Thèse (M.Sc.)--Université Laval, 2004. / Bibliogr. Publié aussi en version électronique.

Cette thèse a pour objet la description et l’analyse des marqueurs discursifs (MD) là, par exemple, ékyé et wèé en français parlé au Cameroun, variété de français régional qui s’inscrit dans le français parlé en Afrique subsaharienne. Elle propose une analyse centrée sur les échanges discursifs et prend en compte la pragmatique afin de montrer que la communication repose sur l’intersubjectivité langagière qu’on peut analyser au moyen de traces linguistiques comme les MD. Pour étudier ces phénomènes pragmatiques au demeurant très peu étudiés en français parlé au Cameroun, la recherche s’est organisée principalement autour des notions de flux discursif, d’implicite social et d’interaction afin de comprendre la structuration informationnelle et le contexte situationnel qui motivent l’apparition des MD là, par exemple, ékyé et wèé dans l’organisation du discours, tant dans la production que dans la réception. Le corpus se compose d’échanges radiophoniques d’une part et d’échanges internet d’autre part. La thèse est composée en deux parties. La première rend compte des aspects théoriques, même si nous l’illustrons parfois avec des extraits de notre corpus. La seconde est consacrée à l’analyse systématique des données (le fonctionnement des quatre MD là, par exemple, ékyé et wèé dans les discours radiophoniques et dans les écrits tirés d’internet). Cette analyse a permis de conclure à la difficulté de définir exactement ce qu’est un MD, et de relever l’existence de terminologies concurrentes, tant les théories qui décrivent et expliquent le fonctionnement des MD sont hétérogènes. Nous proposons une définition opérationnelle des MD pour l’analyse de notre corpus et nous plaidons pour une prise en compte des phénomènes oraux et liés à l’interaction dans les études sur le français régional en Afrique. / This thesis sets out to describe and to analyse the discourse markers (DMs) là, par exemple, ékyé and wèé in Cameroon French, a regional variety of French that is spoken in Subsharan Africa. It is a pragmatic study of oral discourses that highlights how communication is based on speech inter-subjectivity such as DMs, which constitute linguistic traces. In order to study these uninvestigated pragmatic phenomena in Cameroon spoken French, three notions were of prime necessity, namely: discursive continuity, social implicity and interaction. These notions help to shed light on the informational structure and on the situational context of the DMs là, par exemple, ékyé and wèé in discourse organization as well as in its production or in its reception. The data of this study was got from two sources: on the one hand, radio programmes, and on the other hand, scripts collected from the internet. The study comprises two parts: Part one focuses on the theoretical concerns, alongside some illustrations of excerpts from the data. The second part provides a systematic analysis of the data (the functioning of the four DMs là, par exemple, ékyé and wèé in radio programmes and in internet scripts). This analysis enabled the confirmation that not only is it difficult to clearly define what a DM is but that there are also several competing terms and explanations, as theories regarding studies on DMs are heterogeneous. We propose an operational definition of DMs for the analysis of the data and suggest that studies on regional French spoken in Africa should take into account oral phenomena related to interaction.

La zone d'étude , il est de la ville de São Borja, a eu le début de son processus de colonisation et de la formation urbaine et régionale conséquente, à partir de la mise en oeuvre des réductions Jésuites Guaranide São Francisco de Borja et Santo Tomé, au cours de la dix-septième siècle. Depuis la période réductionnelle , ces territoires effectuent des communications socioculturel qui délimitent une similitude ethnique - culturelle entre ces personnes sur les rives du fleuve Uruguay. Cette période missionnaire enracinée modes de vie, les connaissances, les croyances et les marqueurs architecturaux et artistiques, qui sont encore expérimentés dans les zones urbaines régionales. Pour mieux comprendre comment a été la construction de cette identité missionnaire il a été interrogé sur les représentations sociales et les marqueurs culturels missionnaires. Il a fini de jouer récits d'identité et l'enracinement sociale missionnaires. Après réflexion sur les espaces sociaux, marqueurs territoriaux et représentations sociales missionnaires, il estime la thèse que l'identité missionnaire régionale, même si la souffrance constant avec altérités constant com imposée par les relations de pouvoir politiques, idéologiques et économiques du pouvoir politique découlant de propriétaires et centralités du travail, conserve encore les pratiques traditionnelles enracinées dans les modes de vie indigènes, ceux qui sont constamment articulé avec des restes urbains et artistiques de la période réductionnelle. Grâce à l'analyse de réseaux régionaux et les représentations sociales, il est affirmé que la production de significations du monde social missionnaire des rives du fleuve Uruguay est légitimé de rites , sacrée et les croyances mythiques, et par l'affirmation discursive et symbolique de la musicalité missionnaire. Ces marqueurs d'identité des missionnaires font l‟usage de la matérialisation comme transcendance culturelle et spirituelle. Qui est joué par les riverains et identités Gaucha. Donc, cette recherche expose une identité missionnaire qui est à la fois vécu et symbolisé par des dialogues socio- territoriale entre les pratiques sociales traditionnelles et des restes urbains réductionnelle qui ont instigué penser les espaces sociaux missionnaires des forme de vie, des rites et croyances imaginaire , et des les liens territoriaux. / A cidade de São Borja-RS, recorte em estudo, teve o início de seu processo de colonização e consequente formação urbana e territorial a partir da implementação das Reduções Jesuítico-Guarani de São Francisco de Borja e Santo Tomé, durante o século XVII. Desde o período reducional, esses territórios realizam comunicações socioculturais que demarcam uma semelhança étnico-cultural entre esses povos nas margens do rio Uruguai. Esse período missioneiro enraizou modos de vida, saberes, crenças e marcadores arquitetônicos e artísticos que ainda são vivenciados nas áreas urbanas regionais. Procurando melhor compreender como vem se dando a construção da identidade missioneira, problematizou-se como as representações sociais e os marcadores territoriais missioneiros acabam por reproduzir narrativas identitárias e enraizamentos sociais missioneiros. Após a reflexão sobre os espaços sociais, marcadores territoriais e as representações sociais missioneiras, sustenta-se a tese de que a identidade missioneira regional, por mais que venha sofrendo constantemente com alteridades impostas por relações de força política, ideológica e econômica advindas das centralidades estancieiras, ainda mantém práticas tradicionais enraizadas nas vivências nativas. Tais vivências estão constantemente articuladas com os remanescentes urbanos e artísticos do período reducional. Através da análise das redes territoriais e das representações sociais, sustenta-se que a produção de sentidos do mundo social missioneiro das margens do rio Uruguai se legitima a partir de ritualidades, crenças sagradas e míticas e através da afirmação discursiva e simbólica da musicalidade missioneira. Esses marcadores identitários missioneiros se utilizam das materializações culturais como artifícios de transcendência espiritual e cultural, que vem sendo reproduzidos pelas identidades ribeirinha e gaúcha. Portanto, esta pesquisa expõe uma identidade missioneira que, ao mesmo tempo, é vivida e simbolizada, através de diálogos socioterritoriais entre as práticas sociais tradicionais e os remanescentes urbanos reducionais, que instigaram pensar os espaços sociais missioneiros a partir das vivências, dos ritos, das crenças, dos imaginários e dos vínculos territoriais.

La zone d'étude , il est de la ville de São Borja, a eu le début de son processus de colonisation et de la formation urbaine et régionale conséquente, à partir de la mise en oeuvre des réductions Jésuites Guaranide São Francisco de Borja et Santo Tomé, au cours de la dix-septième siècle. Depuis la période réductionnelle , ces territoires effectuent des communications socioculturel qui délimitent une similitude ethnique - culturelle entre ces personnes sur les rives du fleuve Uruguay. Cette période missionnaire enracinée modes de vie, les connaissances, les croyances et les marqueurs architecturaux et artistiques, qui sont encore expérimentés dans les zones urbaines régionales. Pour mieux comprendre comment a été la construction de cette identité missionnaire il a été interrogé sur les représentations sociales et les marqueurs culturels missionnaires. Il a fini de jouer récits d'identité et l'enracinement sociale missionnaires. Après réflexion sur les espaces sociaux, marqueurs territoriaux et représentations sociales missionnaires, il estime la thèse que l'identité missionnaire régionale, même si la souffrance constant avec altérités constant com imposée par les relations de pouvoir politiques, idéologiques et économiques du pouvoir politique découlant de propriétaires et centralités du travail, conserve encore les pratiques traditionnelles enracinées dans les modes de vie indigènes, ceux qui sont constamment articulé avec des restes urbains et artistiques de la période réductionnelle. Grâce à l'analyse de réseaux régionaux et les représentations sociales, il est affirmé que la production de significations du monde social missionnaire des rives du fleuve Uruguay est légitimé de rites , sacrée et les croyances mythiques, et par l'affirmation discursive et symbolique de la musicalité missionnaire. Ces marqueurs d'identité des missionnaires font l‟usage de la matérialisation comme transcendance culturelle et spirituelle. Qui est joué par les riverains et identités Gaucha. Donc, cette recherche expose une identité missionnaire qui est à la fois vécu et symbolisé par des dialogues socio- territoriale entre les pratiques sociales traditionnelles et des restes urbains réductionnelle qui ont instigué penser les espaces sociaux missionnaires des forme de vie, des rites et croyances imaginaire , et des les liens territoriaux. / A cidade de São Borja-RS, recorte em estudo, teve o início de seu processo de colonização e consequente formação urbana e territorial a partir da implementação das Reduções Jesuítico-Guarani de São Francisco de Borja e Santo Tomé, durante o século XVII. Desde o período reducional, esses territórios realizam comunicações socioculturais que demarcam uma semelhança étnico-cultural entre esses povos nas margens do rio Uruguai. Esse período missioneiro enraizou modos de vida, saberes, crenças e marcadores arquitetônicos e artísticos que ainda são vivenciados nas áreas urbanas regionais. Procurando melhor compreender como vem se dando a construção da identidade missioneira, problematizou-se como as representações sociais e os marcadores territoriais missioneiros acabam por reproduzir narrativas identitárias e enraizamentos sociais missioneiros. Após a reflexão sobre os espaços sociais, marcadores territoriais e as representações sociais missioneiras, sustenta-se a tese de que a identidade missioneira regional, por mais que venha sofrendo constantemente com alteridades impostas por relações de força política, ideológica e econômica advindas das centralidades estancieiras, ainda mantém práticas tradicionais enraizadas nas vivências nativas. Tais vivências estão constantemente articuladas com os remanescentes urbanos e artísticos do período reducional. Através da análise das redes territoriais e das representações sociais, sustenta-se que a produção de sentidos do mundo social missioneiro das margens do rio Uruguai se legitima a partir de ritualidades, crenças sagradas e míticas e através da afirmação discursiva e simbólica da musicalidade missioneira. Esses marcadores identitários missioneiros se utilizam das materializações culturais como artifícios de transcendência espiritual e cultural, que vem sendo reproduzidos pelas identidades ribeirinha e gaúcha. Portanto, esta pesquisa expõe uma identidade missioneira que, ao mesmo tempo, é vivida e simbolizada, através de diálogos socioterritoriais entre as práticas sociais tradicionais e os remanescentes urbanos reducionais, que instigaram pensar os espaços sociais missioneiros a partir das vivências, dos ritos, das crenças, dos imaginários e dos vínculos territoriais.

Le diagnostic de maladie d'Alzheimer (MA) chez les patients de moins de 65 ans ou early-onset Alzheimer's disease (EOAD) est souvent difficile car la présentation clinique est fréquemment atypique, dominée par des signes non amnésiques. Les études antérieures sur les marqueurs de diagnostic précoce en imagerie se sont intéressées à l'imagerie structurelle et fonctionnelle dans l'EOAD mais aucune à la perfusion en IRM par la technique de marquage de spin ou arterial spin labeling (ASL). En effet, l'analyse de l'ASL demeure complexe, en particulier à l'échelle individuelle, du fait du faible rapport signal sur bruit des cartographies de perfusion et de l'hétérogénéité des zones atteintes à la phase initiale de la maladie. Notre premier objectif était technique et a consisté à optimiser l'interprétation des cartographies d'ASL grâce à la projection des anomalies de perfusion sur la surface du cortex extraite de l'acquisition morphologique T1 réalisée au cours du même examen, permettant d'accéder à une représentation tridimensionnelle interactive des données perfusionnelles. Le traitement des cartographies intégrait plusieurs étapes successives dont une correction des effets de volume partiel, une normalisation d'intensité spécifique et un lissage surfacique. Ce procédé a été appliqué sur les cartographies de 18 patients atteints d'EOAD avec une qualité de segmentation et de représentation des cartographies surfaciques obtenues jugées respectivement optimale et bonne dans 72 % des cas par deux lecteurs. Notre deuxième objectif était clinique et avait pour but de caractériser les altérations perfusionnelles et métaboliques par ASL et 18fluorodésoxuglucose-TEP (18F-FDG-TEP) sur un groupe de 37 patients atteints d'EOAD. Cette étude préliminaire à montré : (i) un pattern anatomique pathologique commun au niveau des lobules pariétaux inférieurs et des lobes temporaux ; (ii) des discordances entre les 2 techniques avec des lésions plus étendues en 18F-FDG-TEP et la détection en ASL de zones hypoperfusées additionnelles au niveau des lobes frontaux non visibles en 18F-FDGTEP. Ces deux travaux suggèrent que l'ASL pourrait donc devenir une séquence complémentaire clef dans l'arsenal des techniques d'imagerie utiles à un diagnostic précoce de l'EOAD et de la MA. Son utilisation en pratique clinique nécessite cependant une optimisation de sa représentation visuelle, et l'application corticale surfacique utilisée dans ce travail en représente une des voies potentielles. / The diagnosis of Alzheimer's disease (AD) in patients under the age of 65 years, called early-onset Alzheimer's disease (EOAD), remains a challenging issue due to the high incidence of atypical clinical presentations with non-memory symptoms. Although EAOD has been widely explored by structural and functional imaging, no previous study has examined the contribution of ASL in the assessment of cortical perfusion in this disease. Indeed, the analysis of ASL remains complex, especially at the individual level, due to the weak signal-to-noise ratio of the perfusion maps and the heterogeneity of pathological areas in the initial phase of the disease. Our first objective was technical and has consisted in optimizing the visual interpretation of ASL maps by the cortical surface-based projection of the perfusion alterations on the structural T1 sequence acquired during the same imaging protocol, providing a 3D interactive display of the perfusion data. Data processing included several successive steps, such as a partial volume effect correction, a specific intensity normalization and a surface-based smoothing process. It was applied on the perfusion maps of eighteen EOAD patients and the quality of segmentation and of cortical surface-based perfusion maps were scored as optimal in 72% in both cases by two readers. Our second objective was clinical and aimed to characterize the cerebral hypoperfusion and hypometabolism by ASL and 18F-FDG-PET in a group of 37 EOAD patients. Our preliminary study showed: (i) a similar pathological pattern located in the inferior parietal lobules and in the temporal cortex, (ii) discrepancies between the two modalities with the presence of more widespread hypometabolic regions detected by 18F-FDGPET and additionnai areas of alterations in the frontal lobes detected by ASL without apparent hypometabolism. Our studies suggest that ASL may become a useful complementary tool which, in combination with the existing structural and functional techniques, could offer improved efficiency in the difficult early detection of EOAD and AD. Its use in clinical practice, however, requires an optimization of its visual representation, and the cortical surface-based projection applied in this work represents one of the potential ways to this image quality improvement.

L’objectif de cette thèse est d’une part d’étudier l’influence des labels de groupe sur la formation de jugements envers le locuteur employant ces labels et envers la cible de ces labels et d’autre part de proposer un modèle explicatif des effets. La littérature rapporte un effet délétère de l’emploi de labels de groupe péjoratifs sur les jugements exprimés envers le locuteur et envers la cible, l’emploi d’un label péjoratif (e.g., « nègre ») entraînant des jugements plus négatifs que celui d’un label non-péjoratif (e.g., « noir »). Nous nous proposons de répliquer ces effets et de tester l’hypothèse d’une régulation normative de ceux-ci. Notre recherche a été déclinée en deux axes. Le premier a examiné l’effet de la valence du label employé et du niveau de protection normative du groupe cible sur les jugements exprimés envers le locuteur. Le second a étudié le rôle d’indice linguistique de catégorisation joué par les labels de groupe lors de la formation de jugements envers le locuteur, mais également envers la cible du label. Conformément aux prédictions, les résultats montrent que l’emploi d’un label péjoratif entraîne un jugement plus négatif du locuteur que l’emploi d’un label non-péjoratif. Le principal apport de ce thèse réside dans le fait que la simple catégorisation via l’emploi de labels de groupe suffit à entraîner des jugements plus négatifs du locuteur et des jugements plus positifs de la cible du label. De plus, la norme sociale anti-préjugés médiatise les effets obtenus et le niveau de protection normative du groupe cible vient, quant à lui, les modérer. Les implications théoriques de ces résultats et les perspectives de recherche sont discutées. / This thesis aims to study the influence of group labels over the formation of judgments towards the emitter and the target of these label’s and to come up with an explanatory model of these effects. Literature shows a negative effect of pejorative group labels on the emitter's and the target’s judgements; pejorative labels (e.g. “nigger”) leading to more negative judgments than nonpejorativelabels (e.g. “black”). We offer to replicate these effects and to test the hypothesis of a normative regulation of these effects. Our research is declined in two main axes. We first examined the effect of group label valence and normative protection level of the targeted social group on the emitter's judgments. We secondly studied the role of linguistic categorization played by group labels during the formation judgments towards emitter and target. As predicted, results showed that the use of pejorative labels generates more negative judgments of the emitter than the use of non-pejorative labels. The main contribution of this thesis is to show that simple categorization using group labels is sufficient to generate negative judgments of the emitter and positive judgments of the target. Moreover, the anti-prejudice norm mediates the obtained effects, while the level of normative protection of the targeted group moderates them. Theoretical implications of these results are discussed and the prospects for research are mentioned.

La zone d'étude , il est de la ville de São Borja, a eu le début de son processus de colonisation et de la formation urbaine et régionale conséquente, à partir de la mise en oeuvre des réductions Jésuites Guaranide São Francisco de Borja et Santo Tomé, au cours de la dix-septième siècle. Depuis la période réductionnelle , ces territoires effectuent des communications socioculturel qui délimitent une similitude ethnique - culturelle entre ces personnes sur les rives du fleuve Uruguay. Cette période missionnaire enracinée modes de vie, les connaissances, les croyances et les marqueurs architecturaux et artistiques, qui sont encore expérimentés dans les zones urbaines régionales. Pour mieux comprendre comment a été la construction de cette identité missionnaire il a été interrogé sur les représentations sociales et les marqueurs culturels missionnaires. Il a fini de jouer récits d'identité et l'enracinement sociale missionnaires. Après réflexion sur les espaces sociaux, marqueurs territoriaux et représentations sociales missionnaires, il estime la thèse que l'identité missionnaire régionale, même si la souffrance constant avec altérités constant com imposée par les relations de pouvoir politiques, idéologiques et économiques du pouvoir politique découlant de propriétaires et centralités du travail, conserve encore les pratiques traditionnelles enracinées dans les modes de vie indigènes, ceux qui sont constamment articulé avec des restes urbains et artistiques de la période réductionnelle. Grâce à l'analyse de réseaux régionaux et les représentations sociales, il est affirmé que la production de significations du monde social missionnaire des rives du fleuve Uruguay est légitimé de rites , sacrée et les croyances mythiques, et par l'affirmation discursive et symbolique de la musicalité missionnaire. Ces marqueurs d'identité des missionnaires font l‟usage de la matérialisation comme transcendance culturelle et spirituelle. Qui est joué par les riverains et identités Gaucha. Donc, cette recherche expose une identité missionnaire qui est à la fois vécu et symbolisé par des dialogues socio- territoriale entre les pratiques sociales traditionnelles et des restes urbains réductionnelle qui ont instigué penser les espaces sociaux missionnaires des forme de vie, des rites et croyances imaginaire , et des les liens territoriaux. / A cidade de São Borja-RS, recorte em estudo, teve o início de seu processo de colonização e consequente formação urbana e territorial a partir da implementação das Reduções Jesuítico-Guarani de São Francisco de Borja e Santo Tomé, durante o século XVII. Desde o período reducional, esses territórios realizam comunicações socioculturais que demarcam uma semelhança étnico-cultural entre esses povos nas margens do rio Uruguai. Esse período missioneiro enraizou modos de vida, saberes, crenças e marcadores arquitetônicos e artísticos que ainda são vivenciados nas áreas urbanas regionais. Procurando melhor compreender como vem se dando a construção da identidade missioneira, problematizou-se como as representações sociais e os marcadores territoriais missioneiros acabam por reproduzir narrativas identitárias e enraizamentos sociais missioneiros. Após a reflexão sobre os espaços sociais, marcadores territoriais e as representações sociais missioneiras, sustenta-se a tese de que a identidade missioneira regional, por mais que venha sofrendo constantemente com alteridades impostas por relações de força política, ideológica e econômica advindas das centralidades estancieiras, ainda mantém práticas tradicionais enraizadas nas vivências nativas. Tais vivências estão constantemente articuladas com os remanescentes urbanos e artísticos do período reducional. Através da análise das redes territoriais e das representações sociais, sustenta-se que a produção de sentidos do mundo social missioneiro das margens do rio Uruguai se legitima a partir de ritualidades, crenças sagradas e míticas e através da afirmação discursiva e simbólica da musicalidade missioneira. Esses marcadores identitários missioneiros se utilizam das materializações culturais como artifícios de transcendência espiritual e cultural, que vem sendo reproduzidos pelas identidades ribeirinha e gaúcha. Portanto, esta pesquisa expõe uma identidade missioneira que, ao mesmo tempo, é vivida e simbolizada, através de diálogos socioterritoriais entre as práticas sociais tradicionais e os remanescentes urbanos reducionais, que instigaram pensar os espaços sociais missioneiros a partir das vivências, dos ritos, das crenças, dos imaginários e dos vínculos territoriais.

Le long de la frontière entre la Thaïlande et le Myanmar (TMB), le paludisme se caractérise par une forte hétérogénéité de la transmission, une forte prévalence en porteurs sub-microscopiques et par l’émergence de la résistance à l’artémisinine chez Plasmodium falciparum. L'identification précoce des « foyers » infectieux et leurs éliminations sont nécessaires pour contenir la résistance à l'artémisinine. L'objectif de cette thèse était de démontrer l’intérêt d’utiliser des biomarqueurs sérologiques de l'exposition humaine aux piqûres d'anophèles (gSG6-P1) et au Plasmodium (CSP & MSP1-19) pour quantifier le contact homme-vecteur et identifier les foyers résiduels de transmission. Des papiers filtres contenant du sang ont été prélevés sur une cohorte de 2600 personnes suivie tous les 3 mois jusqu'à 18 mois et analysés par dosage immuno-enzymatique (ELISA). Nos résultats ont montré que les niveaux de réponse IgG à l'antigène gSG6-P1 variaient selon le village, la saison et l'âge et étaient positivement corrélés à l'abondance des espèces anophèles et des vecteurs primaires de paludisme. Une association significative et positive a été observée entre la réponse de l'anticorps au gSG6-P1 et le taux d'inoculation entomologique (EIR), démontrant ainsi que l'hétérogénéité de la transmission du paludisme était directement associée à un comportement de piqûre hétérogène. Des études complémentaires ont montré que le biomarqueur salivaire était pertinent pour détecter des variations micro géographiques dans la transmission à P. falciparum. Cela s’est traduit par des chevauchements significatifs entre les foyers infectieux à P. falciparum et ceux à forts répondeurs en anticorps anti-salive d’anopheles (gSG6-P1). Dans l'ensemble, ces résultats indiquent que le biomarqueur salivaire d'Anopheles est prometteur pour les études épidémiologiques et pourrait guider la mise en œuvre d’interventions de lutte antivectorielle « ciblées » afin d'éliminer les foyers résiduels de paludisme. / Malaria along the Thailand-Myanmar border (TMB) displays geographical heterogeneity and is characterized by high prevalence of submicroscopic carriage and the emergence artemisinin resistance in P. falciparum. Timely identification and elimination of remaining P. falciparum transmission “hotspots” is essential to contain artemisinine resistance. The aim of this study was to address the relevance of using serological biomarkers of human exposure to anopheles bites (gSG6-P1) and Plasmodium antigens to identify remaining sources of transmission and to measure spatial and temporal changes in human vector contact along the TMB. Blood spots were collected in filter papers among a cohort of 2600 people followed every 3 months up to 18 months, and used for analysis by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Our findings showed that the levels of IgG responses to gSG6-P1 antigen varied according to village, season, and age and were positively associated with the abundance of total Anopheles species and primary malaria vectors. A significant and positive association was noted between the Antibody response to gSG6-P1 and the entomological inoculation rate (EIR) hence demonstrating that heterogeneity in malaria transmission was directly associated with heterogeneous biting behavior. Further investigations showed that salivary biomarker was relevant to detect small scale variations in P. falciparum malaria. This was supported by scan statistics showing that P. falciparum clusters partially overlap the gSG6-P1 clusters. Altogether, these findings indicates Anopheles salivary biomarker as great potential for epidemiological studies and could be useful to guide the implementation of hotspot–targeted vector control interventions with the aim to achieve malaria elimination.

Cette thèse porte sur la taxonomie des acariens prédateurs de la famille des Phytoseiidae, dont certaines espèces sont utilisées en lutte biologique pour contrôler des acariens ravageurs et quelques petites espèces d’insectes. La taxonomie de ces organismes de petite taille (<500 μm), i.e. identification spécifique et relations entre les taxa, est essentiellement basée sur des caractères morphologiques. Ces caractères parfois difficiles à visualiser, à interpréter (variations intra et inter-taxa, analogies) et en faible nombre rendent l’identification des espèces et la classification actuelle sujette à certaines interrogations ; aucune analyse phylogénétique ne soutient en effet la taxonomie de cette famille. De plus les marqueurs moléculaires développés jusqu’à aujourd’hui ne permettent pas de définir de façon fiable les relations entre les taxa supraspécifiques. Ce travail présente deux objectifs: (i) caractériser via des outils moléculaires l’identité spécifique de deux taxa utiles en lutte biologique et établir des règles de décision moléculaire sur la base de plusieurs concepts analytiques et (ii) déterminer via le développement de nouveaux marqueurs moléculaires les relations supraspécifiques à l’intérieur de la tribu des Euseiini puis au niveau de l’ensemble de la famille. Concernant le diagnostic spécifique, ce travail a montré à travers l’exemple d’Amblyseius swirskii et Phytoseius finitimus l’utilité d’approches intégratives comprenant plusieurs marqueurs, du fait de la forte variation des marqueurs mitochondriaux au niveau intraspécifique. Les valeurs maximales des distances génétiques entre spécimens d’une même espèce (9%, 23% et 2.8 % pour 12S ARNr, CYTB ADN mt et ITSS) ont été établies. Concernant les relations supraspécifiques, des nouveaux marqueurs moléculaires ont été développés. La combinaison de six marqueurs moléculaires (12S ARNr, CYTB ADN mt, COI ADN mt, ITSS, 28S ARNr, HSP90) permet désormais de résoudre les différents rangs taxonomiques à investiguer. L’application de ces marqueurs à la tribu des Euseiini et à l’ensemble de la famille a permis de conclure quant à la validité de certains taxa. Par exemple, ce travail a montré la monophylie des Euseiini et des représentants des sous- tribus considérés. Le genre Iphiseius ne semble en revanche pas valide et inclus dans le genre Euseius. Des analyses morphologiques, biogéographiques et écologiques (plantes-hôtes) réalisées au niveau de l’ensemble de la tribu sur la base d’une compilation bibliographique, ont permis d’émettre des scénarios quant à l’origine ouest gondwanienne de ce taxon sur des plantes de Rosidées et quant à l’évolution de certains caractères morphologiques.Ce travail de thèse ouvre des perspectives d’étude des relations entre les genres de Phytoseiidae du fait des nouveaux marqueurs développés. Les études doivent se poursuivre pour (i) étendre le panel de marqueurs disponibles et surtout (ii) augmenter l’échantillonnage des espèces à inclure dans les analyses en lien avec leurs caractéristiques bioécologiques afin de déterminer comment les relations phylogénétiques peuvent constituer un outil de prédiction de ces caractéristiques utiles à connaître pour la mise en œuvre de la lutte biologique (proies, plantes, nourriture alternative). / This thesis deals with the taxonomy of predatory mites of the family Phytoseiidae, that contains several species used in biological control of pest mites and small insects. The taxonomy of these minute organisms (<500 μm), i.e. specific identification and phylogenetic relationships, is essentially based on morphological characters. These characters, which are sometimes difficult to visualize, interpret (variations in intra and inter-taxa, analogies) and in small numbers, make the identification of species and the current classification questionable. No phylogenetic analysis supports the taxonomy of this family. Moreover, the molecular markers developed up to now are not adapted to define reliable relations between supraspecific taxa. This work aims at: (i) characterizing using molecular markers the identity of two species useful in biological control and establishing molecular decision rules based on several analytical concepts and (ii) determining via the development of new markers the supraspecific relations within the Euseiini tribe and then at the level of the whole family. For the specific diagnosis, this work has shown through the example of Amblyseius swirskii and Phytoseius finitimus the usefulness of integrative approaches including several markers, due to the strong variation in mitochondrial markers at the intraspecific level. Maximum genetic distance values between specimens of the same species (9%, 23% and 2.8% for 12S rRNA, CYTB DNA mt and ITSS) were established. Concerning supraspecific relationships, new molecular markers have been developed. The combination of six molecular markers (12S rRNA, CYTB DNA mt, COI DNA mt, ITSS, 28S rRNA, and HSP90) now allows resolving different supraspecific ranks to be investigated. The application of these markers to the tribe Euseiini and to the family shows that certain taxa were valid. For example, this work emphasizes the monophyly of the Euseiini and representatives of the sub-tribes considered. The genus Iphiseius seems to not be valid and is included in the genus Euseius. Morphological, biogeographical and ecological analyses (host plants) carried out at the level of the whole tribe on the basis of a bibliographic compilation, emphasized the West Gondwanaland origin of this taxon on plants of Rosidae and the evolution of certain morphological characters. This thesis opens new insights for studying the relationships between the genera of Phytoseiidae due to the new markers developed. Studies should continue to (i) extend the panel of available markers and (ii) increase the sampling of species to be included in analyses related to their bio-ecological characteristics in order to determine how phylogenetic relationships can predict interesting life traits for biological control implementation (prey, plants, alternative food).

L’incidence de l’adénocarcinome de l’œsophage augmente depuis 30 ans dans les pays occidentaux et son pronostic est sombre. Le reflux gastro-œsophagien et les acides biliaires ont été incriminés dans l’apparition de la muqueuse de Barrett et sa dégénérescence en adénocarcinome, selon la séquence métaplasie/ dysplasie/ adénocarcinome. Au cours de cette séquence carcinogénétique, a été observée, à partir de tissus humain, une augmentation de l’expression des mucines MUC1 et MUC4. MUC1 et MUC4 sont des O-glycoprotéines membranaires impliquées dans les phénomènes de reconnaissance cellulaire et de signalisation intracellulaire. Les mécanismes du reflux gastro-œsophagien conduisant à l’adénocarcinome de l’œsophage (AO) demeurent mal compris. Tout d’abord, nous avons effectué une approche critique d’un modèle de reflux œsophagien induit chirurgicalement chez le rat. Pour cela, nous avons randomisé 108 rats Sprague-Dawley en deux groupes expérimentaux ; ainsi était réalisée une anastomose oesophagoduodenale avec ou sans gastrectomie afin d’induire respectivement un reflux duodéno-oesophagien (groupe RDO, n=63), et un reflux duodéno-gastro-oesophagien (groupe RDGO ; n=45). Les groupes contrôles comprenaient : (i) la réalisation d’une anastomose oesophago-jéjunale sur anse-en-Y (groupe chirurgical contrôle sans reflux), (ii) une laparotomie blanche, (iii) une gastrectomie subtotale pour induire un reflux duodéno-gastrique (groupe RDG), et enfin (iv) la même procédure que dans le groupe RDGO avec administration d’inhibiteurs de la pompe à protons (groupe IPP). Des analyses histologiques et moléculaires sont réalisées sur l’œsophage. La prévalence de l’œsophage de Barrett (OB) de la dysplasie et de l’AO dans les groupes expérimentaux étaient de 41%, 7% et 11% respectivement. Les analyses histologiques et moléculaires dans les groupes RDO, RDGO et RDG suggèrent que l’OB survient selon le schéma d’une métaplasie intestinale de novo et le migration proximale de cellules duodénales. Aucune métastase à distance n’a été identifiée. Les caractéristiques moléculaires de l’OB identifié chez le rat étaient similaires à celles de l’homme. L’OB était plus fréquent, la dysplasie et l’AO moins fréquent dans le groupe RDO que dans le groupe RDGO(44% vs 24% [ P = 0,038] et 7% vs 25% [ P =0,012], respectivement). Des élements de la séquence carcinogénétique survenait de façon moins fréquente dans le groupe IPP que dans le groupe RDGO [P = .019].Il a été mis en évidence une surexpression des gènes de mucines Muc1 et Muc4, de gènes impliqués dans la prolifération, l’invasion et les métastases, l’adhésion cellulaire et dans la voie PI3K , une diminution de l’expression de gènes suppresseur de tumeur dans les lésions de métaplasie et d’adénocarcinome, dans les zones les plus exposées au reflux.Ensuite, nous avons étudié les propriétés biologiques de cellules issues d’un adénocarcinome de l’œsophage humain et mis en évidence que la perte d’expression de MUC1 dans les cellules OE33 (i) diminue fortement leurs propriétés de prolifération, migration et invasion in vitro et la croissance tumorale in vivo, suggérant un rôle majeur de MUC1 dans la tumorigenèse épithéliale si MUC1 est surexprimée (ii) est corrélée avec une diminution de l’expression de Nfκb et PI3K et peut-être corrélé à l’altération des propriétés biologiques, notemment de prolifération (iii) avec une diminution de l’expression de TSG 101 et Mcm6 potentiels marqueurs mis en évidence dans le modèle murin.En conclusion malgré des différences pathophysiologiques avec l’homme, le modèle de reflux oeso-gastro-duodénal reproduit les lésions histologiques et moléculaires de la séquence carcinogénétique de Barrett et a permis d’identifier des protéines associées à la tumorigenèse et dont l’impact sur les propriétés biologiques des cellules tumorales a été confirmé in vitro et qui pourraient être de potentiels biomarqueurs et cibles thérapeutiques dans l’adénocarcinome de l’œsophage. / Incidence of oesophageal adenocarcinoma developed on Barrett oesophagus increases since 30 years and its prognosis remains poor. Gastro esophageal reflux and biliary acid have been incriminated in Barrett oesophagus metaplasia and its degeneration in adenocarcinoma according to the sequence metaplasia/dysplasia/adencrcinoma. During the carcinogenetic sequence, was observed an increase of expression of the mucins MUC1 and MUC4. MUC1 and MUC4 are membrane bound O-glycoprotein implicated in cell recognition and intracellular signaling. The mechanisms of esophageal reflux leading to esophageal adenocarcinoma (EA) remain poorly understood. In a first part we appraised critically an operatively induced chronic reflux rat model.We randomized 108 Sprague-Dawley rats into 2 experimental groups; one was performing esophagoduodenal (ED) anastomosis with or without gastrectomy to induce duodeno-esophageal reflux (DER group; n = 63), and the other involved duodeno-gastro-esophageal reflux (DGER group; n = 45). Control groups included (i) Roux-en-Y esophagojejunal anastomosis, (ii) laparotomy alone, (iii) subtotal gastrectomy to induce duodenogastric reflux (DGR group), and (iv) the same procedure as in the DGER group plus proton pump inhibition (PPI group). The esophagus underwent histologic and molecular analyses.The prevalence of Barrett’s esophagus (BE), dysplasia, and EA in the experimental groups was 41%, 7%, and 11%, respectively. Histologic and molecular analyses in groups DER, DGER, and DGR suggested that BE occurred through de novo intestinal metaplasia and proximal migration of duodenal cells. No distant metastases were identified. The molecular characteristics of both BE and EA were similar to humans. BE was more common, and dysplasia and EA less frequent in the DER groupwhen compared with the DGER group (44% vs 24% [ P = .038] and 7% vs 25% [ P = .012], respectively). Compared with the DGER group, carcinogenic sequence occurred less frequently in the PPI-treated group (P = .019). It was highlighted an overexpression of MUC1 and MUC4 genes, of genes implicated in proliferation, invasion, metastasis, cell adhesion , in PI3K pathways, a diminution of the expression of tumors suppressor genes in metaplasia, adenocarcinoma lesions in the areas most exposed to reflux. Then cell biological properties studies were carried out in vitro in OE33 oesophageal adenocarcinomatous cells. We showed that loss of expression of MUC1 in OE33 cells (i) induced a reduction of their proliferation, migration and invasion in vitro properties , tumor growth in vivo suggesting a major role of MUC1in epithelial tumorigenesis si MUC1 is overexpressed, (ii) is linked with a diminution of the exprssion of nfκb and PI3K and can be correlated with an alteration of the biological properties especially proliferation (iii) is lined with e diminution of expression of TSG101 and MCM6 , potential biomarkers highlighted in the rat model.In conclusion, despite pathophysiologic differences with humans, the rat model of esophagoduodenostomy reproduces accurately histologic and molecular lesions in the carcinogenetic sequence of BE and allowed us to identify novel, tumor-associated proteins that may be potential biomarkers and new therapeutic targets in EA.