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Aspectos ecológicos da comunidade fúngica do solo em ambientes ripários com diferentes formas de manejo / Ecological aspects from the fungi community soil in riparian environments with different handlings forms

Prade, Cristian André January 2007 (has links)
As florestas ripárias no Estado do Rio Grande do Sul, encontram-se fortemente reduzidas e fragmentadas e, particularmente no rio Taquari-Antas, os efeitos dessa fragmentação são observados. O presente trabalho teve por objetivo avaliar a diversidade fúngica do solo, em ambientes ripários com diferentes formas de manejo, na região de Roca Sales, Rio Grande do Sul, Brasil. Estas amostras foram coletadas em diferentes estações, entre 2003 e 2005. As amostras de solo foram diluídas até 10-6 e semeadas sobre meio BDA, em placas de Petri. A incubação ocorreu a 27ºC por seis dias, com fotoperíodo de 12 horas, para posterior identificação dos espécimes. O pomar de Citrus sinensis com manejo agroecológico apresentou 28 espécies, seguido pelo pomar de C. sinensis com manejo convencional com 26 espécies, pela mata ripária com vegetação nativa 24 espécies e por último pela área reflorestada por Hovenia dulcis Thumb., com 15 espécies. As espécies fúngicas que apresentaram maior número de isolados, independente das áreas amostradas, foram: Trichoderma harzianum, Aspergillus niger e Penicillium citrinum. / The riparian forests in Rio Grande do Sul state, is strongly reduced and fragmented and, particularly on the river Taquari-Antas, the effects of this fragmentations are observed. This current work had as a goal to evaluate the fungic soil diversity, in riparian enviromments with different forms of handling, in the region of Roca Sales, Rio Grande do Sul, Brazil. The soil samples were collected in different seasons, between 2003 and 2005. These soil samples were diluted up to 10-6 and spread in Petri plates in media PDA. The incubation took place at 27ºC for 6 days, with a photoperiod of 12 hours, for after specimen identification. The higher number of specimens was observed, in Citrus orchards with agroecological handling; followed by, Citrus orchards with conventional handling; by riparian forest with arboreal native species and at last by riparian reforested areas with Hovenia dulcis Thumb. The fungic species which showed higger number of isolates, independently of the sampled areas, were: Trichoderma harzianum and Aspergillus niger.
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Avaliação clínica da fungemia detectada pelo sistema de hemocultivo por lise-centrifugação (Isolator). Treze anos de experiência, 1994-2007

Oliveira, Flávio de Mattos January 2007 (has links)
Foram incluídos no estudo 525 casos de fungemia causadas por Candida spp, Cryptocossus spp, Trichosporon spp, Rhodotorula spp, Histoplasma capsulatum, Saccharomyces cerevisiae e Pseudozyma aphidis, que constam nos arquivos do Laboratório de Micologia, Santa Casa-Complexo Hospitalar, Porto Alegre (RS) num período de 13 anos (1994-2007). Aspectos demográficos, doenças de base e fatores associadas aos episódios de fungemia foram estudados. Assim como, os agentes etiológicos e a mortalidade global entre os pacientes com fungemia. Os 525 casos foram classificados da seguinte maneira: candidemia (413/78,6%), subdivididos em: Candida albicans (151/36,5%), C. parapsilosis (91/22%), C. tropicalis (65/15,7%), C. glabrata (27/6,5%), C. pelliculosa (18/4,3%), C. guilliermondii (18/4,3%), C. humicola (7/1,7%), C. krusei (7/1,7%), C. famata (5/1,2%), C. lusitaniae (4/0,9%), C. sake (4/0,9%), C. lipolytica (3/0,7%), C. globosa (3/0,7%), C. intermedia (2/0,5%), C. kefyr (1/0,24%), C. colliculosa (1/0,24%) e Candida sp (8/1,9%); criptocococemia (77/14,6%), subdivididos em: Cryptococcus neoformans (72/93,5%), C. gattii (3/3,9%), C. laurentii (1/1,3%), Cryptococcus sp (1/1,3%); Histoplasma capsulatum (21/4%);Trichosporon spp (9/1,5%) subdivididos em: T. asahii (8/89%), T. mucoides (1/11%); Rhodotorula spp (5/0,9%) subdivididos, Rhodotorula sp (4/80%), R. mucilaginosa (1/20%); Saccharomyces cerevisiae (1/0,2%); Pseudozyma aphidis (1/0,2%)O sexo masculino foi o mais prevalente (288/55%), porém sem significância estatística, a idade variou de 12 dias à 97 anos, com uma mediana de 39,64 anos. A mortalidade nestes pacientes variou entre 22% e 52%. As doenças de base mais frequente foram câncer e Aids. Febre foi o sinal mais frequente. x Neste contexto, a fungemia deve ser incluída no diagnóstico diferencial destes pacientes com febre de origem desconhecida e prolongada. Utilizando-se de técnicas laboratoriais específicas para o diagnóstico etiológico. / We reviewd 525 cases of fungemia caused by Candida spp, Cryptocossus spp, Trichosporon spp, Rhodotorula spp, Histoplasma capsulatum, Saccharomyces cerevisiae and Pseudozyma aphidis. They have all been part of the files of the Mycology Laboratory at Santa Casa Hospital Complex in Porto Alegre (RS), during a thirteen-year period (1994 - 2007). Demographic aspects, underlying diseases and factors associated with the fungemia episodes were studied, as well as the etiologic agents and the global mortality among the patients having fungemia. The 525 cases included in the study were classified according to the following: candidemia (413/78,6%), subdivided in: Candida albicans (151/36,5%), C. parapsilosis (91/22%), C. tropicalis (65/15,7%), C glabrata (27/6,5%), C. pelliculosa (18/4,3%), C.guilliermondii (18/4,3%), C. humicola (7/1,7%), C. krusei (7/1,7%), C. famata (5/1,2%), C. lusitaniae (4/0,9%), C. sake (4/0,9%), C. lipolytica (3/0,7%), C. globosa (3/0,7%), C. intermedia (2/0,5%), C. kefyr (1/0,24%), C. colliculosa (1/0,24%) e Candida sp (8/1,9%); criptocococemia (77/14,6%), subdivided in: Cryptococcus neoformans (72/93,5%), C. gattii (3/3,9%), C. laurentii (1/1,3%), Cryptococcus sp (1/1,3%); Histoplasma capsulatum (21/4%);Trichosporon spp (9/1,5%) subdivided in: T. asahii (8/89%), T. mucoides (1/11%); Rhodotorula spp (5/0,9%) subdivided, Rhodotorula sp (4/80%), R. mucilaginosa (1/20%); Saccharomyces cerevisiae (1/0,2%); Pseudozyma aphidis (1/0,2%) The male gender was the most prevalent (288/55%), although no significance difference was observed. The age ranged from 12 days to 97 years old, with an average of 39,64 years. The mortality among these patients ranged between 22% and 52%. The most frequent underlying diseases were cancer and Aids. Fever was the most frequent sign. xii Within this context, fungemia must be included in the differential diagnosis of these patients presenting long-term fever with unknown cause. Making use of specific laboratorial techniques for the etiologic diagnosis.
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Phellinus Quélet (Hymenochaetaceae, basidiomycota) no sul do Brasil

Silveira, Cláudia Julia Groposo January 2005 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Vegetal. / Made available in DSpace on 2013-07-16T01:32:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Este estudo tem como principal objetivo investigar as relações filogenéticas das espécies de Phellinus Quélet (Hymenochaetaceae, Basidiomycota) no sul do Brasil (Estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul). Baseia-se, principalmente, nas descrições morfológicas citadas na bibliografia dos dois Estados e, em menor proporção, na análise de espécimes de herbários. No total existem 21 táxons em Santa Catarina e 26 no Rio Grande do Sul. A partir das descrições foram selecionados 20 caracteres e seus respectivos estados para serem analisados com relação a cada táxon. As análises dos dados para os dois Estados, aplicando os métodos neighbor-joining e parcimônia, foram realizadas por separado e posteriormente combinadas. Os resultados obtidos suportam o polifiletismo do gênero e a existência de prováveis grupos monofiléticos menos inclusivos. Assim, algumas espécies tradicionalmente consideradas para o gênero são transferidas para gêneros mais homogêneos como Fomitiporia Murrill e Fuscoporia Murrill. Outros assuntos pertinentes, como o desenvolvimento de sistemas de classificação, de conceitos de espécie e da formação dos agrupamentos dentro de Hymenochaetaceae, além dos atuais e possíveis usos de algumas espécies de Phellinus, são tratadas ao longo do trabalho.
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Desenvolvimento inicial da bananeira micorrizada e atividade microbiana em neosolo quartzarenico irrigado com água salina / Initial development of mycorrhizal banana plants and microbial activity in quartzipsamment irrigated with saline water

Mascena, Aldênia Mendes January 2010 (has links)
MASCENA, A. M. Desenvolvimento inicial da bananeira micorrizada e atividade microbiana em neosolo quartzarenico irrigado com água salina. 88 f. 2010. Dissertação (Mestrado em Solos e Nutrição de Plantas) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2010. / Submitted by Aline Nascimento (vieiraaline@yahoo.com.br) on 2013-06-10T15:28:48Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_ammascena.pdf: 1906484 bytes, checksum: efa97eb84ee48456a36681e24e3ee80a (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Nascimento(vieiraaline@yahoo.com.br) on 2013-06-10T16:08:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_ammascena.pdf: 1906484 bytes, checksum: efa97eb84ee48456a36681e24e3ee80a (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-10T16:08:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_ammascena.pdf: 1906484 bytes, checksum: efa97eb84ee48456a36681e24e3ee80a (MD5) Previous issue date: 2010 / The Northeast of Brazil region meets the soil-climate conditions for a favorable cultivation of the banana plant, which can be demonstrated by the prominent position of the region as a great banana producer in the country. The banana is a fruit consumed all over the world, so being intensively cropped everywhere; its importance involves economic, nutritional and social aspects. The soil salinity represents a fundamental stress factor on the banana yield and such soil salinity is very common in northeast of Brazil (semi-arid climate) soils where the crop is widely grown. Under this conditions, arbuscular mycorhizal fungi (AMF) have been investigated lately with the objective to evaluate the role of the fungus in decreasing the plant salinity stress effects. Thus, the present study had the objective to investigate the effects of different irrigation water salt levels on: (a) the soil salt accumulation, (b) on the fungus (AMF) colonization, and (c) on the banana Musa sp. seedling plant growth colonized with native AMF. An experiment was conducted under greenhouse conditions (belonging to Soil Science Department – Federal University of Ceará State – Campus PICI, Fortaleza city). The statistical design was an entirely randomized blocks, in subdivided plots, with a four harvest periods (40, 60, 80 and 100 days after planting), five level of soil salinity (0,5; 1,5; 2,5; 3,5 and 4,5 dS m-1) and four replicates, summing a total of 80 treatments. The banana seedling plants were subjected to a 40 days period of adaptation for fungus infection (mycorrization) and afterwards being irrigated with saline water. The first harvest was at the 40 days after the planting; the other harvests were done at the 60, 80, and 100 days after the planting. The following variables were evaluated: aerial plant dry matter, plant height, stem diameter, stomatal conductance, transpiration rate, photosynthetic rate, soil pH, soil electrical conductivity, root fungus colonization, estimates of AMF sporous, and soil basic respiration. Increase in the irrigation water salt level caused salt accumulation in the soil which was measured through soil electrical conductivity; the soil pH was not significantly affected. The increasing soil salinity did not cause significant differences in the following varables: stomatal conductance, plant transpiration rate, plant height, and stem diameter, otherwise, it reduced the photosynthetic rate and the plant aerial dry matter yield, notably at the 80th after planting. The increase in the salinity of the irrigation water caused a reduction of N and K plant concentrations, but increased the Na concentration an had no effect on the XIII P. The root fungus colonization and the basic soil respiration were both reduced by the salinity of the irrigation water; AMF fungus sporous formation in the soil was not affected. In general, the responses observed in both soil (chemical and microbiological) and plant, as results of the water salinity, were affected by the time exposure of the system soil/plant to the different salinity irrigation water levels. / O Nordeste brasileiro reúne condições edafoclimáticas favoráveis ao cultivo da banana, que pode ser comprovado pela posição de destaque dessa região no cenário produtivo brasileiro. Sendo uma fruta de preferência mundial, e uma das mais exploradas no mundo, assume importância fundamental, pelo seu valor econômico, nutritivo e social. A salinidade dos solos é um importante fator de estresse, ocorrendo em regiões semiáridas e áridas do Nordeste brasileiro, onde a bananeira é cultivada. Neste contexto, os fungos micorrizicos arbuscular (FMA) vêm sendo pesquisados nos últimos anos, com o objetivo de minimizar algum dos efeitos do estresse salino nas plantas. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o efeito de níveis de sais da água de irrigação sobre o acúmulo de sais no solo, à colonização com FMA e ao desenvolvimento de mudas de bananeira Musa sp. colonizadas com fungos micorrizicos arbusculares nativos. Para isso foi instalado um experimento em casa de vegetação do Departamento de Ciências do Solo da Universidade Federal do Ceará, no Campus do Pici em Fortaleza. O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado, em parcelas subdivididas, correspondendo a 4 períodos de colheita (40, 60, 80 e 100 DAT) e 5 níveis de salinidade (0,5; 1,5; 2,5; 3,5 e 4,5 dS m-1), com 4 repetições totalizando 80 unidades experimentais. As mudas de bananeiras passaram por um período de aclimatização e micorrização de 40 dias após o transplantio (DAT), sendo iniciada a aplicação de água salina após este período. A primeira coleta foi aos 40 DAT antes da aplicação dos níveis de salinidade, sendo realizadas as outras coletas aos 60, 80 e 100 DAT, onde foram avaliados os parâmetros: matéria seca da parte aérea e altura das plantas, diâmetro do XI pseudocaule, condutância estomática, taxa de transpiração, taxa fotossintética, pH do solo, condutividade elétrica do solo, colonização micorrízica radicular, densidade de esporos de FMA e respiração basal do solo. O aumento da salinidade da água de irrigação provocou acúmulo de sais no solo, medido pela condutividade elétrica, porém não influenciou significativamente o pH. O aumento nos níveis de salinidade não ocasionou diferença significativa na condutância estomática, taxa de transpiração das plantas, altura das plantas e diâmetro do pseudocaule, porém reduziu a taxa fotossintética e a produção de matéria seca das plantas, notadamente após 80 DAT; o aumento da salinidade da água de irrigação reduziu os teores de N e K, e aumento nos teores de Na, porém não influenciou os teores de P nas plantas. O aumento da salinidade reduziu a colonização micorrízica radicular e a respiração basal do solo, porém não influenciou a densidade de esporos de FMA no solo. De modo geral, as respostas observadas no solo (químicas e microbiológicas) e na planta, em conseqüência da salinidade, foram influenciadas pelo tempo de exposição do sistema solo/planta aos diferentes tratamentos de irrigação.
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Produção de ocratoxina A por fungos isolados de grãos de café e por fungos produtores de pectinases / Ochratoxin A production by fungi isolated from coffee beans and by pectinolytic fungi

Visôtto, Liliane Evangelista 25 April 2003 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-13T19:26:42Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 744359 bytes, checksum: 87ca72fc10ae980db171625c92bdef8d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-13T19:26:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 744359 bytes, checksum: 87ca72fc10ae980db171625c92bdef8d (MD5) Previous issue date: 2003-04-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Avaliou-se a produção de ocratoxina A por fungos filamentosos isolados de grãos de café e por fungos produtores de pectinases. Cinqüenta e seis fungos filamentosos foram isolados dos grãos de café, compreendendo grande variedade de gêneros, dentre os quais o Penicillium foi predominante. Dentre os isolados obtidos, apenas um, identificado como Aspergillus ochraceus, foi capaz de produzir ocratoxina A. Aspergillus ochraceus foi, então, cultivado nos meios de cultura Czapek Dox modificado, extrato de levedura e meio de coco, a 25oC, por 120 horas, com agitação e sem agitação. Constatou-se que a produção de ocratoxina A ocorreu quando o isolado A. ochraceus foi cultivado em caldo Czapek Dox modificado e em caldo extrato de levedura, sem agitação. A ocratoxina A não foi detectada nos cultivos sob agitação. A toxina foi identificada por cromatografia de camada delgada e confirmada pela cromatografia líquida de alta eficiência. A ocratoxina A não foi detectada nos sobrenadantes das culturas dos fungos pectinolíticos Aspergillus niger, Penicillium cultivados expansum, nos meios Penicillium minerais griseoroseum tamponados e Penicillium e italicum, não-tamponados, suplementados com pectina cítrica como única fonte de carbono, a 25oC, por 120 horas, com agitação. As atividades das enzimas pectinolíticas foram determinadas nessas condições de cultivo e variaram de 25,51 a 61,31μmol mL -1 min -1 , para poligalacturonase e 9,79 a 34,5 nmol mL -1 min -1 , para pectina liase. / In this work, the production of ochratoxin A by filamentous fungi isolated from coffee beans and by pectinolytic fungi was evaluated. Fifty-six isolates were obtained from coffee beans, representing a wide variety of fungal genera within which Penicillium was the predominant one. Among all isolates, only one, identified as Aspergillus ochraceus, was able to produce ochratoxin A. This fungus was then cultivated in modified Czapek Dox, yeast extract broth, and grated coconut medium, at 25°C for 120 hours, with or without shaking. When grown in modified Czapek medium and yeast extract broth, without shaking, A. ochraceus produced ochratoxin A in detectable levels by thin layer chromatography and confirmed by high performance liquid chromatography. Ochratoxin A was not detected in the supernatant of the cultures of the pectinolytic fungi Aspergillus niger, Penicillium expansum, Penicillium griseoroseum, and Penicillium itallicum cultivated in buffered and unbuffered mineral media, supplemented with citric pectin as the sole carbon source, at 25°C for 120 hours. The activities of pectinolytic enzymes were determined under these cultivation conditions and varied from 9.79 to 34.5 nmol mL -1 min -1 , for pectin lyase, and from 25.51 to 61.31 μmol mL -1 min -1 , for polygalacturonase.
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Caracterização morfológica e molecular de fungos micorrízicos de orquídeas / Morphological and molecular characterization of orchids mycorrhizal fungi

Nogueira, Ricardo Eustáquio 26 August 2004 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-14T12:59:57Z No. of bitstreams: 1 texto comṕleto.pdf: 141484 bytes, checksum: ca1bc3d59113b37b3518e0aaf5c17ace (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-14T12:59:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto comṕleto.pdf: 141484 bytes, checksum: ca1bc3d59113b37b3518e0aaf5c17ace (MD5) Previous issue date: 2004-08-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As micorrizas são associações consideradas obrigatórias para as orquídeas que ocorrem em ecossistemas naturais, pois este grupo de plantas depende dos fungos tanto para a germinação quanto para o seu estabelecimento. O conhecimento da biodiversidade dos fungos que realizam a associação micorrízica com espécies de orquídeas brasileiras pode ser de grande importância para futuros programas de reintrodução, conservação e manejo dessa espécie vegetal. Assim, este trabalho teve por objetivo caracterizar morfológica e molecularmente alguns isolados fúngicos, do grupo rizoctonióides, de orquídeas neotropicais das regiões do Quadrilátero Ferrífero e Zona da Mata no Estado de Minas Gerais. As características morfológicas se mostraram suficientes para a classificação de isolados em nível de gênero, os quais foram classificados como pertencentes aos gêneros Ceratorhiza e Epulorhiza. A caracterização morfológica permitiu a construção de um fenograma mas não definir suas afinidades filogenéticas. Nove isolados tiveram o espaçador interno transcrito do rRNA seqüenciado, confirmando as suas identificações como pertencentes aos gêneros Ceratorhiza e Epulorhiza. Suas afinidades em relação a outros isolados com seqüências depositadas no GeneBank foram estimadas por meio de métodos filogenéticos. Os resultados demonstram grande diversidade genética destes fungos no Brasil, uma vez que os diferentes isolados obtidos neste trabalho agruparam-se a diferentes clados descritos em estudos com fungos rizoctonióides de outras regiões do mundo. Não pode ser determinada nenhuma relação de especificidade entre os isolados fúngicos e as plantas hospedeiras. / Mycorrhizal association can be considered obligates to orchids in natural ecossystems, since this group of plant depends on the fungi to both germination and stablishment in natural conditions. The biodiversity of orquids mycorrhizal fungi is the great importance to future programs of reintroduction, conservation and management of this plant species. So, the objective of this work was to characterize mycorrhizal fungi, belonging to rizoctoniods groups, morphological and mollecularlly, isolated from neotropical orquids from Quadrilátero Ferrífero and Zona da Mata of Minas Gerais State, Brazil. Morphological characterisitics were sufficient to classify the isolates to Genus level, which were classified as belonging to Ceratorhiza and Epulorhiza. Using morphological characteristics it was possible to build a phenogram but not to define phylogenetics afinities. Nine isolates was sequenced using ITS of rRNA, confirming their identity as Ceratorhiza and Epulorhiza. The affinities to another isolates, which have the sequences deposited in GeneBank, were estimated by phylogenetic methods and showed high diversity of these group of the fungus in Brazil, since different isolates used in this work agrouped to distint clade compared to that described in another regions of the world. It was not possible to determine any specificity relationship between isolates of the fungi and host plants.
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Produção massal de Clonostachys rosea / Mass production of Clonostachys rosea

Saraiva, Rodrigo Moreira 17 February 2009 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-20T18:42:52Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 502635 bytes, checksum: 3d459feebbf0f27372e1bb496c77054c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-20T18:42:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 502635 bytes, checksum: 3d459feebbf0f27372e1bb496c77054c (MD5) Previous issue date: 2009-02-17 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / O biocontrole do mofo cinzento em condições de campo é viável, este fato é comprovado pelo acúmulo de informações quanto ao antagonismo de C. rosea a B. cinerea. Porém, demanda-se otimizar a produção massal do antagonista, bem como obter formulação de baixo custo e estável no tempo. Nesse trabalho, objetivou-se desenvolver metodologia para produzir C. rosea. Avaliaram-se diferentes substratos, a otimização da produção, o tempo ótimo de produção, a suplementação do substrato, a concentração do inóculo inicial, a produção de esporos na ausência de luz e a produção de esporos em diferentes recipientes. Milheto, palha de soja e palha de feijão foram substratos eficientes na produção, que foi afetada pelo nível de umidade em cada substrato. A adição de suco de vegetal (V8 ® ) aumentou a esporulação em substrato arroz. Abrindo-se o recipiente após 6 dias de colonização, antecipou-se o tempo do início da coleta e maior produção de esporos. A faixa de concentração inicial testada (10 3 a 10 8 ) não afetou a produção final de esporos. Não houve diferença significativa entre a produção de esporos na ausência de luz e com fotoperíodo de 12 h, aos 30 dias de colonização. Avaliou-se, ainda, a sobrevivência de esporos de C. rosea, armazenados a 4°C ou temperatura ambiente após diferentes tempos de secagem (12, 24, 36 e 48 h) com dois diluentes (água e sacarose 35%). Também se avaliou a sobrevivência dos esporos em substrato moído, com ou sem Caolin, armazenados a 4°C ou temperatura ambiente. Após 4 meses, avaliou-se a capacidade destes esporos em colonizar folhas de eucalipto. A germinação dos esporos submetidos a diferentes tempo de secagem reduziu-se a zero após dois meses de avaliação, independente do tratamento. Em substrato moído, ocorreu aumento significativo da germinação na presença de caolim, armazenamento a 4°C no primeiro mês de avaliação, mas a germinação reduziu-se a zero após dois meses de avaliação. Realizou-se teste de colonização em folhas de eucalipto com esporos em que a porcentagem de germinação foi zero, e os esporos colonizaram-nas. Portanto, é possível ocorrer a dormência dos esporos, o que será estudado posteriormente. / It is believed that the biocontrol of gray mold with C. rosea under field conditions is viable. However mass production of the antagonist must be optimized and a formulation of low cost and stable over time must be developed. Therefore this research aimed to develop methods to produce and commercialize C. rosea in a commercial scale. We evaluated different substrates, the optimization to production, the optimum time to production, the supplementation of substrate, the initial inoculum concentration, the production of spores on absence of light, and the production of spores in different containers. Millet, soybean straw, and bean straw were efficient as substrates to produce spores, which was affected by the level of moisture on each substrate. The addition of V8 ® vegetable juice increased the sporulation on rice. The opening of the container after 6 days of colonization reduced the time to start to collect spores and increased spores production. The range of initial concentration tested (10 3 to 10 8 ) did not affect the final spores production. After 30 days, it was found no significant difference between the production of spores on absence of light and photoperiod of 12h. We also evaluated the survival of spores of C. rosea in a formulation stored at 4°C or laboratory temperature (24±2°C) after different drying times (12, 24, 36 and 48 h) with two solvents (water and sucrose 35%). The survival of spores in ground substrate, with or without Kaulin, stored at 4°C or environment temperature was evaluated. The ability of these spores to colonize leaves of eucalyptus was also evaluated after 4 months storage. The germination of formulated spores of all treatments reduced to zero after 2 months of evaluation. In the ground substrate, germination significantly increased in the presence of Kaulin, storage at 4°C, at the second month of evaluation, but it was zero after 2 months of evaluation. However the fungus colonized eucalyptus leaves even after the formulated spores being stored for 4 months storage. Therefore, it is possible that the spores become dormant, which will be studied later. / Dissertação liberada do sigilo pelo Orientador em 29 de novembro de 2016. Documento anexado ao Termo de Autorização.
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Estimativa dos níveis de bioaerossóis e compostos orgânicos voláteis fúngicos em ambientes ocupacionais no município de Fortaleza - Ceará / Estimation of aerosols levels and volatile organic compounds fungal in occupational environments in the city of Fortaleza - Ceará

Pantoja, Lydia Dayanne Maia 20 May 2016 (has links)
PANTOJA, L. D. M. Estimativa dos níveis de bioaerossóis e compostos orgânicos voláteis fúngicos em ambientes ocupacionais no município de Fortaleza - Ceará. 2016. 169 f. Tese (Doutorado em Engenharia Civil: Saneamento Ambiental) – Centro de Tecnologia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016. / Submitted by Hohana Sanders (hohanasanders@hotmail.com) on 2016-07-15T17:04:14Z No. of bitstreams: 1 2016_tese_ldmpantoja.pdf: 1775236 bytes, checksum: 8ce6e1787c0ed6b36d1e271f5b9d39e5 (MD5) / Approved for entry into archive by Marlene Sousa (mmarlene@ufc.br) on 2016-07-18T17:21:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_tese_ldmpantoja.pdf: 1775236 bytes, checksum: 8ce6e1787c0ed6b36d1e271f5b9d39e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-18T17:21:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_tese_ldmpantoja.pdf: 1775236 bytes, checksum: 8ce6e1787c0ed6b36d1e271f5b9d39e5 (MD5) Previous issue date: 2016-05-20 / The search for more accurate methods of characterization of fungal composition in the air is required. It is known that when fungi develop within the structure of a building or ventilation filters, clearly there is a reasonable amount of \"hidden contamination\" can not be detected only through visual inspection. As well, the fact is that the fungi when they start to develop emit into the atmosphere Organic Compounds Fungal Volatile (COVFs), arising from the metabolic pathways or from degradation materials due to the release of enzymes produced by them. In the meantime, the goal of this thesis was to estimate the indoor air quality via bioaerosols and COVFs order improvements in monitoring and control of occupational environments in Fortaleza, Ceará. Therefore, there was the analysis of the researched environments (tertiary hospital, shopping center and public library) and application questionnaire to users in order to analyze the worker\'s understanding of the air quality. Then there was the preparation and validation of a protocol for determining COVFs. For the analysis of COVFs was used gas chromatography coupled to mass spectrometry is performed on Analysis Laboratory Trace - UFC. As for fungal samples were sent the Microbiology Laboratory - UECE, in order to identify through macro analysis and micromorphological and biochemical tests. 144 samples were analyzed front of COVFs, with nine compounds were detected in at least one of the sectors considered and only 3-octanone was not observed. In the quantitative analysis, with the highest COVFs concentrations (in g / m3) were 2-methyl-1-propanol, 3-methyl-1-butanol and 2-heptanone. At the regard to fungal findings, 72 samples were analyzed, being observed a high number of colony forming units per cubic meter (UFC.m-3) in all environments, in particular the general collection (3,497 UFC.m-3), followed by the center covered parking commercial (3245 UFC.m-3). While regarding the fungi spectrum composition airborne the three environments, it is formed predominantly by filamentous hyaline, especially the genus Aspergillus sp., and yeasts such as Candida species tropicalis. We evaluated the relationship between COVFs and fungal strains, and found the presence Six similarity groups such as 2-methyl-1-propanol which had a distribution space similar to fungi Acremonium sp., Aspergillus niger, Candida tropicalis and Penicillium sp. Also, we analyzed the distribution of the quantity of sample and COVFs Fungal by seasons, there was a significant difference between fungal samples and seasonality. The data presented mapped existence in the presence of COVFs working environments analyzed, characterizing the need for control of these compounds in ambient air indoor. Through research is expected to provide improved the current monitoring in the absence of national legislation on the COVFs, aiming in the future assist decision making managers in relation to occupational hazards, prompting further discussion in the academic and legislative environment and ultimately contribute to the systematic study of Aerobiology in the country. / A busca por métodos mais acurados de caracterização da composição fúngica no ar se faz necessária. Sabe-se que quando o fungo se desenvolve no interior da estrutura de um edifício ou em filtros de ventilação, claramente, há uma quantidade razoável de \"contaminação oculta\", não podendo ser detectada apenas através de uma inspeção visual. Bem como, é fato que os fungos quando começam a se desenvolver emitem para a atmosfera Compostos Orgânicos Voláteis Fúngicos (COVFs), que surgem das vias metabólicas ou a partir da degradação de materiais, devido à liberação de enzimas produzidas pelos mesmos. Nesse ínterim, o objetivo da presente tese foi estimar a qualidade do ar interno através de bioaerossóis e COVFs visando melhorias no monitoramento e controle de ambientes ocupacionais no município de Fortaleza, Ceará. Para tanto, houve a análise dos ambientes pesquisados (hospital terciário, shopping center e biblioteca pública) e aplicação de questionário aos usuários, visando analisar o entendimento do trabalhador sobre a qualidade do ar. Em seguida, houve a elaboração e validação de um protocolo para determinação de COVFs. Para a análise dos COVFs foi utilizada a cromatografia gasosa associada à espectrometria de massa, sendo executada no Laboratório de Análise Traço - UFC. Enquanto para as amostras fúngicas foram encaminhadas ao Laboratório de Microbiologia - UECE, visando à identificação por meio de análise macro e micromorfológica e provas bioquímicas. Foram analisadas 144 amostras frente aos COVFs, sendo que nove compostos foram detectados em pelo menos um dos setores analisados e apenas o 3-octanona não foi observado. Na análise quantitativa, os COVFs com as maiores concentrações (em μg/m3) foram 2-metil-1-propanol, 3-metil-1-butanol e 2-heptanona. No tocante aos achados fúngicos, 72 amostras foram analisadas, sendo observado um elevado número de unidades formadoras de colônia por metro cúbico (UFC.m-3) em todos os ambientes, em especial o acervo geral (3.497 UFC.m-3), seguido do estacionamento coberto do centro comercial (3.245 UFC.m-3). Enquanto a respeito da composição do espectro de fungos anemófilos dos três ambientes, este é formado predominantemente por filamentosos hialinos, com destaque para o gênero Aspergillus sp., bem como, leveduras, como a espécie Candida tropicalis. Avaliou-se a relação entre COVFs e amostras fúngicas, sendo constatado a presença de seis grupos de similaridade, como o 2-metil-1-propanol que apresentou uma distribuição espacial semelhante aos fungos Acremonium sp., Aspergillus niger, Candida tropicalis e Penicillium sp. Também, analisou-se a distribuição do quantitativo dos COVFs e das amostras fúngicas por estações climáticas, havendo diferença significativa entre amostras fúngicas e à sazonalidade. Os dados apresentados mapearam a existência da presença de COVFs nos ambientes laborais analisados, caracterizando assim a necessidade do controle desses compostos no ar ambiental de interiores. Com a pesquisa espera-se estabelecer uma melhoria no monitoramento vigente devido à ausência de legislação nacional em vigor sobre os COVFs, visando no futuro auxiliar a tomada de decisão de gestores em relação aos riscos ocupacionais, instigando uma maior discussão no meio acadêmico e legislativo e, por fim, contribuir para o estudo sistematizado da Aerobiologia no país.
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Conteúdo de proteína do solo relacionada à glomalina em solos do município de Irauçuba-CE e sua relação com a degradação / Soil protein content related to Glomalin in Irauçuba-CE municipality of soils and its relationship with the degradation

Silva, Cillas Pollicarto da January 2016 (has links)
SILVA, Cillas Pollicarto da. Conteúdo de proteína do solo relacionada à glomalina em solos do município de Irauçuba-CE e sua relação com a degradação. 2016. 47 f. Dissertação (Mestrado em Ciência do Solo)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016. / Submitted by Aline Mendes (alinemendes.ufc@gmail.com) on 2016-08-31T19:15:19Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_cpsilva.pdf: 1630748 bytes, checksum: c3b54b5cdd67018cdbde3d61a11a44ad (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2016-08-31T23:11:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_cpsilva.pdf: 1630748 bytes, checksum: c3b54b5cdd67018cdbde3d61a11a44ad (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-31T23:11:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_cpsilva.pdf: 1630748 bytes, checksum: c3b54b5cdd67018cdbde3d61a11a44ad (MD5) Previous issue date: 2016 / Due to the systematic nature of human activities, combined with the natural actions, the problem of land degradation is increasing more and more and causing a sharp process of desertification, which results in loss of biodiversity, erosion and lack of soil fertility. In view of this, the use of tools indicating the stages of this degradation and recovery is required in order to enable a proper management of these areas. Thus, the study of arbuscular mycorrhizal fungi, such as order to facilitate the recovery of degraded areas, has increased, especially for the production of soil-related protein to Glomalin, which is of great importance for the aggregate stability plus a large potential use as soil quality indicator. Therefore, this study aimed to evaluate soil protein concentrations related to Glomalin, correlating them with the chemical, physical and biological attributes in areas of Irauçuba-EC municipality, namely: area degraded by overgrazing, process area natural regeneration managed by exclusion of domestic animals and native forest characterized by vegetation shrub and tree savanna. They were made collections of deformed soil samples at a depth of 0-10 cm in each area and evaluated attributes of FMA, such as density of total spores, soil protein content related to Glomalin, easily extractable and total (PSRGFE and PSRGT) ; soil chemical properties (pH, Ca2+, Mg2+ Al3+, P, CO, N) and physical (aggregate stability). The results obtained with the average tests showed that among the three areas, only the native forest showed significant differences in the two protein fractions (PSRGFE and PSRGT). However, with respect to the spore density and stability of aggregates, the area of native bush and deletion showed the best average values. Content PSRG associated with other soil attributes, helps to distinguish the quality and monitoring of areas with different levels of soil degradation in Irauçuba-CE. In hierarchical cluster analysis can verify the formation of three groups, confirming the native forest of the distinction with the areas of overgrazing and exclusion, as well as the similarity of these last two areas, indicating that there is a need for more time that there are significant differences between these areas with respect to its recovery. / Devido ao caráter sistemático das atividades antrópicas, combinado com as ações naturais, o problema da degradação do solo vem aumentando cada vez mais e causando um acentuado processo de desertificação, que resulta em perda de biodiversidade, erosão e carência da fertilidade do solo. À vista disso, a utilização de ferramentas que indiquem os estádios dessa degradação e recuperação se faz necessário, a fim de viabilizar um manejo adequado dessas áreas. Dessa forma, o estudo dos fungos micorrizicos arbusculares, como perspectiva de facilitar a recuperação de áreas degradadas, vem aumentando, especialmente pela produção da proteína do solo relacionada à glomalina, que é de grande importância para a estabilidade de agregados além de um grande potencial de utilização como indicador de qualidade do solo. Portanto, o presente estudo teve como objetivo avaliar concentrações de proteína do solo relacionada à glomalina, correlacionando-as com os atributos químicos, físicos e biológicos em áreas do município de Irauçuba-CE, sendo elas: área degradada por superpastejo, área em processo de regeneração natural manejada por exclusão de animais domésticos e uma área de mata nativa caracterizada por vegetação de caatinga arbustiva-arbórea. Foram feitas coletas de amostras deformadas de solo na profundidade de 0-10 cm em cada área e avaliados atributos dos FMA, tais como: densidade de esporos totais, teores de proteína do solo relacionada à glomalina, facilmente extraível e total (PSRGFE e PSRGT); atributos químicos do solo (pH, Ca2+, Mg2+, Al3+, P, CO, N) e físicos (estabilidade de agregados). Os resultados obtidos com os testes de médias comprovaram que entre as três áreas, apenas a mata nativa apresentou diferenças significativas quanto às duas frações da proteína (PSRGFE e PSRGT). Entretanto, no que diz respeito à densidade de esporos e estabilidade de agregados, a área de mata nativa e exclusão foram as que apresentaram os melhores valores médios. O conteúdo de PSRG, associada com outros atributos edáficos, contribui para discriminar a qualidade e monitoramento de áreas com diferentes níveis de degradação do solo em Irauçuba-CE. Na análise de agrupamento hierárquico pode-se verificar a formação de três grupos, comprovando-se a distinção da área de mata nativa com as áreas de superpastejo e exclusão, como também a similaridade dessas duas últimas áreas, indicando que existe a necessidade de mais tempo para que ocorram diferenças significativas entre essas áreas no que diz respeito a sua recuperação.
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Exploring fungal diversity: Passalora, Pseudocercospora, Sirosporium and Zasmidium on Brazilian plants / Explorando a diversidade fúngica: Passalora, Pseudocercospora, Sirosporium e Zasmidium em plantas brasileiras

Silva, Meiriele da 18 February 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-08-22T11:11:06Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 7208096 bytes, checksum: b47fc09fb64969fdb3686851115041b9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-22T11:11:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 7208096 bytes, checksum: b47fc09fb64969fdb3686851115041b9 (MD5) Previous issue date: 2016-02-18 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os fungos conhecidos pela denominação informal de cercosporóides são um dos maiores grupos de microfungos, compreendendo mais de 2000 espécies e englobando diversos gêneros de formas assexuais tendo como correspondente fase assexuada formas ascosporogênicas que eram tradicionalmente classificadas no gênero Mycosphaerella e equivalentes. Possuem distribuição cosmopolita e são altamente diversos especialmente nos países tropicais e subtropicais. Fungos cercosporóides podem ser encontrados como saprófitas, hiperparasitas sendo muito comuns como patógenos de plantas – causando, sobretudo manchas foliares. Diversas doenças importantes de plantas cultivadas são causadas por fungos cercosporóides. Nos últimos anos, a aplicação de técnicas moleculares ao estudo dos cercosporóides gerou novas informações que estão auxiliando o melhor entendimento das relações filogenéticas dentro desse grupo levando a uma re-estruturação do sistema de classificação deste grupo de fungos com rearranjos, fusão de gêneros e reconhecimento de novos gêneros. O presente estudo pretendeu contribuir para estender essa abordagem para cercosporóides já conhecidos no Brasil e novos taxa coletados em trabalhos de campo. Um total de 27 Pseudocercospora spp., 7 Passalora spp., 4 Zasmidium spp. e 1 Sirosporium foram coletados, isolados em cultura pura, sequenciados e submetidos a análises filogenéticas multigênicas. Quatro regiões genômicas (LSU, ITS, tef1 e actA) foram utilizadas para realização de uma análise Bayesiana com o alinhamento das regiões combinadas ITS, actA e tef1. Os resultados obtidos associando filogenia, morfologia e características da cultura revelaram uma rica diversidade incluindo dezoito novas espécies a serem propostas, a saber: Pseudocercospora aeschynomenicola, Ps. diplusodonii, Ps. emmotunicola, Ps. manihotii, Ps. perae, Ps. planaltinensis, Ps. pothomorphes, Ps. sennae-multijugae, Ps. solani-pseudocapsicicola, Ps. vassobiae, Ps. wulffiae, Ps. xylopiae, Passalora dasyphyllii, Sirosporium tocoyenae, Zasmidium aspidospermae, Z. brosimii, Z. peixotoana e Z. roupalina. Onze epitipos foram designados, para as espécies: Pseudocercospora bixae, P. chamaecristae, P.exilis, P. luzardii, P. plumeriifolii, P. richardsoniicola, P. rigidae, P. struthanthi, Passalora schefflerae, Pa. rubida e Pa. vicosae. Três dentre os taxa encontrados representam novos relatos para o Brasil, respectivamente: Ps. euphorbiacearum, Ps. tecomicola, Ps. trinidadensis e vários hospedeiros foram relatados como representando novas associações com cercosporóides de ocorrência já conhecida anteriormente no Brasil. Adicionalmente, o posicionamento filogenético de Camptomeris leucaenae foi investigado pela primeira vez baseado em sequências da região LSU. Confirmou-se que C. leucaenae pertence à família Mycospaerellaceae (Capnodiales, Dothideomycetes), situando-se próximo de Cymadothea trifolii, patógeno de uma leguminosa nativa da Europa. O presente estudo é uma contribuição para uma abordagem moderna para a compreensão com base em dados moleculares da sistemática de cercosporóides do Brasil. Foram geradas informações morfológicas e moleculares para 40 taxa, representando apenas uma pequena fração da diversidade de espécies de cercosporóides conhecida no país. Muitas espécies de cercosporóides descritas ou relatadas por micologistas no Brasil no passado precisam ser recoletadas para se consolidar um entendimento mais preciso desse importante grupo de fungos. / Fungi cercosporoid are one of the largest groups of microfungi, with over than 2000 associated names, including several genera of Mycosphaerella and Mycosphaerella-like sexual morph. The cercosporoids are cosmopolitan fungi and are highly diverse especially in tropical and subtropical countries. Cercoporoid fungi vary from being saprobic, hyperparasitic and plant pathogenic, in the last case they are known to causes several important diseases in several crops. In the last years, the taxonomy of cercosporoid fungi has undergone significant changes. The application of molecular techniques have generated new informations that are helping the understanding of the phylogenetic relationships leading to a re-structuration of the classification system of this group of fungi with rearrangements, fusion of genera and recognition of new genera as distinct. In this study, a total of 27 Pseudocercospora spp., 7 Passalora spp., 4 Zasmidium spp. and one Sirosporium were collected, cultivated and subjected to a multigene analysis. Four genomic regions (LSU, ITS, tef1 and actA) were used to performed a Bayesian analysis with combined ITS, actA and tef1 sequence alignment. Our results based on DNA phylogeny integrated with morphology, revealed a rich diversity with eighteen new species to be described, namely: Pseudocercospora aeschynomenicola, Ps. diplusodonii, Ps. emmotunicola, Ps. manihotii, Ps. perae, Ps. planaltinensis, Ps. pothomorphes, Ps. sennae-multijugae, Ps. solani-pseudocapsicicola, Ps. vassobiae, Ps. wulffiae, Ps. xylopiae, Passalora dasyphyllii, Sirosporium tocoyenae, Zasmidium aspidospermae, Z. brosimii, Z. peixotoana and Z. roupalina. Eleven epitype specimens were designated, Pseudocercospora bixae, P. chamaecristae, P.exilis, P. luzardii, P. plumeriifolii, P. richardsoniicola, P. rigidae, P. struthanthi, Passalora schefflerae, Pa. rubida and Pa. vicosae, three species newly reported, Ps. euphorbiacearum, Ps. tecomicola, Ps. trinidadensis and several new host records linked to known cercosporoid in Brazil. Additionally, the phylogenetic position of Camptomeris leucaenae was investigated for the first time based in sequences of the large subunit ribosomal (LSU). This study confirmed that C. leucaenae belongs to Mycosphaerellaceae s. str. (Capnodiales, Dothideomycetes) and is closely related to Cymadothea trifolii a pathogen a native leguminous plant from Europe. The present study represents the first organized effort towards generating molecular data to support the taxonomy of cercosporoid from Brazil. It yielded information for 40 taxa, representing only a small fraction of yet unknown species diversity in the country. Many additional species still need to be collected and recollected to enable a better understanding of systematic of cercosporoid fungi in Brazil.

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