Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-01-12T14:55:44Z No. of bitstreams: 1 640136.pdf: 6047205 bytes, checksum: e906040cd794ff627ad903b9aad4e479 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-12T14:55:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 640136.pdf: 6047205 bytes, checksum: e906040cd794ff627ad903b9aad4e479 (MD5) Previous issue date: 2005-04-23 / Foram analisados parâmetros relacionados à estratégia de vida (biologia reprodutiva e crescimento pós-natal) em populações naturais e em colônias estabelecidas em cativeiro, de duas espécies de roedores sulamericanos do gênero Thrichomys (Caviomorpha: Echimyidae). T. pachyuros habita o Pantanal, enquanto T apereoides laurentius é comum em habitats rochosos na Caatinga. Ambas espécies são hospedeiros naturais de Trypanosoma cruzi, agente da doença de Chagas, e podem servir como modelos experimentais em diversos estudos parasitológicos. Foram estabelecidas colônias destas espécies. Ambas espécies são facilmente mantidas em condições de laboratório e se reproduzem durante o ano todo. Não necessitam de nenhuma dieta especial e adaptaram-se bem à ração padronizada para camundongos. Os filhotes são precoces ao nascer, possuindo olhos e ouvidos abrt0s, incisivos já expostos, corpo coberto de pêlos, e na primeira semana de vida já conseguem roer alimentos sólidos. o gênero Thrichomys foi c0nsiderado monoespecífico durante muito tempo, porém recentes estudos constataram variação cromossômica, molecular e morfométrica, entre populações. Neste estudo foram encontradas diferenças significativas entre as espécies nos parâmetros de crescimento e em vários parâmetros reprodutivos (tamanho de ninhadas, peso no nascimento e no desmame, maturação sexual). T apereoides laurentius vive em um ambiente semiárido e possui um alto potencial reprodutivo. Suas ninhadas são maiores, o peso dos filhotes no nascimento é menor e a taxa de crescimento é maior do que T pachyuros. As fêmeas de T apereoides laurentius alcançam a maturidade sexual com menor idade e menor peso. Estas diferentes estratégias de cada população estão aparentemente relacionadas às diferentes pressões seletivas presentes nos seus respectivos biomas de origem. / We analyzed life history traits (reproductive biology and postnatal development) in natural populations and in captive-breed colonies of two sibling species of the South American rodeTlt Thrichomys (Caviomorpha: Echimyidae). T pachYlfrus inhabited marshlands of Pantanal, while T apereoides laurelltius lives in very dry rocky habitats in Brazilian Caatinga. Both species are natural hosts of Trypallosoma cruzi, agent of Chagas disease and may serve as experimeutal models in various parasitological studies. We established breeding colonies of these species. They carl be easi!y maintained in the standard laboratory conditions and breed alI over the year. They do not have any special dietary demands and can be fed by standard food pelIets designed for iaboratory mice. They produce precocious offspring that have iheir eyes and ears open, teeth erupted, fur welI developed and can nibble solid food in the first week of life. Previous studies considered the genus Thrichomys as monospecific, however, more recent studies showed cromossomic, molecular and morphometrics vaíiation betwçen populations. In this study we found significant differences between the species in growth rate and several reproductive traits (litter size, body mass at birth and weaning, sexual maturation). T apereoides laurentius, living in harsh environment has a higher reproductive potential. It has larger litter size, smalIer body mass of infants and higher growth rate than T pachyurus. The females of the former species reach sexual maturation earlier and with lower body mass. These differents strategies are apparently related to their different habitats.

ambiente subterrâneo oferece rotas de deslocamento entre pontos de forrageamento ou local de estoque de alimentos e abrigo contra predadores e frio ou calor intensos. Dentre os roedores, cerca de 250 espécies usam o espaço subterrâneo (11%). Algumas dessas espécies são \"subterrâneas estritas\", mas a maioria são \"fossoriais\" em diferentes graus de dependência do subterrâneo, como o Clyomys bishopi que forrageia sobre a terra. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o sistema subterrâneo dessa espécie endêmica do cerrado paulista, e correlacionar com aspectos distais e proximais do comportamento de escavação. No primeiro capítulo, são descritos os sistemas subterrâneos e verificadas suas relações com variáveis ambientais. No segundo, o uso do espaço pela espécie é investigado a partir da dinâmica de abertura das bocas de tocas de sistemas ao longo de dois anos. No terceiro capítulo, a temperatura interna dos sistemas é caracterizada e investigada quanto à sua relação com variáveis ambientais. Finalmente o último capítulo apresenta uma revisão sistemática sobre o uso de sistemas subterrâneos em Rodentia. Os sistemas subterrâneos de C. bishopi são complexos, com diversos túneis, bocas e câmaras de estocagem de sementes e com material de ninho. Os sistemas são maiores e mais profundos na estação seca do que na chuvosa. A espécie abre e fecha as bocas de seus sistemas ao longo do ano, e o maior número de abertura de bocas foi encontrado na estação seca em paisagem aberta, apoiando a hipótese de que os sistemas subterrâneos para a espécie funcionam principalmente como rotas de deslocamento entre áreas de forrageamento, protegidos de predadores. A temperatura apresenta um ciclo circadiano com acrofase após o pôr do sol sem distinção entre as estações climáticas, têm relações com a paisagem em que estão inseridas, sendo menores nas paisagens fechadas e mais elevadas na chuva, com temperatura mais elevada dentro da toca durante a noite e início da manhã. Os hábitos subterrâneos carregam sinais filogenéticos e tem relação com hábitos sociais, interações com o ambiente e a disponibilidade de alimento nos dois sentidos, seja no ganho ou na perda da socialidade. A manutenção da vida social numa espécie e a complexidade dos sistemas relacionam-se também com a maior compactação do solo. A hipótese das relações evolutivas entre a formação de colônias de sistemas subterrâneos, com seus usos e a vida social pode ser testada em trabalhos futuros / The subterranean environment provides displacement routes between foraging points or food storage locations and shelter from predators and intense heat or cold. Among rodents, about 250 species use underground space (11%). Some of these species are strictly subterranean, but most of them are \"fossorial\" in varying degrees of subterranean dependence, such as the Clyomys bishopi that forages above ground. The aim of this study was to characterize the burrow system of this species (that is endemic to cerrado of São Paulo) and to correlate with distal and proximal aspects of the burrowing behavior. In the first chapter, the burrow systems are described and their relationships with environmental variables are verified. In the second, the use of space by the species is investigated from the dynamics of opening and closing burrow systems entrances over two years. In the third chapter, the internal burrow\'s temperature is characterized and it is investigated in relation to the environmental variables. Finally, the last chapter presents a systematic review about the use of burrow systems in Rodentia. Burrow systems of C. bishopi are complex, with several tunnels, entrances and chambers of food storage and nest material. The systems are larger and deeper in the dry season than in the rainy one. The species opens and closes the entrances of its systems throughout the year, and the largest number of entrance openings was found in the dry season that are in open landscape, supporting the hypothesis that this species uses the burrow systems mainly as displacement routes between foraging areas, protected from predators. Temperature exhibits a circadian rhythm with acrophase after sunset without distinction between climatic seasons. This rhythm has relations with the landscape in which they are inserted: smaller in the closed landscapes and more elevated in the rain with higher temperature inside the burrow during night and early in the morning. Subterranean lifestyle carries phylogenetic signals and is related to social habits with interactions between the aridity and the availability of food and sociality on both directions: gain or loss of sociality. Also there are relations soil hardness, burrow\'s complexity and the maintenance of sociality among species. The hypothesis of the evolutionary relationships between the formation of burrow systems colonies with their uses and sociality can be tested in future studies

A estrutura social (ES) de uma espécie está associada à aspectos socio-ecológicos. A linhagem dos Caviomorfos é apontada como um modelo interessante para estudos deste tipo. Os equimídeos são um exemplo de grande diversidade de habitats: possui espécies de Mata Atlância (Trinomys setosus), da Caatinga (T. yonenagae) e fossoriais (Clyomys bishopi). Por isso, escolhemos esses grupos para uma análise intra e interespecífica sobre suas ES, utilizando a abordagem de redes sociais para descrever padrões de associação e interações agonísticas e afliativas. Nosso objetivo foi descrever a superfície da ES de dois grupos de T. setosus, e quatro de C. bishopi em cativeiro. Para tanto, quantificamos parâmetros da ES e avaliamos a relação entre as interações, hierarquia de dominância e as associações espaciais. Avaliamos a dinâmica do grupo usando as distâncias médias interindividuais e o padrão de agregação do grupo. Quantificamos a frequência de vitórias e perdas entre indivíduos em conflitos agonísticos e a frequência de interações afiliativas, através do método todas as ocorrências. As matrizes, índices e redes sociais foram geradas utilizando o software SOCPROG 2.8. Foram encontradas associações preferenciais de curto e longo prazo, em T. setosus, e de curto prazo para Clyomys. Trinomys setosus mostrou altos índices de afiliação, enquanto que em Clyomys houve igual proporção de afiliativos e agonísticos, sendo assim socialmente menos tolerante do que T. setosus reunindo-se apenas para algumas atividades, e as fêmeas são ainda menos tolerantes do que os machos. Sugerimos que a fêmea Meg é dominante sobre os outros, que se organizam em uma hierarquia não linear, mais igualitária e que esta população de T. setosus apresenta níveis de associação, conectividade e interações sociais positivas, semelhantes com T. yonenagae. Quanto ao comportamento reprodutivo, observamos que em T. setosus, há estro pós-parto, como se esperava com base em T. yonenagae e acreditamos haver algum mecanismo de supressão de estro que precisa ser melhor investigado. Três fêmeas engravidaram, cada uma em um momento. Testes genéticos de paternidade realizados indicaram que embora nas gestações de uma das fêmeas (Meg) não houve multipaternidade, ela não escolheu sempre o mesmo macho, e isto sugere uma estratégia de acasalamento promíscua, por parte da fêmea. Os machos de C. bishopi não parecem exercer defesa de parceira sexual nem formação de vínculo após a cópula, sugerindo uma estratégia também promíscua de acasalamento, como em T. setosus. O repertório comportamental para as espécies T. setosus e Clyomys manteve-se semelhante ao de T. yonenagae. Em conclusão, nossos resultados, pioneiros na utilização comparativa de análises de redes sociais, mostram que as espécies apresentam particularidades importantes quanto ao seu comportamento social, mas que são bastante semelhantes em muitos aspectos, o que traz novas perspectivas quanto ao estudo evolutivo e comparativo dessas espécies e também no que diz respeito à manutenção adequada desses animais em cativeiro, considerando condições de bem-estar animal e conservação. / Social structure (SS) of species is associated with socio-ecological aspects and Caviomorpha is pointed as an interesting model for studies of this type. Echimyidae are an example of great diversity of habitats: it has species of Atlantic Rainforest (Trinomys setosus), Caatinga (T. yonenagae) and fossorial (Clyomys bishopi). Therefore, we chose these groups for an intra and interspecific analysis of their SS, using social networks analysis to describe patterns of association, agonistic and affiliative interactions. Our aim was to describe the SS surface of two groups of T. setosus, and four of C. bishopi in captivity. We quantified descriptors parameters and evaluated the relation between interactions, dominance hierarchy and spatial associations through social networks approach. We evaluated group dynamics using the mean interindividual distances and the group aggregation pattern. We quantify frequency of victories and losses between individuals in agonistic conflicts and frequency of affiliative interactions through the all occurrences method. Matrices, indexes and social networks were generated using SOCPROG 2.8 software. Short and long term preferential associations were found in T. setosus, and short term for Clyomys. Trinomys setosus showed high affiliation rates, while Clyomys had an equal proportion of affiliative and agonistic, being thus socially less tolerant than T. setosus, agglomerating only for some activities, and females are even less tolerant than males. We suggest that female Meg is dominant over others, which are organized in a non-linear, more egalitarian hierarchy and this T. setosus population presents levels of association, connectivity, and positive social interactions, similar to T. yonenagae. Regarding reproductive behaviour, in T. setosus, there is postpartum oestrus, as expected based on T. yonenagae, and we regard there is some mechanism of oestrus suppression that must to be investigated. Three females became pregnant, each in a different moment. Genetic tests of paternity performed indicated that although in the pregnancies of unique female (Meg \') there was no multipaternity, not always choose the same male, and this suggests a promiscuous mating strategy on the part of the female. The males of C. bishopi do not seem to exert sexual partner defence or bond formation after copulation, suggesting a promiscuous breeding strategy as in T. setosus. Behavioural repertoire for T. setosus and Clyomys bishopi remained similar to T. yonenagae. In conclusion, our results, which are pioneers in comparative use of social network analysis, presents important peculiarities of species, regarding their social behaviour, although are quite similar in many aspects, which brings new perspectives regarding evolutionary and comparative study of these species and also considering adequate maintenance of animals in captivity, whereas conditions of animal welfare and conservation.

A estrutura social (ES) de uma espécie está associada à aspectos socio-ecológicos. A linhagem dos Caviomorfos é apontada como um modelo interessante para estudos deste tipo. Os equimídeos são um exemplo de grande diversidade de habitats: possui espécies de Mata Atlância (Trinomys setosus), da Caatinga (T. yonenagae) e fossoriais (Clyomys bishopi). Por isso, escolhemos esses grupos para uma análise intra e interespecífica sobre suas ES, utilizando a abordagem de redes sociais para descrever padrões de associação e interações agonísticas e afliativas. Nosso objetivo foi descrever a superfície da ES de dois grupos de T. setosus, e quatro de C. bishopi em cativeiro. Para tanto, quantificamos parâmetros da ES e avaliamos a relação entre as interações, hierarquia de dominância e as associações espaciais. Avaliamos a dinâmica do grupo usando as distâncias médias interindividuais e o padrão de agregação do grupo. Quantificamos a frequência de vitórias e perdas entre indivíduos em conflitos agonísticos e a frequência de interações afiliativas, através do método todas as ocorrências. As matrizes, índices e redes sociais foram geradas utilizando o software SOCPROG 2.8. Foram encontradas associações preferenciais de curto e longo prazo, em T. setosus, e de curto prazo para Clyomys. Trinomys setosus mostrou altos índices de afiliação, enquanto que em Clyomys houve igual proporção de afiliativos e agonísticos, sendo assim socialmente menos tolerante do que T. setosus reunindo-se apenas para algumas atividades, e as fêmeas são ainda menos tolerantes do que os machos. Sugerimos que a fêmea Meg é dominante sobre os outros, que se organizam em uma hierarquia não linear, mais igualitária e que esta população de T. setosus apresenta níveis de associação, conectividade e interações sociais positivas, semelhantes com T. yonenagae. Quanto ao comportamento reprodutivo, observamos que em T. setosus, há estro pós-parto, como se esperava com base em T. yonenagae e acreditamos haver algum mecanismo de supressão de estro que precisa ser melhor investigado. Três fêmeas engravidaram, cada uma em um momento. Testes genéticos de paternidade realizados indicaram que embora nas gestações de uma das fêmeas (Meg) não houve multipaternidade, ela não escolheu sempre o mesmo macho, e isto sugere uma estratégia de acasalamento promíscua, por parte da fêmea. Os machos de C. bishopi não parecem exercer defesa de parceira sexual nem formação de vínculo após a cópula, sugerindo uma estratégia também promíscua de acasalamento, como em T. setosus. O repertório comportamental para as espécies T. setosus e Clyomys manteve-se semelhante ao de T. yonenagae. Em conclusão, nossos resultados, pioneiros na utilização comparativa de análises de redes sociais, mostram que as espécies apresentam particularidades importantes quanto ao seu comportamento social, mas que são bastante semelhantes em muitos aspectos, o que traz novas perspectivas quanto ao estudo evolutivo e comparativo dessas espécies e também no que diz respeito à manutenção adequada desses animais em cativeiro, considerando condições de bem-estar animal e conservação. / Social structure (SS) of species is associated with socio-ecological aspects and Caviomorpha is pointed as an interesting model for studies of this type. Echimyidae are an example of great diversity of habitats: it has species of Atlantic Rainforest (Trinomys setosus), Caatinga (T. yonenagae) and fossorial (Clyomys bishopi). Therefore, we chose these groups for an intra and interspecific analysis of their SS, using social networks analysis to describe patterns of association, agonistic and affiliative interactions. Our aim was to describe the SS surface of two groups of T. setosus, and four of C. bishopi in captivity. We quantified descriptors parameters and evaluated the relation between interactions, dominance hierarchy and spatial associations through social networks approach. We evaluated group dynamics using the mean interindividual distances and the group aggregation pattern. We quantify frequency of victories and losses between individuals in agonistic conflicts and frequency of affiliative interactions through the all occurrences method. Matrices, indexes and social networks were generated using SOCPROG 2.8 software. Short and long term preferential associations were found in T. setosus, and short term for Clyomys. Trinomys setosus showed high affiliation rates, while Clyomys had an equal proportion of affiliative and agonistic, being thus socially less tolerant than T. setosus, agglomerating only for some activities, and females are even less tolerant than males. We suggest that female Meg is dominant over others, which are organized in a non-linear, more egalitarian hierarchy and this T. setosus population presents levels of association, connectivity, and positive social interactions, similar to T. yonenagae. Regarding reproductive behaviour, in T. setosus, there is postpartum oestrus, as expected based on T. yonenagae, and we regard there is some mechanism of oestrus suppression that must to be investigated. Three females became pregnant, each in a different moment. Genetic tests of paternity performed indicated that although in the pregnancies of unique female (Meg \') there was no multipaternity, not always choose the same male, and this suggests a promiscuous mating strategy on the part of the female. The males of C. bishopi do not seem to exert sexual partner defence or bond formation after copulation, suggesting a promiscuous breeding strategy as in T. setosus. Behavioural repertoire for T. setosus and Clyomys bishopi remained similar to T. yonenagae. In conclusion, our results, which are pioneers in comparative use of social network analysis, presents important peculiarities of species, regarding their social behaviour, although are quite similar in many aspects, which brings new perspectives regarding evolutionary and comparative study of these species and also considering adequate maintenance of animals in captivity, whereas conditions of animal welfare and conservation.

Roedores Cricetidae e Echimyidae e marsupiais Didelphidae formam o grupo dos pequenos mamíferos não-voadores das florestas neotropicais, o qual engloba boa parte da diversidade de mamíferos do Brasil, exerce papel ecológico importante na regeneração e dinâmica das florestas, e funciona como indicador de alterações da paisagem e da estrutura local dos habitats. No entanto, a identificação das espécies do grupo é difícil já que a taxonomia é baseada principalmente em caracteres cranianos e cromossômicos, muitas espécies ainda vêm sendo descritas, e faltam listas recentes para muitos biomas e regiões brasileiras. Além disso, apesar de sua importância numérica e ecológica, existe uma carência de informações, e de sínteses e compilações, sobre a diagnose, história natural, distribuição geográfica e ameaças para as espécies deste grupo. Esta dissertação apresenta uma compilação do conhecimento atualmente existente sobre os caracteres diagnósticos, distribuição, uso de habitats e respostas às alterações humanas, dieta, uso do espaço, reprodução e ameaças das espécies de pequenos mamíferos não-voadores de uma das regiões mais ricas da Mata Atlântica, o Planalto Atlântico de São Paulo, encontro entre duas áreas de endemismo adjacentes, que abriga respectivamente cerca de 22 e 32% das espécies de roedores Cricetidae e marsupiais Didelphidae com ocorrência no Brasil. A diagnose das espécie foi baseada na comparação e descrição das mesmas características para todas as espécies, focando principalmente em caracteres externos, passíveis de serem analisadas nos animais vivos e algumas características cranianas e dentárias mais relevantes para os grupos analisados. Já a descrição de características ecológicas foi baseada em extenso banco de dados coletados em 155 sítios com 118.322 armadilhas-noite de esforço no Planalto pelos projetos do Laboratório de Diversidade e Conservação de Mamíferos do Departamento de Zoologia do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, e revisão padronizada da literatura. Para cada uma das 53 espécies, são apresentadas informações sobre: 1- \"Identificação\" que inclui medidas corporais externas (mínimo, máximo e média), um texto de diagnose que descreve características morfológicas externas e cranianas ilustradas em figuras e pranchas, e cariótipo; 2- \"Distribuição\" onde é descrita a distribuição geográfica seguida por informações sobre a ocorrência em biomas e estados brasileiros, e a distribuição e abundância nas matas do Planalto Atlântico de São Paulo; 3- \"História Natural\" onde são descritas a preferência por florestas ou áreas abertas de agricultura, a resposta à fragmentação florestal e regeneração da floresta, a capacidade de ocupar diferentes tipos de ambientes alterados, dieta, hábito, reprodução, uso do espaço e outras informações importantes; e 4- \"Ameaças\" onde se ressalta a presença em listas de espécies ameaçadas estaduais, nacional e internacional e se apresenta uma consideração sobre as ameaçadas sofridas, com base nas informações detalhadas obtidas no Planalto Atlântico de São Paulo. / Rodents from the families Cricetidae and Echimyidae and Didelphidae marsupials represent the non-volant small mammals from Neotropical forests, a group that encompasses much of the diversity of mammals in Brazil, play important ecological roles in forest regeneration and dynamics, and indicates changes in both landscape and local habitat structure. However, species identification is difficult since taxonomy is mainly based on cranial and chromosomal characters, many species are still being described, and recent lists for many biomes and regions are lacking. Moreover, despite their numerical and ecological importance, there is a lack of information, syntheses and compilations on the diagnosis, natural history, distribution and threats to the species of this group. This dissertation presents a compilation of the current knowledge about the diagnostic characters, distribution, habitat use and responses to human disturbances, diet, use of space, reproduction and threats for the non-volant small mammals from one of the richest regions of the Atlantic Forest, the Atlantic Plateau of São Paulo, where two adjacent areas of endemism meet, and which harbors about 22 and 32% of Cricetidae rodents and Didelphidae marsupials occurring in Brazil. Species diagnosis were based on the comparison and description of the same characteristics for all species, focusing mainly on external characters, which can be analyzed in live animals and some dental and cranial features most relevant to the analyzed groups. The description of ecological characteristics was based on an extensive database collected at 155 sites with an effort of 118.322 traps-night by the projects of the Laboratory of Diversity and Conservation of Mammals, Department of Zoology, Institute of Biosciences, University of São Paulo, and a standardized review of the literature. For each of the 53 species, I present information on: 1- \"Identification\" that includes external body measurements (minimum, maximum and mean), a text on diagnosis that describes the external morphological and cranial characteristics illustrated in figures and plates, and karyotype; 2- \"Distribution\" that describes the geographical distribution followed by information on the occurrence in Brazilian biomes and states, and the distribution and abundance in forests of the Atlantic Plateau of São Paulo; 3- \"Natural History\" where the preference for forests or open areas of agriculture, the response to forest fragmentation and regeneration, the ability to occupy different types of altered habitats, diet, habit, reproduction, use of space and other important information are described; and 4- \"Threats\" that highlights the presence in state, national and international lists of endangered species and presents a consideration of the threats, based on the detailed information obtained in the Atlantic Plateau of São Paulo.

Roedores Cricetidae e Echimyidae e marsupiais Didelphidae formam o grupo dos pequenos mamíferos não-voadores das florestas neotropicais, o qual engloba boa parte da diversidade de mamíferos do Brasil, exerce papel ecológico importante na regeneração e dinâmica das florestas, e funciona como indicador de alterações da paisagem e da estrutura local dos habitats. No entanto, a identificação das espécies do grupo é difícil já que a taxonomia é baseada principalmente em caracteres cranianos e cromossômicos, muitas espécies ainda vêm sendo descritas, e faltam listas recentes para muitos biomas e regiões brasileiras. Além disso, apesar de sua importância numérica e ecológica, existe uma carência de informações, e de sínteses e compilações, sobre a diagnose, história natural, distribuição geográfica e ameaças para as espécies deste grupo. Esta dissertação apresenta uma compilação do conhecimento atualmente existente sobre os caracteres diagnósticos, distribuição, uso de habitats e respostas às alterações humanas, dieta, uso do espaço, reprodução e ameaças das espécies de pequenos mamíferos não-voadores de uma das regiões mais ricas da Mata Atlântica, o Planalto Atlântico de São Paulo, encontro entre duas áreas de endemismo adjacentes, que abriga respectivamente cerca de 22 e 32% das espécies de roedores Cricetidae e marsupiais Didelphidae com ocorrência no Brasil. A diagnose das espécie foi baseada na comparação e descrição das mesmas características para todas as espécies, focando principalmente em caracteres externos, passíveis de serem analisadas nos animais vivos e algumas características cranianas e dentárias mais relevantes para os grupos analisados. Já a descrição de características ecológicas foi baseada em extenso banco de dados coletados em 155 sítios com 118.322 armadilhas-noite de esforço no Planalto pelos projetos do Laboratório de Diversidade e Conservação de Mamíferos do Departamento de Zoologia do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, e revisão padronizada da literatura. Para cada uma das 53 espécies, são apresentadas informações sobre: 1- \"Identificação\" que inclui medidas corporais externas (mínimo, máximo e média), um texto de diagnose que descreve características morfológicas externas e cranianas ilustradas em figuras e pranchas, e cariótipo; 2- \"Distribuição\" onde é descrita a distribuição geográfica seguida por informações sobre a ocorrência em biomas e estados brasileiros, e a distribuição e abundância nas matas do Planalto Atlântico de São Paulo; 3- \"História Natural\" onde são descritas a preferência por florestas ou áreas abertas de agricultura, a resposta à fragmentação florestal e regeneração da floresta, a capacidade de ocupar diferentes tipos de ambientes alterados, dieta, hábito, reprodução, uso do espaço e outras informações importantes; e 4- \"Ameaças\" onde se ressalta a presença em listas de espécies ameaçadas estaduais, nacional e internacional e se apresenta uma consideração sobre as ameaçadas sofridas, com base nas informações detalhadas obtidas no Planalto Atlântico de São Paulo. / Rodents from the families Cricetidae and Echimyidae and Didelphidae marsupials represent the non-volant small mammals from Neotropical forests, a group that encompasses much of the diversity of mammals in Brazil, play important ecological roles in forest regeneration and dynamics, and indicates changes in both landscape and local habitat structure. However, species identification is difficult since taxonomy is mainly based on cranial and chromosomal characters, many species are still being described, and recent lists for many biomes and regions are lacking. Moreover, despite their numerical and ecological importance, there is a lack of information, syntheses and compilations on the diagnosis, natural history, distribution and threats to the species of this group. This dissertation presents a compilation of the current knowledge about the diagnostic characters, distribution, habitat use and responses to human disturbances, diet, use of space, reproduction and threats for the non-volant small mammals from one of the richest regions of the Atlantic Forest, the Atlantic Plateau of São Paulo, where two adjacent areas of endemism meet, and which harbors about 22 and 32% of Cricetidae rodents and Didelphidae marsupials occurring in Brazil. Species diagnosis were based on the comparison and description of the same characteristics for all species, focusing mainly on external characters, which can be analyzed in live animals and some dental and cranial features most relevant to the analyzed groups. The description of ecological characteristics was based on an extensive database collected at 155 sites with an effort of 118.322 traps-night by the projects of the Laboratory of Diversity and Conservation of Mammals, Department of Zoology, Institute of Biosciences, University of São Paulo, and a standardized review of the literature. For each of the 53 species, I present information on: 1- \"Identification\" that includes external body measurements (minimum, maximum and mean), a text on diagnosis that describes the external morphological and cranial characteristics illustrated in figures and plates, and karyotype; 2- \"Distribution\" that describes the geographical distribution followed by information on the occurrence in Brazilian biomes and states, and the distribution and abundance in forests of the Atlantic Plateau of São Paulo; 3- \"Natural History\" where the preference for forests or open areas of agriculture, the response to forest fragmentation and regeneration, the ability to occupy different types of altered habitats, diet, habit, reproduction, use of space and other important information are described; and 4- \"Threats\" that highlights the presence in state, national and international lists of endangered species and presents a consideration of the threats, based on the detailed information obtained in the Atlantic Plateau of São Paulo.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-01-12T17:23:21Z No. of bitstreams: 1 566977.pdf: 8045975 bytes, checksum: 6d30ac980bf68120652390c77e567cec (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-12T17:23:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 566977.pdf: 8045975 bytes, checksum: 6d30ac980bf68120652390c77e567cec (MD5) Previous issue date: 2002-06-27 / CAPES / Duas espécies viventes têm sido tradicionalmente reconhecidas no gênero Clyomys: C. laticeps (Thomas, 1909) e C. bishopi Avila-Pires e Wutke, 1981. A primeira estaria distribuída do Chaco paraguaio ao Cerrado do Centro-Oeste do Brasil, Minas Gerais e Bahia, ao passo que a segunda estaria restrita às regiões de Cerrado de São Paulo. A população do Chaco paraguaio foi reconhecida como uma subespécie de C. laticeps com base em apenas dois espécimes e nomeada C. laticeps whartoni Moojen, 1952. O reconhecimento das populações de São Paulo como um novo táxon baseou-se no maior tamanho corporal e na coloração cinzento-amarelada destes exemplares, em contraste com a mais ruiva de C. laticeps. As duas espécies apresentam número diplóide e morfologia dos cromossomos semelhantes. O acúmulo de um maior número de exemplares e os resultados de análises citogenéticas recentes levantaram questões da real divergência entre estes as formas reconhecidas como espécies, sugerindo uma análise mais abrangente da variabilidade morfológica do gênero. Análises de variabilidade morfométrica e qualitativa do crânio foram confrontadas com descrições da morfologia fálica e do padrão de coloração da pelagem, para um total de 112 exemplares provenientes de 16 localidades foram analisados. Os resultados indicam que: 1) os critérios utilizados para nomear C. bishopi são contestáveis, pois os caracteres diagnósticos da espécie são compartilhados por outras populações fora de São Paulo; 2) não foi observado qualquer caráter morfológico que distinguisse a amostra do Paraguai como uma subespécie de C. laticeps; 3) a história biogeográfica, associada com as restrições ecológicas impostas pela vida semifossorial podem ter contribuído para a variabilidade observada na morfologia do báculo e no cariótipo entre as populações atuais; 4) o tamanho dos animais pode estar relacionado com os fatores climáticos; 5) a coloração da pelagem em Clyomys pode ser resultado de uma seleção positiva daqueles indivíduos com coloração mais críptica com o ambiente. No entanto, 6) uma estruturação morfométrica em dois agrupamentos geográficos foi revelada. Dados adicionais sobre os cariótipos e a diferenciação genética entre diferentes populações poderão fornecer melhores subsídios para inferir sobre o status taxonômico das amostras populacionais de Clyomys. / The genus Clyomys has included two living species, C. laticeps (Thomas, 1909) and C. bishopi Avila-Pires & Wutke, 1981. The first nominal form would range from the Paraguayan Chaco to the states of Minas Gerais and Bahia throughout the Brazilian Cerrado, while the second is known only for regions of Cerrado enclaves of São Paulo state. The population of the Paraguayan Chaco was recognized as a subspecies of Clyomys laticeps on the basis of two individuals, and named C. laticeps whartoni Moojen, 1952. The samples from São Paulo were mainly distinguished by their larger body size and gray-yellowish coloration, in contrast to the smaller and predominantly rufous specimens of C. laticeps. The two species have revealed similar diploid numbers and chromosome morphology. The recent acquisition of larger series, representative of the two nominal forms, as well as the results of cytogenetic analyses of selected individuals prompted the question of the real divergence between the two recognized species, here examined in a more comprehensive analysis of the morphological variability of genus. Morphometric and qualitative analyses of skull morphology were confronted with the qualitative description of phallic morphology and pelage coloration, for a total of 112 specimens from 16 localities. The results indicate that: 1) criteria used to distinguish Clyomys bishopi are contestable, because presumptive diagnostic characters are shared with other populations from outside of São Paulo State; 2) no surveyed morphological character distinguishes the Paraguayan sample from Clyomys laticeps; 3) biogeographic history, associated with ecological restrictions imposed by the semifossorial habit of Clyomys may have contributed for the variability in bacular morphology and karyotype documented in extant populations; 4) variation in size may be related to climatic factors; 5) pelage coloration in Clyomys may have resulted from positive selection of individuals that displayed a more cryptic coloration in relation to the environment. Nevertheless, 6) a morphometric structuring of studied samples in two geographic groups was revealed. Additional karyological and genetic comparisons among different populations may provide a better framework for inferences on the taxonomical status of populational samples of Clyomys.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T20:17:05Z No. of bitstreams: 1 200922.pdf: 9127968 bytes, checksum: a5956984eeeeb318102a85ee9e1dd81c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-18T20:17:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 200922.pdf: 9127968 bytes, checksum: a5956984eeeeb318102a85ee9e1dd81c (MD5) Previous issue date: 1986-12 / CAPES / Proechimys cuvieri, com cariótipo de 2N = 28, proveniente do Território do Amapá foi estudado comparativamente a uma amostra da mesma procedência. Análises morfométricas univariada e multivariadas realizadas sobre as amostras revelaram a ocorrência de uma outra morfoespécie na região. O estudo indica a necessidade da divisão por idades para a compreensão da morfologia e sistemática deste taxon. As duas espécies parecem completar a morfogênese antes de atingir o tamanho final. / Proechimys cuvieri with a caryotype of 2N = 28 from Amapá Territory was studied comparatively with a sample from the same location. The morphometric univariate and multivariate analysis done for the samples showed an ocurrence of another morphospecies in the region. The study indicates the necessity of the separation in age classes for the comprehension of the morphology and systematics of this taxon. The two species seems to complete the morphogenesis before it accomplishes their final size.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-01-12T14:47:06Z No. of bitstreams: 1 656201.pdf: 8945602 bytes, checksum: 289b373a1e3a852f99cbb987c9674493 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-12T14:47:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 656201.pdf: 8945602 bytes, checksum: 289b373a1e3a852f99cbb987c9674493 (MD5) Previous issue date: 2005-06 / No gênero Thrichomys cinco descrições de espécies são reconhecidas, sendo que geralmente este gênero é considerado monotípico. Thrichomys apereoides (Lund, 1839) descrito de Lagoa Santa em Minas Gerais é um roedor echimídeo que difere da maioria dos roedores desta família por apresentar pelagem macia e cauda densamente pilosa. Em estudos recentes que enfocam a espécie, os resultados das análises já realizadas (morfométricas, citogenéticas e moleculares) sugerem que Thrichomys seja politípico. O objetivo deste estudo foi realizar análises morfológicas (crânio e báculo) e análise citogenética em três amostras populacionais de Thrichomys apereoides em Minas Gerais (Lagoa Santa, Matozinhos e Santana do Riacho) incluindo os espécimes coletados por Lund (1839), na Bahia (Morro do Chapéu, Mucugê, Palmeiras e Rio de Contas) e em Mato Grosso (Barão de Melgaço), visando compreender os limites morfológicos de possíveis unidades evolutivas independentes dentro do gênero Thrichomys. As análises qualitativa e quantitativa do crânio foram úteis na diferenciação das amostras. Estados de caracteres cranianos, Análise das Funções Discriminantes e Análise dos Componentes Principais discriminaram as amostras. A amostra da Bahia foi totalmente discriminada no eixo canônico principal 1 e parcialmente discriminada das demais amostras no componente principal 1. A análise bacular não discriminou as amostras. A análise citogenética apresentou cariótipos diferenciados: Minas Gerais com 2n = 28 e NF = 50; Bahia com 2n = 26 e NF = 48; Mato Grosso com 2n = 34 e NF = 64. A amostra de Minas Gerais é alocada a Thrichomys aperoides. A amostra da Bahia é alocada a Thrichomys inermis. A amostra de Mato Grosso é alocada a Thrichomys pachyurus. / Five nominal forms in Thrichomys has described, but this genera is currently regarded as monotypic. Thrichomys apereoides (Lund, 1839) described from Lagoa Santa (Minas Gerais) can be distinguished from other genera within the Echimyidae by its soft fur and densely-haired tail. Morphometric, karyological and molecular analysis in Thrichomys suggested that genera is politypic. The present study realized morphological (cranial and bacular) and Karyological analysis in three Thrichomys apereoides samples from Minas Gerais (Lagoa Santa, Matozinhos and Santana do Riacho) within specimens Lund ( 1839) collected, Bahia (Morro do Chapéu, Mucugê Palmeiras and Rio de Contas) and Mato Grosso (Barão de Melgaço) attempt to found independent evolutionary units. Qualitative and quantitative cranial analysis shows differences among the samples studied. Cranial traits conditions, Discriminant Functions Analysis and Principal Component Analysis discriminated the samples. The sample from Bahia has fully discriminated a1ong an axis CV 1 and parti11y discriminated along axis CP 1 . Bacular analysis not discriminated the samples. Karyological analysis discriminated the samples: 2n = 28 and FN = 50 from Minas Gerais; 2n = 26 and FN = 48 from Bahia; 2n = 34 and NF = 64 from Mato Grosso. Thrichomys apereoides is the oldest name the sample from Minas Gerais. Thrichomys inermis is the oldest name the sample from Bahia. Thrichomys pachyurus is the oldest name the sample from Mato Grosso.

The Amazon rainforest harbors the planet's highest biodiversity among terrestrial ecosystems; however, the biology and ecology of most of its species are unknown. Niche partitioning is considered a key factor allowing species co-existence, especially for morphological similar species such as spiny rats of the genus Proechimys. I examined the extent to which habitat differentiation, species body mass, and diet could explain the community composition of small mammals at a site in the southeastern Amazon. Moreover, I radio-tagged sympatric species of Proechimys spp. and Mesomys stimulax (an arboreal spiny rat) to obtain detailed autoecology information, including habitat use and use of space. I found support for niche partitioning among species and associated small mammal species with distinct successional phases of gap dynamics. I also observed among Proechimys spp. a typical polygynous organization: females appeared to be territorial against females of any species of their genus; but male territories overlapped with those of several females. Mesomys stimulax showed evidence of monogamy and possible sociality, although sample sizes were small. To identify the importance of small mammals as seed disperser of Brazil nut seeds, I conduct experiments using a combination of fluorescent powder, seed exclosures, and track plates in forests with and without Brazil nut groves, and in forests with and without Brazil nut harvesting. Among small mammals, only Proechimys spp. removed, dispersed, and preyed upon Brazil nut seeds. Proechimys spp. sometimes scatterhoarded these seeds, and hence have the potential to play a significant role in recruiting new Brazil nut trees. I also trapped small mammals and measured forest structures on the same sites used for the seed dispersal experiment, to determine the ecological effects of Brazil nut harvest on small mammal communities; however, my results showed little evidence of changes associated with the seed exploitation. My results highlight the importance of habitat heterogeneity in structuring small mammal communities, and indicate that forest management practices that alter habitats, such as partial logging, also can be expected to alter small mammal composition and diversity. Proechimys spp. have the potential to play an important role in the ecological restoration of intensive exploited Brazil nut groves.