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Estudo computacional das monoaminoxidases A e B com substratos e inibidores

Canto, Vanessa Petry do January 2014 (has links)
A monoaminoxidase (MAO) é uma enzima importante, que pode atuar como alvo terapêutico. Inibidores da MAO-A apresentam atividade no tratamento de distúrbios de humor, enquanto os inibidores seletivos da MAO-B tem uso, especialmente, no tratamento da Doença de Parkinson. O conhecimento das interações ENZIMA-INIBIDOR é importante no planejamento de fármacos. Nesse contexto, foram realizados estudos das enzimas MAO-A e MAO-B com diferentes ligantes, através da combinação das metodologias de docking, Dinâmica Molecular e Ensemble Docking. Foram escolhidos os ligantes derivados da 1,4-naftoquinona (1,4-NQ), lapachol, menadiona, norlapachol, A2, B2 e C2, os inibidores comerciais clorgilina (MAO-A) e selegilina (MAO-B) e os substratos naturais serotonina (MAO-A) e dopamina (MAO-B). Os resultados do docking mostraram interação de todos os ligantes com algum dos resíduos da "gaiola aromática" (FAD, Tyr407/Tyr444 para MAO-A, Tyr398/Tyr435 para MAO-B), uma importante região catalítica da MAO. Além disso, a seletividade observada experimentalmente da menadiona com a MAO-B também foi observada no docking. Através da DM, foi possível observar algumas diferenças conformacionais entre as estruturas da MAO-A e MAO-B, que podem explicar a seletividade entre as duas isoformas, como por exemplo, distâncias entre resíduos do sítio ativo e ligações de hidrogênio. A partir do Ensemble Docking, foi verificado que a conformação do receptor influencia significativamente o escore das interações ENZIMA+LIGANTE para ligantes volumosos. / Monoamine oxidase (MAO) is an important enzyme that acts as therapeutic target. MAO-A inhibitors show pharmacological activity in the treatment of mood disorders, whereas MAO-B inhibitors are used especially in treatment of Parkinson's Disease. Knowledge of enzyme-inhibitor interactions is important in drug design. Therefore, studies of MAO-A and MAO-B enzymes with different ligands were performed by combining docking, Molecular Dynamics and Ensemble Docking methodologies. Ligands derived from 1,4-naphthoquinone, lapachol, menadione, nor-lapachol, A2, B2, C2, commercial inhibitors clorgyline (MAO-A) and selegiline (MAO-B) and the natural substrates serotonin (MAO-A) and dopamine (MAO-B) were chosen. The docking results shows interactions of all ligands with some residue of the "aromatic cage” (FAD cofactor, Tyr407/Tyr444 for MAO-A and Tyr398/Tyr435 for MAO-B), an important catalytic region of MAO. Furthermore, the experimentally observed selectivity of menadione with MAO-B was also observed by Docking. In Molecular Dynamics results, conformational differences were observed between MAO-A and MAO-B structures, which could explain the selectivity observed between isoforms, e.g. distances between residues of the active site and hydrogen bonds. Ensemble Docking results shows that the conformation of the receptor significantly influence the score of ENZYME+LIGAND interactions for bulky ligands.
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Um modelo para avaliação e acompanhamento contínuo do nível de aquisição de conhecimentos do aprendiz.

Edson Pinheiro Pimentel 31 March 2006 (has links)
Muitos métodos de avaliação utilizados no atual Sistema Educacional não fornecem informações que dêem suporte para a aprendizagem. Da mesma forma, a maior parte dos ambientes computacionais de aprendizagem não dão a devida importância ao processo de avaliação e ao uso que pode ser feito com as informações coletadas a respeito do nível de conhecimentos do aprendiz. Conseqüentemente, estes ambientes não são capazes de responder, a qualquer momento, o que o aprendiz sabe ou não sabe. Conhecer o que o estudante sabe e o que ele não sabe é o primeiro passo para melhorar o processo de ensino-aprendizagem. Lacunas de aprendizagem causadas pela ausência de pré-requisitos contribuem para ampliar as dificuldades de aprendizagem. O ensino de habilidades metacognitivas de forma que o estudante tenha o controle da própria aprendizagem e a avaliação contínua com a respectiva realimentação são assenciais neste processo, de modo que o aprendiz aprenda a aprender. Este trabalho apresenta um modelo para avaliação e acompanhamento contínuo do nível de aquisição de conhecimentos do aprendiz. O modelo proporciona condições para o monitoramento detalhado do nível cognitivo e metacognitivo do aprendiz por parte de todos os envolvidos no sistema educativo, principalmente o professor e o estudante. Além disso, a especificação de uma arquitetura computacional para o modelo apresentado, serve como uma diretriz para a incorporação do mesmo em Sistemas Instrucionais Inteligentes.
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Classificação de alvos utilizando atributos cinemáticos

Mateus de Araujo Fernandes 13 October 2009 (has links)
Sistemas de auxílio à tomada de decisões no cenário de controle/vigilância do espaço aéreo têm sido cada vez mais solicitados à medida que os operadores necessitam lidar com uma maior quantidade de informações e tomar decisões de forma mais ágil e precisa. Neste contexto, é apresentada uma solução para o problema de classificação de alvos aéreos com base em atributos cinemáticos, especificamente velocidade, aceleração e altitude. Estes dados podem ser estimados por um algoritmo de rastreamento a partir de informações de um radar de vigilância primário. São apresentadas três propostas de classificadores, sendo o primeiro deles baseado na relação entre probabilidades condicionais expressa pelo Teorema de Bayes, o segundo implementado a partir de um sistema de inferência fuzzy com pertinências unidimensionais e o terceiro também apoiado na lógica fuzzy, porém com funções de pertinência bidimensionais constituídas a partir de envelopes de vôo das classes de alvos previstas. As características destes classificadores são comparadas entre si e com resultados de trabalhos similares encontrados na literatura. Os três classificadores são capazes de fornecer em tempo real a crença da pertinência de um alvo a determinadas classes, mostrando utilidade na ausência de dados provenientes de um radar secundário/IFF ou de sensores imageadores.
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Modelagem geométrica computacional da evolução da superfície de queima de blocos de propelente.

Wilson Kiyoshi Shimote 00 December 1997 (has links)
O cálculo das propriedades relacionadas com a geometria de um bloco de propelente, como área de queima, volume de propelente residual, momentos de inércia e centro de massa, e a evolução da superfície ao longo da queima, consiste em uma das etapas fundamentais do projeto de motor foguete que utiliza propelente sólido, valores estes que serão utilizados para a determinação dos parâmetros propulsivos do motor, como pressão na câmara de combustão e empuxo. Este trabalho apresenta um método baseado na discretização da superfície de queima inicial em elementos triangulares com o objetivo de calcular a área de queima e o volume de propelente residual. O método gera uma seqüência de novas superfícies de queima usando a malha de pontos obtida no passo anterior podendo desta forma determinar a evolução da superfície de queima de um bloco de propelente. A validação do método é realizada através da comparação dos resultados analíticos da área de queima e da massa de propelente residual, com os resultados obtidos numericamente utilizando três motores cujos blocos de propelente possuem diferentes configurações.
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Análise de faltas em modelo representativo de sistema elétrico proposto para plataforma de lançamento de veículos espaciais

Francisco Yamanaka 28 June 2006 (has links)
Este trabalho apresenta uma proposta de modelo destinado a representar o sistema elétrico de potência previsto para ser implantado no novo Sistema Plataforma de Lançamento, o qual atenderá essencialmente as operações de integração vertical, testes e lançamento de Veículos Lançadores de Satélites (VLS), localizado no Centro de Lançamento de Alcântara (CLA) no estado do Maranhão. Nesse modelo são simuladas faltas, em pontos estratégicos, com o principal objetivo de estimar valores de corrente de curto-circuito e sobretensões, os quais servirão de referências para auxiliar a elaboração de especificação e dimensionamento de dispositivos de proteção e condutores elétricos destinados ao Projeto Executivo desse sistema de potência. Os resultados apresentados, nas simulações computacionais dessas faltas, são consistentes com o tipo de sistema de distribuição elétrico adotado para a mencionada plataforma, condição que ratifica o modelo proposto neste trabalho.
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AC3As-Web: ambiente cooperativo de apoio à avaliação de aprendizagem significativa na Web.

Marcos José Silva e Cunha 00 December 2002 (has links)
Ambientes de educação tradicionais usualmente não estão organizados para atividades de ensino e avaliação de aprendizagem significativa. Atividades de aprendizagem significativa seriam extremamente adequadas à realidade atual, pois capacitariam o aprendiz a aprender e o professor se tornaria um facilitador do processo. Nesse papel, o facilitador poderia propor desafios aos aprendizes e motivá-los para a aprendizagem e avaliação. A avaliação de aprendizagem significativa, no caso desta pesquisa, consiste em atividades individuais ou cooperativas de edição e desenvolvimento de mapas conceituais. Neste trabalho apresenta-se um modelo e arquitetura de ambiente que possibilita ao facilitador avaliar o nível de aprendizagem significativa alcançado pelos aprendizes em relação a uma unidade didática apresentada. O modelo e a arquitetura do ambiente de avaliação de aprendizagem significativa, num contexto cooperativo via Web, foram desenvolvidos e implementados em Java, para suportar atividades de avaliação como parte do processo de aprender e para enriquecer as experiências de aprendizagem de cada aprendiz, individualmente ou em grupo. Foi desenvolvido um exemplo prático de uso para avaliar o ambiente. A partir desse exemplo de uso pode-se verificar a viabilidade e flexibilidade do ambiente. Puderam também ser identificadas, algumas limitações e propostas para melhorar o ambiente.
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Interação viscosa-não-viscosa na análise do escoamento em grades lineares de máquinas de fluxo axiais.

Antonio Fernando Bizarro 00 December 1998 (has links)
O presente trabalho desenvolve uma metodologia numérica de análise do escoamento em grades lineares de perfis aerodinâmicos com aplicação direcionada ao dimensionamento de máquinas de fluxo axiais. O método consiste na realização de uma interação entre dois modelos computacionais: o potencial (ausência de efeitos viscosos) e o de camada limite, obtendo-se resultados muito próximos dos experimentais e com baixo custo computacional. O código potencial, baseado no método dos painéis, utiliza a formulação de Hess & Smith [1
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Geração de entropia em duto retangular com temperatura variável no contorno.

Cesar Augusto Marcelino Matoso 00 December 1998 (has links)
Dutos retangulares são muito utilizados em dispositivos trocadores de calor. Este trablaho visa investigar, usando um modelo computacional, os efeitos da geração de entropia provocadas pelas irreversibilidades decorrentes do atrito viscoco do escoamento e das resultantes da transferência de calor em escoamentos laminares com perfis térmicos e hidrodinamicamente desenvolvidos. Esta investigação permite avaliar a geração de entropia, a qual é influenciada pelo campo de temperatura no contorno, pelo tipo de escoamento, pelas propriedades do fluido e por parâmetros geométricos. Primeiro, o modelo calcula o campo de velocidade. Em seguida é resolvida a equação da energia, obtendo-se assim, o campo de temperatura do fluido para uma dada distribuição imposta no contorno, não necessariamente uniforme. Uma vez conhecidos o campo de velocidade e de temperatura é calculado o campo de geração de entropia por unidade de volume. Com uma dupla integração é calculada a geração de entropia global por unidade de comprimento na seção analisada. A consistência do modelo computacional é verificada pelo refino da malha e pela diminuição da tolerância. São realizadas validações dos métodos utilizados para os cálculos dos campos de velocidade e de temperatura do fluido. Várias razões de aspecto (altura por largura do duto) são estudadas para vários tipos de fluidos. A influência devida aos efeitos viscosos e da troca de calor sobre a geração de entropia é estudada para vários tipos de fluidos, variando-se o número de Prandtl.
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Um método de gerenciamento de energia para nós de redes de sensores sem fio

Ricardo Godói Vieira 25 November 2010 (has links)
Este trabalho de pesquisa propõe um Método de Gerenciamento de Energia para Nós de Redes de Sensores sem Fio denominado MGERSF. Diante deste contexto, concebeu-se o MGERSF, como uma possível solução para algumas dificuldades existentes e inerentes ao gerenciamento de energia em redes de sensores sem fio. Durante o desenvolvimento desta pesquisa, verificou-se que a aplicação do MGERSF não se tratava apenas de um conjunto de boas práticas, mas sim de um método definido e caracterizado em sete passos por um conjunto de aplicações de conceitos técnicos e/ou científicos. A verificação da aplicação do método proposto foi realizada por meio de um estudo de caso. Ela envolveu a implementação, sem completeza, de três experimentos que possibilitaram a aquisição de dados de alguns sensores. Neles, aplicou-se, paulatinamente, o método MGERSF. Os resultados obtidos, a partir da realização destes experimentos, se mostraram satisfatórios.
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Investigação de ganhos na aprendizagem de conceitos físicos envolvidos em circuitos elétricos por usuários da ferramenta computacional Modellus

Dorneles, Pedro Fernando Teixeira January 2005 (has links)
O objetivo deste trabalho de pesquisa foi investigar o desempenho de alunos que trabalharam com atividades de simulação e modelagem computacionais no estudo de circuitos elétricos, utilizando o software Modellus, comparado com alunos expostos apenas ao sistema tradicional de ensino. A fundamentação teórica adotada esteve baseada no referencial de trabalho de Halloun sobre modelagem esquemática e na teoria de Ausubel sobre aprendizagem significativa. O estudo envolveu 193 alunos de cursos de Engenharia, da disciplina de Física-II oferecida pela UFRGS no 2° semestre de 2004. O procedimento didático ocorreu em duas etapas. Na primeira, os alunos do grupo experimental trabalharam com um conjunto de atividades sobre circuitos elétricos simples durante cinco aulas e na etapa seguinte, com um conjunto de atividades sobre circuitos RLC durante quatro aulas. Cada aula teve duração de 1h40min. Os resultados quantitativos mostram que houve melhorias estatisticamente significativas no desempenho dos alunos do grupo experimental, quando comparado aos alunos dos grupos de controle, expostos apenas ao método tradicional de ensino. Os resultados de nossa análise qualitativa sugerem que muitos dos alunos atingiram uma aprendizagem significativa. Nossas observações e o levantamento de opiniões mostraram que o procedimento didático adotado exigiu muita interação dos alunos com as atividades computacionais, dos alunos entre si e com o professor, tornando-se um elemento motivador na aprendizagem dos alunos.

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