Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-04-17T12:07:12Z No. of bitstreams: 1 2012_SilvioPereiradosSantos.pdf: 1725522 bytes, checksum: fdc8f44e2191e34f2791175ecc8f4b2c (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-05-02T11:30:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_SilvioPereiradosSantos.pdf: 1725522 bytes, checksum: fdc8f44e2191e34f2791175ecc8f4b2c (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-02T11:30:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_SilvioPereiradosSantos.pdf: 1725522 bytes, checksum: fdc8f44e2191e34f2791175ecc8f4b2c (MD5) / Registros arqueológicos indicam que o amendoim foi domesticado por índios há pelo menos 3.500 anos na América do Sul. O amendoim (Arachis hypogaea L.) pertence à família Fabaceae, subfamília Faboidea. O gênero Arachis é composto por cerca de 80 espécies, todas endêmicas da América do Sul. O Brasil se destaca por reunir todas as secções e a maioria das espécies. As espécies silvestres, mais próximas ao amendoim cultivado são quase todas diploides e são classificadas em genomas A, B e D. O grupo de genoma B (B lato sensu) foi recentemente dividido em três subgrupos: B sensu stricto, F e K. O amendoim cultivado é um tetraploide, com dois componentes genômicos distintos, cada um com 10 pares de cromossomos, A e B. As espécies com genomas A e B lato sensu são de maior interesse na busca de genes úteis para introgressão, por possuírem genomas semelhantes aos do amendoim cultivado. A utilização de espécies selvagens como fonte de resistência a pragas e doenças tem mostrado ser uma promessa para muitas culturas. Neste trabalho, um número de espécies silvestres diploides com genomas A, B sensu stricto, K, alotetraploides e cultivares de amendoim foram testados quanto à resistência contra a ferrugem (Puccinia arachidis), uma das mais importantes doenças fúngicas do amendoim. Os bioensaios foram feitos usando a técnica da folha destacada. Com exceção das cultivares controles e de uma das espécies silvestres (A. ipaënsis), todos os outros genótipos avaliados mostraram-se resistentes. Os acessos A. gregoryi V6389, A. duranensis SeSn2848, A. stenosperma V10309, A. duranensis V14167, A. villosa V12812, foram os mais resistentes. Híbridos foram produzidos a fim de introgredir genes de resistência a doenças, das espécies silvestres para o amendoim cultivado. No entanto, a hibridação direta entre amendoim cultivado, que é um tetraploide, e as espécies silvestres diploides produz híbridos triploides estéreis. Para superar essa barreira de infertilidade, um esquema de hibridação conhecido como "a rota tetraploide" foi usado. Híbridos interespecíficos foram obtidos entre espécies de genomas A e B lato sensu. Foram feitos cruzamentos entre as espécies, utilizando combinações B x A. No total, 90 híbridos estéreis AB foram obtidos, e foi confirmada a hibridação pela utilização de marcadores moleculares. Estes híbridos AB eram estéreis. Estacas destes híbridos foram tratadas com colchicina para induzir duplicação cromossômica e recuperar a fertilidade. O objetivo foi produzir um genoma tetraploide fértil que é sexualmente compatível com o amendoim cultivado. A restauração da fertilidade foi confirmada com o surgimento de uma estrutura, ginóforo (uma extensão do ovário fecundado), após a floração. No total, 75 plantas resultantes dos cruzamentos A. ipaënsis KG30076 x A. villosa V12812, A. batizocoi K9484 x A. stenosperma V10309, A. batizocoi K9484 x A. duranensis SeSn2848, A. batizocoi K9484 x A. duranensis V14167e A. gregoryi V6389 x A. stenosperma V10309, recuperaram a fertilidade e produziram 2259 sementes viáveis. A fim de confirmar que os híbridos tinham o número esperado de cromossomos, análise citogenética foi feita. Para a detecção de bandas cromossômicas heterocromáticas foi utilizado DAPI, que apresenta afinidade para os nucleotídeos adenosina e timina. O número tetraploide esperado com 40 cromossomos foi confirmado em uma quantidade representativa das combinações híbridas. Híbridos alotetraploides foram cruzados com cultivares das duas subespécies de A. hypogaea: A. hypogaea subsp. hypogaea (Runner e Caiapó) e A. hypogaea subsp. fastigiata (BR1, Senegal e Havana). A fertilidade e a produção de sementes, a produção de ginóforos em relação ao número de flores polinizadas, o tempo decorrido entre a emergência do ginóforo e sua frutificação, e a produção total de ginóforos foram registrados, permitindo que as características de cruzabilidade dos genótipos fossem inferidas. Todas as combinações do cruzamento [amendoim cultivado x alotetraploides] produziram sementes F1 viáveis, embora com fertilidades diferentes. A caracterização citogenética do híbrido resultante do cruzamento de A. hypogaea com o alotetraploides [A. batizocoi K9484 x A. stenosperma V10309]4x foi também realizada. Observações com DAPI e GISH confirmaram a presença de 40 cromossomos. Os cromossomos mostraram a hibridação esperada e padrões de bandas característicos do genoma B (banda heterocromática ausente) e dos genomas A e K (bandas heterocromáticas positivas de DAPI na região do centrômero), representando o cariótipo 2n=4x (2A + 1B + 1K). Os resultados obtidos são promissores e indicam o potencial de novas combinações alélicas das espécies silvestres a serem introgredidas nas cultivares de A. hypogaea. _______________________________________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Archeological registers indicate that the peanut was first domesticated by South American Indians about 3.500 years ago. The peanut (Arachis hypogaea L.) belongs to the family Fabaceae, subfamily Faboidea. The genus Arachis is composed by nearly 80 species, all endemic from South America. Brazil gathers all the sections and most of the species. The wild species, which are closer to the cultivated peanut, are classified in the A, B and D genomes and are almost all diploids. The group which contains the B genome (B lato sensu) was recently divided in three subgroups: B sensu stricto, F e K. The cultivated peanut is a tetraploid, with two different genomic components, each one with 10 pairs of chromosomes, A and B. The species with genomes A and B lato sensu are the ones of a greater interest in the search of useful genes for the introgression because their genomes are similar to the cultivated peanut ones. The use of wild species as a source of resistance to pests and diseases has been affirmed as a promise for many cultures. In this work, a number of diploid wild species with genomes A, B sensu stricto, K, alotetraploids and varieties of peanut were tested to the resistance to the rust (Puccinia arachidis), one of the most important diseases in the peanut. The biotests were made using the detached leaf technique. Excluding the control varieties and one of the wild species (A. ipaënsis), all the other analyzed genotypes were resistant. The accesses A. gregoryi V6389, A. duranensis SeSn2848, A. stenosperma V10309, A. duranensis V14167, A. villosa V12812, were the most resistant. Hybrids were produced to insert resistance to disease genes from the wild species to the cultivated peanut. However, the direct hybridization between cultivated peanut – a tetraploid – and the wild diploid species produce hybrids sterile triploids. To overcome this infertility barrier, a hibridization plan – known as ―tetraploid route" – was used. Interspecific hybrids were obtained between species of genomes A and B lato sensu. Crossings were made between the species, using combinations B x A. In total, 90 sterile hybrids AB were obtained, and it was confirmed the hybridization by use of molecular markers. These hybrids AB were sterile. Poles of these hybrids were treated with colchicine to induce chromosomal duplication and regain the fertility. The objective was to produce a tetraploid fertile genome sexually compatible to the cultivated peanut. The restoration of fertility was confirmed with the appearance of a structure – gynophore (an extension of the impregnated ovary) – after blooming. In total, 75 plants, originated from the crossings A. ipaënsis KG30076 x A. villosa V12812, A. batizocoi K9484 x A. stenosperma V10309, A. batizocoi K9484 x A. duranensis SeSn2848, A. batizocoi K9484 x A. duranensis V14167e A. gregoryi V6389 x A. stenosperma V10309, recovered the fertility and produced 2259 viable seeds. In order to confirm that the hybrids had the expected number of chromosomes, a cytogenetic analysis was made. To detect the heterochromatic chromosomic bands, DAPI was used, which indicates the affinity for the nucleotides adenosine and timine. The expected number tetraploid with 40 chromosomes was confirmed in a representative number of the hybrid combinations. Alotetraploid hybrids were crossed with varieties of the two subspecies of A. hypogaea: A. hypogaea subsp. hypogaea (Runner e Caiapó) and A. hypogaea subsp. fastigiata (BR1, Senegal e Havana). The fertility and the production of seeds, the production of gynophores in relation to the number of pollinated flowers, the elapsed time between the gynophore emergency and its fructification and the total production of gynophores were registered, allowing the deduction of the crossing characteristics of the genotypes. All the combinations of the crossing [cultivated peanut x alotetraploids] produced viable F1 seeds, although with different fertilities. The cytogenetic characterization of the hybrid resultant to the crossing of A. hypogaea with the alotetraploids [A. batizocoi K9484 x A. stenosperma V10309]4x was also made. Observations with DAPI and GISH confirmed the presence of 40 chromosomes. The chromosomes showed the expected hybridization and patterns of bands characteristics from genome B (absent heterochromatic band) and from the genomes A and K (heterochromatic positive bands of DAPI in the centromere region), representing the karyotype 2n=4x (2A + 1B + 1K). The results obtained are promising and indicate the potential of new allelic combinations of wild species to be introduced in varieties of A. hypogaea.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Centro de Desenvolvimento Sustentável, 2008. / Submitted by Diogo Trindade Fóis (diogo_fois@hotmail.com) on 2009-10-01T11:57:35Z No. of bitstreams: 1 2008_RicardoJoseCalemboMarra.pdf: 5818208 bytes, checksum: ca7da1e082ecc421a884ac15be853f81 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2009-10-07T16:28:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_RicardoJoseCalemboMarra.pdf: 5818208 bytes, checksum: ca7da1e082ecc421a884ac15be853f81 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-10-07T16:28:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_RicardoJoseCalemboMarra.pdf: 5818208 bytes, checksum: ca7da1e082ecc421a884ac15be853f81 (MD5) Previous issue date: 2008-12-15 / Qual a base científica utilizada para classificar cavernas no Brasil? Os critérios de relevância e os atributos são suficientes na classificação de cavidades naturais subterrâneas? Para responder a essas questões foram selecionadas 1.169 cavernas separadas como amostra do universo de 6.522 cavidades naturais subterrâneas conhecidas e cadastradas no Brasil. Para cada caverna amostrada foi preparado um questionário (survey) com 20 perguntas, sendo 16 questões alusivas aos critérios de relevância, três para os atributos de qualidade e uma para o contexto, quesitos exigidos pela legislação ambiental. Os 16 critérios de relevância (variáveis independentes) foram assim estabelecidos: dimensão, morfologia, valores paisagísticos, peculiaridades geológicas, peculiaridades geomorfológicas, peculiaridades mineralógicas, vestígios arqueológicos, vestígios paleontológicos, recursos hídricos, ecossistemas frágeis, espécies endêmicas, espécies raras, espécies ameaçadas de extinção, diversidade biológica, relevância histórico-cultural e relevância socioeconômica. Para cada um desses critérios de relevância foram estabelecidos seis graus de relevância assim definidos: informação desconhecida, irrelevante, baixa, média, alta e de notável relevância. Nos atributos de qualidade (variáveis dependentes) foram definidas seis categorias: ecológico, ambiental, cênico, científico, histórico-cultural e socioeconômico. Finalmente, o questionário indagou quatro categorias de contexto: local, regional, nacional e internacional. Os questionários foram respondidos por 11 especialistas, profissionais com larga experiência e grande conhecimento no campo da espeleologia. Os resultados obtidos nas respostas dos especialistas foram submetidos a exaustivos testes estatísticos, utilizando, para isso, ferramentas da análise multivariada conhecida como: descrição contingente (crosstabs), análise discriminante (âmbito das cavernas e mineração), análise discriminante confirmatória (âmbito das cavernas e mineração), análise de regressão (âmbito das cavernas e mineração). Foi possível ainda realizar um levantamento da contextualização espeleológica, um real estado-da-arte das cavidades naturais subterrâneas em relação às unidades de conservação, biomas, tipologia pedológica e litologia. Uma investigação em torno da extração do calcário e do dolomito, coexistindo com municípios onde ocorrem cavidades naturais subterrâneas (CNSs), também foram realizadas com vistas a verificar a amplitude dessa atividade sobre o ativo espeleológico. Os resultados demonstraram que a técnica utilizada da descrição contingente se mostrou satisfatória para conhecer as diversas possibilidades de cruzamentos, trazendo informações extremamente relevantes. Foi constatado ainda que os resultados da análise discriminante foram estatisticamente significativos. Os resultados finais da discriminante validada alcançaram níveis de excelência, pois comprovaram o alcance de índices notáveis de correta classificação. A conclusão é que com as ferramentas da Análise Multivariada é possível obter um grau de confiabilidade acima de 95% para a classificação de cavernas, ao invés de um índice de 62,1% do ponto de vista humano, resultando em uma proposta nova para a classificação de cavernas no Brasil com maior segurança e eficiência. __________________________________________________________________________________ ABSTRACT / What is the scientific basis used for the classification of caves in Brazil? Are the attributes identified today and the aspects evaluated sufficient to classify natural underground cavities? To answer these questions, 1,169 caves were selected as a sample of the universe of 6,522 natural underground cavities known and registered in Brazil. A questionnaire was developed to assess the major attributes of importance for each cave (ecology, environment, scenic beauty, scientific interest, historic-cultural value, or socio-economic value) and identify the perceived relevance (6 levels) of 16 aspects specified by the existing environmental legislation: size; morphology; scenic value; geological, geomorphological and mineralogical peculiarities, archaeological and paleontological remains, hydric resources, fragility of ecosystem, presence of species which are endemic, rare or threatened by extinction, biological diversity, historic-cultural value, and socio-economic value. Scope of importance of the cavities (on a local, regional, national, or international scale) was also evaluated. The questionnaire was distributed to 11 specialists, professionals with a wide experience and knowledge in the area of speleology, and they were asked to evaluate each cave in relation to each of these aspects. The results of these questionnaires were analyzed using the statistical tools of Multivariate Analysis. Cross-tabulated frequency tables were established locating all caves in relation to location (unit of Conservation), biome, typology, podology and lithology. Discriminate analyses for both the caves as such and for the caves located in municipalities where the extraction of limestone and dolomite is practiced led to the identification of pertinent descriptive attributes, and these were compared to what was identified by the experts. Although the classification in relation to attributes of importance was only 62.1% effective, this level was raised to 95% by the use of confirmatory discriminate analysis. The result was a new and more effective proposal for the classification of the caves in Brazil.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Botânica, 2009. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2011-05-09T22:18:57Z No. of bitstreams: 1 2009_MariaRaqueldeCarvalhoCosta.pdf: 86153475 bytes, checksum: 390010e0d04cd01322bd106fa8a8efbf (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2011-05-16T14:07:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_MariaRaqueldeCarvalhoCosta.pdf: 86153475 bytes, checksum: 390010e0d04cd01322bd106fa8a8efbf (MD5) / Made available in DSpace on 2011-05-16T14:07:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_MariaRaqueldeCarvalhoCosta.pdf: 86153475 bytes, checksum: 390010e0d04cd01322bd106fa8a8efbf (MD5) / Este trabalho faz parte do projeto “Flora dos estados de Goiás e Tocantins: Coleção Rizzo”, o qual tem como objetivos o levantamento e o tratamento morfológico e taxonômico das espécies nativas e espontâneas de Apiaceae destes estados. Apiaceae é uma das grandes famílias de Angiospermas, compreende 300-462 gêneros e 2500-3750 espécies de distribuição cosmopolita, principalmente em áreas montanhosas e temperadas, sendo rara nas regiões tropicais. Na flora brasileira é pouco representada, com oito gêneros e ca. de 100 espécies encontradas principalmente em ambientes úmidos e com altitudes elevadas. Nos estados de Goiás e Tocantins, a família está representada por duas das quatro subfamílias: Saniculoideae Burnett e Azorelloideae Plunkett & Lowry, e por 22 taxa, distribuídos em 3 gêneros, Eryngium L. com 20 espécies: Eryngium brasiliense Const., E. ebracteatum Lam., E. floribundum Cham. & Schltdl., E. foetidum L.*, E. goyazense Urb., E. hemisphaericum Urb., E. hookeri Walp.*, E. horridum Malme, E. irwinii Const., E. juncifolium (Urb.) Math. & Const., E. marginatum Pohl ex Urb., E. pandanifolium Cham. & Schltdl., E. pohlianum Urb., E. pristis Cham. & Schltdl., E. regnellii Malme, E. serra Cham. & Schltdl., E. subinerme (Wolff) Math. & Const., E. aff. zosterifolium Wolff*, E. sp.1, E. sp.2; Klotzschia Cham. e Spananthe Jacq. com uma espécie cada: Klotzschia glaziovii Urb. e Spananthe paniculata Jacq. A monografia inclui chaves de identificação, descrições, ilustração e mapas de distribuição para os gêneros e espécies, além de comentários sobre morfologia, taxonomia e ecologia. Três espécies de Eryngium (*) são novas citações para o bioma Cerrado; duas espécies não foram identificadas, e podem ser uma nova espécie; para uma espécie, E. aff. zosterifolium foi uma tentativa de identificação. Coletas adicionais e talvez um estudo da variabilidade morfológica da população de E. goyazense e E. zosterifolium na Serra dos Cristais seria interessante, assim como mais coletas da primeira espécie na Chapada dos Veadeiros. Coletas adicionais de Eryngium sp.2 no sudoeste de Goiás são necessárias para auxiliar a sua identificação. ________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This study is a contribution to the Flora dos estados de Goiás e Tocantins: Coleção Rizzo Project. Its aim is a morphological study and taxonomic monograph of the species of Apiaceae native or spontaneous to these states. Apiaceae is one of the large, cosmopolitan Angiosperm families. It includes 2500-3750 species, distributed in 300-462 genera, most of which are temperate or subtemperate; it is rare in tropical regions and usually concentrated in highland habitats. In the Brazilian flora it is poorly represented with 100 species in eight genera, found mostly in wet, high altitude areas. In Goiás and Tocantins, the family is represented by two of the four subfamilies: Saniculoideae and Azorelloideae and by 22 taxa, distributed in three genera. Eryngium L. is represented by 20 species: Eryngium brasiliense Const., E. ebracteatum Lam., E. floribundum Cham. & Schltdl., E. foetidum L.*, E. goyazense Urb., E. hemisphaericum Urb., E. hookeri Walp.*, E. horridum Malme, E. irwinii Const., E. juncifolium (Urb.) Math. & Const., E. marginatum Pohl ex Urb., E. pandanifolium Cham. & Schltdl., E. pohlianum Urb., E. pristis Cham. & Schltdl., E. regnellii Malme, E. serra Cham. & Schltdl., E. subinerme (Wolff) Math. & Const., E. aff. zosterifolium Wolff*, Eryngium sp.1 and Eryngium sp.2. Klotzschia Cham. And Spananthe Jacq. are represented by one species each: Klotzschia glaziovii Urb. and Spananthe paniculata Jacq. The monograph includes identification keys, descriptions, illustrations and distribution maps for the genera and species, as well as comments on morphology, taxonomy and ecology. Three species of Eryngium are new citations for the Cerrado Biome; two are unidentified to species level, and may be a new species; for one species, E. aff. zosterifolium, the determination is tentative. Additional collections and perhaps a population study of the morphological variability of E. goyazense and E. zosterifolium in the Serra dos Cristais would be of interest, as well as additional collections of the first species in the Chapada dos Veadeiros. Additional collections of Eryngium sp. 2 in southwestern Goiás are necessary to clarify its identity.

O trabalho objetivou estudar taxonomicamente as oito espécies e uma subespécie do gênero Dysdercus que ocorrem no estado de São Paulo: D. albofasciatus Berg. 1878; D. chaquensis Freiberg, 1947; D. fernaldi fuscofasciatus Blote, 1931; D. honestus Blote, 1931; D. imarginatus Blote, 1931; D. longirostris Stal, 1861; D. maurus Distant, 1901; D. peruvianus Guérin-Menéville, 1831; D. ruficollis (L. 1764). Os exemplares estudados foram identificados pelo autor e provieram das coleções do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo (SP), Instituto Biológico de São Paulo (SP), Coleção Costa Lima da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (RJ), Fundação Instituto Agronômico do Paraná (PR), Centro de Diagnóstico"Marcos Enrietti"(PR), Museu de História Natural do Capão da Imbuia (PR) e de coletas efetuadas pelo autor nas principais regiões produtoras de algodão do Estado de São Paulo. Com base nas ilustrações dos caracteres analisados (pigóforo, parâmeros e edeago dos machos e gonocoxas e espermateca das fêmeas) elaboraram-se chaves de identificação para machos e fêmeas. Concluiu-se que: a) as espécies mais comumente associadas ao algodoeiro, no Estado de São Paulo são: D. peruvianus, D. maurus, D. ruficollis, D. honestus e D. chaquensis. b) todos os taxa são seguramente identificados com base nas estruturas genitais de machos e fêmeas. c) os padrões de coloração e porte são úteis como caracteres diagnósticos secundários / This investigation was developed to study taxonomically the eight species and one subespecies of the genus Dysdercus recorded in São Paulo State: D. alfobasciatus Berg, 1878; D. chaquensis Freiberg, 1947; D. fenaldi fuscofasciatus Blote, 1931; D. honestus Blote, 1931; D. immarginatus Blote, 1931; D. longirostris Stal. 1861; D. maurus Distant, 1901; D. peruvianus Guérin-Menéville, 1831 and D. ruficollis (L.,1764). Species identifications were done by the author. The specimens studied belong to the collections of"Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo","Instituto Biológico de São Paulo","Coleção Costa Lima da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro","Fundação Instituto Agronômico do Paraná","Centro de Diagnóstico Marcos Enrietti", and"Museu de História Natural do Capão da Imbuia". Also, cotton-stainer bugs collected in fields in São Paulo State were studied. Based on illustrations of the ninth segment, parameres and"aedeagus"of the male,"gonocoxae"and spermatheca of the female and chromatic characteristics were prepared identification keys for both male and female. According to the results, the species associated to teh cotton plant, in São Paulo State are: D. peruvianus, D. maurus, D. ruficollis, D. honestus and D. chaquensis. All taxa are properly identified by genitals structures of both male and female. The collors patterns and size are useful as secundaries diagnostic characters

As performances² de duas metodologias para detecção de fusos de sono (SS) (Transformada de Gabor, GT e Matching Pursuit, MP) foram comparadas com a análise visual e entre si. O conjunto de dados compreendeu 160 segmentos de EEG pertencentes a 9 adultos jovens normais do sexo masculino, canal C3-A2, contendo 725 fusos detectados visualmente. Nesta amostra, ambas metodologias mostraram uma performance similar. GT localizou 2160 SS ao passo que MP detectou 2766. MP e GT concordam em 564 casos (77.8% dos fusos detectados visualmente). O número de concordâncias entre as metodologias foi 1716 SS, correspondendo a 79.4% dos eventos detectados por GT e a 67% dos detectados por MP. Uma proporção significativa de MP-SS foram reconstruıidos como estruturas múltiplas sobrepostas. / Performance of two time-frequency methodologies for Sleep Spindle (SS) detection (Gabor Transform, GT; Matching Pursuit procedure, MP) were compared with each other and against visual scoring. Data set comprised 160 EEG intervals pertaining to 9 young male subjects, proportionally representative of normal sleep, containing 725 visually detected SS (C3-A2 EEG channel). In this sample, both methodologies showed similarly good performance against visual analysis. GT localized 2160 and MP, 2766 events. MP and GT agreed for 564 (77.8%) of visually detected SS. Overall agreement between automatic methodologies computed 1716 structures, corresponding to (79.4%) of GT-detected, and to (67%) of MP-detected events. A significant (23.8%) proportion of MP-SS atoms were reconstructed as multiple (two or more) overlapping structures.

A estimativa de recursos minerais é essencial para o propósito de planejamento econômico em qualquer empreendimento mineiro. Além de finalizar os trabalhos de pesquisa mineral, a avaliação de recursos/reservas é a base sobre a qual serão estabelecidos os estudos de viabilidade econômica que se seguem. Atividades como planejamento e otimização de cavas, orientação dos avanços da lavra, projeção de fluxos de caixa, projetos de financiamento e mesmo a operação de plantas de beneficiamento requerem, além da prévia estimativa dos recursos disponíveis, a correta classificação desses recursos. A estimativa e a subseqüente classificação dos recursos em diferentes classes ou categorias, de acordo com as possíveis variações que esses recursos apresentem, devem indicar não apenas os níveis diferenciados de risco envolvidos, mas permitir a elaboração de um modelo que quantifique esse risco. Nesse sentido, a indústria mineira já há muito tempo havia reconhecido e estabelecido padrões para avaliação e classificação de recursos mas agora, com a crescente internacionalização das empresas de mineração, cada vez mais é ressaltada a necessidade do estabelecimento de padrões internacionalmente aceitáveis para essa classificação. Todos os principais sistemas de classificação atualmente em uso compartilham alguns aspectos em comum, baseando a definição das classes de recursos em função da distância de separação entre as amostras e no grau de confiança ou acuracidade associado com os resultados estimados. Apesar de muito claros em termos de estabelecer os critérios geométricos de distância entre amostras e distância máxima de extrapolação, os sistemas de classificação não fornecem definições claras de como esses limites de confiança poderiam ser calculados. Dessa forma, esta dissertação buscou, basicamente, apresentar uma alternativa metodológica que, diante da ineficiência dos métodos até então utilizados, permitisse a incorporação de incertezas às estimativas de recursos e reservas, proporcionando o correto enquadramento nas classes propostas pelos principais sistemas de avaliação e classificação. Com esse intuito, investigou-se a aplicabilidade de técnicas geoestatísticas como krigagem e simulação estocástica, procurando apresentar alternativas e discutir as limitações encontradas. Enquanto a krigagem ordinária permite uma resposta rápida em termos de tonelagem, a avaliação do erro associado à estimativa requer a adoção de uma série de hipóteses e é alvo de várias críticas já consubstanciadas na bibliografia. Por outro lado, os resultados obtidos pelas técnicas de simulação empregadas, demonstraram que o erro associado a uma estimativa pode ser avaliado utilizando múltiplos cenários simulados para definir limites de confiança, permitindo uma real avaliação da incerteza associada à estimativa. Tanto pela técnica de simulação gaussiana quanto pela simulação de indicadores obteve-se resultados similares quanto ao espaço de incerteza mapeado e quanto às características de precisão e acuracidade na distribuição de valores de saída da simulação. O estudo de caso é ilustrado em um grande depósito de carvão brasileiro onde a metodologia provou ser apropriada para abordar o problema da quantificação da incerteza, permitindo sua utilização pelos sistemas de classificação de recursos e reservas. / Mineral resources estimation is essential for planning of any new mine. Besides concluding the mineral exploration, the resources/reserves evaluation is the base on which will be established the studies of economical feasibility. Mine planning and pit optimization, mining cuts and orientation, projection of cash flows, and even the operation of processing plants request the estimate of the available resources and their correct classification. The estimate and the subsequent classification of the resources in different classes or categories is based on different levels of risk and requires a model able to quantify this risk for evaluation and classification of mineral resources a long time ago. All classification systems share some common aspects in terms of defining the classes of resources based on distance separating samples and on the degree of confidence or accuracy associated with the results reported. Despite of being very clear in terms of stating sample distances, all the systems of classification do not provide clear definitions on how confidence limits should be calculated. This dissertation investigates an alternatives capable of incorporating uncertainties to the estimates of resources and reserves. Geostatistic techniques as kriging and stochastic simulation were investigated, and their appropriateness was discussed. While the ordinary kriging allows a fast response to determine tonnages, the error calculated requires a series of assumptions which in various cases are difficult to be sustained. Contrary, the results obtained via simulation techniques demonstrate that the error associated with an estimate can be approximated using multiple simulated tonnage models to define confidence limits, allowing a more realistic evaluation of the uncertainty associated with the estimate. Either gaussian simulation or indicators simulation provided similar results in terms of space of uncertainty and precision and accuracy. The methodology developed is illustrated in a large Brazilian coal deposit and proved to be appropriate to address the issue of quantifying the uncertainty necessary to be incorporated in the systems of resources and reserves classification.

Submitted by Marcelo Andrade Silva (marcelo.andradesilva@ufpe.br) on 2015-03-06T12:57:39Z No. of bitstreams: 2 As aparencias enganam.pdf: 5965144 bytes, checksum: 47c84ed30c4ccd754b65d1677e0e684e (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-06T12:57:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 As aparencias enganam.pdf: 5965144 bytes, checksum: 47c84ed30c4ccd754b65d1677e0e684e (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / CNPQ / Esta pesquisa visa analisar a utilização de teorias da biotipologia, testes de inteligência e personalidade, nos fundamentos e práticas psiquiátricas pernambucanas, durante as décadas de 1930-1945, e o comportamento social daí resultante para pacientes e familiares. As questões que permearam o trabalho partiram do principio de que em Pernambuco, durante o período do Governo Vargas (1930-1945), classificar os tipos de doença mental passou a ser um aspecto essencial do trabalho dos psiquiatras. E que, apesar deste processo estar baseado numa análise completa dos aspectos de vida do paciente, a maioria feminina de pacientes do hospital tinha a detecção de seu estado patológico com base em aspectos majoritariamente físicos. Neste sentido, e com base nos estudos do Boletim de Higiene Mental, da Revista Neurobiologia, periódicos da época, além dos próprios prontuários psiquiátricos, investigou-se como tais relações, entre as classificações e a doença mental feminina, foram sendo construídas e adaptadas ao meio, até o momento de seu emprego no Hospital de Alienados de Pernambuco. Observa-se, portanto, como a loucura foi sendo traçada a partir das estruturas morfológicas do corpo, consideradas como fortes determinantes da constituição psicológica e dos valores sociais de uma sociedade.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2015-05-25T18:56:16Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Manuella Coutinho Brayner.pdf: 6537556 bytes, checksum: 2317f067521c49401a2dea67f515f6f4 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-25T18:56:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Manuella Coutinho Brayner.pdf: 6537556 bytes, checksum: 2317f067521c49401a2dea67f515f6f4 (MD5) Previous issue date: 2014-08-22 / Introdução: Em países em desenvolvimento e países da região subsaariana, mortalidade materna elevada coexiste com alta prevalência do HIV, representando as duas principais causas de morte entre mulheres jovens. No Brasil, a notificação desses casos tem revelado mortes de mulheres no período gravídico-puerperal, muitas vezes difícil de classificar como morte feminina por aids ou com HIV/aids. Diante disso, a Organização Mundial de Saúde propõe a utilização do código O98.7 para classificar as mortes maternas obstétricas indiretas por HIV/aids. Objetivo: Reclassificar os óbitos de mulheres portadoras de HIV/aids no ciclo gravídico-puerperal no estado de Pernambuco, no período de 2000 a 2010, tendo como referência a orientação da CID 10 / OMS sobre morte materna. Método: Estudo descritivo exploratório, desenvolvido a partir das seguintes etapas: tradução para português do item “HIV and AIDS” do documento da Organização das Nações Unidas “The WHO Application of ICD-10 to deaths during pregnancy, childbirth and the puerperium: ICD MM, 2012”; relacionamento probabilístico entre o Sistema de Informações sobre Mortalidade (SIM) e o Sistema de Informação de Agravos de Notificação (Sinan); elaboração de um algoritmo de classificação dos óbitos de mulheres portadoras de HIV/aids no ciclo gravídico-puerperal; e reclassificação dos óbitos por um grupo de especialistas. Resultados: Obteve-se um banco formado pelo SIM e Sinan com 25 óbitos de mulheres portadoras de HIV/aids que informavam gestação/puerpério, adicionados a 26 óbitos informados no SIM e subnotificados no Sinan. Dentre os 25 óbitos reclassificados, 12 foram considerados HIV/aids e a condição gravídica era coexistente; nove foram reclassificados por morte materna obstétrica indireta, com o código O98.7 proposto pela OMS; dois como morte materna obstétrica direta/indireta; e dois considerados indeterminados. Conclusão: A reclassificação apontou uma possível mudança de padrão de mortalidade materna, visto que a maioria dos óbitos foram atribuídos ao HIV/aids, podendo levar a uma redução dos óbitos por causas maternas. O algoritmo subsidiará o uso da nova classificação sobre a morte materna e HIV/aids.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Máquinas de aprendizagem têm sido aplicadas em diferentes problemas em Bioinformática. Similarmente, algoritmos de descoberta de padrões também têm sido usados para descobrir motifs em seqüências de proteínas, contribuindo na definição de assinaturas (tais como impressões digitais) que caracterizam classes funcionais de proteínas. Como por exemplo, a classe de receptores acoplados a proteína-G (GPCR) que representam uma das maiores famílias no Genoma Humano. Esta família é um dos grandes alvos de pesquisa para a descoberta e desenvolvimento de novas drogas, conseqüentemente, de grande interesse para a indústria farmacêutica. O modelo proposto nesta dissertação combina máquinas de aprendizagem, como SVM (Support Vector Machine) e MLP (Multilayer Perceptron), e métodos de descoberta de padrões no desenvolvimento de um procedimento para predizer a relação entre uma seqüência primária de proteínas e sua classe funcional. Como caso de estudo, este trabalho apresenta experimentos com a superfamília GPCR, usando padrões em forma de expressões regulares desta família extraídos pelo SPEXS (Sequence Pattern EXhaustive Search), um algoritmo para descoberta de padrões

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:59:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5569_1.pdf: 1939646 bytes, checksum: fb402f0e0817dc663bf9de104b9d5b70 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O reuso de software é uma área de pesquisa em engenharia de software que tem por objetivo prover melhorias significantes na produtividade e qualidade através da otimização do esforço para criar novas aplicações. Porém, existem muitos problemas que devem ser resolvidos para obter os benefícios inerentes ao reuso. Um deles é o problema da busca e recuperação de componentes. Segundo relatos da literatura, a principal dificuldade é encontrar o componente que atenda à solução do problema do desenvolvedor, haja vista que existe uma lacuna entre a formulação do problema e a descrição do componente no repositório. Além disso, estudos mostram que os mecanismos de busca devem estar focados em formas mais intuitivas de classificar os componentes a um baixo custo e serem baseados em informações familiares ao desenvolvedor. Assim, diferentes técnicas devem ser utilizadas para tratar dos inconvenientes mencionados, dentre elas, a folksonomia, uma abordagem colaborativa para categorizar informações na Web pelos usuários. Essa abordagem pode ser uma solução viável para um sistema de classificação distribuída com um baixo custo inicial. Nesse contexto, com o objetivo de minimizar os problemas de busca e recuperação apresentados, este trabalho propõe uma extensão do MARACATU, mecanismo de busca integrado ao Eclipse, que utiliza esquemas de busca por palavras-chave e facetas, com uma abordagem de classificação colaborativa. A solução proposta é baseada nos resultados das pesquisas em busca e recuperação de componentes e folksonomia. Como resultado, a solução apresenta uma nova arquitetura e implementação, combinando folksonomia aos esquemas de busca iniciais do MARACATU. Em seguida, a solução é avaliada através de um estudo de caso baseado em cinco projetos reais