As espécies de capim-colchão (Digitaria spp.) estão entre as principais plantas daninhas que infestam os canaviais brasileiros, porém diferenciação visual dessas espécies é difícil e as diferenças fisiológicas influenciam diretamente na tolerância diferencial a herbicidas inibidores do fotossistema II (FSII), como diuron e tebutiuron e inibidores da acetolactato sintase (ALS), como imazapic e imazapir. A D. nuda é considerada tolerante a esses herbicidas, porém a base fisiológica dessa tolerância ainda não está esclarecida, necessitando de maiores informações a respeito dessa espécie. Sendo assim, os objetivos desse trabalho foram: (i) confirmar a tolerância apresentada por D. nuda e verificar a existência de sinergismo entre herbicidas inibidores do FSII; (ii) caracterizar o crescimento de D. nuda (tolerante) e D. ciliaris (suscetível); (iii) verificar se a absorção radicular e/ou translocação diferencial de diuron são mecanismos que conferem tolerância a D. nuda; (iv) identificar e caracterizar se genes que codificam a citocromo P450 monooxigenase (P450) e glutationa-Stransferase (GST), por meio de PCR em tempo real, atuam na tolerância apresentada por D. nuda ao diuron. A tolerância diferencial da D. nuda foi confirmada em relação a espécie D. ciliaris, através de curvas de dose-reposta para a formulação contendo os herbicidas diuron+hexazinona, no entanto para a ametrina aplicada isoladamente não houve diferenciação de suscetibilidade entre as duas espécies. A associação de ametrina com a formulação contendo os herbicidas diuron+hexazinona provocou efeito sinérgico para o controle de D. nuda, porém para D. ciliaris o efeito foi antagônico. O crescimento das espécies de capim-colchão foi comparado por meio de análise de crescimento, sendo que D. ciliaris apresentou maior crescimento, em condições onde não houve limitações de nutrientes e disponibilidade hídrica, em relação a D. nuda, principalmente por apresentar maior área foliar, numero de folhas e acúmulo de matéria seca por planta. A absorção radicular e translocação de diuron foram quantificadas a partir da aplicação de uma mistura de diuron comercial com diuron (14C) ao solo. As plantas de D. nuda absorveram quantitativamente menos diuron em relação a D. ciliaris, principalmente 3 e 6 horas após a aplicação. A translocação de diuron não diferiu entre as duas espécies avaliadas. Por fim a identificação e caracterização dos genes de P450 e GST revelaram que existe envolvimento da citocromo P450 monooxigenase na metabolização do diuron em D. nuda, fazendo com que se torne mais tolerante a essa molécula e que parte desse fenômeno é explicado pela expressão do CYP81A6. Além disso, a GST é pouco efetiva na desintoxicação de herbicidas do grupo químico das feniluréias e triazinas. / The crabgrass species (Digitaria spp.) are among the main weeds infesting sugarcane fields in Brazil. However the visual differentiation of these weeds is difficult, and the physiological differences affects directly the differential tolerance to herbicides that inhibit the photosystem II (PSII), as diuron and tebuthiuron, and inhibit the acetolactate enzyme (ALS), such as imazapic and imazapyr. D. nuda is considered more tolerant to these herbicides, but the physiological basis of this tolerance is still unclear and need further information about this specie. Therefore, the objectives of this study were: (i) confirm the tolerance shown by D. nuda and verify the existence of synergism between herbicides inhibitors of PSII; (ii) to characterize the growth of D. nuda (tolerant) and D. ciliaris (susceptible); (iii) to verify if the differential root uptake and/or translocation of diuron are mechanisms that confer tolerance to D. nuda; (iv) to identify and characterize if genes coding for cytochrome P450 monooxygenase (P450) and glutathione S-transferase (GST), using real-time PCR, act in the tolerance by D. nuda to diuron. The differential tolerance of D. nuda was confirmed in relation to D. ciliaris, with dose-response curves for diuron + hexazinone, however for the ametryn, applied alone, there was no differential susceptibility of the two species. The combination of ametryn to formulated mixture of diuron + hexazinone resulted in synergistic effect for the control of D. nuda, but for D. ciliaris the effect was antagonistic by the methods evaluated. The growth of crabgrass species was compared by growth analysis, and D. ciliaris presented the highest growth, in conditions of no limitations of nutrients and water availability, when compared to D. nuda, mainly due to its greater leaf area, number of leaves and dry matter accumulation per plant. The root uptake and translocation of diuron were quantified from the application of a mixture of commercial diuron and diuron (14C) to soil. Plants of D. nuda absorbed quantitatively less diuron compared to D. ciliaris, especially 3 and 6 hours after application. The translocation of diuron did not differ between the two species evaluated. Finally, the identification and characterization of P450 and GST genes revealed that there is cytochrome P450 monooxygenase involved in the metabolism of diuron in D. nuda, causing them to become more tolerant to this molecule and that part of this phenomenon is explained by the expression of CYP81A6. In addition, the GST is less effective in the detoxification of fenilureas and triazines herbicides.

Master of Science / Department of Biomedical Science / H. Morgan Scott / The modern phenomenon of increasing prevalence of antibiotic resistance in clinically relevant bacteria threatens humanity’s ability to use antibiotics to treat infection in both humans and animals. Despite the marked complexity of bacterial evolution, there is tremendous importance in unfolding the process by which antibiotic resistance genes emerge, disperse, and persist in the natural world. This thesis investigates certain aspects of this process in two experimental studies that differ primarily by scale but also by methodology. The first study examined the long-term annual prevalence of ceftiofur and tetracycline resistance in Canadian beef cattle from 2002 to 2011 at both phenotypic and genotypic levels. Ceftiofur was present at a very low prevalence (<4%) that did not statistically increase over the decade (p<0.05). Relative proportions of tetracycline genes tet(A), tet(B), and tet(C) also did not significantly change over the observation period. However, it was surprising that almost 20% of isolates recovered from nonselective agar harbored tet(C) given that current literature generally indicates that tet(C) is significantly less prevalent than tet(A) or tet(B). The usage of historical samples in addition to parallel selective plating using agar supplemented with antibiotics provided insight into systemic bias present in common microbial approaches. Long-term sample freezing significantly diminished the recoverability of E. coli over time. Additionally the usage of selective MacConkey agar containing tetracycline biased the proportions of tetracycline genes to over-represent the tet(B) gene in commensal E. coli compared to nonselective MacConkey agar. The second study attempted to explain the short-term selection effects of antibiotic treatment on the overall ecological fitness of commensal E. coli using bacterial growth parameters estimated from spectrophotometric growth curves as a simple surrogate of general fitness. Treating cattle with either tetracycline or ceftiofur was found to not only select in favor of tetracycline resistant bacteria, but also increased the overall fitness among the tetracycline resistant population. However, growth curves were unable able to explain why transiently selected resistant bacteria were eventually replaced by susceptible bacteria once the selection pressure was removed.

Studies on relations between number of sessions and effect of psychotherapy have usually assumed a constant rate of change across different lengths of therapy, explained by a model called the dose-effect model. This assumption has been challenged by the good-enough level (GEL) model, which makes the prediction that the rate of change will vary as a function of total number of sessions. This study aimed to compare these models. We also assessed the relationship between reliable and clinically significant change (RCSI) and total dose of therapy. Participants were drawn from two datasets in the Swedish primary care (n = 640) and adult psychiatric care (n = 249). The participants made session-wise ratings on the Clinical Outcomes in Routine Evaluation-Outcome Measure (CORE-OM). Multilevel analyses indicated a better fit using the GEL-model, with some reservations concerning RCSI and patterns of change. The results may indicate a general lawful relationship that may have implications for future research, as well as psychotherapy practice and policy making.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-11-06Bitstream added on 2014-06-13T20:54:13Z : No. of bitstreams: 1 ferreira_cb_me_jabo.pdf: 3799793 bytes, checksum: f1b3670130a5947eeee6d1e3151f9b69 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Fundecitrus / Dentro da comercialização de frutas, a citricultura é a mais importante. Representa para muitos países, dentre eles, os EUA e o Brasil, uma importante atividade econômica. Porém, esta atividade, vem sofrendo com inúmeras doenças e/ou pragas como a doença do Cancro Cítrico Asiático causada pela bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (X. citri). Deste modo, com o objetivo do estudo do genoma funcional da X. citri, um banco de mutantes deste microorganismo foi obtido por meio de inserção aleatória do transposon Tn5, nas quais foram selecionados 53 mutantes que apresentaram, de forma superficial, alterações fenotípica em relação à X. citri selvagem. Para uma avaliação mais precisa, eles passaram por uma nova confirmação de suas alterações fenotípicas, onde foram inoculados em folhas de Citrus sinensis (Laranjeira pêra-Rio) e Citrus limonia (limoeiro cravo) e monitorados durante 16 dias, e aqueles que apresentaram as maiores alterações em relação à selvagem, tiveram confeccionadas para si curvas de crescimento in vivo. Conseguiu-se, desta forma, avaliar quantitativamente o processo patogênico, relacionar seus sintomas com dados numéricos e ainda descobrir detalhes até então não conhecidos. O mapeamento, dos respectivos loci mutados, foi realizado por seqüenciamento de DNA a partir do transposon, demonstrando que a metodologia empregada para a obtenção dos mutantes foi eficiente, conseguiu também revelar diversas proteína ainda hipotéticas, e outras, até então, não considerados como implicados no processo patogênico, como, uma Integrase, Fe-S oxidoredutase, Helicase IV, Receptor Dependente de Ton-B, entre outros / Concerning the commercialization of fruits, the citrus production is the most important. It represents for many countries, amongst them, U.S.A. and Brazil, an important economic activity. However, this activity has been suffering with many illnesses and/or plagues as the illness from the Asiatic citrus canker caused by the Xanthomonas citri subsp. citri bacterium (X. citri). In this way, from a bank of mutants of X. citri, gotten by means of random insertion of commercial one derived from transposon Tn5, had been selected 53 mutants that had presented, of superficial form, some type of phenotype alteration in relation to the wild X. citri. To a more necessary evaluation, each one of them passed for a new confirmation of its phenotype alterations, where they had been inoculated in leafs of Citrus sinensis ('Pera' sweet orange) and Citrus limonia ('Rangpur' lime) and monitored during 16 days, and those that had presented the biggest alterations in relation to the savage, had confectioned for itself in planta growth curves. We obtain, in such a way, to evaluate quantitatively the pathogenic process, to relate its symptoms with numerical data and still to discover not known details until then. The mapping of respective locus mutated was carried through by sequencing of DNA from transposon, demonstrating that the methodology used for the attainment of the mutants was efficient and still to disclose diverse genes still hypothetical, and others, until then, not considered as implied in the pathogenic process, as, Integrase, Fe-S oxidoredutase, Helicase IV, TonB-dependent receptor, among others

Submitted by Verena Bastos (verena@uefs.br) on 2015-10-29T13:01:23Z No. of bitstreams: 1 JOSEANE BRAND?O PIRES SOARES - DISSERTA??O.pdf: 10148513 bytes, checksum: 4aced6aaf4e996e4bc7f0a25bf31c9df (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-29T13:01:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JOSEANE BRAND?O PIRES SOARES - DISSERTA??O.pdf: 10148513 bytes, checksum: 4aced6aaf4e996e4bc7f0a25bf31c9df (MD5) Previous issue date: 2013-02-27 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado de S?o Paulo - FAPESP / The aim of this work was to study the phenomenon of facilitation in the establishment and development of populations of Lemna aequinoctialis Welw .. through the computer model in NetLogo. For both crops were carried out ex situ to establish parameters and variables to be used in developing the model, and study the phenomenon of facilitation between individuals. With the computational model, we sought to test the ideal inoculum for this facilitation in non-axenic. The experiments were performed in pond water and autoclaved without autoclaving in solution Pirson & Siedel, and various concentrations of citrate Lead. Each week to count the number of individuals sprouted. The results were organized in spreadsheet and produced curves were adjusted in the regression model. A comparison of the results was evaluated from the t test with a confidence level of 5%. The results showed that the cultivation lead promotes increased growth rate of Lemna aequinoctialis Welw. That an individual can stay alive up to 70 days in medium without resetting, and that there is facilitation between individuals of the same species for their development in contaminated environments, so there is a minimum amount by which the colonies are established. The computational model describes the behavior of Lemna aequinoctialis Welw. a simulated environment with and without contamination by microorganisms. The hypothesis of facilitation was studied and showed that a single frond of Lemna in non-axenic not developed, two individuals can develop, and the minimum to ensure the establishment and growth is four individuals. / O objetivo geral deste trabalho foi estudar o fen?meno da facilita??o no estabelecimento e desenvolvimento de popula??es de Lemna aequinoctialis Welw.. atrav?s do modelo computacional em NetLogo. Para tanto foram realizados cultivos ex situ para estabelecer par?metros e vari?veis para serem utilizados na elabora??o do modelo, e estudar o fen?meno da facilita??o entre os indiv?duos. Com o modelo computacional, buscou-se testar o in?culo ideal para esta facilita??o em ambientes n?o-ax?nicos. Os experimentos foram realizados em ?gua da lagoa autoclavada e sem autoclavar, em solu??o de Pirson & Siedel, e em v?rias concentra??es de Citrato de Chumbo. Em cada semana foi contado o n?mero de indiv?duos brotados. Os resultados foram organizados em planilha eletr?nica e foram produzidas curvas ajustadas segundo modelo de regress?o. A compara??o entre os resultados foi avaliada a partir do teste t com n?vel de confian?a de 5%. Os resultados do cultivo mostraram que o chumbo favorece o aumento da taxa de crescimento de Lemna aequinoctialis Welw., que um indiv?duo pode permanecer vivo at? 70 dias num meio sem a reposi??o , e que existe facilita??o entre os indiv?duos da mesma esp?cies para o seu desenvolvimento em ambientes contaminados, existindo assim um valor m?nimo pelo qual as col?nias se estabelecem. O modelo computacional descreve o comportamento da Lemna aequinoctialis Welw. num ambiente simulado com e sem a contamina??o por microorganismo. A hip?tese de facilita??o foi estudada e mostrou que um ?nico indiv?duo em ambiente n?o-ax?nico n?o se desenvolve, dois indiv?duos podem se desenvolver, e o valor m?nimo para se garantir o estabelecimento e crescimento ? quatro indiv?duos.

Large-scale deployment of low-carbon energy technologies is important for counteracting anthropogenic climate change and achieving universal energy access. This thesis explores potential growth rates of technologies necessary to reach a more sustainable global energy system, the material and energy flows required to commission these technologies, and potential future availability of the required resources. These issues are investigated in five papers. Potential future growth rates of wind energy and solar photovoltaics, and the associated material requirements are explored, taking the expected service life of these technologies into account. Methodology for assessing net energy return and natural resource use for wind energy systems are analyzed. Potential future availability of lithium and phosphate rock are also investigated. Estimates of energy and materials required for technologies such as wind energy and photovoltaics vary, and depend on the assumptions made and methods used. Still, it is clear that commissioning of low-carbon technologies on the scale required to reach and sustain a low-carbon energy system in coming decades requires significant quantities of both bulk materials and scarcer resources. For some technologies, such as thin film solar cells and electric vehicles with lithium-ion batteries, availability of materials could become an issue for potential growth rates. Future phosphate rock production could become highly dependent on few countries, and potential political, social and environmental aspects of this should be investigated in more detail. Material and energy flows should be considered when analyzing growth rates of low-carbon technologies. Their estimated service life can indicate sustainable growth rates of technologies, as well as when materials are available for end-of-life recycling. Resource constrained growth curve models can be used to explore future production of natural resources. A higher disaggregation of these models can enable more detailed analysis of potential constraints. This thesis contributes to the discussion on how to create a more sustainable global energy system, but the methods to assess current and future energy and material flows, and availability of natural resources, should be further developed in the future.

Em um contexto de analise de dados de sobrevivência univariados ou multivariados, dados de tempos de falha caracterizam-se pela possibilidade de poderem ser censurados. Embora comum na pratica, a censura impede o uso de alguns procedimentos estatisticos covencionais o que vem motivando, em especial apos a publicacao do artigo de Cox (1972), o desenvolvimento de metodos estatisticos nessa area. Uma linha de estudo recente e a de que, em algumas situacoes, a variavel resposta esteja sendo inuenciada por variaveis latentes, variaveis estas que sao usadas, em um sentido estatistico, para descreverem efeitos geneticos ou ambientais compartilhados pelos indivduos ou, ainda, covariaveis nao consideradas no estudo. Nesse trabalho, enfase e dada aos modelos de sobrevivencia que consideram tempos de falha multivariados e variaveis latentes. Esses tempos aparecem quando, por exemplo, cada individuo em estudo esta sujeito a diversos eventos ou, quando existe um agrupamento natural ou artificial o qual induz dependencia entre os tempos dos individuos do mesmo grupo. Modelos com variaveis latentes em que tais tempos de falha ocorrem em intervalos de tempo, ou seja, em um contexto de censura intervalar sao especialmente considerados nesse trabalho. O modelo de fragilidade gama para dados de sobrevivencia com censura intervalar e proposto, nesse trabalho, como um criterio para a selecao de bovinos. Como uma alternativa para esta selecao, o modelo de curvas de crescimento com efeitos aleatorios e tambem considerado. Para a estimacao dos parametros envolvidos em ambos os modelos propostos, programas computacionais sao apresentados. Uma abordagem Bayesiana e considerada no processo de estimação sendo, o metodo de Markov chain Monte Carlo (MCMC) utilizado e as distribuicoes a posteriori obtidas, usando-se o amostrador de Gibbs. O modelo de fragilidade gama com censura intervalar e o de curvas de crescimento com efeitos aleatorios sao comparados por meio de um estudo de simulação. Para ilustrar ambos os modelos propostos, estudos com bovinos das racas Nelore e Canchim são utilizados. / In a context of univariate or multivariate survival data analysis, failure times data are characterized by the possibility to be censored. Although common in practice, censoring precludes the use of some conventional statistical procedures and it has been motivating, specially after the publication of the Cox's paper (1972), the development of statistical methods in this area. A recent topic of study is concerned with some situations where the response variable is in uenced by latent variables which are used in a statistical sense to describe genetic or environmental efects shared by individuals or also covariates not considered in the study. In this work emphasis is given to survival models which consider multivariate failure times and latent variables. Such times occur when, for instance, each individual under study is exposed to several events or when there is a natural or artificial clustering that causes dependence among times of those individuals at the same cluster. Models with latent variables where such failure times lie in intervals of time, i.e. in an interval censored context are specially considered in this work. The gamma frailty interval censored survival model is proposed in this work as a selection criterion for cattle. As an alternative selection criterion the growth curves model with random efects is also considered. To estimate the involved parameters in both proposed models, computational programs are presented. A Bayesian approach is considered in the estimation process so that the Markov chain Monte Carlo (MCMC) method is used and the posterior distributions are obtained using Gibbs sampling. The gamma frailty interval-censored survival model and the growth curves model with random efects are compared using a simulation study. To illustrate both proposed models studies with Nelore and Canchim cattle are used.

Introdução: A curva de crescimento é um modelo empírico da evolução de uma quantidade ao longo do tempo. As curvas de crescimento são utilizadas em muitas disciplinas , em particular no domínio da estatística, onde há uma grande literatura sobre o assunto relacionado a modelos não lineares. Método:No desenvolvimento dessa dissertação de mestrado, foi realizado um estudo baseado em dados de crescimento nas áreas biológica e médica para comparar os dois tipos de inferência (Clássica e Bayesiana), na busca de melhores estimativas e resultados para modelos de regressão não lineares, especialmente considerando alguns modelos de crescimento introduzidos na literatura. No método Bayesiano para a modelagem não linear assumimos erros normais uma suposição usual e também distribuições estáveis para a variável resposta. Estudamos também alguns aspectos de robustez dos modelos de regressão não linear para a presença de outliers ou observações discordantes considerando o uso de distribuições estáveis para a resposta no lugar da suposição de normalidade habitual. Resultados e Conclusões: Análise dos dois exemplos pode-se observar melhores ajustes quando utilizada o método Bayesiano de ajustes de modelos não lineares de curvas de crescimento. É bem sabido que, em geral, não há nenhuma forma fechada para a função densidade de probabilidade de distribuições estáveis. No entanto, sob uma abordagem Bayesiana, a utilização de uma variável aleatória latente ou auxiliar proporciona uma simplificação para obter qualquer distribuição a posteriori quando relacionado com distribuições estáveis. Esses resultados poderiam ser de grande interesse para pesquisadores e profissionais, ao lidar com dados não Gauss. Para demonstrar a utilidade dos aspectos computacionais, a metodologia é aplicada a um exemplo relacionado com as curvas de crescimento intra-uterino para prematuros. Resumos a posteriori de interesse são obtidos utilizando métodos MCMC (Markov Chain Monte Carlo) e o software OpenBugs. / Introduction: The growth curve is an empirical model of the evolution of a quantity over time. Growth curves are used in many disciplines, particularly in the field of statistics, where there is a large literature on the subject related to nonlinear models. Method: In the development of this dissertation, a study based on data growth in biological areas and medical was conducted to compare two types of inferences (Classical and Bayesian), in search of better estimates and results for nonlinear regression models, especially considering some growth models introduced in the literature. The Bayesian method for nonlinear modeling assume normal errors an usual assumption and also stable distributions for the response variable. We also study some aspects of robustness of nonlinear regression models for the presence of outliers or discordant observations regarding the use of stable distributions to the response in place of the usual assumption of normality. Results and Conclusions: In the analysis of two examples it can be seen best results using Bayesian methodology for non linear models of growth curves. It is well known that, in general, there is no closed form for the probability density function of stable distributions. However, under a Bayesian approach, the use of a latent random variable or auxiliary variable provides a simplification to get every conditional posterior related to stable distributions. These results could be of great interest to researchers and practitioners when dealing with non-Gaussian data. To demonstrate the utility of the computational aspects, the methodology is also applied to an example related to intrauterine growth curves for premature infants. Posterior summaries of interest are obtained using MCMC methods (MCMC) and the OpenBugs software.

Introdução: A curva de crescimento é um modelo empírico da evolução de uma quantidade ao longo do tempo. As curvas de crescimento são utilizadas em muitas disciplinas , em particular no domínio da estatística, onde há uma grande literatura sobre o assunto relacionado a modelos não lineares. Método:No desenvolvimento dessa dissertação de mestrado, foi realizado um estudo baseado em dados de crescimento nas áreas biológica e médica para comparar os dois tipos de inferência (Clássica e Bayesiana), na busca de melhores estimativas e resultados para modelos de regressão não lineares, especialmente considerando alguns modelos de crescimento introduzidos na literatura. No método Bayesiano para a modelagem não linear assumimos erros normais uma suposição usual e também distribuições estáveis para a variável resposta. Estudamos também alguns aspectos de robustez dos modelos de regressão não linear para a presença de outliers ou observações discordantes considerando o uso de distribuições estáveis para a resposta no lugar da suposição de normalidade habitual. Resultados e Conclusões: Análise dos dois exemplos pode-se observar melhores ajustes quando utilizada o método Bayesiano de ajustes de modelos não lineares de curvas de crescimento. É bem sabido que, em geral, não há nenhuma forma fechada para a função densidade de probabilidade de distribuições estáveis. No entanto, sob uma abordagem Bayesiana, a utilização de uma variável aleatória latente ou auxiliar proporciona uma simplificação para obter qualquer distribuição a posteriori quando relacionado com distribuições estáveis. Esses resultados poderiam ser de grande interesse para pesquisadores e profissionais, ao lidar com dados não Gauss. Para demonstrar a utilidade dos aspectos computacionais, a metodologia é aplicada a um exemplo relacionado com as curvas de crescimento intra-uterino para prematuros. Resumos a posteriori de interesse são obtidos utilizando métodos MCMC (Markov Chain Monte Carlo) e o software OpenBugs. / Introduction: The growth curve is an empirical model of the evolution of a quantity over time. Growth curves are used in many disciplines, particularly in the field of statistics, where there is a large literature on the subject related to nonlinear models. Method: In the development of this dissertation, a study based on data growth in biological areas and medical was conducted to compare two types of inferences (Classical and Bayesian), in search of better estimates and results for nonlinear regression models, especially considering some growth models introduced in the literature. The Bayesian method for nonlinear modeling assume normal errors an usual assumption and also stable distributions for the response variable. We also study some aspects of robustness of nonlinear regression models for the presence of outliers or discordant observations regarding the use of stable distributions to the response in place of the usual assumption of normality. Results and Conclusions: In the analysis of two examples it can be seen best results using Bayesian methodology for non linear models of growth curves. It is well known that, in general, there is no closed form for the probability density function of stable distributions. However, under a Bayesian approach, the use of a latent random variable or auxiliary variable provides a simplification to get every conditional posterior related to stable distributions. These results could be of great interest to researchers and practitioners when dealing with non-Gaussian data. To demonstrate the utility of the computational aspects, the methodology is also applied to an example related to intrauterine growth curves for premature infants. Posterior summaries of interest are obtained using MCMC methods (MCMC) and the OpenBugs software.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 834675 bytes, checksum: cbd61abff31c731b6961bd0ef022cffa (MD5) Previous issue date: 2012-02-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Studies that use hierarchical cluster analysis have a problem in determining the optimal number of groups due to lack of objective criteria. Researches involving the adjustment of nonlinear models to data on growth or survival, in which the main interest is to determine how many curves are needed to describe the behavior of the individuals analyzed, use this technique. Some researchers use indices BSS (Between-group Sum of Squares), SPRSQ (Semi-partial R-Squared), RMSSTD (Root Mean Square Standard Deviation), RS (R-Squared) and Mojena method, as a means of assistance in this decision. However, it is not known which one is the best choice to determine that value. The comparison of these statistics was the aim of this study. The entire methodology used the Ward s method to cluster the observations, the von Bertalanffy model to fit the curves, and a specific function, based on the law of cosines and the idea of the Modified Maximum Curvature Method, to calculate the number of groups indicated by the indices. In chapter 1, a real case study was developed. The data set had seven animal growth curves, forming three groups. After grouping the parameter estimates and the calculation of statistics, it was found that only the index SPRSQ pointed to the correct number of groups. Using a function to re-scale the axis of the indices according to the axis of the number of groups, to improve the results obtained, only RMSSTD did not indicate the expected value. Chapter 2 describes the use of simulation to find out which of the statistics mentioned had the highest percentage of accuracy in determining the optimal number of groups in two cases. In the first one, the observations came from a single generator curve and, in the other, the individuals belonged to three different populations. In the case of a single curve, the RS index pointed to the optimal number of groups in most cases. For the case in which there were three different populations, the Mojena method was the one that indicated the right number of groups more often. In these cases, the use of the function that re-scales the axes did not show efficiency to improve the percentage of correct indices. In general, the indices RS and SPRSQ were the most appropriate to assist in determining the optimal number of groups. / Estudos envolvendo análise de agrupamento hierárquico encontram um problema na hora de determinar o número ótimo de grupos, devido à falta de critérios objetivos. Pesquisas que envolvem o ajuste de modelos não-lineares a dados de crescimento ou de sobrevivência, cujo interesse principal é saber quantas curvas são necessárias para descrever o comportamento dos indivíduos analisados, utilizam dessa técnica. Como forma de auxiliar essa decisão, alguns pesquisadores recorrem aos índices BSS (Between-group Sum of Squares), SPRSQ (Semi-partial R-Squared), RMSSTD (Root Mean Square Standard Deviation), RS (R-Squared) e ao método de Mojena. Entretanto, não se sabe qual deles é a melhor escolha para determinação desse valor. A comparação dessas estatísticas foi o objetivo desse trabalho. Toda a metodologia utilizou o método de Ward para fazer o agrupamento das observações, o modelo de von Bertalanffy para o ajuste das curvas, e uma função própria, baseada na lei dos cossenos e na ideia do Método da Máxima Curvatura Modificado, para calcular o número de grupos indicado pelos índices. No capítulo 1 foi feito o estudo de caso real. O conjunto de dados possuía sete curvas de crescimento animal, que formavam três grupos. Após o agrupamento das estimativas dos parâmetros e o cálculo das estatísticas, foi constatado que apenas o índice SPRSQ apontou o número de grupos correto. Usando uma função que re-escalona o eixo dos índices de acordo com o eixo do número de grupos, para melhorar os resultados obtidos, apenas o RMSSTD não indicou o valor esperado. O capítulo 2 descreve o uso da simulação para descobrir qual das estatísticas citadas possuía maior porcentagem de acerto quanto à determinação do número ótimo de grupos em dois cenários. No primeiro, as observações provinham de uma única curva geradora e no outro, os indivíduos pertenciam a três populações diferentes. Para o caso de uma única curva, o índice RS foi o que apontou o número ótimo de grupos na maioria dos casos. Para o cenário onde se possuía três populações diferentes, o método de Mojena foi o que acertou o número de grupos mais vezes. Nesses cenários, o uso da função que re-escalona os eixos não mostrou eficiência para melhorar a porcentagem de acertos dos índices. De modo geral, os índices RS e SPRSQ mostraram-se os mais indicados para auxiliar na determinação do número ótimo de grupos.