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31	Characterization of Small Molecules and Ions by Atmospheric Pressure Ionization-Mass Spectrometry De Silva, Maleesha 10 December 2021 (has links) (PDF) Mass spectrometry (MS) has become a widely used technique for the characterization of a wide range of substances in diverse fields. The selection of appropriate ionization techniques, source parameters, charge carriers based on the analyte’s polarity is essential in MS as only the ions are detected. When using a soft ionization technique, single stage-MS at best provides only chemical composition; thus, tandem MS is needed to determine structural information and dissociation pathways. This dissertation focuses on the characterization of various small molecules and ions using different ionization techniques, charge carriers, and collision-induced dissociation (CID). In Chapter II, commercially available ionic liquid (IL) cations, specifically imidazolium-based IL cations with different side-chain chemistries, were characterized by CID-MS. The imidazolium-based IL cations have diverse dissociations pathways depending on the nature of the side chain (aliphatic or aromatic) or the functional groups (allyl, vinyl, alcohol, methoxy, nitro) present on the side chain. Additionally, it was observed that some IL cations undergo thermal degradation under normal operating temperatures of electrospray ~275 °C. A variety of experimental and complementary computational chemistry results are presented. In Chapter III, cis-3-hydroxyproline (c3hPro) and cis-4-hydroxyproline (c4hPro) isomers were differentiated upon lithiation using CID-MS. The CID-MS of [c4hPro+Li]+ produces three primary fragmentation pathways, namely the neutral losses of H2O, CO, and CO2; whereas CID-MS of [c3hPro+Li]+ produces only loss of CO2 in this same region. These observations may have analytical utility, and in this work, the experimental observations were explored with thermodynamic and transition state calculations to better understand the processes. In Chapter IV, the accurate mass of synthetic monomers including PAH perfluorocycloalkene monomers and their precursors were measured and reported with a publication-quality mass accuracy using atmospheric pressure chemical ionization (APCI)-MS. Additionally, the effect of solution flow rate, ionization mode, source parameters (such as vaporization temperature, dry gas temperature and dry gas flow rate, nebulizer gas pressure), acidification, and different solvent systems on APCI-MS signal intensity were studied. collision-induced dissociation ionic liquid cations dissociation pathways thermodynamics lithiated hydroxyproline isomers synthetic monomers electrospray ionization APCI mass spectrometry polycyclic aromatic hydrocarbons Analytical Chemistry
32	Bioinformatic Identification and Analysis of Hydroxyproline-rich Glycoproteins in Plants Liu, Xiao 19 September 2017 (has links) No description available. Bioinformatics Plant Biology Biology Arabinogalactan-protein AGP Bioinformatics BIO OHIO Evolution Extensin Hydroxyproline-rich glycoprotein HRGP Identification Plant cell wall Plant kingdom Proline-rich proteins Protein superfamily PRP
33	Synthèse et fonctionnalisation sur support solide des aminopyrroles carboxylates Brouillette, Yann January 2005 (has links) Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal. Hydroxyproline 4-oxoproline Pyrrole Aminopyrrole Pyrrole carboxylate 4-aminopyrrole-2 5-dicarboxylate Bromopyrrole Pyrrolo[3,2-d]pyrimidine 9-(9-phenylfluorenyl) Support solide Résine de Wang Réaction haloforme Lamellarine Lukianol Ningaline Storniamide Polycitone Netropsine Distamycine Rigidine
34	Functional Characterization of Beta-Glucuronosyltransferases (GLCATs) and Hydroxyproline-Galactosyltransferases (GALTs) Involved in Arabinogalactan-Protein (AGP) Glycosylation Using CRISPR/Cas9 Gene Editing Technology In Arabidopsis Zhang, Yuan 28 September 2020 (has links) No description available. Genetics Molecular Biology Plant Biology Biochemistry Arabidopsis Arabinogalactan-proteins CRISPR-Cas9 calcium development glucuronic acid glucuronosyltransferase Hydroxyproline-Galactosyltransferases pollen root hairs seed coat mucilage seed germination siliques trichomes reproduction
35	Expression Profiling and Recombinant Production of TomEP, a Tomato Extensin Peroxidase Mishler-Elmore, John William 02 June 2020 (has links) No description available. Plant Sciences Plant Biology Botany Biochemistry Plant Cell Wall Extensin Extensin Peroxidase Peroxidase HRGP Tomato Agrobacterium Protein folding heterologous expression hydroxyproline rich glycoprotein Arabidopsis CRISPR GUS MUG Overexpression TomEP
36	Production and Characterization of Higher-Order Genetic Mutants for the Hydroxyproline-Galactosyltransferase Genes Encoding the Enzymes for O-Galactosylation of Cell Wall Arabinogalactan-Proteins in Arabidopsis Kaur, Dasmeet 16 September 2022 (has links) No description available. Cellular Biology Molecular Biology Biochemistry Genetics Plant Biology Arabidopsis Hydroxyproline-galactosyltransferases Hyp-GALT Arabinogalactan proteins AGP galt25789 galt23456789 Hyp-O-glycans plant growth development vegetative phenotypes reproduction fertilization male-gametophyte embryo development type-II AGs
37	The Implementation and Evaluation of Bioinformatics Algorithms for the Classification of Arabinogalactan-Proteins in Arabidopsis thaliana Yerardi, Jason T. 26 July 2011 (has links) No description available. Bioinformatics Biology Botany Computer Science Molecular Biology Plant Biology Plant Sciences Arabidopsis thaliana protein classification hydroxyproline-rich glycoproteins Arabinogalactan-proteins HRGPs AGPs protein families and subfamilies plant cell wall proteins in silico analysis
38	Aminosäurefunktionalisierte Chromophore als solvatochrome Sondenmoleküle Schreiter, Katja 14 December 2010 (has links) (PDF) In der vorliegenden Arbeit wird die Synthese und Charakterisierung von chiralen prolylfunktionalisierten Farbstoffen vorgestellt. Als chromophore Schlüsselverbindungen wurden Nitroaniline aber auch größere push-pull pi-Systeme wie Schiffsche Basen, Azofarbstoffe und Merocyanine gewählt. Im Fokus dieser Arbeit stehen dabei deren solvatochrome Eigenschaften, pH-Sensitivität sowie mögliche Wechselwirkung mit Biomolekülen und verschiedenen An- und Kationen. Zusätzlich erfolgten Umsetzungen ausgewählter prolylfunktionalisierter chromophorer Bausteine zu Estern und Amiden. Der Einfluss des Prolylbausteins auf das im Festkörper ausgebildete Wasserstoffbrückenbindungsmusters wurde über Einkristallröntgenstrukturanalysen untersucht und nach der Graph Set Methode von Etter klassifiziert. Neben der Einkristallröntgenstrukturanalyse erfolgte die weitere Untersuchung der Festkörpereigenschaften mit Hilfe von UV/Vis- sowie NMR-spektroskopischen Methoden. Das solvatochrome Verhalten der prolylfunktionalisierten Verbindungen wurde mittels multipler linearer Regressionsanalyse gemäß der LSER- (linear solvation energy relationship) Beziehung nach den Ansätzen von Kamlet-Taft und Catalán beschrieben und vergleichend interpretiert. Acidochromie Aminosäure Azofarbstoff Barbiturat Chiralität Chromophor Dipeptid Hydroxyprolin Einkristallröntgenstruktur Fluoreszenz Merocyanin Nitroanilin nucleophile aromatische Substitution Prolin Schiffsche Base Solvatochromie Wasserstoffbrückenbindungsmuster acidochromism amino acid azo dye barbiturate chirality chromophore dipeptide hydroxyproline single-crystal X-ray structure fluorescence merocyanine nitroaniline nucleophilic aromatic substitution proline Schiff base solvatochromism hydrogen-bond pattern ddc:540 Chromophor Solvatochromie Prolin Wasserstoffbrückenbindung Nitroaniline
39	Aminosäurefunktionalisierte Chromophore als solvatochrome Sondenmoleküle Schreiter, Katja 16 September 2010 (has links) In der vorliegenden Arbeit wird die Synthese und Charakterisierung von chiralen prolylfunktionalisierten Farbstoffen vorgestellt. Als chromophore Schlüsselverbindungen wurden Nitroaniline aber auch größere push-pull pi-Systeme wie Schiffsche Basen, Azofarbstoffe und Merocyanine gewählt. Im Fokus dieser Arbeit stehen dabei deren solvatochrome Eigenschaften, pH-Sensitivität sowie mögliche Wechselwirkung mit Biomolekülen und verschiedenen An- und Kationen. Zusätzlich erfolgten Umsetzungen ausgewählter prolylfunktionalisierter chromophorer Bausteine zu Estern und Amiden. Der Einfluss des Prolylbausteins auf das im Festkörper ausgebildete Wasserstoffbrückenbindungsmusters wurde über Einkristallröntgenstrukturanalysen untersucht und nach der Graph Set Methode von Etter klassifiziert. Neben der Einkristallröntgenstrukturanalyse erfolgte die weitere Untersuchung der Festkörpereigenschaften mit Hilfe von UV/Vis- sowie NMR-spektroskopischen Methoden. Das solvatochrome Verhalten der prolylfunktionalisierten Verbindungen wurde mittels multipler linearer Regressionsanalyse gemäß der LSER- (linear solvation energy relationship) Beziehung nach den Ansätzen von Kamlet-Taft und Catalán beschrieben und vergleichend interpretiert. info:eu-repo/classification/ddc/540 ddc:540

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