Submitted by Teresa Cristina Rosenhayme (teresa.rosenhayme@cprm.gov.br) on 2015-07-14T17:52:16Z No. of bitstreams: 1 0821418_2013_Completo.pdf: 2562069 bytes, checksum: 13b45ec6b5f8ed64f697fa027f8d653e (MD5) / Approved for entry into archive by Flasleandro Oliveira (flasleandro.oliveira@cprm.gov.br) on 2015-07-14T18:51:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 0821418_2013_Completo.pdf: 2562069 bytes, checksum: 13b45ec6b5f8ed64f697fa027f8d653e (MD5) / Approved for entry into archive by Flasleandro Oliveira (flasleandro.oliveira@cprm.gov.br) on 2015-07-14T18:51:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 0821418_2013_Completo.pdf: 2562069 bytes, checksum: 13b45ec6b5f8ed64f697fa027f8d653e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-14T18:51:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 0821418_2013_Completo.pdf: 2562069 bytes, checksum: 13b45ec6b5f8ed64f697fa027f8d653e (MD5) Previous issue date: 2013-09

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Física e Matemáticas. Programa de Pós-Graduação em Química. / Made available in DSpace on 2012-10-19T04:10:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2014-09-25T19:52:33Z : No. of bitstreams: 1 181661.pdf: 16313040 bytes, checksum: c5e521a0baa4ff6b86a7dd8b781eb2ff (MD5) / Um método é proposto para a determinação de metais traço em carvão na forma de suspensão por espectrometria de massa com fonte de plasma indutivamente acoplado com introdução da amostra por vaporização eletrotérmica (ETV-ICP-MS). A calibração externa com soluções analíticas e a calibração por diluição isotópica (ID) foram empregadas como técnicas de calibração. As suspensões das amostras foram preparadas em ácido nítrico 5% v/v e colocadas em banho ultra-som para auxiliar na extração dos analitos. Para a ID as suspensões foram colocadas em banho ultra-som por 60 minutos e no banho-maria por 120 minutos. Após a otimização programa de temperatura do ETV, a metodologia foi aplicada à amostras cerificadas de carvão para determinar a concentração de As, Mn, Pb e Se utilizando a calibração externa, e Cd, Hg, Pb e Tl por diluição isotópica. Os reultados obtidos para os metais de interesse foram concordantes com os valores certificados.

Os métodos oficiais da Agência de Proteção Ambiental Norte-americana (EPA) para análise de dioxinas e furanos, utilizam espectrômetros de massas de alta e baixa resolução para identificação e quantificação destes compostos. A extração da amostra é realizada por Soxhlet (SOX) e a etapa de clean up por uma seqüência de colunas de sílica, alumina e carbono/celite. O método que usa espectrômetro de massas de alta resolução é o mais preciso e seguro para este tipo de análise, sendo também o de maior custo. Com o intuito de estabelecer uma análise segura e de menor custo, o presente trabalho teve como proposta a avaliação da aplicação da metodologia de identificação e quantificação de dioxinas e furanos, utilizando espectrômetro de massas de baixa resolução, "íon trap", no modo massas/massas (MS/MS) segundo a metodologia proposta pela empresa VARIAN. Foi também estudada a extração da amostra por ultra-som convencional (US) e ultra-som de ponta, conhecido como disruptor celular (DC) em substituição ao método clássico de extração por soxhlet, bem como a utilização de Florisil® no processo de clean up. Desta forma, amostras de cinzas de incinerador foram extraídas por soxhlet, US e DC e submetidas a processos de clean up segundo os métodos oficiais (seqüência de colunas de sílica, alumina e carbono/celite) ou utilização de Florisil®. Os dados obtidos neste trabalho mostraram que: a- a extração por US não foi adequada, devido à baixa recuperação apresentada; b- a extração por DC mostrou potencialidade de extração semelhante à técnica oficial de extração por Soxhlet; c- o Florisil® não demonstrou ser eficiente no processo de clean up, possibilitando a permanência de vários interferentes os quais dificultaram em muito a análise; d- .a metodologia proposta pela VARIAN foi eficiente nas amostras em estudo, inclusive na amostra real, em que foi utilizada uma cinza de incinerador hospitalar, cujos extratos obtidos, tanto por Soxhlet quanto por DC apresentaram valores de PCDD/Fs de 533 ± 56,1 e 370 ± 81,6 ng g-¹ de I-TEQ respectivamente, sendo estatisticamente equivalentes pelo teste t. / The official EPA (American Envirorunental Protection Agency) methods for analysing dioxins and furans make use of high and low resolution mass spectrometers to identify and quantify these compounds. Sample extraction is carried out in a Soxhlet followed by clean-up by a sequence of silica, alumina and carbon/celite columns. The method using a high resolution spectrometer is the most accurate and confident for this kind of analysis being also the most expensive. In order to establish a cheap and confident analytical method, the present word had the purpose of evaluate the methodology for identification and quantification of dioxins and furans using low resolution ion trap mass spectrometer, in the mass/mass mode (MS/MS). Furthermore, sample extraction by conventional ultra sound (US) and cellular disruptor (CD) was employed instead of the classical Soxhlet extraction, and Florisil® was used in the clean-up processo Incinerator ashes were extracted by Soxhlet, US and CD, followed by c1ean-up according to official methods (sequence of silica, alumina and carbonlcelite columns) or using Florisil®. The obtained data showed that: a) extraction by US was not adequate due to low recovery; b) extraction by CD showed a extraction capability comparable to the official Soxhlet extraction; c) Florisil® showed to be efficient for clean-up, allowing several interferents to be present causing analytical difficulties; d) the methodology proposed by VARIAN proved to be efficient for the studied samples, including a real sample constituted by hospital incinerator ashes, for which extracts by Soxhlet and CD presented I-TEQ values for PCDD/Fs of 533 ± 56,1 ng g-¹ and 370 ± 81,6 ng g-¹ respectively, being statistically equivalents by the t-test.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Geociências, 2006. / Submitted by Diogo Trindade Fóis (diogo_fois@hotmail.com) on 2009-10-23T13:22:39Z No. of bitstreams: 1 2006_Barbara Alcantara Ferreira Lima.pdf: 2489564 bytes, checksum: 7b7844c3b17e5aee354e06c6a0348760 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-10-18T22:03:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Barbara Alcantara Ferreira Lima.pdf: 2489564 bytes, checksum: 7b7844c3b17e5aee354e06c6a0348760 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-10-18T22:03:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Barbara Alcantara Ferreira Lima.pdf: 2489564 bytes, checksum: 7b7844c3b17e5aee354e06c6a0348760 (MD5) / Existem vários métodos de datação que são amplamente utilizados de acordo com o tipo de material do qual se quer datar. Os métodos de datação baseados no desequilíbrio radioativo que utilizam a dependência-tempo da perturbação geoquímica entre isótopos 238 235 232 pai e filho da série de decaimento radioativo natural do U, U e Th, cujos membros finais são isótopos estáveis de chumbo, são os que encontram maior uso numa ampla variedade de problemas na geologia, hidrogeologia e arqueologia. O uso deste método em depósitos de cavernas, como espeleotemas e sedimentos clásticos, provou ser uma ferramenta poderosa para estudar o passado climático e mudanças ambientais. Mais especificamente, espeleotemas, principalmente estalagmites, são freqüentemente estudadas para interpretações paleoambientais. Além disso, a aplicação em estudos geológicos inclui a determinação de idade de rochas e água subterrânea, estudos de erosão superficial, transporte e processos de sedimentação, interações rocha-água subterrânea, dentre outros. A preparação química do método é o principal foco desse trabalho que envolve cuidadoso controle de procedimentos químicos para eliminar contaminação de laboratório e calibração precisa do espectrômetro de massa para obter alta reprodutibilidade. O processo se dá em várias etapas: preparação da amostra, digestão e separação cromatográfica utilizando padrões sintéticos e amostras já datadas em outros laboratórios no mundo, leitura das razões isotópicas em espectrômetro de massa, além do estudo da estalagmite JA-5 da Caverna João Arruda em Bonito-MS. Os resultados obtidos mostram que o método funciona, principalmente com relação à co-precipitação do U e Th e separação cromatográfica desses metais. Observa- se também que as idades obtidas estão dentro do erro associado a cada amostra e se aproximam dos valores obtidos em outros laboratórios (laboratórios validados quanto ao método). É evidente que alguns ajustes devem ser levados em consideração para ter um resultado melhor, principalmente no ajuste do método de leitura em MC-ICP-MS. O estudo de caso feito com a estalagmite JA-5 sugere que a amostra parou de crescer em torno de 2,0 ky. Este estudo é diferente se o comparamos com o dado obtido para a estalagmite JA-3 encontrada na mesma caverna, mas em locais de dinâmica hídica diferente. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / There are many dating methods largely used according to the kind of material to be dated. Methods that rely on the time-dependency of geochemical disequilibrium 238 235 232 U, U and Th natural decay system, between daughter and parent isotope, from the whose final members are stable Pb isotopes, are the most useful in a broader variety of geological, hydrological and archeological problems. The use of this method in cave deposits like speleothems and clastic sediments proved to be a powerful tool to study past climatic and environmental changes. Speleothems like stalagmites are frequently used in paleoenvironmental interpretations. This method may be applied to rocks and underground water dating, erosion studies, transport and sedimentation processes, interactions between rock-groundwater, among others. The present work focuses on the chemical preparation of the U-Th method including the chemical procedures to avoid laboratory contamination and the mass spectrometer precise calibration in order to get high reproducibility. The process has many steps: samples preparation; digestion and chromatographic separation using standards and samples already dated in other laboratories; determination of the isotopic ratios by mass spectrometers, and a case study based on a stalagmite from João Arruda cave, Bonito, Mato Grosso State, Brazil. The obtained data shows the reliability of the method works, mostly in relation to co precipitation of U and Th and to the chromatographic separation of these metals. It is also observed that the obtained dates are within the errors for each sample and are very similar to the dates obtained in other laboratories (validated to this methodology). Further improvements are necessary to achieve better results, mostly related to the reading method in the MC-ICP-MS. The case study in the JA-5 stalagmite shows that it stopped growing around 2,0 ky. This is a different result from that obtained on JA-3 stalagmite, from the same cave, but placed in a spot with different hydrodynamics.

Os métodos oficiais da Agência de Proteção Ambiental Norte-americana (EPA) para análise de dioxinas e furanos, utilizam espectrômetros de massas de alta e baixa resolução para identificação e quantificação destes compostos. A extração da amostra é realizada por Soxhlet (SOX) e a etapa de clean up por uma seqüência de colunas de sílica, alumina e carbono/celite. O método que usa espectrômetro de massas de alta resolução é o mais preciso e seguro para este tipo de análise, sendo também o de maior custo. Com o intuito de estabelecer uma análise segura e de menor custo, o presente trabalho teve como proposta a avaliação da aplicação da metodologia de identificação e quantificação de dioxinas e furanos, utilizando espectrômetro de massas de baixa resolução, "íon trap", no modo massas/massas (MS/MS) segundo a metodologia proposta pela empresa VARIAN. Foi também estudada a extração da amostra por ultra-som convencional (US) e ultra-som de ponta, conhecido como disruptor celular (DC) em substituição ao método clássico de extração por soxhlet, bem como a utilização de Florisil® no processo de clean up. Desta forma, amostras de cinzas de incinerador foram extraídas por soxhlet, US e DC e submetidas a processos de clean up segundo os métodos oficiais (seqüência de colunas de sílica, alumina e carbono/celite) ou utilização de Florisil®. Os dados obtidos neste trabalho mostraram que: a- a extração por US não foi adequada, devido à baixa recuperação apresentada; b- a extração por DC mostrou potencialidade de extração semelhante à técnica oficial de extração por Soxhlet; c- o Florisil® não demonstrou ser eficiente no processo de clean up, possibilitando a permanência de vários interferentes os quais dificultaram em muito a análise; d- .a metodologia proposta pela VARIAN foi eficiente nas amostras em estudo, inclusive na amostra real, em que foi utilizada uma cinza de incinerador hospitalar, cujos extratos obtidos, tanto por Soxhlet quanto por DC apresentaram valores de PCDD/Fs de 533 ± 56,1 e 370 ± 81,6 ng g-¹ de I-TEQ respectivamente, sendo estatisticamente equivalentes pelo teste t. / The official EPA (American Envirorunental Protection Agency) methods for analysing dioxins and furans make use of high and low resolution mass spectrometers to identify and quantify these compounds. Sample extraction is carried out in a Soxhlet followed by clean-up by a sequence of silica, alumina and carbon/celite columns. The method using a high resolution spectrometer is the most accurate and confident for this kind of analysis being also the most expensive. In order to establish a cheap and confident analytical method, the present word had the purpose of evaluate the methodology for identification and quantification of dioxins and furans using low resolution ion trap mass spectrometer, in the mass/mass mode (MS/MS). Furthermore, sample extraction by conventional ultra sound (US) and cellular disruptor (CD) was employed instead of the classical Soxhlet extraction, and Florisil® was used in the clean-up processo Incinerator ashes were extracted by Soxhlet, US and CD, followed by c1ean-up according to official methods (sequence of silica, alumina and carbonlcelite columns) or using Florisil®. The obtained data showed that: a) extraction by US was not adequate due to low recovery; b) extraction by CD showed a extraction capability comparable to the official Soxhlet extraction; c) Florisil® showed to be efficient for clean-up, allowing several interferents to be present causing analytical difficulties; d) the methodology proposed by VARIAN proved to be efficient for the studied samples, including a real sample constituted by hospital incinerator ashes, for which extracts by Soxhlet and CD presented I-TEQ values for PCDD/Fs of 533 ± 56,1 ng g-¹ and 370 ± 81,6 ng g-¹ respectively, being statistically equivalents by the t-test.

Orientador: Marcos Nogueira Eberlin / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-22T08:30:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sorrilha_AnaElisaPintoMoreira_D.pdf: 4964997 bytes, checksum: e6e5d82a2a945a5188490186d62f07cb (MD5) Previous issue date: 1996 / Doutorado

Orientadores: Anita Jocelyne Marsaioli / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-22T18:41:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alves_PericlesBarreto_D.pdf: 8158372 bytes, checksum: 402660b32655d5b44d4e2146d3d78d07 (MD5) Previous issue date: 1997 / Doutorado

Orientador: Nicolao Jannuzzi / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Fisica Gleb Wataghin / Made available in DSpace on 2018-07-23T17:18:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bilac_SergioArturBianchini_M.pdf: 1301813 bytes, checksum: d95e409ea69bb0b4ae0cb3583f43f4e9 (MD5) Previous issue date: 1973 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed. / Mestrado / Física / Mestre em Física

Orientador : Marcos Nogueira Eberlin / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-28T17:32:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Moraes_LuizAlbertoBeraldode_D.pdf: 6211691 bytes, checksum: 5e9788b7a69105913278bfdf2322919f (MD5) Previous issue date: 1999 / Doutorado

Orientador : Jose Camillo Novello / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-02T23:24:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Smolka_MarcusBustamante_D.pdf: 13169476 bytes, checksum: 534084d55f017b34ca272ac8bba62a9e (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: A bactéria Xy/ella fastidiosa é responsável por várias doenças de plantas economicamente importantes, incluindo a clorose variegada do citros (CVC). Apesar de seu genoma já estar completamente sequenciado, os estudos das proteínas expressas pela bactéria são quase inexistentes. Na presente tese, foi utilizada a eletroforese de duas dimensões em combinação com a espectrometria de massas para identificar os produtos de 142 diferentes genes da X. fastidiosa, incluindo proteínas secretadas e as relacionadas com adesão, que apresentam particular interesse para o estudo da patogenicidade. Análise comparativa do perfil protéico da bactéria crescida como colônias isoladas em meio sólido de cultura com o da bactéria formando biofilme em meio líquido de cultura indicou a expressão específica de uma cisteíno protease, uma lipase e uma isoforma da subunidade da fímbria do tipo IV na condição de formação de biofilme. Análise do índice de uso de códons específicos ("codon bias") das proteínas mais expressas no extrato celular total revelou uma distribuição de valores inesperadamente baixa, o que é proposto como sendo possível causa da natureza fastidiosa da X. fastidiosa. Um banco de dados disponibilizando as informações geradas foi construído e pode ser acessado pela intemet: URL: www.proteome.ibLunicamp.br. Os resultados representam um esforço inicial para a caracterização da expressão de proteínas na X. fastidiosa e devem ajudar a promover um maior entendimento dos mecanismos de sobrevivência, adesão e secreção, bem como viabilizar subsequentes estudos de análise diferencial do proteoma da X. fastidiosa em diversos modelos experimentais. Na segunda parte da tese é mostrado um novo método para análise quantitativa de proteomas por espectrometria de massas. A estratégia proposta se baseia em marcar duas amostras a serem comparadas com diferentes formas isotópicas do reagente ICA T ("Isotope Coded Afinity Tags"), comigrá-Ias num único gel 2DE e identificar e quantificar as proteínas por espectrometria de massas. Os resultados mostram que proteínas rotuladas com as formas isotopicamente pesada e normal do reagente ICA T comigram na mesma posição em géis 2DE. Quando as proteínas são subsequentemente digeridas e analisadas por espectrometria de massas, a razão da abundância relativa das proteínas em cada amostra pode ser determinada precisamente, baseando-se nas intensidades relativas do sinal espectro métrico dos peptídios contendo as diferenças isotópicas. Utilizando esta estratégia, foi possível realizar quantificações com precisão melhor que 20 % / Abstract: The bacteria Xy/ella fastidiosa is the causative agent of a number of economically important crop diseases, including citrus variegated chlorosis (CVC). Although its complete genome is already sequenced, X. fastidiosa is poorly characterized by biochemical approaches at the protein level. In the present work it was used two dimensional electrophoresis in combination with mass spectrometry to identify the products of 142 different X. fastidiosa genes, including secreted and adhesion related proteins that show particular interest for the study of pathogenesis. Comparative proteome analysis of the bacteria grown as isolated colonies on a solid culture medium and the bacteria forming biofilm on a liquid culture medium indicated the specific expression of a cysteine protease, a lipase and an isoform of the type IV fimbriae subunit in the biofilm forming condition. A codon usage analysis of the most expressed proteins from the whole cell extract revealed a low biased distribution, which we propose to be related with the slow growing nature of X. fastidiosa. A database of the X. fastidiosa proteome was developed and can be accessed via the intemet (URL: www.proteome.ibLunicamp.br). The results represent an initial effort to characterize protein expression in X. fastidiosa and should contribute for a better understanding of the survival, adhesion and secretion mechanisms. It also provides the basis for subsequent differential proteome analysis on various experimental models. The second part of the thesis presents a new method for quantitative proteome analysis using mass spectrometry. The proposed strategy is based on labelling two different samples to be compared with the different istopic forms of the ICA T (Isotope Coded Afinity Tags) reagent, combine and comigrate them in a single 2DE gel and identify and quantify the proteins by mass spectrometry. It is shown that proteins labeled with the isotopically heavy and normal forms of the reagent co-migrate in 2DE gels and that the ratio of protein abundance can be accurately determined from the rein active mass spectrometric signal intensities of the heavy and normal forms of labeled, cysteine containing peptides. 80th identification and accurate quantification (better than 20 %) are therefore achieved in a simple single-step analysis / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular