A tuberculose bovina (bTB) é um problema sanitário importante em Moçambique e ainda a espera de uma ação organizada por parte dos Serviços Veterinários Oficiais. O presente estudo teve por objetivo investigar e mapear os genótipos de Mycobacterium bovis circulantes no país e paralelamente maximizar a utilização de abatedouros como fonte de informação epidemiológica da bTB. Durante o período de outubro de 2016 a abril de 2017 foram colhidas um total de 90 amostras de lesões sugestivas de tuberculose bovina nos abatedouros Municipais de Maputo e Maxixe e dois abatedouros privados da província de Maputo. Essas amostras, juntamente com outras 10, disponibilizadas pelo Laboratório Central de Veterinária e 72 do banco de amostras de Faculdade de Veterinária de Moçambique foram processadas para isolamento, identificação e discriminação molecular (MIRU-VNTR e spoligotyping) de micobactérias. Nos abatedouros foram coletados dados para calcular as prevalências de carcaças com lesões sugestivas de tuberculose e foi estimada em 0,63% e 80% das carcaças condenadas por tuberculose apresentaram lesões compatíveis com generalização da infecção. Foram obtidos 104 isolados identificados como gênero Mycobacterium, dos quais 80 foram compatíveis com o MTBC e 10 MNT. Destes 80 MTBC, 70 foram identificados como M. bovis. O MIRU-VNTR discriminou os 70 isolados de M. bovis em 47 perfis, agrupados em 3 complexos clonais e cinco singletons. Dos 24 loci estudados, os que apresentaram maiores polimorfismos foram MIRU 960, 2996 e QUB-4052. Em relação ao spoligotyping, foram identificados cinco perfis, dos quais o mais prevalente foi o SB0961, seguido do SB0140, SB2306, SB2481 (novo) e SB1099. Dos 70 isolados submetidos a análises dos complexos clonais africano 1, africano 2, europeu 1 e europeu 2, foram detectados apenas 18,5% de europeu. O distrito de Machanga foi o que apresentou maior diversidade de isolados e o Govuro maior número de isolados de M. bovis. Quando comparados as técnicas, o MIRU-VNTR apresentou maior poder de discriminação em relação ao spoligotyping. O complexo clonal europeu 1 está relacionado com o SB0140 que por sua vez é característico de isolados do Reino Unido e de países que tiveram trocas comerciais de bovinos com o país, incluindo os circunvizinhos a Moçambique e de onde há registros da importação de animais para Moçambique. A não identificação precisa dos complexos clonais dos spoligotyping SB0961, SB2306, SB2481 relacionados, podem ser derivados do BCG, que é sugestivo de evolução clonal própria de Moçambique e os complexos clonais até hoje existentes não são suficientes para discriminar os isolados de Moçambique. Embora os dados de abatedouros sugeriram que a prevalência da tuberculose bovina em Moçambique está entre as mais baixas dos países africanos, a predominância de carcaças com lesões generalizadas significa alto risco de exposição de animais e humanos, sobretudo das populações rurais que têm estreito contato com esses animais. Esse risco é ampliado em função da alta prevalência de humanos que vivem com HIV/AIDS no país. Assim, recomenda-se que Moçambique estruture programa de controle da doença nos animais e métodos de diagnóstico que detectem a infecção por M. bovis na população humana. / Bovine tuberculosis (bTB) is a major sanitary problem in Mozambique and awaits organized action by the Official Veterinary Services. The aim of this work was to investigate and map the circulating Mycobacterium bovis genotypes in the country and to maximize the use of slaughterhouses as a source of epidemiological information for bTB. During the period from October 2016 to April 2017, a total of 90 samples with lesions suggestive of bovine tuberculosis were collected from Maputo and Maxixe Municipal abattoirs and two private abattoirs from the province of Maputo. These samples, together with 10 others provided by the Central Veterinary Laboratory and 72 from the Veterinary Faculty sample bank were processed for isolation, identification and molecular discrimination (MIRU-VNTR and spoligotyping) of mycobacteria. Samples collected in the slaughterhouses were analyzed by calculating the prevalence of carcasses with lesions suggestive of bTB, which was estimated at 0.63% and 80% of carcasses condemned for tuberculosis presented lesions compatible with generalized infection. A total of 104 isolates were identified as M. bovis as Mycobacterium genus were obtained, of which 80 were compatible with MTBC and 10 MNT. Of these 80 MTBC, 70 were identified as M. bovis. The MIRU-VNTR discriminated the 70 isolates of M. bovis in 47 profiles, grouped in 3 clonal complexes and 5 singletons. Of the 24 loci studied, the ones with the highest polymorphisms were MIRU 960, 2996 and QUB-4052. In relation to spoligotyping, five profiles were identified; SB0961 was the most prevalent, being SB0961, followed by SB0140, SB2306, SB2481 (new) and SB1099. Of the 70 isolates submitted to analyzes of the clonal complexes African 1, African 2, European 1 and European 2, only 18.5% of European complex were detected. Machanga district presented the greatest diversity of isolates, while Govuro district had largest number of isolates of M. bovis. The MIRU-VNTR presented greater power of discrimination in relation to spoligotyping. The European clonal complex 1 was related to SB0140 which in turn is characteristic of isolates from the United Kingdom and from countries that have had commercial trade in cattle with UK including those surrounding Mozambique and where there are records of imports of animals for Mozambique. The precise identification of the clonal complexes of the SB0961, SB2306 and SB2481 related spoligotypings subject to the BCG derivatives, is suggestive of the clonal evolution of Mozambique and that the clonal complexes to date are not sufficient to discriminate against the isolates from Mozambique. Although data from slaughterhouses suggested that the prevalence of bovine tuberculosis in Mozambique is among the lowest in African countries, the predominance of carcasses with generalized lesions means a high risk of animal and human exposure, especially of rural populations that have close contact with these animals. This risk is amplified due to the high prevalence of people that living with HIV/AIDS in the country. Thus, it is recommended that Mozambique structure a disease control program in animals and diagnostic methods that detect M. bovis infection in the human population.

Submitted by Leticia Schettini (leticia@ufrrj.br) on 2017-03-16T14:03:46Z No. of bitstreams: 1 2008 - Telma de Figueiredo do Nascimento.pdf: 875301 bytes, checksum: 0d53eac4a000372a6c136ed189b7dd48 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T14:03:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Telma de Figueiredo do Nascimento.pdf: 875301 bytes, checksum: 0d53eac4a000372a6c136ed189b7dd48 (MD5) Previous issue date: 2008-11-19 / In Brazil it is believed that bovine tuberculosis is present in all states, as is in all continents. The official indices are 1.3% of the national herd infected, which represent a large number in the order of 2.5 million animals. Mycobacterium bovis stands out as zoonotic disease of major importance. Increasing are the economic losses, caused by tuberculosis in cattle, such as low productivity of the herd, condemnation of carcasses at slaughterhouses, reduction in the production of milk and meat, commitment marketing of animals and their products domestically and externally. It is estimated that about 5,0 % of human tuberculosis is caused by Mycobacterium bovis. The success of a program to control a disease is closely linked to various factors including the knowledge of the history of the causative agent and its spatial and temporal distribution. Molecular methods are used as auxiliary tools in combating the disease by providing information in order to achieve these goals. In the last decade, methods for molecular typing of M. tuberculosis were developed and implemented on a large scale. Although the genomes of the two parasites are very similar, the discriminatory power of the methods is smaller in Mycobacterium bovis. In this study were analyzed samples from cattle slaughtered in refrigerators under Federal Inspection in the state of Minas Gerais. A total of 215 cultures sent to the Laboratory of Applied Molecular biology to Micobacterioses, and only 159 confirmed a profile of Mycobacterium bovis through molecular techniques applied. The south and state has the highest prevalence of the disease in the samples studied. The method of Spoligotyping applied to the samples showed the presence of 32 different profiles, obtaining a HGDI of 0.86 and a departure from the MIRU-VNTR presented 40 different profiles with a HGDI of 0.87. In this study was to evaluate that when using these techniques together we get a greater discriminatory power between these strains. / No Brasil acredita-se que a tuberculose bovina est? presente em todos os Estados, assim como est? em todos os continentes. Os ?ndices oficiais est?o em 1,3% do rebanho nacional infectado, que representaria um n?mero elevado, na ordem de 2,5 milh?es de animais. Mycobacterium bovis destaca-se como zoonose de reconhecida import?ncia. Crescentes s?o as perdas econ?micas, causada pela tuberculose em bovinos, como a baixa na produtividade do rebanho, condena??o de carca?as em matadouros, redu??o na produ??o de leite e carne, comprometimento da comercializa??o de animais e seus produtos no mercado interno e externo. Estima-se que em torno de 5,0% da tuberculose humana ? causada por M. bovis. O sucesso de um programa de controle de uma doen?a est? estreitamente ligado a diferentes fatores entre os quais o conhecimento da hist?ria do agente etiol?gico e sua distribui??o espacial e temporal. Os m?todos moleculares s?o utilizados como ferramentas auxiliares no combate ? doen?a fornecendo informa??es com a finalidade de alcan?ar estes objetivos. Na ?ltima d?cada, m?todos para tipagem molecular de Mycobacterium tuberculosis foram desenvolvidos e aplicados em larga escala. Embora o genoma dos dois parasitos seja muito parecido, o poder discriminat?rio dos m?todos decresce para Mycobacterium bovis. Neste trabalho foram analisadas amostras de bovinos abatidos em Frigor?ficos sob Inspe??o Federal no estado de Minas Gerais. Um total de 215 culturas foram enviadas ao Laborat?rio de Biologia Molecular Aplicada ? Micobacterioses, e apenas 159 confirmaram um perfil de Mycobacterium bovis atrav?s das t?cnicas moleculares de Spoligotyping e 159 a t?cnica do MIRU-VNTR. A mesorregi?o Sul e Sudoeste mostraram a maior preval?ncia da doen?a nas amostras estudadas. O m?todo de Spoligotyping aplicados ?s amostras mostrou a presen?a de 32 perfis diferentes, obtendo um HGDI de 0,86 e em contra partida o MIRU-VNTR apresentou 40 perfis diferentes com um HGDI de 0,87. Neste estudo foi poss?vel avaliar que quando utilizamos estas t?cnicas em conjunto obtemos um maior poder discriminat?rio entre essas cepas.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:30:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Alyne Melo Pereira.pdf: 2782543 bytes, checksum: 9841bfc0f181c8d2c6af086d835eadc3 (MD5) Previous issue date: 2012-03-07 / Tuberculosis (TB) is a chronic infectious bacterial disease, very contagious, that, despite almost 130 years of biomedical research since the discovery of the tubercle bacillus, it continues to be a major threat to global health and is one of the leading causes of death by a bacterial organism, particularly in the developing world. The etiologic agent, Mycobacterium tuberculosis, is a bacterium that is easily transmitted by air. The disease control depends on several factors, being the correct diagnosis; efficient treatment; and active disease patient management to avoid transmission, essential ones. In order to improve the success in diagnosis, the knowledge of genotypic profiles by molecular techniques has provided positive results. Additionally, the correlation between the geographical locations of TB cases is a useful tool to aid epidemiological control strategies, especially when it is performed together with the knowledge of genetic variability of the studied TB strains. In this study we used the 15 loci MIRU-VNTR technique to identify polymorphisms among Mycobacterium tuberculosis isolates. A total of 119 M. tuberculosis samples, isolated between 2006 and 2007 from patients attending two reference hospitals of Goiânia city, were genotyped and the results compared with the gold standard RFLP-IS6110 technique. The 15 loci MIRU-VNTR analysis of 119 TB isolates provided 110 distinct genotypes, 105 of which contained only one isolate while 14 isolates were grouped in five genetic groups (clusters). This technique showed a good discriminatory power (0.9986). The 15 loci MIRU-VNTR technique was more discriminatory than RFLP-IS6110 (0.9942). We also performed the georeferencing of 241 TB cases, corresponding to all clinical forms reported in Goiânia during the year 2007 by the City´s Secretary of Health Department. The cases were randomly distributed throughout the city. The distribution of cases showed that, visually, there was no relationship between disease and socio-economic situation of the population. Among the georeferenced cases, we were able to genotype 50 isolates by 15 loci MIRU-VNTR. A great genetic variability of genotypes among the 50 isolates was observed, and the few ones that were clustered did not show epidemiological links. Based on the observed data, no transmission source the TB was identified in the city of Goiânia, and consequently we can infer that TB in the City of Goiânia could be resulted from a previously acquired infection due to the high degree of heterogeneous genetic profiles observed. / A tuberculose (TB) é uma doença bacteriana crônica infecto-contagiosa que, apesar de quase 130 anos de pesquisas desde a descoberta do bacilo, continua a ser um importante agravo à saúde global e uma das principais causas de morte, particularmente nos países em desenvolvimento. A doença tem como agente etiológico o Mycobacterium tuberculosis, uma bactéria de fácil transmissão uma vez que os bacilos se propagam pelo ar. O controle da doença depende de vários fatores, dentre os quais, o correto diagnóstico, o tratamento completo e o manejo adequado dos pacientes com a doença ativa para evitar a transmissão são fundamentais. Neste cenário, o conhecimento dos perfis genotípicos dos microorganismos circulantes em uma região, através de técnicas moleculares apropriadas, tem contribuído com bons resultados. Além disso, a correlação entre o espaço geográfico de casos da doença é uma ferramenta útil para a definição de estratégias epidemiológicas, sobretudo quando se conhece a variabilidade genética das cepas presentes em uma determinada população associada a sua localização geográfica. Neste estudo, foi empregada a análise de MIRU-VNTR para identificar o polimorfismo de 15 loci em amostras de Mycobacterium tuberculosis. Foram analisadas 119 amostras, coletadas entre 2006 e 2007, de pacientes com TB pulmonar em dois hospitais de referência no município de Goiânia. Os resultados obtidos pela técnica de 15 loci MIRU-VNTR foram posteriormente, comparados com resultados gerados pela técnica padrão ouro RFLP-IS6110. Pela análise dos padrões moleculares dos 119 isolados, foram encontrados 110 genótipos distintos. Destes, 105 continham um único isolado enquanto que 14 amostras se agruparam em cinco grupos (cluster) genéticos. Esta técnica apresentou um bom poder discriminatório (0,9986). Nossos resultados mostraram que a técnica de tipagem por 15 loci MIRU-VNTR se mostrou mais discriminatória que a técnica de RFLP-IS6110 (0,9942). Adicionalmente, foram georreferenciadas 241 amostras de pacientes diagnosticados com qualquer forma clínica de TB em 2007 de acordo com a Secretaria Municipal de Saúde e destas, 50 amostras foram genotipadas por 15 loci MIRU-VNTR. No georreferenciamento de 241 casos da doença, observou-se uma distribuição aleatória destes pelo município sem aglomerados significativos. A distribuição dos casos mostrou que, visualmente, não houve relação entre a doença e a situação sócio-ecônomica da população. O estudo genotípico de 50 isolados georreferenciados demonstrou que existe grande variabilidade genética de cepas circulantes na cidade e essas, quando agrupadas, não apresentam associação geo-espacial que possibilite estabelecer uma ligação epidemiológica entre os casos. Podemos concluir que não existem focos recentes de transmissão da doença, podendo esta ser proveniente de reativação endógena de infecção latente adquirida anteriormente, já que a maioria dos isolados apresentaram perfis únicos.

Orientador: Antonio Carlos Paes / Resumo: A tuberculose causada por Mycobacterium bovis (bTB) é uma zoonose de distribuição mundial com ampla gama de hospedeiros. Nos países onde a bTB é prevalente, 10 a 20% dos casos de tuberculose humana são causados por M. bovis. São escassos em todo o mundo estudos que investigam a resistência à isoniazida (INH) e rifampicina (RMP) em linhagens de M. bovis de origem bovina, reservatórios silvestres, e em casos humanos de tuberculose. Foi investigada a diversidade genotípica de 67 linhagens de M. bovis isoladas de bovinos de abatedouro, obtidas de 100 linfonodos com lesão caseosa, pelas técnicas de Spoligotyping e MIRU-VNTR, bem como foi determinado o perfil fenotípico de resistência à INH e RMP pela técnica de REMA, e pesquisadas possíveis bases genéticas para resistência aos antimicrobianos. Dentre os isolados, 11 (16%) foram classificados como MDR-TB, 8 (12%) resistentes à INH e 2 (3%) resistentes à RMP. A pesquisa pelo GenoType MTBDRplus ver. 2.0 não acusou a presença de mutações em nenhum dos isolados fenotipicamente resistentes. Foram identificados 16 spoligotipos entre as linhagens. A subfamília BOV_1 predominou com 52 (77,6%) isolados, com os SIT 481, 482, 594, 665, 691, 698, 1021, 1667, 1852, 2141 e dois isolados sem shared type. A BOV_2 foi identificada em 8 (11,9%) isolados, com o SIT 683. Os SIT 982, 1851 e 1853 foram agrupados na família BOV. Dois isolados não foram classificados em família ou subfamília. A análise de MIRU-VNTR com painel de 12 MIRUs, identificou 31 i... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Tuberculosis caused by Mycobacterium bovis (bTB) is a zoonosis of worldwide distribution with broad host range. In countries where bTB is prevalent, 10-20% of the human cases of tuberculosis are caused by M. bovis. All over the world there are few studies investigating the resistance to isoniazid (INH) and rifampicin (RMP) in M. bovis strains from cattle, wild reservoirs, and human cases of tuberculosis. The genotypic diversity of 67 M. bovis strains obtained out of 100 lymph nodes with caseous lesions from slaughtered animals was investigated by Spoligotyping and MIRU-VNTR techniques, as well as the assessment of their phenotypic profile of resistance to INH and RMP by REMA method and the search of possible genetic basis for antimicrobial resistance. Among the obtained isolates, 11 (16%) were classified as MDR-TB, 8 (12%) INH-resistant and 2 (3%) RMP-resistant. The use of GenoType MTBDRplus ver. 2.0 did not pointed the presence of genetic mutations in any of the phenotypically resistant isolates. Sixteen different spoligotype patterns were identified. The BOV_1 subfamily predominated with 52 (77.6%) isolates, with SITs 481, 482, 594, 665, 691, 698, 1021, 1667, 1852, 2141 and two isolates without a given SIT. BOV_2 was identified in 8 (11.9%) isolates, within SIT 683. The SITs 982, 1851 and 1853 were grouped in BOV family. Two isolates were not classified in family or subfamily. The MIRU-VNTR analysis using the 12 classical MIRUs, identified a cluster of 31 isolates belonging... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Yes / Background: Tracking recent transmission is a vital part of controlling widespread pathogens such as Mycobacterium tuberculosis. Multiple methods with specific performance characteristics exist for detecting recent transmission chains, usually by clustering strains based on genotype similarities. With such a large variety of methods available, informed selection of an appropriate approach for determining transmissions within a given setting/time period is difficult. Methods: This study combines whole genome sequence (WGS) data derived from 324 isolates collected 2005–2010 in Kinshasa, Democratic Republic of Congo (DRC), a high endemic setting, with phylodynamics to unveil the timing of transmission events posited by a variety of standard genotyping methods. Clustering data based on Spoligotyping, 24-loci MIRU-VNTR typing, WGS based SNP (Single Nucleotide Polymorphism) and core genome multi locus sequence typing (cgMLST) typing were evaluated. Findings: Our results suggest that clusters based on Spoligotyping could encompass transmission events that occurred almost 200 years prior to sampling while 24-loci-MIRU-VNTR often represented three decades of transmission. Instead, WGS based genotyping applying low SNP or cgMLST allele thresholds allows for determination of recent transmission events, e.g. in timespans of up to 10 years for a 5 SNP/allele cut-off. Interpretation: With the rapid uptake of WGS methods in surveillance and outbreak tracking, the findings obtained in this study can guide the selection of appropriate clustering methods for uncovering relevant transmission chains within a given time-period. For high resolution cluster analyses, WGS-SNP and cgMLST based analyses have similar clustering/timing characteristics even for data obtained from a high incidence setting. / ERC grant [INTERRUPTB; no. 311725] to BdJ, FG and CJM; an ERC grant to TS [PhyPD; no. 335529]; an FWO PhD fellowship to PM [grant number 1141217N]; the Leibniz Science Campus EvolLUNG for MM and SN; the German Centre for Infection Research (DZIF) for TAK, MM, CU, PB and SN; a SNF SystemsX grant (TBX) to JP and TS and a Marie Heim-Vögtlin fellowship granted to DK by the Swiss National Science Foundation. The computational resources and services used in this work were provided by the VSC (Flemish Supercomputer Center), funded by the Research Foundation - Flanders (FWO) and the Flemish Government – department EWI.

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:55:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Solange Alves Vinhas.pdf: 4494197 bytes, checksum: c05b3a06ae983246a835977f36eb32e3 (MD5) Previous issue date: 2013-08-30 / Background: Based on the hypothesis that genetic variability of Mycobacterium tuberculosis (MTB) could influence virulence and immunopathology we analyzed genetic profiles of different MTB strains in order to detect relatedness between genetic diversity and presence of cavity (disease severity). Methods: We conducted a retrospective molecular study in Vitória ES, based on TB strains (2003 to 2006, n = 214) from patients with pulmonary cavitary and non-cavitary TB using IS6110-RFLP, Spoligotyping and MIRU-VNTR methodologies. RESULTS: Initially, we compared the association of the demographic and clinical characteristics of patients with the presence of cavities. After logistic regression the variables that most contributed to explain the model of the disease were smear positive (ORajust = 5.96; IC= 2.58-13.73) and sputum production (ORajust = 4.55; IC= 1.28-16.12), there was no statistically significant association with the remaining variables. The LAM family was the most frequent within the samples of the two groups analyzed, representing 65 (62%) of the isolates in the cavitary group and 40 isolates (38%) of the non-cavitary. After comparing the proportions of LAM and other spoligotyping families there was no statistically significant difference between the groups (p=0.17). In relation to deletions RDRio (p=0.65) and RD174 (p=0.65) there were no statistically significant difference between the groups. Amongst the 205 isolates analyzed, 25 (12%) belonging to the non-cavitary group and 43 (21%) belonging to the cavitary group, were grouped in clusters. The statistical analysis of the association of the occurence of clusters with the presence of cavity showed no statistically significant difference between the quantity of clusters and the groups that were analyzed, (p= 0.4). Conclusion: The genotipic profile for the isolates from patients with cavitary and non-cavitary disease was determined. Our data showed that LAM9 was the most frequent among the strains between cavitary and noncavitary groups, corroborating findings that this family is the most frequent in Brasil. There were no statistical differences that could show association among the variables analyzed related to presence of cavity or disease severity / Introdução: Baseado na hipótese de que a variabilidade genética de Mycobacterium tuberculosis (MTB) pode influenciar a virulência e a gravidade da doença os perfis genéticos de isolados clínicos de MTB foram avaliados para detectar associação entre diversidade genética e gravidade da doença. Objetivos: Analisar características genéticas de isolados de MTB e verificar sua possível associação com a gravidade da TB pulmonar. Métodos: Estudo retrospectivo, caso controle, conduzido em Vitória-ES, utilizando isolados de MTB (2003 a 2006, n=214) de pacientes com TB pulmonar, cavitária (127) e não cavitária (87). Realizou-se genotipagem por meio de RFLP-IS6110, Spoligotyping, MIRU-VNTR 24 loci, e a análise de deleções e inserções, como RDRio, RD174 utilizando PCR multiplex, bem como a detecção do Ag85C103. Realizou-se análise estatística, para verificação dos padrões de distribuição das variáveis, seguida de análises bivariadas para verificação de associações entre elas, empregando-se os teste exato de Fisher ou Chi-quadrado, ambos com 95% de intervalo de confiança e nível de significância (&#61554;) < 0,05. Resultados: Após a regressão logística, as variáveis que contribuíram no modelo explicativo da doença foram baciloscopia (ORajust = 5,96; IC= 2,58-13,73) e produção de escarro (ORajust = 4,55; IC= 1,28- 16,12). Não houve associação estatisticamente significativa com o restante das variáveis.A família LAM foi a mais frequente entre os dois grupos analisados, representando 65 (62%) dos isolados no grupo cavitário e 40 isolados (38%) do grupo não cavitário. Não houve diferença estatisticamente significativa entre os grupos em relação à deleção RDRio (p=0,65) e com relação à deleção RD174 (p=0,65). Dentre os 205 isolados analisados, 25 (12%) isolados do grupo não cavitário e 43 (21%) do grupo cavitário, estavam em cluster. não houve diferença estatisticamente significativa entre a quantidade de clusters e os grupos analisados (p= 0,4). Conclusões: Foi determinado o perfil genotípico dos isolados de pacientes com doença pulmonar, cavitária e não cavitária. Não houve associação entre a presença de cavidade e os genótipos encontrados. Não houve associação do genótipo com nenhum dos marcadores moleculares avaliados

<p>Prostitucijom se prevashodno bave žene zbog čega se često naziva i &bdquo;ženskom profesijom&rdquo;. U Republici Srbiji zastupljen je prohibicionistički model regulisanja prostitucije. Prema odredbi čl. 16. st. 1. Zakona o javnom redu i miru Republike Srbije, lica koja se odaju prostituciji podležu prekr&scaron;ajnom kažnjavanju. Osim &scaron;to odavanje prostituciji predstavlja prekr&scaron;aj protiv javnog reda i mira, lica koja se bave prostitucijom, a koja su pretežno žene, izložena su osudi dru&scaron;tvene sredine. Osuda dru&scaron;tvene sredine povlači za sobom stigmatizaciju, marginalizaciju i diskriminaciju žena u prostituciji.<br />Nesrazmerno veliki broj žena koje se bave prostitucijom u odnosu na broj mu&scaron;karaca bio je razlog da doktorsku disertaciju zasnujemo na teorijskom konceptu roda, primarne analitičke kategorije u feminističkim istraživanjima, prihvatajući kao polazi&scaron;te stav da &bdquo;rodni režimi nisu jednostavno odnosi mu&scaron;karaca i žena, već su oni sistem moći, očekivanja, uloga, pona&scaron;anja, stavova, diskursa i prikazivanja, vizualizovanja i hijerarhizovanja rodnih razlika&rdquo; (Blagojević Hjuson 2013, 34). Rodni režim koji sa jedne strane &bdquo;ograničava individualne mogućnosti i slobode&rdquo; (Ibid.), sa druge strane otvara ženama put ka prostituciji, dok dru&scaron;tvo bavljenje prostitucijom najče&scaron;će pogre&scaron;no vidi kao &bdquo;izbor&rdquo; same žene. Saglasno tome, prostituciju kao žensku profesiju istražujemo polazeći od toga da rodni obrazac oblikovan patrijarhalnom ideologijom u Srbiji, u određenim nepovoljnim životnim situacijama, vr&scaron;i nevidljiv, ali snažan pritisak na ženu da uđe u prostituciju.<br />Osnovni cilj istraživanja jeste da, uzimajući u obzir prihvaćen prohibicionistički pristup u regulisanju prostitucije, istražimo pravni i dru&scaron;tveni položaj žena u prostituciji.<br />Osim aktuelnog pravnog i dru&scaron;tvenog položaja žena u prostituciji u na&scaron;oj zemlji, istorijsko-pravnim metodоm analizirali smo položaj žena u prostituciji u Srbiji u vremenskom periodu od pre Prvog svetskog rata do danas.<br />Kako bi se kritički sagledali svi aspekti aktuelnog prohibicionističkog modela u Srbiji, u disertaciji su, osim prohibicionističkog, istraživanjem obuhvaćeni, reglementacioni, abolicionistički i neoabolicionistički modeli. Odabrane su po dve države koje prihvataju jedan od navedenih modela i analiziran je uticaj izabranog modela na položaj žena u prostituciji.<br />Zakonodavstvo Savezne Republike Nemačke i Kraljevine Holandije odabrano je za analizu kako bi se utvrdilo kako reglementacioni model utiče na položaj žena u prostituciji. Od država koje su implementirale abolicionistički model, za analizu je izabrano zakonodavstvo Republike Italije i Kraljevine &Scaron;panije. Kako bismo stekli uvid u relativno nov, neoabolicionistički model regulisanja prostitucije, za analizu smo odabrali zakonodavstvo Kraljevine &Scaron;vedske i Kraljevine Norve&scaron;ke. Od država koje kao i Republika Srbija prihvataju prohibicionistički model, za analizu je izabrano zakonodavstvo Republike Hrvatske i Crne Gore.<br />S obzirom na to da smo želeli da pružimo potpunu sliku o pravnom položaju žena u prostituciji u Republici Srbiji, za potrebe disertacije sproveli smo empirijsko istraživanje čiji su rezultati omogućili sticanje uvida u praksu organa nadležnih za procesuiranje slučajeva prostitucije, kao i stvaranje potpunije slike o dru&scaron;tvenom položaju žena u prostituciji u Republici Srbiji.<br />Na osnovu rezultata sprovedenog istraživanja do&scaron;li smo do zaključka da je neophodna promena pravnog položaja žena u prostituciji. Promena je moguća isključivo napu&scaron;tanjem postojećeg prohibicionističkog pristupa u regulisanju prostitucije, koji se negativno odražava na sve aspekte života žena u prostituciji.<br />U skladu sa rezultatima istraživanja, u disertaciji su date i preporuke za unapređenje pravnog i dru&scaron;tvenog položaja žena u prostituciji u Republici Srbiji.</p> / <p>Prostitucijom se prevashodno bave žene zbog čega se često naziva i &bdquo;ženskom profesijom&rdquo;. U Republici Srbiji zastupljen je prohibicionistički model regulisanja prostitucije. Prema odredbi čl. 16. st. 1. Zakona o javnom redu i miru Republike Srbije, lica koja se odaju prostituciji podležu prekr&scaron;ajnom kažnjavanju. Osim &scaron;to odavanje prostituciji predstavlja prekr&scaron;aj protiv javnog reda i mira, lica koja se bave prostitucijom, a koja su pretežno žene, izložena su osudi dru&scaron;tvene sredine. Osuda dru&scaron;tvene sredine povlači za sobom stigmatizaciju, marginalizaciju i diskriminaciju žena u prostituciji.<br />Nesrazmerno veliki broj žena koje se bave prostitucijom u odnosu na broj mu&scaron;karaca bio je razlog da doktorsku disertaciju zasnujemo na teorijskom konceptu roda, primarne analitičke kategorije u feminističkim istraživanjima, prihvatajući kao polazi&scaron;te stav da &bdquo;rodni režimi nisu jednostavno odnosi mu&scaron;karaca i žena, već su oni sistem moći, očekivanja, uloga, pona&scaron;anja, stavova, diskursa i prikazivanja, vizualizovanja i hijerarhizovanja rodnih razlika&rdquo; (Blagojević Hjuson 2013, 34). Rodni režim koji sa jedne strane &bdquo;ograničava individualne mogućnosti i slobode&rdquo; (Ibid.), sa druge strane otvara ženama put ka prostituciji, dok dru&scaron;tvo bavljenje prostitucijom najče&scaron;će pogre&scaron;no vidi kao &bdquo;izbor&rdquo; same žene. Saglasno tome, prostituciju kao žensku profesiju istražujemo polazeći od toga da rodni obrazac oblikovan patrijarhalnom ideologijom u Srbiji, u određenim nepovoljnim životnim situacijama, vr&scaron;i nevidljiv, ali snažan pritisak na ženu da uđe u prostituciju.<br />Osnovni cilj istraživanja jeste da, uzimajući u obzir prihvaćen prohibicionistički pristup u regulisanju prostitucije, istražimo pravni i dru&scaron;tveni položaj žena u prostituciji.<br />Osim aktuelnog pravnog i dru&scaron;tvenog položaja žena u prostituciji u na&scaron;oj zemlji, istorijsko-pravnim metodom analizirali smo položaj žena u prostituciji u Srbiji u vremenskom periodu od pre Prvog svetskog rata do danas.<br />Kako bi se kritički sagledali svi aspekti aktuelnog prohibicionističkog modela u Srbiji, u disertaciji su, osim prohibicionističkog, istraživanjem obuhvaćeni, reglementacioni, abolicionistički i neoabolicionistički modeli. Odabrane su po dve države koje prihvataju jedan od navedenih modela i analiziran je uticaj izabranog modela na položaj žena u prostituciji.<br />Zakonodavstvo Savezne Republike Nemačke i Kraljevine Holandije odabrano je za analizu kako bi se utvrdilo kako reglementacioni model utiče na položaj žena u prostituciji. Od država koje su implementirale abolicionistički model, za analizu je izabrano zakonodavstvo Republike Italije i Kraljevine &Scaron;panije. Kako bismo stekli uvid u relativno nov, neoabolicionistički model regulisanja prostitucije, za analizu smo odabrali zakonodavstvo Kraljevine &Scaron;vedske i Kraljevine Norve&scaron;ke. Od država koje kao i Republika Srbija prihvataju prohibicionistički model, za analizu je izabrano zakonodavstvo Republike Hrvatske i Crne Gore.<br />S obzirom na to da smo želeli da pružimo potpunu sliku o pravnom položaju žena u prostituciji u Republici Srbiji, za potrebe disertacije sproveli smo empirijsko istraživanje čiji su rezultati omogućili sticanje uvida u praksu organa nadležnih za procesuiranje slučajeva prostitucije, kao i stvaranje potpunije slike o dru&scaron;tvenom položaju žena u prostituciji u Republici Srbiji.<br />Na osnovu rezultata sprovedenog istraživanja do&scaron;li smo do zaključka da je neophodna promena pravnog položaja žena u prostituciji. Promena je moguća isključivo napu&scaron;tanjem postojećeg prohibicionističkog pristupa u regulisanju prostitucije, koji se negativno odražava na sve aspekte života žena u prostituciji.<br />U skladu sa rezultatima istraživanja, u disertaciji su date i preporuke za unapređenje pravnog i dru&scaron;tvenog položaja žena u prostituciji u Republici Srbiji.</p> / <p>Since women usually deal with prostitution the prostitution is often called the &ldquo;female profession&rdquo;. The Republic of Serbia stands for the prohibitionist model of regulating prostitution. According to Article 16 paragraph 1 of the Law on Public Order and Peace of the Republic of Serbia, a person who deals with prostitution will be subject to the fine for a misdemeanor. Apart from the fact that prostitution is misdemeanor against public order and peace persons who are dealing with the prostitution, who are mostly women, will be exposed to the condemnation of society. Condemnation of the society is connected with stigmatization, marginalization and discrimination of women in prostitution.<br />Unproportionally large number of women dealing with the prostitution comparing to the number of men was determinative to establish the Ph.D. thesis on the theoretical concept of gender, the primary analytical category in feminist researches, accepting the fundamental concept that &ldquo;gender regimes are not simply the relationship between men and women, but are the system of power, expectations, roles, behaviors, attitudes, discourse and presentation, visualization and hierarchization of gender difference&rdquo; (Blagojevic Hughson 2013, 34). The gender approach, which on one hand, &ldquo;is limiting individual abilities and freedoms&rdquo; (ibid), is on the other hand opening the path of women towards prostitution, while the society most often wrongly sees prostitution as a woman&rsquo;s &ldquo;choice&rdquo;. In accordance with this, we analyze prostitution as a woman&rsquo;s profession taking into consideration that gender pattern shaped by patriarchal ideology in Serbia, in certain unfavorable life circumstances hasinvisible but powerful pressure on a woman to enter into prostitution.<br />The basic goal of the research is to, taking into consideration the accepted prohibitionist approach in regulating prostitution, analyze the legal and social status of women in prostitution.<br />Apart from the current legal and social status of women in prostitution in Serbia, based on the historical-legal method we have analyzed the status of women in prostitution in Serbia in the time period from before the First World War up today.<br />In order to critically review all the aspects of the current prohibitionist model in Serbia, the thesis analyzes in addition to the prohibitionist, also the reglementary, abolitionist and neo-abolitionist model. Two countries were selected,which accepted one of the stated models and we analyzed the impact of the selected model on the status of women in prostitution.<br />The legislation of the Federal Republic of Germany and the Kingdom of the Netherlands was chosen for the analysis in order to assess how the reglementary model influences the status of women in prostitution. The legislation of the Italian Republic and Kingdom of Spain was selected from the countries that implemented the abolitionist model. In order to have insight into a relatively new, a neo-abolitionist model of regulating prostitution we chose to analyze the legislation of the Kingdom of Sweden and the Kingdom of Norway. The legislation of the Republic of Croatia and Montenegro were selected, which like the Republic of Serbia, accept the prohibitionist model.<br />Since in this PhD thesis we strive to present the full picture of legal status of women in prostitution in the Republic of Serbia, we conducted empirical research and the results of this research enabled us to have insight into the practice of authorities in charge for processing the cases of prostitution and to have more clear picture about the social status of women in prostitution in the Republic of Serbia.<br />Based on the results of conducted research, we came to the conclusion that it is necessary to change the legal status of women in prostitution. This change is possible only by abandoning the existing prohibitionist approach in regulating prostitution that negatively affects all the aspects of women&rsquo;s lives in prostitution.<br />In accordance with the results of the research, in the Ph.D. thesis we gave recommendations for improvement of the legal and social status of women in the prostitution in the Republic of Serbia.</p> / null