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Glicobiologia estrutural e evolução molecular da PglB de Campylobacter lari

Pedebos, Conrado January 2013 (has links)
A N-glicosilação é um processo pós-traducional que se caracteriza pela adição de um oligossacarídeo a cadeia lateral de um resíduo de asparagina, contida na assinatura D/E-X-N-X-S/T em bactérias. Na última década, a partir do organismo modelo Campylobacter jejuni identificaram-se diversas enzimas participantes da rota da N-glicosilação. Dentre estas, a proteína responsável pela transferência em bloco da cadeia oligossacarídica para a proteína aceptora é a oligossacariltransferase PglB, cuja estrutura foi obtida por cristalografia em 2011. A partir destes avanços, o presente trabalho visa contribuir no entendimento do processo de N-glicosilação ao acrescentar à PglB cristalografada a presença de explícita de solvente, flexiblidade e substratos. Ainda, busca caracterizar filogeneticamente a proteína compreendendo os três domínios da vida, descrevendo a sua história evolutiva. Os resultados obtidos indicam que a PglB pode possuir diferentes conformações para o sítio catalítico, algo não observado na estrutura cristalográfica, alternando entre esses estados durante o tempo. Além disso, a proteína demonstrou realizar movimentos que sugerem a existência de uma espécie de alosteria no sítio catalítico, onde a proteína aceptora glicosilada tem sua saída facilitada a partir de alterações conformacionais comunicadas entre as cavidades da enzima. O motivo conservado WWDYGY manteve-se fortemente interagindo com o substrato, enquanto o motivo MIV pouco interagiu com a treonina da posição +2. Dessa maneira, os dados desse trabalho auxiliam no entendimento da glicobiologia estrutural da PglB e trazem novas informações relativas a catálise. Adicionalmente, dados preliminares sobre a ancestralidade dessa enzima formam a primeira amostragem de uma árvore compondo os três domínios, assim como uma segunda árvore descreve a transição do motivo MIV no domínio Bacteria. / N-glycosylation is a post-translational feature which is characterized by the addition of an oligosaccharide to the side-chain of an asparagine residue presented in the motif D/E-X-N-X-S/T in Bacteria. In the last decade, studies in the C. jejuni species identified many enzymes participating in the N-glycosylation pathway. Among these, the protein responsible for the en bloc transference of the oligosaccharide chain to the protein acceptor is the oligosaccharyltransferase PglB, whose structure was obtained in 2011 by x-ray crystallography. Departing from these findings, the present work aims to contribute for the comprehension of the N-glycosylation process by adding explicit solvent, flexibility and substrates to the PglB crystallographic structure. Still, we attempt to infer the phylogeny of the protein comprising the three domains of life, describing the evolutionary history of the enzyme. The obtained results indicate that PglB may possess different conformations for the catalytic site, a characteristic not observed in the crystal structure, alternating between states. Besides, the protein demonstrated movements that suggest the existence of an allosteric mechanism in the catalytic site, where the exit of the glycosylated protein is facilitated by conformational transitions communicated between cavities. The conserved motif WWDYGY performed strong interactions with the proteic substrate, while the MIV motif did not. Thus, these data may contribute to understand the structural glycobiology of PglB and bring new insights regarding the catalysis mechanism. Additionally, preliminary data involving the ancestrality of this enzyme demonstrated the first phylogenetic tree comprising the three domains, as well as a second tree which describes the transition of the MIV motif in the Bacteria domain.
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Predição in silico do efeito de grampos olefínicos em peptídeos como estratégia ao planejamento racional de compostos bioativos

Villavicencio, Bianca January 2016 (has links)
O estudo de peptídeos grampeados, que estabilizam voltas de hélices-α com a ligação de uma cadeia química, desenvolveu-se na última década, uma vez que a adição de um elemento não peptídico (grampo) mostrou aumentar o conteúdo de hélice e a estabilidade conformacional destas moléculas. A consequente manutenção de um arcabouço estrutural definido possibilita, em princípio, simular regiões específicas da superfície de proteínas e, assim, modular terapeuticamente potenciais vias de sinalização associadas. Neste sentido, a capacidade de antecipar a eficácia de grampos sobre peptídeos específicos através de simulações computacionais pode contribuir na aceleração e na redução de custos no processo de planejamento racional de novos fármacos. O presente trabalho buscou avaliar a capacidade de simulações por dinâmica molecular em reproduzir o efeito conformacional de grampos olefínicos em um peptídeo derivado da RNAse A. Foram utilizados três diferentes campos de força: AMBER99SB-ILDN, CHARMM36 e GROMOS54a7, e os resultados foram comparados a dados de dicroismo circular obtidos experimentalmente, além de análises de RMSD, RMSF, estrutura secundária e conteúdo de hélice. Os parâmetros utilizados com o campo de força átomo unido GROMOS54a7 foram os que mais se aproximaram dos dados experimentais, embora não tendo sucesso na descrição de dois dos três grampos nos parâmetros simulados, mas tendo um desempenho melhor do que campos de força que descrevem todos os átomos do sistema. Tais resultados indicam que, com melhorias na parametrização, a dinâmica molecular pode ser utilizada para antecipar efeitos conformacionais de grampos olefínicos em peptídeos. / The study of stapled peptides, which stabilize turns of an alpha-helix through the addition of a linker, has developed in the last decade since it was shown that the addition of the staple enhanced helical content and conformational stability of peptides. The maintenance of a structural scaffold allows the simulation of specific regions of protein surfaces, and thus allows the therapeutical modulation of signaling pathways of interest. The ability to anticipate the efficacy of the addition of a staple in a peptide through computational simulations may contribute to enhance the speed and lower the costs associated with rational drug design. This work evaluated the capability of molecular dynamics simulations to reproduce the effect of all-hydrocarbon staples in an RNAse A-derived peptide. We used three different force fields: AMBER99SB-ILDN, CHARMM36 and GROMOS54a7, and the results were compared to experimentally obtained circular dichroism data. The parameters used with the GROMOS54a7 united-atom force field revealed themselves to be more closely related to experimental data, even though it does not reproduce the effect of the addition of a staple in two of three stapled peptides, but it also shows an enhanced performance when compared to all-atom force fields. These results indicate that, with further enhancement of parametrization, molecular dynamics simulations may be used to anticipate conformational effects of all-hydrocarbon staples in peptides.
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Estudo de propriedades mecânicas de novas nanoestruturas de carbono através de simulação molecular

Silveira, Julian Francisco Rama Vieira January 2016 (has links)
Nas últimas décadas, foram descobertas e estudadas diversas nanoestruturas baseadas em carbono, como os fulerenos, os nanotubos de carbono e o grafeno. Estas apresentam um conjunto de propriedades físicas excepcional, com vasto potencial de aplicação no desenvolvimento de novas tecnologias. Estes materiais também têm servido como blocos fundamentais para a criação de novas nanoestruturas, com propriedades físicas diferenciadas, que podem ser modificadas e controladas visando aplicações específicas. Estudos experimentais recentes nesta área são promissores, porém falta um maior entendimento fundamental destas novas estruturas e suas propriedades. O objetivo deste trabalho é propor novas nanoestruturas alternativas baseadas em carbono, buscar um melhor entendimento da estrutura de nanomateriais recentemente sintetizados e reportados na literatura e avaliar suas propriedades mecânicas através de simulações de dinâmica molecular, de modo a verificar se apresentam potencial para serem aplicados em dispositivos práticos no qual alta resistência mecânica e leveza sejam necessárias. Foram estudadas três classes de estruturas: superestruturas à base de anéis feitos com nanotubos de carbono (nanocorrentes e nanogrades) propostas neste trabalho, estruturas híbridas combinando grafeno e nanotubos, de forma a buscar uma estrutura mais resistente, reportadas recentemente na literatura (chamada de grafeno rebar), e superestruturas ramificadas utilizando nanofilamentos de diamante (diamond nanothreads) também sintetizados em estudos recentes. As superestruturas à base de anéis apresentaram excelentes propriedades mecânicas, apresentando resistência mecânica superior a materiais convencionais, porém com grande elasticidade, o que deve motivar mais estudos sobre essa emergente classe de nanomateriais. Os testes com o grafeno rebar permitiram demonstrar o conceito caraterístico da estrutura híbrida, onde os nanotubos agem como reforço estrutural para o grafeno. Finalmente, com base nos testes realizados, as superestruturas feitas a partir de nanofilamentos de diamante se mostraram instáveis para possível aplicação, tal que novas configurações devem ser buscadas. Estes resultados trazem um maior entendimento sobre a relação entre estrutura e propriedades destes nanomateriais, motivando futuros estudos teóricos e experimentais envolvendo a aplicação destas no desenvolvimento de novas tecnologias. / Several carbon-based nanostructures have been discovered and studied in the last decades, such as fullerenes, carbon nanotubes and graphene. These materials exhibit an outstanding set of physical properties, which can be applied in the development of new technologies. The same materials have also been used as building blocks for creating new nanostructures with different physical properties, which can be modified and controlled towards specific applications. Recent experimental studies in this area are promising, but a greater fundamental understanding of these new structures and their properties are still elusive. The objective of this dissertation is to propose novel carbon-based nanostructures, to obtain a better understanding of the structure of newly synthesized nanomaterials reported in the literature, and evaluate their mechanical properties using molecular dynamics simulations, in order to evaluate their suitability for the development of practical devices where strong and light-weight materials are required. Three types of carbon nanostructures were studied: superstructures based on rings made out of carbon nanotubes (nanochains and nanofences) proposed in this work, hybrid structures combining graphene and nanotubes, recently reported in the literature (called graphene rebar), and branched superstructures using diamond nanothreads (also synthesized in recent studies). Ring-based CNT superstructures exhibited excellent mechanical properties under tensile strain, with superior mechanical resistance compared to conventional materials, but with great elasticity. Tests with rebar graphene demonstrated that the nanotubes act as structural reinforcement for graphene. Finally, the branched superstructures based on diamond nanothreads proposed in this study were not stable, and alternatives should be investigated in the future. These results provide a better understanding of the relationship between structure and properties of the investigated nanomaterials, motivating future theoretical and experimental studies regarding their application in the development of new technologies.
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Caracterização da dinâmica da complexação do receptor tipo Toll 4 humano a MD-2

Aguiar, Carla Carvalho de January 2013 (has links)
Os receptores tipo Toll desempenham um importante papel na resposta imune inata, reconhecendo tanto padrões moleculares associados a patógenos (PAMPs), quanto padrões moleculares associados a danos (DAMPs), liberados sob condições de injúria ou estresse celular. O receptor tipo Toll 4 humano (hTLR4), associado ao seu co-receptor, o fator de diferenciação mielóide 2 (MD-2), forma um heterodímero caracterizado como responsável pelo reconhecimento de lipopolissacarídeos bacterianos (LPS), derivados de bactérias Gram-negativas. Nestes casos, sabe-se que o MD-2 reconhece LPS e promove a dimerização do complexo hTLR4 - MD-2 - LPS, promovendo a sinalização intracelular. Já foi reportada a ausência da associação hTLR4 a MD-2, no reconhecimento de outros ligantes por hTLR4, e, nesses casos, pouco é conhecido a respeito das mudanças estruturais e conformacionais sofridas por este receptor. No presente estudo, empregando a técnica de simulação por dinâmica molecular, foram exploradas as propriedades dinâmicas do complexo de reconhecimento de LPS, hTLR4 - MD-2, bem como investigou-se as implicações da presença do co-receptor para a biologia estrutural do hTLR4. Os resultados mostram que o receptor apresenta um movimento do tipo pinça, o qual leva a um estado final mais aberto da estrutura em forma de ferradura. Ademais, a estabilidade desta estrutura parece ser influenciada pela presença do co-receptor, MD-2. / Toll-like receptors (TLRs) play an important role in innate immunity recognizing pathogen-associated molecular patterns (PAMPs), as also damageassociated molecular patterns (DAMPs), released after cellular injury or stress. Human Toll-Like Receptor 4 (hTLR4) and its co-receptor, myeloid differentiation factor 2 (MD-2), as a heterodimer, is a well-known complex of Gram-negative bacteria lipopolysaccharide (LPS) recognition. In this process, MD-2 recognizes LPS and promotes the dimerization of the complex hTLR4 - MD-2 - LPS, initiating an intracellular immune signaling. Moreover, it has been reported that hTLR4 can also act in the absence of MD-2, in the case of other ligands recognition, and, in these cases, little is known about the structural and conformational changes that hTLR4 structure underwent. In the current study, employing molecular dynamics simulations, we had explored the dynamical properties of the hTLR4 - MD-2 complex and investigated the implications of the co-receptor complexation to the structural biology of hTR4. We observed that the receptor showed a tweezers-like movement, leading to a more oppened final state of its horseshoe-shaped structure. Additionally, the stability of this structure seems to be influenced by the presence of the co-receptor, MD-2.
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Matriz não-modal em integração e inicialização num modelo barotrópico e um estudo numérico da dispersão vertical turbulenta / Integration and initialization by non-modal matrix in a barotropic model and a numerical study of the turbulent vertical dispersion

Campos Velho, Haroldo Fraga de January 1992 (has links)
A técnica da matriz não-moda! é útil num contexto em que não se tem acesso aos modos normais de um sistema, caso freqüente em muitos modelos meteorológicos de área limitada. O método é investigado no contexto de um modelo unidimensional, tanto para integração temporal, como para filtrar componentes de altas freqü ências dos dados iniciais do modelo (procedimento conhecido como inicialização). Determinam-se os campos de velocidade com o uso da inversa generalizada de Moore-Penrose, como solução de uma equação de Poisson associada a cada componente da velocidade horizontal. Mostra-se também um estudo da dispersão vertical de contaminantes em camadas estáveis, cujo coeficiente de difusão turbulenta é obtido ela teoria ele similaridade local , num esquema de fechamento de primeira ordem. / The non-modal matrix technique is valuable if it does not have knowledgc of thc normal medes of the system. It is very usual in many limited area metercological models. The method is investigated in the one-dimensional model context, for temporal integration, anel for filtering high frequcncies in the initial data of the model (this procedure is known as initialization) . The velocity fields are obtained by using thc Moore-Pcnrosc gcncralizcd invcrsc. This inverse is a solution of the Poisson equa.t ions assotiatcd to cach horizontal velocity component. It is also shown a study of the vertical dispersion of containants in stable la.ycrs, whose turbulent coefficient is taken from Lhe local similarity theory (first closc ordcr).
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Efeitos da não-localidade na formação de padrão em dinâmica de populações

Novais, Keila Lopes Viana 31 March 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Física, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2014-10-10T19:12:33Z No. of bitstreams: 1 2014_KeilaLopesVianaNovais.pdf: 2957506 bytes, checksum: 251206ca9cbd8361d5b775693d02c7ba (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2014-11-20T12:36:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_KeilaLopesVianaNovais.pdf: 2957506 bytes, checksum: 251206ca9cbd8361d5b775693d02c7ba (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-20T12:36:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_KeilaLopesVianaNovais.pdf: 2957506 bytes, checksum: 251206ca9cbd8361d5b775693d02c7ba (MD5) / Nesta dissertação vamos investigar a formação de padrão em dinâmica de populações. Partimos de uma equação integro-diferencial não linear para descrevera densidade populacional U(x; t). A não-localidade é introduzida por meio de dois kernels g α (x) e f β (x). Os dois parâmetros α e β são os comprimentos de interação de crescimento e competição, respectivamente. Por meio de um método iterativo obtemos a evolução de U(x; t) que leva a uma solução estacionária U(x). Para uma densidade uniforme, U(x) = U0, dizemos que o sistema não forma padrão. Consequentemente a densidade não é uniforme o sistema forma padrão. Definimos um parâmetro de ordem ? como sendo a integral de ΔU(x)=U(x)–U0, em todoo intervalo do sistema. Assim podemos mostrar que a natureza cria padrão, ?> 0, de modo a permitir mais indivíduos em um dado nicho ecológico. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / In this thesi we investigate the pattern formation in population dynamics.We start from a non-linear integro-differential equation to describe the densityU(x; t). The non-locality is introduced by means of two Kernels g α (x) and f β (x).The two parameters α and β are the lengths of the interaction of growth and competition,respectively. By means of an iterative method we obtain evolution of U(x; t)which leads to a stationary solution U(x). For a uniform density, U(x) = U0, wesay that the system do not make pattern. Consequently, for a not uniform densitythe system makes pattern. We define an order parameter ? as the integral of ΔU(x)=U(x)– U0, over the entire range of the system. Thus we show that nature provides pattern ?> 0, in such way to allow more individuals in a given ecological niche.
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Utilização de picos de reflexão de alta ordem de raios - x de síncrotron para o estudo da intercalação de água em argila sintética no regime de baixa umidade relativa

Fonsêca, Cyntia Larisse Silva da 28 March 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Física, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2014-11-06T16:12:06Z No. of bitstreams: 1 2014_CyntiaLarisseSilvadaFonsêca.pdf: 3170791 bytes, checksum: c6ce548beb25cef90720dc263349348a (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-11-14T10:49:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_CyntiaLarisseSilvadaFonsêca.pdf: 3170791 bytes, checksum: c6ce548beb25cef90720dc263349348a (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-14T10:49:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_CyntiaLarisseSilvadaFonsêca.pdf: 3170791 bytes, checksum: c6ce548beb25cef90720dc263349348a (MD5) / Nesse trabalho sugerimos um modelo de procedimento experimental utilizando a técnica de espalhamento de raios-X para o estudo da dinâmica de intercalação de água na argila sintética Lítio-Fluorohectorita, que é uma argila expansível considerada pura. Sua fórmula química por meia célula unitária é dada por: Li0,6 - (Mg2,4 Li0,6) Si4 O10 F2 . Seus planos cristalinos formam plaquetas, nas quais a água pode intercalar fazendo com que essas se expandam na direção de empilhamento formando 0, 1, 1,5 e 2 camadas de água (WL). Adotando a nossa argila como sendo centrossimétrica estudamos o comportamento do processo de intercalação de água na camada intermediária da Lítio-Fluorohectorita para o regime de uma camada de água. O resultado desse procedimento mostrou um comportamento diferenciado entre as amplitudes dos picos de reflexão de alta ordem, usualmente não estudados para esse tipo de argila devido a sua baixa intensidade. À medida que a água entra na camada intermediária no regime de 1WL, mostramos que há diminuição da intensidade de espalhamento para as reflexões (002 e 006) e aumento para as reflexões (003 e 005) assim como não há mudança significativa na intensidade do pico (004). Utilizamos dados experimentais, cuja análise da intensidade dos picos confirmou qualitativamente o nosso modelo. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / In this work we suggest a model of experimental procedure using the X-ray scattering technique to study the dynamics of water intercalation in the synthetic clay Lithium-Fluorohectorite (Li-Fh), which is a swollen clay, considered pure. It’s chemical formula per half unite cell is: Li0,6 - (Mg2,4 Li0,6) Si4 O10 F2 . Its crystalline planes form platelets, in which the water can intercalate making so these platelets to expand in the stacking direction, forming 0, 1, 1.5 and 2 water layers (WL). Adopting the centrossimetric clay model, we studied the behaviour of the water intercalation in the intermediary layer of Li-Fh for one water layer regime (1WL). The results of this procedure show different behaviour among the peaks of high order reflection, usually not studied for this clay because its low intensity. As the water penetrates the intermediary layer, in the 1WL regime, we show that there is a reduction in the scattering intensity for the reflections (002 and 006) and an increase in the scattering intensity for the reflections (003 and 005). Also we show that there is no significant change in the intensity for the reflection peak (004). We used the experimental data whose intensity analysis confirmed qualitatively our model.
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Estudo numérico-experimental para proposição de modelo biodinâmico do corpo-humano submetido a vibrações verticais / Numerical and experimental study to propose a dynamic model of the human body subjected to vertical vibrations

Bolina, Cecília de Castro 30 November 2013 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Civil e Ambiental, 2013. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-01-15T18:07:37Z No. of bitstreams: 1 2013_CeciliadeCastroBolina.pdf: 6719556 bytes, checksum: d98c67c97aac19a5b7e60f3fbc7513dd (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-02-06T17:28:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_CeciliadeCastroBolina.pdf: 6719556 bytes, checksum: d98c67c97aac19a5b7e60f3fbc7513dd (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-06T17:28:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_CeciliadeCastroBolina.pdf: 6719556 bytes, checksum: d98c67c97aac19a5b7e60f3fbc7513dd (MD5) / As edificações concebidas nos últimos anos são cada vez mais leves e esbeltas, e em geral com baixo fator de amortecimento estrutural, provocando redução nas frequências naturais das estruturas e tornando-as mais suscetíveis a carregamentos dinâmicos, já que suas frequências naturais passam a ficar cada vez mais próximas das frequências de excitação. Assim, ao projetar-se uma edificação é necessário quantificar em que níveis de vibração os ocupantes serão expostos. As estruturas são dimensionadas de modo a atender os requisitos referentes ao estado de ruína, contudo, pode estar suscetível a vibrações que proporcionem desconforto humano. No entanto, não é esperado que ocupantes de edifícios estejam expostos a níveis da vibração que causam danos físicos diretamente ao corpo. Portanto, admite-se que a vibração de um edifício pode afetar a saúde de forma indireta, causando, por exemplo, uma diminuição da concentração nas pessoas ou um estresse ambiental adicional que possa afetar a saúde mental, o estado emocional e etc. Na prática torna-se difícil fornecer um modelo ou método apropriado de verificação e análise que prediga estes efeitos no corpo humano. Este trabalho tem como objetivo realizar um estudo experimental para determinação da transmissibilidade das vibrações na cabeça/assento e cabeça/laje com vistas de verificar se atendem os requisitos de conforto, no tocante a adequabilidade das edificações quanto às vibrações e propor um modelo biodinâmico para o corpo humano. Na primeira etapa, os ensaios são realizados com oito indivíduos sobre a laje, com a sua excitação produzida pela caminhada de dois, quatros e seis pessoas e uma na postura sentada; e, na segunda etapa pelo pulo dos indivíduos sobre a laje mantendo a postura sentada; Posteriormente, o indivíduo monitorado permanece na postura em pé, realizando novamente as excitações de caminhada e pulo. Em todas as etapas, os níveis de vibração são aplicados de forma progressiva, aumentado aos poucos o número de indivíduos que caminham ou pulam sobre a laje para quantificar os efeitos da vibração em seres humanos. As aferições são realizadas ao longo do eixo z, de acordo com as definições das normas ISO 2631 (1997), utilizando-se de acelerômetros triaxiais, com sinais adquiridos por meio do ADS 2000, amplificador de sinais e o equipamento Human Vibration Meter (HVM 100 - medidor de vibração no corpo humano). Um modelo linear de seis graus de liberdade foi desenvolvido para representar o comportamento biodinâmico de indivíduos submetidos à vibração e ajustado com base nos resultados experimentais da transmissibilidade da vibração. Os resultados indicaram que a curva de transmissibilidade numérica e experimental para a população amostrada entre o assento e a cabeça apresentaram ajustes muito próximos. _____________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The design of buildings has become increasingly slim in recent years, with greater flexibility, and generally with low structural smoothing factor, causing the natural frequency of structures to decrease and become more susceptible to dynamic loads as they approach the excitation frequencies associated with human activities. Nonetheless, building occupants are not expected to be exposed to vibration levels that cause direct physical damages to the body. Thus, the project of a building requires the quantification of the vibration levels that the occupants will be exposed to. The structures will be dimensioned in order to meet the requirements referent to the state of ruin; however, they could be susceptible to vibrations that provide human discomfort. Therefore, the vibration of a building is regarded as indirect influence on health, for example when causing a decrease in human concentration or an additional environmental stress that could affect mental health, emotional state, etc. In practice, it is difficult to provide a proper predictive model or method to verify and analyze such effects on the human body. The objectives of this study are to conduct an experimental study to establish the transmissibility of head and seat vibrations, as well as head and slab vibrations, in order to verify whether they meet the requirements of comfort associated with the suitability of buildings regarding vibrations, and finally to propose a biodynamic model of the human body. The first stage involved tests on eight individuals on the slab with excitation provided by two, four and six individuals walking and one subject sitting; at the second stage, the individuals jumped on the slab maintaining sitting posture; posteriorly, the monitored subject remains in standing posture, once more carrying out the excitations when walking and jumping. The vibration levels at all stages are progressively applied gradually increasing the number of individuals walking or jumping on the slab to have the effects of vibration on human beings quantified. The measurements are carried out along the ‘z’ axis according to definitions by ISO 2631 (1997) using triaxial accelerometers with signals acquired through ADS 2000, signal amplifier and the equipment Human Vibration Meter (HVM 100 – human vibration meter). A six-degree of freedom linear model was developed to represent the biodynamic behavior of individuals subjected to vibration and adjusted based on the experimental results from vibration transmissibility. The results indicated that the numerical and experimental transmissibility curve for the population sampled between head and seat presented very similar adjustments.
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Estudo dos efeitos isotópicos no processo colisional reativo H+Li2→LiH+Li

Cunha, Thiago Ferreira da 07 March 2013 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Física, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-06-18T13:13:12Z No. of bitstreams: 1 2013_ThiagoFerreiradaCunha.pdf: 1813617 bytes, checksum: 9f3319bedd61ecfa307b7e60d70cd9d4 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-06-19T12:00:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_ThiagoFerreiradaCunha.pdf: 1813617 bytes, checksum: 9f3319bedd61ecfa307b7e60d70cd9d4 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-19T12:00:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_ThiagoFerreiradaCunha.pdf: 1813617 bytes, checksum: 9f3319bedd61ecfa307b7e60d70cd9d4 (MD5) / Neste trabalho, determinamos as propriedades dinâmicas das reações D+Li2→LiD+Li e T+Li2→LiT+Li com o objetivo de verificar os efeitos isotópicos na promoção da reatividade da reação H+Li2 →LiH+Li. Para tanto, calculamos as seções de choque reativas, distribuições vibracionais, rotacionais, translacionais e angulares do produto. Todo este estudo foi realizado via método quase clássico das trajetórias a partir de uma nova e acurada superfície de energia potencial construída para o sistema H+Li2→LiH+Li. Através deste estudo,verificamos um aumento significativo nos valores das seções de choque reativas da reação H+Li2 quando o núcleo de Hidrogênio é substituído pelos seus isótopos Deutério e Trítio. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / In this work, we determined the dynamical properties of D+Li2 → LiD+Li and T+ Li2→LiT+Li reactions with the objective to verify the isotopic effects in the reactive promotion of the H+ Li2 →LiH+Li reaction. In order to do so, we calculated the reactive cross sections, vibrational, rotational, translational and angular distributions of the product. All this study was performed using the quasi classical trajectory method based on a new accurate potential energy surface built to the H+ Li2 →LiH+Li reaction. From this study, we noted a significant increase of the H+Li2 reactive cross section when the hydrogen nucleus is replaced by its isotopes deuterium and tritium.
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Análise dinâmica de pórticos metálicos contraventados / Dynamic analysis of metal bracing porch

Chaves, José Roberto Ferreira 27 May 2009 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Departamento de Engenharia Civil, 2009. / Submitted by samara castro (sammy_roberta7@hotmail.com) on 2011-01-14T11:49:17Z No. of bitstreams: 1 2009_JoseRobertoFerreiraChaves.pdf: 6676462 bytes, checksum: 4880566d6c6ce3ddcf5c2de37f505666 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2011-01-19T16:01:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_JoseRobertoFerreiraChaves.pdf: 6676462 bytes, checksum: 4880566d6c6ce3ddcf5c2de37f505666 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-01-19T16:01:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_JoseRobertoFerreiraChaves.pdf: 6676462 bytes, checksum: 4880566d6c6ce3ddcf5c2de37f505666 (MD5) Previous issue date: 2007-05 / Este trabalho apresenta um comparativo entre quatro tipologias de contraventamento treliçado, buscando auxiliar na escolha de uma mais adequada para o combate à esforços horizontais em estruturas metálicas. São usados dois modelos estruturais, um com trinta e o outro com cinqüenta pavimentos, pré-dimensionados segundo a NBR-8800. Os modelos dos contraventamentos são discretizados por elementos finitos de barra com dois nós que permitem deslocamentos e deformações finitas, considerando-se apenas rigidez axial. Os elementos são considerados retos entre coordenadas nodais e as forças externas atuam somente nos nós da estruturas. A simulação numérica é realizada utilizando o método dos elementos finitos através do programa computacional SAP. Os modelos analisados são submetidos ao "Vento Sintético" e o sismo de El Centro (Califórnia, 1940). A simulação da parcela flutuante do vento é baseada na formulação de Monte Carlo e para o sismo é utilizada a componente NS. Como resultados, a resposta dinâmica no domínio do tempo apresenta o comportamento dos diferentes tipos de contraventamento analisados quanto ao deslocamento lateral de topo, massa e período fundamental da estrutura. ____________________________________________________________________________ ABSTRACT / This work presents a comparison between four types of trussed bracing, seeking to help in choosing the most appropriate one to combat horizontal tension in steel structures. Two numerical models are used, one with thirty and other with fifty stories presized according to NBR-8300. The models are discretized by bar finite elements with two nodes that allow finite displacements and deformations, considering only axial stiffness. The elements are considered straight between nodal coordmates and the external forces act only in the nodes of the structures. The numerical simulation is performed using the finite element method using the SAP computer program. The models analyzed are subjected to the "Synthetic Wind" and the earthquake of El Centro (California, 1940). The simulation of the floating wind portion is based on the formulation of Monte Carlo and for the earthquake the NS component is used. As a result, the dynamic response in time domain shows the behavior of the different types of bracing analyzed on the top lateral displacement, mass and fundamental period of the structure.

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