The release of the Illumina BovineSNP50 BeadChip in late 2007 has drawn attention from cattle breeders around the world to develop breeding programs that leverage association of these single nucleotide polymorphism (SNP) with economically important quantitative trait loci (QTL). In that context this project has come to study applications of the SNP panel in beef cattle. Analysis of linkage disequilibrium (LD) existing in Angus, Charolais, and crossbred animals revealed the pattern of LD within each breed group, as well as the persistence of LD phase between pairs of the breed groups. This is important for genomic selection where SNP are trained in one population and used to predict breeding value for animals in another population. Detection of chromosome regions potentially carrying QTL or causative mutations affecting the phenotypic variation in economically important traits was presented at individual SNP and haplotype levels. There were 269 SNP associated (P<0.001) with birth weight (BWT), weaning weight (WWT), average daily gain (ADG), dry matter intake (DMI), mid-test metabolic weight (MMWT), residual feed intake (RFI). They explained 1.64% - 8.06% of the phenotypic variation in these traits. There were 520 SNP associated (P<0.001) with carcass quality traits, namely hot carcass weight, back fat thickness, ribeye area, marbling scores, lean yield grade by Beef Improvement Federation, steak tenderness, and six rib dissection traits. These SNP explained 1.90 - 5.89% of the phenotypic variance of the traits. Many of the significant SNP were located on chromosome 6. Six haplotypes were found associated (P<0.05) with ADG, DMI, and RFI. In order for genomic selection to happen in beef cattle, higher density SNP panels should be made available at low genotyping cost. However, the cost of genotyping animals for high density SNP chip is still high, thus genotype imputation has come to practice. The last chapter of this thesis compared two approaches presently used in genotype imputation, investigated factors affecting imputation accuracy, as well as the impact of imputation accuracy on genomic estimated breeding value (GEBV). It proved that the highest possible accuracy of GEBV is attainable with sufficiently large groups of reference animals. / Ontario Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs. Ontario Cattlemen’s Association. Ontario Farm Innovation Program. Agriculture and Agri-Food Canada’s Growing Forward Program. Agriculture Adaptation Council. Ontario Research and Development Program. MITACS Accelerate. Beef Improvement Opportunities.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1797227 bytes, checksum: e12639c68c3972023379c9f437bc1e5c (MD5) Previous issue date: 2012-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The base of agribusiness of sugar cane is the breeding. Can be shown that the great strategy selection of plant would be through the prediction of genotypic values using BLUP (Best Linear Unbiased Predictor) individual (BLUPI). This procedure would use both the information of family and individuals for selection. However this method is rarely used in breeding programs because of operational problems related to obtain data plant. Recently an alternative operationally more practical was proposal and is called BLUPIS (BLUP individual simulated). In this case the data are collected at the level of plot. With this is possible to select the best families, and subsequently, to simulate the number of individuals to be selected within the best families. This work has as aims to develop an algorithm for analysis BLUP under the Bayesian focus with different settings of priors in your modeling, in statistical software R, for possible available to the user and compare it with the Classic REML / BLUP. The results showed that the method with Bayesian BLUPIS performed by the algorithm built with the R program was effective. The algorithm took into account the uncertainties on all parameters, as also allowed the use of a priori information. The Bayesian method is more efficient when considering the relationship information model and the distribution of the prior information (major genotypic effects and variances and heritability smaller). / A base do agronegócio de cana-de-açúcar é o melhoramento genético. Pode ser mostrado que a estratégia ótima de seleção da planta seria através da predição de valores genotípicos usando o BLUP (Best Linear Unbiased Predictor) individual (BLUPI). Este procedimento usaria, simultaneamente, a informação de família e de indivíduos para a seleção. No entanto esse método dificilmente é usado nos programas de melhoramento devido a problemas operacionais relacionados à obtenção dos dados ao nível de planta. Recentemente uma alternativa operacionalmente mais prática foi proposta, e é denominada BLUPIS (BLUP individual simulado). Nesse caso os dados são coletados ao nível de parcela. Com isso é possível selecionar as melhores famílias e, posteriormente, simular o número de indivíduos a serem selecionados dentro das melhores famílias. Este trabalho teve como objetivo desenvolver um algoritmo para análise do BLUPIS sob o enfoque bayesiano, com diferentes definições de distribuições a prioris na sua modelagem, no software estatístico R, para possível disponibilização ao usuário e compará-la com o método clássico REML/BLUP. Os resultados mostraram que o método BLUPIS com enfoque bayesiano realizado através do algoritmo construído junto ao programa R foi eficiente. O algoritmo levou em consideração a incerteza existente sobre todos os parâmetros do modelo, como também possibilitou o uso de priori informativa. O método bayesiano se mostrou mais eficiente, isto é, com efeitos genotípicos maiores e variâncias e herdabilidade menores, quando se consideraram no modelo a informação de parentesco e a distribuição da priori informativa.

FROTA JUNIOR, José Itamar. Divergência genética entre progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce. 2012. 106 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Rede Nordeste de Tecnologia, Fortaleza-CE, 2012. / Submitted by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-05-24T13:27:22Z No. of bitstreams: 1 2012_tese_jifrotajunior.pdf: 7557129 bytes, checksum: 6c9f0d978e3d8d53df85c9c6cfa07a24 (MD5) / Approved for entry into archive by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-05-24T13:29:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_tese_jifrotajunior.pdf: 7557129 bytes, checksum: 6c9f0d978e3d8d53df85c9c6cfa07a24 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-24T13:29:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_tese_jifrotajunior.pdf: 7557129 bytes, checksum: 6c9f0d978e3d8d53df85c9c6cfa07a24 (MD5) Previous issue date: 2012 / The present work was developed in order to characterize and evaluate the genetic diversity of dwarf cashew progenies from Embrapa Agroindústria Tropical using molecular and morphological markers as well as the indication of divergent materials to the breeding program. It was used 50 dwarf cashew progenies from Embrapa Agroindústria Tropical collection located in the Experimental Center of Pacajus, Ceará. In the molecular analysis, each progeny was sampled by collecting leaves from two plants per plot and then analyzed at Embrapa´s molecular biology lab. It was performed DNA´s extractions based on CTAB (Cetyltrimethylammonium bromide) method, adapted by Cavalcanti (2004). ISSR´s markers (Inter Simple Sequence Repeat) were used. Jaccard´s coefficient and UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) cluster analysis were applied in the group analysis. Cluster analysis allowed the division into fourteen groups of genetic similarity being the most divergent progenies CNPAT 92-56, 92-62 and 92-385, and the most similar ones CNPAT 92-331 and 92-335. Variables such as plant height, diameter, number of nuts and production, were used in the quantitative analysis. Euclidian distance was used in the genetic distance analysis. UPGMA method were used in cluster analysis. The variable with highest relative contribution to genetic divergence was production, with 97,80%. The UPGMA cluster analysis allowed the division into eleven groups. The most divergent material was CNPAT 92-331 coming from Capisa farm in Piauí state. The most similar materials formed the subgroup I of group I, CNPAT 92-54 and 92-58 with 95% similarity. There is genetic variability, however no direct relationship between molecular and quantitative analysis was found / O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de caracterizar e avaliar a diversidade genética de progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce da Embrapa Agroindústria Tropical por meio de marcadores moleculares e morfológicos, assim como, a indicação dos materiais divergentes para o programa de melhoramento genético. Foram utilizadas 50 progênies instaladas no Campo Experimental de Pacajus, CE. Na análise molecular, cada progênie foi amostrada coletando-se folhas de duas plantas/parcela e analisadas no laboratório de Biologia Molecular da Embrapa Agroindústria Tropical. Foram realizadas extrações de DNA baseadas no método CTAB (brometo de cetiltrimetilamônio) ajustado por Cavalcanti (2004) e utilizados marcadores do tipo ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Utilizou-se o coeficiente de Jaccard e análise de agrupamento UPGMA (Método de Média Aritmética Não Ponderada) para análise dos grupos. Doze iniciadores ISSR geraram 71 bandas das quais 27 foram polimórficas. A análise de agrupamento permitiu a divisão em quatorze grupos de similaridade genética, onde as progênies mais divergentes foram CNPAT 92-56, CNPAT 92- 62 e CNPAT 92-385 e as mais similares foram CNPAT 92-331 e CNPAT 92-335. Na análise quantitativa foram utilizadas as seguintes variáveis: altura da planta, diâmetro da copa, número de castanhas e produção. Foi utilizada a Distância Euclidiana para análise da distância genética e UPGMA para a análise de agrupamento. A produção foi a variável que obteve maior contribuição relativa para a divergência genética com 97,80%. A análise de agrupamento UPGMA possibilitou a distribuição de 11 grupos. O material mais divergente foi o CNPAT 92-331 oriundo da Fazenda Capisa (Piauí). Os mais similares formaram o subgrupo I do grupo I, CNPAT 92-54 e CNPAT 92-58 com 95% de similaridade. Há variabilidade genética, no entanto não foram encontradas relações diretas entre a análise molecular e a quantitativa

A riqueza e a diversidade de espécies forrageiras dos Campos Sulinos, pode propiciar a inserção de espécies nativas em programas de melhoramento. As gramíneas nativas do gênero Paspalum possuem grande variabilidade, que pode contribuir para seleção de genótipos adaptáveis às várias condições ecológicas de regiões tropicais e subtropicais. Dentre as espécies deste gênero destaca-se o Paspalum notatum com ecótipos que possuem superioridade produtiva quando comparados à cultivares comerciais, o que contribui para que esta espécie seja candidata ao lançamento de novas cultivares. Avaliações de plantas melhoradas submetidas a diferentes práticas de manejo, como fertilização ou consorciação, são fundamentais para gerar conhecimento acerca das características produtivas. O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial produtivo de uma progênie híbrida intraespecífica de P. notatum submetida a diferentes níveis de fertilização nitrogenada ou consorciação com leguminosas para serem empregados em sistemas de produção a pasto ou na recuperação de pastagens naturais degradadas. A produção de matéria seca e a densidade populacional de perfilhos dos genótipos de P. notatum respondem de forma positiva aos níveis de fertilização nitrogenada. O nível de fertilização 120 kg N ha-1ano-1 promove a maior eficiência de uso de nitrogênio nos genótipos de P. notatum. Os genótipos B26, C22, C9 e Bagual são indicados para serem utilizados em sistemas de consórcio com leguminosas de clima temperado. A produção de matéria seca de sistemas com genótipos de P. notatum consorciados com trevo branco mais cornichão é semelhante à produção de sistemas fertilizados com até 240 kg N ha-1ano-1, evidenciando a viabilidade do consórcio entre essas espécies. / The richness and diversity of forage species in the Campos Sulinos region may facilitate the inclusion of native species in breeding programs. Native grasses of the Paspalum genus show great variability which may contribute to the selection of adaptable genotypes to the various ecological conditions of tropical and subtropical regions. Within the genus, Paspalum notatum is a species with superiorly productive ecotypes compared to commercial cultivars, rendering this species a candidate for the release of new cultivars. The evaluation of bred plants submitted to different management practices, such as fertilization or consortium with legumes is fundamental to acquire knowledge about the productive features. The objective of the present work was to evaluate the productive potential of an intraspecific hybrid progeny of Paspalum notatum submitted to different nitrogen fertilization levels or intercropped with legumes, with the objective of being used in grazing systems or in the recovery of degraded natural pastures. The dry matter yield and tiller population density of Paspalum notatum genotypes respond positively to nitrogen fertilization levels. The 120 kg N ha-1year-1 fertilization level promotes the highest nitrogen utilization efficiency in Paspalum notatum. Genotypes B26, C22, C9 and Bagual are indicated for legume intercropped systems with temperate legumes. The dry matter production of intercropped systems between Paspalum notatum genotypes with white clover plus birdsfoot trefoil is similar to the production of systems fertilized with up to 240 kg N ha-1year-1, demonstrating the viability of the intercropped between these species.

Submitted by JANAINA RODRIGUES DA SILVA null (janainars_t@yahoo.com) on 2016-11-22T18:37:46Z No. of bitstreams: 1 Araucaria angustifolia_Janaína Rodrigues da Silva.pdf: 2218927 bytes, checksum: 12fa99634d8fc6869bca8b6bedc8a600 (MD5) / Rejected by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: No campo “Versão a ser disponibilizada online imediatamente” foi informado que seria disponibilizado o texto parcial porém no campo “Data para a disponibilização do texto completo” foi informado que o prazo para disponibilização de texto completo “Não se aplica” por se tratar de texto completo a ser disponibilizado imediatamente. Caso opte pela disponibilização do texto completo selecione no campo “Versão a ser disponibilizada online imediatamente” a opção “Texto completo”. Caso queira disponibilizar imediatamente apenas o texto parcial indique no campo “data para disponibilização do texto completo” o tempo em que apenas a versão parcial estará disponível. Esta opção é utilizada caso você tenha planos de publicar seu trabalho em periódicos científicos ou em formato de livro, desse modo somente as páginas pré-textuais, introdução, considerações e referências sejam disponibilizadas. Por favor, corrija esta informação realizando uma nova submissão. on 2016-11-25T16:55:14Z (GMT) / Submitted by JANAINA RODRIGUES DA SILVA null (janainars_t@yahoo.com) on 2016-11-30T18:44:16Z No. of bitstreams: 1 Araucaria angustifolia_Janaína Rodrigues da Silva.pdf: 2218927 bytes, checksum: 12fa99634d8fc6869bca8b6bedc8a600 (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-12-02T12:21:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_jr_me_ilha.pdf: 2218927 bytes, checksum: 12fa99634d8fc6869bca8b6bedc8a600 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-02T12:21:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_jr_me_ilha.pdf: 2218927 bytes, checksum: 12fa99634d8fc6869bca8b6bedc8a600 (MD5) Previous issue date: 16-08-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Em função da importância ecológica, econômica e do alto grau de degradação das Florestas com araucária, informações sobre genética de populações envolvendo a Araucaria angustifolia são essenciais para programas de conservação ex situ e o melhoramento genético. A conservação ex situ de populações na forma de testes de procedências e progênies permite monitorar os níveis de variabilidade genética e verificar a eficácia de estratégia de amostragem utilizadas nas populações. Dentro deste contexto, o objetivo foi realizar a caracterização genética e estimar o ganho com a seleção em três testes de procedências e progênies de A. angustifolia em Colombo-PR visando a produção de madeira e de sementes. Essas áreas experimentais foram estabelecidas sob delineamento experimental em blocos de progênies compactadas. O número de progênies e repetições em cada área variou da seguinte forma: 25, 110 e 50 progênies e 16, 2 e 6 repetições, nas áreas 1, 2 e 3, respectivamente. Os caracteres avaliados foram: o diâmetro a altura do peito (DAP), altura total (ALT), volume total (VOL), diâmetro médio de copa (DMC) e espessura da casca (ESP) aos 30, 32 e 33 anos de idade e os caracteres de produção de pinhão. Os parâmetros genéticos e componentes de variância foram obtidos pelo procedimento REML/BLUP. Os resultados deste trabalho permitiram concluir que há variação genética significativa entre procedências e progênies para a maioria dos caracteres avaliados. Verificou-se que a maior parte da variação genética encontra-se entre progênies para 67% dos caracteres avaliados e 33% entre procedências. O diâmetro a altura do peito aos 32 anos foi o mais indicado para a seleção dos indivíduos nas áreas experimentais. As correlações fenotípicas e genéticas entre os caracteres silviculturais foram moderadas a altas, positivas e significativas, variou de 0,95 a 0,98. As procedências Telêmaco Borba-PR e Irati- PR apresentam melhor desempenho em DAP 32. A correlação entre as distâncias genotípicas e geográficas foram positivas em todas as áreas experimentais, confirmando que a variabilidade genética está estruturada no espaço. Com base na distância de Mahalanobis, os acessos de araucária foram separados em grupos distintos. Esses foram formados, principalmente, pelas procedências geograficamente mais próximas. Com a análise descritiva das pinhas e pinhões obteve-se ligeira superioridade na capacidade produtiva das árvores matrizes da área 1 comparada as árvores matrizes da área 2. Correlações fenotípicas moderadas negativa a moderadas positiva foram observadas para os caracteres de crescimento associados aos da produção de pinhão. Com base no diâmetro à altura do peito aos 32 anos foram simuladas duas intensidades de seleção em nível individual. A intensidade de seleção de 41%, 38% e 27% foi a mais adequada visto que proporcionaram ganhos por seleção de 8,27% 7,63% e 7,59% nas áreas 1, 2 e 3, respectivamente. Esta estratégia evitará a perda excessiva de variabilidade genética e ganhos genéticos modestos. / Due to both ecological and economic importance, as well as the high degree of degradation of Araucarian Forests, it can be important to obtain genetic information about genetic of Brazilian pine (Araucaria angustifolia) population is essential to ex situ conservation programs and genetic improvement. The ex situ population conservation, in the configuration of provenance and progeny tests allow monitoring the genetic variability levels and checking the efficiency of sampling strategies used in population. In this context, the aim of this work was to perform the genetic characterization and estimate gain with selection in three provenance and progeny tests of A. angustifolia in Colombo-PR, Brazil, more specifically, and analysis will focus on its wood and seed production. Those trial areas were established by experimental design in compacted blocks of progeny. The number of replicates and progenies in each area varied as follows: 25, 110 and 50 progenies and 16, 2 and 6 replicates, respectively, in the areas 1, 2 and 3. The evaluated traits were: diameter at breast height (DBH), total height (ALT), total volume (VOL), average crown diameter (DMC) and bark thickness (ESP) at 30, 32 and 33 years old beyond the traits related to pine nut production. Genetic parameters and variance components were obtained by REML/BLUP procedure. The results of this study indicated a significant genetic variation among provenances and progenies for the majority of evaluated traits. It was determined that most of the genetic variation was found among progenies up to 67% of the analysed traits and 33% among of provenances. The DBH at age 32 was the most suitable for the selection of individuals in the experimental areas. Phenotypic and genetic correlations between growth traits were observed from moderate to high, positive and significant, varying from 0,95 to 0,98. Provenances Telêmaco Borba-PR and Irati-PR presented best performances for the trait for DBH 32. The correlation between genotypic and geographical distances were positive in all experimental areas, confirming that genetic variability is structured in space. Based on the Mahalanobis distances, the araucaria accesses were separated into different groups. These were clustered, especially by the geographically closest provenances. With the descriptive analysis of pine cones and pine nuts, it gave a slight superiority in the productive capacity of trees in the Area 1 compared to trees of Area 2. Moderate negative to moderate positive phenotpic correlation were observed for growth traits associated to variables of pine nut production. Based on DBH trait at 32 years old were simulated two selection intensities at individual level. The selection intensity of 41%, 38% and 27%, leads genetic gains 8.27%, 7.63% and 7.59% in areas 1, 2 and 3, respectively. This strategy will avoid an excessive loss of genetic variability and modest genetic gains.

Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Resumo: Em função da importância ecológica, econômica e do alto grau de degradação das Florestas com araucária, informações sobre genética de populações envolvendo a Araucaria angustifolia são essenciais para programas de conservação ex situ e o melhoramento genético. A conservação ex situ de populações na forma de testes de procedências e progênies permite monitorar os níveis de variabilidade genética e verificar a eficácia de estratégia de amostragem utilizadas nas populações. Dentro deste contexto, o objetivo foi realizar a caracterização genética e estimar o ganho com a seleção em três testes de procedências e progênies de A. angustifolia em Colombo-PR visando a produção de madeira e de sementes. Essas áreas experimentais foram estabelecidas sob delineamento experimental em blocos de progênies compactadas. O número de progênies e repetições em cada área variou da seguinte forma: 25, 110 e 50 progênies e 16, 2 e 6 repetições, nas áreas 1, 2 e 3, respectivamente. Os caracteres avaliados foram: o diâmetro a altura do peito (DAP), altura total (ALT), volume total (VOL), diâmetro médio de copa (DMC) e espessura da casca (ESP) aos 30, 32 e 33 anos de idade e os caracteres de produção de pinhão. Os parâmetros genéticos e componentes de variância foram obtidos pelo procedimento REML/BLUP. Os resultados deste trabalho permitiram concluir que há variação genética significativa entre procedências e progênies para a maioria dos caracteres avaliados. Verificou-se que a maior parte da variaçã... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:34:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KarinK_DISSERT.pdf: 1760441 bytes, checksum: 1f006562e5e54fbb0d69c184d2961828 (MD5) Previous issue date: 2013-06-19 / The main specie of marine shrimp raised at Brazil and in the world is Litopenaeus vannamei, which had arrived in Brazil in the `80s. However, the entry of infectious myonecrosis virus (IMNV), causing the infectious myonecrosis disease in marine shrimps, brought economic losses to the national shrimp farming, with up to 70% of mortality in the shrimp production. In this way, the objective was to evaluate the survival of shrimps Litopenaeus vannamei infected with IMNV using the non parametric estimator of Kaplan-Meier and a model of frailty for grouped data. It were conducted three tests of viral challenges lasting 20 days each, at different periods of the year, keeping the parameters of pH, temperature, oxygen and ammonia monitored daily. It was evaluated 60 full-sib families of L. vannamei infected by IMNV in each viral challenge. The confirmation of the infection by IMNV was performed using the technique of PCR in real time through Sybr Green dye. Using the Kaplan-Meier estimator it was possible to detect significant differences (p <0.0001) between the survival curves of families and tanks and also in the joint analysis between viral challenges. It were estimated in each challenge, genetic parameters such as genetic value of family, it`s respective rate risk (frailty), and heritability in the logarithmic scale through the frailty model for grouped data. The heritability estimates were respectively 0.59; 0.36; and 0.59 in the viral challenges 1; 2; and 3, and it was also possible to identify families that have lower and higher rates of risk for the disease. These results can be used for selecting families more resistant to the IMNV infection and to include characteristic of disease resistance in L. vannamei into the genetic improvement programs / A principal esp?cie de camar?o marinho cultivado no Brasil e no mundo ? o Litopenaeus vannamei, que teve entrada no Brasil nos anos 80. Contudo, a chegada do v?rus da mionecrose infecciosa (IMNV), causador da doen?a da mionecrose infecciosa em camar?es marinhos, trouxe preju?zos econ?micos ? carcinicultura nacional, com mortalidades de at? 70% na produ??o de camar?es. Dessa maneira, objetivou-se avaliar a sobreviv?ncia de camar?es Litopenaeus vannamei infectados pelo v?rus da mionecrose infecciosa utilizando o estimador n?o param?trico de Kaplan-Meier e um modelo de fragilidade para dados grupados. Foram conduzidos tr?s testes de desafios virais com dura??o de 20 dias cada, em diferentes ?pocas do ano, mantendo-se os par?metros de pH, temperatura, oxig?nio e am?nia controlados diariamente. Foram avaliadas 60 fam?lias de irm?os completos de camar?es marinhos L. vannamei infectadas pelo IMNV em cada desafio viral. Foi feita a confirma??o da infec??o pelo IMNV atrav?s da t?cnica de PCR em tempo real utilizando o corante Sybr Green. Atrav?s do Estimador de Kaplan-Meier foi poss?vel detectar diferen?as significativas (p<0,0001) entre as curvas de sobreviv?ncia das fam?lias, entre as curvas de sobreviv?ncia entre os tanques por desafio viral e tamb?m na an?lise conjunta dos desafios virais. Foram estimados, em cada desafio, par?metros gen?ticos como o valor gen?tico de fam?lia e sua respectiva taxa de risco (fragilidade), e a herdabilidade na escala logar?tmica por meio do modelo de fragilidade para dados grupados. A herdabilidade estimada foi respectivamente 0,59; 0,36; e 0,59 nos desafios virais 1; 2; e 3; e tamb?m foi poss?vel identificar as fam?lias que possuem as menores e maiores taxas de risco para a doen?a. Esses resultados podem ser utilizados para sele??o de fam?lias mais resistentes ? infec??o pelo IMNV e a inclus?o da caracter?stica de resist?ncia ? doen?a em programas de melhoramento gen?tico de L. vannamei

A riqueza e a diversidade de espécies forrageiras dos Campos Sulinos, pode propiciar a inserção de espécies nativas em programas de melhoramento. As gramíneas nativas do gênero Paspalum possuem grande variabilidade, que pode contribuir para seleção de genótipos adaptáveis às várias condições ecológicas de regiões tropicais e subtropicais. Dentre as espécies deste gênero destaca-se o Paspalum notatum com ecótipos que possuem superioridade produtiva quando comparados à cultivares comerciais, o que contribui para que esta espécie seja candidata ao lançamento de novas cultivares. Avaliações de plantas melhoradas submetidas a diferentes práticas de manejo, como fertilização ou consorciação, são fundamentais para gerar conhecimento acerca das características produtivas. O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial produtivo de uma progênie híbrida intraespecífica de P. notatum submetida a diferentes níveis de fertilização nitrogenada ou consorciação com leguminosas para serem empregados em sistemas de produção a pasto ou na recuperação de pastagens naturais degradadas. A produção de matéria seca e a densidade populacional de perfilhos dos genótipos de P. notatum respondem de forma positiva aos níveis de fertilização nitrogenada. O nível de fertilização 120 kg N ha-1ano-1 promove a maior eficiência de uso de nitrogênio nos genótipos de P. notatum. Os genótipos B26, C22, C9 e Bagual são indicados para serem utilizados em sistemas de consórcio com leguminosas de clima temperado. A produção de matéria seca de sistemas com genótipos de P. notatum consorciados com trevo branco mais cornichão é semelhante à produção de sistemas fertilizados com até 240 kg N ha-1ano-1, evidenciando a viabilidade do consórcio entre essas espécies. / The richness and diversity of forage species in the Campos Sulinos region may facilitate the inclusion of native species in breeding programs. Native grasses of the Paspalum genus show great variability which may contribute to the selection of adaptable genotypes to the various ecological conditions of tropical and subtropical regions. Within the genus, Paspalum notatum is a species with superiorly productive ecotypes compared to commercial cultivars, rendering this species a candidate for the release of new cultivars. The evaluation of bred plants submitted to different management practices, such as fertilization or consortium with legumes is fundamental to acquire knowledge about the productive features. The objective of the present work was to evaluate the productive potential of an intraspecific hybrid progeny of Paspalum notatum submitted to different nitrogen fertilization levels or intercropped with legumes, with the objective of being used in grazing systems or in the recovery of degraded natural pastures. The dry matter yield and tiller population density of Paspalum notatum genotypes respond positively to nitrogen fertilization levels. The 120 kg N ha-1year-1 fertilization level promotes the highest nitrogen utilization efficiency in Paspalum notatum. Genotypes B26, C22, C9 and Bagual are indicated for legume intercropped systems with temperate legumes. The dry matter production of intercropped systems between Paspalum notatum genotypes with white clover plus birdsfoot trefoil is similar to the production of systems fertilized with up to 240 kg N ha-1year-1, demonstrating the viability of the intercropped between these species.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-09-19T13:03:22Z No. of bitstreams: 1 Robson da Silva Ramos.pdf: 2083261 bytes, checksum: a3bd5f9d9f715a880c77016b51a793ad (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-19T13:03:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Robson da Silva Ramos.pdf: 2083261 bytes, checksum: a3bd5f9d9f715a880c77016b51a793ad (MD5) Previous issue date: 2016-01-29 / The genetic variability of sugarcane is explored by genetic improvement from hybridizations between parents that presents high yield per si. However, parental recommendation has as a limiting factor the lack of floral synchronism between the genotypes and the lack of characterization of the accessions by the pollen viability, which may reflect on infertility or low fertility of caryopses. Informations about pollen viability of genotypes of sugarcane during the storage time, allow us to estimate the moment when pollen retains its germination power, vigor and genetic integrity to promote hybridizations between parents that have asynchronous flowering. This work aimed to study general aspects from hybridization in sugarcane, verify the existence of correlation between the pollen viability and the fertility of caryopsis, evaluate the viability of the pollen obtained from the upper and lower third of the panicles of tem genotypes, as well as pollen viability during the storage time of four varieties. The experiments were conducted at Estação de Floração e Cruzamento da Cana-de-açúcar de Devaneio. The pollen viability was tested by lugol solution and its conservation was made in a freezer at -18°C. The experimental design was completely randomized in a factorial design. Significant differences were identified among genotypes for all variables analyzed. The conservation method used in this study proved effective for maintaining the viability of three of the four genotypes. It was found a positive correlation between pollen viability and fertility of the caryopsis. / A variabilidade genética da cana-de-açúcar é explorada pelo melhoramento genético a partir de hibridações entre genitores que apresentam alto rendimento per si. Entretanto, a recomendação de parentais tem como fator limitante a falta de sincronismo floral entre os genótipos, bem como a falta de caracterização dos acessos quanto a viabilidade polínica, o que pode refletir em infertilidade ou baixa fertilidade das cariópses. Informações sobre a viabilidade polínica de genótipos da cana-de-açúcar no decorrer do tempo de conservação permite estimar o tempo no qual o pólen preserva seu poder germinativo, vigor e integridade genética para promover hibridações entre genitores que apresentam florescimento assíncronos. O presente trabalho objetivou estudar aspectos gerais da hibridação em cana-de-açúcar, verificar a existência de correlação entre a viabilidade polínica e a fertilidade da cariópse, avaliar a viabilidade de pólens obtidos do terço superior e inferior de panículas de dez genótipos, assim como a viabilidade polínica no decorrer do tempo de armazenamento de quatro variedades. Os experimentos foram conduzidos na Estação de Floração e Cruzamento da Cana-de-açúcar de Devaneio. A viabilidade polínica foi testada através da solução de lugol e a sua conservação foi feita em freezer a -18ºC. O delineamento experimental adotado foi o inteiramente casualizado em esquema fatorial. Foram identificadas diferenças significativas entre os genótipos para todas variáveis analisadas. A metodologia de conservação empregada no estudo mostrou-se eficiente para manutenção da viabilidade em três dos quatro genótipos avaliados. Foi verificada correlação positiva entre a viabilidade do pólen e a fertilidade da cariópse.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-10-06T13:31:22Z No. of bitstreams: 1 Tiago Vinicius Batista do Carmo.pdf: 833536 bytes, checksum: 6f420d513b278867c960dacc4bea24ac (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-06T13:31:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tiago Vinicius Batista do Carmo.pdf: 833536 bytes, checksum: 6f420d513b278867c960dacc4bea24ac (MD5) Previous issue date: 2014-01-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Passiflora cincinnata Mast. species is gaining popularity in the market and it has been considered a wild species that has great potential to contribute to the genetic improvement of commercial passion fruit. This study aims to evaluate the genotypes of wild passion fruit (P. cincinnata) by using morphological descriptors, agronomic traits and molecular markers ISSR. The experimental was randomized blocks in simple scheme with five replications and two plants per plot. For morphoagronomic characterization were evaluated 22 quantitative traits and 13 qualitative characteristics. For molecular characterization 12 ISSR primers were tested. Ac cording to the mean squares obtained from the analyzes of the variance to 21 traits evaluated, it can be highlighted that the significant differences (p <0.01) among the means of the genotypes for all traits. It was found that for the 21 morphological traits measured, which contributed most to the diversity was the MI (internode mean) with 43.12%, followed by DH5 (diameter stems to 5 cm of soil) and LS (spread sepal). The average similarity found was 68%. UBC 887 and UBC 841 primers stood out with the highest values for the attributes of the markers observed, demonstrating suitability to use in researches of different types of P. cincinnata. It was diagnosed low genetic variability among genotypes. The genotypes have potential to be used in breeding programs, especially those exploiting obtaining ornamental passiflora. / A espécie Passiflora cincinnata Mast. vem se popularizando no mercado e tem sido considerada uma das espécies silvestres que possuem grande potencial para contribuir com o melhoramento genético do maracujazeiro comercial. Diante do exposto, este trabalho tem como objetivo avaliar genótipos de maracujá-do-mato (P. cincinnata) por meio de descritores morfológicos e descritores agronômicos, além de marcadores moleculares do tipo ISSR, visando identificar variabilidade genética. O delineamento experimental foi em blocos casualizados em esquema simples com cinco repetições, com duas plantas por parcela. Para caracterização morfoagronômica foram avaliadas 22 características quantitativas e 13 características qualitativas. Para caracterização molecular foram testados 12 primers de ISSR. De acordo com os quadrados médios obtidos das análises de variância para as 21 características avaliadas pode-se ressaltar as diferenças significativas (p<0,01) entre as médias dos genótipos para todos os caracteres avaliados. Verificou-se que para os 21 descritores morfológicos avaliados, o que mais contribuiu para a diversidade foi o MI (média internódio) com 43,12%, seguido por DH5 (diâmetro das hastes a 5 centímetros do solo) e LS (largura da sépala). A similaridade média encontrada foi 68%. Os primers UBC 887 e UBC 841 se destacaram com os valores mais altos para os atributos dos marcadores observados, demonstrando aptidão para serem utilizados em pesquisas de diversidade em P. cincinnata. Foi diagnosticada baixa variabilidade genética entre os genótipos avaliados. Os genótipos possuem potencial para serem utilizados em programas de melhoramento, principalmente os que exploram a obtenção de passifloras ornamentais.