Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-23Bitstream added on 2015-03-03T12:07:25Z : No. of bitstreams: 1 000813686.pdf: 326575 bytes, checksum: 07c43c03f8e32860c7bc5d7ff45a606d (MD5) / A mancha de ramularia, causada pelo fungo Ramularia areola, é responsável pela desfolha prematura da planta de algodoeiro, resultando na redução do potencial produtivo. Dessa forma, o presente trabalho teve o objetivo avaliar o agente etiológico, a produção de inóculo de R. areola, a resistência genética de genótipos e o controle integrado da mancha de ramularia. Os ensaios foram conduzidos nos Laboratório e em telado da Embrapa Meio Ambiente, Jaguariúna, SP; e em condições de campo nas safras 2011/2012 em Primavera do Leste, MT, Correntina, BA e Santa Helena de Goiás, MT, e na safra 2012/2013 em Sapezal, MT. Nos ensaios conduzidos em laboratório, foram avaliados o crescimento micelial em diferentes meios de cultura, a germinação de conídios e a identificação molecular do isolado IMA244. No ensaio conduzido em telado foi avaliada a severidade da doença por meio de uma escala diagramática. Neste ensaio foi realizada a inoculação artificial de diversos genótipos de algodoeiro utilizando o isolado IMA244. Nos ensaios a campo foram estudados os comportamentos de cultivares suscetíveis e resistentes a mancha de ramularia tratadas com e sem a aplicação de fungicidas; plantas de algodoeiro da cultivar FM 951LL suscetível a doença tratadas com e sem a aplicação foliar de agentes de biocontroles; e plantas de algodoeiro das cultivares BRS 293 e BRS 423 tratadas com e sem fungicida e agente de biocontrole (Trichoderma asperelum). Os parâmetros avaliados nos estudos em campo foram: severidade, produtividade e qualidade de fibra. Os meios de cultura extrato de Malte, V8 e BDA apresentaram os melhores resultados, quando analisado o crescimento micelial do isolado IMA244. .. / Ramularia leaf Spot, caused by Ramularia areola, is responsible for premature defoliation of the cotton plant, thus resulting in yield potential reduction. The present study aimed to evaluate the control of Ramularia leaf spot through the use of cotton genotypes and biocontrol agents. The tests were conducted in laboratory and screen house at Embrapa Environment, Jaguariuna, SP; field trials were performed in 2011/2012 in Primavera do Leste, MT, Correntina, BA and Santa Helena de Goiás, MT, and at the season 2012/2013 in Sapezal, MT. In tests conducted in laboratory evaluations of mycelia growth in different culture media, conidial germination and molecular identification of isolated IMA244 were performed. The trial in screen house the disease severity using a diagrammatic scale was evaluated. In this test the artificial inoculation of various cotton genotypes using isolated IMA244 and IMA 237 was performed. In field trials we study the susceptible and resistant genotypes to R. areola treated with and without application of fungicides; cotton plants of cultivar FM 951LL treated with and without foliar sprays of biocontrols agents; and cultivars BRS 293 and BRS 423 treated with and without fungicide and biocontrol agent (Trichoderma asperelum). It was evaluated severity, yield and fiber quality. The culture media malt extract, V8 and PDA showed the best results when analyzing the mycelia growth of isolate IMA244. The isolated IMA244 showed 99% similarity when compared with ITS 1 region of isolates of Mycosphaerella areolla deposited in NCBI. The CNPA 2007-419 grown in greenhouse and artificially inoculated with isolate IMA244 had the lowest ratio of area under the progress of the severity, when compared with the other treatments. In field trials BRS 272 and lineage CNPA GO 1265 ...

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2013. / Submitted by Luiza Silva Almeida (luizaalmeida@bce.unb.br) on 2013-07-31T14:55:58Z No. of bitstreams: 1 2013_LíviaPereiraJunqueira.pdf: 4592146 bytes, checksum: 25daaa73f912f4b0a533171978376623 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-08-05T15:23:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_LíviaPereiraJunqueira.pdf: 4592146 bytes, checksum: 25daaa73f912f4b0a533171978376623 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-05T15:23:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_LíviaPereiraJunqueira.pdf: 4592146 bytes, checksum: 25daaa73f912f4b0a533171978376623 (MD5) / O cultivo da lima ácida ‘Tahiti’ (Citrus latifolia Tanaka) tem grande importância no Distrito Federal e é uma atividade rentável, podendo ser indicada para pequenos produtores. A podridão floral dos citros (Colletotrichum acutatum) e a gomose (Phytophthora spp.) são doenças de grande importância econômica para a citricultura, podendo causar perdas de até 100% da produção No entanto, os fungicidas recomendados e registrados para o controle dessas doenças não têm oferecido resultados satisfatórios e ainda oferecem riscos de contaminação do meio ambiente e do aplicador. Indutores abióticos de resistência, fertilizantes foliares e fungicidas de baixo impacto têm sido utilizados em várias espécies de frutíferas, muitas vezes com resultados satisfatórios, porém há carência de estudos científicos quanto à eficiência destes produtos no controle de doenças de citros. Neste sentido, o objetivo deste trabalho foi avaliar a produtividade, taxa de vingamento de flores, incidência e severidade de gomose (Phytophthora spp.) e características físicas dos frutos nas plantas de limeira ácida ‘Tahiti’ tratadas com fertilizantes aplicados via foliar, indutor de resistência abiótico e fungicida. O experimento foi conduzido em um pomar de lima ácida ‘Tahiti’ com nove anos de idade, localizado no Distrito Federal. O delineamento experimental foi em blocos casualizados com três repetições intercaladas por fileiras de bordadura. Os tratamentos utilizados foram: calda de sulfato de cálcio acrescida de fertilizante solúvel acidificada a pH= 4, calda de sulfato de cálcio sem fertilizante solúvel, acidificada a pH= 4, Acibenzolar-S-Methyl, fosfito de potássio + oxicloreto de cobre, fungicida (Tebuconazole 200 g/l + Trifloxystrobin 100 g/l) e testemunha. Os produtos foram aplicados por um pulverizador tracionado por trator, na vazão de 0,41 litros/segundo a intervalos de 10 dias durante a estação das chuvas (dezembro a abril), de 15 dias entre as estações da seca e das chuvas (outubro e novembro) e 30 dias durante a estação da seca (maio a setembro). As aplicações foram feitas durante o período de abril de 2010 a julho de 2011. Para a avaliação da produtividade e vingamento de flores, marcaram-se as flores durante o período de um ano (maio de 2010 a abril de 2011) e as colheitas foram iniciadas em setembro de 2010 e se estenderam até dezembro de 2011, levando em consideração o período de carpogênese (período da floração a colheita) dos frutos. As características físicas comprimentos longitudinal e transversal, massa fresca de frutos, quantidade de suco, espessura de casca e massa de casca após a extração do suco foram avaliadas a partir de frutos coletados durante o período de colheita, em dois momentos, quais sejam safra (março de 2011) e entressafra (outubro de 2011). As avaliações para a análise da gomose de Phytophthora (Phytophthora sp.) foram efetuadas aos 21 meses após a primeira pulverização, determinando-se a incidência (porcentagem de plantas com sintomas de gomose na região do coleto) e a severidade (porcentagem do perímetro do coleto com lesões contínuas) da gomose. . Em relação ao vingamento de flores, durante os meses cujas flores originaram frutos no período da safra, os tratamentos com fungicida, fosfito de potássio + cobre e calda de sulfato de cálcio acrescida de fertilizante solúvel apresentaram os melhores resultados. Durante a floração que produziu frutos na entressafra, o fungicida manteve um bom resultado, assim como a calda de sulfato de cálcio sem fertilizante. Apesar das médias de produtividade durante a entressafra não serem significativas estatisticamente, os produtos apresentaram diferenças consideráveis, sendo que a calda de sulfato de cálcio acrescida de fertilizante solúvel apresentou o melhor resultado, seguida do fungicida. Durante o período da safra houve diferença significativa entre os tratamentos. Os produtos à base de calda de sulfato de cálcio acrescido fertilizantes, calda de sulfato de sulfato de cálcio, o fungicida e o Acibenzolar-S-Methyl proporcionaram os melhores resultados. A testemunha e o fosfito de potássio acrescido de cobre não diferiram entre si, apresentando-se como os priores resultados de produtividade. A gomose foi mais severa nas plantas tratadas com o fungicida, seguido pela testemuha (plantas não tratadas). Embora não tenha havido diferenças significativas pelo teste de Scott-Knott a 5%, a maior incidência de gomose também foi registrada nas plantas tratadas com o fungicida mesosistêmico, seguida pela testemunha. Em relação às características físicas dos frutos, não houve diferença significativa pelo teste de Scott Knott quando os tratamentos foram comparados dentro dos períodos de safra e entressafra, porém o tratamento calda de sulfato de cálcio acrescida de fertilizante solúvel proporcionou um sutil aumento na massa fresca de fruto em relação aos demais tratamentos. Os frutos produzidos durante o período de safra foram significativamente maiores a 5% de probabilidade pelo teste de Scott Knott que aqueles produzidos no período de entressafra para todos os tratamentos. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Production of ‘tahiti’ acid limes (Citrus latifolia Tanaka) is an important and profitable activity in the Federal District, suitable for small-scale farmers. In terms of its economic effects, citrus blossom blight (Colletotrichum acutatum) and gummosis (Phytophthora spp). is a major plant disease and is capable of producing losses of up to 100%. However, the fungicides recommended and registered for control of the disease have not produced satisfactory results and present risks to the environment and hazards for those who apply them. Abiotic resistance inducers, foliar fertilizers, and low-impact fungicides have been used on various types of fruit trees, often with satisfactory results. There are, however, few scientific studies as to the efficacy of these products in the control of citrus diseases. The objective of this work is to assess yields, the survival rate of flowers, the physical characteristics of fruits, and the incidence and severity of gummosis (Phytophthora sp.) on ‘tahiti’ acid lime trees treated with fertilizers applied to leaves, an abiotic resistance inducer and fungicide. The experiment was carried out in a nine-year-old grove of ‘tahiti’ acid limes located in the Federal District. The experiment consisted of random blocks with repetitions interspaced with border strips. Plots comprised six plants, of which the first and last were considered borders. The treatments used were: calcium sulfate solution with added soluble fertilizer, acidified at pH= 4; calcium sulfate solution without soluble fertilizer, acidified at pH= 4; Acibenzolar-S-Methyl; potassium phosphite + copper oxychloride; fungicide (Tebuconazole 200 g/l + Trifloxystrobin 100 g/l); and controls. These products were applied using a tractor-pulled sprayer, with a flow of 0.41 liters/second, at 10-day intervals during the rainy season (December to April); 15-day intervals during the interim between the wet and dry seasons (October and November); and at 30-day intervals during the dry season (May to September). Spraying was carried out during the period from April 2010 to July 2011. To assess yields and survival of flowers, blossoms were marked over the period of one year (from May 2010 to April 2011) and harvesting began in September 2010 and extended into December 2011, taking into account the period from flowering to harvest (carpogenisis). The physical characteristics: longitudinal and transversal lengths, fresh-fruit mass, quantity of juice, thickness of the skin, and mass of skin after removal of the juice were assessed for fruits picked at two specific times, i.e., during the harvest period (March 2011) and during offseason production (October 2011). Assessments for gummosis Phytophthora (Phytophthora sp.) were carried out 21 months after the first spraying, to determine the incidence (percentage of plants with symptoms of gummosis at the foot) and severity (percentage of the foot perimeter with continuous lesions) of gummosis. With respect to survival of flowers, in the months in which the buds that are to produce fruits during the harvest season receive treatment, the best results were obtained with applications of a fungicide; potassium phosphite + copper; and calcium sulfate solution with addition of a soluble fertilizer. During blossoming that produces offseason fruits, the use of fungicide continued to produce good results, as did a solution of calcium sulfate without fertilizer. Although, on average, offseason yields presented no statistically significant differences there were, nonetheless, perceptible variations using different treatments, the best results being achieved with calcium sulfate with added soluble fertilizer, and the second best using fungicide. During the harvest period there were significant differences in yields using the different treatments. Trees treated with calcium sulfate solution with added fertilizer; calcium sulfate solution; fungicide; and Acibenzolar-S-Methyl produced the best results. The controls, and trees treated with potassium phosphate and copper, produced similar results and considerably lower yields. Gummosis proved to be most serious among plants treated with mesosystemic fungicide, followed by the controls (untreated plants). No significant differences were found using the Scott-Knott test at 5%, which also detected the greatest incidence of gummosis in plants treated with mesosystemic fungicide, followed by the controls. The characteristics assessed were: fruit dimensions and mass, skin thickness, quantity of juice, and weight of the skin after extracting juice. There was no significant difference in the 5% probability by the Scott Knott test, when treatments were compared within harvest and between-harvest periods, however, in relation to other treatments, calcium sulfate solution with added soluble fertilizer provided a slight increase in the fresh fruit mass, possibly due to the presence of micronutrients in the solution. Fruits produced during the harvest season were significantly larger than those produced in between-harvest periods with all treatments; however, this outcome was expected, in view of increased plant metabolism at higher temperatures.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2013. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2013-08-06T15:21:16Z No. of bitstreams: 1 2013_BernardoSouzaMelloViscardi.pdf: 946847 bytes, checksum: 6166f63c54e067123ac75785157ad32f (MD5) / Approved for entry into archive by Leandro Silva Borges(leandroborges@bce.unb.br) on 2013-08-06T20:13:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_BernardoSouzaMelloViscardi.pdf: 946847 bytes, checksum: 6166f63c54e067123ac75785157ad32f (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-06T20:13:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_BernardoSouzaMelloViscardi.pdf: 946847 bytes, checksum: 6166f63c54e067123ac75785157ad32f (MD5) / O feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris) e o caupi (Vigna unguiculata) são culturas de grande importância para o Brasil. Doenças, cujos patógenos sobrevivem e se multiplicam no solo, como a podridão radicular causada por Sclerotium rolfsii, é um dos principais fatores que limitam a produtividade dessas culturas. O alto custo do uso de fungicidas e os problemas ambientais associados ao uso de agroquímicos levaram a um incremento na pesquisa de métodos alternativos para o controle de doenças. Na primeira parte deste trabalho foi testada a eficiência do esterco bovino (0, 10, 20, 40, 80 e 160 g/kg de solo) e a combinação destas com a inoculação de sementes de feijão-caupi com Trichoderma harzianum e procimidona, na produção de massa de grãos, massa de parte aérea, massa de raízes e altura de plantas. A segunda parte avaliou a eficiência da aplicação de T, harzianum e procimidona ao solo no controle de S. rolfsii e o impacto dessas técnicas combinadas com esterco bovino (0, 40, 80 e 160g/kg de solo), nas características biométricas do feijoeiro comum. Nos dois experimentos as doses crescentes de esterco foram favoráveis ao desenvolvimento da massa de parte aérea, de raízes e de grãos. Trichoderma harzianum mostrou ter influência positiva na produtividade de grãos de caupi e na redução da podridão em P. vulgaris contaminadas com S. rolfsii (UB 193). ______________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The common bean (Phaselous vulgaris) and the cowpea (Vigna unguiculata) are important crops in Brazil. Soil-borne diseases, such as the southern blight (Sclerotium rolfsii), is among the causes of yield reduction. The high costs of fungicide applications and the environmental problems, the chemicals might cause, led to an increase in research of alternative methods for disease control. Therefore, in the first part of this work, cattle manure (0, 10, 20, 40, 80 and 160 g/kg of soil) was added to soil. Vigna seeds were treated with Trichoderma harzianum or procimidone and sowed in soil with or without cattle manure. The following variables were evaluated for each combination of treatment: seed germination, total grain weight, fresh plant weight, fresh root weight, and plant height of cowpea. The second part of the study was conducted to measure the effects of T. harzianum and procimidone applied on soil amended with cattle manure (0, 40, 80, and 160 g/kg of soil) on southern-blight of common bean. The same biometric variables were evaluated as in the first part of the study. The increasing manure doses resulted in greater fresh weight of grains, plants, and roots. The application of T. harzianum into soil had a positive impact on the cowpea yield and in the decrease of disease (S. rolfsii UB 193) on P. vulgaris.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-05-05T21:06:02Z No. of bitstreams: 1 2017_BrunaPinheirodeLima.pdf: 1430114 bytes, checksum: eb86b453e02a640888b9bb486b0b8c7b (MD5) / Rejected by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br), reason: Boa noite, Por favor, adicione o campo título alternativo. Atenciosamente. on 2017-05-26T22:12:38Z (GMT) / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-05-29T15:45:46Z No. of bitstreams: 1 2017_BrunaPinheirodeLima.pdf: 1430114 bytes, checksum: eb86b453e02a640888b9bb486b0b8c7b (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-06-12T20:04:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_BrunaPinheirodeLima.pdf: 1430114 bytes, checksum: eb86b453e02a640888b9bb486b0b8c7b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-12T20:04:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_BrunaPinheirodeLima.pdf: 1430114 bytes, checksum: eb86b453e02a640888b9bb486b0b8c7b (MD5) Previous issue date: 2017-06-12 / O feijoeiro, Phaseolus vulgaris L., (família Fabaceae) é amplamente cultivado e compõe a dieta dos povos nas Américas Central e do Sul e África. No Brasil, grande produtor (3,2 milhões de toneladas), o tipo preferido varia de acordo com a região do país, mas predomina o grupo varietal ‘Carioca’. A produção é fortemente afetada por viroses e o Bean golden mosaic virus – BGMV (gênero Begomovirus e família Geminiviridae) é o vírus mais comumente relatado causando grandes perdas. Um conjunto de amostras de feijoeiro foi coletado no Estado de Goiás e os ácidos nucleicos purificados foram sequenciados pela plataforma Illumina MiSeq. Foram encontrados contigs referentes a vírus classificados em quatro gêneros, incluindo um cytorhabdovírus, (família Rhabdoviridae) que apresenta partículas envelopadas, genoma de ssRNA (-) e hospedeiros vegetais, normalmente transmitidos por afídeos e cigarrinhas. Este vírus foi provisoriamente denominado Bean associated cytorhabdovirus (BaC). Neste estudo, foi confirmada a infecção por BaC nas amostras originais e em 69,3% dos feijoeiros coletados em Brasília-DF, Cristalina-GO e Luziânia-GO, em infecção mista com vírus transmitidos por mosca branca (Bemisia tabaci), o BGMV e o Cowpea mild mottle virus (gênero Carlavirus e família Betaflexiviridae). Amostras de feijoeiro provenientes de Luziânia-GO foram utilizadas para caracterização molecular de um isolado denominado BaC_Luz, bem como fonte de inóculo para os ensaios biológicos. As extremidades 3’ e 5’do BaC foram identificadas por RACE (Rapid Amplification cDNAs Ends). O genoma completo do BaC_Luz foi recuperado por amplificação da sequência em seis fragmentos e possui 13.449 nt. Foram identificados os cinco genes essenciais comuns aos vírus da família Rhabdoviridae, (N: nucleoproteína, P: fosfoproteína, M: proteína matriz, G: glicoproteína e L: polimerase) flanqueados por duas regiões não transcritas a leader (l) e a trailer (t), além de um gene situado entre P e M (3) que codifica uma provável proteína de movimento. Análises filogenéticas conduzidas com a sequência de aminoácidos da nucleoproteína mostraram que o BaC se agrupou em um clado junto com os membros do gênero Cytorhabdovirus e comparações par a par apresentaram maior identidade com os vírus que infectam monocotiledôneas e são transmitidos por cigarrinhas, o Northern cereal mosaic virus e Barley yellow striate mosaic virus, porém em um ramo diferente do clado. A transmissão do BaC_Luz foi, primeiramente, realizada mecanicamente ao feijoeiro ‘Jalo’ e resultou em 25% de plantas positivas. O BaC_Luz foi utilizado como fonte de inóculo em ensaio de transmissão por adultos de mosca branca provenientes do mesmo campo a feijoeiros ‘Jalo’, ‘Pérola’ e ‘BRS FC 401 RMD’ por um período de acesso de inoculação (PAI) de 14 dias resultando em 100% de eficiência. Em condições controladas, o mesmo isolado, após período de acesso de aquisição (PAA) de 7 dias do vírus por adultos avirulíferos e posterior PAI de 7 dias, resultou em 25, 50 e 75% de transmissão a soja (Glycine max) ‘BR16’, caupi (Vigna unguiculata) e feijoeiro ‘BRS FC 401 RMD’, respectivamente. Este estudo apresenta dados inéditos, pois relata a identificação do primeiro rhabdovírus infectando feijoeiro e também, pela primeira vez apresenta evidências que um membro da família Rhabdoviridae pode ser transmitido por Bemisia tabaci. / The common bean (Phaseolus vulgaris L.) (Fabaceae family) is widely cultivated and is an important food in the the diet in different countries in Central and South America and Africa. In Brazil, a large producer (3.2 million tons), the Carioca type of bean is preferred. The bean yield may be affected by the incidence of viruses and Bean golden mosaic virus - BGMV (genus Begomovirus and family Geminiviridae) is the most commonly reported as responsible for large losses in bean production. Samples of common beans were collected in State of Goiás, sequenced by the Illumina MiSeq platform and contigs of viruses belonging to four genera were identified, including a cytorhabdovirus, (Rhabdoviridae family). Cytorhabdoviruses have enveloped particles, ssRNA (-) genome, infect plant hosts and are usually transmitted by aphids and leafhoppers. The new cytorhabdovirus was denominated Bean associated cytorhabdovirus (BaC). In this work, the infection by BaC was confirmed in the original samples and in 69,3% of samples from Brasília, Cristalina and Luziânia in mixed infections with other whitefly transmitted viruses, BGMV and Cowpea mild mottle virus (genus Carlavirus and family Betaflexiviridae). Samples from Luziânia (isolate BaC_Luz) were used for molecular characterization and as inoculum source in biological assays The 3' and 5' ends of BaC were identified by RACE (Rapid Amplification cDNAs Ends). The complete BaC_Luz genome and was recovered by PCR amplification of six fragments and is 13.449 nt long. The genome presents the five essential genes common to rhabdoviruses, (N: nucleoprotein, P: phosphoprotein, M: matrix protein, G: glycoprotein and L: polymerase) flanked by two non-transcribed leader (1) and trailer (T) regions, in addition to a gene located between P and M (3) encoding a likely moviment protein. Phylogenetic analyzes conducted with the amino acid sequence of the nucleoprotein showed that BaC clustered together with members of the genus Cytorhabdovirus, and pariwise comparisons showed greater identity with Northern cereal mosaic virus and Barley yellow striate mosaic virus that infect monocotyledons and are transmitted by leafhoppers, but are clustered in different branch of the clade. BaC is mechanically transmitted to bean 'Jalo' at a rate of 25% and by whitefly. BaC_Luz was used as an inoculum source in a whitefly transmission test from field infected plant to 'Jalo', 'Pérola' and 'BRS FC 401 RMD' beans with an inoculation access period (IAP) of 14 days resulting in 100% of transmission efficiency. Under controlled conditions, after a seven-day acquisition access period (AAP) in infected plants by aviruliferous adults and subsequent seven-day IAP, resulted in 25, 50 and 75% transmission to soybean (Glycine max) 'BR16 ', cowpea (Vigna unguiculata) and common bean' BRS FC 401 RMD ', respectively. This study presents novel data reporting the identification of the first rhabdovirus infecting beans also for the first time a virus member of the family Rhabdoviridae being transmitted by Bemisia tabaci.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-06-05T18:35:12Z No. of bitstreams: 1 2017_PedroMarettiBrant.pdf: 2836357 bytes, checksum: 9d3963f4506e49546ec09c79daaa34f4 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-06-20T21:20:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_PedroMarettiBrant.pdf: 2836357 bytes, checksum: 9d3963f4506e49546ec09c79daaa34f4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-20T21:20:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_PedroMarettiBrant.pdf: 2836357 bytes, checksum: 9d3963f4506e49546ec09c79daaa34f4 (MD5) Previous issue date: 2017-06-20 / A floricultura no Brasil teve início como atividade secundária da fruticultura nos estados de São Paulo e Santa Catarina no início do século XX e atualmente apresenta um crescimento anual de exportação maior que a média mundial. O Distrito Federal (DF) é o décimo em valor de mercado no país, sendo um mercado altamente promissor por apresentar a maior renda per capita do país. Com a expansão do setor, aumento na incidência das doenças e a constante introdução de mudas e sementes exóticas no país, fatores de cultivo, manejo e sanidade vegetal podem constituir um entrave à produção de ornamentais no país e DF. Ainda assim, pesquisas direcionadas a detecção precisa de espécies virais ocorrendo em plantas ornamentais são incipientes no país e escassas no DF. O estudo de viroma em combinação com as estratégias de Next Generation Sequencing (NGS), tendo o apoio das metodologias de bioinformática, têm possibilitado uma eficiente descrição de diferentes organismos presentes em diferentes amostras biológicas nos mais diversificados ambientes e proporcionado avanços significativos em diferentes campos das ciências, incluindo a virologia vegetal. Neste trabalho, um pool composto por dez espécies de plantas ornamentais provenientes do Viveiro I da NOVACAP (Companhia Urbanizadora da Nova Capital do Brasil) foi submetido ao sequenciamento NGS. Após análise dos dados gerados, por meio de diferentes técnicas de bioinformática, sequências novas foram encontradas, indicando seis prováveis novas espécies virais em diferentes gêneros e famílias. Duas prováveis espécies novas de Nucleorhabdovirus (família Rhabdoviridae) foram identificadas, sendo uma delas em Pachystachys lutea (camarão-amarelo) e a outra em Coreopsis lanceolata (margaridinha). Nesta mesma ornamental, margaridinha, identificou-se também uma provável espécie nova do gênero Umbravirus (família Tombusviridae). Outro representante da família Tombusviridae, neste caso uma espécie classificada no gênero Pelarspovirus, foi identificada em Jasminum nitidum (jasmim estrela). As demais espécies, uma do gênero Cytorhabdovirus e outra uma do gênero Potyvirus, foram detectadas no pool de amostras. Dentre essas prováveis espécies novas de vírus, duas sequências detectadas nas plantas ornamentais C. lanceolata e P. lutea apresentaram maior proximidade com os vírus Sonchus yellow net nucleorhabdovirus (SYNV) e Potato yellow dwarf nucleorhabdovirus (PYDV), respectivamente, e foram denominadas como Coreopsis mottle-associated virus (CMaV) e Pachystachys mosaic-associated virus (PMaV). Para CMaV e PMaV, o genoma total foi recuperado mediante amplificação genômica nas amostras originais utilizando primers internos sobrepostos, sendo as extremidades 3’ e 5’ recuperadas através da técnica RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends - RACE). Após estes procedimentos, sequências foram obtidas via sequenciamento Sanger, confirmando a alta identidade com a sequência montada in silico pelo NGS. Com a sequência completa dos dois vírus procedeu-se análises filogenéticas. A partir de análises comparativas via alinhamento múltiplo de sequências (MSA), alinhamento pairwise e filogenéticas, propôs-se que CMaV e PMaV sejam prováveis espécies novas para o gênero Nucleorhabdovirus, tendo em vista a identidade nucleotídica de 56,99% entre os genomas de CMaV e SYNV e 46,99% entre PMaV e PYDV. / In Brazil, the floriculture agribusiness started as a minor activity in the São Paulo and Santa Catarina states in the early 20th century and currently its annual market growth is bigger than worldwide’s mean. The Federal District (DF) is ranked in the 10th place in terms of market value in Brazil, being a highly promising market due to the high average per capita income of its population. With the expansion of this sector, it was observed a significant increase in the incidence of diseases due to the constant transit and introduction into the country of exotic plant material and seeds. In addition, the implementation of new crop management practices is also having direct effects on disease outbreaks. These factors may affect the sustainability of the ornamental plant agribusiness sector in the country. Research efforts aiming to develop accurate diagnostic tools for viral species occurring in ornamental plants are yet incipient in the country. The virome study employing Next Generation Sequencing (NGS) techniques, combined with bioinformatics methods, has been considered as the most powerful strategy aiming to exploit the genetic diversity of organisms present in any biological sample and allowed significant advances in different fields of science, including plant virology. For this work a pool of ten ornamental plants from NOVACAP (Companhia Urbanizadora da Nova Capital do Brasil) Nursery 1 was sent to NGS. Posterior to data analysis, the sequences obtained were compared to reference genomes from DNA data banks and assembled, producing potential six plant virus sequences in different genera and families. Two probable new species from Nucleorhabdovirus (Rhabdoviridae family) were identified, one in Pachystachys lutea and other in Coreopsis lanceolata. In this ornamental plant, C. lanceolata, it was identified as well a probable new species of the genus Umbravirus (Tombusviridae family). Other member of the Tombusviridae family, now from the Pelarspovirus genus, was identified in Jasminum nitidum. Two of the assembled species, one of the Cytorhabdovirus genus and other from the Potyvirus genus, were detected in the pool only. Among these probable new viral species, two sequences that were detected in the ornamental plants C. lanceolata and P. lutea were close to the Sonchus yellow net nucleorhabdovirus (SYNV) and Potato yellow dwarf nucleorhabdovirus (PYDV) viruses, respectively, and were named as Coreopsis mottle-associated virus (CMaV) and 4 Pachystachys mosaic-associated virus (PMaV). For CMaV and PMaV, the total genome was recovered by amplifying the genome from the original samples using sintesyzed primers, while the 3’ and 5’ ends with the RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends) technique. Posterior to these assays, sequences were obtained from Sanger sequencing method, confirming the high identity with the in silico assembled sequence from NGS. With the complete sequence of both viruses, phylogenetics assays were made. With the multiple sequence alignment (MSA), pairwise alignment and phylogenetics, we propose that CMaV and PMaV are probable new viruses from the Nucleorhabdovirus genus, as the nucleotide identity of the genome were 56.99% from CMaV and SYNV and 46.99% from PMaV and PYDV.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-07-10T20:45:08Z No. of bitstreams: 1 2017_MariaGeaneFontes.pdf: 4573833 bytes, checksum: ab50d2e6f2ab5d5e3f1d2ee9a669ced0 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-07-27T20:33:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_MariaGeaneFontes.pdf: 4573833 bytes, checksum: ab50d2e6f2ab5d5e3f1d2ee9a669ced0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-27T20:33:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_MariaGeaneFontes.pdf: 4573833 bytes, checksum: ab50d2e6f2ab5d5e3f1d2ee9a669ced0 (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / O tomateiro (Solanum lycopersicum L.) é uma das hortaliças mais importantes no Brasil e no mundo. A doença comumente conhecida como ‘vira cabeça’ (causada por espécies de Tospovirus) é uma das mais importantes afetando o tomateiro a nível mundial. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo estudar a interação tomateiro-tospovírus através da análise transcritômica na interação compatível Solanum lycopersicum–Groundnut ringspot virus (GRSV), da avaliação da resistência a tospovírus na cv. ‘Rey de Los tempranos’ (=‘PI 203230’) e da caracaterização de novas espécies hospedeiras de GRSV. No CAPÍTULO II foi realizado um estudo do transcritoma na interação compatível entre a cultivar de tomate ‘Santa Clara’ e GRSV com a finalidade de identificar genes inibidos ou induzidos após inoculação do vírus. Amostras foliares de plantas da cv. ‘Santa Clara’ (mecanicamente inoculadas com um isolado de GRSV e mock-inoculadas) foram coletadas a 0, 3, 5, 7 e 10 dias após a inoculação. Um ‘pool’ equimolar entre os períodos 3-5 (3-5DAI) e 7-10 (7-10DAI) foi estabelecido após a extração do RNA, análise da concentração e da qualidade. Um total de 12 bibliotecas de cDNA foram sequenciadas gerando um total de 396 milhões reads que foram mapeados no genoma de referência do tomateiro. Cerca de 9.206 genes foram diferencialmente expressos na interação S. lycopersicum ‘Santa Clara’ – GRSV. Dentre esses genes 5.562, 5.283 e 3.924 foram identificados como diferencialmente expressos nos períodos 0DAI, 3-5DAI e 7-10DAI, respectivamente. O espectro de eficiência da resistência identificada na cultivar de tomate ‘Rey de Los Tempranos’ foi investigada em bioensaios envolvendo a inoculação mecânica com uma coleção de isolados de Tospovirus (CAPÍTULO III). Plantas da linhagem resistente ‘LAM 147’ (portadora do gene Sw-5) também foram avaliadas e a cv. ‘Santa Clara’ (isolinha suscetível de ‘LAM 147’) foi utilizada como controle suscetível. Os resultados indicaram que a resistência do acesso ‘Rey de Los Tempranos’ se caracteriza como sendo do tipo espécie-específica (funciona somente contra isolados de TSWV) e isolado-específica (alguns isolados de TSWV são capazes de ‘quebrar’ a resistência). Plantas híbridas (F1) resultante de cruzamentos realizados entre ‘Rey de Los Tempranos’ e cv. ‘Santa Clara’ (inoculadas com o isolado TSWV #523) não exibiram sintomas, indicando que esta seria uma resistência conferida por fator(es) dominante(s). No CAPÍTULO IV, amostras foliares com sintomas similares aos induzidos por espécies de Tospovirus (clorose, necrose foliar intensa, mosqueado, anéis concêntricos e deformação foliar) foram coletadas em campos de soja [Glycine max (L.) Merrill], ervilha (Pisum sativum L.), jiló (Solanum aethiopicum L. var. gilo Raddi), almeirão (Cichorium intybus L.) e jurubeba vermelha (S. stramonifolium Jacq.) em Brasília–DF, Brasil. Para a identificação do agente causal dessas doenças foram realizados testes sorológicos, moleculares e bioensaios examinando o círculo de plantas hospedeiras. Resultados dos testes moleculares e sorológicos (ELISA) mostraram que as plantas sintomáticas foram positivas apenas para a espécie GRSV. Todos os isolados foram capazes de induzir sintomas característicos de tospoviroses nos ensaios de círculos de hospedeiras. Desta forma, o presente trabalho também relata pela primeira vez cinco novas espécies como hospedeiras naturais de GRSV em condições brasileiras. / The tomato (Solanum lycopersicum L.) is one of the most important vegetables in Brazil and around the world. The disease universally known as ‘spotted wilt’ is caused by species of Tospovirus and it is one of the most important problems affecting tomato crops worldwide. The main objectives of the present work were to study the tomato–tospovirus interaction via transcriptional analysis of a compatible interaction Solanum lycopersicum–Groundnut ringspot virus (GRSV), to evaluate the spectrum of resistance to tospovirus in the cultivar ‘Rey de Los Tempranos’ (=‘PI 203230’ ) and to characterize new GRSV hosts. A transcriptome study on the compatible interaction between the tomato cultivar ‘Santa Clara’ and GRSV (CHAPTER II) was conducted in order to identify genes inhibited and/or induced after virus infection in ‘Santa Clara’ (a highly susceptible tomato accession). Leaf samples of ‘Santa Clara’ plants mechanically inoculated with one GRSV isolate as well as mockinoculated plants were collected at 0, 3, 5, 7 and 10 days after inoculation (DAI). Equimolar pools of the periods 3-5 (3-5DAI) and 7-10 (7-10DAI) were established after RNA extraction and concentration and quality assessement. Twelve cDNA libraries were sequenced and a total of 396.2 millions reads were mapped into the tomato reference genome. About 9,206 genes were differentially expressed in the interaction S. lycopersicum ‘Santa Clara’–GRSV. Among these genes, 5,283; 5,562 and 3,924 genes were identified as differential expressed in the periods 0DAI, 3-7-5DAI, and 10DAI, respectively. The resistance spectrum of the cultivar ‘Rey de Los Tempranos’ was investigated in bioassays involving mechanical inoculation with 22 tospovirus isolates (CHAPTER III). Plants of the resistant inbred line ‘LAM 147’ (carrying the Sw-5 gene in homozygous condition) were also evaluated and the susceptible cultivar ‘Santa Clara’ (the near isogenic line of ‘LAM 147’) was used as susceptible control. The results indicated that the resistance of ‘Rey de Los Tempranos’ might be characterized as being species-specific (i.e. effective only against TSWV isolates) and isolated-specific (i.e. a subgroup of TSWV isolates was able to overcome the resistance). Hybrid plants (F1) derived from the crosses between ‘Rey de Los Tempranos’ and ‘Santa Clara’ (inoculated with the TSWV #523 isolate) did not exhibit symptoms, indicating that the resistance could be conferred by dominant factor(s). In CHAPTER IV, foliar samples displaying symptoms similar to those induced by Tospovirus species (chlorosis, necrosis, leaf mottling, concentric rings and leaf deformation) were collected in production fields of soybean [Glycine max (L.) Merrill], field pea (Pisum sativum L.), chicory (Cichorium intybus L.), scarlet eggplant (Solanum aethiopicum L. var. gilo Raddi), and red jurubeba (S. stramonifolium Jacq.) in Brasília-DF, Brazil. Serological tests, molecular assays, and host range studies were carried out in order to identify the causal agents of these diseases. Serological tests (ELISA) showed that symptomatic plants were positive only for GRSV. PCR analyses of the soybean, field pea, scarlet eggplant, chicory, and red jurubeba were conducted using primers specific for the nucleocapsid protein (N). The sequence analyses of the tospovirus-derived amplicons displayed high identity with GRSV isolates. All isolates were able to induce characteristic symptoms of tospoviroses in all plant species employed in the host range studies. Thus, the present work also reports for the first time five new plant species as natural hosts of GRSV under Brazilian conditions.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2017. / Texto parcialmente disponibilizado pelo autor. Conteúdo restrito: Capítulos 4-Material e Métodos; 5-Resultados e 6-Discussão. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-07-26T13:55:17Z No. of bitstreams: 1 2017_DonaldManigat_PARCIAL.pdf: 621102 bytes, checksum: 1f0b1edf50dddf5686b5208b044257b7 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-08-11T20:04:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_DonaldManigat_PARCIAL.pdf: 621102 bytes, checksum: 1f0b1edf50dddf5686b5208b044257b7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-11T20:04:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_DonaldManigat_PARCIAL.pdf: 621102 bytes, checksum: 1f0b1edf50dddf5686b5208b044257b7 (MD5) Previous issue date: 2017-08-11 / O tomateiro industrial (Solanum lycopersicum L. Solanaceae) é atacado por um grande número de artrópodes-praga que além de sugarem a seiva das plantas podem atuar como vetores de viroses e causarem broqueamento de frutos. O objetivo deste trabalho foi avaliar se a associação entre um acesso selvagem de Solanum habrochaites f. glabratum com reconhecida resistência a insetos-praga e cultivares comerciais de tomateiro industrial contribuem para o manejo de fitófagos sugadores transmissores de viroses e lepidópteros broqueadores de frutos. O experimento foi conduzido na Fazenda Água Limpa (FAL), Brasília-DF, nas safras 2015 e 2016. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso, com quatro repetições e cinco tratamentos: ‘BRS Tospodoro’, ‘BRS Tyão’ e o acesso S. habrochaites ‘PI-134417’ cultivados isoladamente ou em associação. Nos ensaios a campo, após o transplantio das mudas, foram avaliados semanalmente, as densidades dos insetos-fitófagos sugadores e broqueadores de fruto, o número de frutos contendo ataque por broqueadores bem como os ovos e as ninfas encontrados sobre as plantas (contagem direta em todas as estruturas de dez plantas por parcela). As densidades dos insetos vetores de fitoviroses foram avaliadas ainda através da coleta em armadilhas amarelas adesivas. Além disso, foram empregadas dez plantas por parcela para estimar a produção total, de frutos normais (sem ataque) e atacados. Foi avaliada ainda a incidência de begomovírus nas plantas através de sintomatologia visual e por PCR com primers específicos para detecção viral. A oviposição de Helicoverpa zea sobre os genótipos testados foi avaliada no laboratório. Os dados foram analisados por ANOVA por medidas repetidas e ANOVA seguidas de teste Tukey a p≤0,05. A associação entre genótipos comerciais de tomateiro industrial e o acesso selvagem ‘PI-134417’ reduziu, na maioria dos casos, a densidade de insetos sugadores vetores de fitoviroses nas cultivares comerciais bem como a coleta em armadilhas do tipo painel adesivo amarelo. Similarmente, a associação entre as cultivares comerciais e o acesso selvagem de ‘PI-134417’ reduziu o número de frutos broqueados por brocas pequenas e gigantes em ambos ou em pelo menos um dos genótipos de tomate industrial avaliados. Não foram observadas diferenças no ataque de insetos sugadores vetores de fitoviroses e broqueadores de frutos entre as cultivares comerciais testadas. A sintomatologia visual de begomovirose detectada a campo não foi confirmada em laboratório para nenhum dos tratamentos avaliados. Não houve diferença em relação à oviposição de H. zea em plantas de tomateiro selvagem e industrial em ensaios de laboratório. / The industrial tomato (Solanum lycopersicum L. Solanaceae) is attacked by a great number of pests which include sap feeders that can also act as virus vectors and fruit borers. This study aimed at evaluating if the association between a wild genotype of Solanum habrochaites f. glabratum possessing known resistance to many insect-pests and commercial cultivars of industrial tomato can help on the management of phytophagous sap feeders and viruses vectors and fruit borers lepidopteran. Trials were run at Fazenda Água Limpa (FAL), Brasilia-DF-Brazil, during 2015 and 2016 seasons. Treatments were designed in completely randomized blocks with four replications and consisted of three genotypes (‘BRS Tospodoro’, ‘BRS Tyão’ and the wild access S. habrochaites ‘PI-134417’) grown alone or in association with the wild access. After seedling transplantation, the densities of phytophagous insects (sap feeders and fruit borers) as well as the number of eggs, nymphs and bored fruits were monitored weekly by direct counting them in all the structures of 10 plants per plot. The densities of virus’ vectors were also sampled by using yellow sticky traps. The yield of the commercial cultivars (non-bored and bored fruits) was estimated by harvesting 10 plants per plot. The incidence of begomovirus was evaluated by the presence of visual symptoms and confirmed by PCR using specific primers for virus detection. The oviposition of Helicoverpa zea on the tested genotypes was evaluated on a trial run within Lab condition. Data were analyzed by repeated measures ANOVA and ANOVA, both followed by Tukey test at p≤0.05. The association between industrial cultivars and the wild access ‘PI-134417’ reduced, in most cases, the densities of sap feeders on the commercial cultivars as well as the entrapped insects in the yellow sticky panels. Similarly, the association between the commercial cultivars and the wild access of ‘PI-134417’ reduced the number of bored fruits by small and giant borers in at least one or both commercial cultivars evaluated. There were no differences in the attack of sap feeders or fruit borers between the commercial cultivars tested. The visual symptoms of infection by begomovirus were not confirmed by the PCR analysis. Also, there were no differences between in the oviposition of H. zea among the tested genotypes.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-08-02T17:31:17Z No. of bitstreams: 1 2017_JosemarForesti.pdf: 1624127 bytes, checksum: e36609a924046e1f6a3fda9439390d1f (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-08-29T20:07:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_JosemarForesti.pdf: 1624127 bytes, checksum: e36609a924046e1f6a3fda9439390d1f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-29T20:07:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_JosemarForesti.pdf: 1624127 bytes, checksum: e36609a924046e1f6a3fda9439390d1f (MD5) Previous issue date: 2017-08-29 / O percevejo Leptoglossus zonatus (Dallas) (Hemiptera: Coreidae) apesar de ser considerado praga secundária do milho grão, pode alcançar o status de praga chave no milho semente. Este trabalho objetivou estudar os fatores relativos à biologia de L. zonatus e as perdas que ele ocasiona, bem como selecionar inseticidas eficientes para o seu controle em milho semente e quais as densidades desta praga que requerem a adoção de medidas para o seu controle. Os estudos relativos à biologia do inseto foram iniciados a partir de posturas com no máximo dois dias de idade. Os ensaios para determinação do período suscetível do milho destinado à produção de sementes foram conduzidos em campo e em casa de vegetação com parcelas contendo quatro plantas envoltas em gaiolas de 0,6 x 0,6 x 2,4 m. Cada parcela foi infestada com 10 casais de L. zonatus que foram mantidos em contato com as plantas por 0-20, 0-40, 0-60, 21-40, 21-60, 41-60 dias e por 0-10, 11-20, 21-30, 31-40 e 41-50 dias, além do tratamento testemunha sem infestação. Ao final de 60 dias, as espigas foram colhidas e as sementes obtidas foram classificadas por amostragem visual, em sementes murchas, com dano no embrião, com dano no endosperma e o total de sementes danificadas. Para a quantificação das perdas que o inseto causa a campo foram avaliadas espigas provenientes de quatro lavouras dos cultivos de primeira e segunda safra, amostrando-se 50 espigas de cada lavoura. As espigas foram classificadas, por amostragem visual, nas mesmas categorias descritas anteriormente. Essas categorias, acrescida de sementes provenientes de campo sem infestação (testemunha), foram empregadas ainda em testes para avaliação da qualidade da semente. Os dados obtidos no ensaio para estabelecimento do período suscetível foram usados para estimativa da variável b da fórmula de nível de dano econômico (NDE). Adicionalmente, foi determinada a CL50 dos inseticidas em ensaios de laboratório e testada a CL50 dobrada em ensaios de campo através da exposição da planta, do inseto e da planta + inseto. Os inseticidas que apresentaram eficiência maior que 75% (λ-cialotrina + tiametoxam, permetrina e metomil) foram empregados no cálculo do NDE nas modalidades de aplicação previstas na bula e para genótipos de baixo, médio e alto potencial genético. O nível de controle foi estabelecido como sendo 20% abaixo do NDE. O percevejo L. zonatus passa por cinco instares, com duração média de 7,0 dias. O maior período de suscetibilidade do milho a L. zonatus, avaliado através dos ensaios com e sem sobreposição de dano, coincide com as fases iniciais de desenvolvimento dos grãos (embonecamento e grão bolha d’água). Houve correlação entre os resultados obtidos através da análise visual e dos testes para avaliação da qualidade fisiológica da semente, com a maior qualidade ocorrendo nas sementes sem dano, e a pior qualidade ocorrendo nas sementes danificadas (murchas, com dano no embrião ou endosperma). Não foram verificadas diferenças significativas entre as porcentagens das diferentes categorias de sementes danificadas por percevejos avaliadas visualmente na primeira ou segunda safra. Entretanto, os valores encontrados, em ambas as safras para porcentagem total de sementes danificadas por percevejos ficaram acima dos níveis exigidos em termos de qualidade da semente (85% de germinação ou 97% de sementes sem apresentar injúria de insetos). O NDE variou de três a oito insetos adultos por 1.000 plantas (0,003 a 0,008 insetos adultos por espiga) e o NC variou de dois a seis adultos por 1.000 plantas (0,002 a 0,006 adultos por espiga). A tomada de decisão é mais frequente quando se emprega a pulverização terrestre em comparação à pulverização aérea e linhagens de médio e alto potencial genético em comparação as de baixo potencial genético. / The western leaffooted bug, Leptoglossus zonatus (Dallas) (Hemiptera: Coreidae), despite being considered a secondary pest of corn grains, can reach the status of a primary pest in seed corn. This work sought to study the factors related to the biology of L. zonatus and the losses that it causes, as well as to select efficient insecticides for its control in seed corn and the pest densities that require the adoption control measures. Studies on the biology of the insect utilized egg masses with a maximum of two days of age. The tests to determine the susceptible period of corn for seed production were conducted in the field and in the greenhouse with plots containing four plants surrounded by cages measuring 0.6 x 0.6 x 2.4 m. Each plot was infested with 10 couples of L. zonatus that were maintained in contact with the plants for 0-20, 0-40, 0- 60, 21-40, 21-60, 41-60 days and for 0-10, 11-20, 21-30, 31-40 and 41-50 days, in addition to the control treatment without infestation. At the end of 60 days, the corn ears were harvested and the obtained seeds were classified by visual sampling into categories of wilted seeds, with damage to the embryo, with damage to the endosperm and completely damaged seeds. For the quantification of losses caused by the insect in the field the ears from four fields of the first and second seasons were evaluated, sampling 50 ears of each field. The ears were classified by visual sampling in the same categories as described above. These categories, plus seed from the field without infestation (control), were further used in tests to evaluate the quality of the seed. The data obtained in the test for establishment of the susceptible period were used to estimate the variable b of the economic injury level formula (EIL). In addition, the LC50 of the insecticides was determined in laboratory tests and the LC50 in field trials was tested by exposure of the plant, insect and plant + insect. The insecticides that showed efficacy greater than 75% (λ-cyhalothrin + thiamethoxam, permethrin and methomyl) were used in calculation of the EIL for the application modalities included on the package label and for genotypes of low, medium and high genetic potential. The control level was established as being 20% below the EIL. The western leaffooted bug L. zonatus goes through five instars, with an average duration of 7.0 days. The highest susceptibility period of corn to L. zonatus, evaluated via the assays with and without damage overlapping, coincides with the initial development stages of the grains (silking and blister). There was a correlation between the results obtained through the visual analysis and the tests to evaluate the physiological quality of the seed, with the highest quality occurring in the seeds without damage, and the worst quality occurring in damaged seeds (wilt, damage to the embryo or endosperm). There were no significant differences between the percentages of the different categories of seeds damaged by the western leaffooted bug evaluated visually in the first or second season. However, the values found in both crops for total percentage of seeds damaged by the western leaffooted bugs were above the levels required in terms of seed quality (85% germination or 97% seed without presenting insect injury). The EIL ranged from three to eight adult insects per 1,000 plants (0.003 to 0.008 adult insects per ear) and the ET (Economic Threshold) ranged from two to six adults per 1,000 plants (0.002 to 0.006 adults per ear). Decision making is more frequent when terrestrial spraying is used compared to aerial spraying, and medium and high genetic lineages compared to those with low genetic potential.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-08-07T12:19:44Z No. of bitstreams: 1 2017_MarceloHenriqueLisboaRennó.pdf: 483930 bytes, checksum: f71ab1a98d720224cd9ea980b3bfce6c (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-09-12T19:02:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_MarceloHenriqueLisboaRennó.pdf: 483930 bytes, checksum: f71ab1a98d720224cd9ea980b3bfce6c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-12T19:02:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_MarceloHenriqueLisboaRennó.pdf: 483930 bytes, checksum: f71ab1a98d720224cd9ea980b3bfce6c (MD5) Previous issue date: 2017-09-12 / A incidência de doenças na cultura do algodoeiro tem restringido o aumento em produtividade em todas as regiões produtoras no Brasil. Dentre elas a Mancha de ramulária é a principal doença foliar do algodoeiro do Brasil. Com a expansão das áreas cultivadas para o Cerrado, a doença passou a se manifestar mais cedo provocando desfolha prematura, e consequentemente, a redução do potencial produtivo. O agente causal é tradicionalmente identificado como Ramularia areola, mas trabalhos recentes, com pouca representação de isolados nacionais transferiram o agente causal para Ramulariopsis pseudoglycines. Entretanto, uma amostragem representativa das populações brasileiras de R. areola ainda não foi estudada frente a esta classificação, para confirmar a identidade do agente causal no país. Além disso, a introdução recente de genótipos suscetíveis de algodão de origem australiana e americana, onde a doença é menos importante, tem levado a diversos surtos epidêmicos. O uso de defensivos químicos tem sido a principal forma de controle dessa doença, mas acarreta prejuízos ambientais. Além disso, aplicações intensivas de fungicidas podem induzir a seleção e prevalência de populações do patógeno resistentes aos princípios ativos mais empregados. A utilização de variedades resistentes é uma excelente alternativa de manejo, mas também induzem mudanças na composição da população do patógeno para superação de resistência do hospedeiro. O conhecimento das populações do patógeno predominantes em cada região produtora é fundamental para que os programas de melhoramento desenvolvam cultivares com resistência ampla e durável. Com base na ramificação dos conidióforos a partir da base o agente causal da doença foi transferido de Ramularia areola, para Ramulariopsis gossypii. Recentemente estudos moleculares revelaram a existência de uma nova espécie (Ramulariopsis pseudoglycines) associada com a mancha de ramulária. Adicionalmente, é possível que essa doença seja causada por um complexo de espécies, como descrito em outros patossistemas. Portanto uma amostragem representativa das populações brasileiras de Ramulariopsis spp. é fundamental para a identificação precisa do patógeno e consequentemente para o controle eficiente da doença. Diante disso esse trabalho teve como objetivos verificar a espécie predominante de Ramulariopsis que ocorre nas principais regiões produtoras de algodão no Brasil e avaliar isolados representantes de cada região, quanto a parâmetros epidemiológicos do patossistema algodão-ramularia. A caracterização molecular de 93 isolados representativos das principais regiões produtoras de algodão no país, revelou que todos os espécimes pertenceram a R. pseudoglycines. Nos ensaios de avaliação dos parâmetros epidemiológicos com cinco isolados, em condições controladas, os isolados do Mato Grosso do Sul e Mato Grosso causaram maiores incidência e severidade agressivos na cultivar susceptível cv. FM 975WS que os isolados do Maranhão, Bahia e Goiás. Além disso, o período de incubação dos isolados mais agressivos foi cinco dias menor que o dos isolados menos agressivos na cultivar susceptível. Quando avaliados na cultivar resistente cv. BRS 372 não foi superada por todos os isolados testados, com menores índices de doença. As cvs. TMG 47B2RF e DP 1648B2RF não apresentaram sintomas quando inoculados com quaisquer dos cinco isolados testados. / Incidence of cotton diseases restricts increases of crop yield in all Brazilian producing regions. Among these diseases, the Ramularia leaf spot is the most important foliar disease in cotton in Brazil. Due to the expansion of cultivated areas to the Cerrado region, the disease now arises earlier, causing premature defoliation and, consequently, reduction in yield. Causal agente is traditionally referred to as Ramularia areola, but recente work, with few representatives of Brazilian isolates transferred the causal agent to Ramulariopsis pseudoglycines. So far, a representative study of Brazilian R. areola isolates has not been undertaken. In addition, the recent introduction of cotton susceptible genotypes from Australia and the United States, where the disease is less important, has been associated to several epidemic outbreaks. Nowadays, the use of pesticides is the most important control strategy of this disease, but intensive use of chemicals lead to environmental risks. However, intensive sprayings of fungicides may lead to resistant pathogen populations. The use of resistant varieties is an excellent management alternative due to its high efficiency and low environment impact, but reliance on major host resistance genes also pressures pathogen population towards resistance breakdown. Understanding the mechanisms of resistance and the variability of the pathogen populations in co-evolution with the plant host are essential for breeding programs focused on developing resistant cultivars. Based on the ramification of the conidiophores, the causal agent of ramularia leaf spot was transferred from Ramularia aerola para Ramulariopsis gossypii, and recently, molecular characterization revealed still another entity associated to ramularia leaf spot, Ramulariopsis pseudoglycines. Additionally, it is possible that the disease is caused by a complex of species, as it has been described in other pathosystems. Thus, a study of a representative sample of the Brazilian populations Ramulariopsis spp. is fundamental for the precise identification of the pathogen and for the efficient disease management. Therefore, this work aimed to identifying the predominant species of Ramulariopsis occurring in the Brazilian cotton growing regions and to evaluate representative isolates of each locality as to epidemiological parameters of the cotton-ramularia pathosystem. Molecular characterization of 93 isolate representative of the main Brazilian cotton growing regions showed that all specimens belonged to R. pseudoglycines. In the assays for evaluation of epidemiological parameters, with five isolates, in controlled conditions, representatives of the states of Mato Grosso do Sul and Mato Grosso caused higher disease incidence and severity in the susceptible cv. FM 975WS than the isolates from the states Maranhão, Bahia and Goiás. Furthermore, period of incubation of the most aggressive isolates was five days shorter than the ones of the least aggressive isolates in the susceptible cultivar. When tested against the resistant cultivar BRS 372, resistance was overcame by all isolates, albeit with lower disease levels. Cultivars TMG 47B2RF and DP 1648B2RF did not show any disease symptoms when inoculated with any one of the five isolates studied.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-08-02T18:17:54Z No. of bitstreams: 1 2016_SandroCoelhoLinharesMontalvão_PARCIAL.pdf: 1518701 bytes, checksum: d86ee1aac30dfe2a9bb7f01f5ab7f320 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-10-06T17:55:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_SandroCoelhoLinharesMontalvão_PARCIAL.pdf: 1518701 bytes, checksum: d86ee1aac30dfe2a9bb7f01f5ab7f320 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-06T17:55:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_SandroCoelhoLinharesMontalvão_PARCIAL.pdf: 1518701 bytes, checksum: d86ee1aac30dfe2a9bb7f01f5ab7f320 (MD5) Previous issue date: 2017-10-06 / O algodoeiro é uma das espécies mais cultivadas no mundo. A cotonicultura brasileira tem destaque, ocupando o 5o lugar entre os produtores mundiais e 3o como exportador. Apresenta a maior média de produção por área cultivada (~5t/ha) em sequeiro no mundo. As pragas e doenças podem comprometer a produtividade. Assim, duas doenças merecem destaque, a meloidoginose (Meloidogyne incognita raças 3 e 4) e a murcha de fusário (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum), pois podem ser destrutívas às plantas, tanto isoladamente como em associação. A dificuldade de se fazer um controle eficiente, é devido à capacidade dos patógenos de parasitarem uma ampla gama de hospedeiros e terem grande persistência no solo, dificultando o controle através de tratos culturais como a rotação de cultura e até mesmo a utilização de tratamentos químicos. A busca por alternativas como o uso de Bacillus sp. no controle de doenças de plantas é justificada. Assim, o objetivo geral desse trabalho foi selecionar e caracterizar estirpes de Bacillus antagonistas a M. incognita e F. oxysporum f. sp. vasinfectum (Fov). Para tanto, foi realizado um ensaio in vitro com 11 estirpes de Bacillus thuringiensis para verificar a atividade tóxica a Caenorhabditis elegans, e posteriormente contra J2 de M. incognita, em laboratório e em casa de vegetação. Também foram testados quatro produtos biológicos (Onix, Rizos, NemaControl e Nemix) e carbofuran – (Furadan 350 SC) para o controle de M. incognita em casa vegetação. Para isso, foi instalado um ensaio em delineamento inteiramente casualizado com seis repetições por tratamento e uma planta por vaso. Foram inoculados os ovos e eventuais J2 do nematoide, 20 dias após a emergência das plantas e as seguintes variáveis foram avaliadas: altura (cm), peso fresco da parte aérea (g), peso seco da parte aérea (g), peso fresco de raiz (g), peso seco de raiz (g) e fator de reprodução (FR). Para a histopatologia, foi selecionado o produto Onix (Bacillus methylotrophicus) inoculado em sementes de algodão. Vinte dias após a emergência das plântulas foi inoculada uma suspensão de J2 de M. incognita. As avaliações foram realizadas entre 2 e 45 dias após a inoculação, com o cálculo de fator de reprodução, acompanhamento da penetração de J2 durante os 12 primeiros dias após a inoculação dos nematoides e cortes histopatológicos da raiz para acompanhar o desenvolvimento do parasita. Para a realização dos ensaios de seleção de Bacillus contra Fov, foi realizada uma seleção prévia do meio de cultura, onde diferentes concentrações de meio EMBRAPA e meio BDA foram avaliadas. Nos testes de antagonismo, foi proposta uma escala de notas para facilitar as avaliações, onde com os testes e o auxilio da escala foram avaliados 178 isolados de Bacillus e selecionadas 13 estirpes para os ensaios de metabólitos solúveis em água e metabólitos voláteis. Por fim, foi realizado um teste em casa de vegetação para avaliar a eficiência dos isolados selecionados in vitro, onde as sementes de algodão foram sanitizadas, microbiolizadas com micélio e esporo de Fov colocadas em bandejas com substrato, inoculadas com os tratamentos e conduzidas em casa de vegetação por 25 d. Quatro estirpes de B. thuringiensis tóxicas a C. elegans também apresentaram atividade de controle in vivo sobre M. incognita; o produto Onix reduziu aproximadamente 50% o FR de M. incognita; para os testes de antagonismo contra Fov, as estirpes de Bacillus, GF267, S1301, S1823, S1967, S2535 e S2536 foram selecionadas. / Cotton crop is one of the most cultivated arround the world. The brazilian cotton production has grown, occupying 5th place among the world's producers and 3rd as exporter. Brazil presents the highest average production per cultivated area (~5t/ha) in non-irrigated land in the world. Pests and diseases can compromise the productivity. Thus, two diseases highlight: root-knot nematode (Meloidogyne incognita races 3 e 4) and Fusarium-wilt (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum). These pathogens can be destructive to the plant, both singly as in association. The difficulty of making an efficient control, is due to the ability of the pathogens to infect a wide range of hosts and to have great persistence in soil, making difficult to control through cultural practices as the crop rotation and even the use of chemical treatments. The search for alternatives such as the use of Bacillus sp. in the control of plant diseases is justified. Thus, the overall objective of this work was to select and characterize strains of Bacillus antagonists to M. incognita and F. oxysporum f. sp. vasinfectum (Fov). For that, initialy an in vitro trial was conducted with 11 strains of Bacillus thuringiensis to evaluate their toxic activity to Caenorhabditis elegans, and later against J2 juvenilles of M. incognita, in laboratory conditions and under greenhouse. Were also tested four commercial products (Onix, Rizos, NemaControl and Nemix) and carbofuran – (Furadan 350 SC) for the control of M. incognita under greenhouse. This test was conducted in a completly randomized design with six replications per treatment and one plant per pot. Nematode eggs were inoculated, 20 d after emergence of plants and the following plant variables were evaluated: height (cm), shoot fresh weight (g), shoot dry weight (g), fresh root weight (g), root dry weight (g), the reproduction factor (RF). For the histopathological study was selected the product Onix (Bacillus methylotrophicus) inoculated in cotton seeds. Twenty days after cotton seed germination a suspension juvenilles of M. incognita was inoculated. The evaluations was carried out from 2 to 45 d after inoculation. The reproduction fator and penetration of J2 were evaluated and observed by histopathology tissue cuts. For the tests of selection of Bacillus against Fov, a prior selection of culture media was done, where different concentrations of culture medium EMBRAPA and BDA were evaluated. In tests of antagonism 178 isolates of Bacillus have been tested and 13 strains were selected for water-soluble metabolites and volatile metabolites. Finally, a greenhouse test was conducted to evaluate the efficiency of in vitro selected isolates, where the cotton seeds were inoculated with Fov and antagonists, and, cultivated under greenhouse for 25 d. Four strains of B. thuringiensis toxic to C. elegans also in vivo controled M. incognita; the product ‘Onix’ reduced around 50% of RF for M. incognita; in tests of antagonism against Fov, the strains of Bacillus, GF267, S1301, S1823, S1967, S2535 e S2536 were selected.