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Efeito da utilização de diferentes critérios de controle de qualidade dos genótipos em estudos de associação e seleção genômica amplaBresolin, Tiago [UNESP] 30 July 2015 (has links) (PDF)
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000855289.pdf: 556396 bytes, checksum: 4e85edbcc33683600669d9e398de7842 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Na seleção genômica os estudos se concentram em estimar a habilidade ou acurácia de predição genômica. A acurácia de predição pode ser afetada por muitos fatores como a herdabilidade da característica, o tamanho efetivo da população, a densidade dos marcadores, o tamanho do genoma, o número de loci afetando a característica e distribuição dos seus efeitos, o desequilíbrio de ligação e o tipo e número de informações fenotípicas usadas nas análises estatísticas. Contudo, muitos desses fatores podem ser direta ou indiretamente afetados pela edição do conjunto de marcadores, podendo influenciar a acurácia de predição genômica. Para os estudos de associação genômica ampla a falta de qualidade dos dados genômicos pode levar a resultados falso-negativos ou positivos na fase de descoberta das regiões associadas a características de importância econômica. Além disso, o controle de qualidade pode levar a perdas de marcadores que capturam uma proporção significativa da variância genética. Sendo assim, este estudo teve como objetivos avaliar o efeito do controle de qualidade, da densidade e da frequência alélica dos marcadores sobre a seleção genômica e o efeito do controle de qualidade dos marcadores nos estudos de associação genômica ampla, em bovinos da raça Nelore. Para isso foram utilizadas informações fenotípicas, genotípicas e de pedigree provenientes de fazendas que integram os programas de melhoramento genético da DeltaGen e CRV Paint. Foram utilizadas as características idade ao primeiro parto, peso à desmama e peso ao sobreano. Os animais foram genotipados com o painel Illumina Bovine HD, que contém, aproximadamente, 777.000 SNPs. Os fenótipos foram pré-corrigidos para os efeitos fixos, utilizando um modelo animal uni-característica. Para a seleção genômica foram criados 1) três cenários com diferentes limiares de exclusão dos SNPs de acordo com os critérios de controle... / In the genomic selection, the main objective of studies is to estimate the ability or accuracy of genomic prediction. The accuracy of genomic prediction can be influence for the following factors: heritability of the trait, effective population size, maker density, genome, number of loci affecting the trait and distribution of their effects, linkage disequilibrium and number and type of phenotype information used in the statistical analyzes. However, many of this factors described above may be directly or indirectly influenced by the quality control of the makers and, as a consequence, the accuracy of genomic prediction may be affected. For genome-wide association studies, the low quality data can lead to false-negative or positive results in the discovery phase of the regions associated with economic traits. On the other hand, the use of a quality control may remove markers that capture a significant proportion of the genetic variance. Therefore, the objective of this study was evaluate the effect of quality control, density and allele frequency of markers on the genomic selection and the effect of quality control of makers on genome-wide association studies in Nellore breed. Phenotype, genotype and pedigree information, belonging to two breeding programs - DeltaGen and CRV Paint, were used. Age at first calving, weaning weight and yearling weight traits were studied. The animals were genotyped using the Illumina Bovine HD panel which contains 777 thousand SNP markers, approximately. The phenotype was corrected by the fixed effects using a single trait animal model. To the genomic selection were created: 1) three scenarios with different exclusion threshold of SNP markers according to quality control criteria; 2) seven sub panels with different markers density ranging from 10,000 to 734,272 SNP markers; and 3) five bins of markers based on the minor allele frequency. In the genomic selection Genomic ... / FAPESP: 2013/26264-4
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Insetos bentônicos como indicadores da qualidade da água em áreas reabilitadas após mineração de carvão no sul de Santa CatarinaCampos, Thaiane da Silva Teixeira January 2012 (has links)
Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais da Universidade do Extremo Sul Catarinense – Unesc, como requisito parcial para obtenção do título de mestre em ciências ambientais. / A qualidade dos recursos naturais no sul catarinense sofreu um impacto negativo com a atividade mineradora do carvão no século XIX. Projetos de recuperação ambiental estão sendo implantados há quase uma década, modificando o cenário da qualidade ambiental na região. A Companhia Siderúrgica Nacional (CSN) já reabilitou mais de 135 ha, sendo uma delas conhecida como Campo Mina Malha II Leste, a qual se apresenta em estágio mais avançado de reabilitação em relação às demais. A área localiza-se a noroeste do município de Siderópolis, é drenada pelo rio Fiorita, que, por sua vez, integra a sub-bacia do rio Mãe Luzia, um dos principais tributários da bacia hidrográfica do rio Araranguá. O objetivo deste trabalho foi verificar se o processo de reabilitação das áreas degradadas resulta em uma melhora na qualidade da água, utilizando-se insetos bentônicos como indicadores, e se as características físico-químicas da água exercem influência sobre a fauna bentônica. As coletas da fauna aquática foram realizadas na sub-bacia do rio Fiorita, durante o período de fevereiro de 2011 a janeiro de 2012, com amostragens mensais em três pontos (P01, P02 e P03). O ponto P01 se encontra em áreas sem influência de poluição pela mineração de carvão, mantendo as condições naturais da água; o ponto P02 está localizado em uma área reabilitada em 2006; e o ponto P03, em uma área degradada. Os insetos foram coletados ao longo de 10 metros de cada ponto amostral, com o uso de uma rede entomológica do tipo Súrber, malha 1mm, por meio da virada de pedras e revolvimento de substrato. Em laboratório, os exemplares foram identificados até nível de família. Para avaliar a qualidade da água, foram registrados in loco o pH, a condutividade, a temperatura, a vazão e o OD. Para avaliar a estrutura da entomofauna aquática, foram calculados os índices de diversidade e equitabilidade e analisada a similaridade entre os três pontos amostrais. Os resultados obtidos comprovaram o sucesso do processo de reabilitação ambiental, de maneira que o P01 apresentou maior riqueza e abundância; o P02 uma riqueza satisfatória, que respondeu às expectativas do presente estudo, enquanto o P03 obteve uma riqueza e abundância muito baixa, características singulares das áreas impactadas pela mineração.
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Efeitos do tempo de espera em currais de frigorífico no bem-estar e na qualidade da carne de bovinos /Costa, Franciely de Oliveira. January 2013 (has links)
Orientador: Marcia del Campo Gigena / Coorientador: Mateus José Rodrigues Paranhos da Costa / Banca: Emanuel Almeida de Oliveira / Banca: Roberto de Oliveira Roça / Resumo: Objetivou-se avaliar o efeito de dois tempos de espera pré-abate sobre o bem-estar e a qualidade da carne de bovinos. O trabalho foi desenvolvido no Uruguai onde 30 novilhos Hereford foram agrupados aleatoriamente em dois tratamentos, de acordo com o tempo de espera nos currais do frigorífico: 12 horas (Tratamento 1; n=15) e três horas (Tratamento 2; n=15). Os animais foram abatidos quando pesavam, em média, 500 Kg de peso vivo, em um frigorífico comercial, que segue padrões de bem-estar animal e que está habilitado para exportar carne. O temperamento individual dos animais foi avaliado, uma semana antes do abate, utilizando-se testes restritivos e não restritivos (tempo de saída, escore de tronco e escore de saída) com os quais foi construído um índice que combina os três testes (Tindex). Os registros comportamentais dos animais foram realizados durante o período de espera e foram obtidos através da identificação da postura corporal (em pé), no registro da atividade de ruminação e registro das frequências de comportamentos negativos, sendo estes: monta e briga. Determinaram-se cinco indicadores fisiológicos: creatina fosfoquinase (CPK); ácidos graxos não esterificados (NEFA); β-hidroxibutirato (βOHB); glicose e; cortisol, nas diferentes etapas prévias ao abate, a saber: durante a pesagem na fazenda, imediatamente após o desembarque no frigorífico, após o tempo de espera e durante a sangria. As medidas de pesos das carcaças quentes, grau de terminação, grau de conformação e dentição foram obtidas no frigorífico. Da mesma forma, as medidas de temperatura e pH da carne que foram realizadas a 1, 3, 6, 12, 24, 36 e 48 horas após o abate, no músculo Longissimus (LM). Além disso, 45 minutos post mortem, foram extraídas amostras do LM para determinar o conteúdo de glicogênio. Para as análises de cor e força de cisalhamento, amostras do LM foram maturadas, por ... / Abstract: The aim was to evaluate the effect of pre slaughter lairage time on welfare and meat quality of cattle. The study was performed in Uruguay. Thirty Hereford steers were randomly grouped in two treatments according to the lairage time in pens in the slaughterhouse: 12 hours (Treatment 1, n = 15) and three hours (Treatment 2, n = 15). Animals were slaughtered when they reached an average of 500 kg of LW, in a commercial slaughterhouse licensed to export meat, and following animal welfare standard procedures. Temperament was individually assessed one week before slaughter by both restrained (crush score) and non-restrained tests (flight-time and exit speed). By means of it was built an index that combines all three tests (Tindex). The behavioral records of the animals were performed during the lairage period and were obtained through the identification of body posture (standing), the record of rumination activity and the record of the frequency of negative behaviors (mounts and fighting). Blood samples were taken from all animals searching for basal values in five welfare indicators: Creatine kinase (CPK), Non esterified fatty acids (NEFA), ß-hidroxibutirate (βOHB), Glucose and Cortisol, and also their respective changes, according to the following periods: before leaving the farm, immediately after arriving at the slaughter house, after lairage time, and during bleeding. Measurements of hot carcass weight, finishing degree, conformation degree and dentition were obtained in the slaughterhouse. In the same way, measurements of pH and temperature of the meat were taken in 1, 3, 6, 12, 24, 36 e 48 hours post mortem at the Longissimus muscle (LM). Besides, 45 minutes post mortem, muscle samples were extracted from the LM to determine glycogen concentration. For color and shear force analysis, LM samples were aged for a two days period. Muscle color was measured with the L*, a* and b* parameters and ... / Mestre
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Efeitos do treinamento concorrente sobre a composição corporal e gasto energético de repouso em mulheres na menopausa /Rossi, Fabrício Eduardo. January 2012 (has links)
Orientador: Ismael Forte Freitas Junior / Banca: Luiz Carlos Marques Vanderlei / Banca: Roberto Carlos Burini / Resumo: O envelhecimento associado à menopausa no sexo feminino causa significativas modificações na composição corporal e no gasto energético de repouso (GER), no entanto, há poucas evidências dos efeitos do treinamento concorrente sobre essas variáveis em mulheres na menopausa. Sendo assim, os objetivos deste estudo foram: I) Verificar os efeitos do treinamento concorrente sobre a composição corporal e taxa metabólica de repouso em mulheres na menopausa II) Verificar os efeitos de 16 semanas de treinamento concorrente e a influência do tempo de intervenção sobre a composição corporal de mulheres obesas na menopausa. Participaram deste estudo mulheres, na menopausa, as quais foram divididas em dois grupos: grupo treinamento e grupo controle. As avaliações ocorreram no momento inicial, após oito e 16 semanas de treino, no entanto o GER foi avaliado somente no momento inicial e após oito semanas de treinamento. Para estimativa da gordura de tronco, massa gorda, percentual de gordura corporal e massa corporal magra foi utlizado o DEXA. O GER foi estimado pela calorimetria indireta. O protocolo de treinamento consistiu de 50 minutos de treinamento resistido e 30 minutos de treinamento aeróbio... / Abstract: The aging associated with the menopause in women causes significant changes on the body composition and in the resting energy expenditure (REE), although there are few evidences related to the effects of concurrent training on this variables in menopausal women. Therefore, the objectives of this study were: I) To verify the effects of concurrent training on the body composition and resting metabolic rate of menopausal women. II) To verify the effects of 16 weeks of concurrent training and the time influence of intervention on the body composition of obese menopausal women. The study included women in menopause, in which were divided into two groups: training group and control group. The assessments occurred in the baseline moment, after eight and 16 weeks of training, however the REE was evaluated only in the baseline moment and after eight weeks of training. In order to estimate the trunk fat, fat mass, body fat percentage and fat free mass it was used the DEXA. The REE was estimated by the indirect calorimetry. The training protocol consisted of 50 minutes of resistance training and 30 minutes of aerobic training... / Mestre
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Vaga-lumes bioindicadores de poluição luminosa e riqueza de espécies em áreas naturais da Serra de Paranapiacaba e em áreas urbanizadas / Fireflies bioindicators of light pollution and species richness in natural areas of the SA Paranapiacaba and urbanized sitesSantos, Raphael Machado 12 December 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-12-12 / Universidade Federal de Minas Gerais / Bioluminescent beetles are common for their wide distribution in the world, but the composition of the fauna of these organisms is still unknown to most of the areas where they occur. Brazil is the country with the largest number of cataloged species of bioluminescent insects, but studies of faunal surveys, which allow observing the composition of the assemblies of these insects, with the aim of monitoring impacts in natural areas has only recently been realized. The present study focuses on the artificial night lighting as a possible impact on assemblies of bioluminescent beetles. To the knowledge of the fauna of luminous beetles in the State of São Paulo, surveys were conducted by sampling at three sites of the Atlantic Forest in the SA of Paranapiacaba. The species found were: Aspisoma lineatum, Aspisoma physionotum, Aspisoma sp., Cratomorphus beskei, Cratomorphus giganteus, Photinoides penai, Photinus sp1, Photinus sp9, Ethra aff. malledicta ou axilaris, Ethra aff. adicta, Cladodes demoulini, Cladodes flabelicornis, Amydetes sp., Bicellonycha sp., Bicellonycha sp8, Pyrogaster lunifer, Pyrogaster moestus, Pyrogaster sp3 ref. (PORTO, 2011), Photuris elliptica, Photuris sp1, Photuris sp7 Stenophrixotrix sp1, Brasilocerus sp1, Phrixotrix hirtus, Pseudophengodes sp1, Hapsodrilus pyrotis, Pyroptesis cincticollis, Ptesiomopsia luculenta, Pyrearinus candelarius, Pyrearinus micatus e Pyrophorus divergens. The investigated area in SA Paranapiacaba has the second highest species richness of bioluminescent insects of the state of São Paulo until now. From the cluster analysis was done with the data obtained in the field and published data to categorize areas as more and less urbanized was possible to deduce a dependence relationship between species and area in which they can occur. Like other studies, lower richness of bioluminescent beetles in more urbanized areas was observed, we chose a species to investigate the possible effects of artificial lighting. For the study we used the method of counting grid in two similar areas, where only one had artificial lighting. Was possible to compare the data obtained from the two sites with randomization of the same data through a robust non-parametric test, thereby we verified that the sample populations showed no number of different occurrences, the p value is not significant (t=1,780787, R=5000, P=0,059988). We conclude that Bicellonycha lividipennis is not sensitive to ligth of sodium vapor lamps. So this species is not a good indicator species to light pollution for this type of light source. The bioluminescence spectra and the sodium light were superimposed; a possible explanation for that B. lividipennis is not sensitive to light sodium is the activity of the species which is relatively early when there is still strong lighting of twilight. / Coleópteros bioluminescentes são conhecidos pela sua ampla distribuição no mundo, porém a composição da fauna desses organismos ainda é desconhecida para a maior parte das áreas onde eles ocorrem. O Brasil é o país com o maior número de espécies de insetos bioluminescentes catalogadas, porém estudos de levantamentos faunísticos, que possibilitam observar a composição das assembleias d esses organismos, com o objetivo de monitoramento de impactos em áreas naturais só tem sido realizados recentemente. O presente trabalho foca a iluminação artificial noturna como um possível impacto nas assembleias de coleópteros bioluminescentes. Para o conhecimento da fauna de coleópteros no Estado de São Paulo, foram realizadas séries de levantamentos por meio da coleta em três locais de Mata Atlântica na Serra de Paranapiacaba. As espécies encontradas foram: Aspisoma lineatum, Aspisoma physionotum, Aspisoma sp. (não foi identificada), Cratomorphus beskei, Cratomorphus giganteus, Photinoides penai, Photinus sp1, Photinus sp9, Ethra aff. malledicta ou axilaris, Ethra aff. adicta, Cladodes demoulini, Cladodes flabelicornis, Amydetes SP (ainda não foi identificad), Bicellonycha sp. (ainda não foi identificada), Bicellonycha sp8, Pyrogaster lunifer, Pyrogaster moestus, Pyrogaster sp3 ref. (PORTO, 2011), Photuris elliptica, Photuris sp1, Photuris sp7 Stenophrixotrix sp1, Brasilocerus sp1, Phrixotrix hirtus, Pseudophengodes sp1, Hapsodrilus pyrotis, Pyroptesis cincticollis, Ptesiomopsia luculenta, Pyrearinus candelarius, Pyrearinus micatus e Pyrophorus divergens. A área de investigada na SA de Paranapiacaba apresenta a segunda maior diversidade de insetos bioluminescentes do Estado de São Paulo até o momento. A partir da análise de agrupamento que foi realizada com os dados obtidos em campo e dados da literatura, é possível deduzir uma relação de dependência entre espécies e área em que elas podem ocorrer, quando categorizamos as áreas como mais e menos urbanizadas. Como tem sido observada uma menor riqueza de besouros bioluminescentes em áreas mais urbanizadas neste e em outros trabalhos, elegemos uma espécie para investigar os possíveis efeitos da iluminação artificial. Para o estudo utilizamos o método de contagem em grid em duas áreas semelhantes, onde apenas uma era iluminada; com a análise dos dados obtidos, por meio de um teste não-paramétrico robusto realizado com aleatorizações dos dados, foi possível comparar os dados obtidos com aqueles gerados ao acaso, e com isso verificamos que as populações amostrais não apresentaram número de ocorrências diferentes, sendo o valor de p encontrado, não significativo (t=1,780787, R=5000, P=0,059988). Dessa maneira, concluímos Bicellonycha lividipennis não é sensível à luz de sódio. Portanto, não é uma espécie boa para ser indicadora de poluição luminosa para esse tipo de fonte. Os espectros de bioluminescência e da luz de sódio foram confrontados e, uma possível explicação para que B. lividipennis não seja sensível à luz de sódio é que o início da atividade da espécie ocorre quando ainda há forte iluminação do crepúsculo.
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Cobertura florestal ou função ecológica: o dilema da restauração na bacia do Rio Sorocaba / Forest cover or ecological function: the dilemma of the restoration in the basin of Sorocaba River and Middle TieteFernandes, Gerson Eli 21 September 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-09-21 / Não recebi financiamento / The study aimed to evaluate restored areas implemented in the basin of the Sorocaba River and Middle Tiete based on terms of commitments to environmental restoration and conduct adjustment terms. We selected two to three projects in each sub-basin to those with the presence of restoration, certified by the consent of the owner. In each restoration, we evaluated attributes of species diversity and functions, control and management, soil protection and nutrient cycling. The restored areas restoration presented 17 ± 10 species, under the condition established by law, mortality was high, around 40% with an average of 1090 individuals/ha. Croton floribundus, Schinus terebinthifolius, Guazuma ulmifolia, Inga vera, Citharexylum myrianthum, Cordia sellowiana represented 31.7% of species planted and together with Enterolobium contortisiliquum, colubrina Anadenanthera, C. urucurana, Ceiba speciosa, Eugenia uniflora, Lithraea molleoides, Psidium guajava, Triplaris americana, Erythrina speciosa represented 52.8% of the planted individuals. The restoration were in critical situation and, although species richness is according to legal requirements, we observed the concentration on few common and frequent species in general pioneers. Regardless of age, the studied areas did not restore the structural and physical aspects of the forest, and were not efficient in the establishment of ecological processes, highlighting the need to review the procedures adopted in the legal and technical mechanisms of restoration in the region. / O estudo teve por objetivo avaliar projetos de restauração de áreas degradadas implantados na bacia dos Rios Sorocaba e Médio Tietê realizados a partir de termos de compromissos de restauração ambiental e termo de ajustamento de conduta. Foram selecionados dois a três projetos em cada sub-bacia entre os que apresentavam presença da restauração, atestada pela anuência do proprietário. Em cada restauração foram avaliados os atributos da diversidade de espécies e de funções, controle e manejo, proteção do solo e ciclagem de nutrientes. As áreas em restauração apresentaram 17±10 espécies, abaixo da condição estabelecida pela legislação, com alta mortalidade, em torno de 40% e média de 1090 indivíduos/ha. Das espécies, Croton floribundus, Schinus terebinthifolius, Guazuma ulmifolia, Inga vera, Citharexylum myrianthum, Cordia sellowiana, representaram 31,7% dos indivíduos e, juntamente com Enterolobium contortisiliquum, Anadenanthera colubrina, Croton urucurana, Ceiba speciosa, Eugenia uniflora, Lithraea molleoides, Psidium guajava, Triplaris americana, Erythrina speciosa somaram 52,8% dos indivíduos plantados. Os projetos de restauração foram considerados em situação crítica e, embora apresentem riqueza dentro do recomendado, concentraram-se em poucas de espécies mais comuns e frequentes, em geral pioneiras. Independentemente da idade, as áreas estudadas não restauraram os aspectos estruturais e físicos da floresta, e não foram eficientes no estabelecimento dos processos ecológicos, evidenciando a necessidade de se rever os procedimentos adotados nos mecanismos legais e técnicos da restauração na região.
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Indicadores biomecânicos do risco de quedas em marcha com duplas tarefas e a influência do treinamento de equilíbrio com haste vibratória : diferenças entre idosos caidores e não caidores /Hallal, Camilla Zamfolini. January 2013 (has links)
Orientador: Mauro Gonçalves / Coorientador: Edgar Ramos Vieira / Banca: Adalgiso Coscrato Cardozo / Banca: Júlio Cerca Serrão / Banca: Flavia Roberta Faganello Navega / Banca: Karina Gramani Say / Resumo: As quedas são responsáveis pela dependência funcional, institucionalização, medo de cair e perda de confiança em idosos. Existem associações entre risco de quedas e alterações em parâmetros biomecânicos e metabólicos da marcha de idosos. Entretanto, não existe na literatura estudos que comprovem a eficácia desdes métodos para discriminar idosos caidores e não caidores com limiares classificadores. Os objetivos deste estudo foram identificar entre parâmetros biomecânicos e metabólicos as melhores variáveis preditoras de quedas em idosos e identificar pontos de corte classificadores. Participaram do estudo 37 idosos do gênero feminino divididos em caidores e não caidores. Foram coletados os torques articulares do quadril, joelho e tornozelo; custo energético durante a marcha; e variabilidade do tempo das fases da marcha. Para análise dos dados foi utilizado o algoritmo C4.5 de aprendizado de maquinas. A variabilidade do tempo de apoio mostrou-se capaz de distinguir os grupos de idosos caidores e não caidores com 93% de sensibilidade, 100% de especificidade e ponto de corte de 0.101917. O máximo torque isométrico flexor de joelho também foi capaz de distinguir os grupos com 87% de sensibilidade, 76% de especificidade e ponto de corte de 62.52 N.m/Kg. As demais variáveis foram irrelevantes e não contribuiram para padrões discriminativos. O algorítmo de aprendizagem de máquina simbólico (C4.5) mostrou-se capaz de extrair conhecimento sobre os dados coletados e classificar idosos caidores e não caidores a partir de pontos de corte. Este método permitiu identificar que as variáveis de variabilidade do tempo de apoio e máximo torque isométrico flexor de joelho são capazes de discriminar idosos caidores e não caidores e pode contribuir para a identificação precoce de idosos caidores e implementação de programas de prevenção e tratamento / Abstract: Not available / Doutor
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Efeitos do dano muscular sobre indicadores neuromusculares e de aptidão aeróbia /Assumpção, Claudio de Oliveira. January 2014 (has links)
Orientador: Benedito Sergio Denadai / Banca: Sérgio Ricardo de Abreu Camarda / Banca: Adalgiso Coscrato Cardozo / Banca: Jonato Prestes / Banca: Tiago Rezende Figueira / Resumo: O objetivo deste estudo foi analisar o efeito protetor de uma sessão de corrida em declive sobre a economia de corrida (EC) e os indicadores de dano e fadiga muscular, induzidos durante e após uma corrida de longa duração no plano. Trinta indivíduos ativos do gênero masculino com idade de 23,6±3,9 anos, massa corporal de 73,8±10,2 Kg, estatura de 174,3±6,8 cm e índice de massa corporal de 24,2±3,1 Kg.m2, foram divididos randomicamente entre grupo experimental (GEXP) e controle (GCON). Testes progressivos até a exaustão foram realizados para a determinação do limiar de lactato (LL) e do consumo máximo de oxigênio ( O2max) na esteira rolante. Posteriormente, foram determinados: a) os indicadores da fadiga - pico de torque isométrico (PTI), atividade eletromiográfica raiz quadrática da média do sinal eletromiográfico durante o PTI (RMSpti) e taxa de desenvolvimento de força (TDF) dos músculos reto da coxa e vasto lateral (extensores), bíceps da coxa e semitendinoso (flexores); b) indicador de dano muscular (creatina quinase - CK) e; c) a EC antes, imediatamente após e 48 h após a realização da corrida 1 (C1) de longa duração (60 min a 70% O2max). Na semana seguinte, o grupo GEXP realizou uma corrida em declive (30 min a 70% O2max com -15% de inclinação) para indução do dano muscular (DM) sendo mensuradas as mesmas variáveis e respeitando os mesmos intervalos para as avaliações posteriores a C1. Quatorze dias após a corrida em declive foi realizada a corrida 2 (C2), sendo determinados novamente os indicadores de fadiga, do DM e a EC nos mesmos instantes da C1. O grupo GCON não realizou a corrida em declive, contudo, 21 dias após a realização da C1, foram realizados os mesmos procedimentos do grupo GEXP. As variáveis foram comparadas através da análise de variância ANOVA-F medidas repetidas, sendo adotado um nível de significância de p < 0,05. A corrida em declive determinou queda do PTI (~ 15%) e piora... / Abstract: The aim of this study was to analyze the protective effect of a downhill running bout on running economy (RE), muscle damage and fatigue markers induced by a long-distance level running bout. Thirty healthy active males aged 23.6 ± 3.9 years, weight 73.8 ± 10.2 kg, height of 174.3 ± 6.8 cm and body mass index 24.2 ± 3.1 kg.m2 took part on the study and were randomically divided into experimental (GEXP) and control (GCON) groups. Their maximal oxygen consumption ( O2max) and lactate threshold (LT) were determined by incremental test until exhaustion. Fatigue indexes (isometric peak torque - IPT), electromyographic signal (root mean square during the IPT - RMSipt), rate of force development (RFD) of the rectus femoris and vastus lateralis (knee extensors), biceps femoris (BF) and semitendinous (knee flexors), muscle damage markers (creatine quinase - CK) and RE were assessed before, immediately after and 48 hours after a first long-distance running bout (R1) (60 min at 70% O2max). On the following week, volunteers of the GEXP performed a downhill running bout (30 min at 70% O2max with a -15% slope) to induce muscle damage (MD) with all aforementioned variables being assessed at the same time points of the condition R1. Fourteen days after the downhill running bout a second long-distance run (R2) was performed, repeating the same assessment protocol. The GCON group did not perform the downhill running bout. However, the GCON performed the same procedures of GEXP, 21 days after R1. The variables were compared by analysis of variance (ANOVA-F) for repeated measures, with the significance level set as p < 0.05. On the long-distance runs (R1 and R2), significant differences over time (decrease in pre vs. post; increase in post vs. 48 h) for IPT of the knee extensors and knee flexors, and RFD of the knee extensors were found, irrespectively of the run or group. Statistical treatment also showed significant difference for CK activity between... / Doutor
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Caracterização de célula progenitora hepática no cultivo celular de fígado de feto canino /Tavares, Mariana Riboli. January 2016 (has links)
Orientador: Gilson Hélio Tonillo / Coorientador: Joaquim Mansano Garcia / Coorientador: Annelise Carla Camples / Banca: Maricy Apparício Ferreira / Banca: Fabiana Ferreira de Souza / Resumo: Com a descoberta das células-tronco abriu-se um leque de possibilidades nas pesquisas de nichos destas em diferentes órgãos e também no estudo de doenças e regeneração tecidual. O fígado vem sendo alvo de muitos estudos já que as doenças crônicas deste órgão tem como resolução um transplante, o que é caro e há poucos doadores. O fígado é composto, principalmente, por hepatócitos, no entanto, seu cultivo e mantença in vitro são difíceis. Assim, uma alternativa é a manutenção das células progenitoras hepáticas. Elas são conhecidas em camundongos, humanos, mas, pouco mencionadas em cães. Esse trabalho objetivou mostrar a existência das células progenitoras hepáticas no cultivo celular de fígado fetal de cães por imunocitoquímica e citometria de fluxo a fim de saber se este nicho celular existe no cultivo e se é possível num futuro próximo a separação desta linhagem nesta espécie. Foram utilizados para a realização do trabalho 10 fetos sendo que destes foi possível o aproveitamento em sete animais. Foi realizado no trabalho isolamento, cultivo de células hepáticas, criopreservação, curva de crescimento celular, imnocitoquímica e citometria de fluxo. A cultura celular durou sete passagens, com dobramento populacional de 31,7 horas, na imunocitoquímica as células foram marcadas positivamente para os seguintes marcadores: EpCAM, NCAM, Nestina e Thy-1.Na citometria de fluxo foi possível realizar a dupla marcação das células com os maracadores EpCam e NCAM que resultaram em 0... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: With the discovery of stem cells has opened up a range of possibilities in niche research these in different organs and also in the study of diseases and tissue regeneration the liver has been the subject of many studies since chronic diseases of this organ has the resolution a transplant, which is expensive and there are few donors. The liver consists mainly of hepatocytes; however, its cultivation and maintenance in vitro are difficult. Thus, an alternative is to maintain the hepatic progenitor cells. They are known in mice, humans, but rarely mentioned in dogs. This study aimed to show the existence of hepatic progenitor cells in cell culture fetal liver of dogs by immunocytochemistry and flow cytometry in order to know if this cell niche exists in the cultivation and whether it is possible in the near future the separation of this lineage in this species. They were used to carry out the work 10 fetuses and of these it was possible to use in seven animals. Work was carried out in isolation, cultivation of liver cells, cryopreservation, cell growth curve, immunocytochemistry and flow cytometry. The cell culture lasted seven passes, doubling time in 31.7 hours, in immunocytochemistry cells were positively stained for the following markers: EpCAM, NCAM, Nestin and Thy-1. In flow cytometry it was possible to double staining of cells with EpCam markers and NCAM which resulted in 0.5 % ± 0.173 of the total of the cells analyzed. Concludes that the purpose of the desir... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Análise do uso das águas de uma empresa do ramo petroquímico via análise de sobrevivência /Novaes, Edimar Izidoro. January 2014 (has links)
Orientador: Miriam harumi Tsunemi / Banca: Luciana Vaz de Arruda Silveira / Banca: Diogo Francisco Rossoni / Resumo: Na literatura é discutido o uso de planárias como bioindicadores de qualidade das águas, pois diferentes dos ensaios de toxicologia clássica, os animais conseguem captar efeitos de exposição a longo prazo. Atualmente, uma das técnicas de se verificar a qualidade das águas com o uso de planárias é realizando o teste cometa. Propomos uma forma alternativa para verificar a qualidade das águas utilizando planárias, a qual consiste em acompanhar o tempo de vida das mesmas inseridas em diferentes ambientes aquáticos. No estudo presente foram utilizados os dados obtidos por uma empresa que atua no ramo petroquímico e que utiliza as águas do rio Jaguari em seu processo de produção, nos quais foram aplicadas as técnicas estatísticas de análise de sobrevivência para comparar os níveis de poluentes tóxicos nos diferentes ambientes aquáticos. Também propomos um modelo de regressão para realizar inferências nos tempos de vida das planárias para os diferentes locais dos quais foram coletadas as amostras de água. O novo método proposto apresentou uma forma eficiente e de baixo custo no uso das planárias da espécie Dugesia Tigrina como bioindicadores de qualidade de águas. / Abstract: In literature the use of planarians as bioindicators of water quality is discussed, because differently from classic toxicology tests, the animals are able to capture long term exposition effects. Currently, one of techniques to verify the water quality with the use of planarians is performing the comet assay. We propose a new alternative to verify the water quality by accompany lifetime planarians on different aquatic environments. In the present study we used data obtained from a petrochemical company that uses Jaguari river on its production process. Survival Analysis was used to compare the levels of toxic pollutants on different aquatic environments. We also propose a regression model to make inference in the lifetimes of planarians for the different locations from which water samples were collected. The new proposed method presented an efficient and low cost way to use planarians of Dugesia Tigrina specie as water quality bioindicators / Mestre
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