Abstract: Molecular and cellular insights into IKAP and Elongator functions As the first step in the complex process of gene expression, the transcription of genes from DNA to RNA by RNA polymerase II is subject to a multiplicity of controls and is thereby the endpoint of multiple cell regulatory pathways. We focused here on the molecular and cellular functions of IKAP and by extension of Elongator complex, initially found associated with the hyperphosphorylated RNA polymerase II during the elongation stage of transcription. IKAP is required for the assembly of Elongator subunits into a functional complex. Elongator has a histone acetyltransferase (HAT) activity associated with one of its subunits, named hELP3. In agreement with a potential role in transcript elongation, Elongator is associated with nascent RNA emanating from the elongating RNA polymerase II along the transcribed region of several yeast genes and chromatin immunoprecipitation experiments have also demonstrated an association of Elongator with genes in human cells. Different mutations in the human IKBKAP gene, encoding IKAP/hELP1, cause familial dysautonomia, a severe neurodevelopmental disease with complex clinical characteristics. Affected individuals are born with the disease and abnormally low numbers of neurons in peripheral nervous ganglions. To gain insight into the role played by IKAP and the Elongator complex in the transcription of genes and concomitantly learn about the molecular defects underlying the FD, an RNA interference approach was used to deplete the IKAP protein in human cells. In yeast, disruption of ELP1 (yeast homolog of human IKAP) is known to destabilize the ELP3 catalytic subunit, which leads to loss of Elongator integrity. Our experiments performed in human cells revealed that the levels of hELP3 protein is also affected by IKAP depletion after RNAi. We took advantage of this cellular loss-of-function model to identify genes whose transcription requires IKAP, by microarray experiments. Among the identified candidates, several were previously described to be involved in cell motility, or actin cytoskeleton remodelling. Because cell motility is of crucial importance for the developing nervous system, and therefore of obvious relevance to FD, the potential role of IKAP in cell motility was characterized at the cellular level. Several cell motility/migration assays demonstrated that the IKAP depletion has functional consequences so that IKAP-depleted cells showed defects in migration. Particularly, the reduced cell motility of neuronal-derived cell lines may be highly relevant to the neurodevelopmental disorder that affects FD patients. Whether or not the defects in cell migration resulted of impaired transcriptional elongation of the IKAP-dependent genes was investigated by chromatin immuno-precipitation technique. These experiments indicated that IKAP depletion leads to a decreased histone H3 acetylation in the transcribed region of its target genes in the context of Elongator complex. These acetylation defects are correlated with a decrease of the RNA polymerase II recruitment through the transcribed region of target genes, whereas the recruitment on the promoter is mostly unaffected. These results indicate that Elongator affects transcript elongation in vivo, but not the recruitment of the RNA polymerase II to the promoter. These very specific effects of IKAP/hELP1 depletion on histone acetylation and RNA polymerase II density across target genes are consistent with a direct effect of Elongator on transcriptional elongation in vivo and point to a function for Elongator in histone acetylation during transcript elongation. Résumé: Caractérisation des rôles biologiques de la protéine IKAP et du complexe Elongator La transcription des gènes de lADN en ARN est fondamentale pour lexpression des protéines et la capacité de nos cellules à sadapter à leur environnement. Ce processus finement régulé est catalysé par un enzyme, lARN polymérase II, vers lequel convergent une multitude de voies de signalisation. Dans le cadre de ce travail, nous nous sommes intéressés aux fonctions moléculaires et cellulaires de la protéine IKAP et du complexe Elongator. IKAP est la protéine qui assemble les sous unités dElongator en un complexe fonctionnel. Le complexe Elongator est associé à lARN polymérase II hyper-phosphorylée pendant létape délongation de la transcription et possède une activité histone acétyltransferase associée à une de ses sous unités, appelée ELP3. Chez la levure, Elongator est recruté an niveau des ARNs naissants, qui émanent directement de lARN polymérase II au niveau de la région transcrite des gènes étudiés. De plus, des expériences dimmunoprécipitation de la chromatine ont mis en évidence la présence du complexe Elongator au niveau de plusieurs gènes humains. Différentes mutations au niveau du gène IKBKAP, codant pour la protéine IKAP, sont responsables de la dysautonomie familiale, une maladie génétique qui affecte le développement du système nerveux périphérique. En effet, les individus affectés présentent une diminution de la densité de neurones au niveau des ganglions nerveux périphériques. Lobjectif de nos travaux est de comprendre davantage le rôle de la protéine IKAP et du complexe Elongator dans la transcription des gènes et ainsi, dinvestiguer les mécanismes moléculaires responsables dans la physiopathologie de la dysautonomie familiale. Un modèle de perte de fonction pour la protéine IKAP a dabord été généré par interférence dARN. Des travaux réalisés chez la levure indiquent que la protéine ELP1 (homologue de IKAP chez la levure) est essentielle pour la stabilité de la sous unité catalytique du complexe, la protéine ELP3. Les expériences réalisées sur notre modèle humain démontrent que le taux de la protéine ELP3 est également affecté par la déplétion dIKAP causée par linterférence dARN. Ce modèle de perte de fonction a été utilisé afin détablir la liste des gènes dont lexpression est contrôlée par la protéine IKAP, par des expériences de microarrays. Parmi les candidats identifiés, plusieurs ont été décrits comme impliqués dans la migration cellulaire et le remodelage du cytosquelette dactine. Le processus de migration des cellules est fondamental au cours du développement du système nerveux et par conséquent particulièrement relevant dans le contexte de la dysautonomie familiale. Limplication dIKAP dans la migration cellulaire a été investigué par différents tests de fonction qui montrent que la diminution dIKAP dans différentes lignées cellulaires entraîne une réduction significative de leur capacité migratoire. Ces résultats suggèrent que la diminution du nombre de neurones observée dans les ganglions périphériques des patients atteints de la dysautonomie familiale pourrait résulter dune altération de leur capacité à migrer au cours du développement. Enfin, des expériences dimmunoprécipitation de la chromatine ont été menées en utilisant notre modèle afin de déterminer dans quelle mesure le déficit de migration observé en labsence dIKAP serait la conséquence dun défaut de la fonction dElongator au niveau de lélongation de la transcription des gènes. Les résultats nous ont montré que la diminution dexpression dIKAP entraîne une réduction de lacétylation des histones H3 dans la région transcrite de ses gènes cibles. De plus, ce déficit dacétylation est directement corrélé avec un désengagement progressif de lARN polymérase II le long de la région transcrite de ces gènes. Par conséquent, ces résultats démontrent que le complexe Elongator affecte lélongation des transcrits in vivo, mais pas le recrutement de lARN polymérase II au niveau du promoteur. Ces effets très spécifiques de labsence dIKAP sur lacétylation des histones et lengagement de la polymérase II dans la transcription des gènes cibles montrent quElongator exerce un rôle direct au niveau de lélongation de la transcription de ces gènes. De plus, ces résultats suggèrent que la fonction dElongator serait dacétyler les histones au cours de lélongation transcriptionnelle in vivo.

Amyloidoses comprise a group of gain-of-toxic function protein misfolding diseases, in which normally soluble proteins in their functional state undergo conformational changes into highly organized and generally intractable thread-like aggregates, termed amyloid fibrils. These structures accumulate predominantly in the extracellular space but growing evidence suggests that amyloids may start to form intracellularly. At least 26 different human proteins, intact or in fragmented form, are known to form amyloid, which is linked with many debilitating neurodegenerative diseases such as Alzheimer’s disease (AD), Creutzfeldt-Jakob disease, and transthyretin (TTR)-related amyloidosis (ATTR). In this work, we focus on ATTR, which is one of the most frequent systemic amyloid diseases. A functional link was established between hereditary ATTR, a severe and fatal disorder and the enhanced propensity of the human plasma protein transthyretin (TTR) to form aggregates, caused by single point mutations in the TTR gene. The disease is heterogeneous and clinical symptoms vary from cardiomyopathy to progressing sensorimotor polyneuropathy depending on TTR variant involved and the amyloid deposition site. Despite the fact that TTR-derived amyloid accumulates in different organs such as heart, kidney, eyes, and predominantly in the peripheral nerves of ATTR patients, the exact mechanism of the disease development is not understood. In contrast to the case of AD, it has been difficult to generate an animal model for ATTR in transgenic mice that would be useful in understanding TTR aggregation processes and the mechanisms of the associated toxicity as these mice did not develop any neuropathic phenotype besides amyloid deposits. Therefore, we created a disease-model in Drosophila due to its huge repertoire of genetic techniques and easy genotype – phenotype translation, as well as its success in modeling human neurodegeneration. We have generated transgenic flies that over-express the clinical amyloidogenic variant TTRL55P, the engineered variant TTR-A (TTRV14N ⁄ V16E), and the wild-type protein. All TTR variants were found in the secreted form in the hemolymph where misfolding occurred and depending on the pool of toxic species, the fate of the fly was decided. Within a few weeks, both mutants (but not the wild-type TTR) demonstrated a time-dependent aggregation of misfolded molecules in vivo. This was associated with neurodegeneration, change in wing posture, attenuation of locomotor activity including compromised flying ability, and shortened life span. In contrast, expression of the wild-type TTR had no discernible effect on either longevity or fly behavior. In this work, we also addressed the correlation between TTR transgene dosage and thus, protein levels, with the severity of the phenotypes observed in TTR-A flies which developed a “dragged wing” phenotype. Remarkably, we established that degenerative changes such as damage to the retina strictly correlated with increased levels of mutated TTR but inversely with behavioral alterations and the dragged wing phenotype. We characterized formation of aggregates in the form of 20 nm spherules and amyloid filaments intracellularly in the thoracic adipose tissue and brain glia (both tissues that do not express the transgene). Moreover, we detected a fraction of neurotoxic TTR-A in the hemolymph of young but not old flies. We proposed that these animals counteract formation and persistence of toxic TTR-A species by removal from the circulation into intracellular compartments of glial and fat body cells and this is part of a mechanism that neutralizes the toxic effects of TTR. We validated the fly model for ATTR by applying a genetic screen during study of modifier genes. We found Serum amyloid P component (a product of the APCS gene) as a potent modifier of TTR amyloid-induced toxicity that was effective in preventing the apoptotic response in cell culture assay and capable of reducing the dragged wings when co-expressed in TTR-A flies. Finally, we optimized this fly model in order to screen for therapeutic compounds effective against ATTR. Feeding assays showed the effectiveness of several compounds among known native-state kinetic stabilizers of TTR against its aggregation. We described several early endpoints in this model, which can be used as a rapid and cost-effective method for optimizing concentrations and pre-screening of drug candidates. As the proof of principle, by feeding flies with increasing doses of diflunisal analogue (an FDA-approved Non-Steroidal Anti-Inflammatory Drug) a dose-dependent reduction of the dragged wings was observed.

Background. Familial Amyloidosis with Polyneuropathy (FAP) is an autosomal dominantly inherited systemic amyloid disease. The disease is caused by mutations in the transthyretin (TTR) gene, where close to 100 different amyloidogenic mutations have been identified. FAP is found worldwide, but endemic areas with a high frequency of patients are found in Portugal, Japan and northern Sweden. Cases from these endemic areas all share the same TTR c.148G>A, p.V50M ("V30M") mutation, but the phenotype of the disease varies between the areas, and also within the endemic areas. The mean onset of the disease is two decades earlier in Portugal and Japan compared to Sweden, but late as well as early age at onset cases occur within all the populations. Interestingly, the different populations all display a maternal anticipation, where an earlier onset is observed for those individuals who inherit the trait from their mother. Since substantial variation in the phenotype is observed for different populations, epigenetic/genetic and/or environmental factors must exert a significant impact on the penetrance of the disease. Amyloid formation is caused by conformational changes of proteins, which facilitates their assembly into fibrils, amyloid. Oxidative stress can mediate conformational changes of proteins and since the mitochondria regulate oxidative processes within the cell, mitochondrial function may affect amyloid formation. The mitochondrial DNA is a non-nuclear DNA, which is entirely maternally inherited, and therefore could be related to the observed maternal anticipation of the disease. In addition, differences within the surrounding regions of the TTR gene may have an impact on the transcription of the gene and thereby on the expression of the different alleles. Material and methods. DNA from early and late onset V30M cases and from non-carriers (the latter utilised as controls) from Swedish, French, Japanese and Portuguese populations were analysed. In addition, DNA from healthy Swedish V30M carriers was analysed. Conventional analytical methods were employed, such as PCR, sequencing and genotyping. Conventional statistical methods used were t-test, Chi-squared test and maximum likelihood. Results. The study of V30M carrier frequency in two counties (Lycksele and Skellefteå) within the Swedish endemic area revealed a carrier frequency of 2.14% and 2.54%, respectively. The mitochondrial haplogroup analysis showed that in populations with generally late onset (French and Swedish), the haplogroup distribution of late onset cases resembled that of the controls derived from the same area, whereas haplogroup distribution for early onset patients was significantly different. The most pronounced difference was for the rare haplogroup K, of which early onset cases had a higher frequency than the controls. Analysis of the Portuguese population, with predominantly early onset, showed that haplogroup distribution for early onset cases were similar to the Portuguese control group, which had a different distribution than the Swedish control group. By analysis of pedigrees from Swedish and Portuguese patients it could be shown that mitochondrial genetic variation entirely could explain maternal anticipation in the Portuguese patients, whereas for Swedish patients, an additional parent of origin effect is present. Our analysis of the TTR gene disclosed a polymorphism (rs62093482) in the 3'UTR region of the Swedish patients. This polymorphism was found in all V30M carriers, irrespective of symptoms. In addition, homozygous TTR V30M carriers were homozygous also for the polymorphism. Since Swedish patients share a common founder this polymorphism thus is localised on the V30M allele. This polymorphism was found in only 4% of the Swedish controls. French controls showed the same frequency, but none of the French V30M patients displayed the polymorphism. In the Japanese population the polymorphism was not present at all. Interestingly, this polymorphism generates a potential binding site for microRNA and thereby possibly could down-regulate the expression of the mutated TTR allele. Conclusions. The carrier frequency in the endemic area is remarkably high, above 2% in the Lycksele and Skellefteå areas. The prevailing haplogroup distributions in the different endemic areas are consistent between the general population and the patient group with the predominant phenotype of that area. Mitochondrial genetic differences may explain maternal anticipation in Portuguese patients, and have an influence in Swedish patients. A polymorphism in the 3'UTR regulatory region of the mutated TTR allele is found in all Swedish patients. This polymorphism may down-regulate TTR V30M expression and thereby contribute to the late onset of the disease noted in the Swedish population.

Contexte  Le cancer colorectal, deuxième par ordre de fréquence chez les femmes françaises, se développe principalement à partir de lésions précancéreuses, des adénomes. Les facteurs associés à l'obésité sont multiples, incluant des événements de début de vie, le niveau socio-économique et le comportement alimentaire ; l'obésité a aussi été associée de façon assez constante au risque de cancer colorectal. Cependant les associations entre des facteurs anthropométriques spécifiques ou au cours de la vie et le risque de tumeurs colorectales selon la filiation adénome-cancer ou selon le site sont moins claires. La ménopause est un événement de vie majeur et est associée à des modifications anthropométriques, tandis que le traitement hormonal de la ménopause (THM) est susceptible d'interagir avec les aspects anthropométriques mais aussi directement avec le risque de tumeur. De plus, la prescription du THM dépend de plusieurs paramètres, dont l'importance du suivi médical. Enfin, si le dépistage des tumeurs colorectales est conseillé à partir de 50 ans (soit aux environs de la ménopause) les attitudes vis-à-vis du dépistage varient selon de nombreux paramètres incluant les antécédents familiaux de cancer, le niveau socio-économique et les comportements de santé. Objectif  Le risque de tumeurs colorectales dépend ainsi de nombreux facteurs étroitement liés, parmi lesquels nous avons choisi d'étudier les relations complexes entre facteurs anthropométriques au cours de la vie, utilisation de THM et antécédents personnels de coloscopie, et le risque d'adénomes et de cancers colorectaux. Population  Les analyses ont été effectuées sur les données de la cohorte de femmes françaises E3N, comportant environ 1400 cas d'adénomes diagnostiqués parmi 17000 femmes ayant passé une coloscopie au cours du suivi (1993-2002) et 690 cas de cancers diagnostiqués parmi 92000 femmes au cours du suivi (1990-2008). Résultats  Notre étude a mis en évidence plusieurs aspects originaux. Tout d'abord, nous avons mis en évidence que les trois facteurs d'exposition principaux étudiés étaient associés au risque de tumeurs colorectales de façon significativement hétérogène en fonction du site, renforçant l'hypothèse selon laquelle il existe trois entités bien distinctes le long du cadre colorectal. Les caractéristiques anthropométriques typiquement occidentales (IMC et tour de taille élevés) étaient associées à un risque accru de tumeurs du côlon gauche, tandis que les associations originales que nous avons décrites entre taille assise et risque d'adénomes du côlon droit, et entre corpulence dans l'enfance et plus faible risque d'adénomes du rectum suggèrent de nouvelles pistes de recherche pour ces sites à l'étiologie mal connue. La mise en évidence d'une association positive entre prise de THM de type estrogènes seul (habituellement prescrit aux femmes hystérectomisées) et risque d'adénomes, en particulier du côlon gauche, et d'une association inverse entre le même type de THM et le risque de cancer, en particulier du côlon gauche, n'étant pas cohérentes avec les associations décrites dans la littérature, nous a conduit a explorer un éventuel biais de dépistage. La pratique de coloscopie était effectivement plus fréquente chez les femmes utilisant des estrogènes seuls (et donc aux antécédents d'hystérectomie), tandis que les antécédents de fibrome utérin étaient associés à un risque accru d'adénomes. De leur côté, les antécédents personnels de coloscopie étaient associés à une diminution de risque de cancer, surtout du côlon gauche, tandis que la réduction de risque des cancers du rectum devenait semblable à celle observée pour le côlon gauche dans la période la plus récente. Conclusion  En conclusion, nos résultats suggèrent qu'il existe des moyens efficaces de prévention des tumeurs distales, mais que la prévention des tumeurs du côlon droit demande des études spécifiques et peut-être de nouveaux paradigmes.

La present tesi avalua els efectes de certs factors ambientals sobre la paraoxonasa1 (PON1), enzim antioxidant, possiblement protector enfront les malalties cardiovasculars, a través de dos estudis d'intervenció i un de transversal. En primer lloc, el tractament amb simvastatina dels pacients amb hipercolesterolèmia familiar, que presentaven una activitat paraoxonasa baixa, s'associava a un increment de l'activitat fins a valors similars als d'individus normolipèmics, independentment dels polimorfismes PON1-55 o PON1-192. En segon lloc, l'entrenament físic s'associava a un augment de l'activitat paraoxonasa en els individus QQ i una disminució de la mateixa en els portadors de l'al·lel R pel polimorfisme PON1-192. L'increment de l'activitat paraoxonasa immediatament després de l'exercici físic agut era seguit per una disminució subseqüent de l'activitat. La recuperació dels nivells basals d'activitat paraoxonasa a les 24h de l'exercici físic agut es donava en els individus QQ independentment del seu estat d'entrenament, i en els individus portadors de l'al·lel R només quan estan entrenats. En tercer lloc, el consum elevat d'àcid oleic comportava un augment de la concentració de c-HDL i de l'activitat paraoxonasa en els homes portadors dels genotips QR i RR del polimorfisme PON1-192, respectivament.Paraules claus: paraoxonasa, PON1, genotips, simvastatina, hipercolesterolèmia familiar, interacció gen-dieta, lipoproteïna d'alta densitat (HDL), exercici físic agut, entrenament físic, estrès oxidatiu, àcid oleic, oli d'oliva, peròxids lipídics, malaltia cardiovascular. / The present thesis evaluates some environmental factor effects on paraoxonase1 (PON1), an possibly protective against cardiovascular disease antioxidant enzyme, through two intervention studies and a cross-sectional one. First, treatment with simvastatin of the familial hypercholesterolemic patients, which had low paraoxonase activity, was associated with an increase in the activity to values similar to the normolipemic ones, regardless of the PON1-55 or PON1-192 polymorphisms. Second, Regular exercise was associated with an increase in PON1 activity in QQ subjects and with a decrease in R carriers. Increased PON1 activity immediately after a bout of exercise was subsequently followed by a decrease of activity. The recovery of the basal PON1 activity levels at 24 h was found in QQ subjects regardless of their training status and in trained R carriers, but not in untrained R carriers. Third, high oleic acid intake was associated with increased HDL cholesterol and PON1 activity levels only in men who were QR and RR of the PON1-192 polymorphism, respectively.

Thèse de doctorat : ETUDES GERMANIQUES : Metz : 1997. / 1997METZ016L. 188 ref.

Background Transthyretin amyloid (ATTR) amyloidosis is a systemic disorder caused by amyloid deposits formed by misfolded transthyretin (TTR) monomers. Two main forms exist – wild-type and hereditary ATTR amyloidosis, the latter associated with TTR gene mutations. Wild-type ATTR amyloidosis has a late onset and primarily cardiac manifestations, whereas hereditary ATTR amyloidosis is a rare autosomal dominant condition with a considerable phenotypic diversity. Both disorders are present all over the world, but endemic areas of the hereditary form are found in Sweden, Portugal, Brazil and Japan. Gastrointestinal (GI) complications are common in hereditary ATTR amyloidosis and play an important role in the patients’ morbidity and mortality. Malfunction of the autonomic and enteric nervous systems has been proposed to contribute to the GI disturbances, but the underlying mechanisms have not been fully elucidated. The aims of this thesis were to assess the prevalence of GI disturbances for different subtypes of ATTR amyloidosis, to further explore the mechanisms behind these disturbances, and to evaluate the outcome of the patients’ GI function after liver transplantation, which currently is the standard treatment for hereditary ATTR amyloidosis. Methods The Transthyretin Amyloidosis Outcomes Survey (THAOS) is the first global, multicenter, longitudinal, observational survey that collects data on patients with ATTR amyloidosis. THAOS enrollment data were used to assess the prevalence of GI symptoms and to evaluate their impact on nutritional status (mBMI) and health-related quality of life (EQ-5D Index Score). Data from routine investigations of heart-rate variability and cardio-vascular response to tilt tests were utilized to evaluate the impact of autonomic neuropathy on the scintigraphically measured gastric emptying half-times in Swedish patients with hereditary ATTR amyloidosis. Gastric wall autopsy specimens from Japanese patients with hereditary ATTR amyloidosis and Japanese non-amyloidosis controls were analyzed with immunohistochemistry and computerized image analysis to assess the densities of interstitial cells of Cajal (ICC) and nervous tissue. Data from gastric emptying scintigraphies and validated questionnaires were used to evaluate the outcome of Swedish patients’ GI function after liver transplantation for hereditary ATTR amyloidosis. Results Sixty-three percent of the patients with TTR mutations and 15 % of those with wild-type ATTR amyloidosis reported GI symptoms at enrollment into THAOS. Subsequent analyses focused on patients with TTR mutations and, among them, unintentional weight loss was the most frequent symptom (32 %) followed by early satiety (26 %). Early-onset patients (<50 years of age) reported GI symptoms more frequently than late-onset cases (70 % vs. 50 %, p <0.01), and GI symptoms were more common in patients with the V30M mutation than in those with non-V30M mutations (69 % vs. 56 %, p <0.01). Both upper and lower GI symptoms were significant negative predictors of nutritional status and health-related quality of life (p <0.01 for both). Weak but significant correlations were found between gastric emptying half-times and the function of both the sympathetic (rs = -0.4, p <0.01) and parasympathetic (rs = -0.3, p <0.01) nervous systems. The densities of c-Kit-immunoreactive ICC were significantly lower in the circular (median density 0.0 vs. 2.6, p <0.01) and longitudinal (median density 0.0 vs. 1.8, p <0.01) muscle layers of the gastric wall in patients compared to controls. Yet, no significant differences in protein gene product 9.5-immunoreactive nervous cells were found between patients and controls either in the circular (median density 3.0 vs. 6.8, p = 0.17) or longitudinal (median density 1.4 vs. 2.5, p = 0.10) muscle layers. Lastly, the patients’ GI symptoms scores had increased slightly from before liver transplantation to the follow-ups performed in median two and nine years after transplantation (median score 7 vs. 10 vs. 13, p <0.01). However, their gastric emptying half-times (median half-time 137 vs. 132 vs. 125 min, p = 0.52) and nutritional statuses (median mBMI 975 vs. 991 vs. 973, p = 0.75) were maintained at follow-ups in median two and five years after transplantation. Conclusion GI disturbances are common in hereditary ATTR amyloidosis and have a negative impact on the patients’ nutritional status and health-related quality of life. Fortunately, a liver transplantation appears to halt the progressive GI involvement of the disease, although the patients’ GI symptoms tend to increase after transplantation. An autonomic neuropathy and a depletion of gastrointestinal ICC seem to contribute to the GI disturbances, but additional factors must be involved.

Das CHARGE-Syndrom ist ein autosomal dominant vererbtes Dysmorphiesyndrom. Meistens handelt es sich um sporadische Fälle. Nur für ca. 2/3 der Betroffenen konnte als Ursache eine Mutation im CHD7-Gen nachgewiesen werden.  In dieser Arbeit wurde eine Familie untersucht, in der zwei Kinder gesunder Eltern von einem CHARGE-Syndrom betroffen sind und die Mutation c.7302dupA heterozygot aufweisen. Die  ursächliche Mutation c.7302dupA ließ sich in den väterlichen Spermien nachweisen. Ein Gonadenmosaik konnte somit beim Vater der betroffenen Kinder bestätigt werden.  Eine Methode zur DNA-Analyse an Einzelspermien wurde etabliert, mittels derer der Grad des Mosaiks näher bestimmt werden konnte. In einer Stichprobe des untersuchten Falles trugen 16 von 59 der untersuchten Einzelspermien die Mutation c.7302dupA. Aus diesem Ergebnis lässt sich ein deutlich erhöhtes Wiederholungsrisiko bei einem weiteren Kind ableiten. Eine Interaktion von CHD7 mit CHD8 konnte durch einen direkten Yeast-Two-Hybrid nachgewiesen werden. Bestätigt wurde dieses Ergebnis durch den Nachweis der Ko-Lokalisation der beiden Proteine sowie durch ein Signal in einem bimolekularen Fluoreszenzkomplement-Assay. Im direkten Yeast-Two-Hybrid ließ sich die Interaktionsstelle im CHD7 auf den AS Bereich 1950–2172 mit den Domänen SANT und CR3 mit distalen und proximalen Überhängen eingrenzen.  Durch das Einfügen einer bei einem CHARGE-Patienten identifizierten Missense-Mutation p.Trp2091Arg in den entsprechenden CHD7-Abschnitt ließ sich keine Interaktion mit CHD8 im direkten Yeast-Two-Hybrid mehr nachweisen. Die Bedeutung dieser Missense-Mutation beim Wegfall der Interaktion zwischen CHD7 und CHD8 als Ursache für das CHARGE-Syndrom ist in diesem Fall anzunehmen.

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Ce travail de recherche vise à analyser les déterminants de la santé des enfants canadiens à travers des données de panels. Des enfants entre 0 et 1 an sont sélectionné en 1994 et sont suivit dans le temps jusqu'en 2009. On regarde comment les caractéristiques de la famille (revenu, famille monoparentale, état matrimonial) celles de l'enfant (sexe, poids gestationnel, prématuré à la naissance) ainsi que les antécédents de la mère durant la grossesse (habitudes de fumer et boire de l'alcool, problèmes prénataux, santé de la mère, l'éducation de la mère) influencent la santé de l'enfant. Les résultats trouvés par le biais d'estimation de modèle logit montrent que les facteurs comme l'état matrimonial, les problèmes éprouvés par la mère durant la grossesse ainsi que la santé de la mère sont les trois facteurs principaux qui influencent négativement la santé d'un enfant canadien. Le niveau d'éducation de la mère et la structure familiale sont aussi des déterminants importants de la bonne santé d'un enfant. Par ailleurs, les effets revenus sur la santé sont éliminés par les effets fixes. Après avoir contrôlé pour les caractéristiques individuelles de l'enfant et du ménage, on constate que le revenu influence positivement la probabilité que l'enfant soit en bonne santé, mais il est très faible dans le modèle RE et non significatif avec le modèle FE. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : santé de l'enfant, problèmes prénataux, programmation fœtale, poids gestationnel, modèle à effets fixes (FE), modèle à effets aléatoires (RE), effets marginaux, estimation logistique, variable dichotomique, facteur permanent, panel balancé.