Resumo: A produção de doses de sêmen, enriquecidas com espermatozóides portadores do cromossomo X ou Y, aumentará a contribuição da inseminação artificial para: o incremento do progresso genético, produtividade e retorno econômico nas atividades pecuárias, e para a prevenção de doenças ligadas ao cromossomo X, na espécie humana. Constituiu objetivo do presente trabalho: aplicar o método de "swim-up" associado à centrifugação em gradiente descontínuo de densidade para produzir amostras de sêmen enriquecidas com espermatozóides portadores do cromossomo X, em bovinos. Após os tratamentos, os espermatozóides foram submetidos ao controle de qualidade pela avaliação da integridade acrossomal e taxas de produção de embriões in vitro. A validação dos resultados foi feita pela análise da proporção sexual dos embriões produzidos in vitro através da amplificação de uma seqüência específica do cromossomo Y presente no genoma bovino. Após a análise dos resultados observouse que não houve diferença significativa (P>0,05) no desvio da proporção sexual quando comparamos o grupo controle (45,20% de fêmeas) com os procedimentos de separação de espermatozóides (60,65% de fêmeas, em média). Os métodos de separação de espermatozóides, não prejudicaram a fertilidade dos espermatozóides (taxas de clivagem e blastocistos, em média, de 70% e 26% respectivamente). Este pode ser considerado um procedimento a ser utilizado na PIV de embriões bovinos. / Abstract: The production of doses of semen enriched with X- and Y- bearing spermatozoa will increase the artificial insemination contribution for genetic progress, productivity and economic return in livestock production and prevention of diseases connected to X chromosome, in humans. The purpose of this work was associated the modified swimup method with the centrifugation in density gradient for separation of X-bearing spermatozoa. Quality control of centrifuged spermatozoa were evaluated by acrosomal integrity and in vitro embryo production. The results were validated by sex proportion of in vitro produced embryos using PCR by Y- specific sequences present in bovine male genomic DNA. After the determination of genetic sex of in vitro produced embryos, the results showed no statistical difference (P>0.05) on deviation of sex ratio when the control group (45.20% female) was compare with the others spermatozoa selection procedures (60.65% female). The spermatozoa selection methods didn't impair fertility of X-bearing spermatozoa (cleavage and blastocyst rates: 70% and 26%, respectively) and would be considered methods of relevance to be introduced on in vitro produced embryos programs. / Orientador: Vera Fernanda Martins Hossepian de Lima / Coorientador: Lúcia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Francisco Antonio Techiatti Fazano / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Gisele Zoccal Mingoti / Mestre

O açaí (Euterpe oleracea) é um fruto proveniente do açaizeiro, uma palmeira nativa da Amazônia Brasileira, considerado uma “superfruta” devido ao seu alto valor nutricional, com destaque para as antocianinas, associadas a efeitos benéficos à saúde. Uma vez que genótipos de frutos desenvolvidos por programas de melhoramento têm sido avaliados a fim de identificar frutos com composição fitoquímica melhorada e potencial antioxidante, o objetivo deste trabalho foi investigar o efeito do melhoramento genético na composição química, perfil de compostos bioativos e atividade antioxidante de seis genótipos de açaí (E. oleracea). Análises de composição química, perfil de antocianinas e carotenoides e de atividade antioxidante em diversos sistemas in vitro (método ABTS, oxidação da glutationa, teste da desoxirribose e células SH-SY5Y) foram realizadas em 6 genótipos e 1 amostra comercial utilizada como padrão. Com relação a composição química, de maneira geral, os genótipos apresentaram elevados teores de lipídeos (36,30 – 47,44%), fibras totais (11,31 – 15,88%), proteínas (7,78-9,50%) e cinzas (3,49 – 4,44%). Adicionalmente, as antocianinas cianidina 3-glicosídeo (12-43%) e cianidina 3-rutinosídeo (57-88%) foram identificadas nos genótipos avaliados e o genótipo L22P13 apresentou um incremento de 85% no teor de antocianinas totais. Com relação ao perfil de carotenoides, luteína, zeaxantina, α-caroteno e β-caroteno foram os principais carotenoides identificados nos genótipos avaliados, sendo que os genótipos BRS-PAMISTA e L22P13 apresentaram os teores mais elevados de carotenoides totais (125,39μg/g e 118μg/g). Com relação a atividade antioxidante, todos os genótipos reduziram a geração do radical ABTS em maior ou menor grau, embora diferenças significativas entre os genótipos e a amostra comercial não tenham sido observadas (IC50 = 73,98 – 175,7 vs. 121,7 μg/g). Entretanto, houve associação moderada e inversa entre a geração do radical ABTS e níveis de antocianinas e carotenoides. Ausência de diferenças significativas entre os extratos hidroetanólicos dos genótipos e a amostra comercial também foi observada no ensaio da desoxirribose (IC50 = 361,5 – 497,7 vs. 520,1 μg/g). Em cultura de células SH-SY5Y, os extratos hidroetanólicos na concentração de 50 μg/mL apresentaram um efeito protetor contra as espécies reativas geradas pelo H2O2 (ensaio DCFH-DA) e esse resultado foi associado ao teor de antocianinas dos extratos. Os resultados apontam genótipos promissores, com elevados teores de antocianinas e carotenoides, com potencial atividade antioxidante in vitro e um possível efeito protetor de células frente as espécies reativas. / The açaí (Euterpe oleracea) is a fruit of the açaizeiro, a native palm of the Brazilian Amazon, considered a "superfruit" due to its high nutritional value, especially anthocyanins, associated with beneficial health effects. Since fruit genotypes developed by breeding programs have been evaluated to identify fruits with improved phytochemical composition and antioxidant potential, the aim of this study was to investigate the effect of genetic improvement in the chemical composition, bioactive compounds profile and antioxidant activity of six açaí (E. oleracea) genotypes. The analysis of chemical composition, anthocyanins and carotenoids profile and antioxidant activity in various in vitro systems (ABTS method, glutathione oxidation, deoxyribose test and SH-SY5Y cells) were performed in six genotypes of açaí and one commercial sample that was used as standard. Regarding the chemical composition, in general, the genotypes showed high levels of lipids (36.30 – 47.44%), total fiber (11.31 – 15.88%), protein (7.78-9.50%) and ashes (3.49 – 4.44%). In addition, the anthocyanins cyanidin 3-glucoside (12-43%) and cyanidin 3-rutinoside (57-88%) were identified in evaluated genotypes and L22P13 genotype showed an increase of 85% in total anthocyanin content. Regarding the carotenoid profile, lutein, zeaxanthin, α-carotene and β-carotene were the main carotenoid identified in genotypes, being that BRS-PAMISTA and L22P13 genotypes showed the highest levels of total carotenoids (125.39 μg/g and 118 μg/g). Regarding the antioxidant activity, all genotypes reduced ABTS radical generation in greater or lesser extension, although there were no significant differences between hydroethanolic extracts of different genotypes and the commercial sample (IC50 = 73.98 - 175.7 vs. 121.7 μg/g). However, an inverse and moderate association between radical ABTS generation and anthocyanins and carotenoids content was observed. Absence of significant differences between hydroethanolic extracts of evaluated genotypes and the commercial sample was observed also in the deoxyribose assay (IC50 = 361.5 to 497.7 vs. 520.1 μg/g). In culture of SH-SY5Y cells, hydroethanolic extracts at concentration of 50 μg/mL had a protective effect against the reactive species generated by H2O2 (DCFH-DA assay) and this result was associated with the anthocyanins content of the extracts. The results showed promising genotypes with high levels of anthocyanins and carotenoids with antioxidant potential in vitro and a possible protective effect of cells against reactive species.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2018-08-29T13:06:02Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Joicy Vitoria Miranda Peixoto - 2016.pdf: 2788388 bytes, checksum: bfe276668887fe4612e8d02840aee543 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-08-29T14:12:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Joicy Vitoria Miranda Peixoto - 2016.pdf: 2788388 bytes, checksum: bfe276668887fe4612e8d02840aee543 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-29T14:12:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Joicy Vitoria Miranda Peixoto - 2016.pdf: 2788388 bytes, checksum: bfe276668887fe4612e8d02840aee543 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The tomato is an important crop in both the national scene, and internationally, being its fruits among the most consumed in the world. These have nutritional importance, a source of several essential nutrients for a balanced diet as vitamin C, pro-vitamin A (betacarotene) and antioxidants (lycopene and other carotenoids). The social and economic importance of culture is associated with the generation of employment and source of funds for family. Given the benefits of tomato and its relevance in the country objective of this study was to characterize 25 genotypes of industrial tomato as the morphological aspects (number of leaf branches and floral racemes), productive and nutritious, and to select those likely to fruit cultivation to consumption "in natura" aimed at producing hybrids. The evaluation of the number of branches leaf and floral racemes allowed to conclude that the first variable positively influences the second, providing increased productivity. The lines CVR 1, CVR 3, CVR 4, CVR 5, CVR 21 and CVR 22 have an aptitude for genetic improvement of tomato, these being the higher productivity. Furthermore, it is concluded that lines including the CVR 8 are suitable for consumption "in natura", being that they produce fruits with soluble solid content above three degrees brix, oblong format, pH and vitamin C content in normal amount. The CVR 22 lineage produces tastier fruits due to better ratio between soluble solids and titratable acidity. The CVR 3 and CVR 8 lines yield fruits of higher acidity and lower pH, and accentuated red color, are indicated for the genetic improvement of industrial tomato. / O tomateiro é uma importante cultura tanto no cenário nacional, quanto no internacional, estando os seus frutos entre os mais consumidos no mundo. Estes possuem importância nutricional, sendo fonte de vários nutrientes fundamentais à dieta balanceada como vitamina C, pró-vitamina A (beta-caroteno) e antioxidantes (licopeno e outros carotenóides). A importância social e econômica da cultura está associada à geração de emprego e fonte de renda para várias famílias. Diante dos benefícios do tomate e de sua relevância no país, objetivou-se com este trabalho caracterizar 25 genótipos de tomate industrial quanto aos aspectos morfológicos (número de ramos foliares e rácimos florais), produtivos e nutritivos, além de selecionar aqueles propícios ao cultivo de frutos para consumo “in natura” visando à produção de híbridos. A avaliação do número de ramos foliares e rácimos florais permitiram concluir que a primeira variável influencia positivamente a segunda, proporcionando incremento em produtividade. As linhagens CVR 1, CVR 3, CVR 4, CVR 5, CVR 21 e CVR 22 possuem aptidão para o melhoramento genético do tomateiro, sendo estes os de maior produtividade. Além disso, concluiu-se que essas linhagens incluindo a CVR 8 são aptas ao consumo “in natura”, sendo que estes produzem frutos com teor de sólidos solúveis acima de três graus brix, formato oblongo, pH e teor de vitamina C em quantidade normal. A linhagem CVR 22 produz frutos mais saborosos devido a melhor relação entre sólidos solúveis e acidez total titulável. As linhagens CVR 3 e CVR 8 produzem frutos de maior acidez e menor pH, além de coloração vermelho acentuada, sendo indicados para o melhoramento genético do tomateiro industrial.

nÃo hà / O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de caracterizar e avaliar a diversidade genÃtica de progÃnies de meios-irmÃos de cajueiro anÃo precoce da Embrapa AgroindÃstria Tropical por meio de marcadores moleculares e morfolÃgicos, assim como, a indicaÃÃo dos materiais divergentes para o programa de melhoramento genÃtico. Foram utilizadas 50 progÃnies instaladas no Campo Experimental de Pacajus, CE. Na anÃlise molecular, cada progÃnie foi amostrada coletando-se folhas de duas plantas/parcela e analisadas no laboratÃrio de Biologia Molecular da Embrapa AgroindÃstria Tropical. Foram realizadas extraÃÃes de DNA baseadas no mÃtodo CTAB (brometo de cetiltrimetilamÃnio) ajustado por Cavalcanti (2004) e utilizados marcadores do tipo ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Utilizou-se o coeficiente de Jaccard e anÃlise de agrupamento UPGMA (MÃtodo de MÃdia AritmÃtica NÃo Ponderada) para anÃlise dos grupos. Doze iniciadores ISSR geraram 71 bandas das quais 27 foram polimÃrficas. A anÃlise de agrupamento permitiu a divisÃo em quatorze grupos de similaridade genÃtica, onde as progÃnies mais divergentes foram CNPAT 92-56, CNPAT 92- 62 e CNPAT 92-385 e as mais similares foram CNPAT 92-331 e CNPAT 92-335. Na anÃlise quantitativa foram utilizadas as seguintes variÃveis: altura da planta, diÃmetro da copa, nÃmero de castanhas e produÃÃo. Foi utilizada a DistÃncia Euclidiana para anÃlise da distÃncia genÃtica e UPGMA para a anÃlise de agrupamento. A produÃÃo foi a variÃvel que obteve maior contribuiÃÃo relativa para a divergÃncia genÃtica com 97,80%. A anÃlise de agrupamento UPGMA possibilitou a distribuiÃÃo de 11 grupos. O material mais divergente foi o CNPAT 92-331 oriundo da Fazenda Capisa (PiauÃ). Os mais similares formaram o subgrupo I do grupo I, CNPAT 92-54 e CNPAT 92-58 com 95% de similaridade. Hà variabilidade genÃtica, no entanto nÃo foram encontradas relaÃÃes diretas entre a anÃlise molecular e a quantitativa / The present work was developed in order to characterize and evaluate the genetic diversity of dwarf cashew progenies from Embrapa AgroindÃstria Tropical using molecular and morphological markers as well as the indication of divergent materials to the breeding program. It was used 50 dwarf cashew progenies from Embrapa AgroindÃstria Tropical collection located in the Experimental Center of Pacajus, CearÃ. In the molecular analysis, each progeny was sampled by collecting leaves from two plants per plot and then analyzed at EmbrapaÂs molecular biology lab. It was performed DNAÂs extractions based on CTAB (Cetyltrimethylammonium bromide) method, adapted by Cavalcanti (2004). ISSRÂs markers (Inter Simple Sequence Repeat) were used. JaccardÂs coefficient and UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) cluster analysis were applied in the group analysis. Cluster analysis allowed the division into fourteen groups of genetic similarity being the most divergent progenies CNPAT 92-56, 92-62 and 92-385, and the most similar ones CNPAT 92-331 and 92-335. Variables such as plant height, diameter, number of nuts and production, were used in the quantitative analysis. Euclidian distance was used in the genetic distance analysis. UPGMA method were used in cluster analysis. The variable with highest relative contribution to genetic divergence was production, with 97,80%. The UPGMA cluster analysis allowed the division into eleven groups. The most divergent material was CNPAT 92-331 coming from Capisa farm in Piauà state. The most similar materials formed the subgroup I of group I, CNPAT 92-54 and 92-58 with 95% similarity. There is genetic variability, however no direct relationship between molecular and quantitative analysis was found

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-09-19T13:59:13Z No. of bitstreams: 1 Antonio Esmael Silva de Oliveira.pdf: 1089311 bytes, checksum: e93b02f0fa36f0951963b3bf1afdc9e9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-19T13:59:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Antonio Esmael Silva de Oliveira.pdf: 1089311 bytes, checksum: e93b02f0fa36f0951963b3bf1afdc9e9 (MD5) Previous issue date: 2015-09-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / In the present work were estimated genetic gains in two environments due to recurrent selection practiced in population CNPH6400 for the type Valenciano, as well as parameters of adaptability and stability in five environments, with the final objective to evaluate the potential for recommendation of Valencian populations for the Sao Francisco Valley. The experiments were carried out in the municipalities of Petrolina - PE, Juazeiro - BA, and Belem San Francisco - PE, during the years 2013 to 2014. It was adopted the experimental design of randomized blocks, with three replications and twelve treatments to evaluate the genetic gain and fourteen treatments, including eight Valencianas for adaptability and stability parameters. The characteristics evaluated were total and commercial bulb yields, which were. Adjusted by covariance from the average plant stand of each experiment. Were estimated heritability, differential selection, genetic gain. Adaptability and stability parameters were estimated by the methods of Eberhart & Russel and Lin & Binns. Significant differences were observed for bulbs commercial production in the two environment, except for the population 25CA10 in Juazeiro - BA. The mean genetic gain for bulbs commercial production in the yellow Valenciana population 25CA10 were 378.88% in Petrolina - PE and 16.30% in Juazeiro - BA, while the purple population T811CR13 the gains were 340.76% to Petrolina - PE and 55 01% to Juazeiro - BA. The genetic gains were not linear to the sequence of the evaluated cycles, and these oscillations were attributed to genetic drift and selection emphasizing the thickness of cataphylls in recent cycles. It was observed genotype x environment interaction for all variables. The two methodologies presented discrepant results for the cultivar Alfa San Francisco. The Valencianas 25CA10 populations and T811CR13 showed average bulb productions close or above experiments means, combined with wide adaptability and stability, having the potential to be recommended as new cultivars for the region of the São Francisco Valley. / No presente trabalho foram estimados ganhos genéticos em dois ambientes devido a seleção recorrente praticada na população CNPH6400 para o tipo Valenciano, bem como parâmetros de adaptabilidade e estabilidade em cinco ambientes, com o objetivo final de avaliar o potencial de recomendação de populações Valencianas para o Vale do São Francisco. Os experimentos foram conduzidos nos municípios de Petrolina – PE, Juazeiro – BA, e Belém do São Francisco – PE, nos anos de 2013 a 2014. Foi adotado o delineamento experimental de blocos ao acaso, com três repetições, sendo doze tratamentos para avaliação do ganho genético e quatorze tratamentos, sendo oito Valencianas para parâmetros de adaptabilidade e estabilidade. As características avaliadas foram produção total de bulbos e produção de bulbos comerciais. Os dados da produção total foram corrigidos pela covariância a partir do stand médio de cada experimento. Foram estimadas a herdabilidade, o diferencial de seleção, o ganho genético. Parâmetros de adaptabilidade e estabilidade foram estimadas pelas metodologias de Eberhart & Russel e Lin & Binns. Nas avaliações de ganho genético foram observadas diferenças significativas para produção comercial de bulbos nos dois ambientes, exceto para a população 25CA10 em Juazeiro - BA. As médias do ganho genético para produção comercial na população Valenciana amarela 25CA10 foram 378,88% em Petrolina – PE e 16,30% em Juazeiro – BA, enquanto na população roxa T811CR13 os ganhos foram de 340,76% para Petrolina – PE e 55,01% de Juazeiro – BA. Os ganhos genéticos não foram lineares para a sequência dos ciclos avaliados, sendo essa oscilação atribuída a deriva genética e a seleção com ênfase a espessura de catáfilos nos últimos ciclos. Foi observada interação genótipo x ambiente para todas as variáveis avaliadas. As duas metodologias apresentaram resultados discrepantes para a cultivar Alfa São Francisco. As populações Valencianas 25CA10 e T811CR13 apresentaram produção de bulbos próximos ou acima das médias dos experimentos, aliadas a ampla adaptabilidade e boa estabilidade, tendo potencial para serem recomendadas como novas cultivares para a região do Vale do São Francisco.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-04-10T12:56:37Z No. of bitstreams: 1 Eduardo Bruno Afonso Ferreira Pita.pdf: 590172 bytes, checksum: af018845d1a00ba8cf2281a306b684a5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-10T12:56:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eduardo Bruno Afonso Ferreira Pita.pdf: 590172 bytes, checksum: af018845d1a00ba8cf2281a306b684a5 (MD5) Previous issue date: 2013-01-30 / The objective of this work were to select Pennisetum sp. genotypes based on survival and realize the characterization agronomic-bromatological in Serra Talhada municipality, semiarid region of Pernambuco. The experiment was established in 2011 at the Lauro Ramos Bezerra Experimental Station, Agricultural Research Institute (IPA), Northeast Brazil, under randomized block design, with four replications. The clones/treatments were represented by 38 Pennisetum sp. genotypes, being 27 elephant grass (P. purpureum Schum.) interspecific hybrids crossed with millet (P. glaucum L. R. Br.), generated in 2009; seven elephant grass cultivars (Taiwan A-146, Taiwan A-25, Mercker SEA, Cuba 116, “Elefante Roxo”, “Elefante B” and Napier 472-76); two commercial cultivars (Cameroon and “Mineirão”) and two elephant grass interspecific hybrids with millet from the IPA Itambé-PE unity (Itambé-2006 selection and Natural Itambé). Ten agronomic-bromatological traits were evaluated in three cycles between the months of February/2011 to March/2012, with the first cut made after 60 days and the other with 105 days, because of the dry season. Of the 38 genotypes evaluated, eight elephant grass cultivars (“Elefante Roxo”, Taiwan A-146, Cuba 116, Taiwan A-25, Napier 472-76, “Elefante B”, “Mineirão” and Cameroon) and eight interspecific hybrids (ST-20A, ST-36A, ST-42, ST-45A, ST-51, Seleção Itambé-2006 e Natural Itambé) were selected . The cultivars presented higher survivability compared to hybrids in the Serra Talhada conditions. However the some hybrids showed survivors, revealing expressive dry matter concentration and high production, highlighting the ST-36A, ST-42 and ST-47A hybrids, which showed 6.6, 4.2 and 5.5 t DM/ha and concentration of dry matter of 24.46, 25.95 and 23.15% on average of the three cuts, respectively. / Objetivou-se com esse trabalho selecionar genótipos de Pennisetum sp. com base na sobrevivência e realizar a caracterização agronômico-bromatológico no município de Serra Talhada, região semiárida de Pernambuco. O experimento foi implantado em 2011, na Estação Experimental Lauro Ramos Bezerra, pertencente ao Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA), adotando-se o delineamento em blocos ao acaso, com quatro repetições. Os clones/tratamentos foram representados por 38 genótipos de Pennisetum sp., sendo 27 híbridos interespecíficos de capim-elefante (P. purpureum Schum.) cruzado com o milheto (P. glaucum L. R. Br.) gerados em 2009, sete cultivares de capim-elefante (Taiwan A-146, Taiwan A-25, Mercker SEA, Cuba 116, Elefante Roxo, Elefante B e Napier 472-76), dois cultivares comerciais (Cameroon e o Mineirão) e dois híbridos interespecíficos de capim-elefante com milheto oriundos da unidade do IPA de Itambé-PE (Seleção Itambé-2006 e o Natural Itambé). Dez variáveis agronômico-bromatológicas foram avaliadas em três ciclos compreendidos entre os meses de fevereiro de 2011 a março de 2012, sendo o primeiro corte realizado aos 60 dias e os demais com 105 dias, devido a estação seca. Dos 38 genótipos, oito cultivares de capim-elefante (Elefante Roxo, Taiwan A-146, Cuba 116, Taiwan A-25, Napier 472-76, Elefante B, Mineirão e o Cameroon) e oito híbridos interespecíficos (ST-20A, ST-36A, ST-42, ST-45A, ST-51, Seleção Itambé-2006 e Natural Itambé) foram selecionados. Os cultivares apresentou maior capacidade de sobrevivência frente aos híbridos nas condições de Serra Talhada, porém alguns híbridos se mostraram sobreviventes, revelando teores de matéria seca elevada e valores de produção expressivos, destacando-se o ST-36A, ST-42 e o ST-47A, que apresentaram 6,6; 4,2 e 5,5 t de MS/ha e teores de MS de 24,46 %, 25,95 % e 23,15 % na média dos três cortes, respectivamente.

Orientadores: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira, Juan Lucas Argueso / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-16T23:40:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Galzerani_Felipe_M.pdf: 2436643 bytes, checksum: ea790894d475c5a1b97c1d97f93475fa (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: A crise energética e a preocupação ambiental têm feito do etanol uma fonte de energia renovável atrativa. Brasil e Estados Unidos têm se destacado nos últimos anos como os dois maiores produtores deste importante recurso energético. O etanol brasileiro é produzido pela fermentação da sacarose da cana-de-açúcar pela levedura Saccharomyces cerevisiae. Cepas laboratoriais de S. cerevisiae estão entre os organismos mais bem caracterizados pela biologia moderna. Durante décadas elas passaram por uma série de modificações genéticas com a criação de mutações em genes marcadores que atualmente viabilizam procedimentos de manipulação genética. Em contraste, o processo de fermentação industrial é realizado por cepas selvagens, mas que permanecem ainda inexploradas geneticamente, dificultando a aplicação de técnicas de manipulação genética. O presente estudo teve como objetivo "domesticar" a linhagem JAY270, um isolado da cepa industrial Pedra-2, tornando-a de fácil manipulação genética, plataforma para a introdução de características que melhorem o desempenho dela nas indústrias. A estratégia de domesticação foi baseada no sistema de manipulação Delitto Perfetto, para que o seu genoma altamente heterozigoto fosse preservado e assim mantivesse as suas características de interesse industrial. Dois cassetes integrativos com marcas de seleção diferentes foram construídos a partir de plasmídeos e utilizados na deleção das duas cópias do gene URA3 da levedura. O fragmento homólogo de reparo foi usado na retirada das marcas genéticas de seleção evitando a permanência de quaisquer resquícios de transgenia. Ao final do processo de domesticação a JAY270 passou a apresentar auxotrofía para uracila, mantendo intacta a sua arquitetura genômica heterogênea e, assim, o seu vigor híbrido, os quais têm sido relacionados à boa atividade fermentativa da linhagem industrial. Embora tenha sido um processo bastante laborioso, este resultado deverá facilitar novos estudos que necessitem de técnicas de manipulação genética como a do Delitto Perfetto para melhorar características fermentativas da linhagem industrial. / Abstract: The energy crisis and the environmental concern have made ethanol an attractive renewable energy source. Brazil and the United States have been, in the last years, the largest producers of this important energy resource. Brazilian ethanol is produced through fermentation of sucrose from sugar cane by Saccharomyces cerevisiae yeasts. Laboratory strains of S. cerevisiae are among the most well characterized organisms in modern biology. For decades they have undergone a series of genetic changes with the creation of mutations in markers genes that now enable current procedures for genetic manipulation. In contrast, the industrial fermentation process is carried out by wild strains that remain as of yet genetically unexplored hindering the application of genetic engineering techniques. The objective of the present study was to domesticate the JAY270 diploid strain, which is an isolate of the industrial yeast Pedra-2, simplifying its genetic manipulation into a biological platform for the introduction of characteristics that improve its performance in industries. The genetic manipulation strategy was based on the Delitto Perfetto procedure to preserve the highly heterogeneous genome of the JAY270 strain including its genetics properties related to characteristics of industrial interest. Two integrative cassettes containing different genetic markers were constructed from plasmids to be used in deletion of both copies of the URA3 gene of the JAY270 strain. A repair homologous fragment was employed in the removal of the selective markers used during the manipulation steps, avoiding any remaining transgenic traces. The auxotrophy to uracil was achieved after complete deletion of the URA3 genes from the JAY270 diploid genome. The heterogeneous genomic architecture of the JAY270 was maintained as well as its hybrid vigor related to fermentative characteristics of industrial interest. The auxotrophic yeast generated in this study will facilitate the application of genetic engineering techniques such as Delitto Perfetto to achieve improvement in the industrial fermentation traits of the wild strain. / Mestrado / Genetica de Microorganismos / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Orientador: Jose Luiz dos Santos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Filosofia e Ciencias Humanas / Made available in DSpace on 2018-08-09T04:14:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DelCont_ValdeirDonizete_D.pdf: 3917121 bytes, checksum: 9f1794257f0c8a0fe069a5f8804685dc (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: Esta tese tem como objetivo defender que nos Estados Unidos, em torno do termo eugenia, estabeleceram-se referenciais teóricos e práticas sociais a partir da concepção de que a eugenia tratava-se de uma legítima ciência da hereditariedade, no sentido de fazer estender para os seres humanos o que seria válido para ervilhas, milhos, porcos e cavalos, com o firme propósito do melhoramento das especificidades genéticas humanas. Proposta por Francis Galton como conseqüência lógica da aplicação da teoria da seleção natural darwiniana na constituição biológica humana, procuraremos demonstrar que a eugenia se estabeleceu como um campo de produção de saber científico em estreita sintonia com o desenvolvimento do debate sobre hereditariedade na passagem do século XIX para o XX, em um contexto pautado pelo avanço imperialista e por teorias raciológicas e discriminatórias que buscavam legitimar práticas sociais em função da melhora racial da espécie humana, a partir da eliminação das características consideradas eugenicamente inferiores. Para tanto, procurar-se-á relacionar os referenciais teóricos que deram sustentação epistêmica às práticas laboratoriais e sociais fundamentadas nos princípios eugênicos, bem como estruturar as práticas institucionais que possibilitaram a formação de um modelo de eugenia que descreveremos como modelo estadunidense, a partir do qual uma série de medidas foram implementadas visando à eliminação do que foi considerado o germeplasma defeituoso responsável pela degenerescência dos indivíduos e das condições sociais. Considerado até pouco tempo como um assunto superado, principalmente devido à sua associação com a ideologia nazista, a eugenia, por intermédio dos novos cenários abertos pelo avanço da ciência genômica, volta a ocupar não somente o imaginário social, como também, através de novas roupagens, parece estar presente em uma série de desdobramentos envolvendo as ciências genômicas, principalmente em suas versões biotecnológica, farmacogenômica e genética, o que torna relevante a reconsideração da formação da eugenia, seu declínio e transformação como campo de produção de conhecimento científico / Abstract: This thesis aims to defend that theoretical approaches and social practices from the conception that eugenics was a legitimate science of the hereditary succession were established about the word eugenics in the United States of America, in the sense of extending to the human beings what would be valid for peas, corns, pigs and horses, with the purpose of improving the human beings genetic nature. Proposed by Francis Galton as a logical consequence of the application of the Darwin¿s theory on natural selection in the human beings biological constitution, we will demonstrate that the eugenics established itself as a scientific knowledge production field in straight accordance with the development of the debate about hereditary succession in the passage from the nineteenth to twentieth centuries, within a context marked by the imperialist advance, by racial and discriminatory theories that searched to legitimize social practices in function of racial improvement of the human species, through the elimination of the characteristics considered lower eugenically. Therefore, we will relate the theoretical basis that had given epistemic sustenance to the laboratory and social practices established in the eugenics principles, as well as structuralizing the institutional practices that make possible the formation of a eugenics model that we will describe as an United States model, through which a series of measures had been implemented aiming the elimination of what was considered the defective germeplasma responsible for the individuals degeneration and for the social conditions. Considered until little time ago as an surpassed subject, mainly due to its association with the Nazi ideology, the eugenics, through of the new setting opened by the advance of genomic science, comes back not only to occupy the social imaginary, but also, through new version, seems to be present in a series of foldings involving genomics sciences, mainly in its biotechnological, farmacogenetic and genetic versions, that becomes relevant the reconsideration of the eugenics formation, its decline and transformation as a field of production of scientific knowledge / Doutorado / Ciencias Sociais / Doutor em Ciências Sociais

Orientador: Sergio Luiz Monteiro Salles Filho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Geociencias / Made available in DSpace on 2018-08-11T22:04:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pedro_EdilsondaSilva_D.pdf: 4051339 bytes, checksum: d09b246c6421ec992188b778a4af5802 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O propósito deste estudo de tese é identificar melhores estratégias institucionais de governança e coordenação para organizar a Pesquisa em Melhoramento Genético de Cana-de-açúcar. Para este fim, conceitualmente foram utilizadas as abordagens evolucionistas visando sintetizar um marco analítico com foco direcionado à questão da governança em sistemas setoriais de inovação ligados a agricultura. A estratégia de pesquisa exploratória foi empregada como metodologia para precisar o problema e compreender seus elementos e relações relevantes. Também foram aplicadas ferramentas de prospectiva estratégica para analisar cenários e incertezas críticas. A partir destas definições e recursos, a pesquisa identificou as forças, fraquezas, oportunidades e ameaças e, sobretudo, as falhas de coordenação nas dimensões atores, base de conhecimento e marcos regulatórios. Estes elementos subsidiaram a composição e análise das incertezas críticas e trajetórias institucionais estratégicas na projeção de cenários alternativos. Como resultado, o estudo aponta inovações institucionais que podem apoiar o desenvolvimento e organização da coordenação da PD&I, baseando-se em diretrizes de aumento de coerência sistêmica - tais como gestão dos processos decisórios, compartilhamento de objetivos e recursos. Entendese que este estudo setorial apresenta uma plataforma importante para desenhar políticas e estratégias institucionais mais robustas para a organização da pesquisa enfrentar as transformações no padrão produtivo da agricultura e agroindústria nos próximos 10 anos. / Abstract: The purpose of this study is to identify better governance institutional strategies and coordination of Research in Sugar Cane Genetic Improvement. Therefore, evolutional approaches were used to synthesize an analytical mark focusing on governance question in sectorial systems of innovation connected to agriculture. The strategy of exploratory research was used as a methodology to define the problem, understand its elements, and relevant relations. Strategic prospecting tools were applied to analyze scenarios and critical uncertainnesses. From these definitions and resources, the research identified strengths, weaknesses, opportunities and threats, and above all, coordination failures in dimensions as such actors, knowledge base, and regulatory marks. And these elements supported the composition and analysis of critical uncertainnesses and strategic institutional trajectories in alternative scenario projections. As a result, the study indicates institutional innovations which can support the development and organization of RD&I coordination according to the directions of systemic coherence increasing - as such management of decision processes, sharing of goals and resources. It is understood that this sectorial study presents an important platform to design more powerful institutional politics and strategies so that the organizational research can face agricultural and agroindustrial productive patter transformations in the next ten years. / Doutorado / Doutor em Política Científica e Tecnológica

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-03-07T19:19:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Dulcilene O. Silva.pdf: 963345 bytes, checksum: dc23d1a7d5dca5366312e2961aa1c5a5 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-03-07T19:21:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Dulcilene O. Silva.pdf: 963345 bytes, checksum: dc23d1a7d5dca5366312e2961aa1c5a5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-07T19:21:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Dulcilene O. Silva.pdf: 963345 bytes, checksum: dc23d1a7d5dca5366312e2961aa1c5a5 (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study aimed to measure the genetic progress of coffee grain yield (in bags.ha-1) from the clonal selection of Conilon coffee plants and the estimation of genetic parameters for three consecutive agricultural years. The experiment was carried out in six randomized complete blocks, with four plants per plot, at 3 x 2 m spacing, at the Embrapa Rondônia experimental station, Ouro Preto do Oeste - RO. It began in December 2011 with 130 genotypes and the evaluations occurred in the 2014, 2015 and 2016 harvests. The estimation of the genetic parameters, the prediction of the values and the genotypic effects of the clones, the genetic progress and the minimum number of measurements were performed with the REML / BLUP procedure by the SELEGEN program. Estimates of the genetic parameters indicated genetic component predominance in each agricultural year, however, the environmental variation (temporary effects plus permanent effects) predominated over the genotype variation in the joint evaluation of the crops. The genetic progress of the coffee yield was 49.88% with the selection of the best 10% clones, and provided an increase in average productivity from 42.57 bags.ha-1 to 63.80 bags.ha-1. With three agricultural years it was possible to select clones that maintain their genetic superiority, with high accuracy (0.90) and determination (0.88). The MHPVG procedure associated with the genetic gains selected superior, stable and more adaptable clones of Conilon coffee trees for the northern region of Brazil. / Objetivou-se mensurar o progresso genético da produtividade de grãos de café beneficiado (em sacas.ha-1) a partir da seleção clonal de cafeeiro Conilon e com a estimação de parâmetros genéticos, durante três anos agrícolas consecutivos. O experimento foi conduzido em seis blocos completos casualizados, com quatro plantas por parcela, em espaçamento de 3 x 2 m, na estação experimental da Embrapa Rondônia, Ouro Preto do Oeste – RO. Iniciou-se em dezembro de 2011, com 130 genótipos e as avaliações ocorreram nas safras de 2014, 2015 e 2016. A estimação dos parâmetros genéticos, a predição dos valores e dos efeitos genotípicos dos clones, do progresso genético e do número mínimo de medidas repetidas foram realizadas com o procedimento REML/BLUP, pelo programa SELEGEN. As estimativas dos parâmetros genéticos indicaram predominância do componente genético em cada ano agrícola, no entanto, a variação ambiental (efeitos temporários mais efeitos permanentes) predominou sobre a variação genotípica na avaliação conjunta das safras. O progresso genético da produtividade de café beneficiado foi de 49,88% com a seleção dos 10% melhores clones, e proporcionou um incremento na produtividade média de 42,57 sacas.ha-1 para 63,80 sacas.ha-1. Com três anos agrícolas foi possível selecionar clones mantenedores de sua superioridade genética, com elevada acurácia (0,90) e determinação (0,88). O procedimento MHPVG associado aos ganhos genéticos selecionou clones de cafeeiro Conilon com desempenho superior, estáveis e com maior adaptabilidade para a região Norte do Brasil.