Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-03-28T23:44:47Z No. of bitstreams: 1 MarcelloFreireAlvesDeSouza_DISSERT.pdf: 1986391 bytes, checksum: 9141a1d4aa66ea914416e1981fed4e4f (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-03-29T00:01:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MarcelloFreireAlvesDeSouza_DISSERT.pdf: 1986391 bytes, checksum: 9141a1d4aa66ea914416e1981fed4e4f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-29T00:01:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MarcelloFreireAlvesDeSouza_DISSERT.pdf: 1986391 bytes, checksum: 9141a1d4aa66ea914416e1981fed4e4f (MD5) Previous issue date: 2015-04-10 / Atualmente a ecografia diagn?stica est? inserida em v?rias ?reas da atua??o m?dica e vem sendo realizada por diversos profissionais m?dicos, desde os que militam diretamente na ?rea da imagem como os imagenologistas (radiologistas e ultrassonografistas), at? os ginecologistas, pediatras, neurologistas, cl?nicos gerais, endocrinologistas, angiologistas, ortopedistas, reumatologistas, urologistas, cirurgi?es gerais e vasculares. ? bem sabido que o profissional m?dico, para o exerc?cio de sua miss?o, necessita de um amplo conjunto de habilidades, compet?ncias e atitudes desenvolvidas e exercitadas durante o seu per?odo de forma??o. Convivendo com estudantes de medicina ao longo de quase 20 anos em ambiente hospitalar, observei lacunas no processo de aprendizagem por parte dos alunos quanto ao que ? ultrassonografia diagn?stica e suas aplica??es, evidenciando-se falhas quanto ? compreens?o da ac?stica b?sica ecogr?fica, percebendo-se dificuldades quanto ? identifica??o das estruturas anat?micas nas imagens ecogr?ficas, inabilidade nas solicita??es de exames e nas interpreta??es das imagens e dos laudos. Partindo dessas constata??es, foi desenvolvido neste mestrado profissional um livro digital multim?dia que exp?e o que vem a ser a ultrassonografia como modalidade diagn?stica por imagem, tratando de sua historiografia e seus conceitos f?sicos/ac?sticos, relatando o processo de forma??o da imagem ecogr?fica, discorrendo sobre as caracter?sticas dos equipamentos ultrassonogr?ficos e suas tecnologias embarcadas, destacando-se suas aplica??es diagn?sticas, estas ?ltimas apresentadas por meio de v?deos nos quais ser?o descritos aspectos das imagens ecogr?ficas captadas. Esse livro estar? dispon?vel para acesso em formato digital, servindo de ferramenta did?tica ? forma??o m?dica desde o in?cio da gradua??o e poder? ser utilizado conjuntamente com a disciplina de anatomia topogr?fica e descritiva, oferecida no ciclo b?sico do curso de gradua??o em medicina da Universidade Federal do Rio Grande do Norte-UFRN. / Currently, the diagnostic ultrasound is inserted in various areas of medical action and carried out by many medical professionals, from which militate directly in the image area, such as radiologists and sonographers, but also by gynecologists, pediatricians, neurologists, general practitioners, endocrinologists, angiologists, orthopedists, rheumatologists, urologists, general and vascular surgeons. It is well known that the medical professional, for the exercise of its mission, requires a broad set of skills, competencies and attitudes developed and exercised during their training period. Living with medical students over nearly 20 years in hospital environment, I noticed gaps in the learning process by the students about what is diagnostic ultrasound and its applications, demonstrating failures as understanding the basic acoustic ultrasound, difficulties in identifying of anatomical structures in ultrasound images and inability in requests examinations and interpretations of images and reports. Based on these findings, it was developed in this Professional Masters a multimedia digital book that exposes what the ultrasound as a diagnostic modality imaging, dealing with its historiography and its physical/acoustic concepts, relating the process of formation of the ultrasound image, discussing about the features of sonographic equipments and their embedded technologies and highlighting its diagnostic applications , the latter presented through videos which will be described aspects of captured ultrasound images. This book will be available for access in digital format, serving as a teaching tool in medical education since the beginning of the course, so that can be used in conjunction with the discipline of Gross Anatomy, offered in the basic cycle of the Medicine Undergraduate Course of the Federal University of Rio Grande do Norte (UFRN).

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:50:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 450151.pdf: 5232039 bytes, checksum: 9491305c42da390420a0305a83ed9d50 (MD5) Previous issue date: 2013-03-27 / Hippocampus segmentation in magnetic resonance imaging is an important procedure in many clinical situations, such as monitoring changes in patients with Alzheimer's disease. However, the manual delineation of this structure, in three-dimensional images, is a laborious task and prone to subjective interpretation of the health professional. Some automated methods have been proposed in recent years. Much of these methods use pre-segmented templates, also known as atlas, which are aligned to the input image in the segmentation process. However, using a single standard atlas increases the dif?culty targeting individuais that have non-normal anatomy, such as the elders and patients with AD. To achieve a good precision in these cases, without any manual intervention of the user, new methods employ techniques in which several different atlases are used. The alignment of these atlases with the image, leads to a high computational cost. This work proposes employing and atlas selection technique by meta-information in order to choose the ideal tiemplate for an individual, enabling low computational cost segmentation technique. The results obtained, by testing 350 individuals, in various clinical conditions and ages, showed that the use of atlas selection significantly increases segmentation accuracy, when compared to a method using a default atlas, while keeping the computational cost low. The relevance of three selection parameters medical condition, age and gender - has been evaluated and confirmed by the test suite. / A segmenta??o do hipocampo em imagens de resson?ncia magn?tica ? um importante procedimento em variadas situa??es cl?nicas, como por exemplo, no acompanhamento da evolu??o da doen?a de Alzheimer. Por?m, a delimita??o manual desta estrutura, em imagens tridimensionais, ? uma tarefa bastante trabalhosa e sujeita a interpreta??o subjetiva do profissional de sa?de. Alguns m?todos automatizados foram propostos nos ?ltimos anos. Grande parte destes m?todos utilizam modelos pr?-segmentados, tamb?m conhecidos como atlas, que s?o alinhados ? imagem de entrada no processo de segmenta??o. No entanto, a utiliza??o de um ?nico atlas padr?o dificulta a segmenta??o de indiv?duos com anatomia diferente da normal, como idosos e pacientes com a doen?a de Alzheimer. Para alcan?ar boa precis?o nestes casos, sem nenhuma interven??o manual do usu?rio, novos m?todos empregam t?cnicas nas quais v?rios atlas diferentes s?o utilizados. O alinhamento destes atlas com a coagem leva a um custo computacional elevado. Este trabalho prop?em o emprego de uma t?cnica de sele??o de atlas por meta-informa??o de modo a escolher o atlas ideal para um indiv?duo e possibilitar o emprego de uma t?cnica de segmenta??o com baixo custo computacional. Os resultados, obtidos atrav?s de testes com exames de 350 indiv?duos em variadas condi??es cl?nicas e faixas et?rias, mostram que o emprego de sele??o de atlas aumenta significativamente a precis?o de segmenta??o, quando comparado ? um m?todo que utiliza um atlas padr?o, mantendo o custo computacional baixo. A relev?ncia de tr?s par?metros de sele??o - condi??o cl?nica, faixa et?ria e g?nero - foi avaliada e confirmada atrav?s do conjunto de testes.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:33:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 446507.pdf: 436565 bytes, checksum: 4c823a43f4c8a59fe78a718fa8291c1a (MD5) Previous issue date: 2013-03-04 / Aims: The aims of the study were to assess the necessity of lateral chest X-rays in newborns on mechanical ventilation in a neonatal intensive care unit, and to estimate the dose of radiation exposure during such exams. Methods: Cross-sectional study performed at the neonatal intensive care unit of a city hospital in Porto Alegre (Brazil). Patients were followed on daily basis, and all chest x-rays were registered while they were on mechanical ventilation, including the first day postextubation. Two experienced neonatologists were included as external observers, to assess, independently, the necessity of having performed each of the lateral views of chest x-rays all newborns had. Results: Sixty five newborns were included. There were 426 chest x-rays requisitions during the study period. Of these, 374 were antero-posterior plus lateral views and 52 were only antero-posterior views. The index of chest x-rays requisitions was of 0,8 x-rays per newborn per day, corresponding to 0,7 antero-posterior and lateral views per newborn per day and 0,1 antero-posterior x-rays per newborn per day. The use of the antero-posterior view associated with the lateral view compared to only the antero-posterior view increases three-fold the exposition of the newborn to ionizing radiation. Conclusion: We noticed the lack of well-defined guidelines on the use of the lateral view of chest x-rays in neonatal intensive care units. Many institutions, including ours, are performing chest-x-rays lateral views at a rate greater than needed. This behavior leads to an elevated exposition of radiation dose to the newborns, potentially leading to future consequences. / Objetivos: Os objetivos do presente estudo s?o avaliar a necessidade das radiografias de t?rax em perfil dos rec?m-nascidos submetidos ? ventila??o mec?nica de uma Unidade de Tratamento Intensivo Neonatal, bem como determinar a dose de exposi??o ? radia??o durante esses exames.M?todos: Estudo prospectivo, transversal, conduzido na Unidade de Tratamento Intensivo Neonatal de um hospital em Porto Alegre (Brasil). O estudo foi realizado entre 01 de dezembro de 2011 e 01 de junho de 2012. O paciente foi acompanhado diariamente, anotando-se todas as radiografias de t?rax realizadas durante o tempo em que permaneceu em ventila??o mec?nica at? o 1? dia p?s-extuba??o (inclusive). Participaram, como avaliadores externos, dois neonatologistas com longa experi?ncia na ?rea. Ambos avaliaram, de forma independente, a necessidade ou n?o de se realizar a radiografia de t?rax na posi??o em perfil para cada exame solicitado. Resultados: Sessenta e cinco crian?as foram inclu?das. Houve 426 requisi??es de radiografias de t?rax durante o per?odo do estudo. Dessas, 374 foram proje??es ?ntero-posteriores e perfil, enquanto que, em 52, foi realizado somente o ?ntero-posterior. O ?ndice de solicita??es de radiografias de t?rax equivaleu a 0,8 radiografias por crian?a por dia de interna??o, correspondendo a 0,7 radiografias ?ntero-posterior e perfil por crian?a por dia e 0,1 radiografia ?ntero-posterior por crian?a por dia. O fato de se realizar um exame de t?rax em ?ntero-posterior e perfil, comparado quando realizado apenas o ?ntero-posterior, aumenta em mais de 3 vezes a exposi??o do rec?m- nascido ? radia??o ionizante. Conclus?o: Observamos que n?o existem diretrizes bem definidas e claras sobre a realiza??o da radiografia de t?rax em perfil nas Unidades de Tratamento Intensivo Neonatais. Muitas institui??es, assim como a nossa, est?o realizando proje??es em perfil em uma frequ?ncia muito maior do que a necess?ria. Esse comportamento resulta em uma exposi??o de dose elevada para esses rec?m-nascidos, podendo gerar consequ?ncias futuras.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:35:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 429244.pdf: 7848641 bytes, checksum: 61cb9e48ce85b1b1f7a5bc2b6e4b3be6 (MD5) Previous issue date: 2011-01-18 / Este trabalho teve como objetivo principal desenvolver e validar um prot?tipo de Ambiente Colaborativo em Medicina Nuclear em um teste piloto, com profissionais experientes da ?rea de Medicina Nuclear. Inicialmente, foram detectadas as premissas, restri??es e funcionalidades necess?rias para o desenvolvimento e implementa??o deste ambiente. Bancos de Imagens Cl?nicas, Experimentais e Simuladas foram desenvolvidos, al?m de um Banco de Documentos e um prot?tipo para realizar a submiss?o facilitada de simula??es pelo m?todo Monte Carlo atrav?s de processamento em cluster computacional hospedado no Laborat?rio de Alto Desempenho da PUCRS. O prot?tipo foi desenvolvido no ambiente Moodle, amplamente utilizado pela comunidade cient?fica e acad?mica e foi avaliado com uma amostra de quinze profissionais experientes que atuam efetivamente na ?rea de Medicina Nuclear em um teste piloto de intera??o. Foram realizadas an?lises descritivas da amostra, bem como an?lises quantitativas e qualitativas da opini?o dos usu?rios no intuito de promover a melhoria desse ambiente. O Ambiente Colaborativo em Medicina Nuclear teve boa aceita??o pela amostra do teste piloto e poder? ser aprimorado para a futura aplica??o na rotina dos profissionais que atuam em servi?os de Medicina Nuclear, universidades e em pesquisas nesta ?rea.

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2016-06-22T19:31:46Z No. of bitstreams: 1 DIS_PEDRO_COSTA_KLEIN_COMPLETO.pdf: 6980963 bytes, checksum: a6ac65c82ee1febce8c50b5771036f44 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-22T19:31:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_PEDRO_COSTA_KLEIN_COMPLETO.pdf: 6980963 bytes, checksum: a6ac65c82ee1febce8c50b5771036f44 (MD5) Previous issue date: 2016-03-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The white matter lesion detection is an important procedure for the diagnostic of Multiple Sclerosis in patients. As important as the detection, monitoring the progression of the disease, by calculating the volumes of the lesions, also shows itself necessary. In clinical practice, this procedure is done manually by a professional or, in many cases, only a qualitative analysis is made. The manual nature of this procedure implies in a series of deficiencies on the procedure, such as variations between diagnoses from different experts on the same subject and variation between diagnostics from the same expert to the same subject at distinct moments. Yet, the manual procedure shows itself time consuming, due the large amount of slices acquired by exam and the need for a careful analysis from the expert to quantify the lesions. In order to avoid these problems, automatic approaches for Multiple Sclerosis lesion detection and quantification using computer aided diagnostic systems are proposed. These methods, mostly, demand for the acquisition of an extra modality of magnetic resonance images, where the anatomy of the brain is evidenced, thus allowing the white matter lesion identification. This additional exam goes beyond the scope of the traditional clinical practice, which implies in additional costs and prevents the method of being applied to old exams, for monitoring the disease progression. This work proposes a method for automatic detection and segmentation of Multiple Sclerosis Lesions that uses only the modality of magnetic resonance exam adopted for clinical practice, using probabilistic atlases spatially aligned to the patient?s exams for identifying the brain structures. The results obtained through the usage of the method into a set of 24 patients and 6 healthy controls of different ages, showed that the developed method is capable of detecting white matter lesions with some precision. However, the quantification of these lesions was impaired mostly due divergences between the white matter probabilistic atlas and the real white matter region of the exams. / A detec??o de les?es de subst?ncia branca ? um procedimento importante para o diagn?stico da Esclerose M?ltipla em pacientes. T?o importante quanto a detec??o, o acompanhamento da progress?o da doen?a, por meio do c?lculo da volumetria destas les?es, tamb?m se mostra necess?rio. Na pr?tica cl?nica, este procedimento ? realizado manualmente por um profissional, ou em muitas vezes ? somente realizada uma an?lise qualitativa. O car?ter manual deste procedimento implica em uma s?rie de defici?ncias no procedimento como varia??es entre diagn?sticos de diferentes especialistas para um mesmo paciente e varia??es entre diagn?sticos de um mesmo especialista para um mesmo paciente em momentos distintos. Ainda, a tarefa manual mostra-se muito custosa em tempo, devido ao grande n?mero de fatias adquiridas por exame e a necessidade de uma an?lise cuidadosa do especialista para a quantifica??o das les?es. Com o intuito de evitar estes problemas, abordagens autom?ticas para detec??o e quantifica??o de les?es de Esclerose M?ltipla atrav?s do uso de sistemas de diagn?stico auxiliado por computador v?m sendo propostas. Estes m?todos autom?ticos, em sua maioria, demandam a aquisi??o de uma modalidade adicional de imagem de resson?ncia magn?tica, na qual ficam evidenciadas as estruturas anat?micas do c?rebro, permitindo assim a identifica??o de les?es em subst?ncia branca. Este exame adicional foge ao escopo tradicional da pr?tica cl?nica, o que implica em custos adicionais e impede que estes m?todos sejam aplicados em exames antigos, para acompanhamento da progress?o da doen?a. Este trabalho prop?e um m?todo para detec??o e segmenta??o autom?tica de les?es de Esclerose M?ltipla que utiliza apenas a modalidade de exame de resson?ncia magn?tica utilizada na pr?tica cl?nica, utilizando para identifica??o das estruturas cerebrais atlas probabil?sticos alinhados ao espa?o do paciente. Os resultados obtidos atrav?s do emprego do m?todo em um conjunto de 24 pacientes e 6 controles de diferentes faixas et?rias, mostram que o m?todo desenvolvido ? capaz de detectar les?es de subst?ncia branca com certa precis?o. Entretanto a quantifica??o destas les?es mostrou-se prejudicada principalmente por diverg?ncias entre o atlas probabil?stico de subst?ncia branca e a regi?o real de subst?ncia branca nos exames.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:47:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ItaloMSR_DISSERT.pdf: 4133389 bytes, checksum: 575496a3d8aa350df8e3e86992d9b27b (MD5) Previous issue date: 2011-03-02 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The vascular segmentation is important in diagnosing vascular diseases like stroke and is hampered by noise in the image and very thin vessels that can pass unnoticed. One way to accomplish the segmentation is extracting the centerline of the vessel with height ridges, which uses the intensity as features for segmentation. This process can take from seconds to minutes, depending on the current technology employed. In order to accelerate the segmentation method proposed by Aylward [Aylward & Bullitt 2002] we have adapted it to run in parallel using CUDA architecture. The performance of the segmentation method running on GPU is compared to both the same method running on CPU and the original Aylward s method running also in CPU. The improvemente of the new method over the original one is twofold: the starting point for the segmentation process is not a single point in the blood vessel but a volume, thereby making it easier for the user to segment a region of interest, and; the overall gain method was 873 times faster running on GPU and 150 times more fast running on the CPU than the original CPU in Aylward / A segmenta??o vascular ? importante no diagn?stico de doen?as como o acidente vascular cerebral e ? dificultada por ru?dos na imagem e vasos muito finos que n?o s?o vistos. Uma maneira de realizar a segmenta??o ? extraindo a centerline do vaso com height ridges, que usa a intensidade como caracter?sticas para a segmenta??o. Este processo pode levar de segundos a minutos, dependendo da tecnologia atual empregada. O m?todo ? implementado em GPU, ou seja, ? executado de maneira paralela em placa gr?fica. O desempenho do m?todo de segmenta??o executado em GPU ? comparado com o mesmo m?todo em CPU e o m?todo original de Aylward em execu??o tamb?m na CPU. O melhoramento do novo m?todo sobre o original ? dupla. O ponto de partida para o processo de segmenta??o n?o ? um ?nico ponto no vaso sangu?neo, mas um volume, tornando assim mais f?cil para o usu?rio a sele??o de uma regi?o de interesse, e, o ganho do m?todo proposto foi 873 vezes mais r?pido sendo executado em GPU e 150 vezes mais r?pido sendo executado em CPU do que o original de Aylward em CPU