Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-04-19T04:12:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337932.pdf: 2390116 bytes, checksum: 30038e57b21fee52eab77f33b1446cb0 (MD5) Previous issue date: 2015 / Ophiocordyceps representa o maior e mais variado táxon de Ophiocordycipitaceae, tanto morfologico quanto ecologicamente. Ophiocordyceps dipterigena foi descrito por Berkeley e Broome (Cordyceps dipterigena), em 1875, a partir de um material coletado em uma mosca adulta no Sri Lanka (Ceilão). Atualmente o táxon, apresentando distribuição pantropical, é caráterizado morfologicamente pelos estromas filiformes, capitados, marrom alaranjados a amarelados, região fértil terminal, hemisférica e bem definida. Apresenta uma ampla variedade de hospedeiros (moscas adultas) e atualmente possui seis sinônimos heterotípicos. Apesar das evidências de um complexo taxonômico, nenhum estudo mais aprofundado (morfológico e molecular) foi realizado com este táxon até o momento. Este trabalho apresenta aspectos taxonômicos, ecológicos e filogenéticos sobre O. dipterigena, a partir de análises morfológicas (macro, micro e ultraestruturais) e de biologia molecular. Ao todo, foram revisados 84 materiais parasitas de moscas adultas de espécimes morfologicamente e ecologicamente próxima de O. dipterigena. Uma filogenia (ITS) do complexo O. dipterigena é apresentada, assim como uma discussão geral sobre diferentes possíveis novos táxons existentes. Novos caráteres relevantes para a interpretação de hipóteses de espécies são apresentados. O nome Cordyceps muscicola é resgatado da sinonímia de O. dipterigena sendo caráterizada por parasitar moscas grandes, geralmente aderidas na superfície abaxial, mas sempre com micélio recobrindo todo hospedeiro, até o momento ocorrente na Floresta Ombrófila Densa do território Catarinense. Além da lectotipificação do desenho do protólogo de C. muscicola e da epitipificação de um espécime da localidade do tipo (Blumenau) a espécie é combinada em Ophiocordyceps, O. muscicola. Outras três espécies (Ophiocordyceps sp. 1, sp. 2 e sp. 3), que se diferenciam no complexo O. dipterigena, são apresentadas, são caráterizadas pela combinação de caráteres morfológicos e ecológicos. Outras possíveis espécies novas são discutidas. Este trabalho demonstra uma grande diversidade no complexo O. dipterigena e prevê o elevado potencial de revelar uma diversidade maior ainda com pesquisas futuras.<br> / Abstract : Ophiocordyceps is the largest and most varied taxon of Ophiocordycipitaceae, both morphologically and ecologically. Ophiocordyceps dipterigena was described by Berkeley and Broome (as Cordyceps dipterigena) in 1875 from material collected on an adult fly in Sri Lanka (Ceylon). Currently, the taxon presents pantropical distribution and is morphologically characterized by having filiform, capitate, orange-brown to yellowish stromata and a terminal, hemispheric, well defined fertile region. Ophiocordyceps dipterigena occurs on a wide variety of hosts (adult flies) and currently has six heterotypic synonyms. Despite the evidence of a possible taxonomic complex, no detailed investigation into the possibility of cryptic species has yet been conducted. This work offers the first comprehensive taxonomic, ecological and phylogenetic treatment of the O. dipterigena complex, supported by morphological and molecular analyses. In all, eighty-five collections morphologically and ecologically related to O. dipterigena were examined. A phylogeny (ITS) of the O. dipterigena complex is presented, as well as a general discussion on potentially new taxa in the complex. New characters relevant to the interpretation of species hypotheses are presented. The name Cordyceps muscicola is recovered from synonymy with O. dipterigena, characterized by a thoroughly myceliated host which often adheres to the abaxial surface of leaves, until the moment occurring in the Ombrophilous Dense Forest territory of Santa Catarina. In addition to the lectotypification of the protologue drawing of C. muscicola and epityfication of a specimen from the type locality (Atlantic rainforest of Blumenau), the species is recombined in Ophiocordyceps as O. muscicola. Three additional species are described (Ophiocordyceps sp. 1, sp. 2 and sp. 3) which differ in the O. dipterigena complex on the basis of morphological and ecological characters. Other possible new species are discussed. This work demonstrates both a greater diversity within O. dipterigena complex than previously considered, and forecasts the high potential for revealing greater diversity with further research.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina. Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. / Made available in DSpace on 2013-07-15T23:03:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 221467.pdf: 1817418 bytes, checksum: 4df6dfea9849545662d15122be228145 (MD5) / O aumento crescente de bactérias resistentes devido a múltiplos fatores incentiva à pesquisa de novas substâncias antibacterianas. Os fungos basidiomicetos do gênero Polyporus são fonte de metabólitos secundários de interesse medicinal entre os quais estão os compostos

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2013-12-06T00:08:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 319753.pdf: 1321186 bytes, checksum: 340974d0e6666e16b102c1f24db09682 (MD5) Previous issue date: 2013 / Políporos é um dos principais grupos de fungos decompositores de madeira, contudo, o conhecimento sobre sua diversidade ainda é escasso. Em Santa Catarina, a sinopse sobre a diversidade dos macromicetos apresenta 247 espécies de fungos, destas, 143 são poliporoides, principalmente da região insular. Para a continuidade e o avanço do conhecimento sobre a diversidade de fungos poliporoides que ocorrem na Mata Atlântica de Santa Catarina, foram estudados aspectos sobre a ecologia de comunidades fúngicas, particularmente de uma área pouco explorada, bem como um complexo taxonômico que ocorre na região. Primeiramente foi avaliada e caracterizada a comunidade de políporos em uma área de Floresta Ombrófila Densa do Parque Nacional da Serra do Itajaí, em termos de riqueza, abundância e funcionalidade. Entre os 152 espécimes coletados 58 espécies foram identificadas. Polyporus dictyopus, Perenniporia martia e Fuscoporia walhbergii foram as espécies dominantes. Com base nas frequências relativas nos diferentes tipos e substratos foram encontrados cinco grupos funcionais, dos quais dois formados por Phylloporia spathulata (em raízes vivas no solo) e Phylloporia chrysita (em lianas vivas) e os outros três constituídos por espécies saprofíticas, sendo cada grupo caracterizado pela presença de uma das espécies dominantes citadas. Finalmente, Phellinus piptadeniae é apresentada como um complexo taxonômico, em processo de especiação, a partir de evidências ecológicas (hospedeiro e distribuição geográfica) e filogenéticas. <br> / Abstract : Polypores is one of the most important groups of wood-decay fungi; however, its diversity knowledge is still scarce. In Santa Catarina state, a synopsis of macrofungi diversity presented 247 species, of which 143 are polypores, mainly from insular region. In order to continue and improve the knowledge about the diversity of polypores, wich are occurring in the Atlantic Forest of Santa Catarina, ecological aspects of fungal communities were studied, in an unexplored area, as well as a complex taxonomy that occurs in the region. Firstly, was described the community of wood-decaying polypores in the Atlantic Rain Forest of Parque Nacional da Serra do Itajai, characterizing the community in terms of richness, abundance and functionality. Among 152 specimens collected 58 species were identified. Polyporus dictyopus, Perenniporia martia and Fuscoporia walhbergii were the dominant species. Based on the relative frequency in the different types of substrates where five functional groups were recognized. Two of them were formed by Phylloporia spathulata (on live roots in the ground) and Phylloporia chrysita (on live trunks); and three other functional groups, consisting of saprophytic species, each of them was characterized by the presence of one of the dominant species. Finally, Phellinus piptadeniae is presented as a taxonomic complex, in a speciation process, evidenced by the existence of two phylogenetic and ecological (host and geographic distribution) lineages.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-01-17T03:13:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 343402.pdf: 1773127 bytes, checksum: bb8b95fead85f2cbb1a324c1b6ebc8bc (MD5) Previous issue date: 2016 / No sul de Santa Catarina, cerca de 6700 hectares encontram-se degradados pela atividade de mineração de carvão. Para a recuperação destas áreas é proposta a implementação do processo de revegetação. Entretanto, as espécies vegetais apresentam dificuldades no estabelecimento nessas áreas devido às condições adversas do solo. Neste contexto, a adição de substratos que melhorem as condições do solo como o biocarvão, o qual confere a capacidade de aumentar o pH dos solos ácidos, aumentar a capacidade de retenção de água do solo, aumentar o teor de carbono e reduzir a lixiviação de elementos contaminantes. Além disso, a utilização de plantas pioneiras inoculadas com fungos micorrizicos arbusculares (FMA) pode ajudar na implantação de cobertura vegetal nestes locais, devido ao favorecimento na absorção de elementos pouco móveis no solo como é o caso do fósforo (P). O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência do biocarvão e da adubação fosfatada na simbiose de FMA em mudas de bracatinga (Mimosa scabrella), e cedro rosa (Cedrella fisillis), destinadas a programas de recuperação de áreas degradas pela mineração de carvão. Para isso, dois experimentos independentes foram conduzidos em casa de vegetação do Laboratório de Microbiologia do Solo da UFSC. Em um primeiro ensaio foi avaliada a influência do biocarvão na simbiose FMA-Planta seguindo delineamento inteiramente casualizado, em arranjo fatorial 5 X 5: com cinco concentrações de biocarvão misturado no solo (0%, 1%, 2,5%, 5%, 10% v/v) e cinco tratamentos de inoculação com FMA (Acaulospora morrowiae SCT400A, Gigaspora albida SCT200A, Rhizophagus clarus RJ102A, a mistura dos três FMA e um tratamento controle sem propágulos de FMA) em bracatinga e cedro por 15 semanas. No segundo ensaio foi avaliada a interação FMA-planta em diferentes concentrações de P no solo seguindo delineamento inteiramente casualizado, em arranjo fatorial 6 X 3: seis tratamentos de inoculação de FMA (Acaulospora morrowiae SCT400A, Gigaspora albida SCT200A, Rhizophagus clarus RJ102A, Acaulospora colombiana SCT115A, Claroideoglomus etunicatum SCT115A e um tratamento controle não inoculado) e três concentrações de P no solo (0 mg kg-1 P solo, 50mg kg-1 P solo e 200mg kg-1 P solo) por 13 semanas. As variáveis avaliadas foram: pH do solo, colonização micorrizica, número de esporos no solo, altura da planta, diâmetro do caule, biomassa da parte aérea e teor e acúmulo de P nas folhas. Neste estudo encontrou-se que as plantas tiveram um crescimento maior quando foram inoculadas e quando foi adicionado o biocarvão no solo. As plantas de cedro apresentaram maior crescimento nas doses altas de biocarvão, enquanto que maiores doses de biocarvão foram prejudiciais no crescimento da bracatinga. Além disso, os FMA tiveram comportamentos diferentes para cada espécie vegetal, sendo os tratamentos com A. morrowiae os que apresentaram maior colonização micorrízica e crescimento na bracatinga e os tratamentos com R. clarus no cedro. Também, se verificou que a falta ou o excesso de P no solo podem inibir a colonização micorrízica e o crescimento das mudas. Quando os FMA foram inoculados num solo sem esterilizar o crescimento vegetal não apresentou diferenças significativas com o tratamento controle. Em conclusão encontrou-se que os FMA junto com o biocarvão e a adubação de P são uma ferramenta útil nos processos de revegetação.<br> / Abstract : In the south of Santa Catarina?s state, near of 6700 ha are presently degraded due coal mining. In order to the recovery of these land was proposed the implementation of revegetation process. Meanwhile, the plant species face difficulties growing in these lands due to the adverse soil conditions. With this aim on mind, the addition of substrates that could enhance soil conditions like biochar, which contribute to increasing the pH in acid soils, enhance water holding capacity, as well as enhance soil carbon sequestration and prevent lixiviation of potential contaminants. In addition, pioneering plants inoculated with arbuscular mycorrhizal fungi (FMA) could help in the implementation of vegetation cover in these lands, because produce an increase in the absorption of low-mobile elements like phosphorus (P). This project aiming to evaluate the influence of biochar and phosphorus soil addition in the symbiosis of AMF in bracatinga (Mimosa scabrella) and cedar (Cedrela fissilis) for recovery degraded lands due coal mining programs. This was carried out in two independent experiments at greenhouse in Laboratorio de Microbiologia do Solo at UFSC. In the first experiment was tested the influence of biochar in AMF-Plant symbiosis in a completely randomized factorial design 5 X 5 with five concentrations of biochar mixed in soil (0%, 1%, 2,5%, 5%, 10% v/v) and five inoculation AMF treatments (Acaulospora morrowiae SCT400A, Gigaspora albida SCT200A, Rhizophagus clarus RJ102A, a mix with the tree AMF anda treatment without AMF propagules) in bracatinga and cedar for 15 weeks. For the second experiment was tested the interaction AMF-Plant with different doses of P in soil in a completely randomized factorial design 6 X 3: six AMF inoculation treatments (Acaulospora morrowiae SCT400A, Gigaspora albida SCT200A, Rhizophagus clarus RJ102A, Acaulospora colombiana SCT115A, Claroideoglomus etunicatum SCT115A and an no-inoculated treatment) and three P doses in soil (0 mg kg-1 P of soil, 50mg kg-1 P of soil e 200mg kg-1 P of soil) for 13 weeks. Variables assessed were soil pH, AMF root colonization, number of spores in soil, plant height, stem diameter, above ground biomass and P content and accumulation. In this study were found that plants grew more when were inoculated with AMF and were planted with biochar in the soil. Cedar plants grew better in the higher biochar doses, while high doses were prejudicial for bracatinga. Besides that, AMF shown different performance for each plant specie being treatments with A. morrowiae the one that shown higher root colonization and plant growth in bracatinga and the ones inoculated with R. clarus in cedar. Also found that the lack and excess of P in soil could inhibit both plant and AMF development. When the AMF were inoculated in a non autoclaved soil with native AMF, plant growth did not shown differences with the non-inoculated treatment. In conclusion AMF, biochar and P addition are a useful tool in revegetation process.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Química, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-03-21T04:09:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 344681.pdf: 4209817 bytes, checksum: 49ff9810eceba75eca01c547eae0947b (MD5) Previous issue date: 2016 / Abstract : This thesis was developed in the context of citrus waste biorefineries. Within such biorefineries, it has been proposed that the pectinases to be used for hydrolysis of pectin be produced by solid-state fermentation, using the filamentous fungus Aspergillus niger. During solid-state fermentation, aerial hyphae occupy the interparticle spaces, binding adjacent particles together, while surface, biofilm and penetrative hyphae secrete a pool of hydrolytic enzymes that decrease the firmness of the solid particle. The resulting morphology of the mycelium, namely the spatial distributions of these hyphae, is related to mass and heat transfer within the fermentation bed and, apparently, to the production of hydrolytic enzymes. However, more studies are necessary to understand the factors that determine the morphology of the mycelium. A useful tool for guiding such studies is a 3D phenomenological model that describes the morphology of the mycelium formed by the filamentous fungus and relates this morphology with intra- and extracellular phenomena, such as, for example, intracellular flow of substrate through the fungal network. The aim of the thesis was to provide theoretical and experimental foundations for the development of such a model. This objective was achieved in two main steps: development of a computational model for penetrative and aerial hyphae and time-lapse visualization of mycelial growth. The computational model was developed to explore the factors affecting the distribution of aerial hyphae with height above the surface and of penetrative hyphae with depth below the surface, with rules of branching and inactivation that were different for each type of hypha. These rules were adjusted to data from the literature for the growth of Rhizopus oligosporus and Aspergillus oryzae on solid media. The adjusted rules lead to the hypothesis that penetrative hypha extend mainly downwards, with their maximum length being determined by the firmness of the solid particle and the pressure drop inside the hypha. Meanwhile, aerial hyphae grow in any direction, as though their tips move in a random walk, and there is no limitation of maximum height. Aerial hyphae seem to stop extending due to steric impediments, resulting in a maximum local biomass concentration. In order to study the growth of penetrative hyphae and expression of hydrolytic enzymes, fluorescent strains of Aspergillus niger were constructed. The mode of growth of penetrative hyphae was characterized with various different inoculum density and the types of carbon sources in the medium. These results indicated that penetrative hyphae differentiate around the same time reproductive hyphae begin to grow: extension of leading hyphae is interrupted and intense branchingstarts. In addition, expression of exopolygalacturonase B in penetrative hyphae also changes with differentiation: from apical and limited to few hyphae to subapical and present in the majority of hyphae. / Esta tese foi desenvolvida no contexto de biorrefinarias de polpa cítrica. Para estas biorrefinarias, propõe-se que as pectinases a serem usadas na hidrólise da pectina sejam produzidas por fermentação em estado sólido, utilizando o fungo filamentoso Aspergillus niger. Na fermentação em estado sólido, hifas aéreas ocupam o espaço entre as partículas, entrelaçando partículas adjacentes, enquanto que hifas superficiais, de biofilme e penetrantes secretam enzimas hidrolíticas que modificam a consistência das partículas. A morfologia do micélio formado, ou seja, a distribuição espacial das hifas, está relacionada com a eficiência de transferência de massa e de calor através do leito de fermentação e, aparentemente, com a produção de enzimas hidrolíticas. No entanto, faltam estudos sobre os fatores que determinam a morfologia do micélio. Uma ferramenta útil para guiar estes estudos é um modelo fenomenológico 3D que descreve a morfologia adotada pelo fungo filamentoso e relaciona esta morfologia a fenômenos intra e extracelulares, como, por exemplo, fluxo intracelular de substrato através do micélio. O objetivo desta tese foi obter fundamentação teórica e experimental para o desenvolvimento deste modelo. Para este fim, o trabalho foi conduzido em duas partes: desenvolvimento de um modelo matemático para hifas penetrantes e aéreas e visualização do crescimento do micélio em time-lapse. O modelo matemático foi desenvolvido para investigar os fatores que afetam a distribuição de hifas aéreas em função da altura acima da superfície do meio e de hifas penetrantes em função da profundidade abaixo da superfície. Neste modelo, o espaço acima e abaixo da superfície é dividido em andares e a extensão das hifas é descrita pela adição de segmentos de hifa, de tamanho fixo, em cada andar. O modelo inicia-se com pontas de hifa na superfície, a partir das quais segmentos de hifa podem estender e cada segmento formado pode continuar estendendo, ramificar ou inativar, de acordo com regras de probabilidade, que são diferentes para cada tipo de hifa. Estas regras, e os parâmetros correspondentes, foram ajustadas aos dados de distribuição de biomassa de Rhizopus oligosporus e Aspergillus oryzae, em diferentes meios sólidos. Com base nestas regras, foram propostas hipóteses de que as hifas penetrantes estendem principalmente para baixo e o comprimento máximo delas é determinado pela consistência da partícula sólida e pela perda de carga no interior da hifa. Enquanto isso, as hifas aéreas crescem em qualquer direção, como se suas pontas se movimentassem seguindo o passeio aleatório, e não há limitação de altura máxima para o crescimento. As hifas aéreas param de estender devido ao impedimento estérico,resultante de uma máxima concentração local de biomassa. A fim de investigar o crescimento de hifas penetrantes e a expressão de pectinases ao longo do micélio, duas cepas fluorescentes de Aspergillus niger foram desenvolvidas: as duas cepas expressam o gene eGFP (proteína fluorescente verde melhorada) sob um promotor constitutivo e um gene de fusão de uma poligalacturonase e mCherry, que é uma proteína fluorescente vermelha, sob o promotor nativo da poligalacturonase. A poligalacturonase escolhida para a cepa pgaRed foi a endopoligalacturonase B, codificada no gene pgaB, cujo promotor é constitutivo, ao passo que a poligalacturonase escolhida para a cepa pgxRed foi a exopoligalacturonase B, codificada no gene pgxB, cujo promotor é induzido por galacturonato presente no meio. Através destas cepas, o modo de crescimento das hifas penetrantes foi caracterizado: se a densidade de esporos é baixa, hifas penetrantes podem ser formadas diretamente do tubo germinativo, caso contrário, as hifas penetrantes são formadas apenas depois que as hifas superficiais atingirem uma densidade mínima; as ramificações são subapicais e bem distribuídas ao longo da hifa parental, exceto quando a densidade de hifas dentro do sólido é alta e, neste caso, as ramificações ocorrem nas regiões de menor densidade de hifas, que geralmente são próximas às pontas das hifas parentais. As hifas penetrantes diferenciam-se no mesmo momento em que surgem as hifas reprodutivas e, a partir deste momento, as hifas parentais param de estender e ocorre intensa formação de ramificações. Além disso, a expressão de pgxB nas hifas penetrantes muda de apical, e limitada a poucas hifas, para subapical e presente na maioria das hifas. O tipo de fonte de carbono afeta o tempo de germinação, a profundidade máxima atingida pelas hifas penetrantes e a frequência de ramificação por hifa. Por fim, o conhecimento adquirido com as cepas fluorescentes foi utilizado para delinear como o modelo fenomenológico 3D deve ser desenvolvido no futuro.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Química, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-03-21T04:15:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 344109.pdf: 2132551 bytes, checksum: ce482fdce49fb3dee55e987122afb313 (MD5) Previous issue date: 2016 / Fungos do gênero Pleurotus são conhecidos como produtores de lacases. Esta enzima tem vasta aplicação nas indústrias de bebidas, alimentos, têxteis, bem como na degradação diversos de poluentes ambientais. A fim de se minimizar os custos de produção desta enzima, diversos resíduos agroindustriais, normalmente disponíveis na região de produção, podem ser utilizados na formulação de meios de cultivo. Assim sendo, o presente trabalho teve como objetivos (a) caracterizar quimicamente os resíduos lignocelulósicos água de imersão de folhas secas de bananeira e pó de cascas de banana; (b) estudar a produção de lacase por Pleurotus sajor-caju, em frascos agitados e biorreator, utilizando resíduos da bananicultura na composição do meio de cultivo; (c) avaliar a influência da velocidade de agitação sobre a produção de lacase por Pleurotus sajor-caju; (d) caracterizar a enzima produzida; (e) avaliar a eficácia do caldo enzimático bruto sobre a degradação de bisfenol-A. Os experimentos em frascos agitados foram realizados em frascos Erlenmeyer de 500 mL contendo 100 mL de meio de cultivo inoculados com dois discos de ágar de 12 mm contendo micélio fúngico. Os frascos foram mantidos a 30 oC e agitação de 110 min-1, por 15 dias. Os experimentos em biorreator foram realizados em modelo BIOSTAT B da marca B. BRAUN com volume de trabalho de 4 L, sendo o inóculo 10% deste volume. O pH inicial foi ajustado em 6,0, a temperatura fixada em 30 oC, a aeração em 0,3 vvm e a velocidade de agitação em 100, 350 e 500 min-1, dependendo do experimento. Os resíduos água de imersão de folhas secas de bananeira e pó de cascas de banana apresentaram relação C:N iguais a 13,8 e 16,9, respectivamente. Os percentuais de cinzas foram 28,6 e 12,8% para água de imersão e pó de cascas de banana, respectivamente. O meio de cultivo OXI, formulado com resíduos da bananicultura, mostrou-se adequado para a produção de lacase por Pleurotus sajor-caju, sendo os maiores valores de atividade encontrados nos testes em frascos agitados (60 g L-1 pó de cascas de banana) e em biorreator (45 g L-1 pó de cascas de banana e 350 min-1) iguais a 2.416 e 1.850 U L-1, respectivamente. As atividades obtidas utilizando-se velocidades de agitação 100 e 500 min-1 foram 200 e 9 vezes, respectivamente, inferiores às obtidas utilizando-se velocidade de 350 min-1. Encontrou-se como pH ótimo os valores de 2,5 e 3,0. Com relação à temperatura ótima, todas as temperaturas avaliadas (20, 30, 40 e 50 oC) apresentaram atividade relativa próxima a 100 %. Observou-semaior estabilidade da enzima nos valores de pH 5 e 7; e temperatura de estabilidade na faixa de 20 a 40 oC. Os valores de Km e Vmáx foram 0,1 mM e 1,25 mM min-1, respectivamente. O caldo enzimático bruto foi capaz de degradar 100 % do bisfenol-A (500 mg L-1) em 48 h de incubação.<br> / Abstract : Fungi of the Pleurotus genus are known as laccase producers. This enzyme is widely applied in the food, beverage and textile industries as well as in the degradation of various environmental pollutants. In order to minimize production costs for this enzyme, several agro-industrial wastes, normally available in the production area, may be used to formulate the culture media. Thus, the objectives of this study were to: (a) chemically characterize the lignocellulosic wastes: immersion water of dried banana leaves and banana peel powder; (b) study laccase production by Pleurotus sajor-caju, in shake flasks and bioreactor, using banana plantation wastes in the culture medium composition; (c) evaluate the influence of agitation speed on laccase production by Pleurotus sajor-caju; (d) characterize the enzyme produced; (e) evaluate the efficacy of the crude enzymatic broth on bisphenol-A degradation. The experiments in shake flasks were carried out in Erlenmeyer 500 mL flasks containing 100 mL of culture medium inoculated with two 12 mm agar discs containing fungal mycelium. The flasks were kept at 30 oC with 110 min-1 agitation, for 15 days. The experiments in bioreactor were carried out in a B. BRAUN BIOSTAT B fermenter with 4 L work volume, with inoculum being 10 % of this volume. Initial pH was adjusted to 6.0, temperature fixed at 30 oC, aeration at 0.3 vvm and agitation speed at 100, 350 and 500 min-1, depending on the experiment. The water wastes from the immersion of dried banana leaves and banana peel powder had a C:N ratio equal to 13.8 and 16.9, respectively. Ash percentages were 28.6 and 12.8 % for immersion water and banana peel powder, respectively. The OXI culture medium, formulated with banana plantation wastes proved to be adequate for laccase production by Pleurotus sajor-caju, with the greatest activity values being found in tests with flasks agitated at (60 g L-1 banana peel powder) and in bioreactor (45 g L-1 banana peel powder and 350 min-1) equal to 2,416 and 1,850 U L-1, respectively. The activities obtained using 100 and 500 min-1 agitation speeds were 200 and 9 times, respectively, lower than those obtained using a speed of 350 min-1. The values of 2.5 and 3.0 were considered ideal for the pH. In relation to ideal temperature, all evaluated temperatures (20, 30, 40 and 50 oC) showed activity relatively close to 100 %. Greater enzyme stability was observed with pH values of 5 and 7; and temperature stability in the range of 20 to 40 oC. The Km and Vmáx values were 0.1 mM and 1.25 mM min-1, respectively. Thecrude enzymatic broth was able to degrade the bisphenol-A (500 mg L-1) 100 % in 48 h incubation.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Química / Made available in DSpace on 2012-10-21T16:48:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 210529.pdf: 923738 bytes, checksum: e93ab97333eb07fb2380a63792a2a4ca (MD5) / Os esporos de fungos filamentosos termo-resistentes não só resistem às temperaturas de pasteurização de sucos e derivados de frutas, como são ativados por tratamento térmico germinando e provocando a deterioração destes produtos. Este trabalho tem como objetivo o estudo da resistência térmica de Byssochlamys nivea e Talaromyces flavus em suco de maçã. Duas temperaturas de incubação foram utilizadas (20 e 30ºC), possibilitando o estudo da influência deste parâmetro na resistência térmica destes fungos. Os esporos foram submetidos a diferentes tratamentos térmicos para avaliação da resistência térmica em tubo TDT Thermal Death Time, usando como meio suco de maçã a 12º Brix com pH = 3,2, como meio de aquecimento. Os resultados obtidos mostraram, para ambos os fungos, uma resistência térmica maior, quando estes foram produzidos a temperaturas maiores de incubação (30ºC). Entre os dois fungos filamentosos estudados, o Byssochlamys nivea se mostra o mais resistente com um comportamento não linear da curva de

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. / Made available in DSpace on 2012-10-20T13:18:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / A crescente demanda de produtos do setor florestal tem gerado um déficit no mercado mundial que exige o desenvolvimento e a aplicação de tecnologias alternativas para o aumento da produtividade das essências florestais. Os solos destinados ao reflorestamento no Brasil são, na sua maioria, de baixa fertilidade, utilizando-se grandes quantidades de fertilizantes químicos. Essas práticas oneram a produção e contribuem para a poluição do ambiente através da hipoxia e eutroficação dos mananciais aqüíferos. O eucalipto, a essência florestal mais utilizada em reflorestamentos no país, apresenta crescimento rápido e tem a seu

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. / Made available in DSpace on 2012-10-18T10:27:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2014-09-25T23:05:45Z : No. of bitstreams: 1 177253.pdf: 25762417 bytes, checksum: 08ff918d80f18b8d7fa947c864df47ec (MD5) / Este estudo inicia uma nova geração de bioprocessos para a produção de inoculantes de fungos ectomicorrízicos (fECM). Foi estudada a produção de inoculante do fECM Pisolithus microcarpus (isolado UFSC-Pt 116), em biorreator tipo airlift com circulação externa. Inicialmente, estudou-se o efeito da composição do meio de cultura sobre a produção de biomassa fúngica, utilizando-se como base os meios Melin-Norkrans Modificado (MNM) e meio Litchfield e Arthur (L&A). Uma das variações do meio L&A, que promoveu maior produtividade, foi estudada por meio de planejamento fatorial, tendo-se como variáveis os componentes: peptona, extrato de levedura e glicose (g.L-1). A concentração de glicose pôde ser aumentada em até 40%, permitindo um melhor rendimento do biorreator. A peptona (de carne ou soja) apresentou fatores de crescimento importantes, enquanto que o extrato de levedura apresentou fatores deletérios. Em biorreator airlift o fungo cresceu principalmente na forma de pellets densos e esféricos, havendo grande produção de pigmentos. Os valores de velocidade específica máxima de crescimento foram 0,391 dia-1, para o cultivo em frascos, e 0,576 dia-1, para o cultivo no airlift. Os valores de conversão foram 0,42 g.g-1, e de produtividade de 0,49 g.L-1.dia-1, para os dois processos. O biorreator airlift forneceu velocidade específica de formação de biomassa superior a outros processos citados na literatura, com relação ao gênero Pisolithus, mostrando-se promissor para produção de biomassa de fECM. São necessários, no entanto, estudos visando controlar a fisiologia de crescimento do fungo e a adequação do processo ao cultivo de outros isolados/espécies de fECM.

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-15. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:29Z : No. of bitstreams: 1 000856459.pdf: 3178267 bytes, checksum: 2cf663dcd224c489e1ad9c983349b072 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Fungus-growing attine ants forage diverse substrates to grow mutualistic fungi for food. In addition to the fungal partner, colonies of these insects harbor a rich microbiome composed of bacteria, filamentous fungi and yeasts. Previous studies investigated ecological aspects of filamentous fungi in gardens of leaf-cutter ants and reported some Trichoderma species; however, no studies systematically addressed the putative association of Trichoderma species with attine ants, especially in non-leafcutter ants. Here, a total of 68 strains of Trichoderma preserved in our collection were analyzed using three molecular markers (ITS, tef1 and rpb2). In addition, 30 out of 68 strains were also morphologically examined. The strains correspond to samples collected from leaf-cutter and non-leafcutter ants in 12 points from four states in Brazil and two points in Texas (USA), comprising the largest sampling carried out so far for Trichoderma in attine ant environment. Our results revealed the richness of Trichoderma in this environment, since we found 19 Trichoderma species, including three new species described in the present work (T. attinis, T. texana and T. longifialidicum). Moreover, we show that all 68 strains grouped within different clades across the Trichoderma phylogeny, which are identical or closely related to strains derived from several other environments, supporting for a transient nature of the genus Trichoderma in attine ant colonies. The discovery of three new species suggests that the dynamic foraging behavior of these insects might be responsible for accumulation of transient fungi into their colonies, which might hold several fungal taxa still unknown for science