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Relações interespecíficas: diversidade, métodos de ancoragem e hábitos alimentares associados aos tubos de espécies de Ceriantharia (Cnidaria; Anthozoa) / Interspecific relationships: diversity, anchoring methods and feeding habits associated to the tubes of Ceriantharia species (Cnidaria; Anthozoa) / Relaciones interespecíficas: diversidad, métodos de anclaje y hábitos alimentarios asociados a los tubos de especies de Ceriantharia (Cnidaria; Anthozoa)

Ceriello, Hellen 04 June 2018 (has links)
Submitted by Hellen Ceriello (hellenceriello@hotmail.com) on 2018-06-15T23:29:21Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Finalizada - BANCA.pdf: 2330776 bytes, checksum: 3d3e8e2b5b094d5da14941dc13e82cdd (MD5) / Rejected by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: INCLUIR FOLHA DE APROVAÇÕES - obrigatória no exemplar definitivo – folha providenciada pela Pós-graduação Agradecemos a compreensão. on 2018-06-16T00:27:35Z (GMT) / Submitted by Hellen Ceriello (hellenceriello@hotmail.com) on 2018-06-16T19:43:49Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Finalizada - BANCA.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-06-18T21:37:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ceriello_h_me_assis_int.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-18T21:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ceriello_h_me_assis_int.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) Previous issue date: 2018-06-04 / Item withdrawn by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-09-17T19:55:43Z Item was in collections: Dissertações - Biociências - FCLAS (ID: 286) No. of bitstreams: 8 ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf: 1095261 bytes, checksum: 5788ec61fbfc675195f50b22772b393a (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) ceriello_h_me_assis_int.pdf.jpg: 3552 bytes, checksum: 2304c7c099a8b4ca267f41698bbe80b6 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf.jpg: 3766 bytes, checksum: 25c8ef4a719513631285960e4bf4aff2 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf.jpg: 3552 bytes, checksum: 2304c7c099a8b4ca267f41698bbe80b6 (MD5) ceriello_h_me_assis_int.pdf.txt: 136556 bytes, checksum: 3cd84936795a333bd26f9ee1d7d23d94 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf.txt: 27631 bytes, checksum: 25e016d08098e925710727934c893eab (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf.txt: 136556 bytes, checksum: 3cd84936795a333bd26f9ee1d7d23d94 (MD5) / Item reinstated by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-09-17T19:56:40Z Item was in collections: Dissertações - Biociências - FCLAS (ID: 286) No. of bitstreams: 8 ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf: 1095261 bytes, checksum: 5788ec61fbfc675195f50b22772b393a (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf: 2526259 bytes, checksum: 8014154575f86b5c15e144b1ab36f32e (MD5) ceriello_h_me_assis_int.pdf.jpg: 3552 bytes, checksum: 2304c7c099a8b4ca267f41698bbe80b6 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf.jpg: 3766 bytes, checksum: 25c8ef4a719513631285960e4bf4aff2 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf.jpg: 3552 bytes, checksum: 2304c7c099a8b4ca267f41698bbe80b6 (MD5) ceriello_h_me_assis_int.pdf.txt: 136556 bytes, checksum: 3cd84936795a333bd26f9ee1d7d23d94 (MD5) ceriello_h_me_assis_sub_par.pdf.txt: 27631 bytes, checksum: 25e016d08098e925710727934c893eab (MD5) ceriello_h_me_assis_sub.pdf.txt: 136556 bytes, checksum: 3cd84936795a333bd26f9ee1d7d23d94 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O filo Cnidaria é caracterizado por animais em cujos tecidos encontram-se células tóxicas denominadas cnidócitos. Devido à liberação de substâncias tóxicas, os cnidários apresentam poucas associações com outras espécies, entretanto as associações mais conhecidas são frequentemente descritas como obrigatórias ou comensais facultativas. Um dos grupos deste filo, Ceriantharia, é representando por membros genericamente conhecidos por ceriantários ou anêmonas-de-tubo cuja característica mais marcante é a presença de uma secreção celular única (pticocisto) que auxilia na construção de um tubo, sintetizado pelo próprio animal, que fica inserido no substrato e abriga o animal. Embora existam estudos quanto ao histórico, taxonomia e posição sistemática, análises moleculares e morfológicas e ciclo de vida, estudos a respeito de associações interespecíficas ocorrendo em tubos de ceriantários são escassos. Logo, pouco se conhece sobre essas associações bem como os métodos que as espécies utilizam para se ancorarem aos tubos desses animais. Sendo assim, esse estudo elencou espécies que ocorrem em tubos de Ceriantharia, abordando principalmente os métodos de ancoragem e hábitos alimentares envolvidos nas relações observadas. Os tubos de 8 espécies de ceriantários foram analisados, fornecendo dados quanto a associações de Annelida, Crustacea e Mollusca aos tubos. / The phylum Cnidaria is characterized by animals that carry stinging cells named cnidocytes in their tissues. Due to the release of toxic substances, cnidarians have few associations with other species, however mostly known associations are often described as mandatory or optional commensalism. One of the groups in this phylum, Ceriantharia, is represented by members generally known as ceriantharians or tube-dwelling anemones whose most remarkable feature is the presence of a peculiar cell secretion (ptychocyst) that supports the construction of a tube, synthetized by the animal itself, and inserted into the substrate, lodging the animal. Although there are some studies concerning the history, taxonomy and systematic position, molecular and morphological analyzes and life-cycle, studies regarding interspecific associations occurring with ceriantharian tubes are scarce. Thus, little is known about these associations as well as the methods that the species use in order to anchor on these tubes. Thereby, this study listed species occurring in ceriantharian tubes mainly discussing the anchoring methods and feeding habits involved in the associations observed. The tubes of 8 Ceriantharia species were analyzed, yielding data about interactions with Annelida, Crustacea and Mollusca to the tubes. / 2016/00689-7 / 2017/07870-1
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Filogeografia comparada e história evolutiva da Planície Costeira Sul e Sudeste do Brasil

Silva, Fernanda Britto da January 2008 (has links)
O ambiente costeiro e marinho se caracteriza pela falta de barreiras físicas aparentes, além de ser rico em espécies que possuem fase de desenvolvimento larval livre natante. Devido a esta fase de desenvolvimento larval, as espécies marinhas geralmente apresentam alta capacidade dispersiva, proporcionando alto fluxo gênico e conseqüentemente baixa estruturação populacional. Por outro lado, algumas espécies têm apresentado padrões filogeográficos que não são compatíveis com este cenário clássico. Assim, fatores como tempo de duração da fase larval, predação da larva e o hidrodinamismo podem interferir de maneira significativa na dispersão das espécies. Além disso, fatores ambientais históricos, tais como as grandes mudanças climáticas do Pleistoceno também influenciaram os padrões de diversidade genética das espécies. Neste sentido, estudos comparativos são importantes ferramentas para o entendimento dos diferentes processos que deram origem à atual diversidade. Porém, poucos estudos filogeográficos comparativos foram realizados em espécies marinhas costeiras, em especial nenhum para a costa atlântica da América do Sul. Neste estudo comparamos os padrões de diversidade genética de quatro espécies abundantes de invertebrados que ocorrem ao longo da costa sul-sudeste do Brasil, Uruguai e Argentina, com o objetivo de entender a história evolutiva destas espécies e o que elas podem contar sobre esta região geográfica. Sequenciamos parte do gene mitocondrial Citocromo Oxidase I do moçambique Donax hanleyanus (n= 247), do marisco branco Mesodesma mactroides (n= 59), da tatuíra Emerita brasiliensis (n= 191) e do caranguejo maria-farinha Ocypode quadrata (n= 135). Análises filogeográficas e populacionais foram utilizadas a fim de elucidar e comparar os padrões evolutivos para estas espécies de invertebrados costeiros. Nossos dados revelaram um padrão de variabilidade genética muito baixa para todas as espécies, apesar de apresentarem ampla distribuição geográfica e populações censitárias gigantescas, demonstrando a grande influência das flutuações populacionais históricas na formação da variabilidade genética atual. Apenas E. brasiliensis apresentou uma maior variabilidade ao norte da sua distribuição o que é compatível com expansão populacional recente a partir de algum refúgio de baixa latitude, neste caso, ao norte. Além disto, foi a única espécie a apresentar indicação de isolamento por distância. As histórias demográficas destas espécies, apesar de apresentarem algumas diferenças, parecem estar intimamente ligadas às flutuações de temperatura durante o último grande ciclo glacial, pois três delas apresentaram ancestral comum mais recente (time to most recent commom ancestor – TMRCA) dentro dos 100 mil últimos anos, com exceção de O. quadrata, que apresentou TMRCA há cerca de 500 mil anos. Para todas as espécies constatamos a ocorrência de um longo período de estabilidade demográfica (população reduzida) com expansão populacional mais recente, com exceção de M. mactroides, que apresentou TMRCA e expansão populacional praticamente simultâneos. Emerita brasiliensis foi a espécie com a história demográfica mais recente, apresentando expansão populacional após o último máximo glacial (21 mil anos atrás), e coalescência há cerca de 60 mil anos. As demais espécies apresentaram expansão populacional entre 70 e 100 mil anos, entretanto não podemos descartar a hipótese de expansão simultânea para estas três espécies, já que os intervalos de confiança destas análises se sobrepõem, o que sugere a forte influência de um fator ambiental comum. Ocypode quadrata, além de ter apresentado a história demográfica mais antiga, apresentou a maior diversidade genética, sendo também a espécie com a maior distribuição geográfica, sendo pancontinental, o que sugere ser a espécie mais resistente às mudanças ambientais. As espécies D. hanleyanus e O. quadrata, apresentaram baixa estruturação filogeográfica, o que sugere não haver barreiras biogeográficas efetivas para elas, e corrobora a hipótese de que larvas livres natantes são fator importante para o fluxo gênico elevado. Por outro lado sugerem uma estruturação populacional para M. mactroides (com uma possível barreira biogeográfica no sul de SP) e E. brasiliensis (barreira em Copacabana, RJ). De maneira geral estes dados reforçam a idéia de que só a capacidade dispersiva larval não é suficiente para predizer fluxo gênico e estruturação populacional em populações marinhas costeiras, mas sim uma combinação de fatores ecológicos intrínsecos de cada espécie, assim como os fatores geológicos históricos, como os ocorridos no Pleistoceno. / Coastal and marine environments are usually characterized by lack of evident physical barriers and having many species that show a free-swimming larval stage. Due to this larval stage, marine species commonly show high dispersion rates resulting in high gene flow and low geographical structure. Some species however present phylogeographical patterns that differ from this standard scenario. Factors such as duration of the larval phase, its predation level, and the hydrodinamism of the dispersion can significantly impact species dispersion. Moreover, historical environmental factors, such as the great climatic changes in the Pleistocene are also important elements to shape pattern of genetic diversity of the species. In this sense, comparative analyses are important tools for understanding the different processes that gave rise to the current diversity. Unfortunately, few comparative phylogeographical studies were carried out in sea coastal species, in special none for the Atlantic coast of the South America. In this study we compare the patterns of genetic diversity of four abundant invertebrate species that occur along the beaches of the Brazilian south and southeastern coast, Uruguay and Argentina, to better understand their evolutionary histories as well as what they could tell about the history of this geographical region. For this aim we partially sequenced the mitochondrial Cytochrome Oxidase I gene of the moçambique Donax hanleyanus (n=247), yellow clam Mesodesma mactroides (n=59), mole crab Emerita brasiliensis (n=191) and of the ghost crab Ocypode quadrata (n = 135) and analyzed them using several phylogeographical and populational genetic methods. Our results revealed a pattern of very low genetic diversity for all four species, in spite of their large geographical distribution and the huge population size, evidencing the great influence of the population historical fluctuations in the current genetic variability. Only E. brasiliensis showed a relatively higher variability to the north of its distribution what is compatible with a recent populational expansion from a refugium in low latitudes. Besides it was the only species that presented evidence for isolation by distance. The demographic histories of these species, in spite of presenting some differences, seems to be closely connected with the climatic fluctuations during the last glacial cycle, since three of them presented TMRCAs in the last 100 kyr ago, with the exception of O. quadrata, which presented TMRCA about 500 kyr ago. All species presented a long period of demographic stability with relatively reduced population followed by a more recent population expansion. The exception to this picture is M. mactroides, which presented TMRCA and population expansion nearly simultaneous. Emerita brasiliensis depicted the most recent demographic history, presenting a strong population expansion after the last glacial maximum (21 kyr ago), with TMRCA around 60 kyr ago. The other species presented population expansions between around 70 and 100 kyr ago, however we can not to reject the hypothesis of a simultaneous expansion for these three species, since to the confidence intervals of these analyses overlapped, which would indicate a strong influence of a common environmental feature. Ocypode quadrata presented the most ancient demographic history, the highest genetic diversity, and the largest geographical distribution (it is a pancontinental species). This may indicate that it could the most tolerant to the environmental changes. D. hanleyanus and O. quadrata presented low phylogeographical structure, which can mean the existence of no effective biogeographical barriers to these species, corroborating the hypothesis that a free-swimming larval stage is an important factor for an elevated gene flow. On the other hand, our results suggest a reasonable population structure for M. mactroides (with a possible biogeographical barrier in the south of São Paulo) and E. brasiliensis (barrier around Copacabana, Rio de Janeiro), In conclusion, our results support the proposal that the existence of a freeswimming larval stage is not sufficient to predict high gene flow and population structure in sea coastal species, being this pattern likely a combination of intrinsic ecological factors of each species, as well as biogeographical historical factors.
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Caracterización ecológica de la fauna de macroinvertebrados acuáticos en dos quebradas altoandinas, Ayacucho, Perú / Biólogo con mención en Hidrobiología y Pesquería

Silva Poma, Manuel Alejandro January 2018 (has links)
Recientemente los macroinvertebrados acuáticos han tomado un papel importante en el monitoreo de la calidad de agua, pero para su correcto uso es importante conocer su variabilidad natural en quebradas prístinas puesto que esta información puede servir de comparación con quebradas en situación de impacto. Las quebradas Chicucha y Ccollpahuaycco ubicadas en la localidad de Chontaca (Ayacucho, Perú) fueron estudiadas con el objetivo de determinar la diversidad, variación espacio-temporal y caracterizar los gremios tróficos de los macroinvertebrados presentes en ambas quebradas. Se realizaron 4 campañas de muestreo desde setiembre del 2016 hasta julio del 2017, los muestreos fueron realizados en los microhábitats grava, piedra mediana, roca, poza y restos de vegetación retenidos en la corriente. En total se recolectaron 18340 individuos distribuidos en 9 órdenes, 24 familias y 34 géneros, siendo el orden Diptera el más abundante y de mayor riqueza específica con 9 familias y 19 géneros. A nivel espacial la mayor riqueza y abundancia en la quebrada Chicucha (3616 msnm) fue registrada en el microhábitat piedra mediana, mientras que en la quebrada Ccollpahuaycco (3194 msnm) la mayor riqueza se registró en el microhábitat restos de vegetación y la mayor abundancia en el microhábitat poza. A nivel temporal en ambas quebradas, la mayor riqueza y abundancia se presentaron en la época seca (julio y setiembre). El factor temporal predominó sobre el espacial en determinar la estructura de la comunidad, siendo los meses de setiembre y julio los meses de mayor estabilidad ambiental en ambas quebradas. La determinación de los gremios tróficos en los géneros más importantes mostró que la principal fuente de alimento utilizada es el detrito fino, lo que determinó que el gremio trófico detritívoro sea predominante. / Tesis
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La plasticidad fenotípica no explica diferencias inter-cuencas en las respuestas conductuales de Smicridea annulicornis a la conductividad eléctrica del agua

Flores Toledo, Matías Alfonso 04 1900 (has links)
Título de Biólogo con mención en Medio Ambiente / En Chile los ríos presentan alta variabilidad ambiental en la conductividad, este parámetro es un estresor de los organismos acuáticos y sirve para estimar el grado de perturbación de los ríos. Los efectos de la conductividad sobre los macroinvertebrados bentónico son contexto-dependientes y pueden usar mecanismos homeostáticos que son necesarios para mantener su concentración interna de solutos. Existen respuestas que pueden darse en macroinvertebrados como resultado de (entre otros fenómenos) adaptación local y plasticidad fenotípica. Un organismo que habitan este tipo de sistemas lóticos dentro de los macroinvertebrados bentónicos es Smicridea annulicornis. Proponemos que S. annulicornis responde plásticamente en sus rasgos de desempeño a distintas conductividades y que depende de la cuenca de origen. Las capturas del macroinvertebrado fueron hechas en ríos de las cuencas de Choapa, Maipo y Maule. Se determinó que los rasgos nado, protección y caminata poseen diferencias significativas entre poblaciones en asociación al tamaño corporal. Mientras que al considerar la cuenca hidrográfica los rasgos nado, protección y flexión poseen diferencias significativas entre poblaciones lo que se puede interpretar como adaptación local, solo caminata presenta estas diferencias significativa en interacción de conductividad con cuenca. No existieron estas diferencias en los rasgos con conductividad por lo no se podría expresar plasticidad fenotípica. Comprobamos que los rasgos de desempeño S. annulicornis dependen de la cuenca de procedencia lo que se podría interpretar como adaptación local y que la conductividad no afecta estas respuestas. / In Chile rivers have high environmental variability in conductivity, this parameter is a stressor of aquatic organisms and serves to estimate the degree of disturbance of rivers. The effects of conductivity on benthic macroinvertebrates are context-dependent and can use homeostatic mechanisms that are necessary to maintain their internal concentration of solutes. There are responses that can occur in macroinvertebrates as a result of (among other phenomena) local adaptation and phenotypic plasticity. An organism that inhabits this type of lotic systems within the benthic macroinvertebrates is Smicridea annulicornis. We propose that S. annulicornis responds plastically in its performance traits to different conductivities and that it depends on the basin of origin. The macroinvertebrate catches were made in rivers of the Choapa, Maipo and Maule basins. It was determined that swim, protection and trek traits have significant differences between populations in association with body size. While when considering the watershed the swim, protection and flexion features have significant differences among populations that can be interpreted as local adaptation, only trek presents these significant differences in conductivity interaction with basin. These differences did not exist in the traits with conductivity so it is not express phenotypic plasticity. We found that S. annulicornis performance traits depend on the basin of origin, which could be interpreted as local adaptation and that conductivity does not affect these responses. / El financiamiento de este estudio está inserto dentro de los proyectos FONDECYT N° 1114098 a cargo del Dr. Mauricio José Carter Montecinos (Co-director de tesis) y Nº 1150348 a cargo del Dr. R. Ramos.
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Efeito do sedimento fino de origem terrestre sobre a fauna de macroinvertebrados bentônicos em riachos / Effect of Fine sediment on benthic macroinvertebrate in subtropical streams

Vasconcelos, Márlon de Castro January 2007 (has links)
O aporte de sedimento fino é um dos principais agentes causadores de impactos a ecossistemas aquáticos. Este trabalho teve por finalidade avaliar por experimentalmente o efeito do sedimento fino sobre a fauna de macroinvertebrados bentônicos em um riacho subtropical. O local escolhido foi o rio Forqueta no distrito de Barra do Ouro pertencente ao município de Maquiné, RS. Foi adicionado por tratamento cerca 3138 cm3 de sedimento fino, separado em duas frações: areia fina (0 mm a 0,250mm) e areia grossa (0,25 mm a 1mm), em dois níveis, com e sem sedimento. Os dados foram analisados através por meio de uma Análise de Variância (ANOVA) de dois fatores para abundância total, riqueza e riqueza rarefeita, além de uma Análise de Variância Multivariada (MANOVA) para abundância relativa e composição de espécies e de uma Análise de Correspondência Canônica (pCCA), esta última, para avaliar o quanto eventos de perturbações influenciam a fauna aquática. A interação entre a velocidade do fluxo e os fatores envolvendo sedimentos também foram avaliados. O sedimento fino afetou negativamente a abundância total, a riqueza e a composição de espécies, mas não a riqueza rarefeita e a abundância relativa.O fluxo foi um importante fator para a distribuição da fauna avaliada, sendo a abundância, riqueza e a riqueza rarefeita maior em áreas com maior fluxo. Houve interação do fluxo com a areia fina, aumentando seu efeito sobre a abundância total e riqueza rarefeita em locais com maior velocidade de fluxo. A pCCA mostrou que eventos pontuais e de curta duração de acréscimo de sedimento fino não são danosos à fauna aquática. Os resultados obtidos mostram que o sedimento fino afeta de forma negativa a fauna de macroinvertebrados bentônicos em riachos, e este efeito negativo se dá por diversas formas, tais como redução do hábitat, perda da qualidade do alimento, estresse fisiológico e por outros. A relação da fauna com a velocidade pode ser atribuída às preferênciasecológicas dos grupos encontrados. Por alguns resultados divergirem de estudos prévios, o efeito do sedimento fino sobre a fauna aquática deve ser mais bem estudado. / One of the main forms by which aquatic ecosystems are impacted is the input of fine sediment. The objective of our study was to determinate by one experiment the effect of fine sediment on benthic macroinvertebrates in subtropical streams. The study area was the Forqueta River in Barra do Ouro district of Maquiné city, Rio Grande do Sul, Brazil. It’s was added 3138 cm3 of sediment, in two fractions: fine sand (0mm – 0.25mm) and coarse sand (0.25mm – 1mm) into the river with two levels (with or without sediment) . The data were analyzed by Analysis of Variance (ANOVA two-way) for abundance, richness and rarefied richness, the last one intended to compare species richness based on an equivalent number of individuals. Using Multivaried Analysis of Variance (MANOVA) we examined the effect of fine sediment on relative abundance and composition of species. Sediment was used as one factor in four levels. A Partial Canonical Correspondence Analysis (pCCA) was used to examine the effect of the disturbance event on communities. The interaction between the flow and the factors of the sediment was examined. There was a negative effect of fine sediment on abundance, richness and species composition, but the effect was null on relative abundance and rarefaction of species richness. The flow was important for distribution of individuals colleted. The abundance, species richness and rarefied richness were highest on places with fastest flows. The flow increased the effect of fine sand on abundance and rarefied richness. The pCCA showed that disturbance events of small frequency consisting of input of terrestrial sediment have no negative effects on benthic macroinvertebrate. The relationship between flow and benthic macroinvertebrates can be attributed to the ecological preferences of species. These results showed that fine sediment impact is harmful for benthic macroinvertebrates in streams, particularly in termsof abundance. This negative effect may be a consequence of loss of habitat, reduced food quality, physiological stress and others forms. Because some results differ from other studies, the effect of the fine sediment on the benthic macroinvertebrates needs to be better studied.
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Filogeografia comparada e história evolutiva da Planície Costeira Sul e Sudeste do Brasil

Silva, Fernanda Britto da January 2008 (has links)
O ambiente costeiro e marinho se caracteriza pela falta de barreiras físicas aparentes, além de ser rico em espécies que possuem fase de desenvolvimento larval livre natante. Devido a esta fase de desenvolvimento larval, as espécies marinhas geralmente apresentam alta capacidade dispersiva, proporcionando alto fluxo gênico e conseqüentemente baixa estruturação populacional. Por outro lado, algumas espécies têm apresentado padrões filogeográficos que não são compatíveis com este cenário clássico. Assim, fatores como tempo de duração da fase larval, predação da larva e o hidrodinamismo podem interferir de maneira significativa na dispersão das espécies. Além disso, fatores ambientais históricos, tais como as grandes mudanças climáticas do Pleistoceno também influenciaram os padrões de diversidade genética das espécies. Neste sentido, estudos comparativos são importantes ferramentas para o entendimento dos diferentes processos que deram origem à atual diversidade. Porém, poucos estudos filogeográficos comparativos foram realizados em espécies marinhas costeiras, em especial nenhum para a costa atlântica da América do Sul. Neste estudo comparamos os padrões de diversidade genética de quatro espécies abundantes de invertebrados que ocorrem ao longo da costa sul-sudeste do Brasil, Uruguai e Argentina, com o objetivo de entender a história evolutiva destas espécies e o que elas podem contar sobre esta região geográfica. Sequenciamos parte do gene mitocondrial Citocromo Oxidase I do moçambique Donax hanleyanus (n= 247), do marisco branco Mesodesma mactroides (n= 59), da tatuíra Emerita brasiliensis (n= 191) e do caranguejo maria-farinha Ocypode quadrata (n= 135). Análises filogeográficas e populacionais foram utilizadas a fim de elucidar e comparar os padrões evolutivos para estas espécies de invertebrados costeiros. Nossos dados revelaram um padrão de variabilidade genética muito baixa para todas as espécies, apesar de apresentarem ampla distribuição geográfica e populações censitárias gigantescas, demonstrando a grande influência das flutuações populacionais históricas na formação da variabilidade genética atual. Apenas E. brasiliensis apresentou uma maior variabilidade ao norte da sua distribuição o que é compatível com expansão populacional recente a partir de algum refúgio de baixa latitude, neste caso, ao norte. Além disto, foi a única espécie a apresentar indicação de isolamento por distância. As histórias demográficas destas espécies, apesar de apresentarem algumas diferenças, parecem estar intimamente ligadas às flutuações de temperatura durante o último grande ciclo glacial, pois três delas apresentaram ancestral comum mais recente (time to most recent commom ancestor – TMRCA) dentro dos 100 mil últimos anos, com exceção de O. quadrata, que apresentou TMRCA há cerca de 500 mil anos. Para todas as espécies constatamos a ocorrência de um longo período de estabilidade demográfica (população reduzida) com expansão populacional mais recente, com exceção de M. mactroides, que apresentou TMRCA e expansão populacional praticamente simultâneos. Emerita brasiliensis foi a espécie com a história demográfica mais recente, apresentando expansão populacional após o último máximo glacial (21 mil anos atrás), e coalescência há cerca de 60 mil anos. As demais espécies apresentaram expansão populacional entre 70 e 100 mil anos, entretanto não podemos descartar a hipótese de expansão simultânea para estas três espécies, já que os intervalos de confiança destas análises se sobrepõem, o que sugere a forte influência de um fator ambiental comum. Ocypode quadrata, além de ter apresentado a história demográfica mais antiga, apresentou a maior diversidade genética, sendo também a espécie com a maior distribuição geográfica, sendo pancontinental, o que sugere ser a espécie mais resistente às mudanças ambientais. As espécies D. hanleyanus e O. quadrata, apresentaram baixa estruturação filogeográfica, o que sugere não haver barreiras biogeográficas efetivas para elas, e corrobora a hipótese de que larvas livres natantes são fator importante para o fluxo gênico elevado. Por outro lado sugerem uma estruturação populacional para M. mactroides (com uma possível barreira biogeográfica no sul de SP) e E. brasiliensis (barreira em Copacabana, RJ). De maneira geral estes dados reforçam a idéia de que só a capacidade dispersiva larval não é suficiente para predizer fluxo gênico e estruturação populacional em populações marinhas costeiras, mas sim uma combinação de fatores ecológicos intrínsecos de cada espécie, assim como os fatores geológicos históricos, como os ocorridos no Pleistoceno. / Coastal and marine environments are usually characterized by lack of evident physical barriers and having many species that show a free-swimming larval stage. Due to this larval stage, marine species commonly show high dispersion rates resulting in high gene flow and low geographical structure. Some species however present phylogeographical patterns that differ from this standard scenario. Factors such as duration of the larval phase, its predation level, and the hydrodinamism of the dispersion can significantly impact species dispersion. Moreover, historical environmental factors, such as the great climatic changes in the Pleistocene are also important elements to shape pattern of genetic diversity of the species. In this sense, comparative analyses are important tools for understanding the different processes that gave rise to the current diversity. Unfortunately, few comparative phylogeographical studies were carried out in sea coastal species, in special none for the Atlantic coast of the South America. In this study we compare the patterns of genetic diversity of four abundant invertebrate species that occur along the beaches of the Brazilian south and southeastern coast, Uruguay and Argentina, to better understand their evolutionary histories as well as what they could tell about the history of this geographical region. For this aim we partially sequenced the mitochondrial Cytochrome Oxidase I gene of the moçambique Donax hanleyanus (n=247), yellow clam Mesodesma mactroides (n=59), mole crab Emerita brasiliensis (n=191) and of the ghost crab Ocypode quadrata (n = 135) and analyzed them using several phylogeographical and populational genetic methods. Our results revealed a pattern of very low genetic diversity for all four species, in spite of their large geographical distribution and the huge population size, evidencing the great influence of the population historical fluctuations in the current genetic variability. Only E. brasiliensis showed a relatively higher variability to the north of its distribution what is compatible with a recent populational expansion from a refugium in low latitudes. Besides it was the only species that presented evidence for isolation by distance. The demographic histories of these species, in spite of presenting some differences, seems to be closely connected with the climatic fluctuations during the last glacial cycle, since three of them presented TMRCAs in the last 100 kyr ago, with the exception of O. quadrata, which presented TMRCA about 500 kyr ago. All species presented a long period of demographic stability with relatively reduced population followed by a more recent population expansion. The exception to this picture is M. mactroides, which presented TMRCA and population expansion nearly simultaneous. Emerita brasiliensis depicted the most recent demographic history, presenting a strong population expansion after the last glacial maximum (21 kyr ago), with TMRCA around 60 kyr ago. The other species presented population expansions between around 70 and 100 kyr ago, however we can not to reject the hypothesis of a simultaneous expansion for these three species, since to the confidence intervals of these analyses overlapped, which would indicate a strong influence of a common environmental feature. Ocypode quadrata presented the most ancient demographic history, the highest genetic diversity, and the largest geographical distribution (it is a pancontinental species). This may indicate that it could the most tolerant to the environmental changes. D. hanleyanus and O. quadrata presented low phylogeographical structure, which can mean the existence of no effective biogeographical barriers to these species, corroborating the hypothesis that a free-swimming larval stage is an important factor for an elevated gene flow. On the other hand, our results suggest a reasonable population structure for M. mactroides (with a possible biogeographical barrier in the south of São Paulo) and E. brasiliensis (barrier around Copacabana, Rio de Janeiro), In conclusion, our results support the proposal that the existence of a freeswimming larval stage is not sufficient to predict high gene flow and population structure in sea coastal species, being this pattern likely a combination of intrinsic ecological factors of each species, as well as biogeographical historical factors.
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Estudo comparativo da estrutura da comunidade bentônica de duas represas com diferenças no grau de eutrofização.

Pamplin, Paulo Augusto Zaitune 02 June 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TesePAZP.pdf: 3329629 bytes, checksum: 4631c81548787a96d26e307556c0faa9 (MD5) Previous issue date: 2004-06-02 / The present study aimed to determine and compare the structure of benthic invertebrates community in two reservoirs strongly differing in relation to trophic state. The reservoirs studied were Ponte Nova and Bariri , both resulting from dams on Tietê River. Sampling was carried out as a screening of the system in 90 sampling station in each reservoir. Sampling were carried out in four periods: January, April, July and October 2001. Both reservoirs are polimictic and had an anoxic hypolimnium in January. The concentrations of nitrogen and phosphourus compounds as well as chlorophyll a indicated that Ponte Nova Reservoir is oligo-mesotropic whereas Bariri Reservoir is hipereutrophic. Benthic invertebrates were collected using a Van Veen grab (378cm²) and washed trough a sieve with 210 um open-aperture. A total of 36 were identified in Ponte Nova Reservoir and 39 in Bariri. They belonged to the Oders Ephemeroptera, Diptera, Odonata and Trichoptera (Class Insecta), besides representatives of Oligochaeta and Hirudinea Classes (Filo Anellida) and Gastropoda and Bivalvia Classes (Filo Mollusca). In Ponte Nova Reservoir the highest richness was found in the family Chironomidae (Diptera) represented by 21 taxa, followed by Oligochaeta with 10 species. On the other hand, in Bariri Reservoir Oligochaeta was the group with highest the richness represented by 16 species, followed by Chironomidae with 13 taxa. Chaoborus (Diptera) was numerically dominat in the bentic macroinvertebrate community of Ponte Nova reservoir. They correspond to 77% of the sampled organisms. In Bariri Reservoir, Branchiura sowerbyi (Oligochaeta) was the dominat organism corresponding to 47,6%. During the study period the highest densities of macroinvertebrates were found in Bariri reservoir varying between 1024.1 and 1657.0 ind.m-2, compared with 562 e 850.0 ind.m-2 in Ponte Nova. The analysis of distribuition of organisms in relation to depth showed that Chaoborus inhabited preferentially the deep region in both reservoirs, whereas Chironomidae and Mollusca, preferred the littoral region. For Oligocheta it was observed that in Ponte Nova Reservoir this group preferentially occupied shallow areas, whereas in Bariri the highest densities were found in the deepest zone. An analysis of Shannon-Wiener diversity index and the relation Oligochaeta/Chironamidae showed that the latter was best in characterizing the tropic state of studied environments. / O presente projeto teve como objetivo determinar e comparar a estrutura da comunidade de invertebrados bentônicos em duas represas com diferentes graus de eutrofização. As represas estudadas foram as represas Ponte Nova e Bariri, ambas construídas pelo barramento do rio Tietê. As coletas foram feitas em sistemas de amostragem para cada represa. Ambas as represas são ambientes polimiticos, com anoxia do hipolimnio em janeiro. As concentrações dos compostos nitrogenados, fosfatados e de clorofila a revelam que a represa Bariri é um ambiente hipereutrofizado. Os invertebrados bentônicos foram coletados com uma draga Van Veen (378 cm²) e lavados em peneira com 210 pm de abertura de malha. No total foram identificados 36 táxons na represa Ponte Nova e 39 na represa Bariri pertencentes às Ordens Ephemeroptera, Díptera, Odonata e Trichoptera (Classe Insecta), além de representantes das Classes Oligochaeta e Hirudínea (Filo Anellida) e Classes Gastropoda e Bivalvia (Filo Mollusca). Na represa Ponte Nova o grupo com maior riqueza foi a família Chironomidae (Díptera) com 21 representantes, seguida por Oligochaeta com 10 espécies. Em Bariri, Oligochaeta foi o grupo com maior riqueza, representada por 16 espécies, e Chironomidae, representado por 13 táxons. Numericamente, Chaoborus (Díptera) foi o principal componente da fauna bentônica da represa Ponte Nova, correspondendo a 77% dos organismos coletados, enquanto que Bariri, Branchiura sowerbyi (Oligochaeta) foi o principal representante, correspondendo a 47,6%. Durante o período de estudo foram registradas maiores densidades de zoobentonicos na represa Bariri, variando entre 1024,1 e 1657,0 ind.m-2 , comparados com 562,3 e 850,0 ind.m-2 em Ponte Nova. Em relação à distribuição batimétrica, Chaoborus habitou preferencialmente a região profunda de ambas represas, enquanto que Chironomidae e Mollusca, a região litorânea. Para os Oligachaeta, observou-se que na represa Ponte Nova este grupo teve preferência pelas áreas mais rasas, enquanto que em Bariri, as maiores densidades foram obtidas nas zonas profundas.Comparando-se os valores obtidos para os índices de diversidade de Shannon-Wiener e da relação Oligochaeta/Chironomidae verificou-se que este último foi o que melhor caracterizou a condição de trofia dos ambientes estudados.
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Comunidade de macroinvertebrados bentônicos do rio Madeira e tributários no trecho de construção da UHE Santo Antônio do Madeira, Rondônia, Brasil

Nunes, Marcos Vinicius 18 March 2016 (has links)
Submitted by Luciana Sebin (lusebin@ufscar.br) on 2016-10-05T13:04:19Z No. of bitstreams: 1 TeseMVN.pdf: 3280575 bytes, checksum: f81aadc639164fc15932d17994661317 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-14T14:07:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseMVN.pdf: 3280575 bytes, checksum: f81aadc639164fc15932d17994661317 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-14T14:07:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseMVN.pdf: 3280575 bytes, checksum: f81aadc639164fc15932d17994661317 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-14T14:07:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseMVN.pdf: 3280575 bytes, checksum: f81aadc639164fc15932d17994661317 (MD5) Previous issue date: 2016-03-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / The construction of hydroelectricity power plants in lotic systems promote changes in the morphological and functional characteristics of these ecosystems, also leading to changes in the structure and dynamics of biological communities, both, qualitative and quantitative. Among the communities usually inhabiting recently created reservoirs, benthic macroinvertebrates have special relevance for having close relationship with environmental factors, simultaneously and differently responding to environmental changes. Therefore, based on the hypothesis that the structure and composition of benthic community might be altered as a consequence of the river damming, the presente work had as its main objective to make a species inventory occurring in a stretch of the Madeira River, before and after the construction of the UHE de Santo Antônio do Madeira, determining the composition and spatial di stribution of Hirudinea assemblages, verifying if the Oligochaeta species associatins in Madeira River are similar to those found in other large South America rivers, and if the construction of the power plant altered the patterns of association and distribution of species. Besides that Chironomidae assemblages were analyzed aiming to see if they were also affected, looking at their responses evaluated by biological indices considering the environmental changes after river damming. For this, sediment samples were collected for benthic macroinvertebrates analyses in eight sampling points, being six located upstream the dam and two downstream, before and after damming. Water variables were in situ measured: pH, electrical conductivity, dissolved oxygen, turbidity and temperature, and the sediment collected for granulometric analyses and nutrient concentrations measurements. The results obtained showed that both, water variables and sediment size-fractions were altered in some localities influencing leeches assemblage composition and abundances. It was also observed that Oligochaeta assemblage had a pattern of species association and that it does not tend to disappear after the river damming. However, the river damming caused changes in the structure and composition of the populations of Chironomidae. A decrease in the richness of taxa and overall changes in the benthic community before and after damming was also observed, thus evidencing that dam construction acted as a controlling factor of benthic community. Although the taxonomic richness and diversity index have not responded to these changes, contrarily the β diversity and the relationship between diversity and abundance of classes were sensitive to changes caused by the damming. / A construção de usinas hidrelétricas em sistemas lóticos promove alterações nas características morfológicas e funcionais destes ecossistemas, levando a mudanças na dinâmica funcional e estrutural das comunidades biológicas de forma qualitativa e quantitativa. Dentre as comunidades que se desenvolvem nos reservatórios recém-criados, a comunidade bentônica tem especial relevância, por apresentar estreita relação com os fatores ambientais, respondendo simultaneamente e diferentemente às variações do ambiente. Por isso, baseados na hipótese de que a estrutura e a composição da comunidade bentônica poderá sofrer alterações em consequência do represamento de um rio, este trabalho teve como objetivos realizar um inventário das espécies com ocorrência em um trecho do rio Madeira antes e após a construção da UHE de Santo Antônio do Madeira, observar composição e distribuição espacial das populações de hirudíneos, verificar se as associações entre as espécies de Oligochaeta do rio Madeira são semelhantes às registradas nos grandes rios sulamericanos e se a construção desta hidrelétrica alterou o padrão de associação e distribuição das espécies, além de identificar como a assembleia de Chironomidae pode ser afetada pela construção da barragem por meio das respostas avaliadas por índices biológicos frente às mudanças ambientais após o represamento do rio. Para isso foram coletadas amostras do sedimento, para a análise da fauna, em oitos pontos, sendo seis na montante e dois na jusante da barragem, antes e após a sua construção, sendo medidas in situ as variáveis da água: pH, condutividade elétrica, oxigênio dissolvido, turbidez e temperatura, e coletado sedimento para a análise granulométrica e concentrações de nutrientes. Os resultados mostraram que tanto as variáveis da água quanto a composição granulométrica do sedimento foram alteradas em algumas localidades influenciando na distribuição e abundância das assembleias de hirudíneos. Foi observado que as assembleias de Oligochaeta possuem um padrão de associação entre as espécies e que este padrão não tende a desaparecer após o barramento do rio. Porém o barramento do rio provocou alterações na estrutura e composição das populações de Chironomidae. Também foi observada uma redução na riqueza taxonômica entre o pré e pós–barramento e mudanças na comunidade bentônica, evidenciando que a construção da barragem atuou como um fator controlador da comunidade bentônica. Embora, a riqueza taxonômica e o índice de diversidade não tenham respondido a estas mudanças, contrariamente, a diversidade β e a relação entre a diversidade e as classes de abundância foram sensíveis às alterações provocadas pelo represamento.
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Fauna acompanhante: um universo químico a ser explorado / By-catch: a chemical universe to be explored

Tangerina, Marcelo Marucci Pereira [UNESP] 27 June 2016 (has links)
Submitted by MARCELO MARUCCI PEREIRA TANGERINA null (marcelomptang@hotmail.com) on 2016-07-09T22:03:34Z No. of bitstreams: 1 Tese ABNT Marcelo Tangerina Wagner Vilegas CD.pdf: 3984472 bytes, checksum: 993744f837a77327c951b1988896f63c (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-07-12T17:19:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 tangerina_mmp_dr_araiq.pdf: 3984472 bytes, checksum: 993744f837a77327c951b1988896f63c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-12T17:19:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tangerina_mmp_dr_araiq.pdf: 3984472 bytes, checksum: 993744f837a77327c951b1988896f63c (MD5) Previous issue date: 2016-06-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A fauna acompanhante da pesca do camarão inclui uma série de invertebrados marinhos que são descartados por não ter valor comercial. A fim de tentar acrescentar algum valor a este material, foi analisada a composição química da estrela-do-mar Luidia senegalensis coletada na costa brasileira como consequência da aplicação da pesca de arrasto. A fim de avaliar sua composição química, foi utilizada uma combinação de extração em fase sólida (SPE) seguida de cromatografia líquida de ultra eficiência acoplada a espectrômetro de massas equipado com fonte de ionização por eletrosptray e analisador ion-trap linear (UPLCESI- IT-MSn). Luidia senegalensis contém asterosaponinas, que são esteroides glicosilados sulfatados contendo cinco e seis unidades de açúcar, além de poliidroxiesteroides. Este estudo mostrou a presença de compostos importantes e potencialmente bioativos em invertebrados associados à fauna acompanhante da pesca do camarão, usando um método rápido e eficiente. Normalmente descartada, a fauna acompanhante contém muitos invertebrados que podem hospedar uma grande variedade de gêneros de bactérias, algumas das quais com potencial de produzir produtos naturais bioativos com aplicações biotecnológicas. Assim, para utilizar um material normalmente descartado, foi explorado o potencial biotecnológico de bactérias cultiváveis de duas espécies de invertebrados abundantes na fauna acompanhante, o gastrópode Olivancillaria urceus e a estrela-do-mar Luidia senegalensis. Uma amostra de sedimento da mesma área de coleta também foi investigado. Utilizando múltiplas abordagens de isolamento 134 isolados foram obtidos a partir dos invertebrados e do sedimento. Sequenciamento parcial da subunidade de rRNA (16S) revelou que os isolados pertenciam aos filos Proteobacteria, Firmicutes e Actinobacteria, distribuídos em 28 gêneros. Vários gêneros conhecidos pela sua capacidade de produzir produtos naturais bioativos (Micromonospora, Streptomyces, Serinicoccus e Verrucosispora) foram obtidos a partir das amostras estudadas. Para avaliar as bactérias isoladas quanto à sua capacidade para produzir metabólitos bioativos todas as cepas foram fermentadas e os extratos de fermentação analisados por LC-HRMS e testados em ensaio de atividade antimicrobiana. Quatro cepas apresentaram atividade antimicrobiana contra Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) e Staphylococcus warneri. A produção de metabólitos secundários por bactérias isoladas da fauna acompanhante também foi avaliada por uma abordagem metabolômica utilizando LC-HRMS, onde foi avaliado como as diferenças na composição dos meios de cultura podem alterar a produção de substâncias. Utilizou-se a metabolômica como uma ferramenta para investigar a produção de abyssomicinas, um agente anticâncer, e outros metabólitos secundários em três cepas do actinomiceto raro Verrucosispora maris, isoladas a partir de uma amostra de sedimento e associadas à estrela-do-mar Luidia senegalensis de Ubatuba - SP, Brasil. Nove composições diferentes de meios de cultura foram avaliadas e verificou-se que, dentre todas as cepas, somente RKMT_111 foi capaz de produzir abyssomicinas. O estudo da composição do meio de cultura revelou que a produção de abyssomicinas só foi possível em BFM-11m. Embora as três cepas pertençam à mesma espécie e são provenientes da mesma localização, é notável que cada isolado apresentou diferente capacidade de produção de metabólitos secundários. Os produtos de fermentação de Erythrobacter vulgaris foram avaliados utilizando técnicas de HPLC preparativo, LC-HRMS e RMN. A cepa foi isolada pelo método dry-stamp de uma amostra de sedimento marinho da costa de Ubatuba-SP, Brasil. Depois de sequenciamento completo do rRNA (16S) e identificação, o isolado foi fermentado em larga escala, seu caldo de fermentação extraído por solvente e os compostos purificados por HPLCMS. Análise de LC-HRMS e RMN dos compostos isolados levou à identificação de dois novos derivados do ácido cólico, ácido 3-acetil-glicocólico e o ácido 3-acetilglicodesoxicólico. As substâncias obtidas podem ter sido produzidas por biotransformação do ácido glicocólico e ácido desoxicólico, respectivamente, já presentes no meio de cultivo. Este é o primeiro relato de tais compostos e também a primeira observação de uma acilação realizada por um isolado marinho de Erythrobacter vulgaris. / The by-catch fauna of the shrimp fishery includes a number of marine invertebrates that are discarded because they do not have commercial value. In order to try to add some value to these materials, we analyzed the chemical composition of the starfish Luidia senegalensis collected in the Brazilian coast as a consequence of the trawling fishery method. In order to access their chemical composition, we used a combination of solid phase extraction (SPE) followed by ultra performance liquid chromatography coupled to electrospray ionization ion trap tandem mass spectrometry (UPLC-ESI-IT-MSn). Luidia senegalensis contains asterosaponins, which are sulphated glycosilated steroids, containing five and six sugar moieties, in addition to polyhydroxysteroids. This study helped us to support the presence of important and potentially bioactive compounds in invertebrates associated to the by-catch fauna of the shrimp fishery, using a fast and efficient method. Typically discarded, by-catch contains many invertebrates that may host a great variety of bacterial genera, some of which may produce bioactive natural products with biotechnological applications. Therefore, to utilize by-catch that is usually discarded we explored the biotechnological potential of culturable bacteria of two abundant by-catch invertebrate species, the snail Olivancillaria urceus and the sea star Luidia senegalensis. Sediment from the collection area was also investigated. Utilizing multiple isolation approaches 134 isolates were obtained from the invertebrates and sediment. Small subunit rRNA (16S) gene sequencing revealed that the isolates belonged to Proteobacteria, Firmicutes and Actinobacteria phyla and were distributed among 28 genera. Several genera known for their capacity to produce bioactive natural products (Micromonospora, Streptomyces, Serinicoccus and Verrucosispora) were retrieved from the invertebrate samples. To query the bacterial isolates for their ability to produce bioactive metabolites all strains were fermented and fermentation extracts profiled by LC-HRMS and tested for antimicrobial activity. Four strains exhibited antimicrobial activity against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Staphylococcus warneri. The production of secondary metabolites was assessed using a LC-HRMS-based metabolomics approach, where it was evaluated how differences in media composition can alter the production of chemical compounds. We used metabolomics as a tool to investigate the production of abyssomicins, an anticancer agent, and other secondary metabolites in three strains of the rare actinomycete Verrucosispora maris, all marine isolates from a sediment sample and associated to a starfish from the species Luidia senegalensis of Ubatuba – SP, Brazil. Nine different media compositions were evaluated and it was found that, among all strains, only RKMT_111 was capable of producing abyssomicins. The media composition study revealed that the production of abyssomicins was only achievable in BFM-11m. Although the three strains belong to the same species and the same location, it is worthwhile noticing that each isolate showed different capability for production of secondary metabolites. The products of fermentation of Erythrobacter vulgaris were evaluated using preparative HPLC, LC-HRMS and NMR techniques. Bacterial strain was isolated by drystamp method from a marine sediment sample from the coast of Ubatuba-SP, Brazil. After fully 16S rDNA sequence and identification, the marine isolate was fermented in large-scale, extracted and the compounds purified through HPLC-MS. Analysis of LC-HRMS and NMR of the isolated compounds led to the identification of two new cholic acid derivatives, 3- acetyl-glycocholic acid and 3-acetyl-glycodeoxycholic acid. Both new compounds may have been produced by the biotransformation of glycocholic acid and deoxycholic acid, respectively, already present in the cultivation medium. This is the first report of such compounds and also the first time an acylation has been observed for an Erythrobacter vulgaris marine isolate. / FAPESP: 2011/23159-0
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Purifica??o e caracteriza??o parcial de uma B-D glicosidase de Artemia franciscana com a??o sobre celobiose e lactose

Nascimento, Rob?rio Medeiros do 27 February 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:03:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RoberioMN.pdf: 839058 bytes, checksum: 1087756ecda3734e7aef07c3e72cb26c (MD5) Previous issue date: 2008-02-27 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / ?-D-glucosidase (EC 3.2.1.21) is one of the most interesting glycosidases, especially for hydrolysis cellobiose releasing glucose, is last step degradation of cellulose. This function makes the ?-D-glucosidase is of great interest as a versatile industrial biocatalyst, being critical to various bio-treatment / biorefinery processes, such as bioethanol production. Hen in the report, a ?-D-glucosidase was extracts from protein extracted of the invertebrate marine Artemia franciscana was purified and characterized with a combination of precipitation with ammonium sulfate (0 - 30%, 30 to 50%, 50 to 80%), the fraction saturated in the range of 30 to 50% (called F-II) was applied in a molecular exclusion chromatography, in Sephacryl S-200, the fractions corresponding to the first peak of activity of ?-D-glucosidase were gathered and applied in a chromatography of ion exchange in Mono Q; the third peak this protein obtained chromatography, which coincides with the peak of activity of ?-D-glucosidase was held and applied in a gel filtration chromatography Superose 12 where the first peak protein, which has activity of ?-D-glucosidase was rechromatography on Superose 12. This enzyme is probably multimerica, consisting of three subunit molecular mass of 52.7 kDa (determined by SDS-PAGE) with native molecular mass of 157 kDa (determined by gel filtration chromatography on Superose 12 under the system FPLC). The enzyme was purified 44.09 times with a recovery of 1.01%. Using up p-nitrophenyl-?-D-glucopiranoside as substrate obtained a Km apparent of 0.229 mM and a Vmax of 1.109 mM.60min-1.mL-1mM. The optimum pH and optimum temperature of catalysis of the synthetic substrate were 5.0 and 45 ?C, respectively. The activity of the ?-D-glucosidase was strongly, inhibited by silver nitrate and N- etylmaleimide, this inhibition indicates the involvement of radical sulfidrila the hydrolysis of synthetic substrate. The ?-D-glucosidase of Artemia franciscana presented degradativa action on celobiose, lactose and on the synthetic substrate ?-nitrophenyl-?-D-glucopiranoside indicating potential use of this enzyme in the industry mainly for the production of bioethanol (production of alcohol from the participating cellulose), and production hydrolysate milk (devoid of milk lactose) / ?-D-glicosidase (EC 3.2.1.21) ? uma das mais interessantes glicosidases, especialmente por hidrolisar celobiose liberando glicose, ?ltimo passo de degrada??o de celulose. Esta fun??o faz com que a ?-D-glicosidase seja de grande interesse como um vers?til biocatalizador industrial, sendo critica para v?rios processos de bio-tratamento / biorrefinaria, como produ??o de bioetanol. Neste trabalho, uma ?-D-glicosidase extra?da de extratos prot?icos do invertebrado marinho Artemia franciscana foi purificada e caracterizada com uma combina??o de precipita??o com sulfato de am?nio (30; 50; 80%), a fra??o saturada na faixa de 50% (chamada F-II) foi aplicada em uma cromatografia de exclus?o molecular em Sephacryl S-200, as fra??es correspondentes ao primeiro pico de atividade da ?-D-glicosidase foram reunidas e aplicadas numa cromatografia de troca i?nica em Mono Q; o terceiro pico prot?ico obtido nessa cromatografia, o qual coincide com o pico de atividade da ?-D-glicosidase, foi reunido e aplicado numa cromatografia gel filtra??o Superose 12 onde o primeiro pico prot?ico, o qual possui atividade da ?-D-glicosidase, foi recromatografado em Superose 12. Esta enzima provavelmente ? multimerica, constitu?da por tr?s subunidades, de massa molecular de 52,7 kDa (determinado por SDS-PAGE) e com massa molecular nativa de 157 kDa (determinado por cromatografia gel filtra??o em Superose 12 sob o sistema FPLC). A enzima foi purificada 44,09 vezes com uma recupera??o de 1,01%. Utilizando-se ?-nitrofenil-?-D-glicopiranos?deo como substrato obtivemos uma Km aparente de 0,229 mM (12,7 ?M de produto/cm/hora) e Vm?x de 1,109 mM.60min-1.mL-1. O pH ?timo e a temperatura ?tima de cat?lise do substrato sint?tico foram 5,0 e 45?C, respectivamente. A atividade ?-D-glicosid?sica foi fortemente inibida por nitrato de prata e N-etilmaleimida, esta inibi??o indica o envolvimento de radicais sulfidrila na hidr?lise do substrato sint?tico. A ?-D-glicosidase de Artemia franciscana apresentou a??o degradativa sobre celobiose, lactose e sobre o substrato sint?tico ?-nitrofenil-?-D-glicopiranos?deo, indicando potencial uso desta enzima na ind?stria principalmente para produ??o de bioetanol (produ??o de ?lcool a parti de celulose) e produ??o de leite hidrolisado (leite destitu?do de lactose)

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