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Heterologous Expression of Grapefruit Clones PGT3 and PGT9 in Yeast and Screening of Recombinant Protein for ActivityWamucho, Anye, Hayford, Deborah, McIntosh, Cecelia A. 12 August 2012 (has links)
The wide diversity of plant secondary products results from different modifications undergone during biosynthesis, including glucosylation. These modification reactions result in production of the compounds actually found in plants and to unique chemical and biochemical properties, including some bitter compounds in grapefruit. While the presence of a PSPG box motif allows for identification of a clone as a putative glucosyltransferase (PGT), diversity of GT primary structures makes it difficult to accurately assign specific function. Our approach is to identify and isolate putative GT clones, express them heterologously, and biochemically characterize the proteins. Eleven putative GT clones have been isolated from Citrus paradise and some have been biochemically characterized. The current hypothesis being tested is that PGT3 and PGT9 clones are plant secondary product GTs. Due to issues with inclusion bodies when using E. coli, proteins were expressed in Pichia pastoris using the pPICZA vector. Recombinant protein expression was confirmed by Western blot and proteins were enriched by IMAC. Over 30 flavonoid and simple phenolic substrates, representing many compounds found in grapefruit, were screened for activity with PGT3 and PGT9 proteins. No significant activity was found and the biochemical function of the proteins encoded by these clones will be further investigated.
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Supporting Students’ Writing and Degree Completion: Boot Camps, Write-Ins and Writing RetreatsMcIntosh, Cecilia A. 03 December 2014 (has links)
No description available.
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Structure and Function of Flavonoid Glucosyltransferases: Using a Specific Grapefruit Enzyme as a ModelMcIntosh, Cecilia A. 10 August 2015 (has links)
Glucosyltransferases (GTs) are enzymes that enable transfer of glucose from an activated donor (UDP-glucose) to the acceptor substrates. A flavonol specific glucosyltransferase cloned from Citrus paradisi has strict substrate and regiospecificity (Cp3OGT). The amino acid sequence of Cp3OGT was aligned with a purported anthocyanin GT from Clitorea ternatea and a GT from Vitis vinifera that can glucosylate both flavonols and anthocyanidins. Using homology modeling to identify candidate regions followed by site directed mutagenesis, three double mutations of Cp3OGT were made. Biochemical analysis of the three mutant proteins was performed. S20G+T21S protein retained activity similar to the wildtype (WT- Kmapp-80 µM; Vmax = 16.5 pkat/µg, Mutant- Kmapp-83 µM; Vmax -11 pkat/µg) but the mutant was more thermostable compared to the WT and this mutation broadened its substrate acceptance to include the flavanone, naringenin. S290C+S319A mutant protein retained 40% activity relative to wildtype, had an optimum pH shift, but had no change in substrate specificity (Kmapp-18 µM; Vmax-0.5 pkat/µg). H154Y+Q87I protein was inactive with every class of flavonoid tested. Product identification revealed that the S20G+T21S mutant protein widened the substrate and regio-specificity of CP3OGT. Docking analysis revealed that H154 and Q87 could be involved in orienting the ligand molecules within the acceptor binding site. H363, S20, and S150 were also found to make close contact with the 7-OH, 4-OH and 3’-OH groups, respectively.
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Structure and Function of Flavonoid Glucosyltransferases: Using a specific Grapefruit Enzyme as a ModelMcIntosh, Cecilia A. 01 March 2016 (has links)
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A internacionalização da educação superior no Brasil : um estudo de caso de alunos estrangeiros do Programa de Pós-Graduação em Antropologia Social/UFRGSFeijó, Rosemeri Nunes January 2013 (has links)
A presente dissertação analisa o Programa de Estudantes-Convênio de Pós-Graduação (PEC-PG), promovido pela CAPES e CNPq, por meio do estudo de alunos estrangeiros contemplados com esta modalidade de bolsa, tomando o Programa de Pós-Graduação em Antropologia Social (PPGAS) da Universidade Federal do Rio Grande do Sul como estudo de caso. Neste trabalho, contempla-se a perspectiva histórica do processo de internacionalização da educação superior e a influência do Protocolo de Bolonha no avanço da internacionalização no Brasil. Salienta-se que o PPGAS tem participado no processo de internacionalização desde o seu início. A investigação, baseada em 10 entrevistas, contempla o grau de relevância da formação científica na trajetória de vida dos alunos bolsistas beneficiados pelo PEC-PG. Parte-se da tomada de conhecimento do referido programa pelos bolsistas, suas motivações, experiências e aproveitamento acadêmico, assim como as implicações desta capacitação na sua inserção profissional e social, após a conclusão do curso nos países de origem, ou em sua permanência no Brasil. Os dados coletados indicam que os estudantes vêm em busca de formação em um programa de excelência e que essa expectativa se realiza: a experiência na Antropologia brasileira lhes trouxe novos aportes teóricos e metodológicos que não se faziam presentes na antropologia praticada em seus países de origem. Foram apontados alguns aspectos que poderiam facilitar a experiência de estudantes estrangeiros em Porto Alegre: orientação para entender a burocracia e as dinâmicas da Universidade, maior atenção e reconhecimento de suas experiências vividas no âmbito do PPGAS. Foram, também, apontadas dificuldades: o rigor do inverno e o preconceito racial na cidade de Porto Alegre. Entre alunos latino-americanos, há forte motivação de fixar residência e trabalhar no Brasil; entre os estudantes africanos, a busca por um ensino de qualidade faz parte de um projeto de vida motivado pelo desejo de retornar para promover o desenvolvimento de seu país. Estes egressos podem se tornar atores importantes nas parcerias entre instituições brasileiras e estrangeiras, com o potencial de ajudar na realização de acordos e eventos científicos, envolvendo a participação de pesquisadores de ambos os países. / This dissertation analyzes the PEC-PG, a scholarship program for graduate students) sponsered by CAPES (an agency of Brazil’s Ministry of Education) and CNPq (Brazil’s national science foundation), that targets foreign students. It takes the Graduate Program in Social Anthropology at the Federal University of Rio Grande do Sul (PPGAS-UFRGS) as a case study. In order to do that, the research started by presenting a historical perspective of the process of internationalization of higher education and the influence of the Bologna Protocol in accelerating the internationalization of higher education in Brazil. The PPGAS-UFRGS has been involved in the process of internationalization since its beginning. This research, based on 13 interviews, shows the impact of scientific training for the life trajectory of students who got scholarships from PEC-PG. The interviews covered a number of issues, starting with how the students learned about the fellowship program, their motivations, experiences and academic achievements, as well as the implications of this training to their professional and social integration back in their countries of origin, upon completion of the course, or their stay in Brazil. The data collected indicate that students were seeking education in a program of academic excellence and, in this perspective, they have their expectations fulfilled: the contact with Brazilian Anthropology provided them with new theoretical and methodological approaches which did not exist in the anthropology practisced in their countries of origin. Students also pointed out aspects that could facilitate their experience as foreign students in Porto Alegre. Among others things, they report difficulty in understanding the dynamics of the University and a lack of recognition of their own experiences at the PPGAS. Other challenges were also pointed out, such as the rigors of winter and racial prejudice in the city of Porto Alegre. The research also shows that among students coming from Latin American countries, there is strong motivation to settle and work in Brazil, while among African students the quest for quality education is part of a larger project motivated by a desire to return and foster the development of their countries. These graduates may become important actors in partnerships between Brazilian and foreign institutions, with the potential to help in the accomplishment of scientific agreements and events, involving the participation of researchers from both countries.
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O programa Prêmio Capes de Tese : avaliação dos resultados pós-premiaçãoCarvalho, Renato Barros de January 2014 (has links)
As premiações e honrarias a cientistas fazem parte da dinâmica de funcionamento da atividade científica desde o século XVII. O sistema de recompensas da ciência reforça essa prática baseada na motivação dos cientistas em busca de reconhecimento. No entanto, a lógica desse sistema a partir da estratificação dos cientistas e suas contribuições faz com que haja uma distribuição desigual dos créditos aos pesquisadores, favorecendo os pesquisadores com maior reconhecimento. Os estudos bibliométricos revelam tendências e normas de atuação desse sistema a cientistas ganhadores de grandes prêmios internacionais como Prêmio Nobel e Medalha Fields. Diante desse arcabouço teórico, cabe analisar de que maneira o sistema de recompensas afeta jovens cientistas no início da carreira e quais as consequências destes para a carreira científica e profissional. O estudo tem como objeto os doutores premiados, em âmbito nacional, com o Prêmio Capes de Tese, outorgado pela agência de fomento Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) que desde 2006, premia anualmente as melhores teses de doutorado em 48 áreas de conhecimento, com bolsas de pós-doutorado em instituições de excelência no país e no exterior. A partir dos resultados foi possível verificar que o tema da tese premiada permanece atual, e que mesmo os contemplados que não utilizaram as bolsas de pós-doutorado se beneficiaram dos efeitos do reconhecimento do prêmio na comunidade científica. / The scientific awards and honors are part of the operating dynamics of scientific activity since the seventeenth century. The reward system of science reinforces this based on the motivation of scientists in search of recognition. However, the logic of this system from the stratification of scientists and their contributions means that there is an unequal distribution of credit for researchers, encouraging researchers with greater recognition. Bibliometric studies reveal trends and models of performance winners of major international awards such as the Nobel Prize and Fields Medal. Given this theoretical framework, we analyze how the reward system affects young scientists in their careers and their consequences for the scientific and professional career. The object of this study is the winning doctors, nationwide, with the Capes Thesis Award, awarded by the Brazilian Federal Agency for Support and Evaluation of Graduate Education (CAPES) that since 2006, offer annually awards to the best doctoral thesis in 48 areas of knowledge, with post-doctorate scholarships in institutions of excellence in the country and abroad. From the results we observed that the subject of the award-winning thesis remains current, and even contemplated that didn’t use the post-doctorate scholarships were benefited from the effects of the recognition of the award in the scientific community.
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Política de pós-graduação stricto sensu brasileira no tempo presente: corpo e cultura como objeto de pesquisa em educaçãoPires, Aparecida Carneiro January 2014 (has links)
Submitted by PPGE PPGE (pgedu@ufba.br) on 2015-06-15T15:28:44Z
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Cida Carneiro_Versão para CD.pdf: 938168 bytes, checksum: 2643a9859747be218cbe46cd2fc59b79 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Auxiliadora da Silva Lopes (silopes@ufba.br) on 2015-08-28T17:47:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1
Cida Carneiro_Versão para CD.pdf: 938168 bytes, checksum: 2643a9859747be218cbe46cd2fc59b79 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-28T17:47:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Cida Carneiro_Versão para CD.pdf: 938168 bytes, checksum: 2643a9859747be218cbe46cd2fc59b79 (MD5) / Esta pesquisa expõe as polêmicas e contradições da política de pós-graduação brasileira no tempo presente,
contemplada na linha de pesquisa: Educação, Cultura Corporal e Lazer. Propõe-se a desenvolver estudos
aprofundados acerca dos princípios e valores pautados em uma formação emancipatória, produzidos e
defendidos pela Pós-graduação stricto sensu em Educação, a partir dos direcionamentos da política de avaliação
e financiamento da Agência CAPES. Objetiva-se investigar os princípios de formação emancipatória que estão
sendo defendidos e definidos pela Pós-graduação stricto sensu em Educação a partir dos direcionamentos da
Agência de Política de Avaliação e Financiamento - CAPES em seu percurso histórico. Especificamente, objetiva-
se contextualizar o papel da Pós-graduação stricto sensu em Educação diante das reconfigurações socioeconômicas,
políticas e culturais do capitalismo no tempo presente; compreender a relação entre os critérios de produtividade e
avaliação exigidos pela CAPES na lógica cultural do corpo nos envolvidos na Pós-graduação stricto sensu Brasileira;
analisar os sentidos atribuídos para a Pós-graduação stricto sensu dos/as pesquisadores/as entrevistados/as. A metodologia
adotada nesse trabalho investigativo contemplará a pesquisa bibliográfica, histórica, documental e a pesquisa de campo.
As vozes de alguns dos pesquisadores envolvidos nesta história, como as de Bernadete Gatti, Osmar Fávero,
Marli André, Vera Candau e Robert Verhine e documentos produzidos por eles e elas e na literatura crítica a
temática, compuseram esta pesquisa. Para a análise dos dados, pautamo-nos em conceitos como intelectuais
orgânicos, corpo, cultura, hegemonia e contra-hegemonia, apoiados em Gramsci, em Marx, Silva e outros, numa
perspectiva dialógica. Entrecruzamos as falas com os registros documentais produzidos por este grupo,
destacando as marcas de sentido – o sentido investigado, ou seja, o debate atual das políticas educacionais na
pós-graduação stricto sensu; as polêmicas, paradoxos, ausências e emergências no processo de avaliação da pós-
graduação stricto sensu em Educação pela Capes. O debate sobre o corpo e a cultura na Pós-graduação stricto sensu
apontou a compreensão de um corpo instrumental, em detrimento da formação do sujeito histórico emancipado.
O que nos leva sugerir a necessidade de construção de elementos para uma contra-hegemonia e uma outra práxis
educacional na formação dos sujeitos da pós-graduação brasileira. / ABSTRACT
This research exposes the controversies and contradictions of Brazilian post-graduate policy at the present time,
contemplated in the line of research: Education, Body Culture and Leisure. It is proposed to develop in-depth
studies concerning about the principles, values guided by an emancipatory education, produced and defended by
the Post-graduate studies in Education from the directions of the evaluation and funding agency CAPES policy.
This study aims to investigate the principles of emancipatory education being defended and defined by the Postgraduate
studies in Education from the directions of policy and funding agency review - CAPES on his historic
caree. Specifically, the objective is to contextualize the role of post-graduate studies in Education on the
socioeconomic, political and cultural reconfigurations of capitalism at the present time; to understand the
relationship between productivity and evaluation criteria required by CAPES in the cultural logic of the body
involved in the Post-graduate studies Brazilian; to analyze the meanings attributed to post-graduate studies of
researchers interviewed. The methodology used in this research work will include bibliographical, historical,
documentary research and fieldwork. Voices of some of the researchers involved in this story, as Bernadette
Gatti, Osmar Favero, Marli Andrew, Robert Verhaine and Vera Candau and documents produced by them and in
the critical literature composed the theme of this research. For data analysis we based on concepts such as
organic intellectuals, body, culture, hegemony and against hegemony, supported by Gramsci, Marx, Silva, and
others in a dialogic perspective. We interwove interviewees with documentary records produced by this group,
highlighting the brands sense, the current debate on educational policies stricto sensu graduate programs, the
controversies, paradoxes, absences and emergencies in the process of evaluation of post-graduate studies in
Education from Capes. The debate about the body and culture in post-graduate studies pointed to an instrumental
understanding of the body, rather than the formation of the emancipated historical subject which leads us to
suggest the need for construction of elements of a counter-hegemony and other educational praxis in the
formation of the subject of Brazilian graduate.
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A internacionalização da educação superior no Brasil : um estudo de caso de alunos estrangeiros do Programa de Pós-Graduação em Antropologia Social/UFRGSFeijó, Rosemeri Nunes January 2013 (has links)
A presente dissertação analisa o Programa de Estudantes-Convênio de Pós-Graduação (PEC-PG), promovido pela CAPES e CNPq, por meio do estudo de alunos estrangeiros contemplados com esta modalidade de bolsa, tomando o Programa de Pós-Graduação em Antropologia Social (PPGAS) da Universidade Federal do Rio Grande do Sul como estudo de caso. Neste trabalho, contempla-se a perspectiva histórica do processo de internacionalização da educação superior e a influência do Protocolo de Bolonha no avanço da internacionalização no Brasil. Salienta-se que o PPGAS tem participado no processo de internacionalização desde o seu início. A investigação, baseada em 10 entrevistas, contempla o grau de relevância da formação científica na trajetória de vida dos alunos bolsistas beneficiados pelo PEC-PG. Parte-se da tomada de conhecimento do referido programa pelos bolsistas, suas motivações, experiências e aproveitamento acadêmico, assim como as implicações desta capacitação na sua inserção profissional e social, após a conclusão do curso nos países de origem, ou em sua permanência no Brasil. Os dados coletados indicam que os estudantes vêm em busca de formação em um programa de excelência e que essa expectativa se realiza: a experiência na Antropologia brasileira lhes trouxe novos aportes teóricos e metodológicos que não se faziam presentes na antropologia praticada em seus países de origem. Foram apontados alguns aspectos que poderiam facilitar a experiência de estudantes estrangeiros em Porto Alegre: orientação para entender a burocracia e as dinâmicas da Universidade, maior atenção e reconhecimento de suas experiências vividas no âmbito do PPGAS. Foram, também, apontadas dificuldades: o rigor do inverno e o preconceito racial na cidade de Porto Alegre. Entre alunos latino-americanos, há forte motivação de fixar residência e trabalhar no Brasil; entre os estudantes africanos, a busca por um ensino de qualidade faz parte de um projeto de vida motivado pelo desejo de retornar para promover o desenvolvimento de seu país. Estes egressos podem se tornar atores importantes nas parcerias entre instituições brasileiras e estrangeiras, com o potencial de ajudar na realização de acordos e eventos científicos, envolvendo a participação de pesquisadores de ambos os países. / This dissertation analyzes the PEC-PG, a scholarship program for graduate students) sponsered by CAPES (an agency of Brazil’s Ministry of Education) and CNPq (Brazil’s national science foundation), that targets foreign students. It takes the Graduate Program in Social Anthropology at the Federal University of Rio Grande do Sul (PPGAS-UFRGS) as a case study. In order to do that, the research started by presenting a historical perspective of the process of internationalization of higher education and the influence of the Bologna Protocol in accelerating the internationalization of higher education in Brazil. The PPGAS-UFRGS has been involved in the process of internationalization since its beginning. This research, based on 13 interviews, shows the impact of scientific training for the life trajectory of students who got scholarships from PEC-PG. The interviews covered a number of issues, starting with how the students learned about the fellowship program, their motivations, experiences and academic achievements, as well as the implications of this training to their professional and social integration back in their countries of origin, upon completion of the course, or their stay in Brazil. The data collected indicate that students were seeking education in a program of academic excellence and, in this perspective, they have their expectations fulfilled: the contact with Brazilian Anthropology provided them with new theoretical and methodological approaches which did not exist in the anthropology practisced in their countries of origin. Students also pointed out aspects that could facilitate their experience as foreign students in Porto Alegre. Among others things, they report difficulty in understanding the dynamics of the University and a lack of recognition of their own experiences at the PPGAS. Other challenges were also pointed out, such as the rigors of winter and racial prejudice in the city of Porto Alegre. The research also shows that among students coming from Latin American countries, there is strong motivation to settle and work in Brazil, while among African students the quest for quality education is part of a larger project motivated by a desire to return and foster the development of their countries. These graduates may become important actors in partnerships between Brazilian and foreign institutions, with the potential to help in the accomplishment of scientific agreements and events, involving the participation of researchers from both countries.
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O programa Prêmio Capes de Tese : avaliação dos resultados pós-premiaçãoCarvalho, Renato Barros de January 2014 (has links)
As premiações e honrarias a cientistas fazem parte da dinâmica de funcionamento da atividade científica desde o século XVII. O sistema de recompensas da ciência reforça essa prática baseada na motivação dos cientistas em busca de reconhecimento. No entanto, a lógica desse sistema a partir da estratificação dos cientistas e suas contribuições faz com que haja uma distribuição desigual dos créditos aos pesquisadores, favorecendo os pesquisadores com maior reconhecimento. Os estudos bibliométricos revelam tendências e normas de atuação desse sistema a cientistas ganhadores de grandes prêmios internacionais como Prêmio Nobel e Medalha Fields. Diante desse arcabouço teórico, cabe analisar de que maneira o sistema de recompensas afeta jovens cientistas no início da carreira e quais as consequências destes para a carreira científica e profissional. O estudo tem como objeto os doutores premiados, em âmbito nacional, com o Prêmio Capes de Tese, outorgado pela agência de fomento Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) que desde 2006, premia anualmente as melhores teses de doutorado em 48 áreas de conhecimento, com bolsas de pós-doutorado em instituições de excelência no país e no exterior. A partir dos resultados foi possível verificar que o tema da tese premiada permanece atual, e que mesmo os contemplados que não utilizaram as bolsas de pós-doutorado se beneficiaram dos efeitos do reconhecimento do prêmio na comunidade científica. / The scientific awards and honors are part of the operating dynamics of scientific activity since the seventeenth century. The reward system of science reinforces this based on the motivation of scientists in search of recognition. However, the logic of this system from the stratification of scientists and their contributions means that there is an unequal distribution of credit for researchers, encouraging researchers with greater recognition. Bibliometric studies reveal trends and models of performance winners of major international awards such as the Nobel Prize and Fields Medal. Given this theoretical framework, we analyze how the reward system affects young scientists in their careers and their consequences for the scientific and professional career. The object of this study is the winning doctors, nationwide, with the Capes Thesis Award, awarded by the Brazilian Federal Agency for Support and Evaluation of Graduate Education (CAPES) that since 2006, offer annually awards to the best doctoral thesis in 48 areas of knowledge, with post-doctorate scholarships in institutions of excellence in the country and abroad. From the results we observed that the subject of the award-winning thesis remains current, and even contemplated that didn’t use the post-doctorate scholarships were benefited from the effects of the recognition of the award in the scientific community.
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O programa Prêmio Capes de Tese : avaliação dos resultados pós-premiaçãoCarvalho, Renato Barros de January 2014 (has links)
As premiações e honrarias a cientistas fazem parte da dinâmica de funcionamento da atividade científica desde o século XVII. O sistema de recompensas da ciência reforça essa prática baseada na motivação dos cientistas em busca de reconhecimento. No entanto, a lógica desse sistema a partir da estratificação dos cientistas e suas contribuições faz com que haja uma distribuição desigual dos créditos aos pesquisadores, favorecendo os pesquisadores com maior reconhecimento. Os estudos bibliométricos revelam tendências e normas de atuação desse sistema a cientistas ganhadores de grandes prêmios internacionais como Prêmio Nobel e Medalha Fields. Diante desse arcabouço teórico, cabe analisar de que maneira o sistema de recompensas afeta jovens cientistas no início da carreira e quais as consequências destes para a carreira científica e profissional. O estudo tem como objeto os doutores premiados, em âmbito nacional, com o Prêmio Capes de Tese, outorgado pela agência de fomento Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) que desde 2006, premia anualmente as melhores teses de doutorado em 48 áreas de conhecimento, com bolsas de pós-doutorado em instituições de excelência no país e no exterior. A partir dos resultados foi possível verificar que o tema da tese premiada permanece atual, e que mesmo os contemplados que não utilizaram as bolsas de pós-doutorado se beneficiaram dos efeitos do reconhecimento do prêmio na comunidade científica. / The scientific awards and honors are part of the operating dynamics of scientific activity since the seventeenth century. The reward system of science reinforces this based on the motivation of scientists in search of recognition. However, the logic of this system from the stratification of scientists and their contributions means that there is an unequal distribution of credit for researchers, encouraging researchers with greater recognition. Bibliometric studies reveal trends and models of performance winners of major international awards such as the Nobel Prize and Fields Medal. Given this theoretical framework, we analyze how the reward system affects young scientists in their careers and their consequences for the scientific and professional career. The object of this study is the winning doctors, nationwide, with the Capes Thesis Award, awarded by the Brazilian Federal Agency for Support and Evaluation of Graduate Education (CAPES) that since 2006, offer annually awards to the best doctoral thesis in 48 areas of knowledge, with post-doctorate scholarships in institutions of excellence in the country and abroad. From the results we observed that the subject of the award-winning thesis remains current, and even contemplated that didn’t use the post-doctorate scholarships were benefited from the effects of the recognition of the award in the scientific community.
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