Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas, Université des Antilles et de La Guyane, Faculté de sciences, Technologies et Santé École Doctorale Santé, Environnement et Sociétés dans les Amériques Spécialité Chimie des Substances Naturelles, 2011. / Submitted by Sabrina Silva de Macedo (sabrinamacedo@bce.unb.br) on 2012-06-28T16:19:24Z No. of bitstreams: 1 2011_CharlieBasset.pdf: 16646080 bytes, checksum: 202b47b76e9f64d6a4083eb5ff9d032a (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-04T12:05:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_CharlieBasset.pdf: 16646080 bytes, checksum: 202b47b76e9f64d6a4083eb5ff9d032a (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-04T12:05:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_CharlieBasset.pdf: 16646080 bytes, checksum: 202b47b76e9f64d6a4083eb5ff9d032a (MD5) / Hoje em dia, a descoberta de novos agentes terapêuticos para o tratamento de doenças fúngicas torna-se essencial. Algumas árvores da Amazônia desenvolveram ao longo daevolução metabólitos secundários de defesa, para proteger-se contra a degradação. Estas mesmas substâncias vegetais podem tornar-se candidatas potenciais para o desenvolvimento de compostos antifúngicos. Esta tese de doutorado descreve a seleção bio-inspirada e a coletade espécies da floresta amazônica da Guiana Francesa possuidoras de madeira altamente resistente aos fungos; a partir das quais é proposto isolar, identificar e valorizar os metabólitos secundários responsáveis da durabilidade natural, e estudar as suas propriedades em fungos patogénicos humanos. O estudo levou ao isolamento de substâncias inéditas e forneceu informações adicionais quimiotaxonômicas importantes para as espécies estudadas. No mais,foi possível estabelecer que duas substâncias podem ser relevantes para o desenvolvimento de terapias antimicóticas. ______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / It is now essential to discover new therapeutic agents against the increase of human fungal infections. On the other hand, some Amazonian trees have succeeded to develop a chemical defense arsenal to protect themselves against fungal degradation. These compounds of plantorigin could become potential candidates for the development of antifungal compounds forthe treatment of human fungal diseases. The refore, this manuscript describes the bio-inspiredselection and collection of Amazonian tree species capable of specializing a highly fungi resistant wood; from which it is proposed to isolate, identify and valorize the secondary metabolites responsible for the natural durability, and study their properties on human pathogenic fungi. Ultimately, this study led to the isolation of new compounds and providingad ditional important chemotaxonomic information for the species studied. In addition, it asbeen established that two compounds could be relevant for the development of antimitotic therapies.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4524_1.pdf: 1014823 bytes, checksum: 229bebccea6d48b1fba480a067d1f57e (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Microrganismos endofíticos são encontrados em praticamente todas as plantas na natureza. Estes microrganismos residem no interior dos tecidos vegetais onde podem manter relações simbióticas, produzindo ou contribuindo para a produção de substâncias bioativas que poderão favorecer o desenvolvimento da planta. Essas substâncias, uma vez isoladas e caracterizadas, têm grande potencial para serem utilizadas pela medicina. Na maioria das vezes estas substâncias são produzidas por microrganismos endofíticos isolados de plantas utilizadas na medicina popular. Conyza bonariensis (L.) Cronquist, pertence à família Asteraceae, é popularmente conhecida como rabo-de-raposa. É utilizada pela medicina popular contra micoses superficiais. Foram isolados da planta Conyza bonariensis 53 fungos, 126 bactérias e quatro actinobactérias endofíticas. Houve maior ocorrência de bactérias nas raízes (16,33%) enquanto nas folhas houve maior predominância de fungos (10%). As actinobactérias apresentaram freqüência muito baixa (1,3%). A atividade antimicrobiana foi avaliada pelo método do Bloco de Gelose contra Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Escherichia coli, Mycobacterium tuberculosis, Candida albicans, Malassezia furfur e M. simpodialis. As linhagens que apresentaram melhor atividade foram selecionadas para teste de difusão em disco dos seus fermentados. Eb26F, Eb3F, Eb30F, EbR84 apresentaram melhor atividade em meio Czapek (120h); EbR83 e EbR33, em meio MPE (120h), para a linhagem EbR32 o melhor meio foi BD (120h) e para a actinobactéria EbR49A o meio ISP-3 (72h). Os halos de inibição variaram entre 10mm e 30mm

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:53:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5151_1.pdf: 5837644 bytes, checksum: 29f0e27f501213ff6bdad1f536b88dd9 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Os Myxomycetes constituem um grupo de protistas com 870 espécies, distribuídas em microhabitats diversificados. Eles desempenham importante papel entre os decompositores e na cadeia alimentícia da microfauna. As 218 espécies previamente descritas para o Brasil distribuem-se nas cinco regiões do país, mas a mixobiota de muitos estados ainda não foi descrita. No que se refere a Sergipe, a única espécie referida é Perichaena depressa Lib., apesar deste estado possuir condições climáticas e vegetacionais adequadas ao desenvolvimento dos Myxomycetes. Com o objetivo de ampliar o conhecimento sobre a distribuição dos Myxomycetes nos Neotrópicos e fornecer as primeiras informações sobre a mixobiota do estado de Sergipe, foi desenvolvido um estudo sobre as espécies de Liceales e Physarales que ocorrem na Estação Ecológica Serra de Itabaiana - EESI (10º 40 52 S e 37º 25 15 W, 4389,76 ha, 180-670m alt.), em diferentes fisionomias vegetacionais. Entre abril de 2002 e dezembro de 2003, foram coletados esporocarpos em 19 excursões (4 dias cada) realizadas em diferentes estações do ano e localidades (Floresta Estacional Decidual, Floresta de Galeria, Campo limpo, Campo sujo e Cerrado); 590 cultivos em câmara-úmida foram preparados com casca de árvores vivas (Anacardiaceae, Apocynaceae, Veloziaceae e dicotiledôneas não identificadas), troncos mortos, liter do chão da Floresta e do Cerrado, folhas mortas ainda presas à planta-mãe (Arecaceae, Bromeliaceae, Veloziaceae), plantas suculentas (Bromeliaceae, Cactaceae) e fezes de coelho brasileiro (Sylvilagus brasiliensis L.) e cavalo (Equus caballus L.). Exsicatas representativas das coleções encontram-se depositadas nos herbários UFP (Universidade Federal de Pernambuco, Recife) e MA-Fungi (Real Jardín Botânico de Madri). Foram obtidas 1213 coleções, entre as quais estão representadas 15 espécies de Liceales e 31 de Physarales, pertencentes às famílias Cribrariaceae (Cribraria, 6 spp.), Didymiaceae (Diachea¸1sp., Diderma, 4spp., Didymium, 2 spp.), Liceaceae (Licea, 1 sp.), Physaraceae (Badhamia, 1 sp., Craterium, 3spp., Fuligo, 1 sp., Physarella, 1 sp., Physarum, 18 spp.) e Reticulariaceae (Lycogala, 3 spp., Reticularia, 1 sp., Tubifera, 4 spp.). Todos os táxons constituem primeira referência para o estado de Sergipe. Os espécimes obtidos em culturas de fezes representam 10 morfoespécies, distribuídas nas famílias Cribrariaceae (4 spp.), Physaraceae (2 spp.), Stemonitaceae (1 sp.) e Trichiaceae (3spp.). Todas estas espécies constituem as primeiras referências sobre mixomicetos coprófilos para o Brasil. Cribraria cancellata (Batsch) Nann.-Bremek., C. microcarpa (Schrad.) Pers., Metatrichia vesparia (Batsch) Nann.-Bremek. e Physarum roseum Berk. & Broome estão sendo referidas pela primeira vez como coprófilas em âmbito mundial. A distribuição de Tubifera dimorphoteca Nann.-Bremek. & Loer. foi ampliada na América do Sul e Comatricha aff. mirabilis R. K. Benj. & Poitras, Diachea silvaepluvialis M.L. Farr, Diderma rugosum (Rex) T. Macbr., Didymium dubium Rostaf. e Physarum pulcherrimum Berk. & Ravenel, estão sendo referidas pela primeira vez para o Brasil. Com base no estudo desenvolvido na EESI, três artigos foram produzidos: o primeiro deles inicia o catálogo descritivo da mixobiota de Sergipe, com as espécies de Liceales registradas nos diferentes ambientes, o segundo trata as Physarales ocorrentes na EESI, com a apresentação de uma espécie ainda não descrita de Physarum e novas ocorrências para Sergipe e Brasil; o terceiro trata do grupo das coprófilas, ainda não explorado no país e que se revelou restrito ao ambiente de cerrado na EESI

Submitted by Rafael Santana (rafael.silvasantana@ufpe.br) on 2018-01-31T19:41:15Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Aline Dantas de Oliveira.pdf: 7187935 bytes, checksum: 2f865a50020bf3264c45bd86c0acd251 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-31T19:41:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Aline Dantas de Oliveira.pdf: 7187935 bytes, checksum: 2f865a50020bf3264c45bd86c0acd251 (MD5) Previous issue date: 2016-03-30 / CAPES / Fungos endofíticos são uma fonte ainda pouco explorada de metabólitos biologicamente ativos com as diversas atividades biotecnológica, incluindo atividade terapêutica na saúde e produção de enzimas de importância comercial, como as proteases e lipases. Desta forma, o presente estudo teve como objetivo principal avaliar o potencial biotecnológico de extratos e líquidos metabólitos de fungos endofíticos de macaúba e cana-de-açúcar, testando os mesmos para produção de enzimas, atividade antimicrobiana, bem como atividade citotóxica e antiTrypanosoma. Foram estudados 23 fungos endofíticos de semente de macaúba e gomos de cana de açúcar. Dentre os 23 isolados, dois pertencentes aos gêneros Aspergillus e Fusarium produziram liquido metabólico com atividade bacteriostática ou bactericida frente a várias bactérias patogênicas ao homem, a saber: Escherichia coli, Acinetobacter baumannii, Shigella flexneri, Kocuria rhizophila, Staphylococcus aureus meticilina resistente, Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus oxacilina resistente, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa e Staphylococcus epidermidis. Os mesmos líquidos metabólicos não apresentaram atividade antifúngica frente as quatro espécies de Candida sp. testadas. Além dos líquidos foram testados os extratos metanólicos extraídos dos micélios fúngicos quanto à ação antiproliferativa de Trypanosoma cruzi e citotoxicidade celular de macrófagos da linhagem J774, não apresentando efeito de inibição do crescimento de T. cruzi, e apresentando citotoxicidade maior que a droga controle. Quanto a produção de enzimas, os fungos não apresentaram produção significativa de proteases, lipases, amilases e celulases. Desta forma, os resultados mostram a necessidade de ampliar as pesquisas sobre o potencial químico presente no líquido metabólito produzido por esses fungos endofíticos para testar, bem como apresenta potencial atividade antibacteriana dos fungos estudados. / Endophytic fungi are an unexplored source of biologically active metabolites with diverse biotechnological activities, including therapeutic activity in health and the production of enzymes of commercial importance, such as proteases and lipases. Thus, the present study had as main objective to evaluate the biotechnological potential of extracts and liquid metabolites of endophytic fungi of macaúba and sugarcane, testing them for the production of enzymes, antimicrobial activity, as well as cytotoxic and anti- Trypanosoma. Twenty - three endophytic fungi from macaúba seed and sugar cane buds were studied. Among the 23 isolates, two belonging to the genus Aspergillus and Fusarium produced metabolic liquid with bacteriostatic or bactericidal activity against bacteria pathogenic to man: Escherichia coli, Acinetobacter baumannii, Shigella flexneri, Kocuria rhizophila, Staphylococcus aureus resistant methicillin, Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus resistant oxacillin, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus epidermidis. The same metabolic liquids do not present antifungal activity as four species of Candida sp. Tested. In addition to the fluids extracted from fungal mycelia, the antiproliferative action of Trypanosoma cruzi and cellular cytotoxicity of J774 macrophages showed no inhibitory effect on T. cruzi growth and showed a higher cytotoxicity than a drug control. As for the production of enzymes, fungi did not present significant production of proteases, lipases, amylases and cellulases. Thus, the results show a need to expand as research on the chemical potential present in the liquid metabolite produced by these endophytic fungi to test, as well as to present antibacterial activity of the fungi studied.

Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-04-17T17:51:11Z No. of bitstreams: 1 TESE Jhonathan Paúl Gamboa Trujillo.pdf: 2620813 bytes, checksum: 96a128b87c4fa407ba4fdde8f41cfab8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-17T17:51:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE Jhonathan Paúl Gamboa Trujillo.pdf: 2620813 bytes, checksum: 96a128b87c4fa407ba4fdde8f41cfab8 (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / CAPES / O presente trabalho analisa as espécies de macrofungos comestíveis comercializados em mercados tradicionais de cidades situadas na Cordilheira dos Andes, Equador, pesquisando nomes vernaculares, formas de consumo, fluxos de comércio, valor de importância etnomicológica e valor nutricional. Foram visitados 18 mercados em comunidades indígenas em 10 cidades na cordilheira andina equatoriana. A identificação morfológica das espécies foi sustentada pela análise molecular. Cinco espécies foram encontradas: Agaricus pampeanus (kallamba, kallamba blanca, kallamba de Finados), Auricularia fuscosuccinea (orejas de mono), Coprinus comatus (kallamba blanca), Gymnopus nubicola (kallamba café) e Suillus luteus (kallamba de pino). Agaricus pampeanus, G. nubicola e S. luteus apresentam interesse comercial-tradicional, enquanto A. fuscosuccinea e C. comatus são usadas para troca de mercadorias. As espécies possuem altos teores protéicos, constituindo uma boa fonte de energia e fibra. Basidiomas possuem valor etnomicológico nas comunidades indígenas equatorianas e constituem recurso importante para sua alimentação. Técnicas moleculares atuais são úteis em estudos etnomicológicos, complementando as pesquisas tradicionais. / This current work analizes the species of macrofungi sold in traditional markets in the Andes Ecuador, researching vernacular names, forms of consumption, trade flows, ethnomycological importance value, and also their nutritional value and taxonomy supported by classical and molecular identification. Eighteen markets in the indigenous communities were visited in 10 cities of the Ecuadorian Andes. Five species were found: Agaricus pampeanus, Auricularia fuscosuccinea, Coprinus comatus, Gymnopus nubicola, Suillus luteus and the morphological identification was supported by the molecular identification. Agaricus pampeanus, G. nubicola e S. luteus were of commercial and traditional interest, while A. fuscosuccinea and C. comatus were used to exchange. The species had high protein content and constitute a good source of energy and fiber. The basidiomata have ethnomicological value in the Ecuadorian indigenous communities and are an important resource for alimentation. Molecular techniques are useful in etnomycological studies, complementing the traditional research.

Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-06-20T19:45:57Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Franz de Assis Graciano dos Santos.pdf: 4554992 bytes, checksum: c66c9124f25e700f6bc29151f2450b37 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-20T19:45:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Franz de Assis Graciano dos Santos.pdf: 4554992 bytes, checksum: c66c9124f25e700f6bc29151f2450b37 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / CNPQ / Os biofilmes microbianos são comunidades de microrganismos irreversivelmente aderidos a uma superfície que produzem substância polimérica extracelular, a formação de biofilme é relevante devido à contínua liberação de microrganismos que o compõe, os quais mostram fenótipo diverso daquele encontrado na forma planctônica. Candida parapsilosis, atualmente dividida em três espécies distintas, apresentam notória capacidade de formação de biofilmes em cateteres e outros dispositivos implantados. Assim, este trabalho teve objetivos determinar a ação antifúngica e antibiofilme in vitro e in vivo, isolada e sinérgica, de fluconazol e ácido acetilsalicílico frente a modelo experimental de endocardite por espécies do complexo C. parapsilosis. Os isolados foram revisados e caracterizado morfisiologicamente e por técnicas proteômicas. Assim, 20 isolados fenotipicamente classificados como C. parapsilosis foram reclassificados. A atividade antifúngica das drogas foi determinada seguindo as condições descritas no documento M27-S4 do Clinical Laboratory Standards Institute. A Concentração Inibitória Fracionária (FIC) foi avaliada através das combinações de Ácido Acetilsalicilico, fluconazol e Anfotericina B, usando o método de diluição chequerboard. Na sequência Os testes de aderência foram baseados nos trabalhos de Kimura e Pearsall, 1978. Os biofilmes foram preparados usando-se o modelo de placa de microtitulação e quantificados por metodologia colorimétrica do ensaio de redução de hidróxido de tetrazolium (XTT) para avaliação da viabilidade celular, antes e após tratamento. Adicionalmente, empregou-se o uso de microscopia eletrônica de varredura para observação da arquitetura dos biofilmes do complexo C. parapsilosis. O desafio experimental e avaliação clínica, seguiu o modelo murino neutropênico descrito por Craig e Andes 2008 e foi usado para gerar candidíase disseminada e com consequente endocardite. As técnicas proteômicas empregadas distinguiram os isolados como C. parapsilosis stricto sensu (80%), C. metapsilosis (10%) e C. orthopsilosis (10%), das quais 100% foram capazes de formar biofilme, mesmo apresentando fraca adesão as células epiteliais. Testes de sensibilidade frente aos agentes antifúngicos (fluconazol e anfotericina B) demostraram que todas as cepas do complexo C. parapsilosis foram sensíveis. Ácido acetilsalicílico e Fluconazol apresentaram ação sinérgica frente a todas cepas testadas, padrões de antagonismo e de indiferença foram observados quando utilizado fluconazol e anfotericina B, e ácido acetilsalicílico e anfotericina B. O ensaio de redução de XTT demostrou que todas os isolados formaram biofilmes independente das suplementações e em todos tempos testados. Na atividade anti-biofilme podemos observar uma redução significativa na formação de biofilme por espécies do complexo C. parapsilosis, quando utilizado fluconazol e ácido acetilsalicílico de forma combinada. No desafio experimental, a cepa selecionada para modelo de infecção foi a URM 7434 C. orthopsilosis, por apresentar melhor produção de biofilme, menores CIMs, melhor resposta ao tratamento proposto e melhor resposta aos testes pilotos in vivo, os grupos de tratamento, principalmente os que fizeram uso de fluconazol e ácido acetilsalicílico de forma combinada conseguiram debelar a infecção no sétimo dia de tratamento, sem apresentar recidiva até 28º dia de sobrevida. Neste sentido o conhecimento acerca das espécies do complexo C. parapsilosis, além da expressão dos fatores de virulência e perfil de sensibilidade antifúngica, norteiam e viabilizam a conduta terapêutica adequada para tratamento e cura. / Microbial biofilms are microorganisms communities irreversibly adhered to a surface that produce extracellular polymeric substance, the formation of biofilm is relevant due to the continuous release of microorganisms that compose it which show phenotype different from that found in the planktonic form Candida parapsilosis, currently divided into three distinct species, have a remarkable ability to form biofilms in catheters and other implanted devices. The aim of this study was to determine the antifungal and antibiofilm action in vitro and in vivo, isolated and synergistic with fluconazole and acetylsalicylic acid against an experimental model of endocarditis by C. parapsilosis complex. The isolates were reviewed and characterized morphologically and proteomic techniques. Thus 20 isolates phenotypically classified as C. parapsilosis were reclassified. The antifungal activity of the drugs was determined following the conditions described in document M27-S4 of the Clinical Laboratory Standards Institute. Fractional Inhibitory Concentration (FIC) was evaluated by the combinations of Acetylsalicylic, fluconazole and amphotericin B using the dilution method checkerboard. The adhesion tests were based on the work of Kimura and Pearsall, 1978. Biofilms were prepared using the microtiter plate model and quantified by tetrazolium hydroxide reduction (XTT) colorimetric methodology for viability evaluation before and after treatment. In addition, scanning electron microscopy was used to observe the architecture of the C. parapsilosis complex biofilms. The experimental challenge and clinical evaluation followed the murine neutropenic model described by Craig and Andes 2008 and was used to generate disseminated candidiasis and with consequent endocarditis. The proteomic techniques used in this study distinguished C. parapsilosis stricto sensu (80%), C. metapsilosis (10%) and C. orthopsilosis (10%), 100% of which were able to form biofilms, Epithelial cells. Sensitivity tests against antifungal agents (fluconazole and amphotericin B) demonstrated that all strains of the C. parapsilosis complex were sensitive. Acetylsalicylic acid and fluconazole showed synergistic action against all strains tested patterns of antagonism and indifference were observed when using fluconazole and amphotericin B and acetylsalicylic acid and amphotericin B. The XTT reduction assay showed that all isolates formed biofilms independent of supplements and at all times tested. In the anti-biofilm activity we can observe a significant reduction in biofilm formation by species of C. parapsilosis complex, when used fluconazole and acetylsalicylic acid in combination. The experimental challenge, the selected strain for the infection model was URM 7434 C. orthopsilosis because it presented better biofilm production, lower MICs, better response to the proposed treatment and better response to in vivo pilot tests treatment groups, especially Who used fluconazole and acetylsalicylic acid in combination, were able to control the infection on the seventh day of treatment, without relapse up to the 28th day of survival. In this sense, the knowledge about the species of the C. Parapsilosis complex, in addition to the expression of the virulence factors and the antifungal sensitivity profile, guide and enable the appropriate therapeutic management for treatment and cure.

Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-08-20T20:19:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Jackeline Maria da Silva.pdf: 1830070 bytes, checksum: cd38a877523b6502d8430c98e1cfa370 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-08-28T18:23:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Jackeline Maria da Silva.pdf: 1830070 bytes, checksum: cd38a877523b6502d8430c98e1cfa370 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-28T18:23:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Jackeline Maria da Silva.pdf: 1830070 bytes, checksum: cd38a877523b6502d8430c98e1cfa370 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / FACEPE / Dekkera bruxellensis pertence à família Saccharomycetaceae e é considerado um parente distante de Saccharomyces cerevisiae. Esta levedura, principalmente na sua forma anamorfa Brettanomyces bruxellensis, é um importante contaminante da produção de vinho. O objetivo deste estudo foi comparar a fisiologia de linhagens da levedura Dekkera bruxellensis isoladas da produção de vinho e de álcool combustível quanto ao metabolismo de diferentes açúcares potencialmente utilizados como substrato industrial. Para isso, 30 isolados de Dekkera bruxellensis foram avaliados quanto à habilidade de assimilação respiratória e fermentativa de monossacarídeos e dissacarídeos, a diversidade fenotípica relacionada à repressão catabólica pela glicose, e a assimilação de diferentes açúcares, tais como glicose, sacarose e celobiose sob condição anaeróbica. Diferenças entre os perfis de assimilação respiratória foram observadas para cada isolado. As mais altas velocidades de crescimento foram encontradas em meio com glicose, frutose e sacarose 0,32 h⁻¹, 0,30 h⁻¹ e 0,30 h⁻¹, respectivamente, em aerobiose pelos isolados de destilaria. Em maltose e galactose, as maiores taxas de crescimento foram respectivamente, 0,21 h⁻¹ e 0,27 h⁻¹, alcançadas por isolados de destilaria e de vinícola, e em celobiose e lactose, as maiores taxas foram respectivamente, 0,20 h⁻¹e 0,15 h⁻¹, alcançados pelos isolados de destilaria. A presença do repressor catabólico 2-deoxiglicose no meio com galactose e maltose inibiu o crescimento de todos os isolados de vinho, diferentemente de alguns isolados de etanol que apresentaram resistência a este composto. A adição de Antimicina A nos meios de cultura alterou o crescimento apenas dos isolados de vinícola. Em anaerobiose estrita, os isolados de destilaria alcançaram velocidades de crescimento iguais a 0,44 h⁻¹; 0,40 h⁻¹e 0,26 h⁻¹ em glicose, sacarose e celobiose, respectivamente. A capacidade de assimilação de diferentes açúcares pelos isolados de D. bruxellensis frente às diversas condições testadas mostram a diversidade fenotípica encontrada dentro desta espécie. Além disso, os dados podem colaborar para explicação da capacidade adaptativa dessa espécie em diferentes ambientes industriais cujas fontes alternativas de carbono estejam presentes. Do ponto de vista biotecnológico, estudos com isolados de D. bruxellensis podem ser voltados para a produção de etanol de segunda geração, cujo um dos substratos é a celobiose, açúcar dos quais linhagens selvagens de S. cerevisiae não são capazes de assimilar. / Dekkera bruxellensis belongs to the family Saccharomycetaceae and is considered a distant relative of Saccharomyces cerevisiae. This yeast, mainly in its anamorphic form Brettanomyces bruxellensis, is an important contaminant of wine production. The aim of this study was to compare the physiology of strains Dekkera bruxellensis yeast isolated from wine production and ethanol on the metabolism of different sugars potentially used as industrial substrate. To this, 30 isolates of Dekkera bruxellensis were assessed for fermentative and respiratory assimilation ability monosaccharides and disaccharides, phenotypic diversity related to catabolite repression by glucose and the assimilation of different sugars, such as glucose, sucrose and cellobiose under anaerobic conditions. Differences between the profiles of respiratory assimilation were observed for each isolate. The highest growth rates were found in glucose, fructose and sucrose 0.32 h⁻¹, 0.30 h⁻¹and 0.30 h⁻¹, respectively, in aerobiosis by distillery isolates. In maltose and galactose, the highest growth rates were respectively 0.21 h⁻¹ and 0.27 h ⁻¹, reached by distillery and wine isolates, and in cellobiose and lactose, the highest rates were 0, 20 h⁻¹ and 0.15 h⁻¹, reached by distillery isolates. The presence of the 2-deoxyglucose catabolic repressor in the medium with galactose and maltose inhibited the growth of all the wine isolates, unlike some ethanol isolates were resistant to this compound. The addition of Antimycin A in the culture media altered the growth of only the wine isolates. In strict anaerobiosis the isolates of distillery reached growth rates equal to 0.44 h ⁻¹; 0.40 h ⁻¹ and 0.26 h ⁻¹ in glucose, sucrose and cellobiose, respectively. The capacity of assimilation of different sugars by D. bruxellensis isolates against the different conditions tested shows the phenotypic diversity found within this species. Moreover, the data can corroborate to explain the adaptive capacity of this species in different industrial environments whose alternative carbon sources are present. In biotechnological point of view, studies with isolated D. bruxellensis may be facing a second-generation ethanol, which one of the substrates is a cellobiose, sugar from which wild strains of S. cerevisiae are not able to assimilate

Orientador: Pilar Rodriguez de Massaguer / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-20T21:10:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gumerato_HomeroFerracini_M.pdf: 11871823 bytes, checksum: 6c8f91182e34c452b3ecc2ed5f3c6f2b (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: Neste trabalho foram isolados e identificados dois fungos termorresistentes Aspergillus fumigatus e Neosartorya fischeri diretamente de polpa de maçã das cultivares "FUJI" e "Golden Delicious". Com a finalidade de realizar as citadas identificações e tendo em vista a ampla aplicabilidade em trabalhos futuros, desenvolvemos um programa para computador, denominado FUNG-HOM, disponível para o sistema MS-DOS que permite fazer a identificação presuntiva de 84 fungos comuns em alimentos. O programa, que se baseia no conceito de taxonomia numérica, utiliza como dado de entrada um fungo desconhecido, descrito por 63 caraterísticas, macro e micro morfológicas, das colônias cultivadas nos meios CY A (Czapeck Yeast Agar) incubados a 25°C e 30°C, G25N (25% (w/w) Glycerol Nitrate Agar) e CY20S (Czapeck Yeast with 20% Sucrose Agar) ambos incubados a 25°C. A saída do programa é composta de 4 partes, sendo (1) espécies mais prováveis, (2) a listagem comparativa dos testes do fungo desconhecido com o fungo identificado, (3) a imagem em câmera lúcida do fungo identificado e (4) descrição com dados bibliográficos a respeito da fisiologia, ocorrência em alimentos e micotoxinas produzidas, se ocorrerem. O funcionamento do programa FUNG-HOM foi avaliado em duas etapas, uma teórica que utilizou o simulador COMPSIM3 (programa também desenvolvido neste trabalho) e uma prática que utilizou 44 espécies de origens conhecidas, além das duas tennorresistentes isoladas de polpa de maçã. Os resultados obtidos demonstraram a eficiência do programa identificador. A rapidez e facilidade com que se procede a identificação e a possibilidade da inserção de características optativas no banco de dados, corroboram a eficiência do FUNG-HOM. Ainda foram determinados os parâmetros de termorresistência para o Neosartorya fischeri em suco de maçãs (1:1) das cultivares "FUJI" e "Golden Delicious", pH 3.6 e 15.5° Brix. Nestas condições, o fungo termorresistente que foi isolado da polpa de maçã apresentou: Z = 5.3 °C +/- 3.1 e D93°C =25.85 seg / Abstract: In the first part of this study, two thermoresistant fungi, Aspergillus fumigatus and Neosartorya fischeri, were isolated directly ffom apple pulp (cultivar Fun and Golden Delicious). In order to identify such isolates and considering a wider applicability in future research for the food microbiology a computer program, FUNG-HOM, was developed available in MS-DOS. This program allows identification of84 fungi, commonly found in foods. The FUNG-HOM program is based on concepts of numerical taxonomy. To make an identification, one should enter growth characteristics ofthe unknown fungus colonies (up to 63 characteristics) when incubated in CYA (Czapek Yeast Agar) at temperature of25 to 30°C, G25N (25% Glycerol Nitrate Agar) and CY20S (Czapek Yeast with 20% Sucrose Agar) both at 25°C. The program output is divided into four parts: (1) most probable species, (2) comparative list of tests of the unknown fungi and the identified fungi, (3) images as shown in Camera Lucida ofthe identified fungi and (4) a description with bibliographic data concerning physiology, occurrence in foods and mycotoxin production (when it occurs). The accuracy of FUNG-HOM program was evaluated theoretically by employing a simulator program, COMPSIM3, which was also developed in this work especially to evaluate data bases for identification and diagnostics procedures. A practical evaluation of FUNG-HOM performance was also carried out and in this step it 44 species of known origin were used together the with previously mentioned thermo resistant species isolated from apple pulp. Results obtained showed the accuracy of the identification programo Its speed and ease in performing the identification, as well as its ability to accept addition of optional characteristics in the data base, also confirm FUNG-HOM's efficiency. The thermal resistance of N ..fischeri was determined in apple juice (cultivar FUn and Golden Delicious), pH = 3.6 and Brix=15.5°. In such conditions, its z-value was 5.3°C +/- and D93°C was 25.85 sec / Mestrado / Mestre em Engenharia de Alimentos

O conhecimento dos fungos anemófilos em determinada cidade ou região é importante para o diagnóstico etiológico e o tratamento específico das manifestações alérgicas respiratórias. Várias técnicas quantitativas e qualitativas são preconizadas para coleta e identificação desses fungos na dependência do local estudado. Nesta pesquisa, sobre esporos de fungos do ar, foi utilizado o equipamento Rotorod Sampler®, que retira a amostra do ar através de um bastão de plástico preso a um motor elétrico que o faz girar rapidamente, sendo as partículas suspensas no ar recolhidas pelo bastão. As amostras foram coletadas uma vez por semana, durante 24 horas, correspondendo a um ciclo de coleta. Foram realizadas 52 coletas entre abril de 2000 e março de 2001. Os resultados mostraram prevalência de ascosporos (50,49%), Cladosporium (17,86%), Aspergillus/Penicillium (15,03%), basidiosporos (3,84%), rusts (3,82%), Helminthosporium (2,49%), Botrytis (1,22%), Alternaria (1,19%), smuts (0,90%), Curvularia (0,87%), Nigrospora (0,61%) e Fusarium (0,08%). Não foi possível identificar 1,59% dos esporos de fungos coletados no período. O maior número de esporos foi observado nos meses de verão e o menor, durante o outono. Utilizando provas in vivo e in vitro, avaliou-se a hipersensibilidade a fungos entre 39 pacientes atópicos sofrendo de rinite e ou asma brônquica. Os testes cutâneos identificaram sensibilização em 17,94% dos pacientes, enquanto as provas sorológicas caracterizaram presença de IgE específica em 12,82% dos casos avaliados. A detecção de significativo número de esporos de fungos no ar de Porto Alegre, com muitas espécies comprovadamente alergênicas, e os índices de sensibilização observados em indivíduos atópicos confirmam a importância do estudo dos fungos anemófilos nessa cidade, com vistas a aprimorar o diagnóstico e o manejo de pacientes com manifestações alérgicas respiratórias. / Knowledge of airborne fungi in a given city or region is important for the ecological diagnosis and specific treatment of allergic manifestations induced by inhaled allergens. In order to diagnose the presence of airborne fungi, several qualitative and quantitative techniques are used depending on the study place. This study of fungal air spores was performed with a Rotorod Sampler®, an equipment which samples the air through a plastic rod attached to an electric engine that makes it spin fast enough to collect the particles in the air. The samples were collected once a week for 24 hours using the standard cycle of the manufacturers. A total of 52 samples were obtained from April 2000 through March 2001. The results showed a prevalence of ascosporos (50.49%), Cladosporium (17.86%), Aspergillus/Penicillium (15.03%), basidiosporos (3.84%), rusts (3.82%), Helminthosporium (2.49%), Botrytis (1.22%), Alternaria (1.19%), smuts (0.90%), Curvularia (0.87%), Nigrospora (0.61%), and Fusarium (0.08%). Also, 1.59% of the spores detected here could not be identified by the systematic key used. More fungal spores were observed during the summer, and less during the autumn. Using in vivo and in vitro tests, the hypersensitivity to anemophilous fungi was assessed in 39 atopic individuals with rhinitis and asthma. The skin tests with airborne fungus allergens showed sensitivity in 17.94% of patients, while serum tests detected the presence of specific IgE in 12.82% of the cases. The occurrence of a great number of fungal spores as observed in this study, with many clearly allergenic species, emphasizes the importance of studying airborne fungus in our city in order to improve the diagnosis and care of patients with respiratory allergies.

Orientador: Renato Bonatelli Junior / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-14T01:48:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferreira_AdlaneVilasBoas_M.pdf: 4710064 bytes, checksum: d3338a007eb8a82abc1e32943c08e222 (MD5) Previous issue date: 1991 / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas