Cancer is increasingly prevalent globally and influenced by factors such as obesity and smoking. Cancer itself and chemotherapies, like cisplatin, can affect our reproductive organs and increase the risk of involuntary childlessness. In the ovaries there are oocytes that are surrounded by cumulus cells (CC) and the CC provides the oocyte with nutrients like pyruvate, which is important for the oocytes ability to mature. If the oocyte does not receive sufficient amount of nutrients the ovulation may be compromised. The CC are not well studied, and few prior studies have been done specifically to observe the impact of chemotherapies on CC. Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha (PPARGC1A) is important for the mitochondrial biogenesis in cells. The purpose of the project was to evaluate a method for RNA extraction in CC and observe the impact of cisplatin exposure on the PPARGC1A expression. CCs were aspirated from bovine ovaries and exposed to cisplatin during in vitro maturation. RNA was eluted using the QIAcube and then quality assured. The primer β2 microglobulin (B2M) was used as an endogenous control in the qPCR. The results showed that PPARGC1A was minimally expressed in bovine CC and was inadequate for use when evaluating if cisplatin changes the RNA expression in CC. However, the QIAcube proved to be a suitable method for RNA extraction from bovine CC and B2M showed to be suitable as an endogenous control in bovine CC.

Parodontit är en inflammatorisk tandsjukdom som tar sin utgångspunkt i tandköttsinflammation (gingivit). När inflammationen sprider sig till tandköttsskåran bryts stödjevävnaden ned och en tandköttsficka bildas. Skillnader har påvisats i den subgingivala mikrobiotans storlek och komplexitet mellan parodontitpatienter och friska personer. Etiologin bakom parodontit är inte fullständigt klarlagd, men fynd som dessa ger stöd åt teorin om att sjukdomsförloppet initieras genom uppkomsten av obalans i mikrobiotans sammansättning. Porphyromonas gingivalis är en gramnegativ, obligat anaerob, stavformad bakterie som framför allt återfinns som en del av biofilmen i de djupare delarna av tandköttsskåran. Den är en proteolytisk bakterie som utnyttjar fermentering av aminosyror för sin energiproduktion. För detta ändamål uttrycker P. gingivalis flera olika proteaser. Förutom att proteaserna som P. gingivalis uttrycker är essentiella för dess näringstillförsel utgör de betydande virulensfaktorer. Tillväxt och överlevnad hos P. gingivalis är delvis beroende av dess förmåga att tillägna sig järn, vilket upptas från omgivningen. Nedbrytning och upptag av hem och hemliknande molekyler förmedlas av trypsin-liknande proteaser kända som gingipains. För att klargöra sambandet mellan järntillgång, tillväxt och proteolytisk aktivitet odlades P. gingivalis W50-d under 72 timmar i Brain heart infusion (BHI) med olika hemintillsatser. Den optiska densiteten vid 600 nm och antalet colony forming units (CFU) användes för att mäta tillväxten medan proteolytisk aktivitet mättes med två olika fluorescerande substrat. Mätningarna visade konsekvent störst tillväxt och proteolytisk aktivitet vid låga heminhalter. Resultaten kan förklaras av att bakteriestammar med hög patogenicitet har ett lägre krav på hemintillgång. Det är sannolikt att tillväxt och proteolytisk aktivitet hos Porphyromonas gingivalis påverkas av hemintillgång, men för att med tillförlitlighet kunna hävda på vilket sätt krävs vidare studier. / Periodontitis is an inflammatory periodontal disease that originates from inflammation of the gums (gingivitis). The spreading of inflammation to the gingival crevice may lead to tissue destruction and formation of a periodontal pocket. Differences have been observed in the size and complexity of the subgingival microbiota between patients with periodontitis and healthy individuals. The etiology behind periodontitis is not fully understood, but evidence suggests that the disease may be initiated by the emergence of dysbiosis. Porphyromonas gingivalis is a gram-negative, obligate anaerobic rod primarily found as part of the biofilm of the gingival crevice and in the deep periodontal pocket. Being a proteolytic bacterium, it utilizes the fermentation of amino acids for energy production. For this purpose, P. gingivalis expresses various proteases. In addition to the proteases expressed by P. gingivalis being essential for its nutrition, they constitute important virulence factors. The growth and survival of P. gingivalis are, to some extent, dependent on its ability to acquire iron from the environment. Degradation and uptake of heme and heme-like molecules are facilitated by trypsin-like proteases known as gingipains. To elucidate the relationship between iron availability, growth, and proteolytic activity, P. gingivalis W50-d was cultured for 72 hours in Brain Heart Infusion (BHI) supplemented with various hemin concentrations. Optical density at 600 nm and the number of colony-forming units (CFU) were measured to assess growth, while proteolytic activity was determined using two different fluorescent substrates. Analyses consistently showed increased growth and proteolytic activity at low hemin concentrations. The results can be explained by bacterial strains with high pathogenicity having a lower requirement for hemin availability. It is likely that the growth and proteolytic activity of P. gingivalis are influenced by hemin availability, but further studies are required to reliably determine the nature of these interactions.

<p>Coeliac disease is a chronic inflammatory disease treated with a gluten-free diet, excluding barley, rye and wheat. Hence, there is a demand for methods able to detect gluten in foods in order to ensure correct labeling of products. According to the Codex Alimentarius Commission, 20ppm gluten is the maximum amount allowed in food labeled gluten-free.</p><p>PCR can detect DNA from cereals in food. Four real-time PCR-systems,</p><p>using TaqMan®-probes for detection of barley, oat, rye and wheat were optimized and evaluated. Evaluations were carried out using seeds. Primers were targeted to genes coding for prolamines, seed storage proteins. PCR-systems targeted to barley, oat and wheat were shown to be specific for the cereals corresponding to each system. The system targeted to rye showed cross-reactions with durum wheat and spelt wheat. Detection limits were 50pg, corresponding to <10 haploid genome copies for each cereal. All systems were able to detect 250ppm amounts of DNA, most likely even smaller amounts are detectable. All systems showed an amplification efficiency of ≥95%.</p><p>Systems for detection of barley, oat and wheat are ready for further evaluation, using food products as samples. The rye system however, needs to be re-designed before further evaluation can take place.</p>

<p>Rapporten laddas upp av lärare om detta godkänns av handledare.</p>

No description available.

Vårdrelaterade infektioner (VRI) är ett ökande problem inom hälso- och sjukvården. På neonatalavdelningen på Länssjukhuset Ryhov i Jönköping har det förekommit inkonsekventa odlingsresultat vid misstänkt VRI orsakad av Staphylococcus aureus. Att förebygga VRI samt värna om patientsäkerheten kräver känsliga och pålitliga laboratorieanalyser. Syftet med studien var att bestämma och jämföra lägsta detektionsintervall för metoderna odling och qPCR med och utan anrikning i MAMSA-buljong, av S. aureus. Seriespädningar av S. aureus tillreddes och koncentrationer för ursprungsrören uträknades via viable count (VC). Odling på blodagar samt qPCR med och utan anrikning i MAMSA-buljong utfördes. Resultaten användes för att bestämma ett lägsta detektionsintervall. Odling gav ett lägsta detektionsintervall mellan 0,5–62 CFU/ml, och qPCR mellan 6400–140 000 CFU/ml. Anrikning med MAMSA-buljong innan qPCR-analys gav ett lägsta detektionsintervall mellan 0,6–140 CFU/ml. För detektion via odling räcker enstaka till tiotals CFU/ml i analysprovet. Vid qPCR behövs tusentals till hundratusentals CFU/ml i analysprovet, men vid qPCR med MAMSA-anrikning kan detektionsintervallet sänkas till nivåer jämförbara med odling. För att kunna applicera studiens resultat på den laborativa verksamheten krävs vidare studier med fler bakteriearter och replikat. / Hospital-acquired infections (HAI) are an increasing problem in health care facilities. In the neonatal intensive care unit at Länssjukhuset Ryhov in Jönköping, inconsistent cultivation results have been observed for suspected HAI caused by Staphylococcus aureus. To prevent HAI and to maintain patient safety, sensitive and reliable laboratory tests are essential. The aim of the study was to determine and compare the lowest range of detection for cultivation and qPCR with and without enrichment in MAMSA broth, for S. aureus. Serial dilutions of S. aureus were made, and the original concentration was determined through viable count. Cultivation on blood agar and qPCR with and without enrichment in MAMSA broth was performed. The results were used to determine a minimum detection range. For cultivation, a minimum detection range of 0,5–62 CFU/ml was determined and for qPCR a range of 6400–140 000 CFU/ml. For qPCR after enrichment in MAMSA broth, a lowest detection range of 0,6–140 CFU/ml was determined. For detection with cultivation single to tenths of CFU/ml were needed in the sample. For qPCR thousands to tenths of thousands of CFU/ml were needed. For qPCR with enrichment in MAMSA broth the detection range could be lowered to levels comparable with cultivation. For clinical application, further studies are needed with more bacterial species and replicates.

Reumatoid artrit (RA) är den vanligaste autoimmuna sjukdomen och prevalensen är 0.5-1.0% av populationen i industriella länder. Diagnos av RA sker bland annat genom analys av markörerna reumatoid faktor (RF) samt antikroppar mot cykliskt citrullinerad peptid (anti-CCP). Nefelometrisk metod samt CMIA har båda varit huvudmetoder för markörerna RF och anti-CCP respektive vid utredning av RA på Laboratoriemedicin på Länssjukhuset Ryhov i Jönköping. Införskaffning av instrumentet Phadia 250 har gjort det möjligt att sammanställa analyserna för markörerna på samma enhet. Syftet med studien var att verifiera EliA-metoden för anti-CCP samt RF på instrumentet Phadia 250 för att kunna ersätta nuvarande analysmetoder för de båda RA-markörerna. Bestämning av cut-off, mellanliggande precision, inomserieprecision samt överensstämmelse med tidigare metod utfördes. Totalt 115 prover (70 blodgivare, 30 patientprover och 15 konsekutiva prover) användes. En korrelation utfördes för CMIA respektive nefelometriska metoden med EliA-metoden samt en kategoriöverensstämmelse för nefelometrisk metod, CMIA och EliA-metoden. God korrelation erhölls för anti-CCP mellan CMIA och EliA-metoden (r=0.953, p=0.001) samt för RF mellan nefelometriska metoden och EliA-metoden (r=0.835, p=0.048). Analys av samtliga markörer bör inkluderas som screening för RA för att upptäcka sjukdomen. Metoden EliA tillät analys av båda markörer och verifieringen möjliggjorde övergången till EliA-metoden för Laboratoriemedicin i Jönköping. / Rheumatoid arthritis (RA) is the most common autoimmune disease and the prevalence is 0.5-1.0% among the population in industrial countries. Diagnosis of RA is based partially on detection of the autoantibodies rheumatoid factor (RF) and anti-cyclic citrullinated peptide antibodies (anti-CCP). Nephelometry and CMIA have been the main methods for detection of the antibodies at Laboratoriemedicin at the County Hospital Ryhov in Jönköping. The purpose of this study was to verify the EliA-method for anti-CCP and RF on Phadia 250 in order to replace the current methods with the EliA-method. Determination of cut-off, intermediate precision, within-run precision and consistency with the previous method was performed on a total of 115 samples (70 blood-donors, 30 patient samples and 15 consecutive samples). A correlation between CMIA and the nephelometric method with EliA-method was performed and a cathegorical correspondance was done to assess the accordance between the previous methods with the EliA-method. A good correlation was obtained for anti-CCP between CMIA and the EliA-method (r=0.953, p=0.001) and RF obtained good correlation between the nephelometric method and the EliA-method (r=0.835, p=0.048). Analysis of both markers simultaneously has been recommended and the verification enabled the transition to the EliA-method on Phadia 250 for Laboratoriemedicin in Jönköping.

Sepsis är ett livshotande tillstånd som orsakas av bakterier i blodbanan. Tidig och korrekt antibiotikabehandling är viktig, antibiotikaresistens är ett ökande problem och resistensbestämning är därför essentiell. Vid sepsisdiagnostik med blododling krävs ofta minst två dygn innan resistensbesked kan ges. Antibiotikabehandling måste därför påbörjas innan odlingssvar. Rutinmetod för resistensbestämning vid svenska mikrobiologiska laboratorier är diskdiffusionsmetoden som är standardiserad av European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Vid diskdiffusion odlas bakterier på agarplattor och hämningszoner kring pappersdiskar med antibiotika används som mått på antibiotikaeffekt. Metoden kräver framväxta bakteriekolonier på agarplattor som ursprungsmaterial och utförandet tar 16-20 timmar. EUCAST har vidareutvecklat diskdiffusionsmetoden för snabb resistensbestämning (Rapid Antimicrobial Susceptibility Testing, (RAST)). Resistensbestämning med diskdiffusion utförs då direkt från positiv blododlingsflaska och hämningszoner mäts redan efter 4, 6 och 8 timmar. I metoden används olika brytpunkter för känslighetskategorisering vid de olika tidpunkterna. Syftet med studien var att undersöka hur väl RAST fungerade för Staphylococcus aureus och Streptococcus pneumoniae genom att undersöka bakterieisolat inokulerade i blododlingsflaskor. Totalt 31 isolat; 23 S.aureus och 8 S.pneumoniae undersöktes varav en hög andel med betalaktamresistens. Till båda bakteriearterna användes 5 sorters antibiotika. Zondiametrar mättes av två personer oberoende av varandra och resultaten jämfördes med de från standardiserad diskdiffusion. För S.aureus var vid 4 timmar 102/184 (55 %) avläsningar kategoriseringsbara, vid 6 timmar 164/184 (89 %) och vid 8 timmar 174/184 (95 %). Sammanlagt inträffade 7 felkategoriseringar varav 5 gällde underskattning av klindamycinresistens vid 4 timmar. S.pneumoniae hade sämre tillväxt och metoden var därför svårare att tillämpa. För S.pneumoniae var vid 4 timmar 74/80 (92 %) avläsningar kategoriseringsbara, vid 6 timmar 73/80 (91 %) och vid 8 timmar 77/80 (96 %). Resistens överskattades vid 21 zonmätningar vid 4 timmar. RAST fungerade väl för S.aureus efter 6 timmar. För S.pneumoniae kan sannolikt bedömning av penicillinresistens efter 6 timmar fungera men ytterligare undersökningar krävs. / Bacteria in the bloodstream may cause sepsis, therefore early and correct treatment is important. Antibiotic resistance is an increasing problem and antimicrobial susceptibility testing (AST) is essential for the patients survival. In sepsis with diagnosis based on blood culture, at least two days are required for results from AST. Routine AST-method in Swedish microbiological laboratories is the disc diffusion method standardized by the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). In disc diffusion, bacteria are grown on agar plates and inhibition zones around paper disks with antibiotics are used to measure the antibiotic effect. The method requires bacterial colonies as source material and takes 16–20 hours. EUCAST has further developed the method for Rapid Antimicrobial Susceptibility Testing (RAST). RAST is performed directly from positive blood culture bottles and inhibition zones are measured at 4, 6 and 8 hours. The method uses different breakpoints for categorization at the different timepoints. The purpose of the study was to evaluate RAST for Staphylococcus aureus and Streptococcus pneumoniae by examining bacterial isolates inoculated into blood culture bottles. Zone diameters were measured, and results were compared with those of standardized disk diffusion. For S.aureus, at 4 hours 102/184 (55%) readings were categorizable, at 6 hours 164/184 (89%) and at 8 hours 174/184 (95%). A total of 7 error categorizations occurred, 5 of which were underestimation of clindamycin resistance at 4 hours. For S.pneumoniae at 4 hours, 74/80 (92%) readings were categorizable, at 6 hours 73/80 (91%) and at 8 hours 77/80 (96%). Resistance was overestimated at 21 zone measurements at 4 hours.. RAST showed good results for S.aureus after 6 hours. For S.pneumoniae, further studies are required but RAST may work after 6 hours for penicillin resistance assessment.

Bakgrund: I hälso-och sjukvården är blodtrycksmätning en viktig och grundläggande metod vid korrekt diagnostik och hantering av högt blodtryck. Forskning har under flera år påvisat att olika komponenter påverkar noggrannheten av blodtrycksmätningen. Eftersom auskultatorisk och oscillometrisk blodtrycksmätning utförs på två olika sätt finns en risk att blodtrycksvärdet kan variera mellan metoderna. Syfte: Syftet med studien var att undersöka om det finns någon skillnad mellan auskultatorisk och oscillometrisk blodtrycksmätning utfört i både vila och efter ansträngning. Material och metod: Studien bestod av 20 slumpmässigt utvalda studenter från Hälsohögskolan i Jönköping. Blodtrycksmätning utfördes med hjälp av auskultatorisk blodtrycksmanschett med handmanometer och stetoskop samt oscillometrisk modalitet (OMRON M7). Resultat: Statistisk signifikant skillnad observerades mellan auskultatorisk och oscillometrisk modalitet, både i vila och efter ansträngning. Skillnaden är som störst efter ansträngning för auskultatorisk och oscillometrisk mätmetod, i både systoliskt och diastoliskt blodtrycksvärde. Diskussion: I vården har användning av oscillometrisk blodtrycksmodalitet ökat och därmed finns en risk för minskad reliabilitet och validitet av blodtrycksvärdet. Slutsatser: Statistisk signifikant skillnad föreligger mellan modaliteterna, både i vila och efter ansträngning. / Background: Blood pressure measurement is an important and fundamental method for correct diagnosis and management of high blood pressure, in healthcare. For several years, research has shown that different components affect the accuracy of blood pressure measurement. There is a risk that the blood pressure value may vary between auscultatory and oscillometric measurements because they are performed in two different ways. Purpose: The purpose was to investigate whether there is any difference between auscultatory and oscillometric blood pressure values performed in both rest and after stress. Material and method: The study consists of 20 randomly selected students from the School of Health and Welfare of Jönköping. The measurement was performed using auscultatory blood pressure cuff, sphygmomanometer with stethoscope and oscillometric modality (OMRON M7). Result: Statistically significant difference was observed between auscultatory and oscillometric values, both in rest and stress. The difference is greater after stress for both methods, in systolic and diastolic values. Discussion: In healthcare, use of oscillometric modality has increased thus there is a risk of reduced reliability and validity of the blood pressure value. Conclusion: Statistically significant difference was observed between auscultatory and oscillometric values, both in rest and after stress.

Bakgrund: Lungcancer och malignt melanom är exempel på två sjukdomar som undersöks med dual-modaliteten positron emission tomography/computed tomography (PET/CT). Vid undersökning med PET/CT erhåller patienten både en stråldos från Flourine-18 (18F) märkt med 2-[18F] fluoro-2-deoxy-D-glucose (18FDG) och från CT-modaliteten. Det finns strålningsrisker med undersökningen som kan uttrycka sig i form av stokastiska skador som exempelvis cancer. Syftet med studien var att jämföra stråldoserna mellan lungcancergruppen (misstänkt eller verifierad) och malignt melanomgruppen genom att beräkna den totala effektiva stråldosen samt redovisa riskerna med PET/CT-undersökningen. Material och metod: Materialet omfattades av parametrar gällande undersökningen och urvalet bestod av 20 patienter från lungcancergruppen respektive malignt melanomgruppen som hämtades från Nuklearmedicin, Länssjukhuset Ryhov, Jönköping. En retrospektiv metod med kvantitativ ansats användes för genomförandet av studien. Resultat: En signifikant skillnad (p &lt;0,001) mellan sjukdomsgrupperna förekom där lungcancergruppen erhöll 11,95 milliSievert (mSv) och malignt melanomgruppen 6,03 mSv och den procentuella riskökningen av letal cancer var 0,06 % respektive 0,03 %. Slutsatser: Lungcancergruppen erhöll en dubbelt så hög effektiv dos som malignt melanomgruppen. Den effektiva dosen är dock så låg att riskökningen av letal cancer är marginell och nyttan med undersökningen överväger riskerna. / Background: Lung cancer and malignant melanoma are diseases investigated by the dual-modality positron emission tomography/computed tomography (PET/CT). There are radiation risks with the examination that can appear as stochastic effects such as cancer. The aim of this study was to compare the radiation doses between the lung cancer group (suspected or verified) and the malignant melanoma group by calculating the total effective radiation dose and to declare the risk with the PET/CT examination. Material and method: The material contained parameters regarding the examination and the sample contained 20 patients from the two groups. The method was retrospective with a quantitative approach. Results: There was a significant difference (p &lt;0,001) between these two groups, were the lung cancer group received 11,95 milliSievert (mSv) and the malignant melanoma group 6,03 mSv and the percentage risk for lethal cancer increased by 0,06% and 0,03%, respectively. Conclusions: The lung cancer group received twice as much effective dose than the malignant melanoma group. However, the effective dose is so low that the risk increase of the lethal cancer is marginal, and the benefit of the examination outweighs the risks.