Ctenomys flamarioni, comumente chamado tuco-tuco-das-dunas, é um roedor subterrâneo que habita a primeira linha de dunas costeiras do Estado do Rio Grande do Sul. Devido à pouca informação sobre este roedor e ao fato de ser uma espécie endêmica e ameaçada de extinção (principalmente pela redução e modificações antrópicas a que é submetido o ecossistema costeiro) o principal esforço desta tese foi centralizado na caracterização genética da variabilidade (e em como esta se encontra distribuída) em populações ao longo de toda a área de distribuição da espécie. Para isto foram utilizados dois tipos de marcadores moleculares, loci nucleares (nove loci de microssatélites) e seqüências de DNA mitocondrial (389 pares de bases da região controladora e 665 pares de bases do citocromo-b).Para três das dez populações amostradas foram incorporadas análises demográficas tanto a partir de dados de campo quanto a partir de dados genéticos através da utilização de loci de microssatélites. Para estas populações foram observadas diferenças significativas na proporção de machos e fêmeas (1:2, para os indivíduos adultos) e nas medidas utilizadas como estimativa de dimorfismo sexual (machos com maior peso e comprimento do corpo). Estas evidências sugerem um padrão de poliginia para C. flamarioni. As análises de estrutura genética indicaram forte diferenciação entre as populações, mas não a nível intrapopulacional. As estimativas de dispersão a partir dos dados genéticos utilizando índices de assignement (FST, FIS, mAIc, vAIc) e teste de AMOVA, mostraram diferenças não significativas entre machos e fêmeas, sugerindo dispersão de ambos os sexos. Todavia, a partir de estimativas de FST entre as populações mais próximas, foi inferida uma maior mobilidade dos machos. Quando a dispersão foi comparada entre aspopulações, esta foi significativamente maior para fêmeas, na população que habita a área mais preservada, e com menor densidade de indivíduos, em relação às outras duas. Para o total de populações, ambos os marcadores mostraram baixa variabilidade genética intrapopulacional, embora esta fosse mais crítica para o mtDNA. Para o conjunto de seqüências da região controladora mitocondrial (n = 89) analisadas foram obtidos sete haplótipos, enquanto que para as do citocromo-b (n = 45), cinco. Para os loci de microssatélites foi observado um número baixo de alelos por loci (entre três e oito). A variabilidade genética obtida foi divergente entre as nove populações estudadas, com valores de diversidade alélica que variaram de 1,1 a 3,6 e valores de heterozigosidade média de 0,21 a 0,70.As populações do sul da distribuição apresentaram os menores valores de variabilidade: a maioria dos loci nucleares em estado monomórfico e baixo número de haplotipos para os loci mitocondriais. O baixo polimorfismo obtido para os microssatélites não tem permitido o uso de testes estatísticos para detectar gargalos de garrafa. Todavia, para três das seis populações analisadas foi verificada a existência de reduções recentes do tamanho populacional. Os níveis de diferenciação genética entre populações foram maiores para os loci de microssatélites que para os de mtDNA, sugerindo assim baixo fluxo gênico atual e maior conectividade histórica entre as populações. Através dos testes de AMOVA, para os dois tipos de marcadores genéticos utilizados, foi observada correlação positiva entre a estruturação da variabilidade e a presença de duas das três possíveis barreiras geográficas ao fluxo gênico testadas. Os testes de Mantel evidenciaram um padrão de isolamento pela distância quando todas as populações foram consideradas na análise, mas não a nível regional.As árvores filogenéticas obtidas a partir dos diferentes métodos empregados evidenciaram relações pouco profundas entre os haplótipos, também sugeridas através das análises de Network. Estas últimas indicaram os haplótipos do norte da distribuição como os ancestrais, a partir dos quais teriam se originado os demais. A partir das diferentes abordagens utilizadas para testar a expansão demográfica (mismatch distribution, teste de Tajima, Fu, e modelo de crescimento exponencial), foi evidenciado sinal positivo, embora fraco, de expansão. O baixo poder dos testes empregados pode estar evidenciando, para a espécie, um padrão mais complexo de ocupação de sua atual área de distribuição, no qual flutuações do tamanho populacional, tanto históricas como contemporâneas, teriam um papel fundamental na redução da variabilidade genética. A partir de métodos semi e não-paramétricos foi estimado o tempo de divergência das principais linhagens filogenéticas de C. flamarioni (aproximadamente 90.000 anos) assim como uma taxa de mutação para o citocromo-b (μ = 0,019⁄ sítio ⁄ milhão de anos). Baseado nesta taxa de mutação, o tempo de ocorrência da principal expansão demográfica foi estimado em 60.000 anos. A partir dos resultados obtidos para os marcadores moleculares utilizados, e com o aporte de informação dos polimorfismos cariotípicos e protéicos reportados para a espécie, foi proposto: (1) duas Unidades Evolutivamente Significativas (ESUs) para C. flamarioni, a primeira formada pelas populações das regiões I, II e III, e a segunda incluindo as populações pertencentes à região IV; e (2) que cada uma das populações estudadas se constitua em uma unidade de manejo independente. / The tuco-tuco-das-dunas, Ctenomys flamarioni, is a subterranean rodent that inhabits the first line of the coastal dunes in State of Rio Grande do Sul. Due to the lack of information about this endemic rodent, and the threatened situation of the species (mainly as result of the anthropogenic changes over native coastal ecosystem), the effort of this thesis was focalized on the genetic variability characterization, and its distribution, over the total range of the species. With this aim two kinds of molecular markers were used: nine nuclear microsatellites loci and mitochondrial DNA sequences (389 base pairs of the control region and 665 base pairs of the cytochrome-b). In three of the ten populations sampled demographical analyses were done both from field and genetical data. For adult individuals significant differences were observed toward a female-biased sex-ratio (1 male:2 female) and sexual dimorphism (males heavier and larger than females). These evidences support a hypothesis of polygyny in C. flamarioni.Analysis of genetic structure revealed strong differentiation among populations, but no significant structure at the intrapopulation level. Non-significant values were obtained for the tested indexes, from assignment tests (FST, FIS, mAIc, vAIc) as well as from AMOVA, showing no evidence of sex-biased dispersal over populations. Nevertheless, for the nearest populations, non significant pairwise FST for males suggested a slightly male-biased dispersal pattern. In regard to inter-population differences, significant differences were clearer in the dispersal patterns among females with more dispersal for the population at the most preserved habitat than the two others. For all populations both microsatellites and mtDNA datasets showed low withinpopulation genetic variation but, it was more critical for mtDNA. For the mitochondrialcontrol-region set of sequences (n = 89) a total of seven haplotypes were obtained, and for the cytochrome-b dataset (n = 45) five haplotypes. The nine microsatellite loci surveyed were polymorphic with variable number of alleles by locus, ranging from three to seven. The same was observed with the genetic variability: the population mean diversity for varied between 1.1 to 3.6 alleles, and the mean observed heterozygosity across all loci ranged from 0.21 to 0.70. The three populations from the southern region of the range showed the lowest values of diversity: most of nuclear loci in monomorphic state and low number of haplotypes for the mtDNA datasets. The low number of polymorphic loci in these populations precluded the use of statistical test for bottleneck detection. However, for three of the six populations examined, a genetic signature of recent population size reduction was observed. Levels of genetic differentiation among populations were higher for microsatellites than mitochondrial loci, suggesting lower gene flow at the present than in the past. For both kinds of markers, the AMOVA analyses showed a substantial relationship between the genetic variation partitioning and two of the three hypothesized historical barriers to gene flow. Positive correlation between the genetic and geographic distances (isolation-by-distance pattern) was found when the total sampled range was considered but not at regional level. Phylogenetic tree analyses showed a shallow relationship between haplotypes, also suggested by the network approach. The northern haplotypes were suggested as the most ancient. Weak evidences of recent population expansion were obtained from the mismatch distribution, Tajima and Fu’s tests and using an exponential grow model. The lack ofpower of the applied tests may indicate by a complex pattern of the species occupation in its distribution range, in which historical and current reductions in population size possibly had a primary role in the reduction of genetic variability. Further analyses from nonparametric and semiparametric methods estimated a divergence time of haplotypic lineages of 90,000 years ago, in the Late Pleistocene, and a rate of cytochrome-b evolution μ = 1.9% per million years. Using this rate and assuming a stepwise scenario, the major increase in effective population size was estimated as occurring 60,000 years ago. Despite the lack of phylogeographic information to define Evolutionarily Significant Units (ESUs), based on the patterns of variation and divergence from the two kinds of markers and the previous allozyme and karyotype studies we propose, (1) two ESU,the first including north (I) and central (II and III) regions, and the second including all populations at the south of the distribution (IV); and (2) that each of the populations sampled should constitute an independent management unit.

Há algum tempo dados genéticos vêm sendo utilizados para inferências quanto à natureza do tráfico de escravos ocorrido no período colonial no Atlântico Sul e sobre a origem dos africanos que chegaram ao Brasil. A utilização de marcadores de linhagem mais específicos, como é o caso do DNA mitocondrial (mtDNA) e da região não-recombinante do cromossomo Y (NRY) pode se constituir em poderoso instrumento para o esclarecimento dessas questões. Este trabalho utilizou esses enfoques através do seqüenciamento da HVS-I do mtDNA (highly variable segment I) e de testes em 30 SNPs (single nucleotide polymorphisms) localizados na região não-recombinante do cromossomo Y, em uma amostra de 133 indivíduos classificados como derivados de africanos (preto e pardo) do estado do Rio Grande do Sul (Porto Alegre e região metropolitana), bem como 144 homens classificados do mesmo modo no estado do Rio de Janeiro (Rio de Janeiro e região metropolitana). Os dados do mtDNA indicaram que 89,5% e 78% das matrilinhagens encontradas, respectivamente, no Rio de Janeiro e em Porto Alegre eram de origem africana. Destas, 69% e 82% eram de origem da África Centro-oeste (região típica de povos que falam línguas Bantus), enquanto que a fração complementar teria uma origem no Oeste africano (não-Bantu). Estes resultados estão de acordo com os registros históricos. Os marcadores do cromossomo Y revelaram que 56% (Rio de Janeiro) e 36% (Porto Alegre) destes cromossomos tinham uma origem africana. No entanto, diferentemente do que aconteceu com o mtDNA, as análises não permitiram discriminar os locais de origem dentro do continente africano. Parece, portanto, haver maior estruturação nos dados obtidos com o mtDNA do que com o cromossomo Y, sugerindo uma maior taxa de migração dos homens do que das mulheres dentro do grande tronco lingüístico Niger-Congo. Porto Alegre e Rio de Janeiro quando comparadas em relação ao mtDNA, não apresentam diferenciação significativa, embora pudessem ser observadas algumas diferenças, em destaque a maior presença de linhagens mitocondriais de origem ameríndia em Porto Alegre (16,4%) do que no Rio de Janeiro (8,5%). Já a diferença entre Porto Alegre e o Rio de Janeiro foi significativa quanto aos dados do cromossomo Y. Especialmente notável, é a presença de cromossomos de origem indígena em Porto Alegre: haplogrupos Q* e Q3*, nas freqüências de 3,5% e 1,7%, respectivamente. Analisando somente os indivíduos tipados tanto para o mtDNA quanto para os marcadores do Y, nota-se que ~ 50% deles nas duas amostras apresentam linhagens mitocondriais e do cromossomo Y de origem africana, enquanto de forma complementar, o número de indivíduos com matrilinhagens africanas e cromossomos Y europeus e/ou asiáticos ou ameríndios foi de ~ 41% e ~ 35% para o Rio de Janeiro e Porto Alegre, respectivamente. As amostras estudadas, portanto, caracterizam-se como sendo amplamente mescladas, apenas metade dos genomas considerados sendo de origem completamente africana. / Genetic data have been used for some time now for inferences about the nature of the slave trade that occurred in South Atlantic in the Colonial Period, as well as about the origins of the Africans who arrived in Brazil. The use of lineage-specific markers, like mitochondrial DNA (mtDNA) and those of the non-recombining region of the Y chromosome (NRY), can constitute a powerful tool for elucidation of these questions. This work utilized this approach through sequencing of the mtDNA HVS-I (highly variable segment I), as well by testing 30 SNPs (single nucleotide polymorphisms) located in chromosome Y’s nonrecombining region in a sample of 133 individuals classified as African-derived (black or mulatto) from the state of Rio Grande do Sul (Porto Alegre and metropolitan region), as well as 144 men classified in the same manner in the state of Rio de Janeiro (Rio de Janeiro and metropolitan region). The mtDNA data indicated that 89.5% and 78% of the matrilineages found in Rio de Janeiro and Porto Alegre were of African origin. Of these, respectively, 69% and 82% were of Central-West African origin (region typically of people who speak Bantu languages), while the complementary fraction would have the West African origin (non-Bantu). These results are in accordance with the historical records. The Y chromosome markers revealed that 56% (Rio de Janeiro) and 36% (Porto Alegre) of these chromosomes should have an African origin. But differently of what occurred with the mtDNA results, the analyses did not allow a discrimination of the places of their origin within the African continent. It seems, therefore, that a higher structuration occurs in the mtDNA data as compared to the Y chromosome results, suggesting a higher male in relation to female migration rates within the large Niger-Congo linguistic family. Porto Alegre and Rio de Janeiro do not present significant mtDNA frequency differences, although the Amerindian mtDNA presence is higher in Porto Alegre (16.4%) than Rio de Janeiro (8.5%). On the other hand, Porto Alegre and Rio de Janeiro do show significant differences in the Y chromosome data. Especially notable is the presence of Amerindian chromosomes in Porto Alegre: frequencies of, respectively, 3.5% and 1.7% for haplogroups Q* and Q3*. Considering just the individuals simultaneously typed for mtDNA and the Y chromosome, it is verified that ~50% of then show mtDNA and Y chromosome lineages of African origin, while the number of individuals with African mtDNA but European and/or Asiatic or Amerindian lineages was ~41% for Rio de Janeiro and ~35% for Porto Alegre. The samples studied, therefore, can be characterized as amply admixed, only half of the genomes considered being completely of African origin.

O padrão filogeográfico do lagarto teídeo Cnemidophorus vacariensis, endêmico dos Campos de Cima da Serra do sul do Brasil, foi estudado com a análise de dois segmentos de DNA mitocondrial (12S e 16S) e caracteres morfológicos. Através de métodos de máxima parcimônia, máxima verossimilhança e bayesianos, ambos marcadores moleculares demonstraram, concordantemente, a presença de diferenciação genética entre os clados do Rio Grande do Sul (RS), Santa Catarina (SC) e Paraná (PR). A existência de fluxo gênico foi registrada entre as linhagens do RS e SC, enquanto a população do PR está isolada das demais por, no mínimo, 300 quilômetros. Morfologicamente, a população proveniente do PR exibiu uma tendência de discriminação em três caracteres, enquanto os clados do RS e SC não apresentaram diferenças. Foi possível correlacionar, em parte, os resultados das análises molecular e morfológica, indicando concordância entre as duas abordagens. Os haplótipos exclusivos encontrados sugerem que as populações de C. vacariensis vivenciaram uma história evolutiva de isolamento, o que provavelmente ocorreu no Pleistoceno, quando pulsos de retração e expansão dos biomas abertos se alternavam, exibindo uma dinâmica que pode ter fragmentado por diversas vezes as regiões campestres que este lagarto habitava. Os principais distúrbios que os Campos de Cima da Serra enfrentam atualmente são as queimadas, a pecuária e a silvicultura de espécies exóticas, ameaças que tornam urgentes a definição de estratégias de conservação da região e sua biota. Os lagartinhos-pintados (Cnemidophorus vacariensis) ocorrem em afloramentos rochosos pouco extensos e se deslocam pouco, de modo que Unidades de Conservação de pequeno tamanho poderiam ser efetivas para a sua conservação. Porém, é importante considerar que cada linhagem evolutiva possui um potencial genético distinto das demais e todas devem ser conservadas.

Resumo não disponível

Os lagartos do gênero Liolaemus WIEGMANN, 1834 pertencem à família Liolaemidae FROST et al., 2001. O gênero Liolaemus, com cerca de 200 espécies, inclui lagartos de moderado tamanho, principalmente lagartos pequenos, restritos à região austral da América do Sul. As regiões de ocorrência de Liolaemus incluem extensas áreas de areia eólica: as praias arenosas do Chile, Argentina, Uruguai e o sul do Brasil, assim como areias planas e sistemas de dunas dispersos por todo o interior da Argentina e Chile. No Brasil, o gênero é representado por três espécies: Liolaemus lutzae MERTENS, 1938; Liolaemus occipitalis BOULENGER, 1885 e Liolaemus arambarensis VERRASTRO et al., 2003. A espécie alvo deste estudo é Liolaemus occipitalis, que ocorre ao longo de todo o litoral do Rio Grande do Sul e litoral sul de Santa Catarina (até a ilha de Florianópolis). O objetivo do presente trabalho é apresentar um estudo filogeográfico e de diversidade morfológica desta espécie, com o intuito de aprofundar os conhecimentos sobre L. occipitalis e acerca da problemática de sua conservação, empregando uma análise molecular baseada em DNA mitocondrial, além de análises merística e morfométrica. Com esta finalidade, foram coletados exemplares de L. occipitalis (n = 78) em dez populações ao longo do gradiente geográfico da espécie. Os resultados demostraram que alguns caracteres merísticos e morfométricos apresentaram uma certa tendência de diferenciação entre populações do centro e do norte da distribuição geográfica da espécie; também um padrão mais abrangente de diferenciação entre populações do norte e do sul foi levemente indicado por alguns destes caracteres. Outros caracteres, porém, demonstraram-se variáveis de um modo geral não indicando nenhum padrão geográfico de diferenciação; e outros, ainda, apresentaram-se invariáveis ou com variabilidade não-significativa entre as populações analisadas. As análises moleculares indicaram uma estruturação entre as populações de L. occipitalis de Santa Catarina, o que não ocorreu nas populações do Rio Grande do Sul. Além disso, indicaram como provável centro de origem e dispersão da espécie a região do centro e/ou do sul de sua distribuição no Estado do Rio Grande do Sul. Verificou-se, também, a existência de fluxo gênico livre entre as populações estudadas, e a neutralidade das mutações apresentadas pelas seqüências analisadas.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-02-16Bitstream added on 2014-06-13T20:10:14Z : No. of bitstreams: 1 martinsjunior_j_me_rcla_prot.pdf: 542041 bytes, checksum: 39024d2b6d2463549c438afddde0bb51 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A formiga saúva-da-mata, Atta cephalotes, tem como área de ocorrência a Mata Atlântica e a Floresta Amazônica, pois não consegue viver em regiões quentes e secas como o Cerrado e Caatinga. Como os demais atineos, corta folhas e flores que servem de substrato para o fungo que cultivam, sendo considerada, na Bahia, uma importante espécie que ataca as plantações de cacau na mata cabrucada. Sua classificação taxonômica sempre foi controversa e dificil devido à dificuldade de separar as subespécies através de caracteres morfológicos, que são polimórficos e pouco informativos, fazendo com todas as subespécies fossem sinonimizadas como Atta cephalotes. O presente estudo teve como objetivo caracterizar os Ioci mitocondriais CDI, IGS, Leu-tRNA e CDII de populações de Atta cephalotes e estabelecer uma relação filogenética entre essas populações. Procedeu-se a extração de DNA genômico total, seguida de amplificação com iniciadores específicos e purificação dos amplicons. O produto purificado foi seqüenciado no sentido direto e reverso e consenso das seqüências foi submetido ao alinhamento múltiplo, análise de máxima parcimônia, análise de haplótipos e divergência genética. Os resultados mostraram que existem duas populações geneticamente distintas de Atta cephalotes, uma predominantemente de ocorrência amazônica e outra de Mata Atlântica, contrariando a classificação atual. Foram encontradas no Pará e Amapá dois grupos de populações: um se agrupa com o grupo de espécimes de Mata Atlântica (Bahia e Pernambuco) e o outro com os espécimes da Amazônia, sugerindo a existência de populações simpátricas nesses estados. Talvez o uso de outros marcadores, associados a estudos ecológicos e comportamentais, esclareça se nesses dois estados suas populações estão isoladas reprodutivamente. Possivelmente o grupo da Bahia deve ser classificado como uma espécie diferente do grupo da região Norte. / Not available.

Submitted by JORGE ALFONSO MORALES DONOSO null (jorgemoralesdonoso@gmail.com) on 2017-05-25T14:33:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Jorge_Morales_Donoso.pdf: 4632507 bytes, checksum: 1a342a2dd9af4129e63dd1a00162d1b5 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-05-30T16:18:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 moralesdonoso_ja_me_jabo.pdf: 4632507 bytes, checksum: 1a342a2dd9af4129e63dd1a00162d1b5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-30T16:18:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 moralesdonoso_ja_me_jabo.pdf: 4632507 bytes, checksum: 1a342a2dd9af4129e63dd1a00162d1b5 (MD5) Previous issue date: 2017-04-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A espécie M. nemorivaga corresponde a uma espécie de veado cinza que ocupa a região Amazônica. Com base em estudos anteriores, a atual classificação taxonômica da espécie apresenta inconsistências, que sugerem a presença de mais de uma espécie dentro do que hoje é classificado como M. nemorivaga. Desta forma, o presente trabalho tem como objetivo contribuir com a taxonomia do gênero Mazama, mediante a coleta de um exemplar em sua localidade tipo (Caiena, Guiana Francesa), caracterizando-o morfológica, citogenética e molecularmente, permitindo a comparação da espécie em estudo com outros espécimes utilizados em publicações, a fim de conhecer diferenças entre eles e revisar a taxonomia da espécie. Para tanto, foi coletado um exemplar na localidade tipo da espécie (Guiana Francesa), o qual foi caraterizado por técnicas de morfologia tradicional (medidas crânio-mandibulares, medidas biométricas, coloração da pele), morfologia geométrica, assim como análises citogenéticas (Banda G, Banda C, coloração convencional de Giemsa e coloração Ag-NOR, FISH telomérica) e moleculares (análises filogenéticas de genes mitocôndrias Cyt b de 920 pb, COI I de 658 pb, D-loop 610 pb). Os resultados da caracterização citogenética e molecular, mostraram um claro agrupamento do topótipo de M. nemorivaga com exemplares da região do Amapá, constituindo o clado Norte (Guiana Francesa e Amapá). Além disso, sugere-se a existência de três espécies distintas, com base no nível de diferenças em relação ao topótipo da espécie, uma ocorrendo na Amazônia oriental, acima do rio Amazonas (Amapá e Guiana Francesa), outra na Amazônia central (Mato Grosso, Pará e Maranhão) e uma outra na Amazônia ocidental (Acre e Rondônia). Além disso, foi identificada a presença de pelos na região tarsal como um dos carácteres morfológicos que pode ser utilizado na diagnose da espécie em relação ao outros membros do gênero. / The species M. nemorivaga corresponds to the grey brocket deer that occupies the Amazon region. Based on previous studies, the current taxonomic classification of the species presents inconsistencies, which suggest the presence of more than one species within what is now classified as M. nemorivaga. In this way, the present research project aims to contribute with the taxonomy of the Mazama genus, by collecting a specimen in its type locality (Cayenne, French Guiana). Characterizing the morphological specimen, Cytogenetic and molecular, allowing the comparison of the species under study with other specimens used in publications, in order to know the differences between them and to review the taxonomy of the species. For this, a specimen was collected in the locality of the species (French Guiana), characterized by traditional morphology techniques. (craniomandibular measurements, biometric measurements, skin coloration), geometric morphology, as well as by cytogenetic analyzes (Band G, C-band, conventional Giemsa staining and Ag-NOR staining, telomeric FISH) and molecular (phylogenetic analyzes of mitochondrial genes Cyt b of 920 bp, IOC I of 658 bp, D-loop 610 bp). The results of the cytogenetic and molecular characterization showed a clear grouping of M. nemorivaga topotype along with specimens from the Amapá region, constituting the northern clade (French Guiana and Amapá). In addition, it is suggested the existence of three distinct species, based on differences in relation to the topotype of the species. One occurred in the eastern Amazon, above the Amazon River (Amapá and French Guiana), another in central Amazonia (Mato Grosso, Pará and Maranhão) and another one in western Amazonia (Acre and Rondônia). The presence of hairs in the tarsal region was identified as one of the morphological characters that can be used to diagnose the species in relation to other members of the genus.

Orientador: Fernando Barbosa Noll / Banca: Eduardo Andrade Botelho de Almeida / Banca: Camila Cherem Ribas / Banca: Adriana Coletto Morales Corrêa e Castro / Banca: James M. Carpenter / Resumo: Os processos históricos e ecológicos de diversificação da fauna têm sidoamplamente estudados sob a luz da filogeografia, disciplina que lida com oarranjo espacial das linhagens genéticas. As vespas enxameadoras (Epiponini)como Protonectarina sylveirae (Saussure) são representantes comuns da faunaNeotropical. Esta espécie ocorre amplamente pela floresta Atlântica e apresentauma distribuição peculiar dentro de Epiponini devido à sua ausência na regiãoAmazônica. Apesar de muitos estudos apontarem para a existência dedescontinuidades filogeográficas para diferentes organismos na floresta Atlântica,explicações sobre as causas de tais padrões permanecem inconclusivas. Estetrabalho teve como objetivo investigar o padrão filogeográfico de P. sylveirae,com especial interesse na presença de estruturação genética e diferenciaçãomorfológica, bem como nos eventos históricos que possam explicar o padrãofilogeográfico observado. Os espécimes de P. sylveirae foram coletadosativamente em 13 áreas ao longo de sua distribuição para a extração, amplificaçãoe sequenciamento dos genes mitocondriais 12S, 16S e COI. Foram realizadasanalyses de diversidade genética, demografia histórica, tempo de divergência eestruturação populacional. Identificou-se 22 haplótipos, uma forte estruturaçãogenética foi encontrada pela análise de variância molecular (AMOVA) e a rede dehaplótipos revelou 3 grupos de haplótipos, também corroborados pela AMOVA.As análises de demografia... / Abstract: Ecological and historical processes of fauna diversification have been widelystudied under the light of phylogeography, a discipline that deals with the spatialarrangements of genetic lineages. Swarm-founding wasps (Epiponini) asProtonectarina sylveirae (Saussure) are common representatives of Neotropicalfauna. This species is widespread in Atlantic forest and presents a peculiardistribution within Epiponini because of its absence in Amazon region. Manystudies point to the existence of recurrent phylogeographical discontinuities todifferent groups of organisms in Atlantic forest, but the explanations about eventscausing this patters remain inconclusive. This work aimed to investigate thephylogeographic pattern of P. sylveirae with special interest in presence of geneticstructure, morphological differences among populations, and historical event(s)which could explain the observed phylogeographic pattern. Specimens of P.sylveirae were actively collected in 13 areas throughout its distribution for DNAextraction and amplification of mitochondrial genes 12S, 16S and COI. Analysisof genetic diversity, historical demography, divergence time, and populationstructure were performed. Twenty-two haplotypes were identified, a stronggenetic structuration was found by the analysis of molecular variance (ANOVA)and the haplotype network revealed three haplotype groups, also corroborated byAMOVA. Analysis of historical demography showed that populations of ... / Doutor

Orientador: Mary Massumi Itoyama / Banca: Maria Aparecida Marin Morales / Banca: Carlos Eduardo Almeida / Banca: Carlos Eugênio Cavasini / Banca: Maria Tercilia Vilela de Azeredo Oliveira / Resumo: Os Heteroptera possuem grande número de espécies descritas, aproximadamente, 40.000, além de habitat diversificado e hábitos alimentares bem variáveis, pois, podem viver como parasitas de aves ou mamíferos, se alimentarem de estruturas de plantas, micélios de alguns fungos ou outros artrópodes. Apesar destes insetos possuírem importância econômica seus estudos ainda são poucos explorados, principalmente, com relação aos lobos tetsiculares e suas relações filogenéticas. Assim, o presente estudo teve por objetivo inferir e entender as relações filogenéticas de espécies de Heteroptera pertencentes às famílias Coreidae e Pentatomidae, a partir dos fragmentos dos genes mitocondriais (COI, Cyt b e 16S) e nucleares (28S e 18S) e de dados moleculares associados com dados morfológicos e citogenéticos. A partir das análises foi possível identificar algumas relações entre as famílias, tribos e gêneros, demonstrando a eficiência dos genes e metodologias escolhidas. As famílias formam dois clados e esses formam grupo irmão, na maioria das análises. Analisando a família Coreidae observamos na maioria das análises, que formam agrupamentos monofiléticos. Quanto à família Pentatomidae, em todas as análises confirmaram sua monofilia. Observamos o agrupamento constante de espécies da mesma tribo e também agrupamentos congenéricos, com altos valores de bootstrap. Porém, agrupamentos entre espécies de mesma família, porém de tribos diferentes ainda merecem ser melhor estudados e explorados. Foi observado que com a inserção de dados morfológicos e citogenéticos houve uma melhor resolução dos resultados, principalmente, entre as tribos Pentatomini, Chlorocorini e Carpocorini (Pentatomidae). Com a análise evolutiva foi observado que algumas espécies agrupadas possuem características morfológicas mais semelhantes com espécies de outras tribos do que com seu grupo. Com esta análise foi possível identificar as ... / Abstract: The Heteroptera have large number of described species, about 40,000, and diverse habitat and alimentary habits variables and therefore can live as parasites of birds and mammals, feeding on plant structures, mycelia of fungi or other arthropods. Despite these insects possess economic importance their studies are still few explored mainly in relation to testicular lobes and their phylogenetic relationships. Thus, this study aimed to understand and infer the phylogenetic relationships of species of Heteroptera belonging to the families Coreidae and Pentatomidae, from the fragments of mitochondrial genes (COI, Cyt b and 16S) and nuclear (28S and 18S) and molecular data associated morphological data and cytogenetic data. From the analysis it was possible to identify some relationships between families, tribes and genera, demonstrating the efficiency of genes and methodologies chosen. Families form two clades and these form brother group, most analyzes. Analyzing family Coreidae observed in most analyzes that form monophyletic groups. As the family Pentatomidae in all analyzes confirmed its monophyly. Observed clustering constant species of the same tribe and also congeneric groups with high bootstrap values. However, groupings among species of the same family, but different tribes still deserve to be better studied and explored. It was observed that with the inclusion of morphological and cytogenetic there was a better resolution of the results, especially among the tribes Pentatomini, Chlorocorini and Carpocorini (Pentatomidae). With the evolutionary analysis it was observed that some species grouped morphological characteristics more similar to species of other tribes than with your group. With this analysis it is possible to identify the relationships between families, tribes and genera and some similarities between species of different tribes grouped, however, there is need for a greater number of species and characters involved, because ... / Doutor

Orientador: Adriana Coletto Morales Corrêa e Castro / Banca: Marcos Túlio de Oliveira / Banca: Maurício Martins da Rocha / Resumo: Cupins são insetos eussociais da infraordem Isoptera, que, atualmente, é composta por nove famílias com representantes vivos. Ecologicamente, os cupins desempenham um importante papel na ciclagem de nutrientes do solo, e são conhecidos como "super decompositores". A região Neotropical é a terceira em número de espécies de cupins conhecidas, com aproximadamente 600 descritas, que são divididas em cinco famílias, incluindo Termitidae, que abriga a espécie deste trabalho, Nasutitermes corniger. O presente trabalho se propôs a estudar as populações de N. corniger sob a perspectiva da genética de populações e da filogeografia. Essas duas áreas de estudo, aliadas, permitem que se trace a história evolutiva dos processos responsáveis pelo surgimento de padrões encontrados atualmente. De modo geral, esse foi o objetivo deste trabalho: encontrar e compreender os padrões e os processos que permitem traçar a história evolutiva da espécie N. corniger, distribuída ao longo da região Neotropical, utilizando-se o marcador molecular mitocondrial 16S rDNA. Foram utilizados 230 espécimes de N. corniger, provenientes de mais de 15 estados brasileiros, de países da América do Sul, América Central e Ilhas do Caribe. Após sequenciamento dos fragmentos de 16S rDNA, obteve-se 45 haplótipos, que puderam ser divididos em 6 agrupamentos. Com exceção de alguns haplótipos do agrupamento 1, considerado o mais antigo, os agrupamentos estão distribuídos de modo a relacionar áreas geográficas proximamente localizadas. A observação desse padrão, junto aos resultados da Análise de Variância Molecular (AMOVA), permitiu que se inferisse que as populações analisadas estão estruturadas ao longo da área amostrada. Os resultados da Nested Clade Phylogeografic Analysis (NCPA) frequentemente indicaram isolamento por distância como causa do padrão de distribuição de... / Abstract: Termites are eusocial insects of the infraorder Isoptera, which is currently composed of nine families with living representatives. Ecologically, termites have an important role in nutrient cycling of the soil, and are known as "super decomposers". The Neotropical region is the third in number of known species, with about 600 described species, that are divided in five families, including Termitidae, which involving the specie of this work, Nasutitermes corniger. This work proposed to study the populations of N. corniger by the approach of Populations Genetics and Phylogeography. Both study areas, together, allow to trace the evolutionary history of the processes responsible for the origin of currently found patterns. Overall, this was the aim of this work: to find and understand the patterns and processes which allow to trace the evolutionary history of the specie N. corniger, distributed along the Neotropics, using the mitochondrial molecular marker 16S rDNA. Have been used 230 specimens of N. corniger, from more than 15 Brazilian states, South and Central America countries and Caribbean Islands. After sequencing of 16S rDNA fragments, 45 haplotypes were obtained, which could be divided into six groupings. Except some haplotypes of grouping 1, considered oldest, the groupings are distributed to relate geographical areas most closely located. The observation of this pattern, together with the results of Analysis of Molecular Variance (AMOVA), allowed it to be deduced that populations are structured along sampled area. The results of Nested Clade Phylogeografic Analysis (NCPA) indicate, frequently, isolation by distance as cause of distribution pattern found, inference supported by Mantel's test. From the groupings which were observed at haplotypic network and the haplotype distribution pattern throughout the sampled region, it was still possible to infer a probable ... / Mestre