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Análise filogenética de Polybia lepeletier, 1836 (Hymenoptera, Vespidae, Polistinae) /

Gelin, Luiz Fernando Fracassi. January 2009 (has links)
Orientador: Fernando Barbosa Noll / Banca: Dalton de Souza Amorim / Banca: Eduardo Andrade Botelho de Almeida / Resumo: Polybia é um gênero de vespas sociais enxameadoras que engloba 58 espécies válidas, distribuídas do sul dos Estados Unidos até o norte da Argentina. Esse gênero é dividido em em 11 subgêneros, alguns deles são altamente variáveis morfológicamente. A dificuldade em encontrar sinapomorfias tanto para o gênero quanto para os subgêneros reflete um histórico taxonômico conturbado, já que as espécies aí incluídas são aquelas que não se encaixam em nenhum outro gênero de Epiponini. Além disso, Polybia difere quanto ao posicionamento filético em estudos morfológicos, comportamentais e moleculares (ou combinados). Levando em conta a dificuldade de encontrar sinapomorfias e a variação do gênero na filogenia dos Epiponini, o objetivo deste estudo foi realizar uma análise filogenética das espécies do gênero, buscando estabelecer as relações subgenéricas e verificar as relações entre as espécies. Para isso foi realizado um estudo da morfologia externa de fêmeas adultas de 50 espécies dos 11 subgêneros de Polybia, no qual foram utilizados caracteres já propostos na literatura e levantados novos caracteres, totalizando 65 caracteres de morfologia externa de fêmeas adultas, 20 caracteres de morfologia externa das larvas e 10 caracteres de arquitetura de ninho. Os caracteres foram dispostos em uma matriz de dados composta por 56 táxons terminais, sendo seis do grupo externo (Protopolybia, Charterginus, Brachygastra, Chartergus, Protonectarina e Epipona) e 95 caracteres. A análise foi realizada no programa TNT 1.1 utilizando o princípio da parcimônia com uma combinação de algorítimos: Tree-drifting, Tree-fusing, Ratchet e Sectorial Searches. Após a análise o programa gerou 22 árvores mais parcimoniosas. A árvore de consenso estrito possui a seguinte topologia para os subgêneros de Polybia: (Apopolybia + (Trichinothorax + ((Cylindroca + Pedothoeca)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Polybia is a genus of swarm-founding social wasps which comprises 58 described species, ranging from the south of United States to the north of Argentina. It is divided into 11 subgenera, some of them have a great number of polymorphysms. The difficulty on estabilize synapomorphies for the genus or the subgenera may be regarded as consequence of the trublesomme taxonomic background, because the species included in this genus are the one that could not be placed in in other Epiponini genera. Moreover, Polybia differs on its phylogenetic position in the analyses based on morphology, behavior and molecular (or total evidence) data. Taking into account the difficulty on estabilish synapomorphies and the topologic variation in the Epiponini phylogeny, this study aimed to estabilish the subgeneric relationships and verifies the relationships among species. In order to do this, we made a morphological study of adult females' external parts in 50 species of the 11 Polybia subgenera. It was surveied new characters that were added to the characters previously proposed in the literature, totalizing 65 external morphology of adult females' characters, 20 characters of external morphology of larvae and 10 characters of nest architecture. The data matrix was composed by 56 terminal taxa (six outgroup: Protopolybia, Charterginus, Brachygastra, Chartergus, Protonectarina e Epipona) and 95 characteres. The analysis was run in the program TNT 1.1 under the parsimony principle with a combination of algorytims: Tree-drifting, Tree-fusing, Ratchet e Sectorial Searches. The analysis generated 22 most parsimonious trees. The consensus tree has the falowing topology: (Apopolybia + (Trichinothorax + ((Cylindroca + Pedothoeca) + (Furnariana + ((Formicicola + Platypolybia) + (Myrapetra + ((Myrapetra + ((Synoecoides + Polybia) + Alpha)) + Myrapetra), confirming. therefore, the monophyly... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Análise Cladística de Omalodini Kryzhanovskij, 1972 (Coleptera, Histeridae, Histerinae)

Leivas, Fernando Willyan Trevisan 21 January 2013 (has links)
Resumo: Histerinae está dividida em cinco tribos: Exosternini Bickhardt, 1914; Hololeptini Hope, 1840; Platysomatini Bickhardt, 1914; Omalodini Kryzhanovskij, 1972 e Histerini Gyllenhal, 1808. Estudos de abordagem filogenética para Histeroidea e Histeridae têm questionado a monofilia da subfamília e da maioria de suas tribos. Segundo a classificação corrente de Histeridae, Omalodini é composta por 94 espécies descritas em 12 gêneros distribuídos pelas regiões Neotropical, Afrotropical, Afrotemperada e Oriental: Notolister Lewis, 1894; Sphyracus Marseul, 1853; Ebonius Lewis, 1885; Scapomegas Lacordaire, 1854; Lewisister Bickhardt, 1824; Asolenus Lewis, 1906; Blypotehus Vienna, 2000; Perfidolenus Vienna, 2000; Atribalus Bickhardt, 1921, Rhypochares Marseul, 1854; Theropatina Mazur, 1984; e Omalodes Erichson, 1844, este último dividido em Omalodes (Omalodes), O. (Diplogrammicus) Lewis, 1907 e O. (Cornillus) Lewis, 1907. Os objetivos da presente pesquisa foram testar a monofilia de Omalodini, com base na análise cladística, e propor uma hipótese de relacionamento filogenético para os grupos que compõem a tribo. A matriz foi formada por 50 táxons terminais (35 do grupo interno e 15 do grupo externo) e por 135 caracteres da morfologia dos adultos. Foram realizadas análises com pesos iguais e implícitos aos caracteres. Em ambas as análises, Omalodini apresentou-se um grupo polifilético e as árvores resultantes da análise com pesos iguais (quatro árvores igualmente parcimoniosas) foram escolhidas para restabelecer a monofilia da tribo. Omalodini foi aqui reconhecida com linhagens de Ebonius, Omalodini sp. (novo gênero a ser descrito) e Omalodes, sendo apoiada por seis transformações (Ebonius + (Omalodini sp. + Omalodes)). O grupo irmão de Omalodini foi definido como um clado composto pelas linhagens de Histerini, Platysomatini e Hololeptini. Hipóteses conflitantes foram geradas sobre o posicionamento dos subgêneros de Omalodes perante a análise com pesos implícitos. Salienta-se que Omalodes (Omalodes) compõe o maior grupo de Omalodini sendo necessária uma análise com maior amostragem para considerações mais precisas acerca das relações internas do gênero. Os grupos excluídos a posteriori de Omalodini, Theropatina, Asolenus, Atribalus, Blypotehus, Lewisister, Notolister, Perfidolenus, Rhypochares, Sphyracus, e Scapomegas não puderam ser alocados em nenhuma das tribos existentes de Histerinae.
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Taxonomia e análise filogenética de Menphis (Hubner, [1819]) e gêneros afins (Lepidoptera: Nymphalidae: Charaxinae) baseada em caracteres morfológicos e moleculares

Dias, Fernando Maia Silva 06 August 2013 (has links)
Resumo: O gênero Memphis (Nymphalidae: Charaxinae: Anaeini) compreende 113 taxa em 63 espécies, sendo o mais numeroso em espécies, na extensão da distribuição geográfica dentre os gêneros da tribo Anaeini, e em espécimes depositados em coleções científicas. As espécies pertencentes a este gênero apresentam variadas formas e padrões de coloração, e muitas delas possuem taxonomia confusa pela considerável variação intraespecífica e dimorfismo sexual. São lepidópteros de vôo rápido e alto, habitantes de copas de árvore e geralmente só observados quando descem próximo ao solo para se alimentar de matéria orgânica em decomposição e excrementos de animais. Espécies atualmente em Memphis foram descritas ou combinadas, no decorrer da história, com uma diversidade de nomes genéricos causando grande divergência entre a composição do gênero, assim como de aceitação e estrutura dos gêneros Anaea, Annagrapha, Cymatogramma, Fountainea e Rydonia. Historicamente, sinonímias e mudanças de categoria taxonômicas vêm sendo realizadas sem embasamento filogenético. Em vista da confusão na sistemática em Memphis, o presente estudo testou a relação entre os taxa através das metodologias cladísticas e probabilística, a partir de matrizes de dados morfológicas e moleculares, abarcando representantes de onze grupos de espécies previamente propostos e de espécies de outros gêneros de Anaeini, Preponini e Prothoini, aprimorando a classificação a partir dos resultados obtidos. A amostragem incluiu todas as espécies de Memphis atualmente reconhecidas, exceto M. viloriae, conhecida apenas do exemplar tipo. Uma matriz com 239 caracteres para 85 terminais foi construída através de estudo da morfologia de estágios imaturos, imagos de ambos os sexos, e caracteres comportamentais. Estes dados foram analisados através da metodologia cladística utilizando o critério da parcimônia com pesagens igual e implícita. Adicionalmente, 658 pares de base do gene citocromo oxidade, subunidade I, foram obtidos para 81 terminais e analisados através da máxima verossimilhança e análise bayesiana; e uma matriz combinada de ambos os conjuntos de dados, com 879 caracteres e 85 terminais foi analisada através da análise bayesiana. Os resultados das análises baseadas na morfologia e em dados combinados suportam o monofiletismo da maior parte dos gupos de espécies previamente propostos e dos gêneros Annagrapha, Cymatogramma, Fountainea, Memphis e Rydonia, com o reconhecimento de um novo gênero com duas espécies, Gênero Novo otrere comb. nov. e Gênero Novo hirta comb. nov. O relacionamento entre os gêneros recuperado pela análise com pesagem implícita é a seguinte: (((Prothoe) (Archaeoprepona (Prepona Agrias)) ((Zaretis Siderone) (Hypna (Consul (Anaea (Polygrapha (Fountainea (Cymatogramma ((Gen. Nov. otrere Gen. Nov. hirta) ((Rydonia Annagrapha) Memphis))))))))))). A análise combinada recupera uma topologia semelhante, porém com menor resolução e diferenças no posicionamento dos gêneros Rydonia, Annagrapha e o Gênero Novo. Nas análises somente com dados moleculares, a maioria dos grupos de espécies é recuperado como monofilético, porém, devido à baixa resolução dos nós internos, o monofiletismo não é recuperado para todos os gêneros propostos. Os resultados das análises filogenéticas suportam a aceitação dos gêneros Annagrapha, Cymatogramma e Rydonia, novas sinonímias, estados revalidados, estados novos, combinações revalidadadas, combinações novas, um gênero novo e uma subespécie nova de F. halice. São fornecidas diagnoses, re-descrições, descrições dos estágios imaturos, dados de distribuição e comentários taxonômicos para cada um dos gêneros reconhecidos. Em Fountainea são alocadas as seguintes espécies: F. centaurus, F. cratais stat. rev., F. eurypyle, F. glycerium, F. halice, F. johnsoni stat. rev., F. nessus, F. nobilis, F. rayoensis stat. rev., F. ryphea, F. sossipus, F. titan stat. rev.; em Cymatogramma, C. appias comb. rev., C. arginussa comb. rev., C. artacaena comb. rev., C. centralis comb. rev., stat. rev., C. glauce comb. rev., C. hedemanni comb. rev., C. herbacea comb. rev., C. juliani comb. rev., C. lankesteri comb. rev., stat. rev., C. lemnos comb. rev., C. neidhoeferi comb. rev., C. perenna comb. rev., C.pithyusa comb. rev., C. praxias comb. rev., C. verticordia comb. rev., C. xenippa comb. rev., C. xenocles comb. rev.; em Annagrapha, A. anna comb. rev., A. aureola comb. rev., A. dia comb. rev., A. elina comb. rev., stat. rev., A. polyxo comb. rev.; em Rydonia, R. falcata comb. rev., R. pasibula comb. rev., R. wellingi comb. nov.; no gênero novo, Gen. Nov. otrere comb. nov. e Gen. Nov. hirta comb. nov.; e em Memphis, M. acidalia, M. alberta, M. ambrosia, M. anassa, M. aulica, M. basilia, M. beatrix, M. boliviana, M. catinka, M. cerealia, M. cleomestra, M. cluvia, M. editha, M. forreri, M. grandis, M. gudrun stat. rev., M. iphis, M. laertes, M. laura, M. leonida, M. lineata, M. lorna, M. lyceus, M. maria, M. montesino, M. mora, M. moruus, M. nenia, M. offa, M. phantes, M. philumena, M. phoebe stat. rev., M. polycarmes, M. proserpina, M. pseudiphis, M. salinasi, M. viloriae.
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Divergência interpopulacional e interespecífica e processo seletivo atuante nos genes ortólogos a fruitless e Odysseus em Drosophila mojavensis e D. arizonae /

Santos, Wellington dos. January 2014 (has links)
Orientador: Claudia Marcia Aparecida Carareto / Banca: Luis Gustavo da Conceição Galego / Banca: Francisco Langeani Neto / Resumo: A despeito de ter sido intensivamente estudado, muitas das questões sobre o processo de especiação ainda permanecem sem respostas, principalmente em relação às alterações genéticas que conduzem ao isolamento reprodutivo. Neste trabalho foram analisados dois genes candidatos a genes de especiação, fruitless (fru) e Odysseus (OdsH), em duas espécies cactofílicas estreitamente relacionadas de Drosophila, D. mojavensis e D. arizonae, que divergiram de um ancestral comum a menos que 1 milhão de anos atrás. O gene fru exerce um papel predominante na especificação do potencial para o comportamento sexual de machos de Drosophila, podendo influenciar no isolamento reprodutivo pré-zigótico. O gene OdsH, que contém um homeodomínio que sofreu rápida evolução no subgrupo melanogaster, associa-se a esterilidade híbrida em Drosophila. Foram amplificados e sequenciados fragmentos destes genes em quatro linhagens de D. mojavensis e duas de D. arizonae e realizadas análises de diversidade, testes de seleção e análises filogenéticas. Ambos os genes apresentaram baixa diversidade entre as sequências das duas espécies, o que está de acordo com a divergência recente entre elas. Os testes de seleção realizados para as sequências de ambos os genes revelaram que os fragmentos analisados estão sob seleção purificadora, o que está de acordo com dados em outras espécies de Drosophila considerando o gene fru, mas é diferente do observado no subgrupo melanogaster para o gene OdsH, onde o gene mostra sinal de seleção positiva. As relações filogenéticas reconstruídas para as sequências dos dois genes, bem como redes de haplótipos permitiram fazer inferências sobre a história evolutiva das espécies e suas populações. Análises de Neighbor Joining e de Máxima Verossimilhança agruparam todas a sequências de D. mojavensis em um clado monofilético, como também as sequências de cada uma de suas linhagens corroborando... / Abstract: Despite having been intensively studied, many questions about the process of speciation remain unanswered, especially regarding genetic changes that lead to reproductive isolation. In this study we analyzed two genes candidates for speciation genes, fruitless (fru) and Odysseus (OdsH) in two closely related cactophilic Drosophila species, D. mojavensis and D. arizonae, which diverged from a common ancestor less than 1 million years ago. The fru gene plays a predominant role in the specification of the potential for sexual behavior of Drosophila male, thus influencing the pre-zygotic isolation. OdsH, a gene with a homeodomain that has undergone rapid evolution in the melanogaster subgroup of species, has been associated to hybrid sterility in Drosophila. Sequences of these two genes, known to be variable in Drosophila and other insects, were amplified and sequenced in four strains of D. mojavensis and two of D. arizonae. Analyses of diversity, selection tests and phylogenetic analyses were performed. Both genes show low diversity between the sequences from the two species, which is consistent with the recent divergence between them. The selection tests performed for the sequences showed that the fragments analyzed of both genes are under purifying selection, which is consistent with data in other Drosophila species considering the fru gene, but is different from data for OdsH in species of the subgroup melanogaster, in which is under positive selection. Phylogenetic relationships reconstructed for the sequences of the two genes, as well as networks of haplotypes allowed to make inferences about the evolutionary history of species and populations. Analyzes of Neighbor Joining and Maximum Likelihood clustered all the sequences of D. mojavensis in a monophyletic clade, as well as the sequences of each of its strains, reinforcing the classification of subspecies for the populations from where they were colected. However, the monophyly... / Mestre
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Relacionamento filogenético entre espécies pertencentes às famílias Belostomatidae, Gelastocoridae, Gerridae, Notonectidae, Veliidae (Hemiptera: Heteroptera) e Cercopidae (Hemiptera:Auchenorrhyncha)

Castanhole, Márcia Maria Urbanin [UNESP] 04 March 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-03-04Bitstream added on 2014-06-13T20:43:04Z : No. of bitstreams: 1 castanhole_mmu_dr_sjrp.pdf: 1206486 bytes, checksum: c2670f2f722ece441455142300124430 (MD5) / O presente trabalho teve por objetivo principal contribuir com informações relevantes a cerca de espécies pertencentes a percevejos aquáticos e cigarrinha das pastagens neotropicais brasileiras. As relações filogenéticas entre espécies das famílias Belostomatidae, Gelastocoridae, Gerridae, Notonectidae e Veliidae (Heteroptera) e Cercopidae (Auchenorrhyncha) vêm sendo bastante discutidas, devido ao grande número de espécies pertencentes a esses dois grupos, quanto a sua monofilia e proximidade entre os táxons. Neste trabalho, foram realizadas análises de variabilidade genética, composição nucleotídica e relacionamentos filogenéticos baseada em aspectos citogenéticos (número de autossomos, sistema cromossômico do sexo, presença ou ausência de m cromossomos e cromossomos Y), ecológicos (habitat e hábito alimentar), moleculares (marcadores COI, 16S e 28S) e morfológicos (morfologia dos testículos) combinados e separadamente. Por meio das análises foi possível verificar que os táxons estudados de Cercopidae (Cicadomorpha, Auchenorrhyncha) e das infraordens Gerromorpha e Nepomorpha de Heteroptera apresentaram se monofiléticos. Diante dos relacionamentos observados, foi possível propor também, que o estado ancestral para o sistema cromossômico do sexo foi o X0, enquanto que para o número de autossomos não foi possível estabelecer quais eventos estão ocorrendo, se de fissão ou fusão. Os resultados apresentados são de grande importância em virtude da escassez de dados de percevejos aquáticos e cigarrinha das pastagens,principalmente em análises combinadas, contendo dados moleculares, citogenéticos, ecológicos e morfológicos. Porém, ainda é necessária a análise de um maior número de táxons e de regiões gênicas para corroborar tais achados / The present study aimed at contributing with relevant information about the species of aquatic bugs and spittlebugs in Brazilian neotropical pastures. Phylogenetic relationships among species of the families Belostomatidae, Gelastocoridae, Gerridae, Notonectidae and Veliidae (Heteroptera) and Cercopidae (Auchenorrhyncha) have been widely discussed, due to the large number of species belonging to these two groups, as their monophyly and closeness among taxa. In this study, we performed analyzes of genetic variability, nucleotide composition and phylogenetic relationships based on cytogenetic aspects (number of autosomes, sex chromosome system, presence or absence of m-chromosomes and Y chromosomes), ecological (habitat and feeding habits), molecular (COI, 16S and 28S markers) and morphological (morphology of the testes) combined and separately. Through the analysis we found that the taxa studied to Cercopidae (Cicadomorpha, Auchenorrhyncha) and infraorders Gerromorpha and Nepomorpha of Heteroptera showed up monophyletic. Given the observed relationships, it was also possible to propose that the ancestral state for the sex chromosome system was the X0, while the number of autosomes was not possible to establish which events are occurring fission or fusion. The results presented are of great importance due to the scarcity of data from aquatic bugs and spittlebugs, mainly in combined analyzes, data containing molecular, cytogenetic, morphological and ecological. However, it is still necessary to analyze a greater number of taxa and gene regions to corroborate these findings
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Revisão taxonômica e filogenia de Sclerostomini Benesh, 1955 (Coleoptera, Lucanidae, Lucaninae).

Grossi, Paschoal Coelho January 2011 (has links)
Orientadora : Profa. Dra. Lúcia Massutti de Almeida / Co-orientador : Prof. Dr. Fernando Zagury Vas de Mello / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ciencias Biológicas (Entomologia). Defesa: Curitiba, 21/02/2011 / Bibliografia: fls. 144-148 / Área de concentração: Entomologia / Resumo: O presente trabalho é um estudo de Sclerostomini (Coleoptera: Lucanidae: Lucaninae) pertencente à subfamilia Lucaninae. Este estudo inclui por meio de análises filogenéticas com representantes da tribo e demais gêneros de Lucaninae da América do Sul e região Australiana de Lucaninae, excluindo-se os pertencentes à Chiasognathini, Casignetini e Brasilucanini. Com as análises foi possível definir quais táxons permaneceriam em Sclerostomini como um grupo monofilético. Os gêneros excluídos foram provisoriamente mantidos em Lucaninae incertae sedis e Macrocrates Burmeister transferido para Lucanini. Posteriormente foi realizada uma sinopse da tribo com chave para os gêneros, descrição dos mesmos, lista das espécies e material examinado. Dos 11 gêneros incluídos na tribo, seis são descritos como novos. Lectótipos, paralectótipos e um neótipo são designados, novos status para dois subgêneros de Sclerostomus Burmeister são propostos e novas combinações para 12 espécies são feitas. Scortizus Westwood é revisado e três das quatro espécies incluídas são transferidas para um gênero novo e é apresentada uma chave de identificação para as mesmas. Este gênero é provisoriamente alocado em Lucaninae incertae sedis e possui afinidades com outros táxons da região Andina. / Abstract: This is a study of the tribe Sclerostomini (Coleoptera: Lucanidae) which belongs to Lucaninae. A phylogenetic analysis with the representatives of the tribe and all Lucaninae genera from South America and Australia region was performed, excluding that of Chiasognathini, Casignatini and Brasilucanini. It was possible to define Sclerostomini as a monophyletic group and the genera which belong to the tribe. The genera excluded were leave provisionally in Lucaninae incertae sedis and Macrocrates was transferred to Lucanini. A synopsis of Sclerostomini was made with key for the genera, descriptions, species list and examined material. From the 11 genera, six were described as new. Lectotypes, paralectotypes and on neotype are designated, to subgenera reeived genera status, new status and 12 new combinations are presented. The genus Scortizus is revised, and three of the four species included in it are transferred to a new genus and a key for them is included. This new genus is provisory maintened in as Lucaninae incertae sedis and shares some characters with other Andean genera that are dicussed.
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Divergência interpopulacional e interespecífica e processo seletivo atuante nos genes ortólogos a fruitless e Odysseus em Drosophila mojavensis e D. arizonae

Santos, Wellington dos [UNESP] 16 May 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-09-17T15:24:23Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-05-16. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:47:53Z : No. of bitstreams: 1 000846718.pdf: 1350026 bytes, checksum: ccde94ea62cfa0bca8ae7ebc162a76d7 (MD5) / A despeito de ter sido intensivamente estudado, muitas das questões sobre o processo de especiação ainda permanecem sem respostas, principalmente em relação às alterações genéticas que conduzem ao isolamento reprodutivo. Neste trabalho foram analisados dois genes candidatos a genes de especiação, fruitless (fru) e Odysseus (OdsH), em duas espécies cactofílicas estreitamente relacionadas de Drosophila, D. mojavensis e D. arizonae, que divergiram de um ancestral comum a menos que 1 milhão de anos atrás. O gene fru exerce um papel predominante na especificação do potencial para o comportamento sexual de machos de Drosophila, podendo influenciar no isolamento reprodutivo pré-zigótico. O gene OdsH, que contém um homeodomínio que sofreu rápida evolução no subgrupo melanogaster, associa-se a esterilidade híbrida em Drosophila. Foram amplificados e sequenciados fragmentos destes genes em quatro linhagens de D. mojavensis e duas de D. arizonae e realizadas análises de diversidade, testes de seleção e análises filogenéticas. Ambos os genes apresentaram baixa diversidade entre as sequências das duas espécies, o que está de acordo com a divergência recente entre elas. Os testes de seleção realizados para as sequências de ambos os genes revelaram que os fragmentos analisados estão sob seleção purificadora, o que está de acordo com dados em outras espécies de Drosophila considerando o gene fru, mas é diferente do observado no subgrupo melanogaster para o gene OdsH, onde o gene mostra sinal de seleção positiva. As relações filogenéticas reconstruídas para as sequências dos dois genes, bem como redes de haplótipos permitiram fazer inferências sobre a história evolutiva das espécies e suas populações. Análises de Neighbor Joining e de Máxima Verossimilhança agruparam todas a sequências de D. mojavensis em um clado monofilético, como também as sequências de cada uma de suas linhagens corroborando... / Despite having been intensively studied, many questions about the process of speciation remain unanswered, especially regarding genetic changes that lead to reproductive isolation. In this study we analyzed two genes candidates for speciation genes, fruitless (fru) and Odysseus (OdsH) in two closely related cactophilic Drosophila species, D. mojavensis and D. arizonae, which diverged from a common ancestor less than 1 million years ago. The fru gene plays a predominant role in the specification of the potential for sexual behavior of Drosophila male, thus influencing the pre-zygotic isolation. OdsH, a gene with a homeodomain that has undergone rapid evolution in the melanogaster subgroup of species, has been associated to hybrid sterility in Drosophila. Sequences of these two genes, known to be variable in Drosophila and other insects, were amplified and sequenced in four strains of D. mojavensis and two of D. arizonae. Analyses of diversity, selection tests and phylogenetic analyses were performed. Both genes show low diversity between the sequences from the two species, which is consistent with the recent divergence between them. The selection tests performed for the sequences showed that the fragments analyzed of both genes are under purifying selection, which is consistent with data in other Drosophila species considering the fru gene, but is different from data for OdsH in species of the subgroup melanogaster, in which is under positive selection. Phylogenetic relationships reconstructed for the sequences of the two genes, as well as networks of haplotypes allowed to make inferences about the evolutionary history of species and populations. Analyzes of Neighbor Joining and Maximum Likelihood clustered all the sequences of D. mojavensis in a monophyletic clade, as well as the sequences of each of its strains, reinforcing the classification of subspecies for the populations from where they were colected. However, the monophyly...
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Relações filogenéticas das famílias Coreidae e Pentatomidae (Heteroptera: Pentatomomorpha) baseadas nas sequências de genes mitocondriais (Cyt b, COI e 16S), nucleares (28S e 18S) e informações morfológicas

Gomes, Mariana Oliveira [UNESP] 29 November 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-12-02T11:16:49Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-11-29Bitstream added on 2014-12-02T11:21:27Z : No. of bitstreams: 1 000795557_20141210.pdf: 291411 bytes, checksum: ef26c478bbd65316fa5c9242c475b171 (MD5) Bitstreams deleted on 2014-12-12T11:34:17Z: 000795557_20141210.pdf,Bitstream added on 2014-12-12T11:34:48Z : No. of bitstreams: 1 000795557.pdf: 2924422 bytes, checksum: 64932ca8dc0d733d090315dadbe0a39e (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Os Heteroptera possuem grande número de espécies descritas, aproximadamente, 40.000, além de habitat diversificado e hábitos alimentares bem variáveis, pois, podem viver como parasitas de aves ou mamíferos, se alimentarem de estruturas de plantas, micélios de alguns fungos ou outros artrópodes. Apesar destes insetos possuírem importância econômica seus estudos ainda são poucos explorados, principalmente, com relação aos lobos tetsiculares e suas relações filogenéticas. Assim, o presente estudo teve por objetivo inferir e entender as relações filogenéticas de espécies de Heteroptera pertencentes às famílias Coreidae e Pentatomidae, a partir dos fragmentos dos genes mitocondriais (COI, Cyt b e 16S) e nucleares (28S e 18S) e de dados moleculares associados com dados morfológicos e citogenéticos. A partir das análises foi possível identificar algumas relações entre as famílias, tribos e gêneros, demonstrando a eficiência dos genes e metodologias escolhidas. As famílias formam dois clados e esses formam grupo irmão, na maioria das análises. Analisando a família Coreidae observamos na maioria das análises, que formam agrupamentos monofiléticos. Quanto à família Pentatomidae, em todas as análises confirmaram sua monofilia. Observamos o agrupamento constante de espécies da mesma tribo e também agrupamentos congenéricos, com altos valores de bootstrap. Porém, agrupamentos entre espécies de mesma família, porém de tribos diferentes ainda merecem ser melhor estudados e explorados. Foi observado que com a inserção de dados morfológicos e citogenéticos houve uma melhor resolução dos resultados, principalmente, entre as tribos Pentatomini, Chlorocorini e Carpocorini (Pentatomidae). Com a análise evolutiva foi observado que algumas espécies agrupadas possuem características morfológicas mais semelhantes com espécies de outras tribos do que com seu grupo. Com esta análise foi possível identificar as ... / The Heteroptera have large number of described species, about 40,000, and diverse habitat and alimentary habits variables and therefore can live as parasites of birds and mammals, feeding on plant structures, mycelia of fungi or other arthropods. Despite these insects possess economic importance their studies are still few explored mainly in relation to testicular lobes and their phylogenetic relationships. Thus, this study aimed to understand and infer the phylogenetic relationships of species of Heteroptera belonging to the families Coreidae and Pentatomidae, from the fragments of mitochondrial genes (COI, Cyt b and 16S) and nuclear (28S and 18S) and molecular data associated morphological data and cytogenetic data. From the analysis it was possible to identify some relationships between families, tribes and genera, demonstrating the efficiency of genes and methodologies chosen. Families form two clades and these form brother group, most analyzes. Analyzing family Coreidae observed in most analyzes that form monophyletic groups. As the family Pentatomidae in all analyzes confirmed its monophyly. Observed clustering constant species of the same tribe and also congeneric groups with high bootstrap values. However, groupings among species of the same family, but different tribes still deserve to be better studied and explored. It was observed that with the inclusion of morphological and cytogenetic there was a better resolution of the results, especially among the tribes Pentatomini, Chlorocorini and Carpocorini (Pentatomidae). With the evolutionary analysis it was observed that some species grouped morphological characteristics more similar to species of other tribes than with your group. With this analysis it is possible to identify the relationships between families, tribes and genera and some similarities between species of different tribes grouped, however, there is need for a greater number of species and characters involved, because ...
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Análise filogenética de Polybia lepeletier, 1836 (Hymenoptera, Vespidae, Polistinae)

Gelin, Luiz Fernando Fracassi [UNESP] 08 June 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-06-08Bitstream added on 2014-06-13T19:08:33Z : No. of bitstreams: 1 gelin_lff_me_sjrp.pdf: 1317895 bytes, checksum: acd7387f9942ac10952ca2a69878dffc (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Polybia é um gênero de vespas sociais enxameadoras que engloba 58 espécies válidas, distribuídas do sul dos Estados Unidos até o norte da Argentina. Esse gênero é dividido em em 11 subgêneros, alguns deles são altamente variáveis morfológicamente. A dificuldade em encontrar sinapomorfias tanto para o gênero quanto para os subgêneros reflete um histórico taxonômico conturbado, já que as espécies aí incluídas são aquelas que não se encaixam em nenhum outro gênero de Epiponini. Além disso, Polybia difere quanto ao posicionamento filético em estudos morfológicos, comportamentais e moleculares (ou combinados). Levando em conta a dificuldade de encontrar sinapomorfias e a variação do gênero na filogenia dos Epiponini, o objetivo deste estudo foi realizar uma análise filogenética das espécies do gênero, buscando estabelecer as relações subgenéricas e verificar as relações entre as espécies. Para isso foi realizado um estudo da morfologia externa de fêmeas adultas de 50 espécies dos 11 subgêneros de Polybia, no qual foram utilizados caracteres já propostos na literatura e levantados novos caracteres, totalizando 65 caracteres de morfologia externa de fêmeas adultas, 20 caracteres de morfologia externa das larvas e 10 caracteres de arquitetura de ninho. Os caracteres foram dispostos em uma matriz de dados composta por 56 táxons terminais, sendo seis do grupo externo (Protopolybia, Charterginus, Brachygastra, Chartergus, Protonectarina e Epipona) e 95 caracteres. A análise foi realizada no programa TNT 1.1 utilizando o princípio da parcimônia com uma combinação de algorítimos: Tree-drifting, Tree-fusing, Ratchet e Sectorial Searches. Após a análise o programa gerou 22 árvores mais parcimoniosas. A árvore de consenso estrito possui a seguinte topologia para os subgêneros de Polybia: (Apopolybia + (Trichinothorax + ((Cylindroca + Pedothoeca)... / Polybia is a genus of swarm-founding social wasps which comprises 58 described species, ranging from the south of United States to the north of Argentina. It is divided into 11 subgenera, some of them have a great number of polymorphysms. The difficulty on estabilize synapomorphies for the genus or the subgenera may be regarded as consequence of the trublesomme taxonomic background, because the species included in this genus are the one that could not be placed in in other Epiponini genera. Moreover, Polybia differs on its phylogenetic position in the analyses based on morphology, behavior and molecular (or total evidence) data. Taking into account the difficulty on estabilish synapomorphies and the topologic variation in the Epiponini phylogeny, this study aimed to estabilish the subgeneric relationships and verifies the relationships among species. In order to do this, we made a morphological study of adult females’ external parts in 50 species of the 11 Polybia subgenera. It was surveied new characters that were added to the characters previously proposed in the literature, totalizing 65 external morphology of adult females’ characters, 20 characters of external morphology of larvae and 10 characters of nest architecture. The data matrix was composed by 56 terminal taxa (six outgroup: Protopolybia, Charterginus, Brachygastra, Chartergus, Protonectarina e Epipona) and 95 characteres. The analysis was run in the program TNT 1.1 under the parsimony principle with a combination of algorytims: Tree-drifting, Tree-fusing, Ratchet e Sectorial Searches. The analysis generated 22 most parsimonious trees. The consensus tree has the falowing topology: (Apopolybia + (Trichinothorax + ((Cylindroca + Pedothoeca) + (Furnariana + ((Formicicola + Platypolybia) + (Myrapetra + ((Myrapetra + ((Synoecoides + Polybia) + Alpha)) + Myrapetra), confirming. therefore, the monophyly... (Complete abstract click electronic access below)
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Relações filogenéticas das famílias Coreidae e Pentatomidae (Heteroptera: Pentatomomorpha) baseadas nas sequências de genes mitocondriais (Cyt b, COI e 16S), nucleares (28S e 18S) e informações morfológicas /

Gomes, Mariana Oliveira. January 2013 (has links)
Orientador: Mary Massumi Itoyama / Banca: Maria Aparecida Marin Morales / Banca: Carlos Eduardo Almeida / Banca: Carlos Eugênio Cavasini / Banca: Maria Tercilia Vilela de Azeredo Oliveira / Resumo: Os Heteroptera possuem grande número de espécies descritas, aproximadamente, 40.000, além de habitat diversificado e hábitos alimentares bem variáveis, pois, podem viver como parasitas de aves ou mamíferos, se alimentarem de estruturas de plantas, micélios de alguns fungos ou outros artrópodes. Apesar destes insetos possuírem importância econômica seus estudos ainda são poucos explorados, principalmente, com relação aos lobos tetsiculares e suas relações filogenéticas. Assim, o presente estudo teve por objetivo inferir e entender as relações filogenéticas de espécies de Heteroptera pertencentes às famílias Coreidae e Pentatomidae, a partir dos fragmentos dos genes mitocondriais (COI, Cyt b e 16S) e nucleares (28S e 18S) e de dados moleculares associados com dados morfológicos e citogenéticos. A partir das análises foi possível identificar algumas relações entre as famílias, tribos e gêneros, demonstrando a eficiência dos genes e metodologias escolhidas. As famílias formam dois clados e esses formam grupo irmão, na maioria das análises. Analisando a família Coreidae observamos na maioria das análises, que formam agrupamentos monofiléticos. Quanto à família Pentatomidae, em todas as análises confirmaram sua monofilia. Observamos o agrupamento constante de espécies da mesma tribo e também agrupamentos congenéricos, com altos valores de bootstrap. Porém, agrupamentos entre espécies de mesma família, porém de tribos diferentes ainda merecem ser melhor estudados e explorados. Foi observado que com a inserção de dados morfológicos e citogenéticos houve uma melhor resolução dos resultados, principalmente, entre as tribos Pentatomini, Chlorocorini e Carpocorini (Pentatomidae). Com a análise evolutiva foi observado que algumas espécies agrupadas possuem características morfológicas mais semelhantes com espécies de outras tribos do que com seu grupo. Com esta análise foi possível identificar as ... / Abstract: The Heteroptera have large number of described species, about 40,000, and diverse habitat and alimentary habits variables and therefore can live as parasites of birds and mammals, feeding on plant structures, mycelia of fungi or other arthropods. Despite these insects possess economic importance their studies are still few explored mainly in relation to testicular lobes and their phylogenetic relationships. Thus, this study aimed to understand and infer the phylogenetic relationships of species of Heteroptera belonging to the families Coreidae and Pentatomidae, from the fragments of mitochondrial genes (COI, Cyt b and 16S) and nuclear (28S and 18S) and molecular data associated morphological data and cytogenetic data. From the analysis it was possible to identify some relationships between families, tribes and genera, demonstrating the efficiency of genes and methodologies chosen. Families form two clades and these form brother group, most analyzes. Analyzing family Coreidae observed in most analyzes that form monophyletic groups. As the family Pentatomidae in all analyzes confirmed its monophyly. Observed clustering constant species of the same tribe and also congeneric groups with high bootstrap values. However, groupings among species of the same family, but different tribes still deserve to be better studied and explored. It was observed that with the inclusion of morphological and cytogenetic there was a better resolution of the results, especially among the tribes Pentatomini, Chlorocorini and Carpocorini (Pentatomidae). With the evolutionary analysis it was observed that some species grouped morphological characteristics more similar to species of other tribes than with your group. With this analysis it is possible to identify the relationships between families, tribes and genera and some similarities between species of different tribes grouped, however, there is need for a greater number of species and characters involved, because ... / Doutor

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