Made available in DSpace on 2014-12-17T15:49:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 NerivaniaNG_DISSERT.pdf: 4462053 bytes, checksum: bf282e929e5cb41585970850c4d05edb (MD5) Previous issue date: 2013-03-25 / The family Entomobryidae is one of the most diverse families of Collembola in Northeast Brazil. Data on its diversity may be considered undervalued due to low collection efforts in the region. In this study, five areas in the Northeast region were sampled, to evaluate the species richness of this family. The study was done in the Serra da Jib?ia, Santa Terezinha municipality, Bahia; Serra das Confus?es, Caracol municipality, Piau?; Chapada do Araripe, Crato municipality, Cear?; Mata do Pau-Ferro, Areia municipality, Para?ba and Parque Nacional de Ubajara, Ubajara municipality, Cear?, all considered humid areas of Caatinga. Collections were made using pitfall traps and entomological aspirators. All the collected material was screened, mounted on slides, identified and, finally, the descriptions of some of the new species encountered were made. A total of 48 Entomobryidae species belonging to nine genera were recorded and 27 of these were new to science, representing a percentage of 56.25% of the total. A new record for Brazil was identified and several new records were made to the States. Seira was the genus with wider distribution and it was the only one found in all areas and the most representative with the highest number of recorded species (26). This result was expected, because individuals of the genus Seira have a good adaptability to semi-arid environments, a fact that has already been proven in previous research. Seven new species of Seira were described. A dichotomous key to genera and species of Seirini from Brazil was drafted. This work demonstrates the great potential of Entomobryidae and Seirini in the Northeast, despite having been held in very restricted areas, obtained important results for the knowledge of fauna of the group / A fam?lia Entomobryidae ? uma das mais diversas fam?lias de Collembola do Nordeste Brasileiro. Dados sobre sua diversidade podem ser considerados subestimados devido ao baixo esfor?o de coleta na regi?o. No presente estudo, foram realizadas coletas em cinco localidades do Nordeste, nunca antes amostradas, objetivando avaliar a riqueza de esp?cies desta fam?lia. O estudo foi feito na Serra da Jib?ia, munic?pio de Santa Teresinha, Bahia; Serra das Confus?es, munic?pio de Caracol, Piau?; Chapada do Araripe, mun?cipio do Crato, Cear?; Mata do Pau-Ferro, munic?pio de Areia, Para?ba; e Parque Nacional de Ubajara, munic?pio de Ubajara, Cear?, todas consideradas ?reas ?midas da Caatinga. As coletas foram feitas utilizando-se armadilhas de queda do tipo pitfall e aspiradores entomol?gicos. Todo o material coletado foi triado, montado em l?minas, identificado e, por fim, foram feitas as descri??es de algumas das esp?cies novas encontradas. Um total de 48 esp?cies de Entomobryidae pertencentes a nove g?neros foram registradas e 27 destas s?o esp?cies novas para a ci?ncia, o que representa um percentual de 56,25% do total. Um novo registro de esp?cie para o Brasil foi identificado e novos registros para os estados foram feitos. O g?nero que possuiu distribui??o mais ampla foi Seira, o ?nico encontrado em todas as ?reas e o mais representativo com o maior n?mero de esp?cies registradas (26). Esse resultado j? era esperado, pois indiv?duos do g?nero Seira possuem uma boa adaptabilidade a ambientes semi-?ridos, fato que j? foi comprovado em pesquisas anteriores. Sete novas esp?cies do g?nero Seira foram descritas. Uma chave dicot?mica de identifica??o dos g?neros e esp?cies de Seirini com ocorr?ncia no Brasil foi elaborada. Este trabalho demonstrou o grande potencial de Entomobryidae e Seirini no Nordeste, visto que, apesar de ter sido realizado em ?reas bem restritas, obteve resultados importantes para o conhecimento da fauna do grupo

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:01:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CamilaRC.pdf: 3632183 bytes, checksum: 9261ead3efb5036a43a01c80ef0da51a (MD5) Previous issue date: 2009-11-25 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Spatial-temporal dynamics of zooplankton in the Caravelas river estuary (Bahia, Brazil). The survey was conducted in order to describe the zooplankton community of the estuary Caravelas (Bahia, Brazil), to quantify and relate the patterns of horizontal and vertical transport with the type of tide (neap and spring) and tidal phase (flood and ebb). Zooplankton samples were collected with the aid of a suction pump (300L), filtered in plankton nets (300μm) and fixed in saline formalin 4%. Samples were collected at a fixed point (A1), near the mouth of the estuary, with samples taken at neap tides and spring tides during the dry and rainy seasons. Samples were collected for 13 hours, at intervals of 1 hour in 3 depths: surface, middle and bottom. Simultaneous collection of biological, we measured the current velocity, temperature and salinity of the water through CTD. In the laboratory, samples were selected for analysis in estereomicroscope, with 25 groups identified, with Copepoda getting the highest number of species. The 168 samples obtained from temporal samples were subsampled and processed on equipment ZooScan, with the aid of software ZooProcess at the end were generated 458.997 vingnettes. 8 taxa were identified automatically, with 16 classified as a semi-automatic. The group Copepoda, despite the limited taxonomic refinement ZooScan, obtained 2 genera and 1 species identified automatically. Among the seasons dry and wet groups Brachyura (zoea), Chaetognatha, and the Calanoid copepods (others), Temora spp., Oithona spp. and Euterpina acutifrons were those who had higher frequency of occurrence, appearing in more than 70% of the samples. Copepoda group showed the largest percentage of relative abundance in both seasons. There was no seasonal variation of total zooplankton, with an average density of 7826?4219 org.m-3 in the dry season, and 7959?3675 org.m-3 in the rainy season, neither between the types and phases of the tides, but seasonal differences were significant recorded for the main zooplankton groups. Vertical stratification was seen for the major zooplankton groups (Brachyura, Chaetognatha, Calanoida (other), Oithona spp, Temora spp. e Euterpina acutifrons). The scale of this stratification varied with the type (square or tide) and tidal phase (flood or ebb). The instantaneous transport was more influenced by current velocity, with higher values observed in spring tides to the total zooplankton, however, there was a variation of this pattern depending on the zooplankton group. According to the data import and export of total zooplankton, the outflow of organisms of the estuary was higher than the input. The results suggest that the estuary of Caravelas may influence the dynamics of organic matter to the adjacent coast, with possible consequences in National Marine Park of Abrolhos / Din?mica espacial e temporal do zoopl?ncton no estu?rio do rio Caravelas (Bahia, Brasil). A pesquisa foi realizada no intuito de descrever a comunidade zooplanct?nica do estu?rio do rio Caravelas (Bahia, Brasil), al?m de quantificar e relacionar os padr?es de transporte horizontal e vertical com os tipos de mar? (quadratura e siz?gia) e fases de mar? (enchente e vazante). As amostras do zoopl?ncton foram coletadas com aux?lio de bomba de suc??o (300L), filtradas em redes de pl?ncton (300μm) e fixadas em solu??o salina de formol a 4%. As coletas foram realizadas em um ponto fixo (A1), pr?ximo a desembocadura do estu?rio, com amostras obtidas nas mar?s de quadratura e siz?gia durante os per?odos seco e chuvoso. As amostragens foram feitas durante 13 horas, em intervalos de 1 hora, em 3 n?veis de profundidade: superf?cie, meio e fundo. Simult?nea ? coleta biol?gica, foram medidos a velocidade das correntes, temperatura e salinidade da ?gua, atrav?s de CTD. Em laborat?rio, amostras foram selecionadas para an?lise em lupa, sendo 25 grupos identificados, com Copepoda obtendo o maior n?mero de esp?cie. As 168 amostras provindas das coletas temporais foram subamostradas e processadas no equipamento ZooScan, com aux?lio do software ZooProcess, ao final foram geradas 458.997 vinhetas. Foram identificados 8 t?xons automaticamente, com mais 16 classificados de forma semi-autom?tica. O grupo Copepoda, apesar do refinamento taxon?mico limitado do ZooScan, obteve 2 g?neros e 1 esp?cie identificada de maneira autom?tica. Entre as campanhas seca e chuvosa os grupos Brachyura (zoea), Chaetognatha, al?m dos cop?podes Calanoida (outros), Temora spp., Oithona spp. e Euterpina acutifrons foram os que tiveram maior freq??ncia de ocorr?ncia, aparecendo em mais de 70% das amostras. O grupo Copepoda foi o que apresentou os maiores percentuais de abund?ncia relativa em ambas as campanhas. N?o houve varia??o sazonal do zoopl?ncton total, com densidade m?dia de 7826?4219 org.m-3 no per?odo seco, e 7959?3675 org.m-3 no chuvoso, nem entre os tipos e fases das mar?s, contudo diferen?as sazonais significativas foram registradas para os principais grupos zooplanct?nicos. Foi vista estratifica??o vertical para os principais grupos zooplanct?nicos (Brachyura, Chaetognatha, Calanoida (outros), Oithona spp, Temora spp. e Euterpina acutifrons). A amplitude desta estratifica??o variou com o tipo (quadratura ou siz?gia) ou fase de mar? (enchente ou vazante). O transporte instant?neo foi mais influenciado pela velocidade das correntes, com maiores valores observados nas mar?s de siz?gia para o zoopl?ncton total, entretanto, houve varia??o deste padr?o dependendo do grupo zooplanct?nico. De acordo com os dados de importa??o e exporta??o do zoopl?ncton total, o fluxo de sa?da de organismos do estu?rio foi superior ? entrada. Os resultados sugerem que a regi?o estuarina de Caravelas pode exercer influ?ncia na din?mica de mat?ria para a ?rea costeira adjacente, com poss?veis reflexos no Parque Nacional Marinho dos Abrolhos

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:01:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 BriggidaDM.pdf: 1596693 bytes, checksum: 9715f450449b483eb851c1d730270c57 (MD5) Previous issue date: 2009-08-28 / The rotary dryer is one of the most used equipments in processing industries. Its automatic control mode of operation is important specially to keep the moisture content of the final product in the desired value. The classical control strategies, like PID (proportional integral derivative) control, are largely used in the industrial sector because of its robustness and because they are easy to be implemented. In this work, a data acquisition system was implemented for monitoring the most relevant process variables, like: both inlet and outlet drying air temperature, dryer rotation, outlet air speed and humidity, and mass of the final product. Openloop tests were realized to identify a mathematical model able to represent the drying process for the rotary system. From this model, a PID controller was tuned using a direct synthesis method, assuming a first order trajectory. The PID controller was implemented in the system in order to control the inlet drying air temperature. By the end, closedloop tests (operating in automatic mode) were realized to observe the controller performance, and, after setting the best tune, experiments were realized using passion fruit seeds as raw material. The experiments realized in closedloop showed a satisfactory performance by the implemented control strategy for the drying air temperature of the rotary system / O secador rotat?rio ? um dos equipamentos amplamente utilizados nas ind?strias de processamento. Sua opera??o em modo de controle autom?tico ? importante para manter, principalmente, a umidade do produto final na especifica??o de interesse. As estrat?gias de controle cl?ssicas, tais como o controle PID (proporcional integral derivativo), s?o largamente utilizadas no setor industrial devido ? sua robustez e facilidade de implementa??o. Neste trabalho foi implementado um sistema de aquisi??o de dados para o monitoramento das vari?veis mais relevantes do processo de secagem, tais como: temperatura do g?s na entrada e na sa?da do secador, rota??o do tambor, velocidade e umidade do ar na sa?da do secador, e massa do produto final. Testes em malha aberta foram realizados para identificar um modelo matem?tico capaz de representar o processo de secagem no sistema rotat?rio. A partir deste modelo, o controlador PID foi sintonizado utilizando o m?todo de s?ntese direta e admitindo uma trajet?ria de primeira ordem. O controlador PID foi implementado no sistema com o objetivo de controlar a temperatura do ar de secagem na alimenta??o do secador. Por fim, testes em malha fechada (operando em modo autom?tico) foram realizados para observar o desempenho do controlador e, com a melhor sintonia definida, experimentos com a mat?riaprima, rejeito de maracuj?, se procederam. Os ensaios realizados em malha fechada permitiram verificar um desempenho satisfat?rio da estrat?gia de controle implementada para a temperatura do ar de secagem do sistema rotat?rio

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-03-12T20:41:14Z No. of bitstreams: 1 AlcemyGabrielVitorSeverino_DISSERT.pdf: 2366907 bytes, checksum: 9c123928f1facabf2097d270c1a468ad (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-03-19T11:45:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AlcemyGabrielVitorSeverino_DISSERT.pdf: 2366907 bytes, checksum: 9c123928f1facabf2097d270c1a468ad (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-19T11:45:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AlcemyGabrielVitorSeverino_DISSERT.pdf: 2366907 bytes, checksum: 9c123928f1facabf2097d270c1a468ad (MD5) Previous issue date: 2017-12-08 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A identifica??o de sistemas tem como objetivo determinar modelos matem?ticos capazes de descrever suas caracter?sticas din?micas a partir de observa??es. Geralmente, o processo de identifica??o ? dividido nas seguintes etapas: i) coleta de dados experimentais, ii) determina??o da estrutura do modelo, iii) estima??o de par?metros e iv) valida??o do modelo. Neste trabalho investiga-se o problema da determina??o de estruturas. A partir de t?cnicas de otimiza??o conhecidas como meta-heur?sticas, foi desenvolvido um algoritmo para determina??o da estrutura de modelos NARX polinomiais. Diferente dos m?todos tradicionais, as meta-heur?sticas utilizam um conjunto de poss?veis solu??es e estrat?gias, geralmente baseadas na natureza, para encontrar a solu??o do caso aplicado. Dentre as t?cnicas estudadas est?o o algoritmo gen?tico, a otimiza??o por enxame de part?culas e o algoritmo do morcego. A metodologia proposta foi aplicada na identifica??o de tr?s exemplos experimentais: um aquecedor el?trico, um conversor buck e uma v?lvula pneum?tica. Os resultados demonstram que meta-heur?sticas podem ser aplicadas no problema da sele??o de estruturas em modelos NARX polinomiais. / System identification has the goal to determine mathematical models to describe dynamic characteristics of systems from observations. The identification process is generally divided into the following steps: i) experimental data collection, ii) determination of model structure, iii) parameter estimation and iv) model validation. In this work, the problem determining of structures is investigated. An algorithm was developed to determine the structure of polynomial NARX models using optimization techniques known as meta-heuristics. Unlike traditional methods, metaheuristics use a set of possible solutions and strategies, usually based on nature, to find the solution of the case applied. Among the techniques studied are the genetic algorithm, the particle swarm optimization, and the bat algorithm. The methodology proposed in this work was applied to identify three experimental examples: an electric heater, a buck converter and a pneumatic valve. The results demonstrate that metaheuristics can be applied to the problem of the selection of polynomial NARX model structures.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-04-03T19:47:15Z No. of bitstreams: 1 CarlosDeyvinsonRegesBessa_DISSERT.pdf: 1836128 bytes, checksum: 011b308c5bf1f343af8959cc6d45f0b6 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-04-06T19:10:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CarlosDeyvinsonRegesBessa_DISSERT.pdf: 1836128 bytes, checksum: 011b308c5bf1f343af8959cc6d45f0b6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-06T19:10:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CarlosDeyvinsonRegesBessa_DISSERT.pdf: 1836128 bytes, checksum: 011b308c5bf1f343af8959cc6d45f0b6 (MD5) Previous issue date: 2016-12-19 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Este trabalho tem como enfoque as dificuldades envolvidas em controlar sistemas de or-dem superior com atraso de transporte, onde a solu??o adotada para amenizar o efeito cau-sado pelo atraso ? a utiliza??o de um algoritmo de predi??o, composto pelas t?cnicas do Preditor de Smith e do Preditor de Smith Filtrado. Analisando os casos em que o modelo do sistema usado no algoritmo de predi??o n?o ? id?ntico ao real, foi poss?vel constatar a presen?a de erro na din?mica do sistema. Este erro pode amplificar o esfor?o de controle e o desgaste prematuro dos equipamentos envolvidos, levando em alguns casos a desestabili-zar o sistema. Diante disto, foi proposto o desenvolvimento de um sistema capaz de tratar as incertezas decorrentes da diferen?a entre o modelo e o sistema real, reduzindo o efeito do atraso de transporte sobre o sistema de controle. Como resultado foi gerada uma ferra-menta, que atua de forma aceit?vel para os casos testados, ajustando o modelo do processo e, consequentemente, melhorando a compensa??o de tempo morto. / This work considers the difficulties involved in the control of higher order systems with transport delay, where the solution adopted to mitigate the effect caused by the delay is the use of a prediction algorithm composed of the Smith Predictor techniques and Filtered Smith Predictor. Analyzing the cases where the system model used in the prediction algo-rithm is not identical to the real system, the presence of error in the system dynamics was observed. This error may amplify the control effort and cause premature wear of the equipment involved, in some cases leading the system to instability. In this manner, the development of a tool to treat uncertainties originated from the difference between the sys-tem model and the real system, thereby reducing the effect of transmission delay of the control system, has been proposed. A software to adjust the process model and thus im-prove the dead time compensation was implemented.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:56:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 411919.pdf: 95508 bytes, checksum: 83f7795c6e787311fae6cbcf09b2ee06 (MD5) Previous issue date: 2009-11-27 / O objetivo deste trabalho ? o desenvolvimento de um sistema programa??o autom?tica de bombas de infus?o atrav?s da utiliza??o da tecnologia de identifica??o por r?dio freq??ncia (RFID), prevendo a sua integra??o com um sistema de informa??o hospitalar. Dentro da rotina hospitalar podem ocorrer erros na administra??o de infusoterapia devido a informa??es ausentes ou incorretas e tamb?m pelo erro da programa??o da bomba. Estes erros podem acarretar s?rios danos a sa?de do paciente. Os erros podem ocorrer em qualquer momento desde a prescri??o m?dica at? o procedimento de infus?o no paciente propriamente dito. Um m?dulo de prescri??o eletr?nica foi desenvolvido com a finalidade de gerenciar e armazenar prescri??es eletr?nicas de infusoterapia. Este m?dulo ? baseado em web para permitir sua utiliza??o em qualquer ambiente do hospital com acesso a rede local. O m?dulo desenvolvido faz o papel do sistema de informa??o hospitalar. Foi desenvolvido neste trabalho, um m?dulo de grava??o para etiquetas RFID integr?vel com o sistema de informa??o hospitalar (HIS). Este m?dulo ? capaz de se conectar ao banco de dados requisitando a lista de prescri??es de infusoterapia e apresentar ao farmac?utico que seleciona e grava os dados numa etiqueta inteligente RFID. E esta etiqueta ? ent?o colada na seringa que cont?m o f?rmaco prescrito. Foi desenvolvido um firmware auxiliar para bombas de infus?o de seringa, que permite a comunica??o da bomba com um m?dulo leitor RFID, a leitura e a decodifica??o dos dados contidos na etiqueta RFID, e a programa??o dos par?metros correspondentes da bomba. Este trabalho constitui uma ferramenta de aux?lio para a redu??o de erros nos procedimentos de infusoterapia dentro do ambiente hospitalar. Os m?dulos e o firmware desenvolvidos neste projeto completam o ciclo de automa??o de informa??es dentro do hospital para procedimentos de infusoterapia, pois abrangem desde a prescri??o do f?rmaco, manipula??o da informa??o na farm?cia do hospital at? sua administra??o no paciente.

Submitted by PPG Zoologia (zoologia-pg@pucrs.br) on 2018-05-18T17:22:44Z No. of bitstreams: 1 dissertacao_mestrado_final_paulochaves.pdf: 4426171 bytes, checksum: 8be6ef944f497d1a9518754ebfbc27c1 (MD5) / Approved for entry into archive by Sheila Dias (sheila.dias@pucrs.br) on 2018-05-28T12:19:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dissertacao_mestrado_final_paulochaves.pdf: 4426171 bytes, checksum: 8be6ef944f497d1a9518754ebfbc27c1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-28T12:35:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_mestrado_final_paulochaves.pdf: 4426171 bytes, checksum: 8be6ef944f497d1a9518754ebfbc27c1 (MD5) Previous issue date: 2008-03-20 / Sequ?ncias de DNA usadas na identifica??o de material biol?gico t?m alcan?ado consider?vel popularidade nos ?ltimos anos, especialmente no contexto dos c?digos de barras de DNA. Aferir a esp?cie de origem em amostras de pelos, penas, peles e particularmente fezes ? um passo fundamental para quem estuda a ecologia e evolu??o de diversos animais com este tipo de amostra. Este ? o caso em carn?voros, cujos h?bitos furtivos e baixas densidades populacionais de algumas esp?cies evidenciam a import?ncia de estudos baseados em amostras n?o-invasivas. Entretanto a atual escassez de ensaios padronizados de identifica??o de carn?voros freq?entemente dificulta a aplica??o dessas amostras em larga escala e compara??es de resultados entre diferentes localidades. No presente estudo n?s avaliamos dois segmentos curtos (<250 pb) de DNA mitochondrial (mtDNA) localizados nos genes ATP sintase 6 e citocromo oxidase I com potencial de servirem como marcadores-padr?o para identifica??o de carn?voros. Entre um e 11 indiv?duos de 66 esp?cies de carn?voros foram seq?enciados para um ou ambos os segmentos do mtDNA e analisados usando tr?s diferentes m?todos (?rvore de dist?ncia, dist?ncia gen?tica e an?lise de caracteres). Em geral, indiv?duos conspec?ficos apresentaram menor dist?ncia gen?tica entre si do que em rela??o a outras esp?cies, formando agrupamentos monofil?ticos. Exce??es foram algumas esp?cies que divergiram recentemente, algumas das quais ainda puderam ser identificadas pelo m?todo de caracteres, hapl?tipos esp?cie-espec?ficos, ou reduzindo a abrang?ncia geogr?fica das compara??es (restringindo a an?lise a uma regi?o zoogeogr?fica). An?lises in silico, usando um segmento curto do citocromo b freq?entemente empregado em carn?voros, tamb?m foram realizadas para comparar o desempenho deste segmento em rela??o aos outros dois propostos. N?s ent?o testamos o desempenho destes segmentos na identifica??o de fezes de carn?voros por meio de tr?s estudos de caso: (i) fezes de felinos de zool?gico, objetivando-se verificar o potencial de contamina??o das seq?encias com DNA da presa (coelho); (ii) fezes coletadas no Cerrado brasileiro contendo restos de presas (p?los, ossos, penas), supostamente proveniente de lobo-guar?, objetivando-se investigar a efici?ncia de identifica??o do predador e ocorr?ncia de interfer?ncia do DNA da presa na identifica??o; e (iii) fezes coletadas em uma reserva na Mata Atl?ntica, tamb?m com o objetivo de avaliar a efici?ncia de identifica??o. Apesar de diferen?as em alguns aspectos de sua performance, nossos resultados indicam que os dois segmentos propostos t?m um bom potencial de servir como marcadores moleculares eficientes para identifica??o acurada de amostras de carn?voros ao n?vel de esp?cie. / DNA sequences for species-level identification of biological materials have achieved considerable popularity in the last few years, especially in the context of the DNA barcoding initiative. Species assignment of biological samples such as hairs, feathers, pelts and particularly faeces is a crucial step for those interested in studying ecology and evolution of many species with these samples. This is especially the case for carnivores, whose elusive habits and low densities highlight the importance of studies based on noninvasive samples. However, the current lack of standardized assays for carnivore identification often poses challenges to the large-scale application of this approach, as well as the cross-comparison of results among sites. Here we evaluate the potential of two short (<250 pb) mitochondrial DNA (mtDNA) segments located within the genes ATP synthase 6 and cytochrome oxidase I as standardized markers for carnivore identification. Between one and eleven individuals of 66 carnivore species were sequenced for one or both of these mtDNA segments and analyzed using three different approaches (tree-based, distance-based and character-based), in conjunction with sequences retrieved from public databases. In most cases, conspecific individuals had lower genetic distances from each other relative to other species, resulting in diagnosable monophyletic clusters. Notable exceptions were the more recently diverged species, some of which could still be identified using diagnostic character attributes, species-specific haplotypes, or by reducing the geographic scope of the comparison (restricting the analysis to a single zoogeographic region). Additional in silico analyses using a short cytochrome b segment frequently employed in carnivore identification were also performed aiming to compare performance to that of our two focal markers. We then tested the performance of these segments in the identification of carnivore faeces via three case studies: (i) felid faeces collected in a controlled zoo experiment, aimed at assessing whether DNA from rabbit prey would contaminate the resulting sequences; (ii) field-collected faeces from the Brazilian Cerrado presumed to be from maned wolves and containing prey remains (hairs, bones, feathers), aimed at investigating the efficiency of predator identification and occurrence of prey DNA interference; and (iii) field-collected scats from an Atlantic Forest study site, also addressing the issue of PCR success rate and identification efficiency. In spite of some relevant differences in some aspects of their performance, our results indicate that both of our focal segments have a good potential to serve as efficient molecular markers for accurate species-level identification of carnivore samples.

Submitted by PPG Ci?ncia da Computa??o (ppgcc@pucrs.br) on 2018-06-26T11:05:37Z No. of bitstreams: 1 MATEUS_PRESOTTO_BALEN_DIS.pdf: 1919889 bytes, checksum: 44d920fb6535d287fb71793205e67ca4 (MD5) / Approved for entry into archive by Sheila Dias (sheila.dias@pucrs.br) on 2018-07-02T11:52:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MATEUS_PRESOTTO_BALEN_DIS.pdf: 1919889 bytes, checksum: 44d920fb6535d287fb71793205e67ca4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-02T12:08:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MATEUS_PRESOTTO_BALEN_DIS.pdf: 1919889 bytes, checksum: 44d920fb6535d287fb71793205e67ca4 (MD5) Previous issue date: 2018-03-12 / Software systems have become larger and more complex with considerable dissemination in many industries. Due to the need to become more comprehensive, eventually, operationally and managerially independent systems tend to interoperate with themselves. This integration between independent systems with evolutionary nature and geographically distributed results a class of systems called System-of-Systems. Considering that the architeture of software defines a base structure of a system and the engineering of requirements identifieds the necessary functionalities for a system, these activities are essential for any system, as a consequence, the identification of the stakeholders of a system becomes a primordial activity to elicit the necessary requirements and consequently build the system with the expected functionalities. This study preesents a process and a model for the identification of the main stakeholders of Acknowledged System-of-Systems with the objective of minimizing the problems caused in the definitions of requirements system and software architecture in thus category system. / Sistemas de software t?m se tornado maiores e mais complexos com consider?vel dissemina??o em muitas ?reas. Devido ? necessidade de se tornarem mais abrangentes, eventualmente, os sistemas operacionalmente e gerencialmente independentes tendem a interoperar entre eles. Esta integra??o entre sistemas independentes com natureza evolutiva e geograficamente distribu?do resulta uma classe de sistemas chamada Sistema-de-Sistemas. Uma vez que a Arquitetura de Software define a estrutura base de um sistema e a Engenharia de Requisitos identifica as funcionalidades necess?rias para um sistema, entende-se que essas atividades s?o essenciais para qualquer sistema, assim tornando a identifica??o dos stakeholders de um sistema uma atividade primordial para elicitar os requisitos necess?rios e, consequentemente, construir o sistema com as funcionalidades esperadas. Esta disserta??o apresenta um processo e um modelo para a identifica??o dos principais stakeholders de Sistema-de-Sistemas Acknowledged com o intuito de minimizar os problemas causados nas defini??es dos requisitos do sistema e da arquitetura de software por desconhecer os principais stakeholders.

Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-10-25T13:39:22Z No. of bitstreams: 1 2015 - Carine Cristina Gon?alves Galv?o.pdf: 2315391 bytes, checksum: 154e1cdd3a9bb2de5fd18d636c4a6543 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-25T13:39:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015 - Carine Cristina Gon?alves Galv?o.pdf: 2315391 bytes, checksum: 154e1cdd3a9bb2de5fd18d636c4a6543 (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / Funda??o Carlos Chagas Filho de Amparo ? Pesquisa do Estado do RJ - FAPERJ / Some animals have extremely complex relationships including the formation of matriarchal societies, alliances and communities, specific long-term relationships, and formation of flexible groups, such as dolphins. Ilha Grande Bay, along with Sepetiba Bay, have the largest population of Sotalia guianensis throughout its distribution, with about 1311 individuals in the first one, and 1043 individuals in the second, where it has been registered groups with up to 450 individuals. This study aimed to analyze the social organization of the mothers of S. guianensis from Ilha Grande Bay. The mothers were considered those dolphins observed at least five times in high proximity of a calf; all its associates were also classified as females and included in the analysis. The analysis of these mothers? social structure was carried out in SOCPROG? software (2.5 version) using a Half Weight Index (HWI). It was performed an analysis of the community division by modularity which indicated that individuals do not form independent clusters. A Monte Carlo permutation test was done and showed the presence of preferred associations among some dyads. Finally, a temporal analysis was performed with the use of mathematical models fitted to the Lagged Association Rate to try to explain how associations behave over time. The social structure of the 25 mothers identified in Ilha Grande Bay seems to be poorly differentiated, forming a large social network with weak associations between dyads, and following a fission-fusion dynamics. There was no statistical difference in the associations between and within classes (mothers X females). This work is a contribution to the understanding of the species? social dynamics, which are still poorly known, and highlights the need for more research in the area. / Alguns animais possuem rela??es extremamente complexas, incluindo forma??o de sociedades matriarcais, alian?as e comunidades, relacionamentos espec?ficos de longa dura??o, e forma??o de grupos flex?veis, como ? o caso dos golfinhos. A Ba?a da Ilha Grande, juntamente com a Ba?a de Sepetiba, possui a maior popula??o de Sotalia guianensis em toda a sua distribui??o, com estimativa de 1311 indiv?duos na primeira, e 1043 indiv?duos na segunda, onde j? foram registrados grupos com at? 450 indiv?duos. Este trabalho teve como objetivo analisar a organiza??o social das m?es de S. guianensis da Ba?a da Ilha Grande. Foram consideradas m?es aqueles golfinhos vistos no m?nimo cinco vezes em forte proximidade de um filhote, e todos os seus associados foram classificados como f?meas e inclu?dos nas an?lises. A an?lise da estrutura social destas m?es foi feito no programa SOCPROG? (vers?o 2.5) atrav?s do ?ndice Half Weight (HWI). Foi feita uma an?lise de divis?o de comunidades por modularidade que indicou que os indiv?duos n?o formam agrega??es independentes. Um teste de permuta??o de Monte Carlo foi realizado e mostrou a presen?a de associa??es preferidas entre algumas duplas. Por fim, uma an?lise temporal foi realizada com a utiliza??o de modelos matem?ticos ajustados ? Lagged Association Rate para tentar explicar como as associa??es se comportam no decorrer do tempo. A estrutura social das 25 m?es identificadas de S. guianensis na Ba?a da Ilha Grande se mostrou pouco diferenciada, formando uma grande rede com fracas associa??es entre duplas, seguindo uma din?mica de fiss?o-fus?o. N?o houve diferen?a estat?stica nas associa??es entre e dentro das classes (m?es X f?meas). Este trabalho ? uma contribui??o para o entendimento das din?micas sociais da esp?cie, que ainda s?o pouco conhecidas, e ressalta a necessidade de mais pesquisas na ?rea.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:48:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LarissaAS_DISSERT.pdf: 2513975 bytes, checksum: c4af91c9ccb8a615b65c89426c2338d2 (MD5) Previous issue date: 2013-02-05 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / When crosscutting concerns identification is performed from the beginning of development, on the activities involved in requirements engineering, there are many gains in terms of quality, cost and efficiency throughout the lifecycle of software development. This early identification supports the evolution of requirements, detects possible flaws in the requirements specification, improves traceability among requirements, provides better software modularity and prevents possible rework. However, despite these several advantages, the crosscutting concerns identification over requirements engineering faces several difficulties such as the lack of systematization and tools that support it. Furthermore, it is difficult to justify why some concerns are identified as crosscutting or not, since this identification is, most often, made without any methodology that systematizes and bases it. In this context, this paper proposes an approach based on Grounded Theory, called GT4CCI, for systematizing and basing the process of identifying crosscutting concerns in the initial stages of the software development process in the requirements document. Grounded Theory is a renowned methodology for qualitative analysis of data. Through the use of GT4CCI it is possible to better understand, track and document concerns, adding gains in terms of quality, reliability and modularity of the entire lifecycle of software / Quando a identifica??o de interesses transversais ? feita desde o princ?pio do processo de desenvolvimento de software, ainda nas atividades relacionadas ? Engenharia de Requisitos, muitos s?o os ganhos em termos de qualidade, custo e efici?ncia ao longo do ciclo de vida do software. Esta identifica??o precoce d? suporte ? evolu??o de requisitos, detecta poss?veis falhas na especifica??o de requisitos, melhora a rastreabilidade entre os requisitos, proporciona uma melhor modulariza??o de software e previne poss?veis retrabalhos. Entretanto, apesar de todas estas vantagens, a identifica??o de interesses enfrenta diversas dificuldades, tais como a falta de sistematiza??o e de ferramentas que a ofere?am um bom suporte. Al?m disto, ? dif?cil, muitas vezes, justificar as raz?es pelas quais alguns interesses s?o ou n?o considerados transversais, uma vez que esta identifica??o ?, na maioria das vezes, feita sem qualquer metodologia que a sistematize e a embase. Neste contexto, este trabalho prop?e uma abordagem baseada nos princ?pios da Grounded Theory, chamada GT4CCI, que sistematiza e embasa o processo de identifica??o de interesses transversais nas etapas mais iniciais do processo de desenvolvimento de software, utilizando o documento de requisitos como artefato para a identifica??o. Grounded Theory ? uma renomada metodologia para a an?lise qualitativa de dados. Atrav?s do uso da abordagem GT4CCI ? poss?vel melhor compreender, rastrear e documentar interesses, adicionando assim ganhos em termos de qualidade, confiabilidade e modulariza??o ? todo o ciclo de vida do software