Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 703580 bytes, checksum: c54aea14a44c9f869997d8889058fb2a (MD5) Previous issue date: 2012-08-09 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / The goals of genetic improvement of cotton have always been targeted for improvement in production and fiber quality. Currently, there is need to identify alternatives to the use of oil as fuel for diesel engines. The cottonseed oil has many nutritional advantages over other oils and can be found on the market numerous products. The constant search for genotypes with high oil content, without however losing the high productivity has been already achieved the goal of many researchers in recent years of cotton. One of the objectives of this study was to analyze the genetic inheritance of oil content in cotton. To do this, I evaluated the populations resulting from crosses CNPAC300/91 (P1) and V3 (P2), autofecundados originated from the backcrosses CNPAC300/91 (P1) e F1; V3 (P2) e F1, the parental lines. We used the full and reduced models, to explain the behavior of the average generation, character study, and estimation of variance components. The oil content behaved as a quantitative character. Parents CNPAC 300/91 x V3 were not as contrasting to the oil content, this fact committed biometric interpretations, since little genetic variability was expressed. The variance attributed to dominance deviation, accounted for most of the genetic variance at the crossroads, CNPAC 300/91 x V3. The gene effect attributed to the shift of dominance had the highest estimate and the largest variance, therefore, presented itself as a major gene effect. The additive model-dominate was satisfactory to explain the average behavior of generations, the trait studied. The methodology of generations proved invaluable for the study of the main genetic parameters of cotton crops. The other goal was to select genotypes segregating cotton in the F5 generation by estimating genetic and phenotypic parameters such as heritability, gains from the direct and indirect selection. To this end, the germplasm bank of Embrapa Cotton with 300 hits, three hits were selected with high oil content, which are BRS Aroeira with 25,31%, 26,71% in Acala 1.13-3-1 FURRS and 149 with 1,26% , which were crossed with elite lines from the Breeding Program of Embrapa Cotton, making a total of nine types of crosses. The analyzes were determined from the F3 seeds, which were conducted until the F5 generation with 22 lines, are evaluated along with two witnesses, the lineage CNPAC 300/91 and access V3 that have the lowest and the highest oil content, respectively, in the evaluation by Carvalho et al. (2010). The 22 lines were evaluated in a completely randomized trial with four replications, in each replicate were made three analyzes of the oil content, and for the analysis of variance was used the average of these three assessments. The estimated data of the oil content of the generations of studies allowed to estimate the phenotypic variance, genotypic, environmental, heritability by parent-child regression, and F3 (father) and F5 (son), and obtaining genetic gain. It was determined that there is genetic variation among offspring, so the possibility of obtaining gains by selection among and within progenies. The F5 generation is best to maximize the genetic gain from selection for seed oil content in cotton. The genetic gain estimated in the F5 generation corresponded to 4.98%, higher than the F3 generation indicating that selection for the character will be much more efficient to perform the direct selection in F5. The line CNPA 2011/12 has the potential to be used as parent in breeding programs aimed at improving the oil content of cotton. / Os objetivos do melhoramento genético do algodoeiro sempre foram direcionados para melhoria na produção e na qualidade da fibra. Atualmente, há necessidade de se identificar alternativas para o uso do petróleo como combustível de motores a diesel. O óleo de algodão tem muitas vantagens nutricionais em relação aos outros óleos e pode-se encontrar inúmeros produtos no mercado. A busca constante por genótipos com alto teor de óleo, sem, contudo perderem as altas produtividades já alcançadas tem sido o objetivo de muitos pesquisadores de algodão nos últimos anos. Um dos objetivos deste trabalho foi analisar a herança genética do teor de óleo do algodoeiro. Para tal, avaliaram-se as populações resultantes do cruzamento CNPAC300/91 (P1) e V3 (P2), os retrocruzamentos autofecundados originados do CNPAC300/91 (P1) e F1; V3 (P2) e F1, além das linhagens parentais. Foram utilizados os modelos completo e reduzido, para explicar o comportamento da média das gerações, no caráter em estudo, e estimação dos componentes de variância. O teor de óleo se comportou como um caráter quantitativo. Os progenitores CNPAC 300/91 x V3 não foram tão contrastantes para o teor de óleo, este fato comprometeu as interpretações biométricas, uma vez que pouca variabilidade genética foi expressa. A variância atribuída ao desvio de dominância correspondeu à maior parte da variância genética, no cruzamento, CNPAC 300/91 x V3. O efeito gênico atribuído ao desvio de dominância obteve a maior estimativa e a maior variância, portanto, apresentou-se como o efeito gênico de maior importância. O modelo aditivo-dominante foi satisfatório para explicar o comportamento médio das gerações, no caráter em estudo. A metodologia de análise de gerações mostrou-se de grande valia para o estudo dos principais parâmetros genéticos da cultura do algodoeiro. O outro objetivo foi selecionar genótipos segregantes do algodoeiro na geração F5 através da estimativa de parâmetros genéticos e fenotípicos como herdabilidade, ganhos com a seleção direta e indireta. Para tal, foram selecionadas no Banco de Germoplasma da Embrapa Algodão com cerca de 300 acessos, três acessos com alto teor de óleo, que são, BRS Aroeira com 25,31%, Acala 1.13-3-1 com 26,71% e 149 FURRS com 26,01%, os quais foram cruzadas com linhagens elite do programa de melhoramento da Embrapa Algodão, realizando no total nove tipos de cruzamentos. As análises foram determinadas desde as sementes F3, as quais foram conduzidas até chegar à geração F5 com 22 linhagens, estas foram avaliadas juntamente com duas testemunhas, a linhagem CNPAC 300/91 e o acesso V3 que possuem o mais baixo e o mais alto teor de óleo, respectivamente. As 22 linhagens foram avaliadas em um ensaio inteiramente ao acaso com 4 repetições; em cada repetição foram feitas três análises do teor de óleo, sendo que para a análise de variância usou-se a média destas três avaliações. Os dados estimados do teor de óleo das gerações em estudos possibilitaram estimar as variâncias fenotípicas, genotípicas, ambiental, herdabilidade pela regressão pai-filho, sendo F3 (pai) e F5(filho), e obtenção do ganho genético. Foi determinado que existe variação genética entre as progênies, portanto, a possibilidade de se obterem ganhos pela seleção entre e dentro de progênies. A geração F5 é a mais indicada para maximizar o ganho genético por seleção para o caráter teor de óleo em algodão. O ganho genético estimado na geração F5 correspondeu a 4,98%, superior a geração F3 denotando que a seleção para o caráter será bem mais eficiente, ao realizar a seleção direta na F5. A linhagem CNPA 2011/12 apresenta potencial para ser utilizada como genitor em programas de melhoramento visando melhoria do teor de óleo do algodoeiro.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 4947376 bytes, checksum: a35aac2cfe33f53bbe968ffe450e48f1 (MD5) Previous issue date: 2013-02-05 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The use of molecular markers in genetic studies is a important technique that is able to assist the breeding programs of Coffea canephora. In this context, the microsatellite (SSR) has been preferentially chosen because have reproducibility, high levels of polymorphism, codominant expression and multialelismos. In breeding programs, this technology can be used for different purposes. In genetic diversity studies, it is important for evaluation the genetic resources and selection of potential parents for crossings. In analysis of QTL, it allows the elucidation of quantitative trait and this information can be used in programs that aiming the marker assisted selection (MAS) or positional cloning of genes. In this sense, the present study aimed to demonstrate the application of microsatellite markers in diversity studies, genetic mapping and QTL analysis in C. canephora. In genetic diversity studies, presented in Chapter 1, the result of the transformation of data ) was measured in germplasm studies. We observed a significant loss of genetic information, which influences the management and characterization of genetic resources stored in this collections. In the QTL and mapping studies, presented in Chapter 2, the SSR markers were used to construct the genetic linkage map and identification of genetic factors associated with resistance to coffee leaf rust (Hemileia vaxtatrix), which is the major foliar disease coffee. In this study, we used a population of full-sib progenies, that is maintained in the Incaper (Institute, Technical Assistance and Rural Extension of the Espírito Santo State). This population was phenotyped, considering the components of resistance evaluated in field and in laboratory. We identify, in linkage group 1, a significant QTL for all traits considered in this study and this genomic region is potentially useful in studies of positional cloning or MAS in breeding programs. Finally, because the importance of molecular markers in studies with coffee, in chapter 3, we described a set of 101 new SSRs primers, mined from expressed sequences (EST) Coffee Genome Brazilian Project. The level of polymorphisms, the rate of transferability and its application in studies of molecular characterization and genetic mapping within the genus Coffea were considered. The EST-SSR showed that are a powerfull tools for genetic studies with coffee. Thus, the results obtained in this study are important for genetic studies within species, since they were made available important knowledge that can be used in germplasm management, selection of genotypes resistant to rust, genetic diversity and molecular marker-assisted selection. / O uso de marcadores moleculares em estudos genético apresenta-se como uma técnica potencialmente capaz de auxiliar no melhoramento genético de Coffea canephora. Neste contexto, os marcadores microssatélites (SSR) tem sido preferencialmente escolhidos, pois agregam qualidades importantes, dentre as quais se destacam a reprodutibilidade, altos níveis de polimorfismos, expressão codominante e multialelismos. Em programas de melhoramento genético essa tecnologia pode ser utilizada para diferentes finalidades com destaque para os estudos de diversidade genética, que auxiliam na avaliação dos recursos genéticos disponíveis e seleção de potenciais genitores; e nas análises de QTLs, que permitem a elucidação do caráter quantitativo e utilização dessas informações em programas de seleção assistida por marcadores (SAM) e clonagem posicional de genes. Neste sentido o presente trabalho teve como objetivo geral demonstrar a aplicação dos marcadores microssatélites em estudos de diversidade, mapeamento genético e análises de QTLs em C. canephora. Nos estudos de diversidade genética, apresentados no capítulo 1, o resultado da codificação de dados nas avaliações de germoplasma foi mensurado e observou-se uma perda significativa de informações genéticas, o que influencia no manejo e caracterização dos recursos genéticos armazenados nas coleções. Para os estudos de mapeamento e análises de QTLs, apresentados no capítulo 2, os marcadores SSR foram utilizados para a construção do mapa de ligação genético e identificação de fatores genéticos associados à resistência à ferrugem (Hemileia vaxtatrix), que atualmente é a principal doença foliar do cafeeiro. Neste estudo, progênies de irmãos completos de uma população de melhoramento do Incaper (Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural) foram genotipadas e fenotipadas, considerando componentes de resistência avaliados em campo e em laboratório. O resultado do mapeamento de QTL foi a identificação, no grupo de ligação 1, de QTLs significativos para todas as características consideradas no estudo, o que tornou essa região genômica potencialmente útil em estudos de clonagem posicional ou SAM, em programas de melhoramento genético. Por fim, visto a importância dos marcadores moleculares nos estudos com cafeeiros, no capítulo 3, foi descrito um conjunto de 101 novos primers SSRs, minerados de sequencias expressas (EST) do Projeto Brasileiro do Genoma Café. O nível de polimorfismos, a taxa de transferabilidade e sua aplicação em estudos de caracterização molecular e mapeamento genético dentro do gênero Coffea foram considerados e mostrou que os EST-SSR descritos são ferramentas de grande valia para estudos genéticos com cafeeiros. Dessa forma, os resultados obtidos nesse estudo são importantes para os estudos genéticos dentro da espécie, uma vez que foram disponibilizados conhecimentos importantes que tangem o manejo de germoplasmas, seleção de genótipos resistentes à ferrugem, diversidade genética e seleção assistida por marcadores moleculares.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-08-31Bitstream added on 2014-06-13T18:39:35Z : No. of bitstreams: 1 souza_cs_me_ilha.pdf: 372222 bytes, checksum: a23d8dffc9394536874e4aba2dd0153a (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O Eucalyptus urophylla destaca-se pelo potencial de utilização de sua madeira, pela sua plasticidade de adaptação a diferentes condições ambientais brasileiras e por ser tolerante ao cancro do eucalipto (Cryphonectria cubensis). A utilização de sementes melhoradas se faz necessária, considerando o iminente déficit florestal que começou no Brasil, a partir de 2004, em função da demanda por madeira ser maior que a sua oferta. Entretanto, o melhoramento dessa espécie, no Brasil, depende da existência de variabilidade genética das populações introduzidas, a qual evita a ocorrência de depressão endogâmica. O presente trabalho visa o estudo genético de uma população base de E. urophylla, originária de Flores e Timor, e instalada em Selvíria-MS. Estudou - se a variabilidade genética dessa população através de análises quantitativas. Dessa forma, os objetivos específicos do estudo foram: a) estimar a variabilidade genética para os principais caracteres silviculturais; b) estimar possíveis ganhos na seleção, utilizando-se da seleção entre e dentro de progênies e do Índice Multi-efeitos, analisando o efeito do desbaste em uma população base de E. urophylla. O experimento foi instalado em 17 de março de 1992, na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia, Campus de Ilha Solteira (FE/UNESP), localizada no município de Selvíria – MS. O teste de progênies foi instalado obedecendo a um delineamento experimental em Látice 8x8, quíntuplo, parcialmente balanceado, com 64 progênies provenientes da Estação Experimental do Instituto de Pesquisas e Estudos Florestais (IPEF/ESALQ/USP), localizada no município de Anhembi – S.P. As parcelas contêm oito árvores, no espaçamento de 3,0 x 3,0 metros. Os caracteres quantitativos avaliados e analisados foram: 1- diâmetro à altura do peito (DAP); 2- altura total da planta (H); 3- tipo de... / The Eucalyptus urophylla is detached for its wood potential of utilization for its plasticity of plasticity of adaptation in different Brazilian’s environmental conditions and for being tolerant towards the eucalyptus canker (Cryphonectria cubensis). The utilization of improved seeds is needed, considering the imminent woodland’s deficit that started in Brazil, in 2004, since the heavy Wood demand was higher than it offers. However the improvements of this specie in Brazil, depends on the existence of genetic variability of the installed populations, which avoids the occurrence of endogamous depression. The present report aims at the genetic study of a base population of E. urophylla, originated from Flores e Timor, and installed in Selvíria-MS. Its genetic variability was studied through quantitative analysis. This way, the specific objectives of this report was: a) Guess the genetic variability for the main silvicultural characters; b) Guess possible earnings in the selection, utilizing this selection among and inside the progenies and inside the progenies and the index of multi-effects, analyzing the skive effect in a base population of E. urophylla. The experiment was installed on March 17th of 1992, on the engineering university’s farm of teaching, researches, and extension, campus in Ilha Solteira (FE/UNESP), located in Selvíria - MS. The progenies test was installed obeying an experimental delineation in lattice of 8x8, quintuplet, partially balanced with 64 progenies which came from the experimental station in the woodland’s institute of researches and studies, (IPEF/ESALQ/USP), located in of Anhembi - SP. The parcels have 8 trees, in a space of 3,0 x 3,0 meters. The evaluated and analyzed quantitative characters was: 1-Diameter at chest’s height (DAP); 2-Total plant’s height (H); 3-Kind of bark (CAS); 4- Shape of the shank (FOR); 5- Bifurcation; 6- Survival (SOBR) ... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Leticia da Silveira Pinheiro.pdf: 1061417 bytes, checksum: d3b6dccd4e5c363bd8b7c9da2c672cc0 (MD5) Previous issue date: 2008-03-07 / Recurrent Selection is a population inbreed method that is not traditionally used in autogamous species as rice. However, it is still an interesting methodology to the implementation of recurrent selection populations, due to the possibility of obtaining genotypes with wide genetic base and adequate agronomical traits. It is even more attractive when a great genetic variability is easily available, as it is for rice and could be largely used in the development of more productive elite cultivars and with a better production stability even under low input agricultural systems. Two recurrent selection irrigated rice populations, developed by Embrapa Arroz e Feijão, were synthetized using different recombination methods. The CNA-IRAT 4 population was developed in field conditions using male-sterelity, while the CNA 12 population originated from manual crosses in a circulant partial diallel scheme. The aim of this work was the evaluation of the genetic variability among cycles of the two recurrent selection populations using fourteen SSR markers. Hundred and eighty genotypes of the cycles 1, 2 and 5 of CNA-IRAT 4 population and cycles 1 and 2 of CNA 12, were evaluated. The AMOVA did not indicate any genetic structure among the cycles of selection, meaning that the greater variation was attributed between individuals within cycles, in both studied populations. Unexpected alleles, which means alleles that not belong to the genetic pool of the genitors, were identified in both populations and in all cycles evaluated, mostly of these alleles were observed on CNA-IRAT 4 population. These alleles were probably a result of undesired crosses of genotypes which did not belong to both populations. Parameters Fis and Fit of Wright s statistics indicated that the genetic variability of the manually conducted population (CNA 12) were increased while the population using male-sterelity recombination (CNA-IRAT 4) were reduced. The mean reason for this particular situation was due to the directionally crosses that promoted a greater combination between the alleles of all genitors, while male-sterelity methodology pollination the alleles from plants with major height and more capable of producing more pollen were privileged. To avoid the genetic drift in CNA-IRAT 4, genotypes genetically divergent, with more General Capacity of Combination and with good agronomic attributes, should be introduced on this population. / Seleção recorrente é um método de melhoramento populacional ainda pouco empregado em espécies autógamas, como o arroz. Contudo, a possibilidade de obter genótipos de ampla base genética e com bons atributos agronômicos, é um atrativo interessante para a implementação de populações de seleção recorrente, sobretudo pela necessidade de utilizar a grande variabilidade genética disponível para enfrentar o desafio de desenvolver cultivares elite mais produtivas e capazes de manter a estabilidade de produção. Foram utilizadas, neste estudo, duas populações de seleção recorrente de arroz irrigado, desenvolvidas pelo programa de melhoramento genético da Embrapa Arroz e Feijão. A população CNA-IRAT 4 portadora do gene da macho-esterilidade genética, permitindo assim que a sua recombinação seja feita à campo, e a população CNA 12 recombinada manualmente através do esquema de cruzamento em dialelo ciculante por não possuir este gene. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética entre os ciclos de seleção das duas populações por meio de 14 marcadores SSR. Foram avaliados 180 indivíduos dos ciclos 1, 2 e 5 na CNA-IRAT 4, e ciclos 1 e 2 na CNA 12. O estudo da análise de variância molecular (AMOVA) não indicou nenhum tipo de estruturação entre os ciclos de seleção definindo que a maior parte da variação foi encontrada entre os indivíduos dentro dos ciclos do que entre os ciclos em ambas as populações. Foram identificados alelos não provenientes dos genitores nas duas populações, e em todos os ciclos, principalmente para a CNA-IRAT 4. Estes alelos foram provavelmente resultantes da fecundação indesejada a partir de genótipos que não faziam parte das populações. Os parâmetros Fis e Fit da estatística F de Wright indicaram que a recombinação manual está ampliando a variabilidade genética da população CNA 12, enquanto que a recombinação via gene da macho-esterilidade está reduzindo a variabilidade genética da CNA-IRAT 4, e o principal motivo é que os cruzamentos dirigidos estão promovendo uma maior combinação entre os alelos de todos os genitores, enquanto que a polinização via macho-esterilidade vêm privilegiando os alelos dos genótipos com maior porte e capacidade de produção de pólen e do macho-estéril. Para evitar a deriva genética na CNA-IRAT 4, genótipos de arroz geneticamente divergentes das progênies, com maior Capacidade Geral de Combinação e com bons atributos agronômicos, deverão ser introduzidos nesta população.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Glaucio F O e Silva.pdf: 407953 bytes, checksum: 6fc973eb2803412646e7b58019c28c3c (MD5) Previous issue date: 2007-07-05 / The common bean (Phaseolus vulgaris L.) is part of the daily diet of more than 300 million people worldwide, being an essential food for low income human populations, since it is a cheaper protein source. The beans protein content can be improved by breeding programs since the existence of genetic variability for this character can be explored. It is important to have the relative efficiency of the available methods evaluated. The objective of this research was to evaluate the genetic potential for protein content of segregant populations of common beans submitted to different breeding methods and evaluate the potential of the populations of the bulk method inside F2 families for the traits yield and flowering. The parental utilized in this study was from the bean group carioca , CNFC 7812 with 23% of total protein content and CNFC 8056 with 23% of total protein content. Starting with the F1 generation, was obtained the segregant population F2, witch were selected 150 plants wich families was utilized to produce the populations by three methods: Bulk, Bulk within of F2 and SSD method until the F5 generation. The average protein content of the families obtained by this cross was 16,58% for the method SSD, 20,37% for the method Bulk e 20,44% for the Bulk F2:5. Based on the results, it could be concluded that the best method for protein content was the Bulk method, on account of its easiness and its generation of a larger number of families superior than the best parental and the average of the genitors. Among the evaluated families there is enough genetic variability to be explored for the characters protein, grain yield and flowering. / O feijão (Phaseolus vulgaris L.) participa da dieta de mais de 300 milhões de pessoas no mundo, sendo alimento essencial para populações carentes, pois é fonte barata de proteína. O teor de proteína total de feijão pode ser melhorado com o auxílio de programas de melhoramento, já que existe variabilidade genética a ser explorada para esse caráter. É importante que seja avaliada a eficiência relativa dos métodos disponíveis de condução de populações segregantes. O objetivo desse trabalho foi avaliar o potencial genético de populações segregantes de feijoeiro comum para teor de proteína total, conduzidas por diferentes métodos de melhoramento e avaliar o potencial das populações do método de bulk dentro de F2 para os caracteres produtividade de grãos e florescimento. Os genitores utilizados para gerar estas populações foram do grupo de feijão carioca, CNFC 7812 com 16% de proteína total e CNFC 8056 com 23% de proteína total. A partir da geração F1 obteve-se a população segregante F2, da qual foram separadas 150 plantas cujas sementes foram utilizadas para conduzir as populações por três métodos: Bulk, Bulk dentro de F2 e método de uma única semente (SSD) até a geração F5. Foram realizadas avaliações de qualidade nutricional do grão para teor de proteína em todas as famílias provenientes dos três métodos de condução de populações na geração F5. O teor médio de proteína das famílias obtidas deste cruzamento ficou em 16,58% para o método SSD, 20,37% para o método Bulk e 20,44% para o Bulk F2:5. Dos resultados obtidos pode-se concluir que para o caráter proteína, o método mais indicado foi o método Bulk, pela sua praticidade e por ter gerado mais famílias superiores ao melhor genitor e à média dos genitores. Entre as famílias avaliadas observou-se que existe variabilidade genética suficiente para ser explorada para os caracteres teor de proteína total, produtividade de grãos e florescimento.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Janine M Guedes.pdf: 986675 bytes, checksum: 0cc34cd9a835050bc20a4f5c99b5b4a5 (MD5) Previous issue date: 2012-03-15 / Rice (Oryza sativa) stands out in Brazil for its economic and social importance, being an important source of protein and energy. Selecting lines of upland rice adapted to different environments is critical to the success of breeding programs targeted to family farmers in the state of Goiás, The objective of this work was to evaluate S0:2 families drawn from CNA9 population of the upland rice breeding program in greenhouse and in the field, aiming to select families for recombination and obtainment of a new selecting cycle. 50 families from CNA9 population from recurrent selection were used, in four experiments, with N, P, and inoculant combinations, in a randomized bloc design arrangement with two replicates in greenhouse. Traits evaluated were: plant height, chlorophyll content, canopy dry matter, roots dry matter and volume. The field experiment was arranged in a 14 X 14 square lattice, with 194 families, two controls, and three replicates. Traits evaluated were: plant height, flowering and yield, besides the following diseases: leaf and neck blast, scald, brown spot, grain spot, and narrow leaf spot. Results obtained from greenhouse indicate that families studied performed similarly in the absence of the inoculant, but responded differently for plant height, dry matter, and root volume, regarding nitrogen and phosphorus combinations. Field data showed that the families drawn from CNA9 population showed superior performance when compared to controls and to the original population, especially regarding neck blast and yield. It was possible to select 48 families from the field to recombine in the next breeding cycle. / O arroz (Oryza sativa) destaca-se no Brasil por sua importância econômica e, sobretudo social, sendo uma importante fonte de proteína e energia. Selecionar linhagens de arroz de terras altas adaptadas a ambientes diversos é de extrema importância para o sucesso dos programas de melhoramento direcionados para os agricultores familiares do estado de Goiás. O objetivo desse trabalho foi avaliar famílias S0:2 da população CNA9 do programa de melhoramento de arroz de terras altas em casa de vegetação e no campo, visando a seleção de famílias para recombinação e obtenção de um novo ciclo de seleção. Foram utilizadas 50 famílias da população CNA9 de seleção recorrente em quatro experimentos, utilizando combinações de N, P e inoculante, no delineamento blocos casualizados com duas repetições, em casa de vegetação. Os caracteres avaliados foram altura de plantas, teor de clorofila, matéria seca da parte aérea, matéria seca de raiz e volume. O experimento em campo foi um látice quadrado 14 x 14 com 194 famílias e 2 testemunhas, com três repetições. Foram avaliados os caracteres altura de plantas, floração e produtividade, além das principais doenças: brusone na folha, brusone no pescoço, escaldadura, mancha parda, mancha de grãos e mancha estreita. Dos resultados obtidos para casa de vegetação, pode-se concluir que as famílias mostraram comportamento semelhante na ausência ou presença do inoculante e houve resposta diferenciada das famílias para os caracteres altura de plantas, matéria seca e volume de raiz para as combinações de nitrogênio e fósforo. Os resultados obtidos no campo mostraram que as famílias avaliadas da população CNA9 apresentaram desempenho superior às testemunhas e a população original principalmente em relação a brusone no pescoço e a produtividade de grãos. Foi possível selecionar 48 famílias no campo para recombinação e obtenção do próximo ciclo.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 taryana.pdf: 5876234 bytes, checksum: 626e6debe969770d6329c335e12d0cad (MD5) Previous issue date: 2006-08-24 / The Species Palicourea coriacea (Cham) K,Shum is a species little know, it is belonging to the Rubiaceae family, popularly known as douradinha. The popular use medicine in the therapy of kidneys illnesses. The popular name douradinha is associated with the color of the bracts and of the stem and the species occurs in Cerrado s Bioma, however in different environments. Studies about the genetic diversity and its distribution in natural populations of P. coriacea are of extreme importance for the definition of adequate strategies of handling and cultivation, however they do not exist in literature, studies of this nature. This work had as objective to evaluate the genetic structure from nine natural populations of P. coriacea, collected in States of Goiás and Bahia and to evaluate the genetic diversity of these populations through markers RAPD. The P. coriacea species presented one high level of genetic diversity, or heterozygosity waited by Nei (1972) that it varied between 0,259 and 0,338 in the populations, with equal on average value the 0,296. The AMOVA disclosed that 23% of the total variability is meeting each other between populations. Although the estimates of apparent gene flow (Nm) have disclosed values inferior to one, on the other hand, equal the 0,83. The analyses of Bayesian Statistics had disclosed to a value of f (FIS) equal the 0,98 suggesting the possibility of this species has behavior like autogamous species. The analyses of grouping of the populations using Bayesian and AMOVA statistics disclosed that it does not exist a correlation between geographic distance and genetic distance all the nine populations they grouping, eventually, not obeying its geographic origin. Then, the hypothesis previously formulated of that geographically next populations would be genetic next, was discarded for the results gotten for the Mantel test where it got a correlation of 0,155. In addition, this relatively high inter populations differentiation allows to recommend to a strategy ex situ of the genetic variability using the biggest possible number of populations. In what, the conservation says respect in situ must be taken in account characteristic genetic and demographic of this species considering that this fact implies in the possibility of a continuous evolution and in the development of new adaptable strategies. It is necessary to have conscience on the distribution of the genetic diversity of these areas with intention to not only promote polities for preservation of found natural populations in national parks, but yes to private preservation of the legal reserves and properties. / A espécie Palicourea coriacea (Cham.) K. Schum é uma espécie pouco conhecida cientificamente, pertencente à família Rubiaceae, popularmente conhecida como douradinha. É utilizada pela medicina popular na terapia de doenças renais. O nome popular douradinha está associado à cor das brácteas e do caule e a espécie ocorre no bioma Cerrado, porém em diferentes fitofisionomias. Estudos sobre a diversidade genética e sua distribuição em populações naturais de P. coriacea são de extrema importância para a definição de estratégias adequadas de manejo e cultivo, porém não existem, na literatura, estudos dessa natureza. Este trabalho teve como objetivo avaliar a estrutura genética de nove populações naturais de P. coriacea, coletadas nos Estados de Goiás e Bahia e avaliar a diversidade genética dessas populações utilizando marcadores RAPD. A espécie P. coriacea apresentou um alto nível de diversidade genética, ou heterozigosidade esperada de Nei (1972) que variou entre 0,259 e 0,338 nas populações, com um total geral igual a 0,296. A AMOVA revelou que 23 % da variabilidade total se encontram entre populações e 77 % se encontra dentro de populações. As estimativas de fluxo gênico aparente (Nm) foram inferiores a um, ou seja, igual a 0,83. As análises do índice de fixação (f) por abordagem bayesiana forneceram valores médio igual a 0,98 sugerindo a possibilidade dessa espécie se comportar como uma espécie autógama. As análises de divergência genética e padrão espacial das populações utilizando as matrizes de θB e ΦST par a par revelou que não existe uma correlação entre distância geográfica e distância genética todas as nove populações se agrupam aleatoriamente, não obedecendo a sua origem geográfica. Assim, a hipótese previamente formulada de que populações geograficamente próximas teriam que ser geneticamente próximas, foi descartada pelos resultados obtidos no teste de Mantel onde a correlação foi igual a 0,155. Assim essa diferenciação interpopulacional relativamente alta permite recomendar uma estratégia de amostragem para a conservação ex situ da variabilidade genética, utilizando o maior número de populações possível. No que diz respeito a conservação in situ, deve ser levado em conta características genéticas e demográficas dessa espécie, considerando que esse fato implica na possibilidade de uma evolução contínua e no desenvolvimento de novas estratégias adaptativas. É necessário ter conhecimento sobre a distribuição da diversidade genética destas áreas com o intuito de auxiliar nas políticas para preservação não somente de populações naturais encontradas em parques nacionais, mas também preservação das reservas legais e propriedades privadas.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1285006 bytes, checksum: 66befb25fdda54069e90bd93e5d2c031 (MD5) Previous issue date: 2014-07-10 / The corn crops occupies a prominent position in the agricultural activity in worldwide, being an of the most studied crops in the plant breeding, not so much for the case of corn starch. The corn starch Avati Morotî food is of greater importance for the Paraguayan peasant family and general public as source of typical food in several country regions. In most cases, the producers of this type of maize using seeds its own production of cultivars generally from low productivity, susceptible to disease, pests, and long cycle.Considering the importance of this type of corn for food security the Instituto Paraguayo de Técnologia Agraria (IPTA) is working in the plant breeding for to get early crops, being more productive and with low cost of ownership for small producers cultivars. The objective of this study was to evaluate the existence of interactions between genotypes and environments, and estimate the parameters of adaptability and stability of hybrids of corn starch by the method of Lin and Binns (1988); estimate genetic and phenotypic parameters as the simple correlations, partial and track, the genetic divergence and relative contribution of genetic diversity to characters by the method of Singh (1981) for 49 genotypes of corn starch in three environments in eastern Paraguay. The experimental design was a randomized block design with three replications, with plot containing 25 plants. The analysis of variance showed significant difference for all traits in the locality of Choré with 1% level of significance by F test for the location of Capitan Miranda; however, grain yield (GY) and plant aspect (AP) were not significant. The locality Yjhovy the (PG) was significant at 5%. The analysis of variance showed a significant interaction for genotype by environment at the 5% significance level for the F test, for all traits except male flowering. Most features of the showed interaction of complex type. The adaptability and stability proved more adaptable and stable hybrids, being also the most productive. The 41and 24 materials were genotypes that contained the lowest values of Pi general. In all locations, there was a significant genetic variability for all traits, including productivity the exception of the number of caterpillar (NL) and empty cobs (EV), the grain yield (GY) correlates positively with plant height and percentage of grains to the location of Choré and Yjhovy, lower positive correlation with GY were found with a diameter of cob (DE) and ear length (EC).Features percentage of grains (Pg) and ear length (EC) are those with the highest direct effect on PG between the primary components and secondary components were between plant height (APL) and prolificacy (PROL), the most indicated for indirect selection for grain yield. In all locations, there was a significant genetic variability among genotypes, with genotypes 48 the most divergent between them. From the dendrogram nearest neighbor two groups were formed for the localities Capitan Miranda and Choré, although for Yjhovy three groups were formed and the method of UPGMA were, three and four groups for the localities Capitan Miranda, Chore and Yjhovy, characters male flowering (FM) and plant height (APL) were the main contributors to genetic divergence. / A cultura de milho ocupa posição de destaque na atividade agropecuária no mundo, sendo umas das culturas mais estudadas na área de melhoramento genético, nem tanto assim para o caso de milho amiláceo. O milho amiláceo Avati Morotî constitui uns dos alimentos de maior importância para a população do Paraguai em especial à família camponesa do Paraguai e população em geral por ser parte constituinte de vários pratos típicos do país. Na maioria dos casos os produtores deste tipo de milho utilizam sementes de sua própria produção, geralmente provenientes de cultivares de baixa produtividade, suscetível à doenças e pragas e ciclo muito longo. Considerando as importâncias deste tipo de milho para a segurança alimentar, o IPTA (Instituto Paraguaio de Tecnologia Agrária) trabalha na área de melhoramento para obter cultivares precoces, mais produtivas de baixo custo de aquisição para os pequenos produtores. O objetivo deste trabalho foi avaliar a existência de interação entre genótipos e ambientes e estimar os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade de híbridos de milho amiláceo pelo método de Lin e Binns (1988); estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos, assim também as correlações simples, parciais e de trilha e estudar a divergência genética, assim também a contribuição relativa dos caracteres para diversidade genética pelo método de Singh (1981), para 49 genótipos de milho amiláceo, em três ambientes, na região Oriental do Paraguai. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso, com três repetições, com a parcela contendo 25 plantas. A análise de variância demonstrou diferenças significativas para todos os caracteres avaliados na localidade de Choré com nível de 1% de significância pelo teste F. No entanto, para a localidade de Capitan Miranda, a produtividade de grãos PG e aspecto da planta AP não foram significativos. A localidade Yjhovy o (PG) foi significativa aos 5%. A análise de variância conjunta mostrou uma interação significativa para híbridos por ambientes ao nível de 5 % de significância pelo teste F, para todos os caracteres, com exceção de floração masculina. A maioria das características apresentou interação do tipo complexa. A adaptabilidade e estabilidade revelaram híbridos mais adaptados e estáveis, sendo também, os mais produtivos. Os híbridos 41e 24 foram que contiveram os menores valores de Pi geral. Em todos os locais, observou-se a existência de variabilidade genética para todas as características entre eles a produtividade a exceção do número de lagarta e espiga vazia . A PG correlacionou-se positivamente com a altura de planta e porcentagem de grãos para a localidade de Choré e Yjhovy, menor correlação positiva com PG foi obtida com diâmetro de espiga DE e comprimento de espiga CE. Os caracteres porcentagem de grãos Pg e comprimento de espiga CE são os que apresentaram maior efeito direto sobre a PG entre os componentes primários, e entre os componentes secundários foram altura de planta APL e prolificidade PROL, sendo os mais indicados para seleção indireta para PG. Em todos os locais, observou-se a existência de variabilidade genética entre os híbridos, sendo o genótipo 48 o mais divergentes entre eles. A partir do dendrograma de Vizinho mais próximo foram formados dois grupos para as localidades de Capitan Miranda e Choré, embora para Yjhovy foram formados três grupos e pelo método de UPGMA foram dois, três e quatro grupos para as localidades de Capitan Miranda, Chore e Yjhovy. Os caracteres floração masculina FM e altura de planta APl foram os que mais contribuíram para a divergência genética.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 603649 bytes, checksum: 8078bce5044cb13ffdd772bf86b1760f (MD5) Previous issue date: 2014-05-09 / The bioenergy sector in Brazil has been experimenting the use of saccharine sorgum to optimize ethanol production. However, there are few varieties and little knowledge about the adaptability of available materials. To study the genotypes adaptability and stability is indispensable at the final stages of a saccharine sorgum improvement/amelioration program, in order to signal correctly appropriate genotypes to regions of cultivated lands. Green mass productivity (PMVtn/ha) of saccharine sorgum is influenced by genotype effects (G), environmental effects (E), and by the genotype environment interactions (G x E), that yield different genotype behavior in different environments. The research aimed at studying the genotype adaptability and stability based on (G x E) in order to select the best genotypes of saccharine sorgum driven by ethanol production in intercrop periods of sugar cane plantation. The experiments were carried out in 8 environments encompassing different regions in Brazil (Minas Gerais and São Paulo States in the Southeast Region), as well as (Mato Grosso and Mato Grosso do Sul States plus the Federal District in the West-Central Region), in the tillage years of 2013-2014. In order to select the best genotypes, their adaptability and stability was studied by means of the Eberhart & Russel method, and the methodology Cruz, Torres & Vencovsky proposed. Variance analyses were followed by adaptability and stability analyses. The Eberhart & Russel methodology recommended the genotype BRS 511 for its showing highly predictable behavior and good response to environmental variations under both specific or general conditions regarding all characteristics that were evaluated. It also recommended the genotypes CMSXS644, CMSXS647 and Sugargraze for green mass production (PMVtn/ha), CMSXS629, CMSXS630, CMSXS646, CMSXS647, BRS 508, BRS509, e CV 198 for the variable TBH, and CMSXS629, CMSXS630, CMSXS643, CMSXS646, BRS 506, e BRS509 for the SST contents. The bisegmented regression proposed by Cruz, Torres &Vencovsky only characterized the genotypes concerning their adaptability under specific conditions in favorable environments or their adaptability in general, and concerning their stability as stable. Yet, it has not identified recommendable genotypes. / O setor bioenergético brasileiro vem experimentando o uso de sorgo sacarino para otimizar a produção de etanol. Entretanto, existem poucas variedades e pouco conhecimento da adaptabilidade dos materiais disponíveis. O estudo da adaptabilidade e estabilidade dos genótipos é imprescindível na fase final do programa de melhoramento de sorgo sacarino, para corretas indicações dos genótipos apropriados nas regiões de cultivo. A produtividade de massa verde (PMVtn/ha) do sorgo sacarino é influenciada por efeitos genotípicos (G), efeitos ambientais (A) e das interações genótipos x ambientes (G x A), que levam ao comportamento diferencial dos genótipos nos diversos ambientes. O objetivo deste trabalho foi estudar a adaptabilidade e estabilidade dos genótipos com base nos efeitos da interação genótipos x ambientes para a seleção dos melhores genótipos de sorgo sacarino visando a produção de etanol, na entressafra da cana de açúcar em diferentes regiões do Brasil. Os ensaios foram conduzidos em 8 ambientes nas regiões do sudeste (Minas Gerais, São Paulo) e Centro-Oeste (Mato Grosso, Mato Grosso do Sul e Distrito Federal) no ano agrícola 2013-2014. Para a seleção dos melhores genótipos, fez-se um estudo de adaptabilidade e estabilidade, utilizando-se o método de Eberhart e Russel e a metodologia proposta por Cruz, Torres e Vencovsky. Foram realizadas as análises de variância e posteriormente as análises de adaptabilidade e estabilidade. Pela metodologia de Eberhart e Russel, foi recomendado o genótipo BRS 511, por apresentar comportamentos altamente previsíveis e responsivos às variações dos ambientes em condições específicas ou amplas em todas as características avaliadas. Ela também recomendou os genótipos CMSXS644, CMSXS647, e Sugargraze, para a produção de massa verde (PMVtn/ha); CMSXS629, CMSXS630, CMSXS646, CMSXS647, BRS 508, BRS509, e CV198 para a variável TBH; e CMSXS629, CMSXS630, CMSXS643, CMSXS646, BRS 506, e BRS 509 para o teor de SST. A regressão bissegmentada proposta pelo método de Cruz, Torres e Venconvsky, caracterizou apenas os genótipos quanto à adaptabilidade em condições específicas em ambientes favoráveis ou de adaptação geral, e quanto à estabilidade como estáveis. Porém, não identificou genótipos recomendáveis.

Made available in DSpace on 2014-07-29T14:52:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_ADILSON santos.pdf: 8026419 bytes, checksum: d59ad1a2514d62fabb78f8c2501b3bfc (MD5) Previous issue date: 2010-03-29 / Recombination is one of the most important factors in the evolution of genome organization. It provides the links between homologous chromosomes that ensure their proper segregation during the first meiotic division. It is responsible for the creation of novel allele combinations and yields genetic diversity on which evolutionary selection can act. Double-strand DNA breaks (DSB) initiate meiotic recombination and when the 3 terminus of one of the broken strands invades the unbroken DNA molecule and primes DNA synthesis a double Holliday junction must be resolved through some alternative pathways. When homologous chromosomes exchange genetic material with each other, an event of recombination or a crossover takes place, which may be seen through chiasma. Citological, genetics, and molecular studies in many organisms have demonstrated that crossovers have a non homogeneous distribution across chromosomes, and rather concentrated in relative small DNA fragments usually called recombination hotspots. In searching for genomic features associated with recombination hotspots a model fitted to human genome data explained 42% of recombination rate variation in a 5 mega base pairs scale. Despite the fact that genomes of some plant species have been already sequenced, up to this moment, no research has been published concerning a high resolution characterization of recombination rate variation across a plant s genome. This study used OH- radical cleavage intensity estimates and sequence data of chromosome 4 of A. thaliana and population genetic data from a public set of 250 thousand SNP genotypes obtained for 362 A. thaliana accessions to: i) characterize the recombination rate and linkage disequilibrium (LD) distributions across the chromosome 4 in different scales; ii) search for recombination hotspots; iii) evaluate probable associations between sequence motifs and genomic features with recombination hotspots. The results have shown that the distribution of recombination events across chromosome 4 of A. thaliana is very concentrated: 50% to 60% of all recombination events spans in only 13% to 20% of the total length of the chromosome. Genomic features as G+C percent (G+C%) and OHradical cleavage intensity showed important associations with LD estimates in several scales. The mean OH- radical cleavage intensity and G+C% showed redundancy in correlation analysis with LD and recombination rates. Artificial strong and statistically significant correlations arose from the usage of sliding windows. DNA fragments considered as hotspots lay preferentially in the middle third of the chromosome, while those characterized for having long range LD decay are most localized in the two distal thirds of the chromosome. / A recombinação é um processo chave na evolução da organização dos genomas das espécies, importante para garantir a segregação adequada dos cromossomos homólogos durante a meiose I e criar novas combinações de alelos, gerando variabilidade genética para a ação da seleção natural. Do ponto de vista molecular, a recombinação é iniciada por uma lesão na fita dupla de DNA, denominada Double-Strand Break (DSB), seguida da formação de uma junção dupla de Holliday (dHJ), a qual é resolvida por vias alternativas. Quando há troca de material genético entre os cromossomos homólogos caracteriza-se a ocorrência de um evento de recombinação, crossover, visualizado citogeneticamente por meio de um quiasma. Estudos citológicos, genéticos e moleculares realizados em vários organismos demonstraram que a distribuição de crossover ao longo dos cromossomos não é regular, mas concentrada em fragmentos relativamente pequenos de DNA, denominados hotspots de recombinação. Na busca por correlações entre a distribuição de elementos genômicos e a de ocorrência de hotspots um modelo ajustado com dados do genoma humano se mostrou capaz de explicar até 42% da variação na taxa de recombinação, numa escala de 5 mega pares de bases. Em plantas, apesar da existência de vários genomas já sequenciados nenhum trabalho nesse sentido ainda foi realizado, pelo menos na ordem de resolução proporcionada pela recente disponibilidade de dados genéticos obtidos com o uso de chips de alta densidade de marcas SNP. Usando dados genéticos de populações, obtidos por genotipagem de 362 acessos de A. thaliana com 250 mil marcas SNP, estimativas da intensidade de clivagem por radical OH- e dados da sequência de nucleotídeos do cromossomo 4 de A. thaliana o presente trabalho propõe-se a: i) caracterizar a distribuição de taxas de recombinação e de desequilíbrio de ligação ao longo do cromossomo 4, em várias escalas; ii) identificar fragmentos hotspots de recombinação; e iii) identificar elementos genômicos com provável associação à ocorrência desses hotspots. Os resultados obtidos mostraram que a distribuição das taxas de recombinação ao longo do cromossomo 4 de A. thaliana é bastante concentrada, pois proporções entre 50% e 60% dos eventos de recombinação ocorrem em apenas 13% a 20% da sequência de DNA. Variáveis genômicas como a porcentagem da soma das bases G e C (G+C%) e a intensidade de clivagem por radical OH- apresentam correlações significativas com as estimativas do desequilíbrio de ligação em várias escalas. A média da intensidade de clivagem por radical OH- proporciona informação redundante com a variável G+C%. O uso de janelas deslizantes sobrepostas gera distroções que provocam o surgimento artificial de correlações fortes e significativas. Os fragmentos hotspots de recombinação têm uma distribuição concentrada no terço médio do cromossomo, enquanto os fragmentos caracterizados por longo alcance do desequilíbrio de ligação estão localizados, predominantemente, nos terços distais.