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Caracterização molecular e patogênica de isolados de Colletotrichum spp. associados a sintomas de antracnose em mangueiras /

Souza, Andressa de. January 2011 (has links)
Resumo: A mangueira (Mangifera indica L.) conta com diversos problemas de ordem fitossanitária, destacando-se como um dos mais importantes, a antracnose, causada na maioria das vezes pelo fungo C. gloeosporioides. Dada a importância comercial dessa doença, esse trabalho teve por objetivo realizar a caracterização genética e patogênica de uma população de isolados de Colletotrichum spp. oriundos de tecidos com sintomas de antracnose de diferentes variedades e órgãos das plantas de manga, dos principais municípios produtores do Estado de São Paulo, além de compará-los geneticamente com isolados obtidos de citros. O sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2 possibilitou a identificação de 183 isolados de uma população obtida de mangueiras como C. gloeosporioides, com exceção de apenas um deles, o qual foi identificado como C. acutatum. Já os isolados de citros, sendo três obtidos de folhas assintomáticas e dois de flores com sintomas de podridão, foram classificados em C. gloeosporioides e C. acutatum, respectivamente. Os resultados obtidos mediante o emprego de marcadores fAFLP indicaram uma alta variabilidade genética entre isolados de uma mesma população e a ocorrência de fluxo gênico. Além disso, tais resultados corroboraram aqueles obtidos pelo sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, por agruparem os isolados do estudo segundo a sua espécie. Os isolados representativos da população, inclusive aqueles obtidos de citros, de ambas as espécies de Colletotrichum, causaram sintomas típicos de antracnose quando inoculados em folhas de mangueiras „Palmer‟ e „Tommy Atkins‟, indicando que, provavelmente, não há especificidade de hospedeiros para essas espécies / Abstract: The mango crop (Mangifera indica L.) is attacked by several diseases and in this context, the anthracnose is one of the most important. This disease is caused by the fungus C. gloeosporioides in most situations. Due to economic importance of the anthracnose on mango, the aim of this study was to analyze the genetic and pathogenic variability of Colletotrichum spp. isolates obtained from different organs and varieties of mango plants with anthracnose symptoms, and from different municipalities of São Paulo State that are among the major producers of mango. The isolates from mango were also compared with isolates obtained from citrus. Sequencing of ITS1-5.8S-ITS2 region from 183 isolates obtained from mango allowed the identification of them as C. gloeosporioides, however, one of them, was identified as C. acutatum. The isolates from citrus, obtained from syptomless leaves and flowers with rot symptoms, were identified as C. gloeosporioides and C. acutatum, respectively. The results obtained by applying fAFLP markers indicated high level of genetic variability among isolates within population and the occurrence of gene flow. Moreover, these results corroborated those achieved by sequencing of the ITS1-5.8S-ITS2 region, because the isolates were grouped according to its species. Representative isolates of the population, including those obtained from citrus, belonging to both species of Colletotrichum, caused typical symptoms of anthracnose disease on mango leaves of Palmer and Tommy Atkins varieties, indicating the lack of host specificity for these species / Mestre
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Expressão diferencial de genes em laranja doce (Citrus sinensis L. Osb) em tangerina (Citrus reticulata blanco) em resposta à infecção por Xylella fastidiosa /

Rodrigues, Carolina Munari. January 2011 (has links)
Orientador: Marcos Antonio Machado / Coorientador: Alessandra Alves de Souza / Banca: Celso Benedetti / Banca: Anete Pereira de Souza / Banca: Ivan de Godoy Maia / Banca: Henrique Ferreira / Resumo: A citricultura brasileira responde por 85% das exportações de suco concentrado do mundo, mesmo enfrentando graves problemas de ordem fitossanitária. Dentre as doenças que mais afetam sua produtividade encontra-se a clorose variegada do citros (CVC), causada pela Xylella fastidiosa. Cultivares dentro das espécies de Citrus apresentam respostas diferentes em relação à susceptibilidade à CVC. Enquanto cultivares de laranja doce (Citrus sinensis L. Osb) são bastante suscetíveis, as tangerinas (Citrus reticulata Blanco) por sua vez são consideradas tolerantes. Resultados prévios do nosso grupo sugerem que a resistência deve estar efetivamente envolvida com a ativação de vias de sinalização, não sendo somente consequência de menor bloqueio dos vasos do xilema. Portanto, a hipótese desse trabalho é que a resistência da tangerina Poncan e a suscetibilidade de laranja doce à CVC pode ser comparada através da avaliação da expressão diferencial de genes durante o processo de infecção. Desse modo, o objetivo do trabalho foi avaliar a expressão de genes dessas duas espécies submetidas à infecção pela bactéria. Para tanto plantas de laranja Pera e tangerina Poncan foram desafiadas com X. fastidiosa e as coletas das folhas infectadas e seus respectivos controles feitas em diferentes tempos (1, 7, 14 e 21 dias). Esse material foi utilizado para extração de DNA total que foi usado na confirmação, por RT-qPCR, da presença da bactéria. Após essa verificação, o RNA foi extraído em pools para a construção das bibliotecas subtrativas supressivas (SSHs). Foram feitas seis bibliotecas, porém, não foram obtidas sequencias de qualidade. Em função do baixo rendimento das SSHs, optou-se por proceder as análises com RNA-seq utilizando tecidos xilemáticos de tangerina Poncan, com um dia após... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Brazilian citrus industry accounts for 85% of exports of concentrated juice in the world despite facing serious plant health problems. Among the main diseases that affect its productivity is the citrus variegated chlorosis (CVC), caused by Xylella fastidiosa. Citrus species present different responses in relation to susceptibility to CVC. While sweet orange (Citrus sinensis L. Osb) is very susceptible, mandarin (Citrus reticulata Blanco) is considered tolerant. Previous results from our group suggest that this tolerance observed in mandarin effectively involves activation of signaling pathways and is not only consequence of limited blockage of the xylem vessels. Therefore, the hypothesis of this study is that the tolerance of Ponkan mandarin and susceptibility of sweet orange to CVC can be compared evaluating the differential expression of genes during the infection process, being that the objective of this study. For that, Ponkan mandarin and sweet orange plants were challenged with X. fastidiosa. Infected/non-infected leaves were collected at different times (1, 7, 14, and 21 days). This material was used for extraction of total DNA, which was used for confirming the presence of bacteria by RT-qPCR. After this verification, the RNA was extracted in pools for the construction of suppressive subtractive libraries (SSHs). Six libraries were prepared, but good quality sequences were not obtained. Due to the low efficiency of SSHs, it was decided to proceed with RNA-seq analysis using xylem tissues of mandarin Ponkan, one day after infection with X. fastidiosa. In this analysis it was obtained 35,344,265 transcripts for the non-infected library and 37,326,339 for the infected one. These transcripts were mapped in the whole reference genome of Citrus clementine by using TopHat software. The contigs generated... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Rhizoctonia solani AG-1 : estrutura genética, etiologia e evolutibilidade nos agroecossitemas Brachiaria spp. e arroz na Colômbia /

Molina, Lina Maria Ramos. January 2012 (has links)
Orientador: Paulo Cezar Ceresini / Banca: Helvécio Della Coletta Filho / Banca: Celso Dornelas Fernandes / Banca: Antonio de Goes / Banca: Dilermando Perecin / Resumo: No início dos anos 90, o fungo Rhizoctonia solani emergiu como um patógeno importante associado à morte de pastagens do gênero braquiária na Colômbia. Inicialmente, esse estudo indicou que R. solani AG-1 IA predomina como patógeno associado à queima da folha da braquiária nos Llanos Colombianos. Para o estudo da estrutura genético-populacional do patógeno, um total de 198 isolados de R. solani AG-1 IA foram coletados de campos de B. brizantha cv. Toledo, de Brachiaria híbrido Mulato e do arroz. Os isolados foram genotipados usando dez loci microssatélites. Um sistema reprodutivo misto (reprodução sexuada e clones adaptados) caracterizou as populações de R. solani AG-1 IA que infectam a braquiária. A alta fração clonal e os desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg encontrados foram consistentes com o efeito Wahlund associado à mistura de populações. Padrões históricos de migração entre populações hospedeiro-distintas indicaram a origem provável das populações que infectam braquiária a partir de populações que infectavam arroz. Para determinar o efeito do estresse térmico na evolutibilidade para crescimento micelial, populações de R. solani AG-1 IA infectando braquiária ou arroz e R. oryzae-sativae do arroz, foram submetidas à temperatura ótima e de estresse (25 e 35°C). A herdabilidade para crescimento micelial sob condições de estresse foi considerada alta na população de R. oryzae-sativae do arroz, indicando que os patógenos têm potencial de adaptação à temperatura de 35°C / Abstract: In the early '90s, the fungus Rhizoctonia solani has emerged as an important pathogen associated with the death of Brachiaria pastures in the Colombian Llanos. Initially, this study indicated that R. solani AG-1 IA was the predominant pathogen associated with the leaf blight in the Colombian Llanos. To study the population genetic structure of the pathogen, a total of 198 isolates of R. solani AG-1 IA were collected from fields of B. brizantha cv. Toledo, Brachiaria Mulato hybrid and from rice. These isolates were genotyped using ten microsatellite loci. A mixed mating system (sexual reproduction and dispersal of adapted clones) characterized the populations of R. solani AG-1 IA infecting Brachiaria. The high clonal fraction and deviations from Hardy-Weinberg equilibrium found in three out of four populations were consistent with Wahlund effect associated with the mixing of populations. Historical patterns of migration between different host-populations indicated that the likely source of the current populations infecting Brachiaria in the Colombian Llanos was from populations that originally infected rice. To determine the effect of heat stress on the evolvability for mycelial growth, two host distinct populations of Rhizoctonia solani AG-1 IA infecting either brachiaria or rice and a rice-infecting population of R. oryzae-sativae, were submitted to optimal and stress temperatures (25°C and 35°C). The heritability values for mycelial growth under heat stress was considered high for rice-infecting population of R. oryzae-sativae, indicating that these pathogen's population have a high potential to adapt to 35°C temperature / Doutor
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Estimativas do coeficiente de herdabilidade entre e dentro de famílias F5 de soja /

Finholdt, Rafael Santos. January 2012 (has links)
Orientador: Antônio Orlando Di Mauro / Coorientador: Marcelo Marchi Costa / Banca: Eduardo Antônio Gavioli / Banca: Rinaldo César de Paula / Resumo: O aumento de produtividade é fator preponderante para o melhoramento de soja e lançamento de novas cultivares. A herdabilidade é o parâmetro que indica a porção genética que será transmitida aos descendentes, sendo de suma importância para os melhoristas conhecerem a herança de cada caráter. O objetivo do trabalho foi estimar as variâncias e os coeficientes de herdabilidades nos sentidos amplo e restrito em populações F5 de soja. O experimento foi conduzido em 2010/11 no delineamento experimental de blocos aumentados de Federer, com quatro cruzamentos biparentais e testemunhas intercalares, em Jaboticabal-SP. Os dados foram analisados utilizando-se o Software Genes. Pelos resultados nota-se estimativas de herdabilidades maiores entre famílias quando comparadas a dentro de famílias, o que indica que a seleção é mais favorável entre famílias quando se avançam as gerações. As estimativas dos coeficientes de herdabilidades nos sentidos amplo e restrito foram próximas, na maioria das situações, mostrando que a maior parte da variância genética é de natureza aditiva, onde métodos de seleção simples podem levar a ganhos satisfatórios. Obteve-se elevados coeficientes de variação genéticos (CVg), onde a razão do coeficiente de variação genético pelo coeficiente de variação experimental (CVg/CVe) pode favorecer o direcionamento da seleção / Abstract: Yield increase is one of the main factors for soybean breeding for the new cultivars release. Heritability is the parameter that indicates the genetic proportion transmitted to offspring, being very important for breeders to know the traits inheritance. The aim of this work was to estimate variances and heritability coefficients both on broad and narrow sense in F5 soybean populations. The experiment was conducted in 2010/11 season, using Federer augmented blocks design with 4 biparental crosses and intercalated checks, in Jaboticabal-SP. Data were analised using Genes Software. By the results, it can be noticed that heritability among families showed higher estimates when compared to within families estimates; this indicates that selection among families is more favorable for advancing generation. The estimation of heritability coefficients in broad sense and narrow sense were close in most of the situations, showing that the largest part of genetic variance is of additive nature, in which simple selection methods can lead to satisfactory genetic gains. High genetic variance coefficients were obtained, where the relation between genetic variance coefficient and experimental variance coefficient can be favorable to guide the selection / Mestre
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Isolamento, caracterização molecular e expressão de um novo gene vip3Aa50 de Bacillus thuringiensis virulento para Anticarsia gemmatalis e Spodoptera frugiperda /

Figueiredo, Camila Soares. January 2013 (has links)
Orientador: Janete Apparecida Desidério / Banca: Ricardo Antonio Polanczyk / Banca: Janaína Fernandes Gonçalves / Resumo: A bactéria Bacillus thuringiensis é vista como uma das melhores opções no controle biológico devido à ação entomopatogênica e a especificidade de suas proteínas. As proteínas Vip3, que são secretadas durante o crescimento vegetativo do B. thuringiensis, atuam no controle de importantes lepidópteros praga. O objetivo deste trabalho foi caracterizar um gene vip3A de um isolado de B. thuringiensis, expressar a proteína e verificar sua toxicidade contra larvas de Anticarsia gemmatalis e. Spodoptera frugiperda Para tanto, o gene foi amplificado com iniciadores específicos por PCR, gerando um fragmento de 2370 pb. O fragmento foi clonado em vetor pGEM - T Easy para sequenciamento, subclonado em vetor de expressão pET-28a (+) e o conjunto inserido em células de Escherichia coli BL21 (DE3). A expressão da proteína foi induzida por IPTG, a proteína Vip3Aa50 foi visualizada em SDS-PAGE e detectada por "Western blotting". Os ensaios de toxicidade revelaram alta virulência às larvas neonatas de A. gemmatalis e S. frugiperda, sendo as larvas da população de A. gemmatalis mais sensíveis. O isolado utilizado neste estudo é altamente promissor como fonte de gene vip3A para controle de ambas as pragas por meio da produção de plantas transgênicas como milho e soja. / Abstract: The bacterium Bacillus thuringiensis is seen as one the best options for the biological control due to entomopathogenic action and protein specificity. The Vip3 proteins, which are secreted during the vegetative growth of B. thuringiensis, act to the control the most important lepidopteran pests. The aim of this study was to characterize a vip3A gene from an isolate of B. thuringiensis, to induce the protein and evalute its toxicity against Anticarsia gemmatalis and Spodoptera frugiperda larvae. Therefore, the gene was amplified by specific PCR's primers, generating a 2370 pb fragment. The fragment was cloned into the pGEM-T Easy vector and subsequently, it was sequenced and subcloned into the pET-28a (+)'s expression vector and inserted in to the Escherichia coli BL21 (DE3) cells. The Vip3Aa50 protein expression was induced by IPTG, observed using SDS-PAGE and detected by Western blotting. The toxicity bioassay showed intense virulence for A. gemmatalis and S. frugiperda's neonate larvae. The results showed that A. gemmatalis larval population was more sensitive. The isolate used in this study is highly promising as vip3A source gene to control both plagues through transgenic plant production, such as, corn and soybean. / Mestre
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Estudos funcionais do gene EgTIP2 que codifica uma aquaporina de eucalipto /

Rodrigues, Marcela Iara. January 2013 (has links)
Orientador: Ivan de Godoy Maia / Banca: Douglas Silva Domingues / Banca: Marilia Gaspar / Resumo: A biotecnologia define-se pelo uso de conhecimentos sobre os processos biológicos e sobre as propriedades dos seres vivos, com o fim de resolver problemas e criar produtos de utilidade. É importante frisar que uma das principais vantagens da biotecnologia moderna voltada para a área vegetal é a de poder gerar estratégias de melhoramento aplicáveis a diferentes culturas. Uma das principais estratégias de ação nessa área trata da produção de plantas geneticamente modificadas com transgenes de interesse. Nesse contexto, a caracterização de promotores com padrão de expressão tecido-específico é essencial para que a expressão de tais transgenes em plantas de interesse agronômico e florestal, como em eucalipto, fique limitada a determinados órgãos/tecidos. . Assim, o presente trabalho teve por objetivo realizar a caracterização funcional do promotor do gene EgTIP2 que codifica uma putativa aquaporina intrínseca de tonoplasto (TIP) com expressão específica em raízes de eucalipto. Em paralelo, o perfil de expressão desse gene em resposta ao estresse osmótico foi investigado em eucalipto. Análises de expressão mostraram que tanto o promotor quanto o gene EgTIP2 são regulados positivamente pelo estresse osmótico curto e persistente, enquanto que o promotor parece ser regulado negativamente na presença de ABA-exógeno. Testes histoquímicos revelaram uma expressão vascular-específica dirigida pelo promotor EgTIP2 em plantas de tabaco transgênicas, sugerindo uma possível utilização como ferramenta para aplicação em engenharia genética de espécies lenhosas / Abstract: Not available / Mestre
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Papel funcional de microRNAs na arquitetura vegetativa e radicular de plantas /

Morea, Edna Gicela Ortiz. January 2013 (has links)
Orientador: Fábio Tebaldi Silveira Nogueira / Banca: Luiz Fernando Rolim de Almeida / Banca: Michel Georges Abert Vizentz / Resumo: Os MicroRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs endógenos não codantes de 20-22 nucleotídeos (nt) que regulam a expressão gênica de genes-alvos. Eles estão envolvidos em diversos aspectos de desenvolvimento da planta, tanto na parte aérea, quanto no sistema radicular. Os miRNAs e seus genesalvos tem uma complementariedade quase perfeita em plantas, sendo que esta complementaridade está relacionada à origem dos genes de miRNAs (genes MIRs). A hipótese mais aceita para a origem dos genes de miRNAs é a "hipótese de duplicação invertida", a qual propõe que os genes de miRNAs surgiram a partir de duplicações invertidas do seus genes-alvos nos genomas vegetais. Muitos genes-alvos de miRNA em plantas codificam para fatores de transcrição, tais como os genes SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPLs). Alguns membros da família SPL são regulados por ambos os miRNAs, miR156 e miR529. O sítio de reconhecimento destes microRNAs em transcritos de genes SPLs é conservado e difere somente por sete nucleotídeos. Enquanto o miR156 é altamente conservado entre Angiospermas, incluindo arabidopsis, o miR529 aparentemente está presente somente em eudicotiledôneas basais, monocotiledôneas e no musgo Physcomitrella patens. Neste trabalho, foram realizadas duas abordagens para o estudo da via miRNAs/SPL. Na primeira abordagem, foi analisada a evolução e a possível função da via miR529/SPL em monocotiledôneas e eudicotiledôneas. Foi testado o sítio de reconhecimento do miR529b em dois genes SPLs (SPL9 e SPL15) de arabidopsis encontrados bioinformaticamente via geração de plantas transgênicas de arabidopsis superexpressando o precursor de arroz OsMIR529b. As linhagens transgênicas de arabidopsis (OsMIR529b-OE) apresentaram fenótipos vegetativos e reprodutivos similares aos de plantas duplo mutantes de perda de função para os genes SPL9 e SPL15 de arabidopsis (denominado spl9/spl15). Estes ... / Abstract: MicroRNAs (miRNAs) are endogenous small non-coding RNAs of 20-22 nucleotides (nt) in length that regulate the gene expression transcriptionally and posttranscriptionally. They are involved in many aspects of plant development, both in the shoot and in the root systems. MiRNAs and their target genes have an almost perfect complementarily in plants, and this is related to the complementarity of genes origin of miRNAs genes (MIR genes). The most accepted hypothesis for the origin of miRNA genes is the "inverted duplication hypothesis," which proposes that genes of miRNAs arose from inverted duplications of their target genes in plant genomes. Many miRNA target genes in plants encode transcription factors such as SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPLs). Some SPL family members SPL are regulated by both miRNAs, miR156 and miR529. The recognition site for these microRNAs in SPL transcripts is conserved and only differs by seven nucleotides. While miR156 is highly conserved among Angiosperms, including Arabidopsis thaliana, miR529 is apparently present only in basal eudicots, monocots and in the moss Physcomitrella patens. In this work, were performed two approaches to study miRNA-direct SPL gene regulation. In the first approach, we analyzed the evolution and possible function of the miR529/SPL pathway in monocots and eudicotyledonous. We searched for miR529b recognition sites in SPL genes from core eudicots, such as Arabidopsis thaliana. Interestingly, we found two miR529b-targeted SPLs (SPL9 and SPL15) in Arabidopsis and showed that the recognition sites are functional via the generation of transgenic Arabidopsis plants overexpressing OsMIR529b. OsMIR529b-OE overpressors are phenotipically and molecularly similar to the double mutant spl9/spl15. Our data suggest that miR529b is processed and functional in core eudicots and that this microRNA was recently lost in the evolutionary history of the ... / Mestre
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Interação de genótipos de milho vs locais, anos e épocas de semeadura /

Buzinaro, Rodolfo. January 2014 (has links)
Orientador: Gustavo Vitti Môro / Coorientador: Fabíola Vitti Môro / Banca: Rinaldo César de Paula / Banca: Bruno Éttori Pavan / Resumo: O objetivo desta pesquisa foi avaliar a interação G x A e seu desdobramento em parte simples e complexa, a fim de estudar quais os melhores locais e épocas de semeadura para avaliação de genótipos de milho, quanto à produção de grãos nas cidades de Jaboticabal-SP e Campo Alegre de Goiás-GO. Foram conduzidos quatro experimentos no delineamento de blocos casualizados com três repetições e 17 genótipos sendo 13 sintéticos experimentais, três variedades e um hibrido comercial. Foram avaliadas duas épocas de cultivo para cada local. A estratificação ambiental foi mensurada pelo método tradicional de Lin (1982) e a dissimilaridade ambiental foi estimada pelo método de Cruz e Castoldi (1991), além da correlação de Pearson entre os pares de ambientes. Os resultados demonstraram que houve discordância entre os métodos utilizados. Nos programas de melhoramento, devem-se priorizar avaliações em anos e locais distintos, em detrimento de épocas de semeadura diferentes, a fim de discriminar os melhores genótipos e fazer as recomendações precisas dos mesmos / Abstract: This work aims to evaluate the G x E interaction and its unfolding in simple and complex part, in order to study the best locations and sowing dates for evaluation of genotypes grain yield of maize, at Jaboticabal-SP and Campo Alegre de Goiás-GO. Four experiments were carried out in randomized blocks design with three replications and 17 genotypes where 13 are experimental synthetic, three varieties and a commercial hybrid. Two seasons of cultivation were evaluated for each location. Environmental stratification was measured by the traditional method of Lin (1982) and the dissimilarity has been estimated by the method of Cruz & Castoldi (1991), in addition to the Pearson correlation coefficient between environments pairs. The results showed that there was disagreement between the methods used. Breeding programs must prioritize evaluations in years and locations to the detriment of different sowing dates in order to discriminate the best genotypes and make precise recommendations / Mestre
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Índice de seleção para caracteres agronômicos em populações segregantes de soja /

Bizari, Eduardo Henrique. January 2014 (has links)
Orientador: Sandra Helena Unêda Trevisoli / Coorientador: Antonio Orlando Di Mauro / Banca: Gustavo Vitti Moro / Banca: Everton Luis Finoto / Resumo: No melhoramento genético da cultura da soja, o processo de seleção é complexo e altamente influenciado pelo ambiente. Uma das alternativas para facilitar esse processo é a utilização de índices de seleção, possibilitando a seleção de genótipos desejáveis em gerações iniciais de programas de melhoramento. O objetivo do presente trabalho consistiu em comparar diferentes índices de seleção em populações segregantes de soja, indicando os métodos superiores em várias situações e pesos econômicos propostos, visando maiores ganhos. Foi utilizada a seleção direta e indireta, índice clássico de Smith e Hazel, índice baseado em soma de "ranks" de Mulamba e Mock, índice base de Willians, índice baseado nos ganhos desejados de Pesek e Baker e índice da distância genótipo-ideótipo. O material genético consistiu de sete populações de soja em geração F5, totalizando 386 progênies no delineamento de blocos aumentados de Federer, sendo avaliados os caracteres número de dias para maturidade, altura de planta na maturidade, altura de inserção da primeira vagem, acamamento, valor agronômico, número de vagens por planta, teor de óleo e produtividade de grãos. O índice clássico e índice base foram os que apresentaram menores variações quanto aos ganhos obtidos nas diferentes situações e pesos econômicos estudados. O índice baseado na soma de "ranks" utilizando os caracteres valor agronômico e produtividade de grãos como caracteres principais, além do peso econômico 1 (um) proporcionou os ganhos mais favoráveis no presente estudo / Abstract: In soybean breeding, the selection process is complex and highly influenced by the environment. An alternative to facilitate this process is the use of selection indexes, thus making possible the selection of desirable genotypes in early generations of breeding programs. The main this work was to compare different selection indexes in segregating soybean populations, indicating the superior methods in some situations and proposed economic weights, aiming higher gains. Were used the indexes direct and indirect selection, classical index of Smith and Hazel, index based sum of "ranks" of Mulamba and Mock, index base of Williams, index based desired gains of Pesek and Baker and index of genotype-idiotype distance. The genetic material consisted of seven soybean populations in the F5 generation, totaling 386 progenies in randomized block Federer, for traits number of days to maturity, plant height at maturity, height of the first pod, lodging, agronomic value, number of pods per plant, oil content and yield grain. The classic and base indexes presented lower variations in relation to the gains obtained in different situations and studied economic weights. The index based on the sum of "ranks" with the characters agronomic value and grain yield as a major economic burden beyond one (1) provided the most favorable gains in the present study / Mestre
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Efeitos da interação e toxicidade das proteínas Cry1 e Vip3A de Bacillus thuringiensis em Diatraea saccharalis (Fabr., 1794) (Lepidoptera: Crambidae) /

Davolos, Camila Chiaradia. January 2014 (has links)
Orientador: Manoel Victor Franco Lemos / Coorientador: Baltasar Escriche / Banca: Jackson Antonio Marcondes de Souza / Banca: Odair Aparecido Fernandes / Banca: Bergmann Morais Ribeiro / Banca: Norton Rodrigues Chagas Filho / Resumo: O presente trabalho objetivou avaliar a toxicidade de diferentes proteínas Cry1 e Vip3Aa de Bacillus thuringiensis em larvas de Diatraea saccharalis, verificar o modo de união dessas proteínas aos receptores do inseto alvo e analisar a interação dessas proteínas no controle larval, buscando informações para subsidiar o uso de plantas geneticamente modificadas com genes cry1 e vip3Aa de forma segura e duradoura. A análise de suscetibilidade larval revelou a proteína Cry1Ab como mais efetiva no controle, seguida das proteínas Cry1Ac, Vip3Aa, Cry1Ca e Cry1Fa. A população testada não foi suscetível à proteína Cry1Ea. A proteína Cry1Aa apresentou baixa toxicidade. Nos ensaios de união específica, as proteínas Cry1 ligaram-se a receptores presentes no intestino médio de D. saccharalis e um modelo com três diferentes receptores foi proposto com base nos ensaios de competição heteróloga. Um receptor comum para Cry1Aa, Cry1Ab e Cry1Ac, outro para Cry1Fa e Cry1Ab e um receptor diferente para a proteína Vip3Aa. Dentre as interações avaliadas por bioensaios, as combinações proteicas: Cry1Ab:Cry1Ca e Cry1Fa:Cry1Ca apresentaram efeito sinérgico; as demais combinações revelaram efeitos antagônicos / Abstract: The aim of this research was to evaluate the toxicity of different Cry1 and Vip3A proteins from Bacillus thuringiensis to Diatraea saccharalis, verify the proteins binding to receptors of the target insect and to analyze the protein interactions in larval control, seeking information to support safe and sustainable the use of transgenic Bt plants. The most toxic protein assayed was Cry1Ab followed by Cry1Ac, Vip3Aa, Cry1Ca and Cry1Fa. The population tested was not susceptible to Cry1Ea protein. Cry1Aa showed very low toxicity. Biotinylated Cry1 proteins showed specific binding to the midgut brush border membrane vesicles of the larvae. Heterologous competitive binding assays suggested a model of three receptors, a common receptor for Cry1Aa and Cry1Ab another one for Cry1Fa and Cry1Ab. Vip3Aa did not compete for binding with any of the Cry proteins tested. Among interactions bioassays, the combinations between Cry1Ab:Cry1Ca and Cry1Fa:Cry1Ca showed synergistic effect, whereas the other combinations showed antagonistic effects / Doutor

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