Made available in DSpace on 2015-10-06T13:02:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-19. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:19:26Z : No. of bitstreams: 1 000849134_20170101.pdf: 429152 bytes, checksum: abd1abadcca0b3fa8264300bc2c7ad0a (MD5) Bitstreams deleted on 2017-01-02T15:03:47Z: 000849134_20170101.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-01-02T15:05:06Z : No. of bitstreams: 1 000849134.pdf: 2667968 bytes, checksum: 472c913350f7049ae593ecc260ae5639 (MD5) / A bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc) é o agente causal do cancro cítrico, uma doença que afeta quase todos os tipos de culturas de citros. A produção de determinados fatores de patogenicidade em Xcc é regulado por um grupo de genes chamados rpf, que codificam elementos de um sistema de comunicação célulaFcélula chamada de quórum sensing (QS), mediado por moléculas da família do fator difusível de sinal (DSF). A interferência com a sinalização célulaFcélula, também denominado quórum quenching, seja por degradação do sinal ou excesso de produção tem sido sugerido como estratégia para controlar doenças bacterianas. Nesse estudo, foram isoladas três cepas provenientes de folhas de citros que apresentaram alta capacidade de perturbar a sinalização QS em Xcc. Ensaios de patogenicidade em laranja doce (Citrus sinensis (L.) Osbeck) mostraram que as bactérias pertencentes ao gênero Pseudomonas e Bacillus têm forte capacidade de reduzir a severidade da doença. Estes efeitos foram associados a alteração na aderência bacteriana e a formação de biofilme, fatores que são conhecidos por contribuir para a virulência de Xcc. Essas bactérias quórumFquenching podem ser um instrumento extremamente útil para o processo de controle biológico e oferecer uma alternativa para o tratamento tradicional de cobre, atualmente utilizado para o tratamento do cancro cítrico / The bacterium Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc) is the causal agent of citrus canker, a disease that affects almost all types of citrus crops. The production of particular pathogenicity factors in Xcc is controlled by a cluster of genes named rpf, which encode elements of cellFcell communication system called Quorum Sensing (QS), mediated by molecules of the Diffusible Signal Factor (DSF) family. Interference with cellFcell signaling, also termed quorum quenching, either by signal degradation or overFproduction has been suggested as strategy to control bacterial disease. In this study, we isolated three bacterial strains from citrus leaves that displayed a high ability to disrupt QS signaling in Xcc. Pathogenicity assays in sweet orange (Citrus sinensis (L.) Osbeck) showed that bacteria belonging to the genera Pseudomonas and Bacillus also have a strong ability to reduce the severity of citrus canker disease. These effects were associated with alteration in bacterial attachment and biofilm formation, factors that are known to contribute to Xcc virulence. These quorumFquenching bacteria may represent a highly valuable tool in the process of biological control and offer an alternative to the traditional copper treatment currently used for the treatment of citrus canker disease

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:23:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-13. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:30:01Z : No. of bitstreams: 1 000851960_20160101.pdf: 357482 bytes, checksum: ae9894ea91df158c3f254d8712309980 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-01-04T10:26:50Z: 000851960_20160101.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-04T10:28:39Z : No. of bitstreams: 1 000851960.pdf: 1986629 bytes, checksum: fd2eda9f5c5da698a200b6313ee03909 (MD5) / A indução de supressividade a Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc) em bananeira por meio de produtos orgânicos foi avaliada pela incorporação ao solo, artificialmente infestado com o patógeno, de biocarvão de serragem de Eucalyptus (BC), casca de camarão (CC), composto de lodo de esgoto (LE), concha de marisco (CM), bio-óleo de casca de arroz (BA) e de serragem de Eucalyptus (BE), emulsão (EP) e hidrolisado de peixe (HP). Características químicas do solo; área abaixo da curva de progresso do índice da doença (AACPID); severidade final; descoloração interna do rizoma; respiração microbiana por meio da liberação de CO2; comunidade de F. oxysporum, fungos e bactérias totais; a inibição do crescimento micelial e da germinação de microconídios pelos extratos aquosos e pela liberação de compostos voláteis tóxicos foram os parâmetros avaliados. A CC e o LE reduziram a severidade externa (50 e 37%, respectivamente) e a descoloração interna do rizoma (56 e 36%, respectivamente). As CC e CM reduziram o desenvolvimento das plantas nas fases iniciais de cultivo, mostrando sintomas de fitotoxicidade. A elevação do pH, condutividade elétrica (CE), K, Mg, S, Na, Fe, Zn, CO2 e comunidade de bactérias foram as características que apresentaram maior influência na redução da severidade, enquanto que o aumento no pH, CE, CO2, P, Ca, S, Na e B também contribuíram para reduzir a população de F. oxysporum no solo. O BA, o BE e o HP reduziram em 94, 84 e 40% a AACPID, respectivamente. Os teores de Zn, a inibição do crescimento micelial e inibição da germinação dos microconídios pela ação de compostos voláteis e de extratos aquosos foram os mecanismos que mais explicaram o controle ... / The induction of suppressiveness to Fusarium wilt in banana by the incorporation of Eucalyptus sawdust biochar (BC), shrimp shells (CC), composted sewage sludge (LE), clamshell (CM), bio-oil of rice husk (BA) and bio-oil of Eucalyptus sawdust (BE), fish emulsion (EP) and fish hydrolyzate (HP) to soil was evaluated. Soil chemical characteristics; the area under the curve of progress of the disease index (AUPCDI), final severity and internal discoloration of the rhizome; microbial respiration through the release of CO2; the populations of F. oxysporum, fungi and total bacteria; and inhibition of mycelial growth and microconidia germination through the compounds volatile toxic and aqueous extracts were the parameters evaluated. The CC and LE reduced final severity (50 and 37%, respectively) and the internal discoloration of the rhizome (56 and 36%, respectively). The incorporation of CC and CM reduced plant development in the early stages of cultivation, showing symptoms of phytotoxicity. The increase in pH, electric ...

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:24:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-31. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:30:13Z : No. of bitstreams: 1 000853211.pdf: 1398658 bytes, checksum: c344bd138e41aaee8de5f99ea0007ff7 (MD5) / O setor florestal tem uma grande importância para a economia brasileira, sendo este, fornecedor de matéria-prima para uso em reflorestamento de áreas degradadas assim como para indústrias como de papel e celulose, carvão, moveleira, entre outras. No entanto para obtenção de bons resultados é necessária a utilização de mudas florestais sadias e livres de doenças. A mancha bacteriana do eucalipto e a mancha causada por Cylindrocladium são duas doenças muito comuns em viveiros e, embora os agentes etiológicos sejam diferentes, seus sintomas são bem parecidos, podendo causar dúvidas em um momento de diagnose. O objetivo do presente trabalho foi desenvolver uma rede neural artificial (RNA) que seja capaz de classificar as duas doenças citadas utilizando imagens digitais. Imagens de ambas doenças foram processadas, utilizando a técnica de limiarização a fim de remover o fundo da imagem, e utilizados seus histogramas para treinamento de uma RNA do tipo perceptron multicamadas com algoritmo backpropagation. Foram realizados dez ensaios com cinco topologias diferentes, sendo elas com 34, 128, 248, 368 e 511 neurônios na camada intermediária. Todas as topologias atingiram em média 95% de acertos, sendo considerada a mais adequada aquela que possuía 256 neurônios. / The forest sector has great importance for the Brazilian economy, whose, is raw materials supplier for reforestation of degraded areas as well as for industries like pulp and paper, coal, furniture, among others. However to achieve good results is necessary to use healthy forest seedlings. Bacterial stain of the eucalyptus and the stain caused by Cylindrocladium are two common diseases in nurseries and although the etiologic agents are different, their symptoms are similar, and may cause doubts in a diagnosis moment. The aim of this study was to develop an artificial neural network (ANN) to classify the two cited diseases using digital images. Images of both diseases were processed using a threshold technique to remove the image background, and their histograms were used to training a multilayer perceptron ANN with backpropagation algorithm. Ten essays with five different topologies ( 34, 128, 248, 368 and 511 neurons in the hidden layer) were carried out. All topologies reached on average 95% of correct classifications. The topology with 256 neurons in hidden layer was considered the most suitable one for this project

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-09-10. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:15Z : No. of bitstreams: 1 000858275.pdf: 2667802 bytes, checksum: 013d2f3ce672b7dc45f5a07fb0084a29 (MD5) / A murcha bacteriana causada por Ralstonia solanacearum (Rs) é uma das principais doenças do tomateiro. Não existe no mercado brasileiro cultivares/híbridos com nível de resistência satisfatório ao patógeno. Os porta-enxertos com resistência são utilizados com finalidade de controlar a murcha bacteriana. O patógeno tem a capacidade de permanecer no solo por muitos anos e com isso, inviabilizar o cultivo. Também influenciam nas trocas gasosas, na atividade das enzimas envolvidas em mecanismos de defesa e na produtividade das plantas afetadas. Diante do exposto, os objetivos do trabalho foram: avaliar a atividade das enzimas superóxido dismutase (SOD), catalase (CAT), peroxidase (POD), polifenoloxidase (PPO) e fenilalanina amônia liase (PAL) como respostas bioquímicas ao estresse relacionado à defesa contra murcha bacteriana em tomateiro; avaliar a eficiência da enxertia no controle da murcha bacteriana; comparar as trocas gasosas das plantas enxertadas e não enxertadas com a doença, e avaliar a produtividade dessas plantas em ambiente protegido infestado com o patógeno. Para isso, conduziram-se três experimentos, sendo dois em casa de vegetação, na Faculdade de Ciências Agronômicas da UNESP - Câmpus de Botucatu, Botucatu - SP e o terceiro em ambiente protegido, na Fazenda Ituaú, no município de Salto - SP. No primeiro experimento, foram avaliadas as atividades enzimáticas (SOD, CAT, POD, PPO e PAL) nas folhas e caule das plantas enxertadas e não enxertadas, inoculadas com Rs em nove coletas que foram realizadas às 0, 12, 24, 48, 72, 96, 120, 144 e 288 horas após a inoculação. No segundo, avaliou-se a incidência da murcha bacteriana com 0, 5, 10, 15 e 20 dias após inoculação (DAI) e trocas gasosas com 0, 3, 6, 9 e 12 DAI em plantas enxertadas e não enxertadas inoculadas com Rs. No terceiro experimento, foi avaliada a incidência da murcha bacteriana aos 10, 20, 30, 40, ... / Bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum (Rs) is one of major disease on tomato. There is no market cultivars / commercial hybrids resistant to the pathogen. Rootstocks with resistance are used in order to control bacterial wilt (BW). The pathogen can survive in the soil for many years. Also, to influence gas exchange, in the activity of enzymes involved in defense mechanisms and productivity of the affected plants. The above, the objectives of the study were to evaluate the activity of the enzymes superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT), peroxidase (POD), polyphenol oxidase (PPO) and phenylalanine ammonia lyase (PAL) as biochemical stress responses related to defense against bacterial wilt in tomato; evaluate the efficiency of grafting to control bacterial wilt; compare gas exchange of grafted and not grafted plants inoculated with BW and also check the productivity of these plants in plastic house with the pathogen. Three trial were conducted, two in a plastic house at the Faculty of Agricultural Sciences of Botucatu UNESP, and the third in a protected environment in Ituaú Farm in the Salto city. In the first trial, we evaluated the enzymatic activities (SOD, CAT, POD, PPO and PAL) in the leaves and stems of grafted and not grafted plants, inoculated with Rs in nine samples that were performed at 0, 12, 24, 48, 72, 96, 120, 144 and 288 hours after inoculation. In the second, we evaluated the incidence of bacterial wilt with 0, 5, 10, 15 and 20 days after inoculation (DAI) and gas exchange with 0, 3, 6, 9 and 12 DAI on grafted and not grafted plants inoculated with Rs . The third trial it was evaluated the incidence of bacterial wilt at 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70 and 80 days after transplantat in grafted plants on three different rootstocks and non grafted plants at soil naturally infested with Rs. Based on the results were concluded: The enzymes SOD, CAT and PAL, to the leaves, and SOD, ...

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-31. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:24:03Z : No. of bitstreams: 1 000858683.pdf: 793575 bytes, checksum: f6a1e421e872f385ab4f216d57cddd8e (MD5) / O presente estudo objetivou avaliar o efeito da temperatura sobre as características biológicas de Euschistus heros em três gerações sucessivas. Foram utilizadas seis temperaturas constantes (19ºC, 22ºC, 25ºC, 28ºC, 31ºC e 34ºC ± 1°C), quatro temperaturas flutuantes (diurno:noturna) (25:21ºC, 28:24ºC, 31:27ºC, 34:30ºC ± 1°C) e umidade relativa 70 ± 10% em todos os tratamentos. Cada temperatura teve seis repetições de 20 indivíduos cada. A avaliação do estádio ninfal foi diária e posteriormente na fase adulta foram separados por sexo e avaliados o peso (mg) e a largura do pronoto (mm) dos indivíduos. Após a formação de casais, e realizou a coleta de ovos para avaliar o período de pré-oviposição, número total de ovos e viabilidade de ovos. Foi verificado que o aumento da temperatura ocasionou a redução da duração dos estádios ninfais de E. heros. A menor temperatura constante (19°C), além de prolongar o estádio ninfal do inseto, não houve sobreviventes para as próximas gerações, sendo que foi avaliado por três gerações sucessivas. A temperatura constante do extremo superior (34°C) não influenciou a viabilidade ninfal de E. heros, porém, reduziu a longevidade dos indivíduos adultos. Nas temperaturas flutuantes, a viabilidade ninfal não diferiu entre os tratamentos. No entanto, todas foram superiores em relação à constante de 19°C. Porém, as temperaturas extremas, de 19°C e 34°C o desenvolvimento dos insetos não foi adequado, por isto não houve gerações seguintes. Contudo, o presente trabalho demonstrou que o aumento da temperatura, a partir de 22ºC até o limite de 28°C, favorece a biologia de E. heros / This study aimed to evaluate the temperature on the biological aspects of Euschistus heros during three successive generations. Six constant temperatures were used (19ºC, 22ºC, 25ºC, 28ºC, 31ºC and 34ºC ± 1°C), four floating temperatures (day:night) (25:21 ° C, 28:24 ° C, 31:27 ° C, 34:30 ° C ± 1°C) and relative humidity 70 ± 10% in all treatments. Each temperature had six replications of 20 individuals each. The evaluation of the nymphal stages was daily and later, adults were separated by sex and the weight (mg) and the pronotum (mm) of individuals were evaluated. After the formation of couples, eggs were collected the preoviposition period, total number of eggs and egg viability. The increase in temperature caused reduction in the duration of nymphal stages of E. heros. The smallest constant temperature (19°C), increased the period of insect nymphal stages and there was no survivors for the next generations, and was evaluated by three successive generations. The constant temperature of the upper end (34°C) did not influence the nymphal viability of E. heros, however, reduced the adults longevity. In floating temperatures, the nymphal viability did not differ between treatments; however all were higher than the constant 19°C. The extremes temperatures of 19°C and 34°C the development of insects were not suitable, so there were no subsequent generations. This study showed that the increased temperature from 22°C to a maximum of 28°C favored the E. heros biology.

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-09-18. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:24:48Z : No. of bitstreams: 1 000858302.pdf: 1171602 bytes, checksum: 83b00e17e8cad0c7e01be25be9cf14b7 (MD5) / O objetivo do trabalho foi avaliar produtos alternativos, considerados naturais, como a quitosana e óleos essenciais, no controle pós-colheita da antracnose em abacates 'Breda' e 'Hass'. Foram extraídos dez óleos essenciais de plantas e avaliados, inicialmente, quanto ao potencial antifúngico contra o Colletotrichum gloeosporioides in vitro. Dentre os óleos testados, os de Thymus vulgaris, Lippia sidoides e Cymbopogon citratus foram selecionados pelos seus destacados efeitos inibitórios. Na etapa in vitro foram realizados quatro experimentos, em que foram testados concentrações de quitosana e os óleos, utilizando seis repetições por tratamento. Na etapa in vivo, foram realizados cinco experimentos em que abacates 'Breda' e 'Hass' foram imersos, por 1 minuto, em concentrações de quitosana, e abacates 'Hass' imersos em três concentrações de cada óleo essencial associado a cera comercial. Após a secagem e formação dos revestimentos, os frutos foram armazenados a 22± 2 ºC e 65± 5% UR por 7 dias, para os abacates 'Breda', e a 12± 2 ºC e 80± 5% UR por 14 dias, e por mais 3 dias em temperatura de 22± 2 ºC e 65± 5% UR, para o 'Hass'. Para a análise de variância dos dados, foi conduzido o teste F, e as médias foram comparadas pelo teste de Tukey (P≤0,05). O uso de quitosana a partir da concentração de 1,0% inibe o crescimento micelial e a germinação de conídios de C. gloeosporioides in vitro, e quando aplicada em abacates 'Breda' a 1,0%, e em abacates 'Hass' a 2,0%, é eficiente na redução dos sintomas e da incidência da antracnose nos frutos, e na manutenção da qualidade dos mesmos. Os óleos de tomilho (T. vulgaris) e de alecrim-pimenta (L. sidoides), nas concentrações a partir de 200 μL L-1, inibiem o crescimento micelial e a germinação conidial de C. gloeosporioides, enquanto que as concentrações de 500 e 1000 μL L-1 dos óleos associados à cera de... / This study aimed at evaluating alternative natural products, such as chitosan and essential oils, to control anthracnose in postharvest of 'Breda' and 'Hass' avocados. Ten plant-extracted essential oils were assessed regarding their initial antifungal potential against Colletotrichum gloeosporioides in vitro. Thymus vulgaris, Lippia sidoides and Cymbopogon citratus were selected among the oils for their outstanding inhibitory effects. Four experiments were performed in an in vitro stage, in which concentrations of chitosan and oils were tested in six replicates for each treatment. Then, five experiments were set in an in vivo stage, where in 'Breda' and 'Hass' avocados were immersed in different chitosan concentrations for 1 minute, as well as 'Hass' avocados were dipped in three concentrations of each essential oil associated with commercial wax. After drying and covering, 'Breda' avocados were stored at 22± 2 °C under 65± 5% RH for 7 days; and 'Hass' fruit were kept at 12± 2 ° C and 80 ± 5% RH for 14 days, then for more 3 days at 22 ± 2 °C and 65± 5%. Data underwent F test for variance analysis and means were compared by Tukey test (P≤0.05). Chitosan from 1.0% inhibits C. gloeosporioides mycelial growth and spore germination. The use of 1.0% chitosan in 'Breda' variety and at 2.0% in 'Hass' fruit, is effective in reducing of symptoms and incidence of anthracnose in the fruit, and also maintenance of quality. The thymol (T. vulgaris) and rosemary pepper (L. sidoides) oils from 200 μL L-1, inhibit mycelial growth, while concentrations of 500 and 1000 μL L-1 of oils with carnauba wax are more effective in reducing of symptoms of anthracnose, and by maintaining fruit quality of 'Hass' avocados

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:21:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-09-03. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:25:05Z : No. of bitstreams: 1 000858281.pdf: 1201599 bytes, checksum: 31f0c505bf12e3a3d2d007d7337a28a8 (MD5) / O objetivo deste trabalho foi verificar se o fungicida Fluxapiroxade também exerce os efeitos fisiológicos que a Boscalida e a Piraclostrobina. Estas estrobilurinas e carboxamidas atuam no metabolismo e desenvolvimento das plantas, bem como no aumento da produção e qualidade dos frutos de tomate (Solanum lycopersicum L.) híbrido Conquistador (SAKATA, 2015), em condições de ambiente protegido. O experimento foi conduzido em área experimental da Faculdade de Ciências Agronômicas da Universidade Estadual Paulista, Campus de Botucatu-SP. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso, em plantas de tomate com 5 tratamentos com fungicidas: testemunha, azoxistrobina (75g ha-1), boscalida (75g ha-1), piraclostrobina (75 g ha-1), fluxapiroxade (75g ha-1) e a formulação de fluxapiroxade (50g ha-1) + piraclostrobina (100 g ha-1). Foram realizadas 6 aplicações a intervalos de 7 dias, sendo a primeira aplicação realizada 3 dias após o transplante. O efeito dos tratamentos foi avaliado através das observações das seguintes características: produção e massa média do fruto, trocas gasosas, índice de clorofila nas folhas e atividade das enzimas peroxidase, superóxido dismutase, catalase e nitrato redutase. Os resultados obtidos, demonstram que os fungicidas testados apresentam efeitos fisiológicos positivos nas plantas de tomate cultivadas em ambiente protegido, pois aumentaram a produção de frutos, a atividade da enzima nitrato redutase, a atividade do sistema antioxidativo e o índice de clorofila, sendo que esses efeitos ficaram mais evidentes nas plantas tratadas com a piraclostrobina, boscalida e fluxapiroxade. / This experiment has the purpose to study the physiological effects of strobilurine and carboxamides in metabolism and development of plants, as increased production and fruit quality of hybrid Conquistador tomato (Solanum lycopersicum L.) in greenhouse conditions. This experiment was conduct in an experimental field of the School of Agronomical Sciences at the Universidade Estadual Paulista, Botucatu-SP Campus. The experimental design consisted in randomized blocks in tomato plants with 5 fungicide treatments: control, azoxystrobin (75 g ha-1), boscalid (75g ha-1), pyraclostrobin (75 g ha-1), fluxapyroxad (75g ha-1) and the formulation with fluxapyroxad (50g ha-1) + pyraclostrobin (100 g ha-1), 6 applications with 7 days intervals, the first being 3 days after transplantation. The effect of the treatments were evaluated through observation of the following characteristics: production of fruits and fruit weight, gas exchange, chlorophyll content in leaves and activity of peroxidase, superoxide dismutase, catalase and nitrate reductase. According to the obtain results, it is conclude that the fungicides have positive physiological effects on tomato plants grown in greenhouse conditions, which increased fruit production, the activity of the enzyme nitrate reductase, and the activity of the antioxidant system and chlorophyll index, and these effects were more evident in plants treated with pyraclostrobin, boscalida and fluxapyroxad.

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:21:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-24. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:25:11Z : No. of bitstreams: 1 000858793.pdf: 4733869 bytes, checksum: 5bf1ccc788ea3ad1378e0db67d912463 (MD5) / O gênero Allium inclui espécies de importância para o consumo humano como o alho, cebola e espécies ornamentais. Algumas destas espécies por serem propagadas vegetativamente, podem ser infectadas por vírus pertencentes aos gêneros Allexivirus, Carlavirus e Potyvirus, frequentemente em infecções mistas. Leek yellow stripe virus (LYSV) pertence ao gênero Potyvirus e é considerada a espécie de maior importância na cultura do alho, de modo que foi sequenciado o genoma completo de um isolado de LYSV brasileiro (LYSV-MG) e avaliada sua diversidade genética. Seu genoma possui 10.341 nucleotídeos e codifica uma poliproteína de 3221 aminoácidos. Baseado na análise da região codificadora para a proteína P1, o isolado LYSV-MG, bem como demais coletados em regiões produtoras de alho, não foram classificados como pertencentes aos grupos S e N. Os isolados brasileiros apesar de não apresentarem a deleção na região da P1 (típica do grupo S), formaram um grupo monofilético muito próximo deste grupo e de um isolado de Okinawa, Japão. Em relação ao gene P1, os isolados brasileiros compartilharam 97-99% de identidade de nucleotídeos entre si e 51-64% com isolados de LYSV de outros países. Os dados sugerem que os isolados brasileiros de LYSV, o isolado de Okinawa e os isolados pertencentes ao grupo S podem ser provenientes de um ancestral comum antes da ocorrência da deleção na P1 e divergência dos isolados no grupo S. Como parte do doutoramento sanduíche, realizado na United States Department of Agriculture, sob orientação do Dr. John Hammond, foram estudados os vírus presentes em quatorze diferentes espécies de Allium ornamental nos Estados Unidos. As plantas foram adquiridas em floriculturas e plantadas a campo no outono de 2013 na região de Beltsville, MD. Folhas sintomáticas foram coletadas após a floração durante a primavera de 2014 e avaliadas por PCR usando primers ... / The genus Allium includes important species used for human consumption, as garlic,onion and many other species grown as ornamentals. Some of these species are propagated vegetatively and can be infected by viruses belonging to the genera Allexivirus, Carlavirus and Potyvirus, often in mixed infections. Leek yellow stripe virus (LYSV) belongs to the genus Potyvirus and is considered the most important virus in Allium species. The complete genomic sequence of Leek yellow stripe virus garlic isolate from Brazil (LYSV-MG) has been determined. The LYSV-MG genome consists of 10,341 nucleotides and encodes a deduced polyprotein of 3,221 amino acids. Based on the analysis of the coding region for P1 protein, isolate LYSV-MG and others collected in garlic producing regions, could not be classified as belonging to the groups S and N. Brazilian isolates do not have the deletion present in the P1 from the S-type group but are more closely related to S-type than to N-type isolates. The Brazilian isolates formed a monophyletic group closer to S-type and one isolate from Okinawa, Japan. Brazilian isolates share 97-99% of P1 region nucleotide identity with each other, and 51-64% with different isolates from around the world. The data suggest that Brazilian LYSV isolates are derived from an ancestral source of the Okinawa and S-type isolates, prior to the P1 deletion and divergence in the S-type isolates. As part of the doctorate sandwich in United States Department of Agriculture, under the supervision of Dr. John Hammond, viruses present in ornamental Allium from Beltsville, MD were detected. Bulbs of fourteen different species of Allium were purchased from retail nurseries and planted in the field during the fall of 2013. Leaf tissue from the flowering symptomatic plants were collected during spring 2014, and tested by PCR using generic primers for the genus Allexivirus, Carlavirus and Potyvirus. PCR-positive ...

Made available in DSpace on 2016-04-01T17:55:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-04. Added 1 bitstream(s) on 2016-04-01T18:00:45Z : No. of bitstreams: 1 000860186_20160804.pdf: 237722 bytes, checksum: 99252673c7b9a303744a1706fa82e67b (MD5) Bitstreams deleted on 2016-08-05T12:20:24Z: 000860186_20160804.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-05T12:20:59Z : No. of bitstreams: 1 000860186.pdf: 1059222 bytes, checksum: e6bebf67ecb2875c260948e57fba3979 (MD5) / A produção de laranja e de suco concentrado é uma atividade agrícola que tem uma grande importância para o Brasil, em especial para o estado de São Paulo. Entretanto, o cancro cítrico é uma doença que causa grandes prejuízos à citricultura brasileira e mundial, sendo que até o momento não há nenhum método curativo para esta doença e o principal controle é a erradicação das plantas contaminadas. O cancro cítrico é originário da Ásia e tem como agente causal a bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (Xac), a qual ataca todas as espécies comerciais de citros. Em um estudo de expressão gênica em dois mutantes de Xac que apresentavam diminuição ou ausência total de sintomas de cancro cítrico, a proteína XAC1008 se mostrou altamente expressa, pelo que o objetivo deste trabalho foi a caracterização funcional da ORF XAC1008 de Xac. A estratégia utilizada foi a produção de um mutante desta ORF e avaliação da sua patogenicidade quando comparada com a do isolado 306 de Xac selvagem em plantas de limão 'Cravo' (Citrus limonia Osbek) e laranja Pêra (Citrus sinensis (L.) Osbeck). A técnica utilizada para a obtenção do mutante foi a da mutagênese sítio-dirigida por PCR utilizando o vetor suicida pOK1, seguida de recombinação homóloga. Os ensaios de patogenicidade do mutante ΔXAC1008 mostraram que a mutação alterou a coloração e o formato das colônias e impediu a multiplicação da bactéria in planta, embora ela ainda seja capaz de crescer em meio de cultura. O mutante diminuiu de maneira significativa a formação de biofilme e não foi capaz de causar doença em laranja 'Pêra Rio' (Citrus sinensis (L.) Osbeck) e em limão 'Cravo' (Citrus limonia Osbek), dois de seus hospedeiros citros, enquanto que a Xac 306 selvagem apresentou os sintomas característicos do cancro cítrico nos dois hospedeiros. Os resultados indicam que a proteína XAC1008 não está diretamente relacionada... / The production of frozen concentrated juice from sweet orange is an agricultural activity that is of great importance to Brazil, especially for the state of São Paulo. However, citrus canker is a disease that causes bigger losses to the Brazilian and global citrus industry, and to date there is no curative method for this disease and the main control is the eradication of infected plants. The citrus canker originated in Asia and its causal agent is the bacterium Xanthomonas citri subsp. citri (Xac), which attacks all commercial species of citrus. In a study of gene expression in two Xac mutants with impaired or total absence of symptoms of citrus canker, the ORF XAC1008 was highly expressed, so the aim of this study was the functional characterization of the protein encoded by ORF XAC1008 from Xac. The strategy used was the construction of a mutant of the ORF XAC XAC1008 and evaluation of its pathogenicity in plants of Rangpur lime (Citrus limonia Osbek) and sweet orange 'Pêra Rio' (Citrus sinensis (L.) Osbeck) compared with the wild isolate strain Xac 306. The technique used for obtaining the mutant was PCR-based site-directed mutagenesis using the suicide vector POK1, followed by homologous recombination. Pathogenicity tests of the mutant ΔXAC1008 showed that the mutation affected the color and shape of colonies, and prevent multiplication of bacteria in the plant, though it is still able to grow in the culture medium. The mutant decreased significantly biofilm formation and was not able to cause disease in sweet orange 'Pêra Rio' orange and Rangpur lime, two of its citrus hosts, while the wild isolate strain Xac 306 showed the characteristic symptoms of citrus canker in both hosts. The results indicate that the protein XAC1008 is not directly related to the virulence or pathogenicity of Xac in citrus but is essential for the proliferation and survival of the bacteria in the host. Although the presence of the ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-29Bitstream added on 2014-06-13T20:52:57Z : No. of bitstreams: 1 magalhaes_go_me_jabo.pdf: 351698 bytes, checksum: 134ffda669c0dc4290a262561a93ec92 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo do trabalho foi avaliar a influência do produto comercial a base de Bacillus thuringiensis Agree® e do isolado HD1 em aspectos biológicos do predador Podisus nigrispinus alimentado com lagartas de Plutella xylostella que ingeriram folhas de couve imersas em suspensão de B. thuringiensis; quantificar a frequência alimentar do predador em folhas de couve (fitofagia); e construir a tabela de vida de fertilidade. Os predadores tiveram contato com B. thuringiensis durante todo o seu ciclo de vida pela ingestão da presa contaminada ou ingestão direta da suspensão do isolado HD1 ou do produto comercial Agree® na couve. O experimento foi composto por seis tratamentos: T1: suspensão de HD1 + lagartas de P. xylostella infectada com o isolado HD-1; T2: suspensão de Agree® + lagartas de P. xylostella infectada com o produto comercial Agree®; T3: água destilada + lagartas de P. xylostella; T4: suspensão de HD1; T5: suspensão de Agree®; T6: água destilada. A calda do bioinseticida Agree® (B. thuringiensis var. aizawai + kurstaki) foi utilizada na concentração recomendada pelo fabricante (0,5g /333mL) e o isolado HD1 (B. thuringiensis var. kurstaki) foi empregado na concentração de 3x108 esporos/mL. O desenvolvimento das ninfas foi acompanhado até a fase adulta obtendo-se a duração e a viabilidade dos diferentes ínstares, período de pré-oviposição, oviposição, pós-oviposição, número de posturas por fêmea, número de ovos por postura e fecundidade. Os ovos obtidos foram coletados para determinação do período de incubação e viabilidade. Todos os tratamentos receberam uma folha de couve manteiga variedade Geórgia, que foram substituídas a cada dois dias e submetidas ao teste de coloração por imersão em solução de fucsina ácida a 1%, por 12 horas, para posterior contagem de bainhas alimentares ao estereomicroscópio... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo / The aim of the work was to evaluate the influence of Bacillus thuringiensis based product Agree® and the isolate HD1 in the biological characteristics of the predator Podisus nigrispinus fed on Plutella xylostella caterpillars that ingested collard greens leaves sprayed with the product and quantify the frequency of predator feeding on the leaves (phytophagy), made by counting the pucturas with the aid of dye-based 1% acid fuchsin. The predators were kept in contact to B. thuringiensis during the whole life cycle by the ingestion of contaminated prey or direct ingestion of the suspension of the HD1 strain or Agree®. The essay was composed of 6 treatments: T1: HD1 suspension + P. xylostella caterpillars; T2: Agree® suspension + P. xylostella caterpillars; T3: Distilled water + P. xylostella caterpillars; T4: HD1 suspension; T5: Agree® suspension; T6: water. The solution of bioinsecticide Agree® (B. thuringiensis var. aizawai + kurstaki) was used following the recommended concentration of the manufacturer (0,5g /333mL) and the HD1 strain (B. thuringiensis var. kurstaki) was used in the concentration of 3x108 spores/mL. The development of nymphs was observed until the adult phase to obtain the duration and viability of the different instars, pre-oviposition, oviposition and post-oviposition periods, number of egg mass per female, number of eggs per egg mass and fecundity. The obtained eggs were collected to determine the incubation period and viability. All treatments were given a sheet kale Georgia, which was replaced every two days and tested with coloration by immersion in Fucsin acid (1%) for 12 h and then count the food sheaths in a stereomicroscope. The results allowed concluding that P. nigrispinus and B. thuringiensis can be used together to control P. xylostella in collard crops; the presence of preys, collard ... (Complete abstract click electronic access below)