Buscando o estabelecimento de base concreta para conservação dos fragmentos florestais em Ribeirão Preto, SP, foi efetuado o diagnóstico da vegetação natural no município. Existem 102 remanescentes florestais, e em 99 deles foi efetuado levantamento florístico expedito. Foram encontradas 494 espécies arbóreas, pertencentes a 74 famílias botânicas, além de 31 espécies exóticas. Baseada na composição de espécies de cada fragmento, foi efetuada análise de correspondência retificada (DCA), utilizando a classe de solo onde situa-se o fragmento como variável categórica. Esta análise indica a existência de quatro grupos de vegetação: Mata Mesófila, Mata Decídua, Mata Paludícola e Cerrado, que ocorrem, respectivamente, em Latossolo Roxo, Litossolo, Solo Hidromórfico e Latossolo Vermelho Escuro ou Latossolo Vermelho Amarelo. Cada grupo apresenta composição florística própria e fisionomia típica. A riqueza de espécies encontrada em cada fragmento variou de 13 a 134 espécies. Há um grande número de espécies com ocorrência rara – 275 espécies (52,38%) ocorrem em menos de 5% dos fragmentos, e nove espécies (1,71%) ocorrem em mais de 50% dos remanescentes. Há espécies com ocorrência rara em todos os fragmentos, mas elas tendem a ocorrer em maior número nos fragmentos maiores. Cada fragmento apresenta uma pequena porcentagem do total de espécies da formação, o que indica que, para conservar a diversidade de espécies, todos os fragmentos são importantes. Em geral, predominam nos fragmentos as espécies secundárias iniciais e zoocóricas, com uma tendência de aumentar a proporção de espécies pioneiras e anemocóricas com o aumento das perturbações antrópicas. A maioria dos fragmentos são pequenos e isolados. A análise do componente principal (PCA) mostrou que a área e a área core, fator de forma e dimensão fractal, e os índices de proximidade e similaridade são, respectivamente, os principais fatores atuantes nos três primeiros eixos. A área e a área core apresentaram correlação significativa e positiva com a riqueza de espécies nas Matas Mesófilas e Decíduas. A forma e o isolamento não apresentaram correlação com a riqueza de espécies. Considerando fatores biológicos (riqueza de espécies e proporção de espécies com ocorrência rara) e abióticos (área do fragmento, proporção de área core e índice de similaridade), foi construído o Valor de Conservação (VC), que permite hierarquizar os fragmentos de acordo com sua importância para conservação. A análise conjunta do resultado deste índice e a distribuição espacial dos fragmentos indica que há duas situações que merecem atenção: 1) muitos fragmentos com elevado valor de conservação situam-se em área de expansão urbana e, portanto, expostos a maior pressão antrópica; 2) há uma concentração de fragmentos grandes e próximos entre si, que apresentam elevado VC, na região sul do município, ao longo do ribeirão da Onça, que incluem matas mesófilas, matas paludícolas e cerrado. Em ambos os casos, é sugerida a criação de Áreas de Proteção Ambiental (APA), para potencializar as ações de conservação destas áreas. / In a search to establish a solid base for conservation of forest fragments in Ribeirão Preto, SP, a diagnosis of the natural vegetation of the municipality was done. There are 102 forest remnants and in 99 of them an expeditious floristic survey was carried out. In this survey, 494 tree species were found belonging to 74 botanic families along with 31 exotic species. Based on the species composition of each fragment, a Detrended Correspondence Analysis (DCA) was conducted using the soil class where the fragment is found as categorical variable. This analysis indicates the existence of four vegetation groups: mesophytic forests, deciduous forests, swampy forests and cerrado, that occur respectively in purple latosol, lithosol, hydromorphic soil and dark red latossol or yellow red latossol. Each group presents its own floristic composition and typical vegetation physiognomy. The richness of species found in each fragment was from 13 to 134 species. There is a very large number of species that are very difficult to find - 275 species (52,38%) that occur in less than 5% of the fragments and 9 species (1,71%) occur in more than 50% of the remnants. There are species with rare occurrences in all fragments, but they tend to occur in larger number in the bigger ones. Each fragment presents a small percentage of the total of species, which indicates that to preserve the species diversity all the fragments are important. Generally, the initial secondary and animal dispersed species predominate in the fragments with the tendency to increase the proportion of the pioneer and wind dispersed species with the increase of the human disturbance. The majority of the fragments are small and isolated. The Principal Component Analysis (PCA) shows that the area and the core area, shape factor and fractal dimension, and the proximity index and similarity are, respectively, the main factors acting on the first three axes. The area and the core area showed significant and positively correlated with the species richness in the mesophytic and deciduous forests. The shape and the isolation did not show correlation with the species richness. Considering the biological factors (richness and proportion of species with rare occurrence) and spatial patterns (fragment area, core area proportion and similarity index), the conservation value (VC) was built, which allows us to set a hierarchy of the fragments according to their importance to conservation. The joint analysis of the result of this index and the fragments spatial distribution indicates that there are two situations that deserve attention: 1) many fragments with high conservation value are located in the urban expansion area and therefore exposed to a bigger human disturbance; 2) There is a concentration of large fragments, which are close to each other, that show a high VC in the southern region of the municipality, along the Onça creek, that includes mesophytic forests,swampy forests and cerrado. In both cases the creation of Environmental Protection Areas (APA) are suggested in order to enhance the conservation actions in these areas.

Atualmente, existe um grande número de ferramentas para montagem de fragmentos de DNA disponíveis. Neste trabalho apresentamos um estudo comparativo das ferramentas CAP2, FAKtory, TIGR e PHRAP. Para realizarmos este estudo, primeiramente executamos esses sistemas de montagem sobre 12 casos de testes distintos. Após isso, tomamos os resultados obtidos por cada um deles e os comparamos com as seqüências de onde os fragmentos foram originalmente obtidos. Os testes utilizados avaliam a eficiências dos programas com relação a três problemas associados ao processo de montagem (erros no sequenciamento, fragmentos quimeras e regiões repetidas) e pudemos ver que nenhum dos sistemas é claramente superior aos demais no tratamento de todos eles. Cada ferramenta de montagem parece tratar de melhor forma um problema em especial.Além de avaliarmos os resultados, realizamos também um estudo. / Noways, several peckages for DNA fragment assembly are aviable. In this wok we present a comparative study of the preformances of the programs CAP2, FAKtory, TIGR e PHrap. To get to our objetives, we firt ran each of these programs on twelve intances. After this,we compared the outputs with the sequences from wich the fragments were originally obtained. In this comparison,we took into consideration three problems related to fragments assembly (sequencing errors, chimeric fragments and repeats regions). We conclude that no one of the packages we tested is more efficient than the others when considering all the problems cited above. If we consider a particular problem, the we observed different performances among the programs. Even more, we compare the packages with respect to theirs to CPU times.

A expansão da área urbana da Região Metropolitana de São Paulo vem pressionando, fragmentando e suprimindo os últimos remanescentes de florestas de Mata Atlântica. No entanto, a reconstituição do processo histórico de exploração florestal na região oeste da Grande São Paulo demonstrou que a fragmentação e a deterioração dos remanescentes advêm de atividades econômicas anteriores a urbanização, quando ainda a região estava inserida em uma paisagem de matriz rural. A dinâmica urbana na região, a partir de 1980, foi responsável pela formação de aterros, assentamentos habitacionais de baixo, médio e alto padrão e Rodoanel Mário Covas, produzindo uma trama espacial marcada pelo contraste e pela fragmentação. Em meio a essa trama, a mata da Fazenda TIZO, localizada na divisa dos municípios de São Paulo, Taboão da Serra, Embu, Cotia e Osasco apresenta uma formação florestal diversificada, caracterizada como mata em estágio sucessional médio à tardio com dinâmica regressiva. No intuito de resgatar o potencial ecológico dos remanescentes visando o desenvolvimento sucessional progressivo da mata, nosso trabalho demonstrou a necessidade de um plano de gestão que considere tanto o manejo dos fragmentos quanto intervenções que concilie a ocupação do entorno com a conservação. / Expansion of São Paulo Metropolitan Region\'s urban area comes pressuring, breaking up and suppressing the last remnants of Atlantic moist forest, the Mata Atlântica. However, reconstruction of historical process of forest exploration in the region demonstrated that this fragmentation and deterioration of remnants result from economic activities preceding urbanization, when region still was inserted in a rural matrix landscape. Urban dynamics from 1990, responsible for landfill formation, habitation settlement of low, average and high standard and Mário Covas roadway produced a scenery marked by contrast and fragmentation. In the middle of this scheme, the Farm TIZO forest fragments, located in the cities boundaries of São Paulo, Taboão da Serra, Embu, Cotia and Osasco presents a diversified forest formation, characterized as fragments from low secondary forest to high secondary forest with regressive dynamics. In intention of rescue ecological potential of remnants, aiming gradual development, our work demonstrated the necessity of restoration practice that makes possible increase of effective forest area and reduction of edge effect by means of action as integration of remnants, control of lianas and bamboos in open spaces and edges areas and formation of a corridor with surrounding fragments, between them the Caixa Beneficente\'s forest fragments of Military Police and other private areas.

A expansão da área urbana da Região Metropolitana de São Paulo vem pressionando, fragmentando e suprimindo os últimos remanescentes de florestas de Mata Atlântica. No entanto, a reconstituição do processo histórico de exploração florestal na região oeste da Grande São Paulo demonstrou que a fragmentação e a deterioração dos remanescentes advêm de atividades econômicas anteriores a urbanização, quando ainda a região estava inserida em uma paisagem de matriz rural. A dinâmica urbana na região, a partir de 1980, foi responsável pela formação de aterros, assentamentos habitacionais de baixo, médio e alto padrão e Rodoanel Mário Covas, produzindo uma trama espacial marcada pelo contraste e pela fragmentação. Em meio a essa trama, a mata da Fazenda TIZO, localizada na divisa dos municípios de São Paulo, Taboão da Serra, Embu, Cotia e Osasco apresenta uma formação florestal diversificada, caracterizada como mata em estágio sucessional médio à tardio com dinâmica regressiva. No intuito de resgatar o potencial ecológico dos remanescentes visando o desenvolvimento sucessional progressivo da mata, nosso trabalho demonstrou a necessidade de um plano de gestão que considere tanto o manejo dos fragmentos quanto intervenções que concilie a ocupação do entorno com a conservação. / Expansion of São Paulo Metropolitan Region\'s urban area comes pressuring, breaking up and suppressing the last remnants of Atlantic moist forest, the Mata Atlântica. However, reconstruction of historical process of forest exploration in the region demonstrated that this fragmentation and deterioration of remnants result from economic activities preceding urbanization, when region still was inserted in a rural matrix landscape. Urban dynamics from 1990, responsible for landfill formation, habitation settlement of low, average and high standard and Mário Covas roadway produced a scenery marked by contrast and fragmentation. In the middle of this scheme, the Farm TIZO forest fragments, located in the cities boundaries of São Paulo, Taboão da Serra, Embu, Cotia and Osasco presents a diversified forest formation, characterized as fragments from low secondary forest to high secondary forest with regressive dynamics. In intention of rescue ecological potential of remnants, aiming gradual development, our work demonstrated the necessity of restoration practice that makes possible increase of effective forest area and reduction of edge effect by means of action as integration of remnants, control of lianas and bamboos in open spaces and edges areas and formation of a corridor with surrounding fragments, between them the Caixa Beneficente\'s forest fragments of Military Police and other private areas.

O aumento do conhecimento sobre os mecanismos macromoleculares de diversas doenças tem permitido a identificação de vários alvos terapêuticos, porém o desenvolvimento de fármacos para esses alvos não seguiu na mesma velocidade. Além disso, a presença de padrões estruturais inovadores nesses fármacos é baixa. Neste cenário, buscamos, ao mapear o espaço químico medicinal de compostos heteroaromáticos, introduzir novos fragmentos úteis no desenvolvimento de compostos bioativos inovadores. Para tanto, duas abordagens foram avaliadas: 1) Estudo da viabilidade de síntese de dois núcleos heteroaromáticos sem síntese descrita na literatura. 2) Estudo de uma nova rota sintética para obtenção do núcleo furo[2,3-b]piridina, bem como a viabilidade de sua funcionalização e aplicação no desenvolvimento de compostos com atividade antituberculose. Em relação a primeira abordagem (Capítulo 1), para o núcleo 22 (piridazina-piridona) foi possível explorar uma rota sintética que, embora, ainda não tenha sido possível obter o composto desejado, o mesmo necessita apenas de uma etapa de aromatização para ser obtido. Já para o núcleo 20 (pirido-piridazinona), após o estudo de diversas estratégias sintéticas, foi possível obtê-lo, em baixos rendimentos, e, portanto, a otimização da rota sintética, bem como a completa caracterização dele, ainda serão necessários. Durante a exploração das diversas estratégias para a síntese do núcleo 20, foi possível, a partir de resultado inesperado em uma delas, verificar uma nova rota sintética para compostos furo[2-3-b]piridina substituídos nas posições C-2 e C-3, o que foi objeto de estudo da segunda abordagem descrita nesta tese (Capítulo 2). Utilizando condições brandas e livre de metais, foi possível obter diversas furanopiridinas com diferentes substituições em C-2 (arílico ou alquílico), utilizando diversos cloretos de ácidos ou anidridos. Além disso, foi verificado que o anel furânico do núcleo furanopiridínico é estável na reação de hidrólise do éster em C-3, porém quando na presença de hidrazina é formado um novo padrão estrutural com anel pirazolona, proveniente da abertura do anel furano. Em relação a reatividade química da porção piridínica desse núcleo, em reações de ativação da ligação C-H, foi possível realizar a borilação seguida de acoplamento cruzado de Suzuki na posição C-5. Já arilação radicalar ocorreu em C-4 e a fluorinação direta em C-6. Porém, os rendimentos destas reações não foram satisfatórios. Com isso, foi avaliado a reatividade do derivado N-óxido da furanopiridina com diferentes agentes ativantes e nucleófilos. Com o uso de anidrido tríflico como agente ativante, foi possível a iodação em C-5, bromação em C-4 e hidroxilação em C-4 e C-6. Já utilizando PyBroP, como ativante, foi possível realizar reações de aminação nas posições C-4, C-5 e C-6. Esses compostos tiveram a atividade biológica contra Mycobacterium tuberculosis avaliada, onde um dos compostos apresentou atividade promissora, tanto contra cepas laboratoriais, quanto cepas de isolados clínicos multirresistentes. Além disso, esse composto apresentou alto índice de seletividade, e por ser um fragmento, permitirá futuras otimização estruturais. / The increasing knowledge about the macromolecular mechanisms of different diseases allowed the identification of several therapeutic targets over the years. However, the development of drugs to these targets did not follow the same rate. In addition, the introduction of innovative frameworks in new drugs is unsatisfactory. In this scenario, we aim to introduce new useful fragments for application in the development of innovative bioactive compounds, by charting the medicinal chemical space of heteroaromatic compounds. For this purpose, two approaches were evaluated: 1) Develop a feasible synthetic strategy to obtain two new heteroaromatic cores (Cores 20 and 22); 2) Develop a new synthetic route to obtain the furo[2,3-b]pyridine core, chemical elaborate it and screening it against Mycobacterium tuberculosis. For the first approach (Chapter 1), one aromatization step is needed to obtain core 22 (pyridazine-pyridone). On the other hand, after evaluating several synthetic strategies, it was possible to obtain core 20 (pyrido-pyridazinone) in low yields. Therefore, a synthetic route optimization and a complete characterization are still required for 20. An unexpected result in attempt to obtain core 20, resulted in a new synthetic route to furo[2-3-b]pyridine, C-2 and C- 3 substituted, that was explored in the second approach (Chapter 2). Using mild and metal-free conditions, it was possible to obtain various furopyridines with different substitutions patterns at C-2 (aryl or alkyl) using either acyl chlorides or anhydrides. In addition, the furan moiety in this core, showed to be stable under the C-3-ester hydrolysis, however, in solution, hydrazine opens the furan ring to form a new pyrazolone ring. Regarding the chemical reactivity of the pyridine moiety in the furopyridine core, it was possible to perform the C-H borylation followed by Suzuki coupling reaction at the C-5 position. Furthermore, radical arylation at C-4 and direct fluorination at C-6 had not satisfactory yields. Therefore, the reactivity of the furopyridine N-oxide derivative with nucleophiles using different activating agents was studied. Using triflic anhydride, as an activating agent, it was possible to iodinate at C-5, brominated at C-4 and hydroxylated at C-4 and C-6. Using PyBroP, as an activator, it was possible to perform amination reactions at positions C-4, C-5 and C-6. In the end, our in-house library of furopyridines was screened against Mycobacterium tuberculosis and it was found a promising selective bioactive compound against different multidrug-resistant strains of this mycobacteria. Furthermore, this compound is a fragment, which will allow future structural optimization.

Centrado em dezessete fragmentos da mélica grega arcaica (final do século VII a meados do VI a.C.), este trabalho consiste no estudo da representação de Afrodite nos poetas Álcman, Alceu, Estesícoro, Íbico e Anacreonte. Desse modo, esta tese de doutoramento dá continuidade à dissertação de mestrado já publicada em livro, na qual realizei o mesmo estudo em catorze fragmentos mélicos de Safo (c. 630 - 580 a.C.). Com o recorte agora realizado, o retrato da deusa torna-se ainda mais multifacetado neste que é um dos gêneros poéticos mais importantes da literatura grega antiga, a mélica. Na busca de apreender os movimentos executados nos desenhos de Afrodite pelos cinco poetas mélicos do corpus desta tese, privilegiei a análise interpretativa dos fragmentos sem perder de vista elementos provenientes de outros gêneros poéticos, da iconografia e de registros extraliterários. Procurei, assim, superar, na medida do possível, a precariedade material mais ou menos acentuada das canções fragmentárias e dar conta de uma personagem que não pertence exclusivamente à poesia, mas também a outros gêneros artísticos, à história e à religião gregas. / Concentrated on seventeen fragments of the archaic Greek melic poetry (end of 7th to the middle of 6th centuries B.C.), this work consists in the study of Aphrodites representation in the songs of Alcman, Alcaeus, Stesichorus, Ibycus and Anacreon. Thus, the present graduation thesis gives sequence to the Masters dissertation that has already been published as a book, and in which fourteen melic fragments of Sappho (c. 630 - 580 B.C.) are studied according to the same approach. Now, in this work, the goddesss portrait is even more enhanced in its multiple aspects, despite being fragmented, and inserted in one of the most important genres of ancient Greek literature set within a specific historic period. In the effort to apprehend the movements executed in the drawings of Aphrodite by the five poets in the corpus of this thesis, I have favored the interpretative analysis of the fragments without overlooking the elements originated from other poetic genres, iconographic tradition and extra-literary records. By doing so, I have attempted to overcome, as much as possible, the precariousness of the material, somewhat more or less evident in the fragmented songs, and to understand in-depth a divine character that is not confined to poetry, but pertains to other artistic genres, as well as to Greek history and religion.

A Doença de Chagas, endêmica na América Latina, é causada pelo parasito tripanossomatídeo Trypanosoma cruzi e atualmente já se espalha para o restante do mundo devido à migração humana. Os dois medicamentos disponíveis para o tratamento dessa doença, o Nifurtimox, (banido do Brasil), e o Benzonidazol, são eficazes somente na etapa aguda da doença e possuem efeitos colaterais severos. Recentemente, três novas substâncias para o tratamento chegaram à fase clínica de testes contra essa doença, mas ainda é necessária a pesquisa de novas moléculas contra esse parasito. A enzima Gliceraldeído-3-fosfato Desidrogenase (GAPDH) foi selecionada como alvo para busca de moléculas potencialmente tripanossomicidas. De forma a inibir essa enzima, a busca de moléculas baseou-se na abordagem de fragmentos moleculares para encontrar substâncias com elevada eficiência de ligante. A partir de um banco de dados comercial de 500 mil moléculas, filtros moleculares de solubilidade e da Regra dos Três foram aplicados para montar uma biblioteca focalizada de moléculas. Essa biblioteca foi submetida a estudos integrados baseados na estrutura do alvo macromolecular (docagem) e do substrato da enzima (similaridade química e eletrostática) e a inspeção visual dos fragmentos bem classificados em ambas técnicas foi realizada de modo a selecionar cinco compostos de classes químicas diversas. Essas substâncias foram submetidas a ensaios enzimáticos in vitro por meio de espectroscopia de fluorescência, sendo encontrado então um fragmento com Ki de (425 ± 53) μM e eficiência de ligante de 0,33, valor bastante promissor para abordagem baseada em fragmentos moleculares. Estudos de simulação por Dinâmica Molecular (MD) foram feitos para as cinco moléculas adquiridas, com energia de interação ligante-enzima calculada usando o método MM-GB/SA. A classificação das moléculas por essa energia foi idêntica à obtida experimentalmente. Além disso, a MD possibilitou a predição de modo de interação dos fragmentos no sítio ativo da TcGAPDH e a identificação de uma nova cavidade passível de modulação de sua atividade. Uma segunda série de fragmentos foi selecionada baseada no fragmento ativo de modo a construir uma relação estrutura-atividade (SAR) teórica por MD. A SAR sugere que a presença de um átomo nitrogênio capaz de doar ligações de hidrogênio é importante para a interação, com o resíduo de aminoácido Asp210. Este resíduo de aminoácido desponta como um possível ponto de seletividade para a enzima humana, que possui uma leucina nessa posição. Além disso, a posição na substituição do anel central também está diretamente relacionada à interação da molécula com a enzima, com uma substituição 2,3 em um anel de cinco membros a mais favorável. Este trabalho identificou pela primeira vez um fragmento molecular com alta eficiência de ligante para a enzima TcGAPDH, com o auxílio do uso conjunto de técnicas baseadas na estrutura do ligante e do alvo, para seleção de moléculas, e espectroscopia de fluorescência para identificação de atividade inibitória frente à enzima. Método de simulação por MD conseguiu reproduzir os resultados experimentais e prover informações teóricas de SAR para o composto ativo. / Chagas disease is a parasitic illness endemic in Latin America caused by the trypanosomatid parasite Trypanosoma cruzi that spreads around the world due to people migration. Nowadays, Benznidazole and Nifurtimox (banned in Brazil), are used for the treatment of this disease but causes severe side effects to patients. Recently, three new molecules have reached clínical trials phase in the development of drugs against Chagas disease but it is still necessary to develop new drugs. In this studies, the enzyme Glyceraldehyde-3-phosphate Dehydrogenase (GAPDH) was used as a target for the search of new antitrypanosomatid molecules. It belongs to the glycolytic pathway, the major one for parasite\'s energy generation. With the aim searching a new molecule that inhibits this enzyme, the fragment-based approach guided the search of molecules with high ligand efficiency. A focused compound library was assembled from a database of 500,000 molecules using molecular and solubility filters and the Rule of Three. The integrated use of ligand (chemical and electrostatic similarity) and target (molecular docking) based drug design was carried out to rank the molecular fragments by a consensual score. Through visual inspection of the top 500 molecules five diverse fragments were selected for the in vitro enzymatic assays using fluorescence spectroscopy. One of these molecules shows a Ki equals to (425 ± 53) μM and ligand efficiency equals to 0,33, a promising value for the fragment-based approach. Additionally, Molecular Dynamics simulations (MD) were carried out with these fragments and the predicted energy of interaction for fragment-enzyme complex was able to rank the molecules as using the experimental results. Furthermore, the MD was useful to predict the mode of interaction of the fragments in the active site of enzyme and to reveal a new cavity close to the substrate binding site. A second generation of compounds was selected based on the structure of the active fragment to construct theoretical structure-activity relationship (SAR) using MD. SAR indicates that the presence of a nitrogen with hydrogen-bond donor property is important to the interaction, making hydrogen-bonding with the amino acid residue Asp210. In addition, MD shows the influence of different substituent posítion in the central ring in the energy of the interaction, with a 2,3 substitution at five-atom ring the most favorable. This study identifies the first molecular fragment with high ligand efficiency for the enzyme TcGAPDH, with the combined use of ligand and target-based tools and fluorescence spectroscopy, for selection and identification of active compounds against the enzyme. MD was able to reproduce experimental results and generate theoretical information of SAR to the active molecular fragment.

The Northeastern Atlantic Forest of Brazil contains thousands of forest fragments at different stages of regeneration, some recovering from abandoned agricultural fields, while others recovering from chronic disturbances such as fire, logging, and poaching. Some of these fragments kept protected for several reasons: corporate responsibility, compliance with the forest code, preservation of biodiversity, among others. Although these fragments are far from having the same species richness of plant and animal, they can perform important ecosystem services, such as protection of water bodies, reservoir of important nutrients and carbon (C). This is especially important if we consider that there are global initiatives such as REDD + with the objective of assessing secondary forests and forests in recovery process as important C pools. On the other hand, the management and preservation of these fragments depends on a solid knowledge about their structure and nutrient cycle. There is a relatively rich literature on the loss of biodiversity in these Northeastern forest fragments. Much less is available, however, about the structure and function of these fragments. This work intends to contribute to fill this gap, providing solid scientific information on four forest areas and a secondary forest, where a restoration program was implemented in the State of Alagoas, Northeast of Brazil. After a brief introduction, chapter one discusses the structure of these fragments through a complete forest inventory, where individuals density, height and diameter at breast height (DBH) were measured for each tree with DBH >= 10 cm. With these allometric data, we estimated the basal area and aboveground live biomass (AGLB), comparing these attributes with other estimates available in the literature. In chapter two, we investigated the distribution of nutrients in the forest fragments, where we measured the foliar concentration of C, nitrogen (N) and phosphorus (P). At the same time, we measured the litterfall mass in each fragment and its nutrient content for a one year period of sampling. With this information we were able to establish how these areas cycled their main limiting nutrients and C. Finally, in the last chapter we approached the partition of C and nutrient stocks, above and belowground, in order to evaluate the importance of C pools and nutrients in the forest fragments and understand the role of these fragments in a world that urgently needs to store C in a sustainable reservoir. / A Floresta Atlântica do Nordeste do Brasil contém milhares de fragmentos de florestas em diferentes estágios de regeneração, alguns se recuperando de campos agrícolas abandonados, enquanto outros se recuperam de distúrbios crônicos como incêndio, extração de madeira e caça furtiva. Alguns desses fragmentos ficaram protegidos por várias razões: responsabilidade corporativa, cumprimento do código florestal, preservação da biodiversidade, entre outros. Embora estes fragmentos estejam longe de ter a mesma riqueza de espécies vegetais e animais, podem desempenhar importantes serviços ecossistêmicos, como proteção de corpos d\'água, reservatório de importantes nutrientes e carbono. Isso é especialmente importante se considerarmos que há iniciativas globais como o REDD+ que visam avaliar florestas secundárias e de recuperação como importantes reservatórios de carbono (C). Por outro lado, a gestão e preservação destes fragmentos dependem de um conhecimento sólido sobre a sua estrutura e ciclo de nutrientes. Há uma literatura relativamente rica sobre a perda de biodiversidade nestes fragmentos florestais do Nordeste. No entanto, muito menos está disponível sobre a estrutura e o funcionamento destes fragmentos. Este trabalho pretende contribuir para o preenchimento desta lacuna, fornecendo informações científicas sólidas sobre quatro áreas florestais e uma floresta secundária, onde foi implantado um programa de restauração no Estado de Alagoas, Nordeste do Brasil. Após uma breve introdução, o capítulo um discute a estrutura desses fragmentos através de um inventário florestal completo, onde a densidade indivíduos, sua altura e diâmetro à altura do peito (DAP) foram medidos para cada árvore com DAP >= 10 cm. Com esses dados alométricos, estimamos a área basal e a biomassa viva acima do solo (AGLB), comparando esses atributos com outras estimativas disponíveis na literatura. No capítulo dois, investigamos a distribuição de nutrientes nos fragmentos florestais, onde medimos a concentração foliar de C, nitrogênio (N) e fósforo (P). Ao mesmo tempo, medimos durante um ano a massa da serapilheira em cada fragmento e seu teor de nutrientes. Com essas informações pudemos estabelecer como essas áreas ciclam seus principais nutrientes limitantes e C. Finalmente, no último capítulo abordamos a partição dos estoques de C e nutrientes, acima e abaixo do solo, com o objetivo de avaliar a importância dos pools de C e nutrientes nos fragmentos de floresta e entender qual o papel desses fragmentos em um mundo que necessita urgentemente estocar C em um reservatório sustentável.

A partir do desencantamento do mundo natural, no século XVI, ocorrem alterações na relação ambiente e sociedade, possibilitando a poluição e depredação do meio para o acumulo de capital. E desde então, o modelo de desenvolvimento, amplamente difundido nas áreas rurais, vem promovendo a degradação ambiental e fragmentação florestal. Esta, por sua vez, está diretamente relacionada com a tomada de decisão dos moradores das áreas rurais, em suas práticas, sendo esta condicionada ao sistema cultural vigente. A hipótese testada foi de que quanto maior é a relação dos moradores das propriedades rurais com o mercado e a vida urbana, menor é a conservação dos fragmentos florestais e o objetivo deste estudo foi avaliar a relação existente entre as práticas dos moradores rurais do município de Jacareí e a presença dos fragmentos. Pretendeu-se também identificar quais práticas seriam compatíveis com os pressupostos de sustentabilidade, em suas diferentes dimensões, numa realidade concreta, de tal modo que tal análise pudesse contribuir como subsídios para propostas de políticas públicas voltadas para esse enfoque. Realizou-se um estudo de caso da área rural de Jacareí onde foram selecionadas 6 propriedades rurais localizadas em 10 estradas principais do município, totalizando uma amostra de 60 unidades. A escolha das propriedades foi aleatória, sendo realizada entrevista semi-estruturada e observação in loco dos fragmentos e quintais florestais. Identificou-se que existem práticas que podem contribuir para a não conservação e ou/preença dos fragmentos florestais, principalmente naquelas propriedades relacionadas com o mercado, com monocultivo e também aquelas de lazer. Observou-se também que existem também diferentes culturas e práticas que contribuem com a conservação dos atributos naturais e dos fragmentos florestais, como os policultivos e os sistemas agroflorestais, alem da agricultura familiar, que estão inseridas em uma perspectiva ambiental da sustentabilidade. Foi possível estabelecer que as estratégias para alcançá-la implicam na ampliação e valorização da agricultura familiar e dos sistemas agroflorestais ali existentes. Estas estratégias constituem-se o ponto de partida para o planejamento de políticas públicas voltadas ao meio rural sendo necessário também considerar os aspectos que privilegiam as outras dimensões da sustentabilidade, além da ecológica. / From the disenchantment of the natural world in the sixteenth century, changes in the environment and society relationship occurred, allowing pollution and depredation of the environment for the accumulation of capital. And since then, the development model, widespread in rural areas, has been promoting environmental degradation and forest fragmentation. This, in turn, is directly related to the decision making of the residents of rural areas in their practice, which is subject to prevailing cultural system. The hypothesis tested was that the greater the ratio of residents of rural properties with the market and urban life, lower conservation of forest fragments and objectives of this study were to evaluate the relationship between practices of rural residents of the municipality of Jacarei and conservation of fragments. Also, to identify which practices would be consistent with the assumptions of sustainability in its various dimensions, in reality, so that this analysis could contribute as grants for proposals for public policies that focus. We conducted a case study of the rural area where Jacarei 6 were selected farms located in 10 major roads of the city, in a sample of 60 units. The choice of properties was random, semi-structured interviews and on-site observation of forest fragments and backyards being held. It was identified that there are practices that do not promote the conservation of forest fragments, especially those properties related to the market, and also those with monoculture leisure. It was also observed that there are different cultures and practices that promote the conservation of natural attributes and forest fragments, as polycultures and agroforestry systems beyond the family farm, that are inserted into an environmental sustainability perspective. It was possible to establish that the strategies to achieve it imply the expansion and enhancement of family agriculture and agroforestry therein. These strategies constitute the starting point for planning aimed at rural public policy is also necessary to consider the aspects that favor the other dimensions of sustainability, ecological beyond.

O município de São Luiz do Paraitinga, SP, originalmente coberto pela Floresta Atlântica estabelecida sobre os mares de morros do Planalto Atlântico, testemunhou o uso intensivo da terra que resultou em uma paisagem onde predominam pequenos fragmentos de floresta secundária. Considerando práticas agrícolas orientadas pela topografia nesta paisagem, avaliei o efeito da orientação e inclinação das vertentes na cobertura florestal e na estrutura da vegetação. Orientadas por aspectos produtivos, as preferências de utilização tiveram efeitos expressivos na configuração da paisagem. Enquanto as pastagens ocorreram preferencialmente nas vertentes mais produtivas (norte/leste), a cobertura florestal concentrou-se nas vertentes opostas e nas áreas mais declivosas, de mais difícil cultivo e acesso. A regeneração florestal ocorreu preferencialmente nas vertentes sul e nas maiores declividades, enquanto o desmatamento relativo foi maior nas vertentes norte/leste. Podemos apontar na configuração da paisagem uma origem híbrida, determinada pelas preferências (atributos culturais) e topografia (atributo natural), associados, que não poderia ser explicada por domínios separados de natureza e cultura. A estrutura da vegetação dos fragmentos desta paisagem está correlacionada apenas parcialmente com intervenções humanas que dependem da topografia, podendo sofrer influência, também, de intervenções associadas a outros elementos da paisagem, como a propriedade rural. As ações humanas, suas origens variadas e seus efeitos sobre a vegetação podem ser mais bem compreendidos de forma contextualizada, associados aos processos sociais em curso na paisagem. Ao incluirmos a ação humana nos modelos de paisagem, podemos compreender melhor os processos envolvidos na produção (e degradação) destas paisagens e ficar mais aptos a elaborar propostas de conservação adequadas às paisagens fragmentadas / This study was carried out in São Luiz do Paraitinga a county located in a hilly area in Southeastern Brazil that was originally covered by Atlantic Rainforest. The region has a history of intensive land use which resulted in a severely fragmented landscape. Under the hypothesis that agricultural practices and topography are closely linked in this landscape, I evaluated the effect of slopes orientation and inclination in forest cover and vegetation structure. Land use preferences had significant effects in shaping the landscape. While land use occurred mainly in most productive slopes (north/east), forest covered preferentially south and west facing slopes and steeper slopes. Forest regeneration occurred mainly on south facing slopes and steeper slopes, while deforestation was higher on north/east facing slopes. We propose that the landscape configuration has a hybrid origin, a product of the interplay between human choices (cultural attributes) and topography (a natural attribute), and which could not be explained by separate domains of nature and culture. Vegetation structure was only partly correlated with human interventions that are related to topography, and could also be influenced by actions related to other landscape elements, such as rural properties. Human actions, their varied origins and their effects on vegetation can be better understood if linked to social processes. Hence, if we want to improve our understanding on landscapes production and degradation, as well as propose conservation strategies appropriate to fragmented landscapes we need to explicitly include human activity in our landscape models.