos do cerrado foi determinado pelo método de Folin Ciocateau. Estudo in vivo. Vinte e quatro ratos Wistar machos foram tratados durante 30 dias com uma das seguintes dietas: (Controle) AIN-93G; (Fe) AIN-93G + 350 mg / kg de ferro; (Tu) AIN- 93G + 15% de tucum; (FeTu) AIN-93G + 350 mg / kg de ferro + 15% de tucum. O fígado, baço, coração, intestino, rim e cerébro foram retirados para determinação dos níveis de malondialdeído (MDA); proteínas carboniladas e concentração de ferro. A atividade específica das enzimas antioxidantes catalase (CAT), glutationa redutase (GR), glutationa peroxidase (GPX), glutationa-s-transferase (GST) e da enzima oxidante NADPH oxidase foi também determinada nesses órgão. O potencial antioxidante total do soro foi determinado pelo método do potencial de redução do Fe (Ferric Reducing Ability of Plasma – FRAP). A análise estatística dos dados foi feita pelo teste T amostras independentes utilizando o programa SPSS, com nível de significância considerado de p ≤ 0,05. Resultados: Todos os extratos aquosos, a exceção daquele obtido da lobeira, apresentaram maior concentração de fenólicos totais, quando comparados aos extratos de acetato etílico. Os extratos de acetato etílico da lobeira, jenipapo, araticum e tucum apresentaram maior valor de fenólicos totais (1.166 ± 98; 651 ± 61; 580 ± 143; 540 ± 92 mg TAE / 100 g fruto seco), quando comparados ao extrato de maçã (151 ± 26 mg TAE / 100 g fruto seco). No caso dos extratos aquosos o tucum, ingá, jurubeba, cagaita, araticum, jenipapo, mangaba e cajuzinho (3.343 ± 664; 1.506 ± 55; 1.352 ± 226; 1.203 ± 53; 1.095 ± 159; 1.015 ± 62; 842 ± 60 e 455 ± 55 mg TAE / 100 g seco) apresentaram valores de fenólicos totais maiores que os valores da maçã (273 ± 15 mg TAE / 100 g seco). Em relação ao estudo in vivo, a suplementação de ferro diminuiu o consumo de dieta (p = 0,038), aumentou a concentração de ferro e MDA no fígado (p = 0,000 e 0,002, respectivamente) dos ratos Fe, quando comparados ao grupo Controle. No intestino, o grupo Fe apresentou maior concentração de ferro e o grupo Tu menor, quando comparados ao Controle (p = 0,011 e 0,019, respectivamente). Enquanto no grupo FeTu, o teor foi marginalmente maior que o grupo Fe e igual ao Controle (p = 0,095 e 0,170, respectivamente). Não foram observadas diferenças na concentração de proteína carbonilada nos diversos tecidos entre os grupos estudados. O consumo de tucum reduziu os níveis de MDA no fígado dos animais suplementados com ferro (grupo FeTu) em relação ao grupo Fe (p = 0,013), e aumentou o poder redutor do soro, tanto na presença quanto na ausência da suplementação de ferro, grupos Tu e FeTu, em relação ao grupo Controle (p = 0,006 e 0,011, respectivamente). A enzima GPX apresentou maior atividade no intestino, enquanto a GST no rim dos ratos suplementados com ferro em relação ao Controle (p = 0,046 e 0,043, respectivamente). A catalase, GR e GST tiveram a atividade diminuída no grupo FeTu, quando comparadas ao grupo Fe (p = 0,033; 0,014 e 0,018) no rim. Conclusão: O alto teor de fenólicos totais do extrato aquoso de tucum, associado ao maior potencial redutor do soro dos animais tratados com esse fruto, demonstra que o tucum possui potencial antioxidante. Apesar do fino mecanismo de regulação dos níveis endógenos de ferro do organismo, sua suplementação dietética pode resultar em sobrecarga no tecido de armazenamento e consequente aumento de danos oxidativos a lipídeos. O consumo de tucum in natura associado à dieta parece proteger o organismo de ratos contra danos oxidativos catalisados por ferro. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Background and aim: The consumption of fruits and vegetables has been inversely associated with the incidence of chronic disease and the aging process. This protective potential appears to be associated with the presence of bioactive compounds in these foods that exert antioxidant activity, reducing the generation of reactive species, which cause cellular oxidative damage. In the literature, few reports about the antioxidant potential of the Cerrado fruits point as a good source of antioxidants agents. The aim of this study was to evaluate the antioxidant potential of twelve fruits of cerrado in vitro and test the hypothesis that tucum, fruit that had high total phenolic content and antioxidant potential in vitro, when consumed in natura can protect tissues against oxidative damage generated by excess of iron. Methods: Study in vitro. The total phenolic content of aqueous and ethyl acetate extracts of 9 fruits (araticum - Annona crassiflora Mart.; cagaita - Eugenia dysenterica DC.; ingá - Inga laurina Willd.; jatobá-do-cerrado - Hymenaea stigonocarpa Mart.; jenipapo - Genipa americana L.; jurubeba - Solanum paniculatum L.; lobeira - Solanum grandiflorum Ruiz & Pav.; mangaba - Hancornia speciosa Gomes; and tucum do cerrado - Bactris setosa Mart); 1 pseudofruit (cajuzinho-do-cerrado - Anacardium humile) and 1 palm (guariroba - Syagrus oleracea Mart. Becc.) typical of cerrado was determined by Folin Ciocateau method. Study in vivo. Twenty-four male Wistar rats were treated for 30 days with one of the following diets: (Control) AIN-93G; (Fe) AIN-93G + 350 mg / kg of iron; (Tu) AIN-93G + 15% tucum; (FeTu) AIN-93G + 350 mg / kg iron + 15% tucum. The liver, spleen, heart, intestine, kidney and brain were removed to determine the levels of malondialdehyde (MDA), carbonyl protein and iron concentration. The specific activity of the antioxidant enzymes catalase (CAT), glutathione reductase (GR), glutathione peroxidase (GPX), glutathione-s-transferase (GST) and the oxidant enzyme NADPH oxidase was also determined in these tissues. Total Serum Antioxidant Potential was determined by the method of ferric reducing antioxidant power (Ferric Reducing Ability of Plasma - FRAP). The statistical analysis was performed by independent samples T-test using SPSS (version 19.0, SPSS Inc., Chicago, IL, USA). Results: All aqueous extracts, except that obtained from lobeira, had higher concentration of total phenolics compared to the ethyl acetate extracts. The total phenolic content of ethyl acetate extracts of lobeira, jenipapo, araticum and tucum was higher (1,166 ± 98, 651 ± 61, 580 ± 143, 540 ± 92 mg TAE / 100 g dry fruit) than that obtained for apple extract (151 ± TAE 26 mg / 100 g dry fruit). In the case of aqueous extracts, the tucum, ingá, jurubeba, cagaita, araticum, jenipapo, mangaba and cajuzinho (3,343 ± 664; 1506 ± 55, 1352 ± 226, 1203 ± 53, 1095 ± 159; 1015 ± 62, 842 ± 60 and TAE 455 ± 55 mg / 100 g dry fruit) showed values higher than the total phenolic of apple extract (273 ± 15 mg TAE / 100 g dry fruit). Regarding the in vivo study, the iron supplementation decreased the consumption of diet (p = 0.038), increased the concentration of iron and MDA in the liver (p = 0.000 and 0.002, respectively) of the rats of Fe group compared to Control group. In the intestine, the Fe group showed higher iron concentration and the Tu group lower compared to control (p = 0.011 and 0.019, respectively), while in FeTu group the content was marginally higher than the Fe group and equal to the Control (p = 0.095 and 0.170 respectively). There were no differences in the concentration of carbonyl protein in the different tissues between the groups of study. The consumption of tucum reduced MDA levels in the liver of animals supplemented with iron (group FeTu) compared to Fe group (p = 0.013), and increased the reducing power of serum in the presence and absence of iron supplementation, Tu and FeTu groups, compared to the Control group (p = 0.006 and 0.011, respectively). The enzyme GPX showed higher activity in the intestine, while the GST in the kidney of rats supplemented with iron compared to Control (p = 0.046 and 0.043, respectively). The specific activity of CAT, GR and GST decreased in the FeTu group compared to the Fe group (p = 0.033, 0.014 and 0.018) in the kidney. Conclusion: The high content of total phenolic in aqueous extract of tucum, associated with the greatest reducing potential of serum of the animals treated with this fruit, demonstrates that tucum has antioxidant potential. Despite the fine mechanism of endogenous iron levels regulation, their dietary supplementation can result in overload in the storage tissues and a consequent increase in oxidative damage to lipids. The consumption of tucum in natura associated to the diet seems to protect the organisms of rats against oxidative damage catalyzed by iron.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2013. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2013-06-14T14:02:36Z No. of bitstreams: 1 2013_PaulaTavares.pdf: 2071642 bytes, checksum: dc5f3b1ef02c162114ac1a5acfa84afd (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-06-17T11:16:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_PaulaTavares.pdf: 2071642 bytes, checksum: dc5f3b1ef02c162114ac1a5acfa84afd (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-17T11:16:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_PaulaTavares.pdf: 2071642 bytes, checksum: dc5f3b1ef02c162114ac1a5acfa84afd (MD5) / O solo do Cerrado brasileiro tem sido o foco de poucos estudos sobre sua diversidade microbiana. O solo é um habitat com uma grande diversidade de microrganismos e, assim, ele pode ser usado como uma fonte de enzimas industriais. A identificação de novos genes através da abordagem metagenômica, trouxe vantagens ao desenvolvimento de enzimas com novas atividades. Lipases são um importante grupo de enzimas com várias aplicações biotecnológicas nas industrias de detergente, alimentos, indústrias farmacêuticas e de biocombustível. Para isolar os genes putativos de lipase com tamanho pequeno de DNA (8 kb), foi realizado screening na biblioteca metagenômica de solo de cerrado com substrado de tributirina. A triagem funcional desta biblioteca resultou na identificação de três clones com actividade lipolitica, que foram devidamente sequenciados. Eles revelaram 4 ORFs com funções relacionadas à atividade lipolítica. Duas das enzimas lipolíticas isoladas da biblioteca de pequenos fragmentos de solo de Cerrado tiveram a sua expressão induzida em E. coli BL21 (DE3), sendo nomeadas LipWorfW e LipYorfY. As ORFs tem 1000 pb e codificam para 2 proteínas contendo 300 resíduos de aminoácidos com um peso molecular estimado de 30 kDa para a proteína LipWorfW e 33 kDa para a proteína LipYorfY e identidade com lipases verdadeiras. Resultado de gel de eletroforese SDS- PAGE demonstram a superexpressão destas enzimas. A determinação de sua atividade ideal e os parâmetros enzimáticos vao levar a uma análise bioquímica detalhada a fim de propor a utilização deste produto em aplicações de biodiesel, com foco na melhoria dos processos de produção. Considerando a aplicação potencial biotecnológico destas enzimas, este trabalho visa a seleção e caracterização de lipases três novos genes da biblioteca metagenômica de solo da savana vegetação adequadas para uso na produção de biodiesel. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Brazilian Cerrado soil has been the focus of very few studies about its microbial diversity. Soil is a habitat with high diversity of microorganisms and thus it can be used as a source of industrial enzymes. The identification of new genes through the metagenomic approach led to the development novel enzyme activities. The advantage of directly screening for enzymatic activities from metagenome libraries is that researchers access previously unknown genes and their encoded enzymes. Lipases are an important group of relevant enzymes as they find immense biotechnologically applications in food, detergent, pharmaceutical and biofuel industries. Lipases are mainly produced by microbes, more frequently bacterial, and play a vital role in commercial ventures. To isolate putative lipase genes a small DNA size (8 Kb), Cerrado soil metagenomic libraries were screened with tributirin. The funcional screening of this library resulted in the identification of three lipase activity producing clones that were subsequently sequenced. They revealed 4 ORFs with functions related to lypolitic activity. Two lipolytic enzymes from the small DNA fragments library of Cerrado soil was isolated and their expression induced in E. coli strain BL21 (DE3), being named LipWorfW and LipYorfY. The open reading frame have 1000 pb and encodes a protein containing 300 amino acid residues with estimated molecular weight of 30 kDa for the LipWorfW protein and 33 kDa for the LipYorfY protein and strong identity with true lipases. SDS-PAGE gel electrophoresis demonstrates the overexpression of that lipase on inducing conditions. The determination of their optimal activity and enzymatic parameters will lead to more detailed biochemical analysis, in order to propose the use of this product in biodiesel applications, with focus on improvement of production processes. Considering the potential biotechnological application of these enzymes, this work aims at the selection and characterization of 3 novel lipases genes from metagenomic library from soil from savannah-like vegetation suitable for use in biodiesel production.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-06-18T14:26:43Z No. of bitstreams: 1 2013_ThiagoRodriguesdeOliveira.pdf: 2410520 bytes, checksum: 221bc54b5d81ce06a0e95ba2fa2d105d (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-06-18T15:21:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_ThiagoRodriguesdeOliveira.pdf: 2410520 bytes, checksum: 221bc54b5d81ce06a0e95ba2fa2d105d (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-18T15:21:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_ThiagoRodriguesdeOliveira.pdf: 2410520 bytes, checksum: 221bc54b5d81ce06a0e95ba2fa2d105d (MD5) / O domínio Archaea possui características em comum com os domínios Bacteria e Eukarya, e ao mesmo tempo apresenta características próprias. Até o momento, são raros os estudos sobre a filogenia e diversidade de archaeas de ambientes naturais do Brasil e, por esta razão, este trabalho tem como objetivo avaliar a diversidade de Archaea em sedimentos de lagoas do cerrado em diferentes estações, por meio da caracterização de genes de rRNA 16S. Amostras de sedimentos lacustres, coletadas em diferentes lagoas do Parque Nacional das Sempre Vivas, foram submetidas à extração de DNA total e o DNA foi utilizado em experimentos de PCR empregando os pares de iniciadores 340f/1000r ou 21f/958r, específicos para o domínio Archaea. Os fragmentos amplificados foram clonados em um vetor plasmidial e transformados em E. coli. O DNA plasmidial de clones recombinantes foi extraído, quantificado e submetido ao sequenciamento automático. Em uma das amostras, proveniente da Lagoa Rio Preto Alto (LRPA), observamos um grande predomínio de membros do filo Euryarchaeota, especialmente metanogênicos. Nos demais sedimentos, coletados na bacia Baixo Inhancica (RIB4 e RIB5) foi observado um predomínio de sequências do filo Thaumarchaeota sobre os filos Euryarchaeota e Crenarchaeota na estação seca, mas ainda foi possível observar sequências do filo Euryarchaeota. Na estação de transição seca/chuvosa, não foram encontradas sequências do filo Euryarchaeota e houve quase exclusivamente sequências do filo Thaumarchaeota. As estimativas de alfa-diversidade mostraram uma maior riqueza da comunidade de Archaea nos sedimentos coletados na estação seca e as curvas de rarefação indicaram que a amostragem dos ambientes foi adequada. As amostras de estações diferentes apresentaram diferenças significativas pelas técnicas de beta-diversidade ∫-Libshuff e gráfico de Análise de Componentes Principais (PCA). _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Archaea domain has characteristics in common with the Bacteria and Eukarya domains, while presenting unique traits. Currently there are few studies on the phylogeny and diversity of Archaea in Brazilian environments; therefore, this study’s objective is to estimate the diversity of Archaea communities in lake sediments of the Brazilian Savannah, Cerrado, in different seasons by rRNA 16S analysis. Lake sediment samples, obtained from different lakes in the park “Parque Nacional das Sempre Vivas”, were submitted to DNA extraction, which was used in PCR assays using archaea-specific primers 340f/1000r or 21f/958r. The amplified fragments were cloned into E. coli. Plasmid DNA was extracted, quantified and submitted to standard sequencing procedures. In one of the samples, collected in the lake “Lagoa Rio Preto Alto” (LRPA), we were able to observe a high number of sequences affiliated to Euryarchaeota, especially methanogens. In the sediments collected in the Baixo Inhancica bay (RIB4 and RIB5), in the dry season members of the Thaumarchaeota phylum predominated over the other phyla. It was still possible to detect members of the Euryarchaeota phylum though. In the sediments collected in the transition period between the dry and rainy seasons we were not able to detect sequences affiliated to Euryarchaeota and there were almost exclusively sequences of the Thaumarchaeota phylum. The α-diversity estimates showed that the communities of Archaea in sediments collected in the dry season had higher richness and the non-parametric estimates showed that both the environments have been well sampled. There is a significant difference between the sediment samples collected in different seasons, shown by the statistical test ∫-Libshuff and by the Principal Component Analysis graphic (PCA).

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-07-02T15:05:40Z No. of bitstreams: 1 2013_FranciscodasChagasRoqueMachado.pdf: 1731280 bytes, checksum: 213eefeca4346d8f65ae796861672662 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-07-02T15:53:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_FranciscodasChagasRoqueMachado.pdf: 1731280 bytes, checksum: 213eefeca4346d8f65ae796861672662 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-07-02T15:53:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_FranciscodasChagasRoqueMachado.pdf: 1731280 bytes, checksum: 213eefeca4346d8f65ae796861672662 (MD5) / Atualmente, uma das maiores ameaças à biodiversidade é a fragmentação de áreas naturais. Nesse contexto, as populações remanescentes desse processo podem formar metapopulações, cuja manutenção no longo prazo é assegurada através da dispersão de indivíduos das diferentes subpopulações. Atualmente a Teoria de Metapopulações inclui uma variedade de definições, bem como de populações espacialmente estruturadas cuja preservação demanda medidas específicas. Visando contribuir para uma maior difusão dessa teoria, (1) foi avaliado o seu uso na Região Neotropical mediante a análise da literatura publicada até o ano de 2012 e (2) foram investigadas a estrutura e a dinâmica metapopulacional de duas espécies de drosofilídeos associadas a matas de galeria do Cerrado: Drosophila willistoni e D. paulistorum. Adicionalmente, (3) foram quantificadas as variações na composição das assembleias de drosofilídeos no tempo e no espaço. Este estudo revelou que a maioria dos artigos produzidos para a região Neotropical utilizou a Teoria de Metapopulações de forma imprecisa e não empregou os critérios pertinentes de classificação de metapopulações. Análises das observações de campo realizadas em 17 fragmentos de matas de galeria do DF ao longo de quatro ocasiões amostrais sugerem que D. willistoni e D. paulistorum preenchem bem os critérios de uma metapopulação clássica, cujas dinâmicas foram fortemente influenciadas pelo tempo e, em menor proporção, pelo isolamento das matas. A composição de espécies das assembleias de drosofilídeos nos 17 fragmentos de matas também flutuou no tempo e no espaço. Em resumo, nossos dados mostraram que os drosofilídeos associados a matas de galeria estão adaptados às flutuações ambientais típicas do Cerrado e que considerados no atual contexto da biodiversidade servem de evidência para a conservação de recursos ambientais desprotegidos ou para a manutenção daqueles protegidos. Por fim, sugerimos que a Teoria de Metapopulações receba mais atenção por parte dos pesquisadores e tomadores de decisões, tendo em vista sua importância para o manejo de espécies fragmentadas.