Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3702.pdf: 4025151 bytes, checksum: 2e413c751a3db69e16a3736b9236c225 (MD5) Previous issue date: 2011-03-09 / Financiadora de Estudos e Projetos / Forest fragmentation and habitat loss in tropical regions are implicated for different organisms responses, with special attention to avian species susceptible to disturbance. They react negatively in the face of changes in their habitats, reducing population size. In this scenario, the riparian forests play an important role as refuge for many species of birds. This study aimed to survey the avifauna of two riparian forests belonging to the Batalha River, West-central region of the state of São Paulo. The birds were described according to their composition, guild structures, degree of dependence on forest quality and level of sensitively to disturbances. Altogether, the census methods applied across the paths and point counts revealed a total of 162 bird species distributed in 48 families and 21 orders, among which 98 were forests, 14 endemic to other kind of vegetation, 3 endangered, 8 near threatened 32 abundant residents and various insectivorous specialists. These results testify the important contribution of riparian forests of west-central of São Paulo state in the conservation of local birds that are sensitive to the fragmentation. / Fragmentação florestal e perda de hábitat em regiões tropicais têm suscitado diferentes respostas em diferentes organismos, com especial atenção às espécies sensíveis a perturbações e dependentes de florestas. Estas reagem negativamente frente às alterações em seus hábitats, reduzindo em tamanho populacional. Neste cenário as matas ciliares exercem importante papel como refúgio para diversas espécies de aves. O presente estudo teve por objetivos inventariar as aves de dois fragmentos ciliares pertencentes ao Rio Batalha, região centro-oeste paulista. A avifauna foi caracterizada quanto à sua composição e estrutura, bem como em relação à ocorrência de espécies dependentes e semi-dependentes de florestas, as quais respondem mais sensivelmente a perturbações em seus hábitats. O censo quali-quantitativo, aplicado através dos métodos de trajetos e de pontos de escuta, revelou uma riqueza de 162 espécies de aves somando a avifauna de ambas as áreas, distribuídas em 48 famílias e 21 ordens. Foram identificadas 98 espécies florestais, sendo 27 migratórias, 14 endêmicas a outras formações, 3 ameaçadas de extinção, 8 quase ameaçadas, 32 residentes abundantes e várias insetívoras e frugívoras especialistas. Esses resultados são suficientes para demonstrar a relevante contribuição de matas ciliares do Rio Batalha na conservação da avifauna regional, sensível ao processo de fragmentação. Palavras-chave:, guildas tróficas. 2

Submitted by MYRTHES MARIA MATOS DANTAS (myrthesmmdantas@gmail.com) on 2017-10-31T23:20:17Z No. of bitstreams: 1 Professores inesquecíveis fragmentos experiências atravessamentos final.pdf: 1645613 bytes, checksum: 895949d08bb90ee1a9f38ea56b9788d4 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-11-13T13:15:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dantas_mmm_me_rcla.pdf: 1645613 bytes, checksum: 895949d08bb90ee1a9f38ea56b9788d4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-13T13:15:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dantas_mmm_me_rcla.pdf: 1645613 bytes, checksum: 895949d08bb90ee1a9f38ea56b9788d4 (MD5) Previous issue date: 2017-08-31 / O presente estudo, de cunho qualitativo, tem como propósito compreender quais experiências tornaram determinados professores inesquecíveis para seus alunos. Justifica-se pelo entendimento de que educação e emoção, sendo indissociáveis, capacitam o professor para provocar os “atravessamentos”, segundo Larrossa (2002) aquilo que nos toca, que nos passa e que ao passar nos transforma, assim tornando-o inesquecível aos olhos de seus alunos. O estudo desenvolveu-se no município de Poços de Caldas, em Minas Gerais, tendo como participantes 63 alunos e 04 professores entre os indicados pelos alunos como inesquecíveis, abrangendo alunos que estudaram e professores que atuaram no período compreendido entre 1980 e 2010. Para alcançar o objetivo foram utilizadas como estratégias de pesquisa e instrumentos de coleta de dados: a pesquisa bibliográfica, questionários aplicados aos alunos e entrevistas semiestruturadas com os professores indicados. Com base na discussão a respeito da experiência (Larrosa Bondía, 2007), da memória (Benjamin, 1985), da emoção Vigotsky (1998), Wallon (2007) e demais autores referenciados, pode-se concluir que a emoção que permeia a relação entre alunos e professores, sendo provocada pelas experiências que vivenciam juntos, constitui sua memória e pode marcar sua subjetividade, transformando-os para sempre. E, ainda, que alguns professores se tornaram inesquecíveis para seus alunos - ao transformar suas vidas, ao marcá-las com algo significativo, muitas vezes absolutamente apartado dos conteúdos que ensinou, mas com muito valor para sua constituição como ser singular. As escolhas por esses professores basearam-se tanto em características pessoais quanto profissionais, mas, principalmente, na qualidade das experiências vivenciadas em conjunto e na emoção que fluiu da convivência com eles. / The purpose of this qualitative study is to understand which experiences have made certain teachers unforgettable for their students. It is justified by the understanding that education and emotion, being indissociable, enable the teacher to provoke the "crossings", according to Larrossa (2002) what touches us, that passes us and that when passing makes us, thus making it unforgettable to the eyes of his students. The study was developed in the municipality of Poços de Caldas, in Minas Gerais, with 63 students and 04 teachers among those indicated by the students as unforgettable, covering students who studied and teachers who worked during the period between 1980 and 2010. To achieve the objective was used as research strategies and data collection instruments: bibliographic research, questionnaires applied to students and semi-structured interviews with the indicated teachers. Based on the discussion about the experience (Larrosa Bondía, 2007), memory (Benjamin, 1985), the emotion Vygotsky (1998), Wallon (2007) and other authors referenced, it can be concluded that the emotion that permeates the relationship between students and teachers, being provoked by the experiences they experience together, constitutes their memory and can mark their subjectivity, transforming them forever. And yet, some teachers have become unforgettable to their students - by transforming their lives by marking them with something meaningful, often quite apart from the content they taught, but with great value to their constitution as a unique being. Choices for these teachers were based on both personal and professional characteristics, but mainly on the quality of the experiences lived together and the emotion that flowed from living with them.

[pt] Nos últimos anos surgiram novas tecnologias de sequenciamento de DNA conhecidas como NGS - Next-Generation Sequencing. Estas são responsáveis por tornar o processo de sequenciamento mais rápido e menos custoso, mas também trazem como resultado fragmentos de DNA muito pequenos, conhecidos como reads. A montagem do genoma a partir destes fragmentos é considerada um problema complexo devido à sua natureza combinatória e ao grande volume de reads produzidos. De maneira geral, os biólogos e bioinformatas escolhem o programa montador de sequências sem levar em consideração informações da eficiência computacional ou da qualidade biológica do resultado. Esta pesquisa tem como objetivo auxiliar aos usuários biólogos a avaliar a qualidade dos resultados da montagem. Primeiramente, foi projetada e desenvolvida uma metodologia para obter informações dos genes presentes na montagem, listando os genes que podem ser identificados, aqueles que têm o tamanho correto e a sequência de pares de bases correta. Em segundo lugar, foram realizados testes experimentais exaustivos envolvendo cinco dos principais montadores de genoma conhecidos na literatura os quais são baseados no uso de grafos de Bruijn e oito genomas de bactérias. Foram feitas comparações estatísticas do resultado usando as ferramentas QUAST e REAPR. Também foram obtidas informações qualitativas dos genes usando o algoritmo proposto e algumas métricas de eficiência. Em função dos resultados coletados, é feita uma análise comparativa que permite aos usuários conhecer melhor o comportamento das ferramentas consideradas nos testes. Por fim, foi desenvolvida uma ferramenta que recebe diferentes resultados de montagens de um mesmo genoma e produz um relatório qualitativo e quantitativo para o usuário interpretar os resultados de maneira integrada. / [en] New DNA sequencing technologies, known as NGS - Next-Generation Sequencing, are responsible for making the sequencing process more efficient. However, they generate a result with very small DNA fragments, known as reads. We consider the genome assembly from these fragments a complex problem due to its combinatorial nature and the large volume of reads produced. In general, biologists and bioinformatics experts choose the sequence assembler program with no regard to the computational efficiency or even the quality of the biological result information. This research aims to assist users in the interpretation of assembly results, including effectiveness and efficiency. In addition, this may sometimes increase the quality of the results obtained. Firstly, we propose an algorithm to obtain information about the genes present in the result assembly. We enumerate the identified genes, those that have the correct size and the correct base pair sequence. Next, exhaustive experimental tests involving five of the main genome assemblers in the literature which are based on the use of graphs of Bruijn and eight bacterial genomes data set were ran. We have performed statistical comparisons of results using QUAST and REAPR tools. We have also obtained qualitative information for the genes using the proposed algorithm and some computational efficiency metrics. Based on the collected results, we present a comparative analysis that allows users to understand further the behavior of the tools considered in the tests. Finally, we propose a tool that receives different assemblies of the same genome and produces a qualitative and quantitative report for the user, enabling the interpretation of the results in an integrated way.

Orientador: Renata Giassi Udulutsch / Banca: Ciro Cesar Zanini Branco / Banca: Marcelo Henrique Ongaro Pinheiro / Resumo: Matas ciliares são formações florestais encontradas às margens dos corpos d'água. São caracterizadas pela irregularidade de seus limites e pela sua heterogeneidade florística, uma vez que o leito desses corpos d'água encontra-se em constante transformação. Por apresentarem diferenças florísticas e estruturais mesmo entre fragmentos não tão distantes, somadas à escassez de estudos sobre as matas ciliares da região centro-oeste paulista, foi então elaborado o presente trabalho. Um inventário florestal foi criado, então, a fim de conhecer a composição florística, estrutura vegetacional e ainda atestar o atual estado de conservação da mata ciliar de um remanescente florestal na microbacia Água da Cachoeira, em Paraguaçu Paulista, SP. Através do método de parcelas, foram coletados 518 indivíduos, pertencentes a 29 famílias e 70 espécies diferentes. A partir dos dados observados sobre cada indivíduo foram elaboradas, num primeiro momento, a lista de espécies e a chave de identificação baseada em caracteres vegetativos. Depois, foram ainda elaboradas tabelas sobre a estrutura vegetacional e gráficos de distribuição dos indivíduos em classes de tamanhos. Em relação à florística, observou-se alta riqueza de espécies, sendo que as mais abundantes já tiveram ocorrência documentada para esse tipo de formação florestal. Também foi observada grande quantidade de indivíduos de porte arbóreo e grande quantidade de espécies pioneiras. Quanto à parte estrutural, observou-e que os táxons mais f... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Riparian forests are vegetational formations found on the margins of water bodies. They are characterized by the irregularity of their limits and by their floristic diversity, since the margins of water bodies are constantly changing. By presenting floristic and structural differences even among close forestal fragments, together with the lack of studies on the riparian forests of the São Paulo's midwest region, this study was then conducted. A forest inventory was made in order to know the floristic composition, vegetation structure, and to testify the current conservation state of a riparian forest on a forest remnant at the "Água da Cachoeira" watershed in Paraguaçu Paulista, SP. Through the plots method, we collected 518 individuals belonging to 29 families and 70 different species. From the observed data on each individual we prepared, at first, the list of species and the identification keys based on vegetative characters. Then, tables about the vegetation structure and distribution charts of the individuals' size classes were also prepared. Regarding the flora, there was a high species richness, being that the most abundant species already had their presence documented for this kind of vegetational formation. We also observed a large amount of tree-sized individuals and a lot of pioneer species. As for the structural part, we have noticed that the most frequent and abundant taxa are similar to those verified in other studies conducted in the region, however, common spe... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Maria José de Oliveira Campos / Banca: Roberta Cornélio Ferreira Nocelli / Banca: Sidnei Mateus / Resumo: Os Euglossini distribuem-se exclusivamente na região neotropical. Os machos são facilmente atraídos por terpenóides e hidrocarbonetos aromáticos sintéticos, análogos àqueles presentes nas fragrâncias florais. Essa técnica tem auxiliado no conhecimento da fauna de diferentes áreas biogeográficas, revelando novas espécies. Nos últimos anos, a preocupação crescente com a perda de biodiversidade em seu sentido mais amplo vem se manifestando entre os pesquisadores que estudam aspectos da biologia e ecologia de abelhas, em grande parte, pelo reconhecimento da forte dependência de espécies de plantas cultivadas e nativas em relação às abelhas para a polinização. A habilidade dos Euglossini de se dispersarem e encontrarem flores isoladas e iscas aromáticas distantes tem levado à sugestão de que as abelhas atraídas para as fragrâncias vem de uma vasta área que pode incluir diferentes habitats. Este trabalho teve por objetivos: (1) Conhecer a composição e a diversidade de espécies, a fenologia e o uso de habitats da comunidade de Euglossini de uma área composta por fragmentos de Mata Atlântica, de diferentes tamanhos, em Jacutinga, Sul de Minas Gerais. (2) Avaliar o padrão de deslocamento das diferentes espécies entre esses fragmentos. Abelhas Euglossini foram coletadas em quatro fragmentos de diferentes tamanhos e diferentes graus de degradação na Serra da Forquilha, município de Jacutinga, MG com auxilio de iscas aromáticas. As coletas foram realizadas mensalmente, no período de abril de 2007 a março de 2008. Para analisar a similaridade entre as estações, foi utilizado o Coeficiente de Correlação de Pearson e a Análise Multivariada Conglomerada. A diversidade de espécies foi avaliada por meio dos índices de Shannon - Winner e Índice de Simpson.. Foram coletados 1778 machos de Euglossini, pertencentes a quatro gêneros e dez espécies. As espécies mais...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The orchid bees are distributed exclusively in the Neotropics. The males are easily attracted by terpenoids and aromatic hydrocarbons, synthetic analogs to those found in floral fragrances. This technique has helped in the knowledge of fauna from different biogeographic areas, revealing new species. In recent years, the growing concern over the loss of biodiversity in its broadest sense has manifested itself among researchers who study aspects of biology and ecology of bees in large part by the recognition of the strong dependence of species of cultivated and native plants in relation to bees for pollination. The ability of orchid bees to disperse and find isolated flowers and scented baits far has led to the suggestion that bees attracted to the fragrance comes in a vast area that may include different habitats. This study aimed to: (1) Know the composition and species diversity, phenology and habitat use of community Euglossini an area composed of Atlantic forest fragments of different sizes, Jacutinga, South of Minas Gerais. (2) To assess the pattern of displacement of various species between these fragments. Euglossini were collected in four fragments of different sizes and different degrees of degradation in Mountain Fork, City of Jacutinga, MG aromatic with the aid of bait. Samples were collected monthly between April 2007 and March 2008. To analyze the similarity between the stations, we used the correlation coefficient of Pearson and Multivariate Analysis Conglomerate. Species diversity was assessed by the Shannon - Winner and Simpson index. We collected 1778 male orchid bees, belonging to four genera and ten species. The most abundant species were Eulaema nigrita, Euglossa annectans, Eufriesea violacea and Euglossa truncata. Eucalyptol was more efficient scented bait attracting 49.6% of males of all ten species. The largest number of males was collected in hot and humid season... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Mauro Galetti Rodrigues / Coorientador: Milton Cezar Ribeiro / Supervisor: Carlos Peres / Banca: Adriano Garcia Chiarello / Banca: Luciano Martins Verdade / Resumo: A crescente demanda por fontes alternativas de energia tem contribuído para o aumento da produção de biocombustíveis, levando a fragmentação dos habitats naturais. No entanto, paisagens naturais imersas em matrizes agrícolas podem reter uma diversidade de espécies considerável, mas os efeitos da mudança no uso do solo para a produção de biocombustíveis sobre a persistência das espécies nessas paisagens ainda permanecem incertos. A Mata Atlântica, ecossistema mais fragmentado do Brasil, tem apenas cerca de 12% de sua cobertura vegetal original. A maioria destes remanescentes estão distribuídos em fragmentos pequenos e isolados devido à expansão agrícola, especialmente pela monocultura de cana-de-açúcar. No presente estudo examinamos a riqueza e a composição de mamíferos de médio e grande porte, e quantificamos a contribuição da cobertura florestal, da área estrutural e da quantidade de borda sobre a persistência desses animais. Amostramos 20 paisagens fragmentadas, em um gradiente de cobertura florestal (3% a 96%), imersas em plantações de cana-de-açúcar. Registramos apenas 50% das espécies esperadas de mamíferos de médio e grande porte em todas as 20 paisagens, em comparação com o maior remanescente de floresta semidecídua, o "Parque Estadual Morro do Diabo". Isso nos mostra que esses remanescentes de Mata Atlântica estão altamente empobrecidos, restando apenas25% de espécies especialistas florestais, e a maioria dos mamíferos registrados são espécies generalistas, exóticas e típicas de cerrado. A cobertura florestal foi importante para explicar apenas a presença de alguns ungulados e um roedor de médio porte. As comunidades de mamíferos responderam à substituição de espécies entre as paisagens, que representou 94% da β-diversidade total. Nosso estudo é novo em mostrar que a riqueza de mamíferos não foi afetada pela quantidade de ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The growing demand for alternative energy sources has contributed to increased biofuel production, leading to fragmentation of natural habitats. However, natural landscapes immersed in agricultural matrices can retain a considerable diversity of species, but the effects of the change in land use for the production of biofuels on the persistence of the species in these landscapes remain unclear. The Atlantic Forest, the most fragmented ecosystems in Brazil, has only about 12% of its original vegetation cover. The most of these remnants are distributed in small and isolated fragments due to agricultural expansion, especially by the sugarcane monocultures. In the present study we examined the richness and composition of medium and large sized mammals, and quantify the contribution of the forest cover, the structural area and the edge amount over persistence of these animals. We sampled 20 fragmented landscapes on a forest cover gradient (3% to 96%), immersed in sugarcane plantations. We recorded only 50% of expected species of medium and large sized mammals in all the 20 landscapes, compared to the largest remnant of semideciduous forest, the "Morro do Diabo State Park". This shows that the Atlantic Forest remnants are highly depleted, with only 25% of forest-specialist species and most of the mammals registered are generalist species, exotic and typical from savana. Forest cover was important to explain only the presence of some ungulates and a medium sized rodent. The mammal communities responded to a high turnover of species between the landscapes, which represented 94% of the total β- diversity. Our study is novel in showing that mammal richness was not affected by the habitat amount. It is important to implement effective conservation measures in natural areas in agricultural landscapes in order to develop measures of restoration of forest cover of the fragments, because they are ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-09-03Bitstream added on 2014-06-13T20:40:06Z : No. of bitstreams: 1 cardosojunior_jcs_me_rcla.pdf: 998865 bytes, checksum: 7dd38885a45ca0a706b052a988a29e8f (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Os Euglossini distribuem-se exclusivamente na região neotropical. Os machos são facilmente atraídos por terpenóides e hidrocarbonetos aromáticos sintéticos, análogos àqueles presentes nas fragrâncias florais. Essa técnica tem auxiliado no conhecimento da fauna de diferentes áreas biogeográficas, revelando novas espécies. Nos últimos anos, a preocupação crescente com a perda de biodiversidade em seu sentido mais amplo vem se manifestando entre os pesquisadores que estudam aspectos da biologia e ecologia de abelhas, em grande parte, pelo reconhecimento da forte dependência de espécies de plantas cultivadas e nativas em relação às abelhas para a polinização. A habilidade dos Euglossini de se dispersarem e encontrarem flores isoladas e iscas aromáticas distantes tem levado à sugestão de que as abelhas atraídas para as fragrâncias vem de uma vasta área que pode incluir diferentes habitats. Este trabalho teve por objetivos: (1) Conhecer a composição e a diversidade de espécies, a fenologia e o uso de habitats da comunidade de Euglossini de uma área composta por fragmentos de Mata Atlântica, de diferentes tamanhos, em Jacutinga, Sul de Minas Gerais. (2) Avaliar o padrão de deslocamento das diferentes espécies entre esses fragmentos. Abelhas Euglossini foram coletadas em quatro fragmentos de diferentes tamanhos e diferentes graus de degradação na Serra da Forquilha, município de Jacutinga, MG com auxilio de iscas aromáticas. As coletas foram realizadas mensalmente, no período de abril de 2007 a março de 2008. Para analisar a similaridade entre as estações, foi utilizado o Coeficiente de Correlação de Pearson e a Análise Multivariada Conglomerada. A diversidade de espécies foi avaliada por meio dos índices de Shannon – Winner e Índice de Simpson.. Foram coletados 1778 machos de Euglossini, pertencentes a quatro gêneros e dez espécies. As espécies mais... / The orchid bees are distributed exclusively in the Neotropics. The males are easily attracted by terpenoids and aromatic hydrocarbons, synthetic analogs to those found in floral fragrances. This technique has helped in the knowledge of fauna from different biogeographic areas, revealing new species. In recent years, the growing concern over the loss of biodiversity in its broadest sense has manifested itself among researchers who study aspects of biology and ecology of bees in large part by the recognition of the strong dependence of species of cultivated and native plants in relation to bees for pollination. The ability of orchid bees to disperse and find isolated flowers and scented baits far has led to the suggestion that bees attracted to the fragrance comes in a vast area that may include different habitats. This study aimed to: (1) Know the composition and species diversity, phenology and habitat use of community Euglossini an area composed of Atlantic forest fragments of different sizes, Jacutinga, South of Minas Gerais. (2) To assess the pattern of displacement of various species between these fragments. Euglossini were collected in four fragments of different sizes and different degrees of degradation in Mountain Fork, City of Jacutinga, MG aromatic with the aid of bait. Samples were collected monthly between April 2007 and March 2008. To analyze the similarity between the stations, we used the correlation coefficient of Pearson and Multivariate Analysis Conglomerate. Species diversity was assessed by the Shannon - Winner and Simpson index. We collected 1778 male orchid bees, belonging to four genera and ten species. The most abundant species were Eulaema nigrita, Euglossa annectans, Eufriesea violacea and Euglossa truncata. Eucalyptol was more efficient scented bait attracting 49.6% of males of all ten species. The largest number of males was collected in hot and humid season... (Complete abstract click electronic access below)

Espécies de Brucella são causadoras da brucelose, uma das doenças zoonóticas mais difundidas em todo o mundo, que é causa aborto em animais domésticos e infecção potencialmente debilitante em humanos. Apesar da identificação de diferentes espécies dentro do gênero, baseada na diferença de hospedeiro e patogenicidade, o gênero tem sido descrito como geneticamente homogêneo. Técnicas moleculares têm sido empregadas com o intuito de diferenciar e tipificar estes microrganismos, sendo que a abordagem mais promissora visa a identificação de polimorfismos entre as espécies e biovares. O objetivo do trabalho foi analisar o perfil genético de diferentes cepas de B. abortus obtidos a partir da técnica de SE-AFLP a fim de determinar a sequência dos fragmentos obtidos e genes que poderiam estar presentes nos fragmentos selecionados e compará-las com bancos de genes e de proteínas de procariotos. Foram selecionados 19 fragmentos, que foram purificados, sequenciados e, as sequências obtidas, submetidas a diversas ferramentas de bioinformática visando sua caracterização e identificação. Nenhum dos fragmentos de nucleotídeos apresentou similaridade entre si e/ou com outra sequência já conhecida de outros microrganismos, inclusive com sequências conhecidas do gênero Brucella. Das 114 proteínas hipotéticas geradas pela tradução destas sequências genômicas 57% (65 sequências) apresentaram baixo grau de similaridade com proteínas descritas e disponíveis em BLASTp (proteínas não-redundantes e SwissProt), variando entre 29 e 43. Do total de proteínas similares 85% foram atribuídas e proteínas funcionais e 14% a proteínas hipotéticas. Essas novas sequências deverão ser utilizadas em outros trabalhos visando verificar sua abrangência e especificidade dentro das espécies e biovares de Brucella. / Brucella species are the cause of brucellosis, one of the most widespread zoonotic diseases around the world, which is cause abortion in domestic animals and potentially debilitating infection in humans. Despite the identification of different species within the genus, based on the difference of host and pathogenicity, the genre has been described as genetically homogeneous. Molecular techniques have been employed in order to differentiate and classify these organisms, and the most promising approach aims to identify polymorphisms between species and biovars. The objective of this study was to analyze the genetic profile of different strains of B. abortus obtained by the technique of SE-AFLP to determine the sequence of the fragments obtained and genes that may be present in the selected fragments and compare them to databases of genes and proteins in prokaryotes. We selected 19 fragments that were purified, sequenced and the sequences obtained, subject to several bioinformatics tools aiming at its characterization and identification. None of the fragments showed nucleotide similarity between themselves and / or other sequence already known from other organisms, including known sequences of the genus Brucella. Of the 114 hypothetical proteins generated by translation of genomic sequences 57% (65 sequences) showed low level of similarity to proteins described and available in blastp (protein non-redundant and SwissProt), ranging between 29 and 43. Of the proteins similar 85% were attributed to functional proteins and 14% to hypothetical proteins. These new sequences should be used in other studies to verify its completeness and specificity within the species and biovars of Brucella.

Este trabalho é dedicado ao estudo de reações de fissão de núcleos pesados induzidas por fótons e prótons a energias intermediárias e altas, fazendo uso, para tanto, do código de Monte Carlo CRISP, sendo um trabalho inteiramente computacional. Estudou-se um novo conjunto de parâmetros para a fórmula de massa semi-empírica proposta por Pearson em seu trabalho de 2001, a partir da qual se passou à simulação de reações de fissão induzidas por fótons dos núcleos 208Pb, 232Th, 237Np e 238U, e fissão induzida por prótons nos núcleos 197Au, 208Pb, 237Np e 241Am. Os modelos de Bohr e Wheeler para fissão, de 1939, e o modelo de Weisskopf para emissão de partículas de 1937 foram empregados na simulação. Para os parâmetros de densidade de níveis, um conjunto de parâmetros foi obtido para as fórmulas empíricas de Dostrovsky de 1958 e para a razão de fissão. Foram calculadas seções de choque de fotofissão para os núcleos 208Pb, 232Th, 237Np e 238U, produtos de reações de spallation induzidas por prótons nos núcleos 208Pb e 197Au, e distribuições de massa dos fragmentos de fissão em reações de Bremsstrahlung com o 238U e em reações induzidas por prótons com os núcleos 197Au, 208Pb, 237Np e 241Am. São apresentadas comparações a dados experimentais de todos os cálculos realizados. Também se obteve um modelo para aproximar os valores de barreira de fissão obtidos pelo método ETFSI (Extended Thomas-Fermi plus Strutinsky Integral). / This work is dedicated to the study of heavy nuclei fission induced by intermediate- and high-energy photons and protons, by using to this end the Monte Carlo code CRISP, therefore being an entirely computacional work. A new set of parameters for the 2001 semi-empirical mass formula proposed by Pearson is studied. Then we simulate fission reactions induced by photons and protons on 208Pb, 232Th, 237Np and 238U, and fission induced by protons on 197Au, 208Pb, 237Np e 241Am. The Bohr-Wheeler model for describing the fission process and the Weisskopf model for the emission probability of particles were used to perform the calculation. Regarding the level density parameters, a set of parameters is presented for the empirical formulas of Dostrovsky and for the fission ratio. This work also presents calculated fotofission cross section for induced reactions on 208Pb, 232Th, 237Np and 238U nuclei, spallation products of proton induced reactions on 208Pb and 197Au, and fragment mass distributions of Bremsstrahlung reactions with 238U and of proton induced reactions on 197Au, 208Pb, 237Np and 241Am. Comparisons to experimental data are shown for all calculations. A model to aproximate the fission barrier values obtaind by the ETFSI - Extended Thomas-Fermi plus Strutinsky Integral method is also presented.

A partir do desencantamento do mundo natural, no século XVI, ocorrem alterações na relação ambiente e sociedade, possibilitando a poluição e depredação do meio para o acumulo de capital. E desde então, o modelo de desenvolvimento, amplamente difundido nas áreas rurais, vem promovendo a degradação ambiental e fragmentação florestal. Esta, por sua vez, está diretamente relacionada com a tomada de decisão dos moradores das áreas rurais, em suas práticas, sendo esta condicionada ao sistema cultural vigente. A hipótese testada foi de que quanto maior é a relação dos moradores das propriedades rurais com o mercado e a vida urbana, menor é a conservação dos fragmentos florestais e o objetivo deste estudo foi avaliar a relação existente entre as práticas dos moradores rurais do município de Jacareí e a presença dos fragmentos. Pretendeu-se também identificar quais práticas seriam compatíveis com os pressupostos de sustentabilidade, em suas diferentes dimensões, numa realidade concreta, de tal modo que tal análise pudesse contribuir como subsídios para propostas de políticas públicas voltadas para esse enfoque. Realizou-se um estudo de caso da área rural de Jacareí onde foram selecionadas 6 propriedades rurais localizadas em 10 estradas principais do município, totalizando uma amostra de 60 unidades. A escolha das propriedades foi aleatória, sendo realizada entrevista semi-estruturada e observação in loco dos fragmentos e quintais florestais. Identificou-se que existem práticas que podem contribuir para a não conservação e ou/preença dos fragmentos florestais, principalmente naquelas propriedades relacionadas com o mercado, com monocultivo e também aquelas de lazer. Observou-se também que existem também diferentes culturas e práticas que contribuem com a conservação dos atributos naturais e dos fragmentos florestais, como os policultivos e os sistemas agroflorestais, alem da agricultura familiar, que estão inseridas em uma perspectiva ambiental da sustentabilidade. Foi possível estabelecer que as estratégias para alcançá-la implicam na ampliação e valorização da agricultura familiar e dos sistemas agroflorestais ali existentes. Estas estratégias constituem-se o ponto de partida para o planejamento de políticas públicas voltadas ao meio rural sendo necessário também considerar os aspectos que privilegiam as outras dimensões da sustentabilidade, além da ecológica. / From the disenchantment of the natural world in the sixteenth century, changes in the environment and society relationship occurred, allowing pollution and depredation of the environment for the accumulation of capital. And since then, the development model, widespread in rural areas, has been promoting environmental degradation and forest fragmentation. This, in turn, is directly related to the decision making of the residents of rural areas in their practice, which is subject to prevailing cultural system. The hypothesis tested was that the greater the ratio of residents of rural properties with the market and urban life, lower conservation of forest fragments and objectives of this study were to evaluate the relationship between practices of rural residents of the municipality of Jacarei and conservation of fragments. Also, to identify which practices would be consistent with the assumptions of sustainability in its various dimensions, in reality, so that this analysis could contribute as grants for proposals for public policies that focus. We conducted a case study of the rural area where Jacarei 6 were selected farms located in 10 major roads of the city, in a sample of 60 units. The choice of properties was random, semi-structured interviews and on-site observation of forest fragments and backyards being held. It was identified that there are practices that do not promote the conservation of forest fragments, especially those properties related to the market, and also those with monoculture leisure. It was also observed that there are different cultures and practices that promote the conservation of natural attributes and forest fragments, as polycultures and agroforestry systems beyond the family farm, that are inserted into an environmental sustainability perspective. It was possible to establish that the strategies to achieve it imply the expansion and enhancement of family agriculture and agroforestry therein. These strategies constitute the starting point for planning aimed at rural public policy is also necessary to consider the aspects that favor the other dimensions of sustainability, ecological beyond.