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The Human Immunodeficiency virus-1 can stay undetected and unaffected by host immune surveillance and antiretroviral therapy. This phenomenon is called proviral latency and the cells harbouring such viruses are part of the latently infected cell reservoir. In this situation, the viral genome integrates into the host's genome upon infection, whereby infected cells exhibit either very low levels or no viral transcription, and hence no viral proteins or egress viruses are produced that can be detected by the immune system. However, viral transcription can be re-activated to produce infectious viruses under certain circumstances. Host-encoded retroviral restriction factors like APOBEC3 (A3) proteins are part of our intrinsic immune defences against retroviral infection, introducing mutations in viral replication intermediates. We hypothesize that low levels of G-to-A transition mutations in the HIV-1 LTR region, introduced by APOBEC3G/F, could lead to a latency-like phenotype. These latent viruses pose major hurdles for HIV-1 cure therapies. Our lab previously created a library of clones possessing mutations in the LTR introduced by A3G/F. Later, mutated LTRs were cloned into 3 types of plasmid backbones: 1) a pEGFP expression vector to study the transcriptional activity of the mutated promoter, 2) into non-replicative pNL4 ∆env ∆vif viral expression vector, and 3) into a replicative pNL4-CXCR4 viral vector to study infection and induction by latency reversal agent (LRA) treatment to better understand the mechanism of latency and transcriptional induction. Viruses produced from these plasmids carrying mutated promoters are referred to as latency-prone viruses or LPVs in this thesis. Characterizing the transcription, infection, and induction to PMA/I of the LPVs would essentially help in evaluating the role of A3 mutations in viral latency and further help in the development of new therapeutics.

Introduction: Un transfert de responsabilité entre médecins est le processus par lequel les médecins se cèdent la responsabilité clinique d'une unité de soins. Le département d'urgence est un environnement souvent surchargé dans lequel les soins doivent être administrés rapidement. Le risque de perte d'information lors d'un transfert y est très élevé. Pourtant, l'impact des transferts de responsabilité sur les résultats de santé des patients du département d'urgence demeure peu étudié. Nous avons effectué une étude de cohorte rétrospective afin de déterminer si, au sein du département d'urgence, les patients ayant subi un transfert de responsabilité médicale ont des résultats de santé plus défavorables que les patients qui n'en ont pas subi. Méthodologie: Nous avons inclus tous les patients d'âge adulte ayant été évalués par un médecin d'urgence puis admis dans un des cinq hôpitaux du CHU de Québec-Université Laval pendant l'année fiscale 2016-2017. Les données ont été extraites à partir des bases de données des soins hospitaliers et du système d'information de gestion des urgences (SIGDU). Le résultat de santé principal évalué était la mortalité. Les résultats secondaires étaient l'admission aux soins intensifs, la chirurgie et la durée de séjour hospitalière. Pour évaluer la mortalité, l'admission aux soins intensifs et le besoin de chirurgie, nous avons utilisé des modèles de régression logistique multiniveaux auxquels nous avons intégré un score de propension qui tenait compte des variables confondantes suivantes : hôpital, caractéristiques démographiques des individus, score de l'Échelle de Triage et de Gravité (ÉTG), comorbidités, délai avant évaluation par un médecin d'urgence, délai avant évaluation par un autre spécialiste, délai avant admission, taux d'occupation de l'urgence et nombre moyen de nouveaux patients par heure, orientation initiale au triage et heure du transfert de responsabilité. Pour évaluer la durée de séjour hospitalière, nous avons utilisé des modèles de régression log-linéaires multi-niveaux en tenant compte des mêmes confondants. Nous avons effectué des analyses de sensibilité excluant les patients ayant séjourné plus de 24h à l'urgence et excluant les événements ayant eu lieu plus de 72h après le début de l'hospitalisation. Résultats : Nous avons inclus 21136 visites à l'urgence et 17150 individus uniques dans l'étude. Les médianes [Q1; Q3] pour l'âge, l'index de Charlson, le délai avant de voir un médecin d'urgence et la durée de séjour à l'urgence étaient de, respectivement, 71[55; 83] années, 3[1; 4], 48 [24; 90] minutes, 20 [9,9;32,7] heures. En analyse par score de propension (RC transfert/pas de transfert [IC95%] ou GMR[IC95%]), le fait d'avoir été transféré n'était pas associé à la mortalité (1,08[0,93;1,26]), à la chirurgie (1,95[0,85,1,05]), à l'admission aux soins intensifs (1,01[0,87;1,18]) ou à la durée de séjour hospitalière (1,02[0,94;1,10]). L'abréviation GMR signifiant ratio de moyennes géométriques (Geometric means ratio). Les analyses de sensibilité et de sous-groupes n'ont pas apporté d'information supplémentaire. Conclusion: Les transferts de responsabilité entre médecins d'urgence ne semblent pas augmenter le risque d'événements indésirables graves tels que la mortalité. Des études supplémentaires sont nécessaires pour évaluer l'impact des transferts sur les événements indésirables potentiellement moins graves (p. ex. erreur d'administration de médicaments). / Introduction: A physician handoff is the process through which physicians transfer the primary responsibility of a care unit. The emergency department (ED) is a fast-paced and crowded environment where the risk of information loss between shifts is significant. Yet, the impact of handoffs between emergency physicians on patient outcomes remains understudied. We performed a retrospective cohort study in the ED to determine if handed-off patients, when compared to non-handed-off patients, were at higher risk of negative outcomes. Methods: We included every adult patient first assessed by an emergency physician and subsequently admitted to hospital in one of the five sites of the CHU de Québec-Université Laval during the fiscal year 2016-17. Data were extracted from the local hospital discharge database and the ED information system. Primary outcome was mortality. Secondary outcomes were incidences of ICU admission and surgery and hospital length of stay. We conducted multilevel multivariate regression analyses, accounting for patient and hospital clusters and adjusting for demographics, Canadian Triage and Acuity Score (CTAS), comorbidities, admitting department delay before evaluation by an emergency physician and by another specialty, emergency department crowding, initial ED orientation and handoff timing. We conducted sensitivity analyses excluding patients that had an ED length of stay > 24 hours or events that happened after 72 hours of hospitalization. Results: 21,136 ED visits and 17,150 unique individuals were included in the study. Median[Q1; Q3] age, Charlson index score, door-to-emergency-physician time and ED length of stay were 71[55; 83] years old, 3[1; 4], 48 [24; 90] minutes, 20.8[9.9; 32.7] hours, respectively. In propensity score analysis (OR handoff/no handoff [CI95%] or GMR[Cl95%]), handoff status was not associated with mortality (1.08[0.93,1.26]), surgery (0.95[0.85,1.05]), ICU admission (1.01[0.87,1.18]) or hospital length of stay (1.02[0.94-1.10]). ED occupancy rate was an independent predictor of mortality and ICU admission rate irrespectively of handoff status. Sensitivity and subgroup based analyses yielded no further information. Conclusion: Emergency physicians' handoffs do not seem to increase the risk of severe in-hospital adverse events. ED occupancy rate is an independent predictor of mortality. Further studies are needed to explore the impact of ED handoffs on adverse events of low and moderate severity.

Our motivation for this work is based on the need to monitor the cure and inservice health of composite materials. We describe the continuation of an effort to design a multi-functional fiber optic sensor which can be embedded in polymeric composite laminates for monitoring the degree of cure during its fabrication, as well as internal composite strains occurring post-cure.3 In short, this dual-purpose sensor combines the characteristics of a Fresnel reflectometer with those of the extrinsic Fabry-Perot interferometer. For monitoring cure, a broadband source is used so the output intensity of the sensor is amplitude-modulated as the refractive index of the composite is increased during the polymerization process. Post-cure, a coherent light source is implemented so a. sinusoidal variation of the output signal occurs when strains within the composite cause the sensor output to be phase-modulated. We demonstrate the measurement of refractive index with the Fresnel reflectometer/EFPL and test it as an embedded refractive index monitor. Our experimental results demonstrate that the refractive index of 5-minute epoxy increases by approximately 2 % during the cure process. In addition, the sensor can be used as an interferometer to measure internal composite strains, where the phase difference between consecutive fringe peaks is one-half the wavelength of the source. / Master of Science

This thesis focuses on development of spline-based hazard estimation models for cure rate data. Such data can be found in survival studies with long term survivors. Consequently, the population consists of the susceptible and non-susceptible sub-populations with the latter termed as "cured". The modeling of both the cure probability and the hazard function of the susceptible sub-population is of practical interest. Here we propose two smoothing-splines based models falling respectively into the popular classes of two component mixture cure rate models and promotion time cure rate models. Under the framework of two component mixture cure rate model, Wang, Du and Liang (2012) have developed a nonparametric model where the covariate effects on both the cure probability and the hazard component are estimated by smoothing splines. Our first development falls under the same framework but estimates the hazard component based on the accelerated failure time model, instead of the proportional hazards model in Wang, Du and Liang (2012). Our new model has better interpretation in practice. The promotion time cure rate model, motivated from a simplified biological interpretation of cancer metastasis, was first proposed only a few decades ago. Nonetheless, it has quickly become a competitor to the mixture models. Our second development aims to provide a nonparametric alternative to the existing parametric or semiparametric promotion time models. / Ph. D.

Les bétons contenant des ajouts cimentaires subissent généralement d'importantes dégra-dations par écaillage lors des essais en laboratoire alors que le comportement de ces bé-tons en service est souvent satisfaisant. L'écaillage est influencé par une multitude de paramètres et les mécanismes responsables de ce type de dégradation demeurent mal compris. Les conditions de mise en place et de mûrissement généralement adoptées en laboratoire pourraient être responsables de la formation d'une couche superficielle de faible durabilité qui écaillerait à un taux plus rapide et qui serait plus profonde pour les bétons contenant des ajouts cimentaires. Ce projet de recherche propose une étude de l'influence de méthodes de mûrissement utilisées en chantier sur le comportement à l'écaillage évalué en laboratoire. L'effet d'une membrane drainante à la base du moule et l'effet d'un mûrissement avec une toile de jute humide ou un agent de cure chimique a été étudié sur des mélanges binaires et ternaires contenant des cendres volantes, du laitier de haut-fourneau et de la fumée de silice en différentes proportions. Les résultats montrent que la méthode de mûrissement peut avoir un effet significatif sur le comportement à l'écaillage et que cette influence dépend très fortement de la composition du mélange. L'étude de la variabilité des résultats montre que la faible reproductibilité et la faible ré-pétabilité de l'essai d'écaillage n'est pas amplifiée par la présence d'ajouts cimentaires. Les résultats soulignent l'importance de tenir compte du comportement d'un ensemble d'éprouvettes pour déterminer la résistance à l'écaillage d'un béton en laboratoire. Des essais de sorptivité et de séchage ont été réalisés sur des surfaces identiques à celles soumises à l'essai d'écaillage dans le but de caractériser la couche de surface sujette à l'écaillage. Bien que les résultats de sorptivité obtenus lors de cette étude ne permettent pas de caractériser la couche superficielle, il semble exister un lien entre la sorptivité et l'écaillage. Il ne semble pas y avoir de relation entre l'essai de séchage et l'écaillage bien que cet essai ait permis de distinguer la couche superficielle des différents bétons. Ces observations portent à croire qu'une couche superficielle plus poreuse ne serait pas entiè-rement responsable de l'écaillage des bétons contenant des ajouts cimentaires.

Ce mémoire est consacré à l’étude des méthodes de cure et leurs impacts sur le retrait et la fissuration du béton projeté. Plus globalement, cette recherche traite de la problématique de la fissuration des réparations en béton. Généralement, les réparations en béton projeté génèrent rapidement de grandes surfaces de béton frais. Si elles sont mal protégées, les sollicitations liées au séchage peuvent mener à l’échec de la réparation. Une méthode de cure adéquate permet de prévenir la fissuration et d’augmenter la durabilité de la réparation. Beaucoup reste à faire en ce qui concerne les techniques de cure et de protection afin de déterminer celles qui fonctionnent vraiment. Afin d’évaluer l’apport bénéfique de différentes méthodes de cure sur le béton projeté, une méthode de mesure du retrait a été développée. Cette étape permet de combler l’absence de norme ou de méthode permettant aujourd’hui de mesurer le retrait du béton projeté et de quantifier en même temps l’impact bénéfique des méthodes de cure. Avec cette méthode, les différents produits de cure externe suivants ont été évalués et classés du plus efficace au moins efficace : un agent de cure et de scellement liquide semblable à ceux à base de solvant, un agent de cure et de scellement liquide à base d’eau, un retardateur d’évaporation et enfin, le moins efficace, un agent de cure liquide à membrane à base de résine. Par la suite, des produits de cure interne ont été testés avec la méthode de mesure développée. Les produits testés sont une fibre synthétique et une fibre de chanvre. La fibre synthétique apporte un bénéfice dès la mise en place. La fibre de chanvre semble avoir apporté des améliorations notables plus importantes vis-à-vis du retrait du béton à long terme. Finalement, une technique de cure fréquemment utilisée en chantier (jute humide et polythène) a été évaluée. Les résultats des essais de type chantier sont peu concluants et ne permettent pas d’apprécier l’apport bénéfique des paramètres testés en raison des particularités de la méthode de mesure. En conclusion, ce projet a rempli sa mission quant à la détermination des bénéfices des méthodes de cure sur le béton projeté. Il ouvre également la voie à de nombreuses applications et possibilités futures jusqu’alors non envisageable pour le béton projeté grâce à la méthode de mesure développée. / This thesis is devoted to the study of curing methods and their impacts on the shrinkage and cracking of shotcrete. More generally, this research deals with the problem of cracking of concrete repairs. Generally, shotcrete repairs quickly generate large areas of fresh concrete. If poorly protected, drying stress can lead to the failure of the repair. Curing methods prevent cracking and increase the durability of concrete repair. Much remains to be done with regard to cure and protection techniques to determine what really works. In order to evaluate the beneficial contribution of curing methods on shotcrete, a shrinkage measurement method is developed. This step makes it possible to fill the gap in the standards or methods used today to measure the shrinkage of shotcrete and at the same time to quantify the beneficial impact of curing methods on shrinkage. This method allows to start measuring shrinkage only 4 hours after placement. With this method, the following different external curing products are evaluated and classified from the most effective to the least effective : a solvent based liquid curing and sealing agent, a water-based liquid curing and sealing agent, an evaporation retarder and finally, the least effective, a resin-based membrane liquid curing agent. The solvent-based liquid curing and sealing agent provided the best results. Then internal curing products are tested with the developed measurement method. The products tested are synthetic fibre and a hemp fibre. Synthetic fibre brings an benefits as soon as the concrete is placed. Hemp fibre seems to have made more significant improvements in concrete shrinkage in the long term. Finally, a curing technique frequently used on site is evaluated. The results of this test are inconclusive and do not allow to assess the beneficial contribution of the tested parameters due to the particularities of the measurement method. In conclusion, this project fulfilled its mission to determine the beneficial effects of curing methods on shotcrete. It opens the way for many future applications and possibilities that were not previously possible for thanks to the measurement method developed.

Toxicomanie, anorexie, boulimie, tanorexie, nomophobie, bigorexie. Ces mots disent nos addictions, à la drogue, à l’alimentation, au soleil, au téléphone, au sport. Mais la liste de nos dépendances est plus longue encore : travail, jeu, sexe, amour. Le XXIe siècle a son fléau, la drogue. Selon les acteurs de la politique de santé publique qui sonnent le glas dans le Plan gouvernemental de lutte contre les drogues et les conduites addictives 2013-2017, nous serions tous concernés. Dans ce travail, à l’appui des concepts psychanalytiques, nous proposons d’analyser, pour le déconstruire, le discours qui sous-tend cette politique : celui des addictologues. Nous tenterons d’apporter la preuve par la clinique qu’une autre façon de penser est possible, loin de l’approche objectiviste, normalisante et pathologisante. Notre hypothèse est que ce discours fait une promesse toxique, encourageant ce qu’il dénonce, mais plus encore, qu’il fait de nous tous des drogués. Il entretient la logique addictive du sujet toxicomane et s’étend au-delà des frontières de la toxicomanie. Parvenant à essaimer ses signifiants et à infiltrer sa langue techniciste chez le commun de tous les mortels, il façonne la pensée allant jusqu’à transformer l’amour en une addiction. Le sujet, ainsi suggestionné, s’en remet aux experts addictologues, illusionné par la promesse de guérison d’une maladie qu’il n’a pas. Comment en sommes-nous arrivés là ? Que veut dire être drogué ? L’histoire des drogues et de leurs consommations nous apprend que la toxicomanie est née au XIXe siècle, au temps des avancées de la chimie et de l’avènement du capitalisme. Considérée comme une nouvelle maladie, la dépendance aux drogues fait l’objet de théorisations du côté de la pathologie. Ignorant les théories freudiennes et lacaniennes défendant la notion d’« indépendance », à entendre dans le sens d’un désir qui libère de « la peine de désirer », notre époque contemporaine verra naître de nouvelles théorisations et encouragera l’expansion de la notion de dépendance aux comportements n’impliquant pas la consommation de substances, comme l’amour. Nous verrons que le discours de l’addictologie, avatar du discours capitaliste, pétri d’une idéologie scientiste, doit son succès à la logique sur laquelle il est fondé : une logique de l’ordre du démenti. / Toxicomania, anorexia, bulimia, tanorexia, nomophobia, bigorexia: these words describe our addictions to drugs, food, sun, cell phones and sports. But the list of our dependencies has become even longer and includes work, gaming, sex and love. The twenty-first century has its scourge, and its name is addiction. According to the leaders of public health policy who sound the alarm in the 2013-2017 governmental plan against drugs and addictive behaviors, we are all concerned. In this research, we will rely on psychoanalytical concepts to analyze and deconstruct the discourse of the addictionologists underlying this policy. We will attempt to provide proof through clinical means that another way of thinking is possible, far removed from the approach that objectivizes, normalizes and pathologizes. We will support the hypothesis that this discourse is based on a toxic promise that not only stimulates what it is meant to denounce, but makes addicts of us all. It encourages the logic of addiction with respect to the addicted subject and extends beyond the limits of toxicomania. Having succeeded in spreading its signifiers and infiltrating its technical-sounding jargon among ordinary mortals, this discourse shapes thought to such an extent that even love becomes an addiction. Under this suggestive influence, subjects put themselves in the hands of expert addictionologists, lured by the promise of a cure for an illness they don’t even have. How did we get to this point? What does being an addict really mean? The history of drugs and drug use tells us that toxicomania was born in the nineteenth century, at a time when chemistry and capitalism were both making great strides forward. Considered as a new illness, drug dependency was the subject of theories with a pathological orientation. Unaware of the theories of Freud and Lacan that defend the notion of “independence” – in the sense of a desire that frees from the “suffering of desire” – our contemporary epoch has given rise to new theorizing and encourages the extension of the notion of dependence to behaviors, like love, that do not imply the consumption of substances. We will see that the discourse of addictology, an avatar of the capitalist discourse, shaped using an ideology based on scientism, owes its success to the logic behind it, a logic built on denial.

L’étude menée s’attache à évaluer le potentiel d’activation du laitier de haut fourneau dans un liant ternaire constitué de ciment alumineux, de sulfate de calcium et de laitier. Dans ce système ternaire, le constituant majoritaire est le sulfate de calcium. Le potentiel d’un tel système n’est pas encore connu mais cette étude vise à renseigner sur les principaux avantages et limites d’utilisation. D’un point de vue des propriétés d’usage de ce liant, la prise, le durcissement rapide et la montée des résistances sont assurés par le liant ettringitique. Ensuite, et uniquement si la dessiccation est évitée, le laitier de haut fourneau réagit et dans ce cas, l’apport du laitier dans de tels systèmes est double. Il contribue à l’augmentation des performances mécaniques à moyen et long terme et à limiter l’expansion sous eau. D’un point de vue de la compréhension des mécanismes d’hydratation, une démarche expérimentale originale est mise en place et dévoile le potentiel du laitier. Elle est basée sur la comparaison des performances obtenues avec différentes cures. Le potentiel d’hydratation du laitier est amplifié lorsque le système subit un séchage puis une réhydratation. Cependant, les techniques utilisées (diffraction des rayons X et calorimétrie différentielle à balayage) ne sont pas adaptées au suivi et à la quantification de laitier consommé. Ainsi, la compréhension de l’hydratation s’appuie sur des techniques dites indirectes. Une semi-quantification par diffraction des rayons X est réalisée pour le suivi et l’évaluation de la mayénite, le sulfate de calcium (anhydre ou dihydraté), la syngénite et l’ettringite, l’analyse thermogravimétrique permet de mesurer le degré d’hydratation du système, et la porosimétrie mercure informe sur les changements microstructuraux. La plus grosse difficulté dans ces travaux a porté sur le suivi et la quantification des phases amorphes (anhydres ou hydratées), telles que le laitier, les gels de C-S-H et d’AH3, et c’est pour cette raison qu’une approche par modélisation a été mise en place afin d’identifier le rôle de chaque constituant du système ternaire [Ciment Alumineux – Sulfate de Calcium – Laitier] et particulièrement du laitier lors de l’essai de réhydratation. L’approche par modélisation permet de mieux identifier les phénomènes chimiques et physiques ayant lieu lors de l’hydratation du liant. Elle est utilisée pour expliquer les observations macroscopiques (comme les performances mécaniques) et aide à déterminer les cinétique d’hydratation dans le milieu poreux. Le modèle utilisé n’est pas encore parfaitement au point mais il a permis d’identifier les différentes séquences d’hydratation (à savoir que le liant ettringitique réagit dans les premiers instants et qu’ensuite, l’hydratation de l’anhydrite entraine la formation de gypse et l’hydratation du laitier est effective à long terme) et de confirmer que la réaction du laitier est lente. / The potential of activation of a Ground Granulated Blast Furnace Slag has been evaluated into a ternary system comprising of a Calcium Sulfate as major component and a Calcium Aluminate Cement. This system is not well known and the main goal of this study is to determine its main advantages and limitations. From the usage properties point of view, fast setting and initial strengths are governed by the ettringitic binder. Then, and only if the dehydration is avoided, slag reacts. In this case, slag contributes to the increase of mechanical performances at medium and long terms and to limit the expansion under water. From an understanding point of view, the original experimental approach reveals the potential of the slag. It is based on a comparison of performances with different types of curing methods. The potential of hydration of the slag is amplified when the system is dehydrated during a few days and then rehydrated. However, slag contribution is complex to establish because analytical methods to follow-up slag consumption (such as X-ray Diffraction and Differential Scanning Calorimetry analysis) are not well adapted. So, to understand the hydration mechanisms, indirect approaches are used. Semi-quantitative methods by X-ray Diffraction to follow-up the mayenite, calcium sulfate, syngenite and ettringite, ThermoGravimetric Analysis to measure degree of hydration and Mercury Intrusion Porosimetry to identify microstructural changes have been carried. The most important difficulty concerns the identification and quantification of amorphous phases such as slag, C-S-H and AH3. That is why a modelling approach is necessary to understand the role of each compound in the ternary mixture and in particular the obvious contribution of slag during rehydration test. This modelling approach increases knowledge of the physical and chemical phenomena in this ternary binder. It is useful to explain the observed macroscopic properties such as strength and helps to determine the kinetics of hydration in porous environment. Even if this model is still under development, it has allowed identifying the sequences of hydration (ettringitic binder reacts at very initial time, then anhydrite transforms into gypsum and slag reacts at long term) and confirms therefore that the reaction of slag is slow.