ANDRADE, N. M. Sistema pigmentar extrategumentar de Biomphalaria glabrata (Say, 1818) infectada e não infectada pelo Schistosoma mansoni (Sambon, 1907) e as alterações histológicas ocorridas pós-infecção. 2009. 87 f. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2009. / Submitted by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-03-13T13:22:35Z No. of bitstreams: 1 2009_nmandrade.pdf: 5410358 bytes, checksum: 6a24ceb213e8fa0a192225441d2f748a (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-03-13T13:22:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_nmandrade.pdf: 5410358 bytes, checksum: 6a24ceb213e8fa0a192225441d2f748a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-13T13:22:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_nmandrade.pdf: 5410358 bytes, checksum: 6a24ceb213e8fa0a192225441d2f748a (MD5) Previous issue date: 2009-12-29 / Schistosomiasis is an endemic parasitic disease typical of the Americas, Asia and Africa consisting of a major public health problem. The maintenance of the life cycle of Schistosoma mansoni in their intermediate hosts depends, among other factors, the mechanisms of defense which is performed by hemocytes with reticular pigmentary cells and metals present in the hemolymph of the snail. In this study, we sought to describe the extracutaneous pigment system of B. glabrata infected and not infected with S. mansoni and histological changes occurring post-infection. 44 were infected snails were put out for histological analysis every ten days post-infection resulting in an analysis in 10, 20 and 30 days. After fixation procedures, the specimens were cut and stained by nine stains for histological observation under a light microscope and confocal. For control we used 50 specimens of non-infected snails. Two categories phones were found in both the control and the three groups of infected snails. One group was formed by small pigmented dendritic cells and appeared predominantly in muscle with no difference regarding the amount and size when compared to the control group and infected. The second category was formed by reticular pigment cells that showed a wide distribution throughout the body of the snail. This category was different both in quantity and size when compared to the control and infected groups. The developmental stages were observed in groups of 20 and 30 days of infection while the granulomatous reactions were found either in the three study periods after infection and control groups. The relationship between snail and parasite is essential for understanding the biology of the parasite in its intermediate hosts and the development of methods to control snails in endemic areas. Although many studies about the host-parasite relationship in S. mansoni, the appearance of pigment cells had not yet been reported in invertebrates, thus confirming the presence of these cells becomes important in the elucidation of their role in host-parasite relationship. / A esquistossomose é uma endemia parasitária típica das Américas, Ásia e África consistindo em um grave problema de saúde pública. A manutenção do ciclo vital do Schistosoma mansoni em seus hospedeiros intermediários depende, entre outros fatores, dos seus mecanismos de defesa que é realizada pelos hemócitos juntamente com as células pigmentares reticulares e os metais, presentes na hemolinfa do molusco. Nesse estudo, buscou-se descrever o sistema pigmentar extrategumentar de Biomphalaria glabrata infectada e não infectada pelo S. mansoni e as alterações histológicas ocorridas pós-infecção. Foram infectados 44 moluscos sendo estes retirados para análise histológica a cada dez dias pósinfecção resultando em uma análise no 10º, 20º e 30º dias. Após os procedimentos de fixação, os exemplares foram cortados e corados por nove colorações para observação histológica em microscópio óptico e confocal. Para o controle foram utilizados 50 exemplares de moluscos não-infectados. Duas categorias celulares foram encontradas tanto no grupo controle quanto nos três grupos de moluscos infectados. Uma categoria foi formada pelas células dendríticas pigmentares pequenas e apareceu, predominantemente, no músculo não havendo diferença em relação a quantidade e ao tamanho quando comparado os grupos controle e infectado. A segunda categoria foi formada pelas células reticulares pigmentares que mostraram uma distribuição ampla por todo o corpo do molusco. Essa categoria apresentou diferença tanto em quantidade quanto em tamanho quando comparado ao grupo controle e aos grupos infectados. As formas evolutivas foram observadas nos grupos com 20 e 30 dias de infecção enquanto que as reações granulomatosas foram encontradas tanto nos três períodos de análise pósinfecção quanto no grupo controle. A relação entre molusco e parasito é essencial para o entendimento da biologia do parasito nos seus hospedeiros intermediários e para o desenvolvimento de métodos para o controle de moluscos em áreas endêmicas. Apesar de muitos trabalhos relatando a relação parasito-hospedeiro em S. mansoni, o aparecimento de células pigmentares ainda não tinha sido relatado em invertebrados, assim, a confirmação da presença dessas células se torna importante na elucidação do papel destas na relação parasitohospedeiro.

GOMES, Regina Kelly Guimarães. Infecções relacionadas à assistência à saúde e fatores associados em pacientes transplantados renais em Fortaleza – CE. 2014. 130 f. Dissertação (Mestrado em Saúde Pública) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2014. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2014-09-16T10:53:56Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_rkggomes.pdf: 16484702 bytes, checksum: 42470b36e0a9abfda9d1a501bb0e67fb (MD5) / Approved for entry into archive by denise santos(denise.santos@ufc.br) on 2014-09-16T10:57:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_rkggomes.pdf: 16484702 bytes, checksum: 42470b36e0a9abfda9d1a501bb0e67fb (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-16T10:57:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_rkggomes.pdf: 16484702 bytes, checksum: 42470b36e0a9abfda9d1a501bb0e67fb (MD5) Previous issue date: 2014 / The healthcare-related infections are among the major complications in patients who undergo kidney transplant, by virtue not only of immunosuppression schemes to which they are subjected, as the care carried out by health teams. The aim of this study was to analyze healthcare-related infections in renal transplant recipients in 2012, in the city of Fortaleza, which has consolidated renal transplant services. A cross-sectional study where outpatient records were analyzed, charts and tokens for notification and investigation of patients who performed CCIH kidney transplant in 2012, in HUWC and HGF, institutions with successive records in this type of procedure. A total of 237 attendees, being, 101 (average age: 43.2 years) belonging to the HUWC and 136 (average age: 45.4 years) to the HGF, was included in the study. In both institutions, most people were male, married and resided in the Capital of Ceará. Most of them also had the normal BMI was hypertensive, had as main causes of IRC: inderterminada, SAH and lupus nephritis. The proportion of invasive procedures performed were: graft biopsy (HUWC: 45.54%; HGF: 26.47%), central venous catheter puncture (HUWC: 98.01%; HGF: 97.06%), FAV (HUWC: 66.33%; HGF: 94.11%), and passage of double-J catheter (HUWC: 39.6%; HGF: 22.06%). The estimated prevalence of IRAS in 101 renal transplant recipients at HUWC was 50 (49.05%), and HGF, 31 (22.79%). The most common IRAS, both in HUWC, as in HGF, were urinary tract infections, and the main etiological agents isolated Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli. In HUWC, the socio-demographic factors, clinicians and epidemiologists who presented statistically significant association with involvement by IRAS were: the classification of BMI (p<0.03) time on dialysis before transplantation (p<0.05), the total length of stay (p<0.0001), the time of surgery (p<0.001), cold ischemia time (p<0.01), the passage of double-J catheter (p<0.003), the speaking time of TOT (p<0.03) and time of use of the SVD (p<0.04) in HUWC; on HGF, classification of BMI (p<0.04), LES as a cause of IRC (p<0.01), blood transfusion before transplantation (p<0.02), the total length of stay (p<0.001) and time of use of the CVC (p<0.04). Therefore, throughout the perioperative period, there is a need for development of cautious actions throughout the health team, in order to prevent infections and unnecessary government spending with hospitalizations and prolonged treatments, supporting the growth of renal transplantation technique in the State in recent years. / As infecções relacionadas à assistência à saúde estão entre as principais complicações em pacientes que se submetem a transplante de rim, em virtude, não somente, dos regimes de imunossupressão a que estão submetidos, como a cuidados desempenhados pelas equipes de saúde. O objetivo deste estudo foi analisar infecções relacionadas à assistência à saúde em pacientes transplantados renais em 2012, no Município de Fortaleza, que possui serviços de transplante renal consolidados. Fez-se um estudo transversal onde foram analisadas as fichas ambulatoriais, prontuários e fichas de notificação e investigação da CCIH de pacientes que realizaram transplante renal em 2012, no HUWC e HGF, instituições com recordes sucessivos neste tipo de procedimento. Um total de 237 participantes, sendo, 101 (médias de idade: 43,2 anos) pertencentes ao HUWC e 136 (médias de idade: 45,4 anos) ao HGF, foi incluído no estudo. Em ambas as instituições, a maioria das pessoas era do sexo masculino, casada e residia na Capital do Ceará. Grande parte delas também tinha o IMC normal, era hipertensa, tinha como principais causas de IRC: inderterminada, HAS e nefrites. A proporção de procedimentos invasivos realizados foi: biopsia do enxerto (HUWC: 45,54%; HGF: 26,47%), punção de cateter venoso central (HUWC: 98,01%; HGF: 97,06%), FAV (HUWC: 66,33%; HGF: 94,11%), e passagem de cateter duplo J (HUWC: 39,6%; HGF: 22,06%). A estimativa de prevalência de IRAS nos 101 pacientes transplantados renais no HUWC foi de 50 (49,05%), e no HGF, 31 (22,79%). As IRAS mais comuns, tanto no HUWC, como no HGF, foram infecções do trato urinário, e os principais agentes etiológicos isolados, Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli. No HUWC, os fatores sociodemográficos, clínicos e epidemiológicos que apresentaram associação estatisticamente significante com o acometimento por IRAS foram: a classificação do IMC (p<0,03), o tempo em diálise antes do transplante (p<0,05), o tempo de internação total (p<0,0001), o tempo de cirurgia (p<0,001), o tempo de isquemia fria (p<0,01), a passagem de cateter duplo J (p<0,003), o tempo de uso do TOT (p<0,03) e o tempo de uso da SVD (p<0,04) no HUWC; no HGF, a classificação do IMC (p<0,04), o LES como causa de IRC (p<0,01), a transfusão sanguínea antes do transplante (p<0,02), o tempo de internação total (p<0,001) e o tempo de uso do CVC (p<0,04). Portanto, durante todo o período perioperatório, há necessidade de desenvolvimento de ações cautelosas por toda a equipe de saúde, de forma a prevenir infecções e gastos desnecessários do governo com internamentos e tratamentos prolongados, sustentando o crescimento da técnica de transplantação renal no Estado nos últimos anos.

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:46:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006 / Objetivos: Identificar a incidencia de candidemia hospitalar entre a populacao pediatrica e avaliar os fatores associados a mortalidade. Metodos: Estudo tipo coorte retrospectivo para avaliar criancas de O a 17 anos com candidemia atendidas nas unidades pediatricas no Hospital São Paulo (HSP) ¬Universidade Federal de São Paulo - entre novembro de 1994 e outubro de 2002. A selecao dos pacientes foi feita atraves dos registros de todos os casos de candidemia ocorridos no periodo do estudo. O estudo foi dividido em duas analises: Analise 1 ¬comparar as variaveis associadas a mortalidade entre os pacientes que tiveram alta hospitalar e os que morreram; Analise 2 - Comparar as variaveis relacionadas a mortalidade entre os pacientes que morreram em ate sete dias apos o episodio de candidemia e os que sobreviveram. Todas as hemoculturas foram coletadas com tecnica asseptica e encaminhadas ao laboratorio central do HSP para identificacao do agente e da especie, posteriormente as amostras foram encaminhadas ao Laboratorio Especial de Micologia (LEMI) para confirmacao da especie. As informacoes clinicas e epidemiologicas foram obtidas pela revisao de prontuarios e preenchimento de ficha clinica padrao. Resultados: Avaliamos 92 pacientes com candidemia. A taxa de incidencia foi de 2,8 casos por 1.000 admissoes ou de 0,36 casos por 1.000 pacientes-dia. Quanto a idade, 13 pacientes (14 por cento) eram recem-nascidos, 46 (50 por cento) tinham entre um mes e dois anos e 33 (36 por cento) entre dois e 17 anos. A Candida albicans foi responsavel por 50 por cento (n= 46) das especies isoladas e outros 50 por cento foi de especies nao-albicans, sendo: C. parapsilosis (26,1 por cento), C. tropicalis (16,3 por cento), C. guilliermondii (3,3 por cento), C. glabrata (2,2 por cento) e C. krusei (2,2 por cento). Trinta e seis pacientes (39 por cento) estavam internados em enfermaria de clinica medica, 14 (15,2 por cento) em unidades de terapia intensiva, 14 (15,2 por cento) em unidade hemato-oncologica e 28 (30,6 por cento) em diferentes unidades hospitalares. A Anfotericina B foi utilizada em todos os 70 pacientes que receberam tratamento. O tempo de permanencia dos pacientes no hospital foi em media de 70 dias (min= 2; max.= 184; mediana=43). A taxa de mortalidade geral foi de 46,7 por cento e a mortalidade no periodo de ate sete dias apos o episodio de candidemia foi de 18,4 por cento. Na Analise 1 os fatores significativos associados a mortalidade foram a manutencao do cateter venoso central (OR= 11,46; IC 95 por cento = 3,18- 41,26) e o uso de antagonista de H2 (OR =2,64¬IC95 por cento = 1,00-7,01). Na analise 2 o tratamento da candidemia apareceu como fator protetor (OR= 0,28 - IC95 por cento= 0,09 -0,89). Conclusoes: A mortalidade por candidemia entre as criancas foi elevada, mostrando que as medidas preventivas, como a retirada do cateter venoso central na vigencia da candidemia, devem ser adotas. A realizacao do tratamento da candidemia precocemente e fundamental para aumentar as chances de sobrevivencia das criancas. / Objectives: The objective of this study was to determine the incidence of hospital candidemia among the pediatric population and to investigate factors related to mortality rates. Methods: Retrospective cohort study of children between 0 and 17 years old with candidemia, attending the pediatric units of Hospital São Paulo (HSP) – Universidade Federal de São Paulo between November 1994 and October 2002. Patients were selected from records that included all cases of candidemia during that period. The study was divided two types of analyses: Analysis 1 – comparison of variables associate to mortality among patients who were discharged or died; Analysis 2 – comparison of variables related to mortality among patients who died within seven days after the candidemia episode and those who survived. Blood for hemocultures was aseptically collected and sent to the HSP central laboratory for identification of the type and species of microorganism. Samples were then sent to the Laboratório Especial de Micologia (LEMI) for confirmation of the species. Clinical and epidemiological information was obtained through medical records and filling of standard clinical forms. Results: A total of 92 candidemia patients were evaluated. The incidence rate was 2.8 cases in 1,000 admission, or 0.36 cases/1,000 patients/day. Thirteen (14%) of the patients were newborns, 46 (50%) were between one month and 2 years old, and 33 (36%) were between 2 and 17 years old. Candida albicans was identified in 50% (n=46) of the cases, and the remaining non-albicans cases included C. parapsilosis (26.1%), C. tropicalis (16.3%), C. guilliermondii (3.3%), C. glabrata (2.2%) and C. krusei (2.2%). Thirty-six patients (39% of the sample) had been admitted to a medical clinics unit, 14 (15,2%) to intensive care units, 14 (15.2%) to a hemato-oncologic unit and 28 to others units. Amphotericin B was administered to all 70 patients receiving treatment. Patients were hospitalized in average for 70 days (range 2 to 184 days, median 43 days). The overall mortality rate was 46.7%, and mortality during the first 7 days after the candidemia episode was 18.4%. Factors significantly associated to mortality in Analysis 1 were maintenance of a central venous catheter (OR= 11.46; 95%CI = 3.18-41.26) and the use of a H2 antagonist (OR =2.64; 95%CI = 1.00-7.01). Treatment of candidemia was shown as a protective factor in Analysis 2 (OR= 0.28; 95%CI = 0.09-0.89). 68 Conclusions: The mortality rate due to candidemia was high among the children, indicating that preventive measures, such as removal of the central venous catheter when candidemia is detected, should be taken. The early treatment of candidemia is of fundamental importance to increase survival rates among the affected children. / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:47:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Introdução: Fusarium spp. representa um fitopatógeno de grande importância econômica no Brasil e no mundo. Nos seres humanos pode causar diversos tipos de doenças, que vão desde infecções superficiais em pacientes imunocompetentes, até infecções invasivas e disseminadas como as fungemias em pacientes imunocomprometidos. Objetivos: (1) Avaliar de forma descritiva as características fenotípicas de 157 cepas de Fusarium spp. isoladas de episódios de infecções em humanos e coletas ambientais; (2) Descrever a prevalência de diferentes espécies de Fusarium encontradas nestas amostras. (3) Definir o perfil de susceptibilidade dessas cepas utilizando o método de microdiluição em caldo descrito no documento M38-A2 publicado pelo Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI), frente aos antifúngicos Anfotericina B, Fluconazol, Itraconazol, 5-fluorocitosina e Voriconazol. Material e Métodos: Foram avaliadas 126 cepas clínicas e 31 cepas ambientais de Fusarium spp. que foram coletadas entre os anos de 1996 e 2008. Estas cepas estavam armazenadas no banco de microrganismos do Laboratório Especial de Micologia na Universidade Federal de São Paulo - UNIFESP. Os isolados foram identificados por análise das características macro- e micromorfológicas, seguindo a chave de identificação publicada por De Hoog et al, (2000). A avaliação da susceptibilidade in vitro dos isolados foi realizada pelo método de microdiluição em caldo, de acordo com as normas de padronização publicadas no documento M38-A2 do CSLI (2008). Foram realizadas leituras de 24, 48 e 72h de incubação. Resultados: Analisou-se um total de 157 amostras clínicas e ambientais, incluindo 143 cepas do complexo Fusarium solani (91,1%), 07 do complexo Fusarium dimerum (4,5%), 04 do complexo Fusarium incarnatum (2,5%), 02 de Fusarium verticillioides (1,3%) e 01 do complexo Fusarium oxysporum (0,6%). A maioria dos isolados (98 a 100%) apresentou baixa ou nula susceptibilidade a fluconazol, itraconazol e 5-fluorocitosina, independente dos períodos de incubação dos ensaios. Para anfotericina B e voriconazol, foi documentado aumento substancial no percentual de cepas inibidas em concentrações de droga superiores a 2,0µg/mL entre as leituras realizadas após 24 versus leituras realizadas após 48h/72h de incubação. Em relação aos ensaios de susceptibilidade aos antifúngicos observamos que para voriconazol leituras realizadas após 24h de incubação apresentam maior correlação com as taxas de sucesso terapêutico descritas em séries abertas tratadas com este medicamento. Conclusões: Verificamos que há predomínio de cepas do complexo Fusarium solani tanto nas amostras de micoses superficiais como nas amostras de micoses invasivas. Finalmente, tendo em vista os dados do perfil de susceptibilidade obtidos in vitro, anfotericina B apresenta maior atividade que voriconazol contra as cepas do complexo Fusarium solani e o oposto é observado entre as cepas de Fusarium não-solani avaliadas neste estudo. / Introduction: Fusarium spp. represents a phytopathogen of great economic importance in Brazil and worldwide. In humans it can cause different forms of diseases, ranging from superficial infections in immunocompetent patients to invasive and disseminated infections such as fungemia in immunocompromised patients. Objectives: (1) To identify phenotypic characteristics of 157 strains of Fusarium spp. recovered from human infections episodes and environmental samples, (2) To describe the prevalence of different species of Fusarium found in these samples. (3) To define the susceptibility pattern of Fusarium spp. strains using the broth microdilution method described in the document M38-A2 (2008) published by the Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) against amphotericin B, fluconazole, itraconazole, 5-fluorocytosine and voriconazole. Methods: We analyzed 126 clinical strains and 31 environmental strains of Fusarium spp. which were collected from 1996 and 2008. The strains were stored at -80ºC in the fungi culture collection of the Laboratório Especial de Micologia of Universidade Federal de São Paulo - UNIFESP. The isolates were identified by macro and micromorphological characteristics analysis based on the identification keys published by De Hoog et al, (2000). The evaluation of in vitro susceptibility of the isolates was performed by the microdilution method according to standardization CLSI M38-A2 document. Visual readings were performed after 24, 48 and 72 hours of incubation. Results: We analyzed a total of 157 clinical and environmental samples, including 143 (91.1%) of Fusarium solani complex strains, 07 (4.5%) of Fusarium dimerum complex, 04 (2.5%) of Fusarium incarnatum complex, 02 (1.3%) of Fusarium verticillioides and 01 (0.6%) of the Fusarium oxysporum complex. Most isolates (98 to 100%) showed low or zero susceptibility to fluconazole, itraconazole and 5- fluorocytosine, regardless of the periods of incubation of the tests. For amphotericin B and voriconazole, it was observed a substantial increase in the percentage of strains inhibited at drugs concentrations higher than 2.0µg/mL between the readings taken after 24 versus readings taken after 48h/72h of incubation. In the antifungal susceptibility tests with amphotericin B and voriconazole we observed that readings taken after 24 hours of incubation generate results more similar to those described in open series of therapeutic success rates treated with this medicine. Conclusions: We verified that there is a predominance of Fusarium solani complex strains in both samples of superficial and invasive mycoses. Finally, the data obtained by in vitro susceptibility showed that amphotericin B is more effective than voriconazole against the strains of the Fusarium solani complex and the opposite is observed for the strains of Fusarium non-solani evaluated in this study. / CNPq: 135219-2006-0. / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Made available in DSpace on 2016-04-15T13:03:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 cristian_souza_ioc_dout_2015.pdf: 3397984 bytes, checksum: 18ee9469d3c1b75bff5879e83a9dfdc1 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O presente trabalho se caracterizou como estudo descritivo comparando duas áreas: uma área silvestre onde se encontra o Parque Estadual do Rio Doce (PERD) e outra área urbana, situadas no município de Timóteo-MG. Objetivando estudar o ciclo de transmissão dos agentes das leishmanioses nas duas áreas, verificando possíveis alterações no seu padrão de transmissão. Foram realizadas coletas de flebotomíneos com armadilhas luminosas HP, coleta de amostras biológicas de animais silvestres, sinantrópicos e cães, o período de coletas foi entre setembro de 2012 a fevereiro de 2014. Foram realizados estudos de infecção natural por Leishmania spp., utilizando o gene ITS1, em todas as amostras coletas. E por fim um estudo de fonte alimentar em fêmeas alimentadas naturalmente. As análises foram realizadas com técnicas moleculares (PCR/Sequenciamento). Ficou claro que no município de Timóteo há pelo menos três espécies de Leishmania: Leishmania braziliensis, Leishmania amazonensis e Leishmania infantum. Dando evidência a grande presença de Leishmania braziliensis, identificada em amostras biológica de flebotomíneos, roedores, marsupiais e cães. A participação de flebotomíneos e animais, possíveis reservatório, no ciclo da Leishmania spp. no município de Timóteo ficou mais evidente após as observações da presença infecção natural por Leishmania braziliensis. Nyssomyia whitmani foi a espécie mais capturada na área urbana, enquanto no PERD foi Pressatia choti ambas as espécies foram identificadas com infecção natural por Leishmania braziliensis. A presença de Rattus rattus e Mus musculus, com infecção natural, sugerem que sejam possíveis reservatórios de Leishmania spp. no município Preocupante também e a possibilidade da participação de cães, uma vez que tiveram amostras de sangue com infecção natural. E por fim, e não menos importante foi o registro da participação de Gallus gallus (galinha) e Sus scrofa (porco) enquanto fonte alimentar de flebotomíneos, o que ajuda a manter o ciclo de vida dos vetores na área urbana do município / This work was characterized as a descriptive study comparing two areas: a wild area where is located the Parque Estadual do Rio Doce (PERD) and other urban area, located in municipality of Timóteo-MG, in order to study the transmission\2019 agents of cycle of leishmaniasis in both areas suggested checking possible changes in their transmission\2019s pattern. Sandfly captures were conducted with HP light traps, collecting biologies samples of wild animals, synanthropic and dogs, the period of collections were between September 2012 to February 2014. A study of natural infection of Leishmania spp were performed using the ITS1 gene in all collected samples. And a food meals for the study in females fed naturally. Analyses were performed using molecular techniques (PCR/ Sequencing). It was clear that in Timóteo\2019s municipality exist at least three species of Leishmania: Leishmania braziliensis, Leishmania amazonensis and Leishmania infantum. Giving evidence of the strong presence of Leishmania braziliensis, identified in biological samples of sandflies, rodents, marsupials and dogs. Participation of sand flies and animals, possible reservoirs of the Leishmania spp cycle. In Timóteo became more evident after the observations with the presence of Leishmania braziliensis natural infection. Nyssomyia whitmani was the most captured species in urban areas, while in the PERD was Pressatia choti, both species were identified with Leishmania braziliensis natural infection

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-11-14T03:23:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 348747.pdf: 2500699 bytes, checksum: 37158baf64bce270811a31f04240c949 (MD5) Previous issue date: 2017 / Nas últimas décadas, a disseminação de bactérias patogênicas e resistentes, tornou-se uma preocupação a nível mundial. As metodologias fenotípicas e moleculares tradicionais são laboriosas, requerem muito treinamento técnico e possuem altos custos. O sistema MALDI-TOF/MS, metodologia emergente da espectrometria de massas aplicada à microbiologia, é utilizado na rotina como método de identificação por inoculação direta de bactérias e mostrou-se promissor na determinação precoce da relação epidemiológica de isolados. Os Staphylococcus spp. resistentes à meticilina (MRS) e Enterococcus resistentes à vancomicina (VRE) são importantes patógenos oportunistas que causam Infecções Relacionadas à Assistência à Saúde (IRAS). Assim sendo, o nosso trabalho tem como objetivo analisar biomarcadores proteicos para estudos de identificação, resistência e variabilidade de isolados de MRS e VRE. Os isolados são provenientes do Hospital Universitário (HU/UFSC, Florianópolis/SC, Brasil), coletados entre abril de 2015 e março de 2016 de pacientes, profissionais da saúde, e ambiente hospitalar de cinco alas do hospital: Emergência (EMG), Unidade de Terapia Intensiva (UTI), Centro Cirúrgico (CCR), Clínica Médica I (CMI) e Clínica Cirúrgica I (CRI). Das 1.759 amostras coletadas, foram isolados 17 VRE e 72 MRS. Desses, catorze foram identificados como S. aureus resistentes à meticilina (MRSA) e quinze como E. faecium resistentes à vancomicina. Nossos resultados apontam que o protocolo de MALDI-TOF validado neste trabalho para análises microbiológicas mostrou poder discriminatório para identificação dos isolados a nível de gênero, tanto para VRE quanto para MRS, analisando-se proteínas na faixa de 2.000 a 20.000 Da. Para Staphylococcus spp., os biomarcadores proteicos identificados permitiram uma análise robusta para identificação das espécies, mas não mostraram poder discriminatório suficiente para análises de marcadores de resistência à oxacilina e vancomicina ou de variabilidade e clonalidade. Para a identificação dos Staphylococcus coagulase negativa (SCoN) foram encontrados quatro picos exclusivos para S. sciuri resistentes à oxacilina (MRSCi), quatro para S. haemolyticus resistentes à oxacilina (MRSH) e dezessete para S. warneri resistentes à oxacilina (MRSW). Na tentativa de diferenciar MRSA dos MSSA, foram obtidos nove picos com especificidade e sensibilidade consideráveis, mas somente dois, m/z 2302±2 Da e 3073±2 Da possuem valores relevantes da área sob a curva (AUC) para futuras pesquisas. No caso do VRE, o pico m/z 4430±3 Da foi comum para todas as amostras, entretanto não foi possível identificar picos comuns para identificação das espécies nem para estudos de prospecção de resistência bacteriana. Finalmente, apesar de bem estabelecido para identificação bacteriana, nossos dados sugerem cautela na interpretação dos resultados de MALDI-TOF/MS para estudos de resistência e variabilidade até que modelos computacionais estejam bem validados. / Abstract : Within the last decade, the characterization of pathogenic and resistant bacteria has become a worldwide concern. The conventional microbiology and molecular biology methods are time-consuming, require technical skills training and are costly. Matrix-assisted laser-desorption-ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), an emerging methodology of mass spectrometry applied to microbiology, is a method routinely used for bacterial identification using a whole cell of bacteria and has shown promise in the prompt determination of epidemiological relatedness of clinical isolates. Methicillin-resistant Staphylococcus spp. (MRS) and vancomycin-resistant Enterococci (VRE) are important opportunistic pathogens that cause Healthcare-associated Infections (HAI). The aim of this study was to analyze protein biomarkers for bacterial identification, resistance and variability of MRS and VRE isolates compared to standard strains and control strains. The isolates were collected from the University Hospital (HU/UFSC, Florianópolis/SC, Brazil), between April 2015 and March 2016 from patients, health workers and the hospital environment of five hospital units: Emergency Department (ED), Intensive Care Unit (ICU), Surgical Center (SC), Medical Clinical Unit (MCU) and Surgical Clinical Unit (SCU). From the 1,759 samples that were obtained, 17 VRE and 72 MRS were isolated. Among then, fourteen were identified as methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and seventeen as vancomycin-resistant Enterococcus faecium. Here we show that the MALDI-TOF protocol validated in the study conditions for microbiological analysis showed discriminatory power for the identification of the isolates at the genus level, for both VRE and MRS, analyzing proteins in the range of 2,000 to 20,000 Da. The identified protein biomarkers to Staphylococcus spp. allowed a robust analysis for species identification. However, they did not show sufficient discriminatory power for analyzes of oxacillin and vancomycin resistance markers or of variability and clonality. For the identification of coagulase-negative staphylococci (CoNS), four unique peaks were found for methicillin-resistant S. sciuri (MRSCi), four for methicillin-resistant S. haemolyticus (MRSH) and seventeen for methicillin-resistant S. warneri (MRSW). In an attempt to differentiate MRSA from MSSA, nine peaks with considerable specificity and sensitivity were obtained, but only two, m/z 2302±2 and 3073±2 have relevant area under the curve (AUC) values for future research. In the case of VRE, the peak m/z 4430±3 was common for all samples; however it was not possible to identify common peaks for identification of the species or for prospective studies of bacterial resistance. Finally, although well established for bacterial identification, our data suggest caution in the interpretation of MALDI-TOF/MS results for studies of resistance and variability until computational models are well validated.

A incidência de infecções microbianas relacionadas ao uso de cateteres vem aumentando. Uma característica importante dos microrganismos envolvidos é a capacidade de aderência à superfícies com conseguinte formação de colônia, produção de substâncias extracelulares, e subsequente formação de uma matriz compacta, amorfa, de múltiplas camadas, o biofilme. A atividade de bacteriocinas produzidas por Staphylococcus aureus e Staphylococcus epidermidis sobre microrganismos isolados de dispositivos intravasculares foi avaliada. As bacteriocinas Pep5 e Epidermina inibiram um maior número de isolados clínicos quando avaliadas in vitro por antagonismo direto, apresentando halos de inibição de 20 a 36 mm. A adição de Pep5 e Epidermina durante o crescimento de S. epidermidis e Corynebacterium sp resultou na redução do número de células viáveis. O efeito das bacteriocinas sobre a adesão bacteriana à cateteres de silicone foi avaliado através de três protocolos onde variou-se o momento de adição da bacteriocina: (A) simultaneamente, (B) previamente, e (C) posteriormente ao inóculo microbiano. As bacteriocinas Pep5 e Epidermina reduziram significativamente o número de células de S. epidermidis e Corynebacterium sp. aderidas aos cateteres após 6 h e 12 h de incubação. Não foram observadas diferenças importantes entre os três protocolos A, B, ou C. O efeito de Pep5 sobre Corynebacterium sp. foi verificado por microscopia eletrônica de varredura, podendo ser observadas áreas com resíduos celulares na superfície do cateter. / The in cidence of catheter-related microbial infections has been increasing. One important characteristic of related microorganisms is the adhesion to surfaces with colony formation, production of extracellular substances, and subsequent development of a compact, amorphous, multiple layer matrix, the biofilm. The activity of bacteriocins produced by Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis against microorganisms isolated from intravascular catheters was studied. The bacteriocins Pep5 and Epidermin inhibited a higher number of clinical isolates when evaluated by direct antagonism, showing inhibition zones of 20 to 36 mm. The addition of Pep5 and Epidermin during growth of S. epidermidis and Corynebacterium sp. resulted in a decrease of viable cell counts. The effect of bacteriocins on bacterial adhesion to silicon catheter was evaluated through three protocols differing in the time of bacteriocin addition: (A) simultaneously, (B) before, and (C) after the microbial inoculum. The bacteriocins Pep5 and Epidermin caused a significant reduction of the number of adhered cells of S. epidermidis and Corynebacterium sp. after 6 h and 12 h. No important differences among the protocols A, B or C were observed. The effe tions ct of Pep5 on Corynebacterium sp. was studied by scanning electron microscopy. Sec with cellular residues were observed on the catheter surface.

Made available in DSpace on 2016-08-30T10:49:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_2516_2005_Angela Lourenço Lopes Rodrigues.pdf: 666391 bytes, checksum: 072c4a9ba0be59e7270443bb9acb2b5b (MD5) Previous issue date: 2007-09-28 / As infecções adquiridas em Unidades de Terapia Intensiva (UTIs) apresentam alta incidência, gerando repercussões sobre custos e mortalidade e, no Estado do Espírito Santo (ES), não existem informações disponíveis sobre o impacto econômico das infecções hospitalares em UTIs. O estudo objetiva estimar o custo das três principais infecções em UTIs destinadas a tratamento de pacientes adultos no ES infecções urinárias, pneumonias e infecções de corrente sanguínea. É uma pesquisa tipo casocontrole, com amostra de 97 casos de infecção hospitalar (IH), notificados, durante o período de 01 de julho de 2004 a 31 de dezembro de 2005, pelas Comissões de Controle de Infecção Hospitalar (CCIH) de três hospitais da rede pública. Os casos foram pareados por sexo, idade, número de diagnósticos e índice de gravidade APACHE II à admissão nas UTIs, com 97 controles que não apresentaram infecção no período. A análise dos custos diretos das infecções nas UTIs considerou três variáveis: permanência extra na UTI, consumo de antimicrobianos e realização de exames microbiológicos. Ao se comparar os casos de infecção com seus controles, observou-se que, em média, a permanência hospitalar adicional foi 18 dias para os casos, que consumiram 2,4 mais doses diárias definidas (DDD) de antimicrobianos e realizaram mais 3,8 exames microbiológicos por paciente, durante a internação (p=0,000). No total, a estimativa da média do custo da internação hospitalar, nos dois grupos, demonstrou um custo extra de US$ 2.241, 35 (p=0,05), sendo as diárias de UTI o fator mais oneroso. Nos três tipos de infecção estudados, o maior excesso de custos foi observado para os casos de pneumonia, com média US$ 2.801,14 por paciente. Conclui-se que as infecções adquiridas em UTIs aumentaram a permanência dos pacientes e o consumo de antimicrobianos em hospitais públicos no Estado do Espírito Santo.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde. Programa de Pós-Graduação em Farmácia, Florianópolis, 2016 / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:54:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 340337.pdf: 2007305 bytes, checksum: 6be22e3638da4b7879d83a31d6880e6d (MD5) Previous issue date: 2016 / A exposição de Staphylococcus aureus a glicopeptídeos pode determinar mudanças transcricionais em genes envolvidos na biossíntese da parede celular. Somado a isso, mutações em sistemas reguladores de dois componentes como graSR, vraSR, walKR, além do gene codificador da unidade beta da RNA polimerase (rpoB) têm sido descritas e apresentam possível relação causal com o desenvolvimento de S. aureus com heterorresistência intermediária à vancomicina (hVISA). O fenômeno da heterorresistência é caracterizado pela presença de raras sobpopulações de células que apresentam níveis mais elevados de resistência e está associado a falha terapêutica, maior tempo de hospitalização, além de ser de difícil detecção laboratorial. Os mecanismos genéticos envolvidos neste fenótipo são pouco compreendidos e sua análise pode conduzir a determinação de marcadores moleculares da resistência além de auxiliar na validação de métodos laboratoriais que possibilitem um diagnóstico mais fácil, rápido e acurado. Nosso estudo contou com 12 isolados de hVISA obtidos de quatro hospitais de Santa Catarina e objetivou analisar dados de sequenciamento e o perfil de transcrição nos genes graSR, vraSR, walKR e rpoB destas amostras. Cinco isolados apresentaram-se mutados em pelo menos um dos genes avaliados. As mutações rpoB H481N e graS T224I foram as mais frequentes, seguidas pelas mutações graR D148Q e walK A468T. As mutações walK R222K e vraR E59D foram observadas com menor frequência, porém assim como as demais mutações citadas estão mais sugestivamente implicadas na aquisição da resistência em nossas amostras. Mutações em vraS e walR não foram descritas. Da mesma forma, alterações do perfil transcricional nos genes vraSR e walKR não foram observadas neste estudo. No entanto, a exposição à vancomicina aumentou o nível de expressão dos genes rpoB e graSR em pequeno número de nossas amostras, indicando a possível participação dos mesmos no desenvolvimento do fenótipo hVISA. Embora algumas questões permanecem sem resposta, nosso estudo possibilitou a descrição de alterações genéticas em isolados com redução de suscetibilidade à vancomicina que naturalmente ocorreram em hospitais de Santa Catarina, auxiliando, ainda, na compreensão dos prováveis mecanismos envolvidos na determinação deste fenótipo. <br> / Abstract : Staphylococcus aureus constantly exposed to glycopeptides determines transcriptional changes of genes involved in cell wall biosynthesis. Furthermore, mutations in two-component regulatory systems as graSR, vraSR, walKR and in gene encoding RNA polymerase beta unit (rpoB) have been described and may be related to heteroresistant vancomycin-intermediate S. aureus (hVISA). Heteroresistance is characterized by the presence of a rare population of cells with larger levels of resistance, and it is associated with therapy failure and longer hospital stays. Furthermore their laboratory detection is very difficult. The genetic mechanisms involved in this phenotype are poorly understood and their analysis may lead to the determination of molecular markers and validation of methods, which could make laboratory diagnosis earlier, faster and accurate. Our study included 12 hVISA isolates obtained from four hospitals in Santa Catarina and aimed to analyze sequencing data and the transcription levels of graSR, vraSR, walKR and rpoB genes. Five isolates showed mutations in at least one of the genes evaluated. The rpoB H481N and graS T224I were the most frequent mutations, followed by graR D148Q and walK A468T. The walK R222K and vraR E59D mutations were observed less frequently, but like other mutations were more involved in the acquisition of resistance in our samples. Mutations were not described in vraS and walR. Similarly, changes in the transcriptional profile of vraSR and walKR genes were not observed in this study. However, exposure to vancomycin increased the expression level of rpoB and graSR genes in small number of our samples. This indicated their possible participation in the development of hVISA phenotype. Although some questions remain unanswered, our study allowed the description of genetic changes in strains with reduced sensitivity to vancomycin that naturally occurred in hospitals in Santa Catarina and helped understanding the mechanism involved in the determination of this phenotype.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Farmácia, Florianópolis, 2016 / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:54:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 340467.pdf: 1807485 bytes, checksum: f661f353f7a43a9bf68f0e8de9381343 (MD5) Previous issue date: 2016 / Acinetobacter spp., especialmente A. baumannii é um patógeno oportunista que causa infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS) no mundo todo, com alta morbidade e mortalidade. Infecções causadas por A. baumanni multidroga resistente (MDR) têm aumentado e preocupado os hospitais na escolha da terapia adequada para esses pacientes. O mecanismo mais comum de resistência aos carbapenêmicos em A. baumannii é a degradação enzimática por carbapenemases, como as Beta-lactamases da classe A, Metalo-Beta-lactamase (MBL) e oxacilinases. Neste estudo foram identificados e caracterizados Acinetobacter spp. de um Hospital Universitário (HU-UFSC, Florianópolis/SC, Brasil), isolados entre março e setembro de 2015, coletados de profissionais da saúde, pacientes e superfícies de alto contato de cinco alas do hospital: emergência (EMG), Unidade de terapia intensiva (UTI), Centro cirúrgico (CC), Clínica cirúrgica (CR1) e Clínica médica I (CMI). A identificação e o TSA (Teste de suscetibilidade aos antimicrobianos) foram determinados pelo sistema automatizado (Vitek2®; bioMérieux). Espécies foram também identificadas por sequenciamento do 16S rDNA. A presença de 17 genes foi detectada por qPCR: blaOXA-51-like, blaOXA-58-like, blaOXA-23-like, blaOXA-72-like, blaOXA-143-like, blaOXA-48-like,blaIMP, blaVIM e blaSHV, blaKPC, blaSHV, blaNDM, blaGES, blaCTXM-1, blaCTXM-2, blaCTXM-8, blaCTXM-9. Das 1.430 amostras coletadas, obtivemos 575 isolados, dessas, 140 eram Acinetobacter spp. e 70,7% eram MDR (com 96,9% de resistência aos carbapenêmicos). A detecção dos genes de resistência mostrou que 73,5% das amostras foram positivas para OXA-23, 77,8% para OXA-51 e 2,1% para SHV e CTXM-8. Alguns isolados de Acinetobacter spp. com genes de resistência foram encontrados nas salas de lanches, passante, sala de repouso da enfermagem e nas mãos dos profissionais da saúde. Curiosamente, foram encontrados isolados sensíveis aos cabapenêmicos, mas com genes de resistência para carbapenemases (OXA-23). O teste rápido Blue-Carba, que detecta bactérias produtoras de carbapenemases, mostrou 100% de sensibilidade e especificidade quando comparado ao qPCR. Através do Rep-PCR, 23 perfis diferentes de bandas foram encontrados, quatro desses constituídos exclusivamente por isolados resistentes aos carbapenêmicos, tendo um perfil prevalente com 58 dos isolados (41%). A porcentagem de similaridade global dos 23 perfis foi de 70%. Esses resultados evidenciam alguns pontos críticos no hospital e mostram que uma detecção rápida das bactérias, com genes de resistência circulantes e dos perfis genéticos existentes no hospital, podem orientar condutas para a redução das taxas de IRAs. <br> / Abstract : Acinetobacter spp., particularly A. baumannii, is an opportunistic pathogen that causes healthcare-associated infections (HAI) worldwide with high morbidity and mortality. Infections by A. baumannii multidrug-resistant (MDR) have increased and worried hospital institutions to figure out the appropriate treatment for these patients. The most common mechanism of resistance to carbapenems in A. baumanii is enzymatic degradation by carbapenemases, such as Class A Beta-lactamases, Metallo-Beta-lactamase (MBL) and Oxacilinases. In this study, we identified and characterized Acinetobacter spp. from a University Hospital (HU-UFSC, Florianópolis/SC, Brazil) isolated in Mar-Sep-2015, from healthcare workers, patients and high-touch surfaces at 5 hospital units: Emergency (EMG), Intensive Care (ICU), Surgical Center (SC), Surgical Inpatient (SIU) and Medical Inpatient (MIU). The identification and the AST (antimicrobial susceptibility test) were determined by an automated method (Vitek2®; bioMérieux). Species were also identified by 16S rDNA sequencing. The presence of 17 resistance genes was tested by qPCR: blaOXA-51-like, blaOXA-58-like, blaOXA-23-like, blaOXA-72-like, blaOXA-143-like, blaOXA-48-like, blaIMP, blaVIM e blaSHV, blaKPC, blaSHV, blaNDM, blaGES, blaCTXM-1, blaCTXM-2, blaCTXM-8, blaCTXM-9. From the 1,430 samples collected, we obtained 575 strains, out of these, 140 were Acinetobacter spp. and 70.7% were MDR (being 96.9% of these resistant to carbapenems). The detection of resistance genes showed that 73.5% of strains were positive for OXA-23, 77.8% for OXA-51 e 2.1% para SHV e CTXM-8. Some of A. baumanni with resistance genes were found in the snack room, on a patient bed transfer board, nurse´s station and hands of healthcare workers. Interestingly, we found Acinetobacter spp. sensitive to carbapenems with carbapenem resistance genes (OXA-23). The rapid test Blue-Carba, which detects strains producing carbapenemases, showed 100% of sensitivity and specificity comparing to qPCR. Rep-PCR revealed 23 different profiles (four composed of strains resistant to carbapenems), being one prevalent with 58 isolates (41%). The global percentage of similarity of these profiles was of 70%. These results highlight some critical points found in the hospital and show that a rapid detection of strains with resistance genes and the genetic profiles circulating in the hospital, may contribute in the conduits for the reduction of hospital infection.