Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-06-01T16:43:16Z No. of bitstreams: 1 Cintia Maria Lopes Ferreira.pdf: 3870360 bytes, checksum: a5104bc0f1bab8950ee0485a7c45c453 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-01T16:43:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cintia Maria Lopes Ferreira.pdf: 3870360 bytes, checksum: a5104bc0f1bab8950ee0485a7c45c453 (MD5) Previous issue date: 2012-08-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The destruction of habitats is one of the most important factors leading to species extinction and loss of diversity, which is one of the most studied issues in biological and conservation in recent years. Since the human intervention on ecosystems is growing, resulting in fragmentation and loss of habitats, it is important to analyze the effects of these changes in spatial configuration have on ecological processes. In this work we aimed to study the dynamics of a model in which a predator and prey interact in a homogeneous environment with spatial structure when a proportion of the system is destroyed. We conducted this analysis using techniques from computer simulations as well as analytical tools. We obtained three different regimes depending on the values of model parameters in which there is coexistence of prey and predator, extinction of the predator with survival of prey and the extinction of prey leading to the extinction of the predator. We also studied the effects of destruction of a proportion of habitat on the system, and compared the results with those obtained for the case without fragmentation. We observed that increasing the number of destroyed sites leads to a reduction of the population of predators. We also observed that for a destruction of more than 15% of the sites, the regime of extinction of two species is no longer observed. / A destruição de habitats é um dos fatores mais relevantes que levam à extinção das espécies e perda da diversidade biológica e que é um dos assuntos de conservação mais estudados e debatidos nos últimos anos. Uma vez que a taxa de modificações humanas sobre os ecossistemas vem crescendo, resultando na fragmentação e perda de habitat, é importante analisar os efeitos que essas mudanças na configuração espacial têm nos processos ecológicos. Nesse trabalho tivemos como objetivo estudar a dinâmica de um modelo em que um predador e sua presa interagem em um ambiente homogêneo com estrutura espacial quando uma proporção do sistema é destruído. Realizamos essa análise através de técnicas de simulações computacionais e também ferramentas analíticas. Obtivemos três regimes diferentes dependentes dos valores dos parâmetros do modelo: coexistência de presa e predador, extinção do predador com sobrevivência da presa e extinção da presa levando a extinção do predador. Estudamos também os efeitos da destruição de uma proporção do habitat sobre o sistema, e comparamos os resultados com aqueles obtidos para o caso sem fragmentação. Observamos que o aumento na proporção de sítios destruídos leva a uma diminuição da população de predadores. Também observamos que para uma destruição de mais que 15% dos sítios, o regime de extinção das duas espécies não é mais observado.

The assessment of the geographic distribution of organisms in fragmented landscapes is one of the principal approaches of Conservation Biology, due to the extensive loss of natural habitats, both in overall quantity and quality (habitat fragmentation). In the Brazilian state of Sergipe, the surviving remnants of the forested habitats of the Atlantic Forest and Caatinga biomes support an important diversity of organisms. Given this, the objective of the present study was the quantification and characterization of the forest fragments of the lower Rio São Francisco basin (LSF) in Sergipe, with regard to the size, form, and distribution of fragments from the viewpoint of the conservation of local populations of titi monkeys (Callicebus sp.). This assessment was based on geoprocessing techniques, which were used to map the study area using the programs SPRING 5.1.4 and ENVI 4.3 for the analysis of satellite images in order to estimate the number of fragments within the study area and their characteristics (size, shape, perimeter). A total of 5453 fragments were identified in the LSF, with a total area of 73,850.70 hectares, approximately 10.9% of the 679,210.30 ha of the study area. The program Patch Analyst 4 defined mean fragment size as 13.54±72.14 ha, although only 560 fragments were larger than 20 hectares. The mean and weighted shapes indices (MSI = 2.55 and AWMSI = 3.68) indicated a tendency towards highly irregular fragment shapes (ideal value = 1 for both indices) characterized by a high proportion of edge habitat. Titi monkey populations were surveyed at 67 sites using the playback technique. A total of 15 populations were identified, 13 at new localities. These populations are concentrated in three sub-basins of the LSF those of the Betume, Capivara, and Curituba rivers. The total area occupied by titis was 2,660.10 ha, with occupied fragments varying in size from 2.63 to 1,069.0 hectares. By logistic regression analysis was performed as the program Spatial Analysis in Macroecology (SAM) was able to verify that the features of the landscape and the position does not determine the presence / absence of outriggers in these fragments (p = 0.4962 > 0.05). These findings are extremely important for the long-term planning of conservation and management strategies in the study area, not only for Callicebus, but the ecosystems as a whole. / A distribuição geográfica dos organismos em paisagens fragmentadas é uma das principais abordagens da biologia da conservação devido ao quadro de perda do hábitat em quantidade e qualidade. Em Sergipe, os remanescentes florestais dos biomas da Mata Atlântica e da Caatinga ainda abrigam uma importante diversidade biológica. Este trabalho teve o objetivo de quantificar e caracterizar os fragmentos de floresta da bacia do baixo rio São Francisco de Sergipe (BSF) avaliando-os quanto ao tamanho, a forma e distribuição sob o ponto de vista da conservação de populações de Callicebus ssp. Foram usadas técnicas de geoprocessamento para mapear a área de estudo onde se utilizou os programas SPRING 5.1.4 e ENVI 4.3 e imagens de satélite para estimar a quantidade de fragmentos existentes na região. Foi avaliada uma área de 679.210,30 ha, da qual 10,87% (73.850,70 ha) correspondem a 5.453 fragmentos. Os resultados obtidos através dos programas Patch Analyst 4 e Fragstats 3.3 sobre a forma e tamanho destes fragmentos indica uma média de tamanho para BSF de 13,54 (±72,14). Apenas 560 fragmentos possuem mais que 20,0 ha e estes possuem formas muito irregulares conforme indicam os resultados dos índices de forma médio (MSI = 2,55) e o índice ponderado pelo tamanho da área (AWMSI= 3,68) cujos valores ideais são iguais a 1,0. Os levantamentos de guigós foram realizados com a técnica do Playback para quantificar suas populações em 67 fragmentos. Ao todo 15 populações de guigós foram identificadas, das quais 13 são novas localidades de ocorrência. As populações concentram-se em três sub-bacias: Betume, Capivara e Curituba. A área dos fragmentos com presença de guigós totalizou 2.660,10 ha e variou de 2,63 ha a 1.069,0 ha. Através da análise de regressão logística realizada como o programa Spatial Analysis in Macroecology (SAM) foi possível verificar que as características da paisagem e a posição não determinam a presença/ausência de guigós nesses fragmentos (p: 0.4962>0,05). Essas informações são extremamente importantes no planejamento de conservação de longo prazo e como subsídios para estratégias de manejo na área de estudo não somente para Callicebus sp., mas para o ecossistema como um todo.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Marcos_2010_07-05-10.pdf: 927850 bytes, checksum: 13570c6d61616b1413fb06f5e981d383 (MD5) Previous issue date: 2010-03-31 / Habitat fragmentation is one of the main causes of environmental degradation and a great threat to world biodiversity. Fragmentation can disrupt pollination processes, affecting directly or indirectly pollinators and plants. In Brazil, the Cerrado Biome has lost most part of its vegetation cover in the last four decades, becoming a highly fragmented landscape with many small fragments, several medium-size and a few continuous areas of vegetation. Those remnants have high biological diversity with high level of endemism, but very little is known about the reproductive success of their species. Cardiopetalum calophyllum Schletdl. (Annonaceae) occurs in the Cerrado of Central Brazil, has dicogamy and is pollinated by small beetle called Lobiopa insularis. The reproductive success of C. calophyllum and the abundance of its pollinator were analyzed in fragment of different size from July 2009 to January 2010. The reproductive success was estimated using fruit and seed set rates. Flowers in anthesis were collected to quantify the pollinator abundance inside them. A positive correlation between reproductive success of C. calophyllum and the fragment size was found. However, no correlation was found between pollinator abundance and fragment size. The small fragments are more isolated than the larger ones. This can decrease the pollinator dispersion and gene flow among fragments, increasing inbreeding within population of small fragments. The abundance of Lobiopa insularis seems to be more related to its generalist habits than to the fragment size. In our study, the effect of fragment size and reproductive success of C. calophyllum was stronger in fragments smaller than 10 ha. However, fragment smaller than 20 ha also showed decrease in their productive success. / A fragmentação de habitats é considerada uma das mais poderosas forças de modificações dos ecossistemas, e em grande parte ocorre como resultado das atividades humanas. O Bioma Cerrado apesar de ser um dos hotspots com prioridades de conservação, nas últimas quatro décadas vem perdendo grande parte de sua cobertura vegetal, tornando-se uma paisagem altamente fragmentada com manchas de vegetação de diferentes tamanhos circundados, principalmente, por pastagem e agricultura. Cardiopetalum calophyllum Schletdl. é uma espécie vegetal presente no Cerrado, pertencente à família Annonaceae, polinizada por besouros pequenos, Lobiopa insularis. Com o objetivo de testar se fragmentos menores apresentam menor sucesso reprodutivo de C. calophyllum e menor abundância do polinizador, L. insularis, foram estudados indivíduos dessa espécie vegetal em 10 fragmentos de diferentes tamanhos no Cerrado do Brasil Central entre julho de 2009 a janeiro de 2010. O sucesso reprodutivo foi mensurado através da taxa de produção de frutos e sementes. Para quantificar a abundância do polinizador se fez necessário a coleta das flores, uma vez que o polinizador, L. insularis, se encontrava no interior da câmara floral. Houve uma relação positiva entre o sucesso reprodutivo de C. calophyllum e o tamanho do fragmento. Não houve relação entre a abundância do polinizador e o tamanho do fragmento. Os fragmentos pequenos estão mais distantes da vegetação natural mais próxima, e assim como os fragmentos maiores, possuem matriz do tipo pasto. Isso pode estar dificultando a dispersão do polinizador L. insularis e consequentemente impedindo o fluxo gênico de Cardiopetalum calophyllum entre os fragmentos, levando ao aumento da endogamia e causando falha na fertilização ou aborto de sementes durante o desenvolvimento nesses fragmentos. A abundância do polinizador Lobiopa insularis parece estar mais associada ao seu hábito generalista e a abundância de recursos, do que ao tamanho do fragmento. Nesse estudo o efeito do tamanho do fragmento no sucesso reprodutivo de C. calophyllum foi mais acentuado nos fragmentos < 10 ha. Entretanto, nos fragmentos com até 20 ha também houve redução no sucesso reprodutivo dessa espécie vegetal.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Marcos_2010_07-05-10.pdf: 927850 bytes, checksum: 13570c6d61616b1413fb06f5e981d383 (MD5) Previous issue date: 2010-03-31 / Habitat fragmentation is one of the main causes of environmental degradation and a great threat to world biodiversity. Fragmentation can disrupt pollination processes, affecting directly or indirectly pollinators and plants. In Brazil, the Cerrado Biome has lost most part of its vegetation cover in the last four decades, becoming a highly fragmented landscape with many small fragments, several medium-size and a few continuous areas of vegetation. Those remnants have high biological diversity with high level of endemism, but very little is known about the reproductive success of their species. Cardiopetalum calophyllum Schletdl. (Annonaceae) occurs in the Cerrado of Central Brazil, has dicogamy and is pollinated by small beetle called Lobiopa insularis. The reproductive success of C. calophyllum and the abundance of its pollinator were analyzed in fragment of different size from July 2009 to January 2010. The reproductive success was estimated using fruit and seed set rates. Flowers in anthesis were collected to quantify the pollinator abundance inside them. A positive correlation between reproductive success of C. calophyllum and the fragment size was found. However, no correlation was found between pollinator abundance and fragment size. The small fragments are more isolated than the larger ones. This can decrease the pollinator dispersion and gene flow among fragments, increasing inbreeding within population of small fragments. The abundance of Lobiopa insularis seems to be more related to its generalist habits than to the fragment size. In our study, the effect of fragment size and reproductive success of C. calophyllum was stronger in fragments smaller than 10 ha. However, fragment smaller than 20 ha also showed decrease in their productive success. / A fragmentação de habitats é considerada uma das mais poderosas forças de modificações dos ecossistemas, e em grande parte ocorre como resultado das atividades humanas. O Bioma Cerrado apesar de ser um dos hotspots com prioridades de conservação, nas últimas quatro décadas vem perdendo grande parte de sua cobertura vegetal, tornando-se uma paisagem altamente fragmentada com manchas de vegetação de diferentes tamanhos circundados, principalmente, por pastagem e agricultura. Cardiopetalum calophyllum Schletdl. é uma espécie vegetal presente no Cerrado, pertencente à família Annonaceae, polinizada por besouros pequenos, Lobiopa insularis. Com o objetivo de testar se fragmentos menores apresentam menor sucesso reprodutivo de C. calophyllum e menor abundância do polinizador, L. insularis, foram estudados indivíduos dessa espécie vegetal em 10 fragmentos de diferentes tamanhos no Cerrado do Brasil Central entre julho de 2009 a janeiro de 2010. O sucesso reprodutivo foi mensurado através da taxa de produção de frutos e sementes. Para quantificar a abundância do polinizador se fez necessário a coleta das flores, uma vez que o polinizador, L. insularis, se encontrava no interior da câmara floral. Houve uma relação positiva entre o sucesso reprodutivo de C. calophyllum e o tamanho do fragmento. Não houve relação entre a abundância do polinizador e o tamanho do fragmento. Os fragmentos pequenos estão mais distantes da vegetação natural mais próxima, e assim como os fragmentos maiores, possuem matriz do tipo pasto. Isso pode estar dificultando a dispersão do polinizador L. insularis e consequentemente impedindo o fluxo gênico de Cardiopetalum calophyllum entre os fragmentos, levando ao aumento da endogamia e causando falha na fertilização ou aborto de sementes durante o desenvolvimento nesses fragmentos. A abundância do polinizador Lobiopa insularis parece estar mais associada ao seu hábito generalista e a abundância de recursos, do que ao tamanho do fragmento. Nesse estudo o efeito do tamanho do fragmento no sucesso reprodutivo de C. calophyllum foi mais acentuado nos fragmentos < 10 ha. Entretanto, nos fragmentos com até 20 ha também houve redução no sucesso reprodutivo dessa espécie vegetal.

Este estudo enfocou a importância do contexto de ambientes alterados do entorno para a distribuição de diferentes grupos de espécies de pequenos mamíferos não-voadores em paisagens fragmentadas de Mata Atlântica. Na primeira abordagem (capítulo 2), usando a distribuição de pequenos mamíferos em remanescentes florestais e nos quatro principais habitats alterados de uma paisagem de Mata Atlântica, investigamos (1) como o poder explanatório dos modelos que descrevem a distribuição das espécies em fragmentos florestais varia entre as variáveis da estrutura da paisagem que incorporam ou não a qualidade da matriz e (2) a importância da escala espacial para analisar a influência da estrutura da paisagem. Usamos amostragem padronizada nos remanescentes e habitats alterados para gerar dois índices de qualidade de habitat, correspondentes à abundância e à ocorrência de pequenos mamíferos. Para cada remanescente, calculamos a quantidade de habitat e a conectividade em diferentes escalas espaciais, considerando ou não a qualidade dos habitats ao redor. A incorporação da qualidade da matriz aumentou o poder explanatório dos modelos para todas as escalas espaciais para metade das espécies que ocorreram na matriz, mas apenas quando consideramos a distância entre as manchas de habitat (conectividade). Os resultados indicam a importância da matriz para a dinâmica de paisagens fragmentadas e sugere que índices relativamente simples podem melhorar nosso entendimento sobre a distribuição das espécies, e poderiam ser aplicados na modelagem, monitoramento e manejo de paisagens tropicais complexas. Na segunda abordagem (capítulo 3), testamos duas hipóteses relacionadas à importância do contexto da paisagem para a diversidade biológica encontrada em áreas agrícolas usando os pequenos mamíferos da Mata Atlântica como modelo: (1) que o contexto em que cultivos agrícolas estão inseridos, em particular a quantidade de florestas remanescentes, determina a assembléia de pequenos mamíferos encontrada nestas áreas produtivas; (2) que essas respostas ao contexto são escala-dependentes, sendo observadas em escalas espaciais mais amplas. Para tanto, amostramos 36 sítios em áreas agrícolas em duas paisagens fragmentadas de Mata Atlântica com diferentes proporções de florestas nativas remanescentes, os quais foram selecionados de forma a abranger ampla variação na quantidade e agregação de áreas abertas no entorno imediato. Construímos e comparamos 12 modelos candidatos que diferem quanto à contribuição dos efeitos do contexto em escala espacial ampla e em escala local, incluindo todas as combinações possíveis entre essas variáveis, a interação das variáveis medidas em diferentes escalas, e um modelo nulo. De acordo com as expectativas iniciais, as espécies restritas a biomas florestais foram mais comuns e bem distribuídas em áreas agrícolas circundadas por maiores quantidades de floresta em escala ampla. No entanto, as espécies invasoras e não-restritas a biomas florestais dominaram as áreas agrícolas das duas paisagens estudadas, independentemente da quantidade de floresta remanescente em escala ampla, tendo respondido principalmente, mas de maneira oposta, ao contexto em escalas menores. Os resultados indicam que: (1) a resposta diferencial entre os grupos de espécies é condicionada por diferenças nos requerimentos de habitat entre eles; (2) a manutenção de espécies mais exigentes em áreas agrícolas depende de estratégias de manejo que considerem a escala da paisagem; (3) mesmo áreas de agricultura convencional podem ser importantes para a conectividade da paisagem para espécies exigentes, desde que inseridas em contexto de maior quantidade de matas remanescentes; (4) o controle das populações de espécies invasoras que podem atuar como reservatórios de patógenos causadores de doenças no homem e pestes na agricultura depende de manejo em escala local, pelo menos em paisagens onde as áreas agrícolas são predominantes. / This study focused on the importance of the context of altered habitats in the neighborhoods to the distribution of different groups of species of non-flying small mammals in fragmented landscapes of the Atlantic forest. In the first approach (chapter 2), using the distribution of small mammals in forest remnants and in the four main altered habitats in an Atlantic forest landscape, we investigated 1) how explanatory power of models describing species distribution in forest remnants varies between landscape structure variables that do or do not incorporate matrix quality and 2) the importance of spatial scale for analyzing the influence of landscape structure. We used standardized sampling in remnants and altered habitats to generate two indices of habitat quality, corresponding to the abundance and to the occurrence of small mammals. For each remnant, we calculated habitat quantity and connectivity in different spatial scales, considering or not the quality of surrounding habitats. The incorporation of matrix quality increased model explanatory power across all spatial scales for half the species that occurred in the matrix, but only when taking into account the distance between habitat patches (connectivity). Results indicate the importance of the matrix for the dynamics of fragmented landscapes and suggest that relatively simple indices can improve our understanding of species distribution, and could be applied in modeling, monitoring and managing complex tropical landscapes. In the second approach, (chapter 3), we aimed at testing two hypotheses related to the importance of landscape context to the biological diversity found in areas of agriculture using Atlantic forest small mammals as a model: (1) that the context in which the areas of agriculture are inserted, in particular the quantity of remnant forests, determines the assemblage of small mammals found in those productive areas; (2) that those responses to the context are scale-dependent, being observed at larger spatial scales. To accomplish that, we sampled 36 sites in areas of agriculture in two fragmented Atlantic forest landscapes presenting different proportions of native forest remnants, which were selected aiming at including the widest variation in quantity and aggregation of open anthropogenic areas in the local neighborhood. We built and compared 12 candidate models which differed in relation to the contribution of the effects of context at large and local spatial scales, including all possible combinations between these variables, the interaction of the variables measured at different scales, and the null model. According to our initial expectations, the species that are restricted to forest biomes were the commonest and best-distributed ones, in areas of agriculture surrounded by higher quantities of forest at the large scale. However, the invasive species and the species that are not restricted to forest biomes dominated the areas of agriculture in the two studied landscapes, independently from the quantity of remnant forest at the large scale, and they responded mainly, but in the opposite way, to the context at smaller scales. The results indicate that: (1) the differential response between the groups of species is conditioned by differences in habitat requirements between them; (2) the maintenance of more demanding species in agricultural lands depends on management strategies which consider the landscape scale; (3) even areas of conventional agriculture can be important to the connectivity of the landscape for the most demanding species, as far as they are inserted in a context of higher quantities of remnant forest; (4) the control of the populations of invasive species that can act as reservoirs of pathogens that cause disease in men, and that can be pests in agriculture, depends on the management at local scale, at least in landscapes where the areas of agriculture predominate.

Invasões biológicas são consideradas uma das maiores ameaças atuais à biodiversidade global. O cão doméstico é hoje o carnívoro mais abundante no mundo, e tem invadido áreas de vegetação nativa, podendo causar impactos negativos à fauna silvestre através da predação, competição e transmissão de doenças. A partir de dois extensos bancos de dados obtidos através de armadilhas fotográficas, esta dissertação pretende contribuir com o entendimento das causas e consequências da invasão por cães domésticos de remanescentes florestais e agroflorestas na Mata Atlântica. A dissertação está organizada em dois capítulos. No primeiro, usamos dados obtidos em duas paisagens rurais do Planalto Atlântico de São Paulo com diferentes proporções de florestas remanescentes, e (1) descrevemos o tipo de manejo e as características dos cães que visitam fragmentos florestais, (2) comparamos, entre estas paisagens, a frequência e horário de visitas e o tamanho de grupos de cães invasores assim como os fatores determinantes da intensidade de invasão, e (3) investigamos o impacto da intensidade de invasão sobre a distribuição de mamíferos silvestres de maior porte. No segundo capítulo, usamos dados obtidos em um mosaico agroflorestal do Sul da Bahia, e (4) verificamos se a conversão de florestas nativas em agroflorestas e a intensificação das agroflorestas favorecem a invasão por cães domésticos, e (5) se a invasão por estes animais está mais associada à presença humana nas agroflorestas do que nas florestas. Em conjunto, os resultados dessa dissertação sugerem que: (1) a intensidade da invasão por cães em paisagens antropizadas de Mata Atlântica é altíssima, tanto em termos do número de indivíduos e de visitas como em termos do número de sítios ocupados; (2) a invasão é favorecida pelo tipo de manejo dos animais, que são em grande parte criados soltos, e parece estar fortemente associada à presença do homem; (3) a intensidade de invasão afeta negativamente a distribuição de um maior número de espécies de mamíferos de maior porte do que a perda de 40% de floresta na paisagem; (4) características dos remanescentes florestais associadas à perda de habitat (quantidade e qualidade dos remanescentes) são mais importantes que a pressão de propágulo para determinar a intensidade da invasão; (5) a intensificação do manejo de agroflorestas acentua a invasão. Visto que a intensificação de agroflorestas e de outros sistemas agrícolas vem se acentuando globalmente e que, apesar da diminuição das taxas de desmatamento das florestas tropicais nos últimos anos, a maior parte das áreas remanescentes é constituída de vegetação degradada ou secundária, a quantidade de áreas susceptíveis à invasão e os danos causados por cães domésticos devem aumentar no futuro. / Biological invasions are considered one of the most important threats to global biodiversity. Domestic dogs, the most abundant carnivore in the world, are known to invade areas of native vegetation and impact wildlife through competition, predation and disease transmission. Drawing on two extensive dataset obtained through camera-trapping, this dissertation intends to contribute to the understanding of the causes and consequences of the invasion by domestic dogs of forests fragments and agroforests in the Atlantic Forest. The dissertation is organized into two chapters. In the first chapter, we use data from two rural landscapes of São Paulo Atlantic Plateau with different proportions of remaining forests, and (1) describe the management and the characteristics of dogs that visit forest fragments, (2) compare, between these landscapes, the frequency and time of visits, the size of groups of invading dogs, and the drivers of invasion intensity, and (3) investigate the impacts of invasion intensity on the distribution of native large mammals. In the second chapter, using data from an agroforestry mosaic in southern Bahia, we investigate (4) if the conversion of native forests into agroforests and agroforestry intensification favor the invasion by dogs, and (5) if invasion by these animals is more associated with human presence in agroforests than in forests. Our findings highlight that: (1) the intensity of the invasion by dogs in human-modified landscapes in the Atlantic Forest is extremely high, both in terms of the number of individuals and of visits and in terms of the number of occupied sites; (2) invasion is favored by the type of management, with dogs kept free, and seems to be strongly associated with the presence of humans; (3) invasion intensity negatively affects the distribution of a larger number of large mammals than the loss of 40% of forest in the landscape; (4) characteristics of forest fragments associated with habitat loss (quantity and quality of remnants) are more important than propagule pressure to determine the intensity of invasion; (5) management intensification in agroforests intensifies invasion. As intensification of agroforestry and other agricultural systems has increased globally and, despite the decrease in the rates of deforestation in recent years, most tropical forest remnants consist of degraded or secondary vegetation, the amount of areas susceptible to invasion and the damages caused by domestic dogs should increase in the future.

Comprendre l'organisation de la biodiversité, notamment la distribution et l'abondance des espèces, est une question centrale en écologie. De par son caractère dynamique et parce qu'elle est distribuée à tous les niveaux du vivant, la compréhension des mécanismes sous-jacents permettant sa création et son maintien inclue nécessairement une composante temporelle et spatiale et implique des processus écologiques et évolutifs. Les grottes sous-marines constituent un habitat tout indiqué pour les étudier, car leurs conditions environnementales particulières suggèrent des mécanismes de maintien de la biodiversité particulièrement actifs. De plus, leur caractère naturellement fragmenté permet une différenciation plus aisée des processus agissant à différentes échelles spatiales. Par leur abondance, tant en terme d'espèces que d'individus, les mysidacés cavernicoles en Méditerranée, représentent de ce fait un bon modèle d'étude de ces mécanismes. À l'échelle locale de la parcelle d'habitat, l'étude de l'écologie trophique des cinq espèces de mysidacés cavernicoles (Hemimysis margalefi, H. speluncola, H. lamornae mediterranea, Siriella gracilipes, Harmelinella mariannae) a permis de mettre en évidence l'importance des stratégies alimentaires dans leur maintien. En effet, ces espèces persistent et coexistent non seulement grâce à un partage classique et spatial des ressources et des sites de nourrissage, mais aussi parce que certains sites de nourrissage importants se trouvent à l'extérieur des grottes sous-marines. / Understanding processes of biodiversity creation and maintenance is a central question in ecology. Because biodiversity is dynamic and distributed across all levels of life, identifying underlying mechanisms necessarily takes into account temporal and spatial scales and involves ecological as well as evolutionary processes. Underwater caves are particularly appropriate to address such a question. Indeed, the harsh environmental conditions of this habitat suggest active mechanisms of biodiversity maintenance. In addition, the highly fragmented nature of this habitat facilitates the distinction between the spatial scales at which processes may operate. In the Mediterranean, the high diversity and abundance of cave-dwelling mysids may help identifying the underlying processes that govern biodiversity distribution. At the scale of a habitat patch, the trophic ecology of the main five cave-dwelling mysids (Hemimysis margalefi, H. speluncola, H. lamornae mediterranea, Siriella gracilipes, Harmelinella mariannae) reveals that persistence and coexistence are allowed by trophic strategies such as classical and spatial resource partitioning. In addition, some of the important feeding sites are located outside caves in the productive euphotic zone. This is of particular importance since mysids can bring organic matter from the outside into the caves by way of circadian migrations. This transfer of organic matter can be important in contributing to the persistence of other cave-dwellers.

Habitat fragmentation can adversely affect species populations due to reduced genetic diversity and increased population differentiation due to habitat isolation, reduced population size, and disruption of gene flow. Many species suffer from habitat fragmentation and isolation, and Campanula glomerata is a good example of a species that is noticeably declining in many places due to changes in landscape management. The question is how the model species responds to these changes and whether is the change are reflected in genetic diversity and population structure. The aim of this work is to determine the degree of genetic diversity and to reveal the genetic structure of populations of the model species C. glomerata on a small regional scale in the White Carpathians. This system will allow us to compare populations from two different regions that have been affected to varying degrees by agricultural intensification and fragmentation in the last century. It is a southwestern and northeastern part of the region, which differs from each other in the history of management in the landscape, but also in the continuity of meadows, species composition and environmental conditions. For this purpose, I developed and optimized a total of 16 usable microsatellite markers, 4 of which come from related species of...

The coexistence of species is probably one of the most interesting and complex phenomenon in nature. We constructed an agent based model to study the coexistence dynamics of prey - predator populations by varying productivity levels of producers in fragmented and connected habitats along with different levels of quality of predators. Our results indicated that productivity levels of producers in fragmented and connected habitats along with levels of predator quality are significantly responsible for overall predator - prey population size and survivorship. In the absence of predation, competition between identical prey populations is more probable in connected habitats than in unfragmented or fragmented habitats. Implementing low quality predators in the habitats positively influences the overall coexistence dynamics whereas implementing high quality predators tend to decrease the prey populations. Fragmented habitats provide for greater prey population survival time in highly productive environments but low prey population survival time in less productive environments.

No description available.