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Eficiência ambiental, divergência genética e composição química de grãos de soja no Estado do Tocantins

Daronch, Douglas José 07 April 2015 (has links)
A soja, uma das principais commodities do Brasil, tem o óleo e o farelo como matéria prima para a produção de alimentos e ração animal. Entretanto, são escassas as informações sobre os teores de óleo e proteína de grãos de cultivares nas diferentes épocas de plantio, sob condições de baixa latitude. Assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a eficiência ambiental e a divergência genética de dezessete genótipos de soja, sendo dez cultivares comerciais e sete linhagens oriundas do Programa de Melhoramento Genético da UFT, em ensaios conduzidos no período de safra e entressafra, no ano agrícola 2013/14, em Palmas e Gurupi-TO. O delineamento experimental utilizado em cada ensaio foi de blocos casualizados, com dezessete tratamentos e três repetições. As características estudadas foram: florescimento, maturação, altura de planta, altura da inserção da primeira vagem, número de grãos por vagem, número de vagens por planta, massa de cem sementes, produtividade de grãos, teor de óleo e proteína, eficiência ambiental e divergência genética. A eficiência ambiental foi avaliada através da metodologia adaptada de Fischer (1983) e a divergência genética, por meio de procedimentos multivariados: distância generalizada de Mahalanobis e método de agrupamento e otimização de Tocher. As hibridações 5X6-3 e TMG 1180, 4X5-2 e TMG 1180; 5X6-1 e TMG 1180 são promissoras para obtenção de populações segregantes para produção de grãos. As características número de dias para o florescimento (49,%) e número de vagens por planta (26,6%) foram as que mais contribuíram para a dissimilaridade genética. Para a característica teor de óleo na safra, a maior eficiência foi alcançada pelo genótipo P98Y70, para entressafra o maior valor foi obtido por CD 2737 RR. Para a característica teor de proteína a maior eficiência no período de safra foi obtida pelo genótipo M 9144 RR, para entressafra foi M 8766RR. / Soy, one of the main commodities in Brazil, has oil and bran as raw material for the production of food and animal feed, respectively. However, information on the oil content and protein cultivars grains are scarce, in different planting dates under conditions of low latitude. Thus, this study aimed to evaluate the environmental efficiency and the genetic divergence of seventeen soybean genotypes, ten cultivars and seven lines in trials conducted during the crop season and off season in the agricultural year 2013/14, Palmas and Gurupi -TO. The experimental design used in each trial was a randomized block, with seventeen treatments and three replications. The characteristics studied were flowering, maturity, plant height, pod height, number of seeds per pod, number of pods per plant, weight of hundred seeds, grain yield, oil content, protein, environmental efficiency and the genetic divergence. Environmental efficiency was evaluated using the methodology adapted from Fischer (1983) and the genetic divergence through multivariate procedures: generalized Mahalanobis and grouping method and Tocher. The 5X6-3 hybridizations and TMG 1180, 4X5-2 and TMG 1180; 5X6-1 and TMG 1180 are promising for obtaining segregating populations for grain production. Features number of days to flowering (49%) and number of pods per plant (26.6%) were the ones that contributed most to the genetic dissimilarity. For the characteristic oil content in the harvest, the highest efficiency was achieved by P98Y70 genotype for off season the highest value was obtained by CD 2737 RR. For the characteristic protein content greater efficiency in the harvest period was obtained by the M 9144 RR genotype for off season was M 8766RR.
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Categorização de dados quantitativos para estudos de diversidade genética / Categorization quantitative data for studies of genetic diversity

Barroso, Natália Caixeta 15 December 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2217621 bytes, checksum: 73d2ddc4b72290d7ed609d146e107caf (MD5) Previous issue date: 2010-12-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The genetic diversity study is an important tool in the identification of genetically divergent individuals, wich, can increase the effect of heterosis in the progeny when combinaded. A statistical technique usually applied in this type of study is the cluster analysis. However, before applying this technique, it must be obtained a similarity matrix (or distance) between the genotypes. These distances can be calculated in several ways, which different proposals are found in the literature for quantitative variables, binary and multicategoric. The transformation of quantitative variables in multicategoric can be used to facilitate their characterization with preliminary useful information. There are quite a few methods to make such changes, but they need to be better understood so that the loss of information occurred in such changes does not damage significantly the results of the analysis. Therefore the purposes of this study are: to determine which of these variables categorization methods are efficient; to research the influence of the choice of different coefficients of dissimilarity in cluster analysis, made from simulated data by using quantitative variables and multicategoric; and to investigate whether some hierarchical methods group efficiently the simulated data. For that, there were made 50 simulations of ten quantitative variables to twenty genotypes of a species of reference as corn, each one with four replications. These data were converted in multicategoric using the following methods: equitable division of amplitude, equitable percentage, square rule, Sturges rule and normal distribution. A number of classes had to be established for the first two methods, which were used four and five classes for both. Were used to create distance matrices, in the original data and multicategoric, the dissimilarity measures: Euclidean distance, the average Euclidean, squared Euclidean distance, Mahalanobis distance and weighted distance. Subsequently, the grouping was done by the method of nearest neighbor and the average linkage between groups (UPGMA). The efficiency of these was verified by the statistics of efficiency cophenetic correlation coefficient, stress and distortion degree between the phenetic and cophenetic matrices. The results showed that the cluster method UPGMA was superior to method of nearest neighbor for all distance measures used. Euclidean distances and average Euclidean showed similar performance in all cluster analysis done. Moreover, these two measures got the best performance in all groups performed. All methods of data categorization achieved a satisfactory performance when grouped by UPGMA, except the method of equal percentage with four and five classes. However, the data which have their classes estimated by the square rule had the most similar dendrogram when compared to the obtained using the original data, and therefore, this is the recommended method to perform the categorization of data. / O estudo da divergência genética é uma ferramenta importante na identificação de indivíduos geneticamente divergentes que, ao serem combinados, possam aumentar o efeito heterótico na progênie. Uma técnica estatística muito aplicada nesse tipo de estudo é a análise de agrupamento. Entretanto, antes dessa técnica ser empregada, deve ser obtida uma matriz de similaridade (ou distância) entre os genótipos. Essas distâncias podem ser calculadas de diversas maneiras, sendo que diferentes propostas são encontradas na literatura para as variáveis quantitativas, binárias e multicategóricas. A transformação de variáveis quantitativas em multicategóricas pode ser utilizada para facilitar sua caracterização com informações preliminares de grande utilidade. Existem vários métodos para se fazer essa transformação, porém estes precisam ser melhor entendidos para que a perda de informações ocorrida na transformação não prejudique significativamente os resultados da análise. Portanto, este trabalho teve como objetivos: verificar quais desses métodos de categorização de variáveis são eficientes; pesquisar a influência da escolha de diferentes coeficientes de dissimilaridades na análise de agrupamentos, feita a partir de dados simulados utilizando variáveis quantitativas e multicategóricas; e averiguar se alguns métodos hierárquicos agrupam com eficiência os dados simulados. Para isto, foram feitas 50 simulações de dez variáveis quantitativas para vinte genótipos de uma espécie de referência como o milho, cada um com quatro repetições. Estes dados foram transformados em multicategóricos através dos métodos: divisão equitativa da amplitude, percentual equitativo, regra do Quadrado, regra de Sturges e distribuição normal. O número de classes tinha que ser estabelecido para os dois primeiros, no caso, foi utilizado quatro e cinco classes para ambos. Foram utilizadas para construir as matrizes de distâncias, nos dados originais e multicategóricos, as medidas de dissimilaridade: distância euclidiana, euclidiana média, quadrado da distância euclidiana, distância de Mahalanobis e distância ponderada. Posteriormente, o agrupamento foi feito pelo método do vizinho mais próximo e pela ligação média entre grupos (UPGMA). A eficiência destes foi verificada através das estatísticas de eficiência coeficiente de correlação cofenética, estresse e grau de distorção entre as matrizes fenéticas e cofenéticas. Os resultados mostraram que o método de agrupamento UPGMA foi superior ao método do vizinho mais próximo para todas as medidas de distância utilizadas. As distâncias euclidiana e euclidiana média apresentaram a mesma performance em todas as análises de agrupamento feitas. Além disso, essas duas medidas obtiveram os melhores desempenhos em todos os agrupamentos realizados. Todos os métodos de categorização de dados conseguiram um desempenho satisfatório quando agrupados por UPGMA, exceto o método do percentual equitativo com quatro e cinco classes. Contudo, os dados que possuem suas classes estimadas pela regra do Quadrado apresentaram o dendrograma mais semelhante com o obtido pormeio dos dados originais, sendo este, então, o método mais recomendado para se fazer a categorização de dados.
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Tolerância à salinidade avaliada em genótipos de arroz, cultivados ex vitro e in vitro / Tolerance to salinity available in rice genotypes cultivated in ex vitro and in vitro

Benitez, Letícia Carvalho 17 July 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_leticia_benitez.pdf: 775594 bytes, checksum: 1d79ebc2ce3bb293397c9d3cbc98c0a0 (MD5) Previous issue date: 2008-07-17 / Plants under natural conditions are exposed to several environmental stresses which affect their metabolism. Among them, soil salinity is one of the most serious problems in irrigated agriculture. Trying to identify genetic variability for this character, the main goal of this work was to evaluate the germination and the initial development of plantlets of 10 rice genotypes under salt stress. The plantlets were cultivated ex vitro and in vitro, and many morphological characters were used to phenotype their responses. The investigations were performed ex vitro in the greenhouse and in vitro in culture media with NaCl concentrations of 0, 68, 136 and 204 mM added to a nutrient solution and to culture media, respectively. After 21 days from the beginning of each experiment, plantlet emergence and seed germination in vitro were evaluated. Other characters measured were shoot length, number of leaves, leaf area, root length, number of roots and fresh and dry mass of aerial part and radicular system. Analysis of variance, regression fitting, percentage of reduction and dissimilarity analysis were performed. The salinity damages were seen only at the initial phase of germination and plantlet emergence except on 204 mM concentration which was inhibitory to in vitro seed germination. All measured characters had their development reduced in saline substrate. The characters average shoot area, shoot biomass and root biomass were the most sensitive to NaCl and the characters leaf and root number were the less affected by the salinity excess. The genotypes showed different responses in both experimental conditions. The genotypes formed three groups when an UPGMA hierarchal method was applied to both system of cultivation. Five and two groups were found when Tocher optimization method was applied to in ex vitro and in vitro data, respectively. The variables average shoot area and average root dry mass contributed more to similarity between genotypes ex vitro, while the average shoot and root weight were the most contributing for the in vitro dissimilarity. The variable shoot length was the one that less contributed to genotype discrimination in both cultivation systems. It is concluded that the genotype BRS Bojuru presented the highest tolerance to salinity while BRS Ligeirinho showed the lowest tolerance in both investigations. / As plantas, sob condições naturais, estão expostas a vários estresses ambientais que afetam seu metabolismo. Dentre estes, a salinidade dos solos e da água de irrigação é um dos mais sérios problemas para a agricultura irrigada. Sabendo que o germoplasma do arroz possui uma variabilidade genética para tolerância à salinidade, o objetivo deste trabalho, foi avaliar a germinação e o desenvolvimento inicial de plântulas de 10 genótipos de arroz, cultivados ex vitro e in vitro, por meio de caracteres morfológicos e agrupá-los para o caráter tolerância à salinidade. Foram realizados trabalhos em casa de vegetação e no sistema de cultura in vitro com as concentrações de 0, 68, 136 e 204 mM de NaCl acrescidos à solução nutritiva e ao meio de cultura, respectivamente. Após 21 dias do início de cada experimento, foram avaliadas a emergência de plântulas ex vitro e a germinação de sementes in vitro, além das médias dos caracteres altura da parte aérea, número de folhas, área foliar, comprimento de raiz, número de raiz e massa fresca e seca da parte aérea e do sistema radicular. Foram procedidas análises de variância, ajuste de regressões, cálculos de percentagem de redução e análise de dissimilaridade. A salinidade a atrasou a fase inicial de germinação e emergência de plântulas, exceto na concentração de 204 mM que foi inibitória para germinação das sementes in vitro. Todos os caracteres mensurados tiveram seu desenvolvimento reduzido em substrato salino, sendo os caracteres correspondentes à área foliar média e à fitomassa média da parte aérea e do sistema radicular os mais suscetíveis ao NaCl e número médio de folhas e de raiz os menos afetados pelo excesso de salinidade. Observou-se dissimilaridade entre os genótipos estudados para tolerância à salinidade nas duas condições experimentais, verificada pela formação de três grupos pelo método hierárquico UPGMA, em ambos sistemas de cultivo, e de cinco e dois grupos pelo método de otimização de Tocher no cultivo ex vitro e in vitro, respectivamente. As variáveis, área foliar média e massa seca média de raiz, contribuíram mais para a dissimilaridade entre os genótipos ex vitro, enquanto que massa fresca média da parte aérea e de raiz foram as que mais contribuíram para a dissimilaridade in vitro. A variável altura média da parte aérea foi a que menos contribuiu para a separação dos genótipos nos dois sistemas de cultivo. Pode-se concluir que o genótipo BRS Bojuru apresentou maior tolerância à salinidade, enquanto que BRS Ligeirinho mostrou maior sensibilidade nos dois trabalhos.
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Similaridades e dissimilaridades: a influência da diversidade na qualidade da relação de superiores e subordinados

Silveira, Nereida Salette Paulo da 06 February 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2016-03-15T19:25:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nereida Silveria.pdf: 1043135 bytes, checksum: 77740a92d7c758cec23075ec4c0f5ecb (MD5) Previous issue date: 2007-02-06 / Fundo Mackenzie de Pesquisa / The study investigated the effect of similarity and dissimilarity in characteristics of different depth levels, perceptual or real, over the superiors and subordinate relationship quality through LMX (Leader-Member Exchange) viewpoint. The characteristics investigated were gender and age at the superficial level and work family conflict at deep level. The study counted with the comparative data of 89 dyads. The results indicate the influence of general similarity perception in the quality of superiors and subordinate relationship. The stronger the similarity perceived, better the dyadic relationship. This effect increases when subordinate declares satisfied with the quality and frequency of the contact with his/her superior. Results demonstrate that similarity perception does not correspond to real similarity or dissimilarity, but this correspondence is enhanced when the contact is satisfactory. / O estudo buscou investigar os efeitos da similaridade e dissimilaridade em características de diferentes níveis de profundidade, reais ou percebidas, na qualidade da relação de superiores(as) e subordinados(as) sob a ótica da LMX (Leader-Member Exchange). As características investigadas foram gênero e idade, no nível superficial e conflito família-trabalho no nível profundo. O estudo contou com os dados comparativos de 89 díades. Os dados indicam a influência da percepção de similaridade geral na qualidade da relação de superiores e subordinados. Quanto maior a similaridade percebida, melhor a relação diádica. Este efeito é ampliado quando o(a) subordinado(a) se declara satisfeito(a) com a qualidade e a freqüência do contato com seu/sua superior(a). Resultados demonstram que a percepção de similaridade não corresponde à similaridade ou dissimilaridade real, mas esta correspondência se amplia quando o contato for satisfatório.
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Influência da escala espacial na diversidade beta de anuros considerando diferentes ecoregiões da Mata Atlântica / Influence of spatial scale in the beta diversity of frogs considering different ecoregions of the Atlantic Forest

Melchior, Lara Gomes [UNESP] 23 March 2016 (has links)
Submitted by Lara Gomes Melchior null (lahtuti@hotmail.com) on 2016-04-14T21:11:04Z No. of bitstreams: 1 Mestrado Lara Versão Final.pdf: 949503 bytes, checksum: 2675776db95f4fd4b4d6542497c65b45 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-04-15T13:12:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 melchior_lg_me_sjrp.pdf: 949503 bytes, checksum: 2675776db95f4fd4b4d6542497c65b45 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-15T13:12:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 melchior_lg_me_sjrp.pdf: 949503 bytes, checksum: 2675776db95f4fd4b4d6542497c65b45 (MD5) Previous issue date: 2016-03-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A escolha da unidade amostral e extensão da área de estudo é crucial para a compreensão dos processos e mecanismos influenciando os padrões de distribuição da biodiversidade. Dependendo da escala espacial escolhida, os padrões de distribuição serão influenciados por processos ecológicos e biogeográficos diferentes. Neste trabalho, nós alternamos as unidades amostrais e extensões da área estudada (corpos d’água em um município, corpos d’água em uma ecoregião, municípios em uma ecoregião e municípios na área total de estudo) para avaliar a importância relativa das variáveis ecológicas e biogeográficas na diversidade beta de anuros na Floresta Atlântica Brasileira. Para isso, nós parcionamos a diversidade beta total nos componentes substituição espacial de espécies e aninhamento. Nós observamos que, mantendo a mesma unidade amostral e aumentando a extensão da área de estudo, os valores da substituição espécies aumentam. Por outro lado, mantendo a mesma extensão e aumentando a unidade amostral, os valores da substituição de espécies diminuem. Além disso, nossos resultados concordam que a importância relativa dos fatores ecológicos e biogeográficos na diversidade beta de anuros é dependente da escala espacial. Considerando as menores unidade amostral e extensão, as variáveis ambientais e distância geográfica se alternam na importância relativa associada aos valores de diversidade beta, enquanto que, em escalas espaciais maiores, as ecoregiões passam a ter uma importância relativa maior. / The selection of the sampling unit and extension of the study area is crucial for understanding the processes and mechanisms influencing biodiversity distribution patterns. Depending on the chosen scale, patterns of distribution will be influenced by different ecological and biogegraphical processes. Here, we alternate the sample units and extensions of the study area (water bodies in a municipality, water bodies in an ecoregion, municipalities in an ecoregion, and municipalities in total area of study) to assess the relative importance of ecological and biogeographical factors in the beta diversity of frogs in the Brazilian Atlantic Forest. We partitioned total beta diversity into two additive components, spatial species turnover and nestedness. We found that considering the same sample unit and increasing the extent of the study area the turnover values increased. On the other hand, considering the same extension and increasing the sampling unit, the turnover values decreased. Furthermore, our results agree that relative importance of the ecological and biogeographical processes in frog beta diversity is dependent on spatial scales. Considering the smallest sampling unit and extension, environmental variables and geographic distance alternated in their relative importance associated with beta diversity, while at largest spatial scales, ecoregions showed higher values of relative importance.
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Caracterização e predição de genitores visando à tolerância a germinação na pré-colheita em trigo (Triticum aestivum L.) / Characterization and prediction of parents seeking tolerance to pre-harvest sprouting in wheat (Triticum aestivum L.)

Nörnberg, Rafael 13 March 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_rafael_nornberg.pdf: 1775290 bytes, checksum: 1aed782bae5be322b9bc4cec8e20ade0 (MD5) Previous issue date: 2012-03-13 / The climate adversities, such as high temperatures and rain before and during the harvesting period lead to a phenomenon called Pre-harvest sprouting (PHS) of wheat grain. This germination decreases the wheat flour quality through the activation of enzymes responsible for germination which degrade starch. Therefore, this study had as objective to analyse the character pre-harvest sprouting in hexaploid wheat genotypes (Triticum aestivum L.), in the Southern region of Brazil, based on distinct evaluation years. Also, the evaluations aim to indicate the most adapted cultivars for Southern Brazil and to select parental genotypes for breeding programs of wheat. The experiment was conducted in the years 2010 and 2011, in the Centro de Genômica e Fitomelhoramento, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas (CGF/FAEM/UFPel), located at Capão do Leão County/RS, Brazil. The design used was random blocks with three replications. A total of 33 genotypes were phenotyped regarding agronomic and pre-harvest sprouting characters in wheat. Simultaneously, in 2010, 56 F1 and F2 hybrid populations obtained from artificial hybridizations between eight wheat cultivars, with different tolerance to sprouting according to a complete diallel design, with reciprocals. The populations and their parental genotypes were evaluated in the agricultural season of 2011. In this experiment, the following characters were evaluated: percentage of germinated grains (GG) in the fixed generations F1 and parents, falling number index (FNI) in the fixed generations F1 and parents, and segregant populations (F2). In the analysis of genotype x year, it was detected an interference of the environment on the results of some genotypes. The genotypes: BIO 08228, RAÍZES, HORIZONTE and BRS 194 with the lowest GG values, and the cultivar GUAMIRIM with high FNI, for both evaluation years, showing the presence of PHS tolerance alleles. Based on the genetic dissimilarity, was obtained from the prediction of important parents. Thus elite genotypes such as TBIO ITAIPÚ, BIO 08228, RAÍZES, HORIZONTE, BRS 194, TBIO PIONEIRO, BIO 07367, RAÍZES, GUAMIRIM and FRONTANA were obtained to form the crossing blocks, aiming to complement the distinct alleles for PHS. The majority of genotypes presented reduced alpha-amylase activity, which causes starch degradation. The genotypes TBIO PIONEIRO, MARFIM and TBIO TIBAGI, on the other hand, presented the lowest alpha-amylase activity. There was a high heritability for both characters in both years except for GG of susceptible genotypes in 2011. The PHS tolerance is controlled by additive effects of genes evidenced by high general combining ability and by non-additive effects of genes evidenced by the specific combining ability, but it was evident that the additive effects were more important. The cultivars QUARTZO and FRONTANA presented the best potential for the use in crossing blocks aiming to increase PHS tolerance and to reduce alpha-amylase activity. Transgressive segregation was observed with high heterosis estimates for both traits FNI and GG. This, added to the loss of vigor by inbreeding for FNI, this indicates that these combinations are potential sources of tolerance to PHS. There was a high reciprocal effect that should be taken into account when producing hybrid cultivars with tolerance to pre-harvest germination and high FNI. / As adversidades climáticas como temperaturas elevadas e precipitação antes e durante o período de colheita ocasionam o fenômeno da germinação na pré-colheita (Pre-harvest sprouting PHS) dos grãos de trigo. Tal condução deprecia a qualidade da farinha por meio da atividade de enzimas responsáveis pela germinação, que degradam o amido. Desta forma, o estudo teve o objetivo de analisar o comportamento do caráter germinação na pré-colheita em genótipos de trigo hexaplóide (Triticum aestivum L.), com base em distintos anos de avaliação, gerando informação para a melhor indicação de cultivares a região sul do Brasil e na reposição de combinações promissoras em blocos de cruzamentos em programas de melhoramento genético do trigo. O experimento foi conduzido nos anos de 2010 e 2011, no Centro de Genômica e Fitomelhoramento, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas (CGF/FAEM/UFPel), situado no município do Capão do Leão/RS, Brasil. O delineamento empregado foi de blocos ao acaso com três repetições, foram analisados 33 genótipos de trigo a partir de caracteres agronômicos e relacionados a germinação na pré-colheita do trigo. Simultaneamente, no ano de 2010 foram obtidas 56 populações híbridas F1 e F2 a partir de hibridações artificiais entre oito cultivares de trigo, com distinta tolerância a germinação na espiga, seguindo o delineamento dialélico completo, com os recíprocos. As populações e os respectivos genitores foram avaliados na safra agrícola de 2011 em campo experimental, no município de Capão do Leão, adotando o delineamento em blocos ao acaso, com três repetições. Neste experimento foram avaliados os caracteres: percentual de grãos germinados (GG) nas gerações fixas F1 e genitores, e índice de queda úmido (IQU), nas gerações fixas (F1 e genitores) e populações segregantes (F2). Na análise de interação genótipo x ano foi detectada interferência do ambiente sobre alguns genótipos. Os genótipos BIO 08228, RAÍZES, HORIZONTE e BRS 194 foram aqueles de menores valores de GG, e a cultivar GUAMIRIM com elevado IQ, para os dois anos de avaliação, demonstrando a presença de genes de tolerância a PHS. Com base nos resultados da dissimilaridade genética, foi obtida a predição de importantes genitores. Assim destacam-se TBIO ITAIPÚ, BIO 08228, RAÍZES, HORIZONTE, BRS 194, TBIO PIONEIRO, BIO 07367, RAÍZES, GUAMIRIM e FRONTANA para compor os blocos de cruzamento, visando à melhor complementaridade de alelos distintos de tolerância a PHS em trigo. No desempenho per se, a maioria dos genótipos apresentaram reduzida atividade de alfa-amilase que degradam o amido. Os genótipos TBIO PIONEIRO, MARFIM e TBIO TIBAGI, expressaram reduzida atividade da enzima alfa-amilase. Houve pronunciada herdabilidades para os caracteres em ambos os anos exceto para GG nos genótipos sensíveis em 2011. A tolerância a PHS é controlada por genes de efeitos aditivos evidenciados por elevadas capacidade geral de combinação (CGC) e por genes de efeitos não aditivos evidenciado pela capacidade especifica de combinação (CEC).Se destaca que os efeitos aditivos foram mais importantes sobre a variância genética total. Neste experimento, as cultivares QUARTZO e FRONTANA apresentam o melhor potencial para o uso em blocos de cruzamentos para incremento da tolerância a PHS e redução da atividade da enzima alfa-amilase. Foram evidenciadas constituições genéticas transgressivas em F2 associadas com elevadas estimativas de heterose em F1 para ambas as características avaliadas no IQU e GG. Isto, conciliado a baixa perda de vigor por endogamia para IQU, evidenciando que as populações destas combinações são potenciais fontes de recuperação de indivíduos superiores. Existe pronunciado efeito recíproco para o caráter tolerância a germinação na pré-colheita e aumento do índice de queda.
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Rigid registration based on local geometric dissimilarity

Cejnog, Luciano Walenty Xavier 21 September 2015 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-06-07T15:41:47Z No. of bitstreams: 1 lucianowalentyxaviercejnog.pdf: 14234810 bytes, checksum: 492ebb7393b5f0e7cfc6e822067fe492 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-06-24T13:12:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 lucianowalentyxaviercejnog.pdf: 14234810 bytes, checksum: 492ebb7393b5f0e7cfc6e822067fe492 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-24T13:12:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 lucianowalentyxaviercejnog.pdf: 14234810 bytes, checksum: 492ebb7393b5f0e7cfc6e822067fe492 (MD5) Previous issue date: 2015-09-21 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho visa melhorar um método clássico para o problema de registro rígido, o ICP (iterative Closest Point), fazendo com que a busca dos pontos mais próximos, uma de suas fases principais, considere informações aproximadas da geometria local de cada ponto combinadas à distância Euclidiana originalmente usada. Para isso é necessária uma etapa de pré-processamento, na qual a geometria local é estimada em tensores de orientação de segunda ordem. É definido o CTSF, um fator de similaridade entre tensores. O ICP é alterado de modo a considerar uma combinação linear do CTSF com a distância Euclidiana para estabelecer correspondências entre duas nuvens de pontos, variando os pesos relativos entre os dois fatores. Isso proporciona uma capacidade maior de convergência para ângulos maiores em relação ao ICP original, tornando o método comparável aos que constituem o estado da arte da área. Para comprovar o ganho obtido, foram realizados testes exaustivos em malhas com características geométricas variadas, para diferentes níveis de ruído aditivo, outliers e em casos de sobreposição parcial, variando os parâmetros do método de estimativa dos tensores. Foi definida uma nova base com malhas sintéticas para os experimentos, bem como um protocolo estatístico de avaliação quantitativa. Nos resultados, a avaliação foi feita de modo a determinar bons valores de parâmetros para malhas com diferentes características, e de que modo os parâmetros afetam a qualidade do método em situações com ruído aditivo, outliers, e sobreposição parcial. / This work aims to enhance a classic method for the rigid registration problem, the ICP (Iterative Closest Point), modifying one of its main steps, the closest point search, in order to consider approximated information of local geometry combined to the Euclidean distance, originally used. For this, a preprocessing stage is applied, in which the local geometry is estimated in second-order orientation tensors. We define the CTSF, a similarity factor between tensors. Our method uses a linear combination between this factor and the Euclidean distance, in order to establish correspondences, and a strategy of weight variation between both factors. This increases the convergence probability for higher angles with respect to the original ICP, making our method comparable to some of the state-of-art techniques. In order to comprove the enhancement, exhaustive tests were made in point clouds with different geometric features, with variable levels of additive noise and outliers and in partial overlapping situations, varying also the parameters of the tensor estimative method. A dataset of synthetic point clouds was defined for the experiments, as well as a statistic protocol for quantitative evaluation. The results were analyzed in order to highlight good parameter ranges for different point clouds, and how these parameters affect the behavior of the method in situations of additive noise, outliers and partial overlapping.
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A Shape-based weighting strategy applied to the covariance estimation on the ICP

Yamada, Fernando Akio de Araujo 15 March 2016 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-06-07T17:49:03Z No. of bitstreams: 1 fernandoakiodearaujoyamada.pdf: 21095203 bytes, checksum: 1842e801a538bdeef0368c963b9d98b7 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-06-24T13:47:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 fernandoakiodearaujoyamada.pdf: 21095203 bytes, checksum: 1842e801a538bdeef0368c963b9d98b7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-24T13:47:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 fernandoakiodearaujoyamada.pdf: 21095203 bytes, checksum: 1842e801a538bdeef0368c963b9d98b7 (MD5) Previous issue date: 2016-03-15 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / No problema de registro rígido por pares é preciso encontrar uma transformação rígida que alinha duas nuvens de pontos. A sulução clássica e mais comum é o algoritmo Iterative Closest Point (ICP). No entanto, o ICP e muitas de suas variantes requerem que as nuvens de pontos já estejam grosseiramente alinhadas. Este trabalho apresenta um método denominado Shape-based Weighting Covariance Iterative Closest Point (SWC-ICP), uma melhoria do ICP clássico. A abordagem proposta aumenta a possibilidade de alinhar corretamente duas nuvens de pontos, independente da pose inicial, mesmo quando existe apenas sobreposição parcial entre elas, ou na presença de ruído e outliers. Ela se beneficia da geometria local dos pontos, codificada em tensores de orientação de segunda ordem, para prover um segundo conjunto de correspondências para o ICP. A matriz de covariância cruzada computada a partir deste conjunto é combinada com a matriz de covariância cruzada usual, seguindo uma estratégia heurística. Para comparar o método proposto com algumas abordagens recentes, um protocolo de avaliação detalhado para registro rígido é apresentado. Os resultados mostram que o SWC-ICP está entre os melhores métodos comparados, com performance superior em situações de grande deslocamento angular, mesmo na presença de ruído e outliers. / In the pairwise rigid registration problem we need to find a rigid transformation that aligns two point clouds. The classical and most common solution is the Iterative Closest Point (ICP) algorithm. However, the ICP and many of its variants require that the point clouds are already coarsely aligned. We present in this work a method named Shape-based Weighting Covariance Iterative Closest Point (SWC-ICP), an improvement over the classical ICP. Our approach improves the possibility to correctly align two point clouds, regardless of the initial pose, even when there is only a partial overlapping between them, or in the presence of noise and outliers. It benefits from the local geometry of the points, encoded in second-order orientation tensors, to provide a second correspondences set to the ICP. The cross-covariance matrix computed from this set is combined with the usual cross-covariance matrix following a heuristic strategy. In order to compare our method with some recent approaches, we present a detailed evaluation protocol to rigid registration. Results show that the SWC-ICP is among the best methods compared, with superior performance in situations of wide angular displacement, even in situations of noise and outliers.
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Análise fisiológica, nutricional e de expressão gênica em cultivares de aveia-branca submetidas ao excesso de ferro / Physiological, nutritional and gene expression analysis of oat cultivars submitted to iron excess

Silva, Natália Dias Gomes da, Silva, Natália Dias Gomes da 23 June 2017 (has links)
Submitted by Maria Beatriz Vieira (mbeatriz.vieira@gmail.com) on 2018-06-14T12:18:01Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) resumo_tese_natalia_dias_gomes_da_silva.pdf: 16351 bytes, checksum: 4d5433db73902cfdaaf0790d25a1cf28 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-06-14T20:52:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) resumo_tese_natalia_dias_gomes_da_silva.pdf: 16351 bytes, checksum: 4d5433db73902cfdaaf0790d25a1cf28 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-14T20:52:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) resumo_tese_natalia_dias_gomes_da_silva.pdf: 16351 bytes, checksum: 4d5433db73902cfdaaf0790d25a1cf28 (MD5) Previous issue date: 2017-06-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / A aveia-branca (Avena sativa L.) é alternativa para sucessão de culturas, com potencial de uso nas áreas de produção de arroz irrigado (Oryza sativa L.) no Sul do Brasil. As características dos solos desta região podem limitar o crescimento e desenvolvimento da aveia-branca. Assim, os objetivos desse estudo foram identificar uma concentração de ferro capaz de causar toxicidade em plantas de aveia, diferenciar genótipos sensíveis e tolerantes ao excesso de ferro, quantificar teores nutricionais e verificar possíveis genes envolvidos nestes processos, a fim de auxiliar em trabalhos de melhoramento de cultivares mais adaptadas ao cultivo no Sul do Brasil. Os estudos foram realizados entre os anos 2014 e 2016, no Departamento de Botânica da Universidade Federal de Pelotas e Crop Soil and Environmental Sciences Departament da University of Arkansas. Os resultados evidenciaram que a concentração de 13,5 mmol L-1 de EDTA ferroso em solução nutritiva é eficiente para a distinção de genótipos de aveia tolerantes ou sensíveis ao excesso de Fe. O genótipo URS Taura é tolerante ao excesso de ferro, enquanto os genótipos UPFPS Farroupilha e URS Corona são sensíveis, em condições controladas, através do sistema hidropônico, devendo ser evitadas em áreas suscetíveis à toxidez do nutriente. O excesso de ferro altera a concentração nutricional dos demais elementos nas plantas de aveia. O excesso de ferro na solução nutritiva proporciona alteração significativa na expressão relativa de alguns genes relacionados a absorção, translocação e armazenamento de ferro em plantas de aveia, sendo que os genes OsGS1, OsFER1 e OsPSBA, parecem estar relacionadaos aos processos de tolerância da cultivar URS Taura ao excesso de Fe. O sistema hidropônico é eficiente para a diferenciação de cultivares sensíveis ou tolerantes ao excesso de ferro, possibilitando escolhas mais eficientes para novos trabalhos e indicação de cultivares tolerantes ao excesso do nutriente. / White oat (Avena sativa L.) is an alternative for succession of crops with potential for use in irrigated rice (Oryza sativa L.) production areas, in southern Brazil. The characteristics of these soils may limit the growth and development of white oats. Thus, the objectives of this study were to identify an iron concentration capable of causing toxicity in oat plants, besides differentiating sensitive and tolerant genotypes to iron excess, to quantify nutritional contents and to verify possible genes involved in these processes, in order to assist in futures work in the area, as well as indicate cultivars adapted to the growing conditions of southern Brazil. For that, studies were carried out between 2014 and 2016, in a greenhouse and laboratories of the Department of Botany of the Federal University of Pelotas and Crop Soil and Environmental Sciences Departament of the University of Arkansas. The results showed that the concentration of 13.5 mmol L-1 of ferrous EDTA in nutrient solution is efficient for the distinction of oat genotypes submitted to iron excess. The URS Taura genotype is tolerant to iron excess, while the UPFPS Farroupilha and URS Corona are sensitive under controlled conditions through the hydroponic system and should be avoided in areas susceptible to nutrient toxicity. Iron excess alters the nutritional concentration of the other elements in oat plants. Iron excess in the nutrient solution provides significant alteration in the relative expression of some genes related to iron uptake, translocation and storage in oat plants, being that the genes OsGS1, OsFER1 and OsPSBA, seem to be related to the tolerance processes of the cultivar URS Taura to the excess of Fe. The hydroponic system is efficient for the differentiation of sensitive or tolerant cultivars of iron excess, thus making possible more efficient choices for new work and indication of tolerant cultivars to nutrient excess.
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Heterose e herdabilidade de caracteres relacionados ao rendimento de grãos em trigo (Triticum aestivum L.) / Heterosis and heritability of traits related to grain yield in wheat (Triticum aestivum L.).

Tessmann, Elisane Weber 24 May 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_elisane_weber_tessmann.pdf: 1299023 bytes, checksum: c5038dbcab7cd7e9fc469361c851041e (MD5) Previous issue date: 2013-05-24 / Wheat is among the most important cereal crops in the world, being significant in the daily diet of large parts of Europe, Americas and Oceania. Brazil is not self-sufficient in this crop, producing less than half of the national demand. Several genetic and environmental factors affect wheat yield. The interaction among genotype and environment results in differential yield response depending of environmental conditions. Thus, the assessment of recommended cultivars and populations formed by the crosses between them, become important tools in helping selection of superior populations. The aim of this study was to evaluate elite cultivars and segregating populations. The assessment was focused on traits influencing yield in order to indicate promising combinations to wheat breeding programs. The experiment was conducted in the winter of 2012, in the Palma experimental farm (CGF/FAEM/UFPel), located in Capão do Leão RS/ Brazil. Parental lines, hybrids (F1) and segregating populations (F2) were sown in a randomized block design with three replications. The experimental units consisted of two 3 meters long lines with 0.3 meters spacing between plants and between lines, with 15 plants per line. The population F1 was obtained in the winter of 2011 and one generation was advanced in greenhouse in 2011/2012 warm season. The following traits were evaluated: plant height (PH); leaf spot (LS); number of spikes per plant (NSP); spike length (SL); spike weight (SW); kernels per spike (KPS); kernels weight per spike (KWPS); spike harvest index (SHI) and plant yield (PY). The analysis of variance showed significant differences for all traits studied. The multiple comparisons of means showed similar behavior for the characters PH, NSP, KPS, SHI and PY. The SL formed two groups where the best group was formed by cultivars: CD 104, Marfim, Nova Era, Ônix, Safira and Tibagi. The cultivars CD 104, Cristalino, Marfim, Nova Era and Raízes were superior regard to SW. The dendrogram formed divided the cultivars into seven groups: group I formed by Abalone; group II by Tibagi; group III by Ônix and Safira; group IV by CD 120; group V by cultivars CD 104 and Nova Era; group VI by Cristalino and Raízes, and group VII formed by Marfim. All populations tested (parents, hybrids and F2) showed differential performance in the assessed traits. Some populations were superior just in F1 (CD 104 x Raízes), others superiors just in F2 (Cristalino x Safira, Nova Era x Raízes), others superiors in F1 and F2 (CD 104 x Nova Era, Abalone x Nova Era), and others inferiors in F1 and F2 (Abalone x Tibagi). Just three combinations showed some characters with significant heterosis, where the combination between Abalone and Nova Era showed high values to NSP (108%), SW (40.62%), KWPS (47.55%) and PY (207.37%). Heritability was higher among families than within families, within blocks or individual based. The higher heritability was 70% for PH. Heritability for the traits studied suggests that the selection must be made in advanced generations; moreover, the selection will be more efficient if performed among families. / O trigo atualmente se encontra entre os cereais mais produzidos no mundo, fazendo parte da alimentação diária de grande parte da população da Europa, Américas e Oceania. O Brasil não é autosuficiente nessa cultura, produzindo menos da metade da demanda nacional. Diversos fatores influenciam na produtividade, sendo eles tanto de ordem genética quanto ambiental. A interação entre genótipo e ambiente, faz com que o rendimento responda de forma diferencial dependendo assim das condições ambientais de cultivo. Desta forma, a avaliação do comportamento de cultivares recomendadas para cultivo, bem como da população formada pelos cruzamentos entre elas, se faz importante a fim de contribuir na seleção de populações superiores, que apresentem adaptação à região associado à elevada produtividade. Frente ao exposto, o objetivo deste trabalho foi avaliar o comportamento de cultivares elite, bem como o comportamento das populações segregantes formadas a partir dessas cultivares para caracteres importantes para o rendimento de grãos, visando indicar combinações promissoras para o Programa de Melhoramento de Trigo. O experimento foi conduzido na safra agrícola de 2012, no campo experimental da Palma, pertencente ao Centro de Genômica e Fitomelhoramento (CGF/FAEM/UFPel), localizado na Capão do Leão RS, onde foram semeados os hibridos (F1), população segregante (F2) e os pais. O delineamento experimental foi de blocos casualizados com três repetições, sendo a unidade experimental composta por duas linhas de três metros, espaçadas 0,3 m entre plantas e entre linhas, com um total de 15 plantas por linha. A população F1 foi obtida na estação fria do ano de 2011, e o avanço de geração foi realizado em casa de vegetação na estação quente de 2011/2012. No experimento foi avaliado os seguintes caracteres: estatura de planta (EST), mancha da folha (MF), número de espigas por planta (NEP), comprimento de espiga (CE), massa de espiga (ME), número de grãos por espiga (NGE), massa de grãos por espiga (MGE), índice de colheita por espiga (ICE) e rendimento de grãos por planta (RGP); totalizando 4500 plantas avaliadas. A análise de variância evidenciou diferença significativa para todos os caracteres estudados. Na análise de médias as cultivares apresentaram comportamento similar para os caracteres EST, NEP, NGE, ICE e RGP. Para CE foram formados dois grupos, sendo o melhor grupo formado por CD 104, Marfim, Nova Era, Ônix, Safira e Tibagi. As cultivares CD 104, Cristalino, Marfim, Nova Era e Raízes apresentaram comportamento superior para ME. O dendrograma formado dividiu as cultivares em sete grupos: grupo I formado por Abalone; grupo II por Tibagi; grupo III por Ônix e Safira; grupo IV por CD 120; grupo V com as cultivares CD 104 e Nova Era, grupo VI por Cristalino e Raízes; e grupo VII formado por Marfim. Todas as populações testadas (pais, híbridos e F2) apresentaram comportamento diferencial perantes os caracteres avaliados. Algumas populações foram superiores apenas na F1 (CD 104 x Raízes), superiores apenas em F2 (Cristalino x Safira, Nova Era x Raízes), superiores em F1 e F2 (CD 104 x Nova Era, Abalone x Nova Era), e inferiores em F1 e F2 (Abalone x Tibagi). Apenas três combinações apresentaram alguns caracteres em heterose, sendo a combinação entre Abalone e Nova Era a que apresentou valores elevados para NEP (108%), ME (40,62%), MGE (47,55%) e RGP (207,37%). A herdabilidade mostrou-se maior entre progênies do que dentro da progênie, dentro do bloco ou no indivíduo. A maior herdabilidade foi de 70% para estatura de planta. A herdabilidade dos caracteres estudados sugere que a seleção deve ser realizada em gerações mais avançadas, além disso, a seleção será mais eficiente se realizada entre progênies.

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