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FrequÃncia do vÃrus EPSTEIN-BARR (EBV) em pacientes com cÃncer de mama do serviÃo de mastologia de um hospital do Estado do CearÃ.

Emanuele Silva de Oliveira 26 January 2015 (has links)
FundaÃÃo Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Cientifico e TecnolÃgico / O cÃncer de mama representa a maior causa de mortalidade por cÃncer entre as mulheres em todo o mundo. Apesar de possuir bom prognÃstico quando diagnosticado e tratado adequadamente, as taxas de mortalidade continuam elevadas no Brasil. A etiologia do cÃncer de mama à multifatorial e alguns fatores de risco sÃo descritos, como: idade, histÃria familiar e pessoal de cÃncer, fatores ligados a aspectos endÃcrinos, entre outros. Entretanto, em 50 a 80% dos casos, nenhum desses fatores à identificado, sugerindo a existÃncia de outros. Estudos apontam a associaÃÃo do cÃncer de mama com o VÃrus Epstein-Barr (EBV), entretanto, os estudos sÃo controversos. Assim, o presente estudo teve como objetivo verificar a presenÃa de EBV, utilizando a tÃcnica de HibridaÃÃo in situ, em 75 pacientes diagnosticadas com carcinoma mamÃrio invasivo, provenientes do AmbulatÃrio de Mastologia da Maternidade Escola Assis Chateaubriand. Para a classificaÃÃo molecular, os marcadores RE, RP, HER2, Ki67, TP53, CK5/6 e CK8/18 foram detectados pela tÃcnica de imunohistoquÃmica. Neste estudo, a mediana da idade das pacientes foi de 55 anos, das quais 28% tinham atà 45 anos. Apenas 8,7% dos tumores foram diagnosticados precocemente. Graus de estadiamento mais avanÃados e comprometimento de linfonodos caracterizaram essa amostra. A maioria dos tumores expressaram marcadores de citoqueratinas luminais, receptores hormonais e marcador de proliferaÃÃo celular (Ki67). Por outro lado, TP53 e HER2 estiveram presentes em uma fraÃÃo menor dos tumores. EBV foi positivo em apenas 6,67% dos casos nos quais a presenÃa do vÃrus foi restrita a poucos nÃcleos de cÃlulas tumorais. O subtipo luminal B foi o mais frequente, seguido do luminal A. TP53 foi mais frequente nos tumores do subtipo basal sÃmile (75%), diferindo significativamente dos tumores luminais A (16,7%) (p= 0,03) independente da idade. Entre as pacientes com atà 45 anos, todos os tumores do subtipo triplo negativo (basal sÃmile e normal sÃmile) foram TP53 positivos, enquanto uma baixa frequÃncia foi encontrada nos subtipos luminal A e luminal B com uma diferenÃa estatÃstica entre triplo negativo (100%) e luminal A (14,3%) (p = 0,02), triplo negativo e luminal B (16,7%) (p = 0,02), entre basal sÃmile (100%) e luminal A (p = 0,04) e basal sÃmile e luminal B (p = 0,04). As frequÃncias de TP53 nÃo diferiram significativamente entre os subtipos moleculares nas pacientes acima de 45 anos. Comparando-se os grupos de idade, à interessante notar que os tumores do subtipo triplo negativo nas pacientes de atà 45 anos de idade tiveram TP53 estatisticamente mais frequente do que em pacientes acima de 45 anos quando comparados com luminal B, enquanto nos tumores do subtipo luminal B, TP53 foi mais frequente em pacientes acima de 45 anos de idade. Em conclusÃo, apesar da presenÃa de EBV observada, o pequeno nÃmero de casos e a fraca positividade nÃo permitem afirmar ser este um fator etiolÃgico para o desenvolvimento do cÃncer de mama e nem a associaÃÃo da sua presenÃa com algum subtipo molecular. Entretanto, à importante ressaltar que o vÃrus foi pesquisado com base no seu perfil de latÃncia considerando a expressÃo de EBER e esses dados suscitam a adiÃÃo de outros alvos para a pesquisa da real participaÃÃo do vÃrus. Por outro lado à interessante ressaltar a importÃncia do TP53 como marcador diferencial dos tumores triplo negativos em mulheres abaixo de 45 anos.
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AnÃlise de comunidades microbianas de solo de manguezal por T-RFLP e microarranjos de DNA / AnÃlise de comunidades microbianas de solo de manguezal por T-RFLP e microarranjos de DNA

Fernanda Araujo Paes 25 April 2008 (has links)
FundaÃÃo de Amparo à Pesquisa do Estado do Cearà / The mangroves are essistemas important and productive, found along the coastline of tropical and subtropical regions. Important processes such as nutrient cycling, are directly connected to the activity of soil microbial communities. Given its strategic position the mangroves are very impacted the world. In Brazil, important areas such as the Bay of All Saints (BA) are severely affected by the presence of oil. Understanding the adaptation of the microbiota and its local dynamics, before the environmental change is essential to be able to maintain or restore these ecosystems. This thesis investigated the structure and function of microbial communities in a mangrove area of the Bay of All Saints polluted by the oil industry. Two sites were sampled - one located in the refinement of the industry and another, distant location and used as the control. Besides the measured abiotic data, two independent methods of cultivation were used: T-RFLP and DNA microarranjos. The results of both sites in the experiments of T-RFLP showed that the two bacterial communities differ in their structure. For the site sampled in the refinery, a greater number of Otus suggests an environmental stimulus, the bacterial community, a fact associÃvel the high organic matter content of the site. For microarranjos DNA, similar categories of genes were detected in both places, but the specificity of their sequences were distinct. The genes that encode for the remediation organic, were more representative, more than 40% in total in the two sites. Even detecting similar categories, only 4% of the gene sequences were common to the sites. These data show that different bodies are responsible for similar functions at each point. The difference between the sites observed in the experiments can be related with the fact that Site 1 is located in a region heavily affected by oil. Using the ecological data rates of T-RFLP indicated the site 1 as the most diverse, while the results with the DNA microarranjos show the opposite. In conclusion, the structure and function of the local microbiota are affected by the presence of the oil industry. Additional studies may help understand the dynamics of microbial communities, facing the future exposure to the oil and / or derivatives. / Os manguezais sÃo essistemas importantes e produtivos, encontrados ao longo da linha da costa de regiÃes tropicias e subtropicais. Processos importantes como a ciclagem de nutrientes, estÃo diretamente conectados à atividade das comunidades microbianas desses solos. Dada sua posiÃÃo estratÃgica os manguezais sÃo bastante impactados no mundo todo. No Brasil, Ãreas importantes como a da BaÃa de todos os Santos (BA) sÃo severamente afetadas pela presenÃa do petrÃleo. Compreender as adaptaÃÃes da microbiota local e sua dinÃmica, frente Ãs alteraÃÃes ambientais, à essencial para que se consiga manter ou restaurar esses ecossistemas. A presente dissertaÃÃo investigou a estrutura e a funÃÃo de comunidades microbianas em uma Ãrea de manguezal da baÃa de Todos os Santos poluÃda pela indÃstria do petrÃleo. Dois locais foram amostrados - um, situado na Ãrea de refinamento dessa indÃstria e o outro, distante desse local e usado como controle. AlÃm dos dados abiÃticos medidos, dois mÃtodos independentes de cultivo foram utilizados: T-RFLP e microarranjos de DNA. Os resultados de ambos os sÃtios nos experimentos de T-RFLP mostraram que as duas comunidades bacterianas diferem quanto à sua estrutura. Para o sÃtio amostrado na refinaria, um nÃmero maior de OTUs sugere um estÃmulo ambiental, na comunidade bacteriana, fato associÃvel ao alto teor de matÃria orgÃnica desse local. Para os microarranjos de DNA, categorias similares de genes foram detectados, em ambos os locais, mas a especificidade de suas sequÃncias foi distinta. Os genes que codificam para a remediaÃÃo orgÃnica, foram os mais representativos, mais de 40% no total nos dois sÃtios. Mesmo detectando categorias semelhantes, apenas 4% das sequÃncias genÃticas foram comuns aos sÃtios. Estes dados mostram que organismos diferentes sÃo responsÃveis por funÃÃes similares em cada ponto. A diferenÃa entre os locais observadas nos experimentos pode ser relacionada, com o fato do sÃtio 1 situar-se numa regiÃo fortemente afetada por hidrocarbonetos. Utilizando-se Ãndices ecolÃgicos os dados de T-RFLP indicaram o sÃtio 1 como o mais diverso, enquantoo os resultados com os microarranjos de DNA mostram o oposto. Concluindo, a estrutura e funÃÃo da microbiota local sÃo afetadas pela presenÃa da indÃstria do petrÃleo. Estudos adicionais poderÃo ajudar a compreender a dinÃmica dessas comunidades microbianas, frente Ãs futuras exposiÃÃes ao Ãleo e/ou derivados.
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Biodegradação de filmes de polietileno de baixa densidade (PEBD), polihidroxibutirato-co-hidroxivalerato (PHBV) e blenda de PEBD/PHBV (70/30), em coluna de solo

Bucioli, Elaine Cristina [UNESP] 03 April 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-04-03Bitstream added on 2014-11-10T11:58:38Z : No. of bitstreams: 1 000789456.pdf: 4124788 bytes, checksum: 893ba3b360feb1b81ce417904c8dde18 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os plásticos são materiais que possuem larga escala de aplicação industrial e trazem importância econômica para sociedade atual. O uso dos plásticos sintéticos em embalagens e produtos descartáveis gera impactos sócio-ambientais devido ao descarte e disposição inadequada deste material. Uma das alternativas para minimizar esses impactos é a produção de blendas que possuam características próprias ao uso e que após a utilização, sejam absorvidas em um período curto de tempo pelo meio ambiente. Esse trabalho avaliou a biodegradação dos filmes de PHBV (poli(hidroxibutirato-co-hidroxivalerato)), dos filmes de PEBD (polietileno de baixa densidade) e da blenda de PEBD/PHBV (70/30), em coluna de solo, utilizando metodologias como: Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV), Infravermelho com Transformada de Fourier (FTIR) e avaliação da perda de massa. Foi observado que o PHBV se biodegradou em 30 dias de exposição ao solo, período menor de exposição comparado ao PEBD e a blenda, 180 dias. Através do MEV foi possível observar mudanças micro morfológicas significativas na superfície dos filmes de PHBV e da blenda (furos, fraturas, descamações e erosões), o que complementa os valores encontrados de perda de massa, em que o PHBV teve uma redução de 43,9% e a blenda uma redução de 15,7%, nos respectivos períodos do processo biodegradativo. Os espectros de FTIR forneceram informações importantes para avaliação da biodegradação, pois foram capazes de mostrar as alterações estruturais relevantes após o processo biodegradativo, tal como a hidrólise de ésteres do PHBV na interfase entre o PEBD e PHBV. Através das análises de FTIR verificou se alteração de cristalinidade dos materiais poliméricos, que foi um indicativo que auxiliou a avaliação da biodegradação dos filmes. A blenda nessa proporção (70:30), demonstrou ser susceptível à comunidade microbiana do solo, sofrendo mudanças significativas... / Plastics are materials with large-scale industrial application and economic importance to modern society. The use of synthetic plastics in packaging and disposable products generates socio- environmental due to improper disposal and disposal of this material impacts . One alternative to minimize these effects is the production of blends which have their own characteristics and use after use, to be absorbed in a short period of time in the environment . This study evaluated the biodegradation of PHBV films (poly ( hydroxybutyrate-co- hydroxyvalerate ) ) , films of LDPE ( low density polyethylene ) and LDPE blend / PHBV ( 70/30 ) in the soil column using methodologies as: Scanning Electron Microscopy (SEM ) , Fourier Transform Infrared ( FTIR ) and weight loss evaluation. PHBV was biodegraded within 30 days of exposure to the soil , the less exposure time compared to LDPE and blends in 180 days . Through SEM we observed significant micro morphological changes on the surface of PHBV and blend films ( holes , fractures , desquamation and erosions ) , which complements the values found of mass loss , where the PHBV decreased by 43.9 % and the blend showed a reduction of 15.7% in the respective periods of the biodegradation process. The FTIR spectra provide important information for assessing biodegradation because they showed the important structural changes after the biodegradation process , such as hydrolysis of esters of PHBV at the interface between LDPE and PHBV . Using FTIR analysis was verified crystallinity change of the polymer materials, which was an indication of the films biodegradation. The blend in this ratio, shown to be susceptible to the soil microbial community, undergoing significant changes in its morphology
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Biodegradação de filmes de polietileno de baixa densidade (PEBD), polihidroxibutirato-co-hidroxivalerato (PHBV) e blenda de PEBD/PHBV (70/30), em coluna de solo /

Bucioli, Elaine Cristina. January 2014 (has links)
Orientador: José Carlos Marconato / Coorientador: Suely Patrícia Costa Gonçalves / Banca: Sandra Mara Martins Franchetti / Banca: Adriana de Campos / Resumo: Os plásticos são materiais que possuem larga escala de aplicação industrial e trazem importância econômica para sociedade atual. O uso dos plásticos sintéticos em embalagens e produtos descartáveis gera impactos sócio-ambientais devido ao descarte e disposição inadequada deste material. Uma das alternativas para minimizar esses impactos é a produção de blendas que possuam características próprias ao uso e que após a utilização, sejam absorvidas em um período curto de tempo pelo meio ambiente. Esse trabalho avaliou a biodegradação dos filmes de PHBV (poli(hidroxibutirato-co-hidroxivalerato)), dos filmes de PEBD (polietileno de baixa densidade) e da blenda de PEBD/PHBV (70/30), em coluna de solo, utilizando metodologias como: Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV), Infravermelho com Transformada de Fourier (FTIR) e avaliação da perda de massa. Foi observado que o PHBV se biodegradou em 30 dias de exposição ao solo, período menor de exposição comparado ao PEBD e a blenda, 180 dias. Através do MEV foi possível observar mudanças micro morfológicas significativas na superfície dos filmes de PHBV e da blenda (furos, fraturas, descamações e erosões), o que complementa os valores encontrados de perda de massa, em que o PHBV teve uma redução de 43,9% e a blenda uma redução de 15,7%, nos respectivos períodos do processo biodegradativo. Os espectros de FTIR forneceram informações importantes para avaliação da biodegradação, pois foram capazes de mostrar as alterações estruturais relevantes após o processo biodegradativo, tal como a hidrólise de ésteres do PHBV na interfase entre o PEBD e PHBV. Através das análises de FTIR verificou se alteração de cristalinidade dos materiais poliméricos, que foi um indicativo que auxiliou a avaliação da biodegradação dos filmes. A blenda nessa proporção (70:30), demonstrou ser susceptível à comunidade microbiana do solo, sofrendo mudanças significativas... / Abstract: Plastics are materials with large-scale industrial application and economic importance to modern society. The use of synthetic plastics in packaging and disposable products generates socio- environmental due to improper disposal and disposal of this material impacts . One alternative to minimize these effects is the production of blends which have their own characteristics and use after use, to be absorbed in a short period of time in the environment . This study evaluated the biodegradation of PHBV films (poly ( hydroxybutyrate-co- hydroxyvalerate ) ) , films of LDPE ( low density polyethylene ) and LDPE blend / PHBV ( 70/30 ) in the soil column using methodologies as: Scanning Electron Microscopy (SEM ) , Fourier Transform Infrared ( FTIR ) and weight loss evaluation. PHBV was biodegraded within 30 days of exposure to the soil , the less exposure time compared to LDPE and blends in 180 days . Through SEM we observed significant micro morphological changes on the surface of PHBV and blend films ( holes , fractures , desquamation and erosions ) , which complements the values found of mass loss , where the PHBV decreased by 43.9 % and the blend showed a reduction of 15.7% in the respective periods of the biodegradation process. The FTIR spectra provide important information for assessing biodegradation because they showed the important structural changes after the biodegradation process , such as hydrolysis of esters of PHBV at the interface between LDPE and PHBV . Using FTIR analysis was verified crystallinity change of the polymer materials, which was an indication of the films biodegradation. The blend in this ratio, shown to be susceptible to the soil microbial community, undergoing significant changes in its morphology / Mestre
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Interação de Paracoccidioides com o hospedeiro: análises proteômicas de lavado broncoalveolar / Paracoccidioides interaction with the host: proteomic analysis of bronchoalveolar lavage fluid

Pigosso, Laurine Lacerda 09 May 2016 (has links)
Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2017-09-29T19:49:45Z No. of bitstreams: 2 Tese- Laurine Lacerda Pigosso - 2016.pdf: 7314504 bytes, checksum: fad2e169b6b855dccd4a9cad2626868d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-10-02T13:01:59Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese- Laurine Lacerda Pigosso - 2016.pdf: 7314504 bytes, checksum: fad2e169b6b855dccd4a9cad2626868d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-02T13:01:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese- Laurine Lacerda Pigosso - 2016.pdf: 7314504 bytes, checksum: fad2e169b6b855dccd4a9cad2626868d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-05-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Paracoccidoides brasiliensis and Paracoccidioides lutzii, the etiologic agents of paracoccidioidomycosis, cause disease in healthy and immunocompromised persons in Latin America. We developed a method for harvesting P. brasiliensis yeast cells from infected murine lung to facilitate in vivo transcriptional and proteomic profiling. P. brasiliensis harvested at 6 h post-infection were analyzed using RNAseq and LC-MSE. In vivo yeast cells had 594 differentially expressed transcripts and 350 differentially expressed proteins. Integration of transcriptional and proteomic data indicated that early in infection (6 h), P. brasiliensis yeast cells underwent a shift in metabolism from glycolysis to β-oxidation, upregulated detoxifying enzymes to defend against oxidative stress, and repressed cell wall biosynthesis. Bioinformatics and functional analyses also demonstrated that a serine proteinase was upregulated and secreted in vivo. To our knowledge this is the first study depicting transcriptional and proteomic data of P. brasiliensis yeast cells upon 6 h post-infection of mouse lung. / Paracoccidoides brasiliensis e Paracoccidioides lutzii, os agentes etiológicos da paracoccidioidomicose, causam doenças em pessoas saudáveis e imunocomprometidas na América Latina. Desenvolvemos um método para coletar células de levedura de P. brasiliensis de pulmão murino infectado para facilitar o estudo do perfil transcricional e proteômico in vivo. P. brasiliensis recuperados após 6 horas de infecção foram analisados usando RNAseq e LC-MSE. As células de levedura após passagem in vivo apresentaram 594 transcritos expressos diferencialmente e 350 proteínas diferencialmente expressas. A integração dos dados transcricionais e proteômicos indicou que ainda no início da infecção (6 h), as células de levedura de P. brasiliensis sofreram uma mudança no metabolismo da glicólise para β-oxidação, enzimas desintoxicantes reguladas para se defender contra o estresse oxidativo e repressão da biossíntese de parede. Análises de bioinformática e funcionais também demonstraram que uma serino proteinase foi regulada e secretado in vivo. Pelo o nosso conhecimento, este é o primeiro estudo que descreve a transcrição e dados proteômicos de células de levedura de P. brasiliensis após 6 h de infecção no pulmão de camundongo.
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Biodiversidade microbiana da Ilha da Trindade, prospecção genética e aplicações biotecnológicas utilizando micro-organismos autóctones / Microbial biodiversity in the Trindade Island, genetic prospecing and biotechnological appliccations using indigenous microorganisms

Rodrigues, Edmo Montes 18 August 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-07T13:57:20Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2824180 bytes, checksum: 35078d63ffeaef3e4935030bf53dc74e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-07T13:57:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2824180 bytes, checksum: 35078d63ffeaef3e4935030bf53dc74e (MD5) Previous issue date: 2016-08-18 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Esse estudo é iniciado com uma revisão bibliográfica em que aborda a biorremediação de hidrocarbonetos pesados e hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (PAHs). Na revisão, são explorados aspectos que incluem a obtenção de micro- organismos com capacidade de degradar hidrocarbonetos, vias metabólicas de biodegradação, as consequências ambientais da contaminação e por fim aborda novos estudos que utilizam estratégias e novas tecnologias de biorremediação possíveis em ambientes aquáticos e solos. A parte experimental de nosso estudo segue a mesma linha de pesquisa desenvolvida durante o mestrado. De maneira preventiva, busca-se avaliar e desenvolver metodologias para biorremediar as adjacências da Ilha da Trindade, ambiente pristino e de valor ecológico, caso ocorram acidentes envolvendo o derramamento de hidrocarbonetos. Inicialmente, objetivamos avaliar o genoma dos isolados bacterianos autóctones da comunidade microbiana existente nas águas marinhas que circundam a Ilha da Trindade, Rhodococcus rhodochrous TRN7 e Nocardia farcinica TRH1, isolados durante o trabalho de mestrado como sendo capazes de degradar uma grande variedade de hidrocarbonetos de petróleo. Nosso objetivo também foi avaliar a estrutura da comunidade microbiana e o catabolismo de fenantreno após contaminação de microcosmos contendo água coletada na mesma região e utilizar micro-organismos autóctones como estratégia de bioaumentação. Por fim, objetivou-se desenvolver um produto biotecnológico baseado em emulsões duplas W/O/W fertilizadas, capaz de promover a bioestimulação sem a perda instantânea de nutrientes em águas oceânicas oligotróficas contaminadas por compostos orgânicos hidrofóbicos. Os genomas de R. rhodochrous TRN7 e N. farcinica TRH1 possuem genes de degradação de compostos alifáticos e aromáticos, sendo que 17 genes envolvidos com a biossíntese de antibióticos foram anotados com o genoma de R. rhodochrous TRN7, enquanto que no genoma de N. farcinica TRH1 foram identificados genes relacionados à degradação de caprolactam, precurssor do nylon, e do pesticida atrazina, o que torna ambos os isolados candidatos a serem empregados tanto em estratégias de bioaumentação quanto em outras áreas biotecnológicas. Após a contaminação de microcosmos com hidrocarbonetos, a comunidade microbiana da água litorânea da Ilha da Trindade passa a ser dominada por Gammaproteobacteria, grupo que compõe mais de 72% das sequências analisadas, enquanto que no tratamento controle houve predomínio de Proteobacteria (95% das sequências). Destaca-se a abundância de representantes do gênero Alteromonas, presentes em todos os tratamentos contaminados, com maior valor de abundância (66% das sequências) no tratamento contendo apenas fenantreno como contaminante. Decorridos 30 dias da contaminação, os valores de diversidade foram reduzidos, havendo domínio de grupos bacterianos reconhecidos pela presença de membros com atividade hidrocarbonoclástica. A capacidade de mineralização de fenantreno pela microbiota autóctone da Ilha da Trindade é reduzida quando outros PAHs e hidrocarbonetos de alto peso molecular estão presentes no ambiente. Em relação às emulsões produzidas, nossos resultados mostraram que elas podem ser utilizadas com o propósito de liberação gradual de nutrientes na fase aquosa dispersa. A emulsão é composta por gotículas que variam em um amplo espectro de tamanho que se desestabilizam temporalmente, resultando na liberação da inorgânicos. Quando utilizadas em hidrocarbonoclásticas, fase aquosa conjunto em microcosmos interna, ou contendo não, água contendo nutrientes com bactérias litorânea da Ilha da Trindade contaminada com petróleo, as emulsões W/O/W fertilizadas proporcionaram aumentos significativos da atividade microbiana. Como conclusões, nosso trabalho mostrou que a contaminação por hidrocarbonetos resulta na perda de diversidade microbiana da comunidade microbiana da água litorânea da Ilha da Trindade, e que um ambiente considerado pristino possui microbiota capaz de degradar hidrocarbonetos. Por fim, conclui-se que emulsões duplas W/O/W fertilizadas são uma alternativa para proporcionar aumento significativo na atividade catabólica de hidrocarbonetos em ambientes marinhos oligotróficos. / This study starts with a literature review approach in heavy hydrocarbon bioremediation and polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs). In the review are explored aspects from obtaining microorganisms capable of degrading hydrocarbons, metabolic biodegradation pathways, environmental consequences of contamination and finally discusses new studies using new strategies and bioremediation technologies in water and soil environments. The experimental part of our study follows the same research line developed during the Masters. Preventively, seeks to assess and develop bioremediation methodologies for Trindade Island shoreline, pristine environment with ecological value, should they occur involving the oil spill. Initially we aimed to evaluate the genome of indigenous bacterial isolates Rhodococcus rhodochrous TRN7 and Nocardia farcinica TRH1, isolated during master’s work as being capable of degrading a wide range of petroleum hydrocarbons. Our aim was also to evaluate the microbial community structure and metabolism of PAHs after contamination in microcosms and use indigenous microorganisms as bioaugmentation strategy. Finally, it aimed to develop a biotechnolocal product based on double emulsion W/O/W fertilized able to promote biostimulation without the instant loss of nutrients in oligotrophic oceanic waters contaminated with hydrophobic organic compounds. The genomes of R. rhodochrous TRN7 and N. farcinica TRH1 presents aliphatic and aromatic compounds degradation genes. Moreover, 17 genes involved in the biosynthesis of antibiotics were recorded in the genome of R. rhodochrous TRN7 while in the genome of N. farcinica TRH1 were identified genes related to the degradation of caprolactam, a nylon precursor, and the pesticide atrazine, which makes the isolates candidates to be used in both strategies bioaugmentation as for other biotechnological activity. After contamination by hydrocarbons, in microcosms, the microbial community of the coastal water from Trindade Island becomes dominated by Gammaproteobacteria, a group that makes up more than 72% of the analyzed sequences, while in the control treatment predominated Proteobacteria (95% of the sequences). Noteworthy is the abundance of representatives of the genus Alteromonas, present in all the contaminated treatments with highest abundance (66% of the sequences) in the treatment containing phenanthrene as only contaminant. After 30 days of contamination, diversity values were reduced, with domain of bacterial groups recognized by the presence of members with hydrocarbonoclastic activity. The phenanthrene mineralization capacity by the indigenous microbiota of the Trindade Island is reduced when other PAHs and high molecular weight hydrocarbons are present in the environment, however, does not cease to occur. With respect to emulsions produced, our results showed that they can be used for the purpose of slow release nutrients in the dispersed aqueous phase. The emulsion comprises droplets ranging in a wide range of size that destabilize temporally, resulting in the release of the internal aqueous phase, containing inorganic nutrients. When used together or not, hydrocarbonoclastic bacteria in microcosms containing coastal water from Trindade Island contaminated with oil, the fertilized W/O/W emulsion provided significant increases in microbial activity. In conclusion, our work has shown that hydrocarbons contamination results in the loss of microbial diversity in marine environments, in addition to state that as environment considered pristine has microbiota capable of degrading hydrocarbons and therefore it becomes viable the use of strategies as biostimulation and bioaugmentation employing indigenous bacterial isolates previously selected. Finally, it is concluded that fertilized W/O/W emulsions are an alternative to provide significant increase in catabolic activity hydrocarbons oligotrophic marine environments.
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Avaliação de indicadores biológicos na validação de processos de esterilização de isoladores por peróxido de hidrogênio / Evaluation of biologic indicators in sterilization processes validation sterilization by hydrogen peroxide isolators

Castro, Lilian Cristina Menegon 28 September 2004 (has links)
A resistência de cinco microrganismos presentes na microbiota da área de produção estéril (Cristalização Estéril), frente a ação do gás de peróxido de hidrogênio foi determinada e o valor O obtido para cada microrganismo foi comparado ao valor D do Bacillus stearothermophilus ATCC 12980 exposto ao mesmo agente. Os microrganismos testados foram Bacillus sp, M. luteus, Corynebacterium, Staphylococcus sp e Penicillium sp. Este teste tinha a finalidade de comprovar que a resistência do Bacillus stearothermophilus é maior quando da exposição ao peróxido de hidrogênio se comparada a outros microrganismos presentes na área produtiva. A metodologia consistiu da inoculação de 0,01 mL da suspensão de cada microrganismo na contagem de 102UFC/0,01 mL em cupons de aço inoxidável, previamente esterilizados por calor seco e posterior exposição ao gás de peróxido de hidrogênio. O experimento demonstrou que o valor D obtido para o Bacillus stearothermophilus ésuperior aos obtidos para os outros microrganismos em teste comprovando que a escolha deste microrganismo para o desafio contra o peróxido de hidrogênio é apropriada. Também executou-se o teste que visava garantir que o aço inoxidável é o material de suporte mais recomendado para este fim, utilizando-se suportes de diversos materiais normalmente encontrados no interior dos isoladores (PVC, aço inoxidável, CKC, teflon, polipropileno, látex, silicone, Hypalon, vidro, nylon, saco de alumínio) com 0,01 mL de inóculo de Bacillus stearothermophilus na contagem de 102UFC/O,01 mL, o que foi devidamente comprovado. / The resistance of tive microrganisms found in the sterile production area (Crystallization Area) flora was tested against the hydrogen peroxide gas and the D value of each microrganism was compared to the Bacillus stearothermophilus D Value ATCC 12980 exposed to the same agent. The microrganisms tested were Bacillus sp, M. luteus, Corynebacterium, Staphylococcus sp e Penicillium sp. The purpose of this test was to prove that the resistance of Bacillus stearothermophilus against the exposition the hydrogen peroxide is higher when compared to others microrganisms found in the production area. The methodology consisted in inoculating 0.01 mL of microrganisms suspension with 102UFC/0,01 mL count in stainless steel coupons, treated previously with dry heat and further exposition to the hydrogen peroxide. The experiment demonstrated that the Bacillus stearothermophilus D value is higher against all others microrganisms tested proving that the use of this microrganism for the challenge is appropriate. It was also pertormed a test to guarantee that the stainless steel support is the most recommended one for this purpose, using supports of different materials normally found in the interior of the isolators (PVC, stainless steel, CKC, Teflon, polypropylene, latex, silicon, Hypalon, glass, nylon, aluminum foil) with 0,01 mL Bacillus stearothermophilus inoculum with the count of 102UFC/O,01 mL, that was properly veritied.
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Pesquisa de bioativos e avaliação da atividade biológica de extratos hidroetanólicos de Ficus pumila L. (Moraceae)

NORONHA, Natália Maria 14 February 2014 (has links)
O uso de produtos naturais, principalmente de origem vegetal, na terapêutica medicinal representa a forma mais antiga e difundida de medicação. Ficus pumila, planta amplamente utilizada na ornamentação de muros e paredes, conhecida como hera-miúda ou unha-de-gato, apresenta inúmeras atividades biológicas. Pela população é utilizada como antitumoral, antiinflamatório, tônico e no tratamento de doenças como diabetes e hipertensão. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo estudar a composição química e as atividades antimicrobiana e antioxidante, além da citotoxicidade de extratos hidroetanólicos de caule, raiz, folhas e frutos secos e frescos de Ficus pumila. Em relação à composição química, os resultados encontrados revelaram a presença de taninos e flavonoides em todos os extratos. O maior teor de compostos fenólicos foi exibido pela raiz seca (724,39 mg AG/g) e o menor pelo caule fresco (84,8 mg AG/g). O maior teor de flavonoides foi apresentado pela folha seca (15,30 mg quercetina/g) e o menor pelo caule seco (1,29 mg de quercetina/g). Os testes microbiológicos indicaram a atividade dos extratos contra Bacillus subtilis, Bacillus cereus, Micrococcus luteus, Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus e Proteus mirabilis. Os melhores resultados foram exibidos pelos extratos de caule e raiz. Os extratos não apresentaram atividade contra Mycobacterium tuberculosis H37 e Mycobacterium bovis (BCG). A maior atividade antioxidante foi demonstrada pelo extrato de caule fresco (12,81 μg/mL) e a menor pelo extrato de folha fresca (58,56 μg/mL). A avaliação da citotoxicidade frente à cultura celular revelou a ausência de citotoxicidade dos extratos de caule, raiz e fruto nas concentrações testadas. Concluiu-se que Ficus pumila pode ser, no futuro, uma fonte de compostos antioxidantes e antimicrobianos para o desenvolvimento de novos fármacos. / The use of natural products, mainly of vegetable origin in medical therapy is the oldest form of medication and widespread. Ficus pumila plant widely used in the decoration of walls and partitions, known as Ivy - girl or cat's claw, has numerous biological activities. By population is used as antitumor, anti-inflammatory, tonic and also for the treatment for some diseases such as diabetes and hypertension. In this context, the present work aimed to study the chemical composition and antimicrobial and antioxidant activities, beyond the cytotoxicity of hydroethanolic extracts of root, stalk, leaves and dried and fresh fruits of Ficus pumila. Regarding the chemical composition, the results revealed the presence of tannins and flavonoids in all extracts. The higher content of phenolic compounds was screened by dried root (724.39 mg AG / g) and the lowest by the fresh stem (84.8 mg AG/ g). The highest content of flavonoids was presented by drought (15.30 mg quercetin/ g) and the lowest by dry leaf stem (1.29 mg quercetin/ g). Microbiological tests indicated the activity of the extracts against Bacillus subtilis, Bacillus cereus, Micrococcus luteus, Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus and Proteus mirabilis. The best results were shown by the extracts of stem and root. The extracts showed no activity against Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium bovis H37 (BCG). The highest antioxidant activity was shown by extracts of fresh stem (12.81 mg/ mL) and lowest for fresh leaf extract (58.56 mg/ mL). The cytotoxicity against the cell culture revealed the absence of cytotoxicity of extracts of root, stalk and fruit concentrations tested. It was concluded that Ficus pumila may be in the future a source of antioxidants and antimicrobial compounds for drug development.
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Avaliação do potencial enzimático de fungos endofíticos de Coffea arabica (café), sob cultivo orgânico e convencional, na remediação de efluentes têxteis

PIRES, Josiane Ferreira 28 February 2013 (has links)
O presente trabalho teve por objetivos coletar, isolar, identificar e comparar fungos endofíticos associados às plantas de cafeeiro cultivadas sob diferentes manejos; avaliar o potencial biotecnológico e enzimático dos fungos selecionados e correlacionar este potencial enzimático com a capacidade de remediação destes fungos sobre o corante têxtil Brilhante Azul de Remazol (RBBR) e efluentes gerados por indústrias têxteis. Foram coletadas folhas de plantas de cafeeiros mantidos sob manejos orgânico e convencional. Foram identificadas 39 morfoespécies de fungos endofíticos dentre os isolados provenientes do sistema orgânico e 27 morfoespécies oriundas do sistema convencional. Sete isolados degradaram o corante RBBR disposto em meio de cultura sólido e os quatro que apresentaram melhor descoloração detectada visualmente [CO. 5, CO. 10 (Colletotrichum sp.), CO.11a e CC. 22 (Aspergilllus niger)] e o fungo padrão Lentinula edodes (INCQS 40220) foram analisados quanto à capacidade de produção de enzimas ligninolíticas e capacidade de descoloração em efluente sintético com e sem acréscimo de madeira. Todos os fungos analisados foram capazes de secretar Lacase e/ou Manganês peroxidase e de promover a descoloração do corante RBBR. Os fungos CO.5 e CO.10 apresentaram resultados promissores em efluente sintético, promoveram descoloração e secretaram enzimas do sistema ligninolítico. No entanto, A. niger (CC.22) foi mais eficiente, removendo 94,67% da cor em apenas 48 horas e foi selecionado para a análise de biodegradação do efluente têxtil. Nas análises em efluente têxtil A. niger (CC.22) foi capaz de produzir enzimas e remover até 72,22% de cor também em 48 horas de incubação, reforçando a hipótese de que este fungo basiomiceto apresenta potencial para ser avaliado em sistemas de remediação de poluentes, como os efluentes texteis. / This study aimed to collect, isolate, identify and compare endophytic fungi associated with coffee plants grown under different managements; evaluate the enzymatic and biotechnological potential of selected fungi and correlate with the potential remediation ability of these fungi for textile dye Remazol Brilliant Blue (RBBR) and effluents generated by textile industries. We collected leaves of coffee plants kept under organic and conventional management systems. We identified 39 endophytic fungi morphospecies of isolates from organic system and 27 morphospecies from the conventional system. Seven isolates degraded dye RBBR arranged in solid medium and the four that showed better decolorization visually detected [CO. 5, CO. 10 (Colletotrichum sp.), CO.11a and CC.22 (Aspergilllus niger)] and standard fungus Lentinula edodes (INCQS 40 220) were analyzed for their capacity to produce ligninolytic enzymes and decolorization capacity in synthetic wastewater with and without addition of wood. All fungi studied secreted laccase and/or manganese peroxidase.It also promoted decolorization of the dye RBBR. Fungi CO.5 and CO.10 promoted discoloration and secreted enzymes ligninolytic, showing promising results in synthetic effluent. However, A. niger (CC.22) was more efficient, removing 94.67% of the color in only 48 hours and was selected for biodegradation analysis of textile effluent. In the analyzes in textile effluent A. niger (CC.22) was capable to produce enzymes and remove up to 72.22% color also at 48 hours of incubation, reinforcing the hypothesis that this basidiomycete fungus has potential to be measured in systems for pollutants remediation, such as textile effluents. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
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Isolamento e seleção de fungos endofíticos produtores de compostos bioativos associados à Annona crassiflora

MENDONÇA, Andrea Natan de 15 September 2014 (has links)
Os fungos endofíticos merecem um destaque especial devido a sua diversidade, e consequentemente ao aumento da probabilidade de descoberta de metabólitos. Este trabalho teve por objetivo isolar fungos endofíticos das folhas da Annona crassiflora, selecionar os de melhor atividade e testá-los quanto à capacidade em produzir metabólitos bioativos com atividade antimicrobiana, antioxidante e antiproliferativa. Foram isolados 192 fungos em diferentes períodos do ano, sendo a maior quantidade isolada a partir de folhas adultas. Após o isolamento foi preparado extrato de acetato de etila, e avaliada a atividade dos extratos. Para a análise da atividade antimicrobiana foram utilizados os micro-organismos Staphylococcus aureus ATCC 6538, Escherichia coli ATCC 25922 e Candida albicans ATCC 10231, e foi obtida a atividade de 73,22% contra pelo menos um dos micro-organismos. Contra o S. aureus a atividade dos extratos foi de 45,54%, a C. albicans foi inibida por 31,25% dos extratos, e 54,46% dos extratos foram capazes de inibir a E. coli. A partir destes resultados foram selecionados os extratos fúngicos: A1F2F1, A4F14F1 e A5F18F7. A concentração inibitória mínima contra S. aureus foi de 250-500 μg/mL para o extrato A5F18F7, 500-1000 μg/mL para o extrato A4F14F1 e A1F2F1 não apresentou atividade nas concentrações testadas. O extrato A5F18F7 demonstrou capacidade bactericida na concentração de 1000 μg/mL. Nas análises de atividade antioxidantes o extrato A4F14F1 destacou frente aos demais em todos os testes e ainda obteve uma maior quantidade de compostos fenólicos totais. Os resultados de atividade antiproliferativa demonstraram resultados promissores para o extrato A4F14F1, sendo esta avaliada como potente contra linhagens de células tumorais e uma baixa atividade contra linhagens celulares não tumorais. Através da análise da composição química desses extratos não foi possível identificar compostos que pudessem ser responsáveis pelas atividades testadas, porém foi possível determinar a presença do ácido butanodióico que consiste em um composto de ampla utilização em diversas áreas. Portanto os resultados sugerem a potencialidade dos extratos, e destacam a importância do estudo dos fungos endofíticos, já eles podem ser uma fonte para várias novas substâncias com atividade de interesse farmacológico. / The endophytic fungi deserve a special mention because of its diversity, and consequently the increased probability of discovery metabolites. This study aimed to isolate endophytic fungi from the leaves of Annona crassiflora, select the best activity and test them for their ability to produce bioactive metabolites with antimicrobial activity, antioxidant and antiproliferative. Were isolated 192 fungi in different periods of the year, being the largest single amount from adult leaves. After isolation extract was prepared in ethyl acetate, and evaluated the activity of the extracts. For the analysis of the antimicrobial activity of micro-organisms Staphylococcus aureus ATCC 6538, Escherichia coli ATCC 25922 and Candida albicans ATCC 10231 were used, and the activity of 73.22% against at least one of the micro-organisms was obtained. Against S. aureus activity of the extracts was 45.54% C. albicans was inhibited by 31.25%, and 54.46% of the extract the extracts were able to inhibit E. coli. From these results we selected the fungal extracts: A1F2F1, A4F14F1 and A5F18F7. The minimum inhibitory concentration against S. aureus was 250-500 mg / mL for the extract A5F18F7, 500-1000 mg / mL for A4F14F1 and A1F2F1 extract was inactive at the tested concentrations. The A5F18F7 extract showed bactericidal activity at 1000 mg / mL. In the analyzes of antioxidant activity extract A4F14F1 emphasized compared to other all the tests and still got a larger amount of phenolic compounds. The results of the antiproliferative activity shown promising results for A4F14F1 sample, this being evaluated as potential against tumor cells and a low activity against non-cancer cell lines. By analyzing the chemical composition of these extracts was not possible to identify compounds that could be responsible for the activities tested, but it was possible to determine the presence of butanedioic acid consisting of a compound widely used in various fields. Therefore the results suggest the potential of the extracts, and highlight the importance of the study of endophytic fungi, since they can be a source for several new substances with pharmacological activity of interest. / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - FAPEMIG

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